单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 10549 篇文献，本页显示第 7061 - 7080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7061 | 2025-10-06 |
Identification of Synovial Lymphatics in the TMJ and their Roles in Arthritis and Pain
2025-May-30, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6683299/v1
PMID:40502768
|
研究论文 | 本研究首次发现颞下颌关节中存在滑膜淋巴管，并揭示其在关节炎和疼痛中的作用机制 | 首次在颞下颌关节中鉴定出滑膜淋巴系统，并证明淋巴功能障碍会驱动关节炎和疼痛的发生 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究颞下颌关节滑膜淋巴系统的存在及其在关节炎和疼痛中的作用 | 基因报告小鼠、人类组织样本 | 生物医学研究 | 颞下颌关节关节炎 | 基因报告技术、组织透明化、3D体积成像、功能遗传学、单细胞RNA测序 | NA | 图像、基因表达数据 | 小鼠模型和人类组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7062 | 2025-10-06 |
Spatiotemporal transcriptomic analysis during cold ischemic injury to the murine kidney reveals compartment-specific changes
2025-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.25.654911
PMID:40501673
|
研究论文 | 利用空间转录组技术分析小鼠肾脏冷缺血损伤期间的时空转录组变化 | 首次在肾脏冷缺血损伤中应用空间转录组技术进行全转录组表征，并开发了计算工作流程识别区室特异性变化 | 研究基于小鼠模型，结果向人类临床转化的有效性需进一步验证 | 揭示冷缺血损伤的分子机制及其对肾脏移植结局的影响 | 小鼠肾脏组织 | 空间转录组学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 小鼠肾脏样本（0-48小时冷缺血时间系列） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 7063 | 2025-10-06 |
Bridging Large Language Models and Single-Cell Transcriptomics in Dissecting Selective Motor Neuron Vulnerability
2025-May-12, ArXiv
PMID:40463696
|
研究论文 | 提出一个利用大语言模型和单细胞转录组学分析选择性运动神经元易损性的新框架 | 首次将基因特异性文本注释与单细胞RNA测序数据结合，通过表达加权平均生成生物学背景化的细胞嵌入表示 | NA | 解析选择性运动神经元易损性，改进细胞类型识别和功能分析 | 单细胞RNA测序数据中的细胞 | 自然语言处理,计算生物学 | 运动神经元疾病 | 单细胞RNA测序 | 大语言模型,BioBERT,SciBERT | 文本,基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7064 | 2025-10-06 |
Oligodendroglia vulnerability in the human dorsal striatum in Parkinson's disease
2025-05-05, Acta neuropathologica
IF:9.3Q1
DOI:10.1007/s00401-025-02884-5
PMID:40323467
|
研究论文 | 通过单核RNA测序和空间转录组学揭示帕金森病患者背侧纹状体中少突胶质细胞的脆弱性 | 首次在人类帕金森病背侧纹状体中系统鉴定出15种少突胶质细胞亚类，其中4种为疾病特异性群体，并发现其热休克蛋白过表达、髓鞘形成异常和细胞通讯受损等特征 | 研究样本量未明确说明，仅提及分析了约20万个少突胶质细胞核 | 阐明帕金森病中少突胶质细胞的多样性及其在疾病中的变化 | 人类尾状核和壳核（背侧纹状体）组织样本 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单核RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 约200,000个少突胶质细胞核（来自帕金森病患者和对照脑组织捐赠者） | NA | 单核RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7065 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals shared clonal signatures in nonmalignant B and tumor cells in T-prolymphocytic leukemia
2025-May, Blood neoplasia
DOI:10.1016/j.bneo.2025.100076
PMID:40453149
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示T细胞前淋巴细胞白血病中非恶性B细胞与肿瘤细胞共享的克隆特征 | 首次在单细胞水平证实T-PLL中非恶性B细胞与克隆性T细胞存在共享突变 | 样本量有限（16例患者），仅对9例患者获得复发样本 | 阐明T细胞前淋巴细胞白血病的克隆起源和进化动力学 | 16例T-PLL患者的非恶性细胞和肿瘤细胞 | 单细胞基因组学 | 白血病 | 靶向二代测序, 液滴数字PCR, 单细胞多组学分析 | NA | 基因组DNA, 细胞表面蛋白标记 | 16例T-PLL患者，其中9例有配对的诊断和复发样本 | Mission Bio | 单细胞多组学 | Tapestri Platform | Mission Bio Tapestri单细胞分析平台 |
| 7066 | 2025-10-06 |
In mice, discrete odors can selectively promote the neurogenesis of sensory neuron subtypes that they stimulate
