单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7416 篇文献，本页显示第 7041 - 7060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7041 | 2025-02-11 |
Key Considerations on CITE-Seq for Single-Cell Multiomics
2025-Feb-09, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.202400011
PMID:39924789
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综述 | 本文综述了CITE-Seq技术，一种同时分析单个细胞中基因表达和蛋白质丰度的先进单细胞测序方法 | 本文详细介绍了CITE-Seq的工作流程，并提供了使用抗体衍生标签（ADTs）染色细胞的关键考虑因素 | 本文主要基于微孔单细胞分析系统，可能不涵盖所有CITE-Seq应用场景 | 探讨CITE-Seq技术在单细胞多组学分析中的应用 | 单个细胞中的基因表达和蛋白质丰度 | 单细胞测序 | NA | CITE-Seq, 单细胞mRNA测序, 抗体衍生标签（ADTs） | NA | 基因表达数据, 蛋白质丰度数据 | NA |
| 7042 | 2025-02-11 |
Integration of single-cell and bulk RNA-sequencing data to construct and validate a signature based on NK cell marker genes to predict immunotherapy response and prognosis in colorectal cancer
2025-Feb-07, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01842-7
PMID:39920524
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研究论文 | 本研究旨在构建基于NK细胞标记基因的签名，以预测结直肠癌患者的免疫治疗反应和预后 | 通过整合单细胞RNA测序数据和TCGA结直肠癌样本的WGCNA分析，识别出NK细胞相关的核心基因和特征基因，并构建了一个新的预后签名 | 研究依赖于公开数据集，可能受到数据质量和样本选择的限制 | 预测结直肠癌患者的免疫治疗反应和预后 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），加权基因共表达网络分析（WGCNA） | LASSO回归分析 | RNA测序数据 | 587个TCGA结直肠癌样本，124和201个GEO验证样本 |
| 7043 | 2025-02-11 |
MiR-18a-LncRNA NONRATG-022419 pairs targeted PRG-1 regulates diabetic induced cognitive impairment by regulating NGF\BDNF-Trkb signaling pathway
2025-Feb-06, Proteome science
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12953-025-00239-2
PMID:39915794
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研究论文 | 本研究探讨了糖尿病诱导的认知功能障碍（DCD）中PRG-1的分子机制和细胞异质性，以及其在突触可塑性调节中的作用 | 揭示了PRG-1通过NGF/BDNF-Trkb信号通路在DCD中的突触可塑性调节作用，并发现了miR-18a-LncRNA NONRATG-022419对PRG-1的靶向调控 | 研究主要基于体外高糖诱导的HT22细胞损伤模型，尚未在体内模型中验证 | 探讨糖尿病诱导的认知功能障碍（DCD）的分子机制和细胞异质性，以及PRG-1在该过程中的功能作用 | 海马细胞、HT22细胞 | 分子生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RNA转录组分析 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 7044 | 2025-02-11 |
Retinoic acid antagonizes estrogen signaling to maintain adult uterine cell fate
2025-Feb-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2416089122
PMID:39874292
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研究论文 | 本研究通过遗传学证据揭示了视黄酸（RA）和雌激素信号在维持成年小鼠子宫上皮细胞命运中的拮抗作用 | 首次提供了RA和雌激素信号在维持成年子宫上皮细胞命运中拮抗作用的遗传学证据，并揭示了RA信号缺失导致的细胞命运转变和免疫细胞浸润 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探讨RA和雌激素信号在维持成年子宫上皮细胞命运中的作用 | 小鼠子宫上皮细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三种相关小鼠遗传模型 |
| 7045 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of human blood eosinophils reveals plasticity and absence of canonical cell subsets
2025-Feb, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16213
PMID:38934897
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7046 | 2025-02-10 |
