单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7416 篇文献，本页显示第 7001 - 7020 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 7001 | 2025-02-14 |
Multiplexing cortical brain organoids for the longitudinal dissection of developmental traits at single-cell resolution
2025-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02555-5
PMID:39653820
|
研究论文 | 本文开发并验证了多重化大脑类器官的策略，用于高分辨率解析神经发育轨迹，并链接特定个体的轨迹与遗传变异 | 开发了新的计算方法和多重化策略，包括SCanSNP和共识调用，以解决双细胞和低质量细胞识别的关键问题 | NA | 为大脑疾病和神经多样性建模提供高度可扩展的资源 | 大脑类器官 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | SCanSNP | 单细胞RNA测序数据 | 多个多能干细胞（PSC）系 |
| 7002 | 2025-02-14 |
iFlpMosaics enable the multispectral barcoding and high-throughput comparative analysis of mutant and wild-type cells
2025-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02534-w
PMID:39672980
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研究论文 | 本文介绍了一种名为iFlpMosaics的工具包，用于在相同时间窗口和组织微环境中对多种荧光标记的野生型和Cre突变细胞进行重组酶依赖的比例诱导和单细胞克隆追踪 | iFlpMosaics工具包提供了新的遗传工具和小鼠品系，能够在相同时间窗口和组织微环境中对多种荧光标记的野生型和Cre突变细胞进行重组酶依赖的比例诱导和单细胞克隆追踪 | 当前技术在小鼠中诱导遗传嵌合体时缺乏准确性、通量或条形码多样性 | 研究基因功能及其在组织发育、稳态和疾病中对单个细胞生物学的影响 | 野生型和Cre突变细胞 | 生物医学 | NA | 多光谱成像、荧光激活流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 图像、RNA测序数据 | NA |
| 7003 | 2025-02-09 |
Unveiling heterogeneity in rare cells by combining RNA-based sorting and scRNA-seq
2025-Feb, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-024-02073-2
PMID:39920268
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7004 | 2025-02-14 |
The quality of SIV-specific fCD8 T cells limits SIV RNA production in Tfh cells during antiretroviral therapy
2025-Jan-31, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.00812-24
PMID:39641620
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研究论文 | 本文研究了在慢性持续性HIV/SIV感染中，SIV特异性fCD8 T细胞对Tfh细胞中SIV RNA产生的影响 | 首次揭示了在cART治疗或自然控制者中，SIV-Gag特异性fCD8 T细胞频率与Tfh细胞中SIV RNA量的负相关关系，并通过scRNA-seq分析了不同条件下SIV-Gag特异性fCD8 T细胞的基因表达模式 | 研究样本量较小，仅涉及15只猕猴，且未探讨fCD8 T细胞功能改善的具体机制 | 探讨SIV特异性fCD8 T细胞在慢性HIV/SIV感染中对潜伏感染细胞的影响 | 15只感染SIVmac239的猕猴 | 免疫学 | HIV/SIV感染 | scRNA-seq, 组织切片分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 组织切片数据 | 15只猕猴（8只进展者，7只自然控制者） |
| 7005 | 2025-02-14 |
Single-cell profiling of SLC family transporters: uncovering the role of SLC7A1 in osteosarcoma
2025-Jan-22, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06086-1
PMID:39844299
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研究论文 | 本文通过单细胞测序和RNA-seq数据分析，揭示了SLC7A1在骨肉瘤中的关键作用，并构建了SLC相关的预后模型 | 首次在单细胞水平上揭示了SLC家族转运蛋白在骨肉瘤中的表达模式，并发现SLC7A1在骨肉瘤细胞中的关键作用及其与免疫微环境的相互作用 | 研究主要基于体外实验和数据分析，缺乏体内实验验证 | 探索SLC家族转运蛋白在骨肉瘤中的表达模式及其在肿瘤进展中的作用 | 骨肉瘤细胞和免疫微环境 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞测序, RNA-seq, LASSO回归分析, 虚拟对接 | LASSO回归模型 | 单细胞测序数据, RNA-seq数据 | GSE152048, GSE162454, TARGET和GSE21257队列的数据 |
| 7006 | 2025-02-14 |
Integrative multi-omics analysis for identifying novel therapeutic targets and predicting immunotherapy efficacy in lung adenocarcinoma
2025, Cancer drug resistance (Alhambra, Calif.)