2025-Mar-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.10.579748
PMID:38405728
|
研究论文 | 研究发现特定气味能选择性促进小鼠嗅觉感觉神经元亚型的神经发生 | 首次证明离散气味能特异性加速对其敏感的嗅觉神经元亚型的生成速率 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在其它哺乳动物中验证 | 探究嗅觉刺激如何影响特定嗅觉感觉神经元亚型的神经发生 | 小鼠嗅觉感觉神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 亚型特异性神经元出生日期标记 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7067 | 2025-10-06 |
A tumor cornification and immune-infiltration-based scheme for anti-PD-1 plus chemotherapy response in advanced squamous cell lung carcinoma
2025-Feb-14, Med (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.medj.2024.09.005
PMID:39395411
|
研究论文 | 本研究基于肿瘤角质化和免疫浸润特征建立了一个预测晚期肺鳞癌患者抗PD-1联合化疗疗效的新方案 | 首次提出基于肺鳞癌免疫浸润和角质化特征分类(LICC)的方案，并发现SPRR3+肿瘤细胞通过CD24-SIGLEC10轴介导免疫逃逸的新机制 | 研究样本量相对有限，需要更大规模的前瞻性研究验证LICC方案的临床适用性 | 探索预测肺鳞癌患者抗PD-1免疫治疗联合化疗疗效的生物标志物 | 晚期肺鳞癌患者 | 肿瘤免疫学 | 肺鳞癌 | RNA测序,流式细胞术,多重免疫组织化学,单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据,流式细胞数据,免疫组化数据 | 349例来自ORIENT-12临床试验的肺鳞癌样本，外加其他临床队列验证 | NA | RNA-seq,单细胞RNA-seq,流式细胞术,多重免疫组织化学 | NA | NA |
| 7068 | 2025-10-06 |
Early downmodulation of tumor glycolysis predicts response to fasting-mimicking diet in triple-negative breast cancer patients
2025-Feb-04, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2024.11.004
PMID:39694040
|
研究论文 | 本研究探讨模拟禁食饮食联合化疗对三阴性乳腺癌患者的治疗效果及机制 | 首次发现高糖酵解癌细胞在治疗早期出现糖酵解通路下调可预测三阴性乳腺癌患者对模拟禁食饮食的治疗反应 | 样本量较小（30例患者），需更大规模临床试验验证 | 评估周期性模拟禁食饮食联合术前化疗对早期三阴性乳腺癌患者的疗效 | 30例早期三阴性乳腺癌患者 | 肿瘤代谢研究 | 三阴性乳腺癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 30例早期三阴性乳腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 7069 | 2025-10-06 |
Cross-cellular analysis of chromatin accessibility markers H3K4me3 and DNase in the context of detecting cell-identity genes: An "all-or-nothing" approach
2025-02, Journal of bioinformatics and computational biology
IF:0.9Q4
DOI:10.1142/S0219720025400025
PMID:40169369
|
研究论文 | 通过分析染色质可及性标记H3K4me3和DNase，提出跨细胞染色质开放度(CCO)水平来预测细胞特异性基因 | 首次提出跨细胞染色质开放度(CCO)概念，并证明其与基因必需性状态的相关性 | 仅使用两种分化实验进行验证，数据来源可能有限 | 研究染色质可及性标记与细胞特异性基因检测的关联 | 不同细胞系中的染色质可及性标记(H3K4me3和DNase) | 表观遗传学 | NA | 染色质可及性分析，scRNA-Seq，bulk RNA-Seq | NA | 表观基因组数据，基因表达数据 | 多个细胞系 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序，染色质可及性分析 | NA | NA |
| 7070 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial characterization of plasmablast-like lymphoma cells in primary central nervous system lymphoma
2025-Feb, Blood neoplasia
DOI:10.1016/j.bneo.2024.100058
PMID:40454408
|
研究论文 | 通过单细胞和空间多组学分析揭示了原发性中枢神经系统淋巴瘤中浆母细胞样淋巴瘤细胞的异质性和微环境特征 | 首次在PCNSL中鉴定出具有浆母细胞特征的淋巴瘤亚群，并揭示了其空间分布异质性和与微环境的独特相互作用 | 样本量相对有限，需要更大规模的研究验证发现 | 阐明PCNSL的细胞和空间异质性及微环境特征 | 原发性中枢神经系统淋巴瘤患者样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞测序, 空间多组学分析, B细胞受体分析, 免疫组织化学染色 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 蛋白质表达数据 | PCNSL患者队列（扩展研究中约40%患者具有PBL特征亚群） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间多组学 | NA | NA |