Single-cell Sequencing Traces Mitochondrial Transfers
2025-Jan-15, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae092
PMID:39724171
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7047 | 2025-02-10 |
Hypoxia regulates small extracellular vesicle biogenesis and cargo sorting through HIF-1α/HRS signaling pathway in head and neck squamous cell carcinoma
2025-Mar, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111546
PMID:39631619
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研究论文 | 本研究探讨了缺氧条件下头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）细胞中小细胞外囊泡（sEVs）的生物生成和货物分选的机制 | 揭示了缺氧通过HIF-1α/HRS信号通路调控sEVs生物生成和货物分选的新机制 | 研究主要集中于HNSCC细胞，未涉及其他类型癌症细胞 | 研究缺氧对头颈部鳞状细胞癌中小细胞外囊泡生物生成和货物分选的影响 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）细胞 | 细胞生物学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 空间转录组学和免疫组织化学 | NA | 细胞实验数据 | NA |
| 7048 | 2025-02-09 |
Immune mechanisms in multiple sclerosis: CD3 levels on CD28+ CD4+ T cells link antibody responses to human herpesvirus 6
2025-Mar, Cytokine
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cyto.2025.156866
PMID:39884183
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化分析探讨了抗体介导的免疫反应与多发性硬化症（MS）之间的联系，并揭示了CD28+ CD4+ T细胞上CD3水平通过改变人类疱疹病毒6（HHV-6）的比例对MS进展的影响 | 揭示了CD28+ CD4+ T细胞上CD3水平通过改变HHV-6比例对MS进展的影响，为HHV-6介导的MS生物学机制提供了新的见解 | 抗体介导的免疫反应与MS之间的确切因果关系仍不明确 | 探讨抗体介导的免疫反应与多发性硬化症（MS）之间的关联，并识别可能参与MS发病和进展的特定感染病原体 | 多发性硬化症（MS）患者和对照组 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞测序，孟德尔随机化分析 | NA | 基因表达数据 | MS患者和对照组 |
| 7049 | 2025-02-09 |
Massively parallel flow-cytometry-based screening of hematopoietic lineage cell populations from up to 25 donors simultaneously
2025-Feb, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2024.11.014
PMID:39608688
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研究论文 | 本研究旨在开发一种方法，允许对造血来源细胞表面标记进行高维度和技术统一的筛选 | 该方法能够在技术上统一的方式下筛选数百万细胞上的数百个标记，从而识别和表征稀有细胞群体的变化 | 虽然该方法能够处理大量细胞，但对于极低丰度的细胞群体，仍可能遗漏某些调控异常 | 开发一种高维度且技术统一的细胞表面标记筛选方法，以识别和表征稀有细胞群体的变化 | 造血来源的细胞群体 | 生物信息学 | NA | 流式细胞术、单细胞RNA测序（RNAseq） | 机器学习算法 | 细胞表面标记数据 | 25个供体的细胞样本 |
| 7050 | 2025-02-09 |
MetaLigand: A database for predicting non-peptide ligand mediated cell-cell communication
2025-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.14.633094
PMID:39868215
|
研究论文 | 本文介绍了MetaLigand，一个基于R语言和网络访问的工具，用于预测非肽配体介导的细胞间通讯 | MetaLigand通过整合自动管道和手动整理的数据，提高了预测非肽配体丰度的准确性，并支持单细胞RNA测序和空间转录组数据 | NA | 研究非肽配体在细胞间通讯中的作用，并开发工具预测其生产和受体相互作用 | 非肽配体（NPLs）及其受体 | 生物信息学 | 年龄相关性黄斑变性 | RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 233种非肽配体 |
| 7051 | 2025-02-08 |
Creatine promotes endometriosis progression by inducing M2 polarization of peritoneal macrophages
2025-Mar-01, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-24-0278
PMID:39679878
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研究论文 | 本研究揭示了肌酸（CR）通过诱导腹膜巨噬细胞的M2极化，促进子宫内膜异位症（EM）的血管生成、纤维化和病变进展，为潜在的治疗策略提供了新的见解 | 首次发现肌酸在子宫内膜异位症中通过诱导腹膜巨噬细胞的M2极化，促进病变进展，为治疗提供了新的靶点 | 研究主要基于体外实验，需要进一步的体内实验验证 | 探讨肌酸在子宫内膜异位症中的作用机制 | 子宫内膜异位症患者的腹膜巨噬细胞 | NA | 子宫内膜异位症 | 单细胞测序、RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 子宫内膜异位症患者与无病女性的腹膜巨噬细胞 |
| 7052 | 2025-02-08 |
TEAD3 and TEAD4 play overlapping role in bovine preimplantation development
2025-Mar-01, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-24-0307
PMID:39679917
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研究论文 | 本研究探讨了TEAD3和TEAD4在牛胚胎植入前发育中对滋养外胚层命运决定的重叠作用 | 揭示了TEAD3和TEAD4在牛胚胎植入前发育中的冗余功能，与小鼠模型中的发现形成对比 | 研究仅限于牛胚胎，未涉及其他哺乳动物 | 确定TEAD3在牛胚胎植入前发育中的功能角色 | 牛胚胎植入前发育 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序、RNA干扰、碱基编辑技术 | NA | RNA测序数据、免疫荧光数据 | 未明确提及样本数量 |
| 7053 | 2025-02-08 |
GALNT5 promotes migration and invasion of pancreatic ductal adenocarcinoma cells by activating Erk signaling pathway
2025-Mar, Biochimica et biophysica acta. General subjects
DOI:10.1016/j.bbagen.2025.130769
PMID:39870120
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研究论文 | 本文研究了GALNT5在胰腺导管腺癌（PDAC）中的迁移和侵袭作用及其机制 | 首次发现GALNT5通过激活Erk信号通路促进PDAC细胞的迁移和侵袭 | 未涉及GALNT5在其他类型癌症中的作用 | 探讨GALNT5在PDAC中的功能及其分子机制 | 胰腺导管腺癌细胞 | 癌症研究 | 胰腺癌 | RNA-Seq, 单细胞测序 | NA | RNA-Seq数据, 单细胞测序数据 | TCGA和GTEx数据库中的RNA-Seq数据, 公开可用的单细胞测序数据 |
| 7054 | 2025-02-08 |
A novel protein encoded by porcine circANKRD17 activates the PPAR pathway to regulate intramuscular fat metabolism
2025-Feb-05, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-025-01153-5
PMID:39905551
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研究论文 | 本研究通过circRNA-seq和Ribo-seq数据筛选出具有编码潜力的circRNA候选物，发现circANKRD17在Lantang猪的长背肌中显著升高，并通过单细胞测序和脂质组学分析揭示了其在脂质代谢中的调控机制 | 首次发现circANKRD17具有开放阅读框并能翻译成一种新型571氨基酸蛋白质，该蛋白质通过PPAR途径调控脂质代谢 | 研究主要集中于Lantang和Landrace猪品种，未涉及其他猪品种或物种 | 探索circRNA在脂质代谢中的调控机制，特别是与肌肉内脂肪含量相关的代谢特性 | Lantang和Landrace猪的长背肌细胞 | 分子生物学 | NA | circRNA-seq, Ribo-seq, 单细胞测序, 脂质组学分析 | NA | RNA序列数据, 单细胞数据, 脂质组数据 | 18个circRNA候选物, 477个差异表达基因 |
| 7055 | 2025-02-08 |
Early downmodulation of tumor glycolysis predicts response to fasting-mimicking diet in triple-negative breast cancer patients
2025-Feb-04, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2024.11.004
PMID:39694040
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研究论文 | 本研究探讨了周期性模拟禁食饮食（FMD）在三阴性乳腺癌（TNBC）患者中的抗肿瘤活性和疗效，特别是在与术前化疗结合使用时 | 首次在早期TNBC患者中展示了严重热量限制的周期性FMD与术前化疗结合使用的高病理完全缓解率（pCR）和长期临床结果 | 研究样本量较小（30名患者），需要更大规模的临床试验来验证结果 | 评估周期性FMD在早期TNBC患者中的疗效，并验证肿瘤内糖酵解的早期变化作为营养限制临床益处的预测因子 | 早期三阴性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 30名早期TNBC患者 |
| 7056 | 2025-02-08 |
CD4+ Effector Memory T Cells Related Marker Gene Signatures in Osteoporosis and Aging: Insight From Single-Cell Analysis and Mendelian Randomization
2025-Feb-04, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析和孟德尔随机化方法，探讨了骨质疏松症（OP）与衰老之间的关系及其共享的分子机制 | 首次通过单细胞数据整合和孟德尔随机化分析，识别出CD4+效应记忆T细胞（CD4+ TEM）在OP和衰老样本中的核心作用，并揭示了KLRB1、NR4A2和S100A4基因与OP的因果关系 | 研究主要基于单细胞数据和动物模型，仍需进一步临床验证 | 探讨骨质疏松症与衰老之间的关系及其分子机制 | 骨质疏松症患者、衰老个体和健康对照者的外周血单细胞数据 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、孟德尔随机化（MR）、RT-qPCR | NA | 单细胞RNA测序数据 | 骨质疏松症患者、衰老个体和健康对照者的外周血样本 |
| 7057 | 2025-02-08 |
SLAM-seq reveals independent contributions of RNA processing and stability to gene expression in African trypanosomes
2025-Jan-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae1203
PMID:39673807
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研究论文 | 本文通过开发代谢RNA标记方法和结合超短代谢标记与瞬时转录组测序（TT-seq），研究了非洲锥虫中基因表达的控制，特别是RNA加工和降解对总mRNA水平的独立贡献 | 开发了高效的代谢RNA标记方法SLAM-seq，首次在非洲锥虫中全局量化RNA加工速率和半衰期，揭示了RNA加工和稳定性对总mRNA水平的独立影响 | 研究主要集中于非洲锥虫，结果可能不直接适用于其他生物体 | 探讨非洲锥虫中基因表达的控制机制，特别是RNA加工和降解的作用 | 非洲锥虫（Trypanosoma brucei） | 分子生物学 | NA | SLAM-seq, TT-seq, scRNA-seq | NA | RNA测序数据 | NA |
| 7058 | 2025-02-08 |
RGS10 Deficiency Alleviated Intestinal Mucosal Inflammation Through Suppression of Th1/Th17 Cell Immune Responses in Ulcerative Colitis
2025-01, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13869
PMID:39428350
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研究论文 | 本研究探讨了RGS10在溃疡性结肠炎（UC）中的作用，发现RGS10缺乏通过抑制Th1/Th17细胞介导的免疫反应减轻肠道黏膜炎症 | 首次揭示了RGS10在UC中的具体作用机制，特别是其通过抑制STAT1和STAT3的磷酸化来阻断Th1和Th17细胞的分化 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 研究RGS10在溃疡性结肠炎中的作用及其机制 | 溃疡性结肠炎患者和小鼠模型 | 免疫学 | 溃疡性结肠炎 | qRT-PCR, 蛋白质印迹, 免疫组化, 免疫荧光分析, 单细胞RNA测序, 酶联免疫吸附试验, 流式细胞术 | RGS10基因敲除小鼠 | 基因表达数据, 蛋白质数据 | UC患者和健康对照的样本 |
| 7059 | 2025-02-08 |
Improving doublet cell removal efficiency through multiple algorithm runs
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.01.009
PMID:39911841
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研究论文 | 本研究提出了一种多轮双细胞去除（MRDR）策略，通过多次运行算法来有效减少随机性，提高双细胞去除的效果 | 提出了一种新的多轮双细胞去除策略，通过多次运行算法来减少随机性，提高双细胞去除的效果 | 未提及具体局限性 | 提高单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中双细胞去除的效率 | 14个真实世界数据集、29个条形码scRNA-seq数据集和106个合成数据集 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 14个真实世界数据集、29个条形码scRNA-seq数据集和106个合成数据集 |
| 7060 | 2025-02-07 |
Loss of 18q Alters TGFβ Signalling Affecting Anteroposterior Neuroectodermal Fate in Human Embryonic Stem Cells
2025-Feb-05, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13813
PMID:39908990
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研究论文 | 本文研究了染色体18q缺失如何影响人类胚胎干细胞（hESCs）向视网膜祖细胞分化的能力，并探讨了TGFβ信号通路在此过程中的作用 | 首次揭示了18q缺失通过影响TGFβ信号通路，导致hESCs在前后神经外胚层命运决定中的异常 | 研究仅限于实验室条件下的hESCs，未涉及体内环境或临床样本 | 探究染色体异常对hESCs分化能力的影响，特别是18q缺失对神经外胚层命运决定的作用 | 人类胚胎干细胞（hESCs） | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具有复杂核型的hESCs细胞系 |