DOI:10.20517/cdr.2024.91
PMID:39935429
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析，识别了肺腺癌的新型治疗靶点并预测了免疫治疗的疗效 | 采用单细胞RNA测序、批量转录组分析和全基因组关联研究数据，结合贝叶斯反卷积和机器学习算法，全面表征了肺腺癌的肿瘤微环境，并开发了稳健的预后模型 | 研究依赖于多个患者队列的数据整合，可能存在样本异质性问题 | 识别肺腺癌的新型细胞亚群和分子亚型，探索潜在治疗靶点以提高治疗效果和患者预后 | 肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量转录组分析、全基因组关联研究（GWAS） | 贝叶斯反卷积、机器学习算法 | RNA测序数据、基因组数据 | 多个肺腺癌患者队列 |
| 7007 | 2025-02-14 |
Exploring Core Genes Associated with Sepsis and Systemic Inflammatory Response Syndrome Using Single-Cell Sequencing Technology
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S448900
PMID:39935525
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术分析脓毒症死亡和全身炎症反应综合征（SIRS）患者的单细胞转录组数据，以识别免疫反应中的独特标志物和模式 | 通过UMAP细胞聚类揭示了血液样本中四种主要细胞类型的十二个细胞簇的状态，以及死亡患者和SIRS患者之间主要细胞群体的差异，为早期诊断和治疗提供了新的理论框架 | 研究中未提及样本的具体数量，可能影响结果的普遍性 | 探索与脓毒症和全身炎症反应综合征相关的核心基因，以改善疾病的早期检测和识别 | 脓毒症死亡患者和全身炎症反应综合征（SIRS）患者的血液样本 | 数字病理 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 未提及具体样本数量 |
| 7008 | 2025-02-14 |
Single-cell sequencing reveals cell heterogeneity and aberrantly activated pathways associated with microvascular invasion in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1449624
PMID:39944086
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据，深入分析了肝细胞癌（HCC）中微血管侵犯（MVI）相关的细胞异质性和异常激活的信号通路 | 首次在单细胞水平上揭示了MVI阳性恶性细胞的分子特征和功能异质性，并识别了与MVI相关的特定恶性细胞亚型和关键基因MARCKSL1 | 样本量较小，仅涉及5名患者的肿瘤组织和邻近非肿瘤组织，未来研究需要进一步验证MARCKSL1在MVI进展中的作用 | 探索肝细胞癌中微血管侵犯的细胞异质性、相关生物标志物及细胞间信号相互作用 | 肝细胞癌患者的肿瘤组织和邻近非肿瘤组织 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 5名肝细胞癌患者的肿瘤组织和邻近非肿瘤组织，其中3名患者表现出微血管侵犯 |
| 7009 | 2025-02-13 |
Single-cell sequencing of peripheral blood mononuclear cells reveals immune landscape of monkeypox patients with HIV
2025-Dec, Emerging microbes & infections
IF:8.4Q1
DOI:10.1080/22221751.2025.2459136
PMID:39868995
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了猴痘病毒（MPXV）感染患者的外周血单核细胞，揭示了HIV感染者与非感染者的免疫景观差异 | 首次使用单细胞RNA测序技术详细描绘了HIV感染与非感染猴痘患者的免疫细胞表型和基因表达差异，揭示了HIV感染者病情严重的潜在机制 | 样本量较小，仅包括6名患者，可能影响结果的普遍性 | 研究猴痘病毒在HIV感染与非感染患者中的免疫病理学机制 | 猴痘病毒感染患者的外周血单核细胞 | 生物信息学 | 猴痘 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列数据 | 6名患者（3名HIV+，3名HIV-） |
| 7010 | 2025-02-13 |
A single-cell transcriptome analysis reveals astrocyte heterogeneity and identifies CHI3L1 as a diagnostic biomarker in Parkinson's disease
2025-Feb-15, Heliyon
IF:3.4Q1
DOI:10.1016/j.heliyon.2025.e42051
PMID:39931480
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了帕金森病中星形胶质细胞的异质性，并发现CHI3L1可能作为帕金森病的诊断生物标志物 | 首次在单细胞水平上揭示了帕金森病中星形胶质细胞的异质性，并识别出CHI3L1作为潜在的诊断标志物 | 研究主要基于公开的GEO数据库数据，缺乏独立验证队列 | 识别帕金森病中星形胶质细胞的异质性并研究与其分化轨迹相关的基因 | 帕金森病患者和正常样本中的星形胶质细胞 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞转录组分析, qRT-PCR, Western Blot | Monocle2, AUCell | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量，但包括帕金森病患者和正常样本 |
| 7011 | 2025-02-13 |
Integrative Multi-omics Analysis and Mendelian Randomization Reveal Potential Therapeutic Targets and their Stratification in Lung Squamous Cell Carcinoma
2025-Feb-06, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学分析和孟德尔随机化方法，识别了肺鳞状细胞癌（LUSC）的潜在治疗靶点，并对其进行了分层 | 结合了bulk RNA测序、WGCNA、生存分析、孟德尔随机化、LASSO回归、PPI网络分析、免疫浸润评估、单细胞RNA测序和伪时间分析等多种技术手段，全面探索了LUSC的治疗靶点 | 未提及具体样本量，可能影响结果的普适性 | 识别肺鳞状细胞癌（LUSC）的新型治疗靶点，以改善其治疗策略 | 肺鳞状细胞癌（LUSC） | 数字病理 | 肺癌 | bulk RNA测序、WGCNA、孟德尔随机化、LASSO回归、PPI网络分析、单细胞RNA测序、伪时间分析 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 7012 | 2025-02-13 |
Integrative mapping of human CD8+ T cells in inflammation and cancer
2025-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02530-0
PMID:39614111
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scAtlasVAE的深度学习模型，用于整合大规模单细胞RNA测序数据并进行跨图谱比较，构建了一个广泛的人类CD8 T细胞图谱 | 开发了scAtlasVAE模型，能够整合大规模单细胞RNA测序数据，构建了包含1,151,678个细胞的人类CD8 T细胞图谱，揭示了不同细胞亚型之间的联系及其表型和功能转变 | NA | 研究人类CD8 T细胞在炎症和癌症中的克隆景观和动态变化 | 人类CD8 T细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | VAE（变分自编码器） | 单细胞RNA测序数据 | 1,151,678个细胞，来自961个样本，涵盖68项研究和42种疾病条件 |
| 7013 | 2024-12-01 |
Human CD8+ T cell map with single-cell transcriptome and TCR information
2025-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02529-7
PMID:39614112
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7014 | 2024-12-01 |
Publisher Correction: Massively parallel single-cell sequencing of diverse microbial populations
2025-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02570-6
PMID:39614113
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 7015 | 2025-02-13 |
Capture of Totipotency in Mouse Embryonic Stem Cells in the Absence of Pdzk1
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202408852
PMID:39630006
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研究论文 | 本研究通过删除单个基因Pdzk1，在胚胎干细胞（ESCs）中建立了全能性 | 首次通过删除Pdzk1基因在胚胎干细胞中实现全能性，突破了胚胎和胚胎外组织之间的屏障 | 研究仅限于小鼠胚胎干细胞，尚未在人类细胞中验证 | 探索胚胎干细胞的全能性扩展及其分化潜能 | 小鼠胚胎干细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组分析，bulk RNA-seq | NA | RNA-seq数据 | NA |
| 7016 | 2025-02-13 |
SYISL Knockout Promotes Embryonic Muscle Development of Offspring by Modulating Maternal Gut Microbiota and Fetal Myogenic Cell Dynamics
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202410953
PMID:39680624
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研究论文 | 本研究探讨了SYISL基因敲除如何通过调节母体肠道微生物群和胎儿肌源性细胞动态来促进胚胎肌肉发育 | 揭示了SYISL基因敲除通过改变母体肠道微生物群组成和提高胚胎血清中的丁酸水平，进而通过丁酸-HDAC-H3K9ac/H3K27ac途径调节肌肉生成的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类或其他动物模型中进行验证 | 探讨SYISL基因敲除对胚胎肌肉发育的影响及其机制 | 小鼠胚胎 | 生物医学 | 肌肉疾病 | RNA-seq, ChIP-seq, scRNA-seq | 小鼠模型 | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 7017 | 2025-02-13 |
Mesenchymal Stem Cells Prevent SLC39A14-Dependent Hepatocyte Ferroptosis through Exosomal miR-16-5p in Liver Graft
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202411380
PMID:39680749
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研究论文 | 本文研究了间充质干细胞通过外泌体miR-16-5p预防肝移植中SLC39A14依赖的肝细胞铁死亡 | 首次发现SLC39A14在肝移植中的促铁死亡作用，并揭示了hBMSCs通过外泌体miR-16-5p下调SLC39A14表达的治疗机制 | 未提及具体样本量及实验设计的局限性 | 探究肝移植中肝细胞损伤的机制及间充质干细胞的治疗作用 | 肝移植中的肝细胞及人骨髓来源的间充质干细胞 | 生物医学 | 肝移植相关疾病 | 单细胞RNA测序分析 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 7018 | 2025-02-13 |
Aberrant Chitinase 3-Like 1 Expression in Basal Cells Contributes to Systemic Sclerosis Fibrosis
2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202310169
PMID:39686726
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了系统性硬化症（SSc）中基底细胞异常表达的几丁质酶3样1（Chi3L1）在纤维化过程中的作用，并探讨了其作为潜在生物标志物和治疗靶点的可能性 | 首次在SSc患者中识别出高表达Chi3L1的基底细胞亚群，并揭示了Chi3L1通过IL-17RA介导的纤维化机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步在人体临床试验中验证Chi3L1和IL-17RA作为治疗靶点的有效性和安全性 | 探讨系统性硬化症纤维化的分子机制，并寻找潜在的治疗靶点 | 系统性硬化症患者的皮肤细胞和小鼠模型 | 生物医学研究 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | RNA测序数据 | SSc患者和健康对照的皮肤细胞样本 |
| 7019 | 2025-02-13 |
A Bi-Specific T Cell-Engaging Antibody Shows Potent Activity, Specificity, and Tumor Microenvironment Remodeling in Experimental Syngeneic and Genetically Engineered Models of GBM
2025-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.18.628714
PMID:39763755
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研究论文 | 本文研究了一种双特异性T细胞接合抗体（BTE）在实验性同源和基因工程胶质母细胞瘤（GBM）模型中的活性、特异性及肿瘤微环境重塑效果 | 在具有完整免疫系统的原位和基因工程小鼠模型中评估BTE的功能，填补了以往研究主要在免疫缺陷动物模型中进行的空白 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证 | 探讨BTE在胶质母细胞瘤中的治疗机制和效果 | 胶质母细胞瘤（GBM） | 生物医学 | 胶质母细胞瘤 | 多色流式细胞术、单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、多重免疫荧光、多参数磁共振成像（MRI） | NA | 实验数据 | 多个GBM临床前模型中的小鼠 |
| 7020 | 2025-02-13 |
TGFBR2 High mesenchymal glioma stem cells phenocopy regulatory T cells to suppress CD4+ and CD8+ T cell function
2025-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.07.631757
PMID:39829747
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研究论文 | 本研究通过多方面的分析方法，揭示了TGFBR2高表达的间充质胶质瘤干细胞（GSCs）通过模仿调节性T细胞（Tregs）来抑制CD4+和CD8+ T细胞功能的机制 | 首次发现并描述了TGFBR2驱动的免疫抑制性GSC状态，并确定了其与TGF-β II型受体的特异性关联 | 研究主要基于体外实验和患者来源的细胞，尚未在体内模型中验证这些发现 | 探索胶质母细胞瘤（GBM）中肿瘤微环境的免疫抑制机制，特别是GSCs在其中的作用 | 胶质母细胞瘤中的间充质胶质瘤干细胞（GSCs） | 肿瘤免疫学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞测序，生物信息学分析，分子和药理学操作 | NA | 临床和实验数据集，单细胞测序数据 | 患者来源的GBM神经球和临床GBM标本 |