| 7071 | 2025-10-06 |
Deciphering the Regulatory Networks of the Migrasome-Associated Cell Subpopulation in Heterotopic Ossification via Multi-Omics Analysis
2025-Jun-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500965R
PMID:40540299
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示异位骨化中迁移体相关细胞亚群的调控网络 | 首次识别出间充质谱系细胞作为关键的迁移体相关细胞亚型，并确定Ppib和Tagln为关键分子，构建了其调控网络和空间分布模式 | 研究主要基于公共数据库数据，实验验证可能有限 | 阐明异位骨化的关键生物分子网络和调控机制 | 异位骨化组织样本 | 生物信息学 | 异位骨化 | 单细胞转录组测序, 批量转录组测序, 空间转录组测序, 多组学分析 | 高维加权基因共表达网络分析, 机器学习 | 转录组数据, 空间转录组数据 | 来自GEO数据库的多个数据集和临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 7072 | 2025-10-06 |
Integrating Single-Cell and Experimental Analyses Uncover Macrophage Ferroptosis Is a Key Event in the Development of Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2025-Jun-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501120R
PMID:40542598
|
研究论文 | 通过整合单细胞测序和实验分析，揭示巨噬细胞铁死亡是慢性阻塞性肺疾病发展的关键事件 | 首次结合单细胞测序和实验验证，系统阐明香烟烟雾通过诱导巨噬细胞铁死亡促进COPD发展的机制 | 研究主要基于公共数据库和小鼠模型，需要进一步人类样本验证 | 探究香烟烟雾诱导的巨噬细胞铁死亡在COPD发病机制中的作用 | COPD患者肺组织、RAW264.7细胞系、BMDM细胞、COPD小鼠模型 | 单细胞生物学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 免疫组化, qRT-PCR, western blotting | NA | 单细胞测序数据, 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 公共数据库GSE171541和GSE173896的单细胞数据，体外和体内细胞系实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7073 | 2025-10-06 |
Quantitative measurement of phenotype dynamics during cancer drug resistance evolution using genetic barcoding
2025-Jun-20, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59479-7
PMID:40541962
|
研究论文 | 提出一种通过遗传谱系追踪和种群规模数据推断癌症耐药性动态的数学框架 | 无需直接测量耐药表型即可推断耐药性动态的数学框架 | 未直接测量耐药表型，依赖推断方法 | 理解癌症耐药性进化机制 | 结直肠癌细胞系SW620和HCT116 | 计算生物学 | 结直肠癌 | 遗传条形码技术、单细胞RNA测序、单细胞DNA测序 | 数学框架 | 遗传谱系追踪数据、种群规模数据 | 两种结直肠癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞DNA测序 | NA | NA |
| 7074 | 2025-10-06 |
ISCU-p53 axis orchestrates macrophage polarization to dictate immunotherapy response in esophageal squamous cell carcinoma
2025-Jun-20, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07787-7
PMID:40541964
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示食管鳞状细胞癌中ISCU-p53轴通过调控巨噬细胞极化影响免疫治疗反应的机制 | 首次发现ISCU通过胞质滞留p53促进M2巨噬细胞极化的新机制，并证明靶向ISCU可增强抗PD-1抗体疗效 | NA | 探索食管鳞状细胞癌免疫治疗反应差异的分子机制 | 食管鳞状细胞癌患者的肿瘤微环境细胞 | 单细胞生物学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 接受PD-1抑制剂治疗的部分缓解、疾病稳定患者及未接受术前治疗的手术患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7075 | 2025-10-06 |
The critical role of PDGFRa + Sca1 + fibroblasts in angiogenesis and vascular repair in the corpus cavernosum
2025-Jun-20, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04434-y
PMID:40542354
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了阴茎海绵体中PDGFRa+Sca1+成纤维细胞在血管生成和修复中的关键作用 | 首次发现并鉴定了一个独特的PDGFRa+Sca1+成纤维细胞亚群，该亚群具有分化为内皮细胞和平滑肌细胞的潜力，并参与血管修复过程 | 研究主要基于动物模型，尚未在人类样本中得到验证 | 探究成纤维细胞在勃起功能障碍发病机制中的作用 | 糖尿病性ED和海绵体神经损伤性ED动物模型中的阴茎海绵体组织 | 单细胞生物学 | 勃起功能障碍 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | ED动物模型组织 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7076 | 2025-10-06 |
Human induced neural progenitor cells generated from three-dimensional aggregate-based culture significantly improve post-stroke recovery in tMCAO mice
2025-Jun-20, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04433-z
PMID:40542444
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于3D聚集体培养的高效诱导神经祖细胞生产方法，并验证其在脑卒中小鼠模型中的治疗效果 | 开发了可扩展的3D悬浮培养系统，避免了有害的细胞解离和重铺过程，并通过单细胞RNA测序揭示了iNPC的亚群特征 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未进行人体临床试验 | 开发高效的iNPC生产方法并评估其在脑卒中恢复中的治疗潜力 | 诱导多能干细胞来源的神经祖细胞和tMCAO小鼠模型 | 再生医学 | 脑卒中 | 单细胞RNA测序，3D细胞培养 | NA | 基因表达数据，细胞表型数据 | 3个iPSC细胞系，tMCAO小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7077 | 2025-10-06 |
Integrating multi-omics data to optimize immunotherapy in endometrial cancer: a comprehensive study
2025-Jun-20, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02978-2
PMID:40540226
|
研究论文 | 通过整合多组学数据研究子宫内膜癌患者对免疫治疗反应的分子机制和肿瘤微环境特征 | 首次综合运用多组学数据和多种计算框架系统分析子宫内膜癌免疫治疗反应差异，特别关注肿瘤相关巨噬细胞亚型的作用 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 优化子宫内膜癌免疫治疗策略 | 子宫内膜癌患者 | 生物信息学 | 子宫内膜癌 | 多组学分析,单细胞RNA测序,体细胞突变分析,拷贝数变异分析 | TIDE,EaSIeR,ImmunoPhenoScore,ESTIMATE,TIMER,EPIC,Scissor算法 | 基因组学数据,转录组学数据,单细胞测序数据 | 来自公共数据库的子宫内膜癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 7078 | 2025-10-06 |
In mice, discrete odors can selectively promote the neurogenesis of sensory neuron subtypes that they stimulate
2025-Jun-18, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.96152
PMID:40531183
|
研究论文 | 研究发现特定气味能选择性促进小鼠嗅觉感觉神经元亚型的神经发生 | 首次证明离散气味能特异性加速对其敏感的嗅觉神经元亚型的生成速率 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在其它哺乳动物验证 | 探究嗅觉刺激如何影响特定嗅觉感觉神经元亚型的神经发生 | 小鼠嗅觉感觉神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 亚型特异性神经元出生日期标记 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 7079 | 2025-10-06 |
The spatial and single-cell landscape of skin: Charting the multiscale regulation of skin immune function
2025-06, Seminars in immunology
IF:7.4Q1
DOI:10.1016/j.smim.2025.101958
PMID:40267702
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和空间转录组学技术在揭示皮肤免疫系统多尺度异质性方面的应用 | 整合单细胞和空间技术系统解析皮肤免疫景观的多尺度调控机制 | NA | 探讨皮肤免疫功能的分子和细胞特征及其空间调控机制 | 皮肤组织中的先天性和适应性免疫细胞 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 7080 | 2025-10-06 |
Selective inhibition of stromal mechanosensing suppresses cardiac fibrosis
2025-Jun, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-025-08945-9
PMID:40307543
|
研究论文 | 本研究通过抑制基质机械感受机制联合TGFβ通路调控，实现心脏成纤维细胞向静息状态的转化并缓解心脏纤维化 | 首次发现SRC激酶作为成纤维细胞富集的机械感受器，联合抑制SRC机械感受与TGFβ信号可产生协同抗纤维化效应 | 研究主要基于小鼠模型和工程化心脏组织，尚未在人类临床试验中验证 | 开发治疗心血管纤维化的机械治疗策略 | 心脏成纤维细胞和肌成纤维细胞 | 分子细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞测序分析，药理学抑制，工程化心脏组织模型 | 小鼠心力衰竭模型 | 转录组数据，形态学数据，代谢数据 | 公共人类和小鼠单细胞测序数据集的荟萃分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |