单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 10776 篇文献，本页显示第 6981 - 7000 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6981 | 2025-10-06 |
Molecular Fingerprint of Endocannabinoid Signaling in the Developing Paraventricular Nucleus of the Hypothalamus as Revealed by Single-Cell RNA-Seq and In Situ Hybridization
2025-05-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14110788
PMID:40497964
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和原位杂交技术揭示了小鼠下丘脑室旁核发育过程中内源性大麻素信号传导的分子特征 | 首次在分子定义的神经元和星形胶质细胞中绘制了2-AG和AEA信号传导的时空图谱，发现了从Dagla到Daglb的发育转换 | 研究仅限于小鼠模型，且某些大麻素受体亚型的mRNA未能检测到 | 阐明下丘脑室旁核发育过程中内源性大麻素信号传导的纳米结构 | 小鼠胚胎期和出生后发育阶段的下丘脑室旁核神经元和星形胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 原位杂交, 免疫组织化学 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | 小鼠胚胎期和出生后发育阶段的脑组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6982 | 2025-10-06 |
The cGAS/STING Pathway: Friend or Foe in Regulating Cardiomyopathy
2025-05-25, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14110778
PMID:40497954
|
综述 | 本文系统探讨cGAS/STING信号通路在心肌病炎症调控中的双重作用及治疗潜力 | 整合单细胞RNA测序数据与系统文献综述，揭示cGAS/STING通路在心肌病中的调控机制和潜在治疗靶点 | cGAS/STING通路在心肌病中的具体分子机制仍不明确且存在争议，需未来研究验证 | 阐明cGAS/STING信号通路在心肌病炎症反应中的调控作用及治疗干预策略 | 心肌病相关的炎症机制和cGAS/STING信号通路 | 自然语言处理 | 心肌病 | 单细胞RNA测序, 文献综述 | NA | 文本数据, 测序数据 | 公开可用的人类单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6983 | 2025-10-06 |
Dynamic Expression and Functional Implications of the Cell Polarity Gene, Dchs1, During Cardiac Development
2025-05-24, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14110774
PMID:40497950
|
研究论文 | 本研究通过构建Dchs1-HA敲入小鼠模型，揭示了Dchs1在心脏发育过程中的动态表达模式和功能意义 | 首次系统阐明Dchs1在心脏发育中的时空表达模式及其在非心肌细胞间的极性延伸和细胞间通讯作用 | 研究主要基于小鼠模型，在人类心脏发育中的直接应用仍需进一步验证 | 探究Dchs1在心脏发育过程中的表达模式和功能机制 | Dchs1-HA敲入小鼠模型的心脏组织 | 发育生物学 | 先天性心脏病 | 免疫组织化学、Western blotting、单细胞转录组学 | NA | 图像数据、蛋白质印迹数据、单细胞转录组数据 | 不同发育阶段的小鼠心脏组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6984 | 2025-10-06 |
Tyrosinase in melanoma inhibits anti-tumor activity of PD-1 deficient T cells
2025-May-15, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02237-4
PMID:40375241
|
研究论文 | 本研究通过CRISPR/Cas9技术敲除黑色素瘤中的酪氨酸酶，发现其能抑制T细胞的抗肿瘤活性，并揭示了酪氨酸酶缺失可逆转免疫冷肿瘤表型 | 首次发现酪氨酸酶在黑色素瘤中抑制T细胞抗肿瘤活性，并证明其缺失可增强PD-1缺陷T细胞的抗肿瘤效果 | 研究基于小鼠B16黑色素瘤模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探索黑色素瘤抵抗免疫治疗的分子机制 | B16黑色素瘤细胞、T细胞、PD-1缺陷小鼠 | 肿瘤免疫学 | 黑色素瘤 | CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | 小鼠黑色素瘤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6985 | 2025-10-06 |
CAF-derived exosomal LINC01711 promotes breast cancer progression by activating the miR-4510/NELFE axis and enhancing glycolysis
2025-Apr-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202402024RRR
PMID:40172996
|
研究论文 | 本研究揭示了乳腺癌相关成纤维细胞通过外泌体传递LINC01711激活miR-4510/NELFE轴，从而增强乳腺癌细胞糖酵解和恶性进展的分子机制 | 首次发现CAF来源外泌体中的LINC01711通过miR-4510/NELFE轴调控TXN表达并促进糖酵解的新机制 | NA | 探索乳腺癌微环境中CAF通过外泌体lncRNA促进肿瘤进展的分子机制 | 乳腺癌细胞、癌症相关成纤维细胞(CAF)及其外泌体 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 单细胞测序、降维分析、聚类分析、细胞注释 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6986 | 2025-10-06 |
A Potential Contribution of S100A11 to Skin Fibrosis and Pulmonary Involvement in Systemic Sclerosis
2025-Jan, Experimental dermatology
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/exd.70026
PMID:40525602
|
研究论文 | 本研究探讨了S100A11在系统性硬化症皮肤纤维化和肺部受累中的潜在作用 | 首次发现S100A11在SSc真皮成纤维细胞中高表达，且血清水平与皮肤厚度评分和间质性肺病参数相关 | 研究样本量有限，需要进一步功能实验验证S100A11的具体作用机制 | 探究S100A11在系统性硬化症纤维化过程中的潜在病理生理作用 | 系统性硬化症患者皮肤标本和血清样本 | 病理学 | 系统性硬化症 | 免疫组织化学染色,单细胞RNA测序,酶联免疫吸附试验 | NA | 组织图像,基因表达数据,血清蛋白水平数据 | 系统性硬化症患者和健康对照的皮肤标本及血清样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6987 | 2025-10-06 |
Suppression of the Prostaglandin I2-Type 1 Interferon Axis Induces Extramedullary Hematopoiesis to Promote Cardiac Repair After Myocardial Infarction
2025-Jun-17, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 本研究揭示了前列腺素I2-1型干扰素轴在心肌梗死后脾脏髓外造血中的调控作用及其对心脏修复的影响 | 首次发现PGI2通过IP-cAMP-SP1级联反应抑制脾脏髓外造血，并阐明1型干扰素信号缺失可增强心肌梗死诱导的脾脏髓外造血 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究脾脏髓外造血在心肌梗死后心脏修复中的作用机制 | Tcf21CreER Scfflox/flox心肌梗死小鼠模型、GFP+造血干细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 流式细胞术、液相色谱-串联质谱、单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、脂质组学数据、单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6988 | 2025-10-06 |
LARP7 Protects Vascular Smooth Muscle Cell Contractile Phenotype in CKD by Coupling with P300
2025-Jun-16, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000761
PMID:40522739
|
研究论文 | 本研究揭示了LARP7通过耦合P300维持血管平滑肌细胞收缩表型并减轻慢性肾病相关血管病变的新机制 | 首次发现LARP7作为内源性正向调节因子，通过增强P300组蛋白乙酰转移酶活性和H3K27乙酰化来维持VSMC收缩表型 | NA | 探究LARP7在维持血管平滑肌细胞收缩表型和减轻慢性肾病相关血管病变中的作用机制 | 血管平滑肌细胞、慢性肾病患者和小鼠模型 | 分子生物学 | 慢性肾病、血管钙化、动脉粥样硬化 | 单细胞RNA测序、免疫染色分析、功能获得和缺失实验 | NA | 基因表达数据、蛋白质相互作用数据 | 慢性肾病患者和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6989 | 2025-10-06 |
Role for Complement C5 in Eosinophilic Inflammation of Severe Asthma
2025-Jun-16, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16616
PMID:40524528
|
研究论文 | 本研究通过痰液蛋白质组学分析探讨补体C5在重度哮喘嗜酸性粒细胞炎症中的作用 | 首次通过蛋白质组学方法确定补体C5与嗜酸性粒细胞炎症的直接关联，并发现巨噬细胞是C5的主要来源 | 样本量有限，主要依赖痰液蛋白质组学数据，需要更大规模研究验证 | 阐明补体系统特别是C5在重度哮喘发病机制中的作用 | 重度哮喘患者和健康对照者，以及哮喘小鼠模型 | 生物医学研究 | 哮喘 | 数据依赖性采集质谱、加权基因共表达网络分析(WGCNA)、单细胞RNA测序、免疫荧光染色 | NA | 蛋白质组学数据、RNA测序数据、临床生理数据 | 重度哮喘患者和健康对照者（具体数量未明确说明） | NA | 质谱分析、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6990 | 2025-10-06 |
Loss of N-6 adenine-specific DNA methyltransferase 1 leads to meiotic prophase abnormalities and male sub-fertility in mice†
2025-Jun-15, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf052
PMID:40079145
|
研究论文 | 本研究揭示了N6AMT1在小鼠精子发生过程中对减数分裂进程的关键调控作用 | 首次证明N6AMT1通过调控减数分裂性染色体失活和DNA双链断裂修复影响雄性生育能力 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探究N6AMT1在精子发生过程中的功能机制 | 小鼠生殖细胞和精子发生过程 | 生殖生物学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 染色体铺展分析 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 转录组数据 | N6amt1基因敲除小鼠及其对照 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6991 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics identify a chemotherapy-resistance related cluster overexpressed CLIC3 in ovarian cancer
2025-Jun-14, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02882-9
PMID:40515890
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学识别卵巢癌中与化疗耐药相关的细胞亚群及其关键标志物CLIC3 | 首次在单细胞水平识别出与卵巢癌化疗耐药相关的特异性上皮细胞亚群c3，并发现其关键标志物CLIC3通过整合素β1重分布和PI3K-AKT通路介导耐药机制 | 样本量较小（仅5个卵巢癌样本），需要在更大规模队列中验证发现 | 探索卵巢癌化疗耐药机制并识别关键生物标志物 | 卵巢癌患者样本（3例耐药，2例敏感） | 单细胞转录组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | GSVA，细胞通讯分析，加权基因共表达网络分析 | 单细胞转录组数据 | 5个卵巢癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6992 | 2025-10-06 |
Single-cell and bulk RNA analysis identifies EMT-associated CAF signatures and prognostic model in lung adenocarcinoma
2025-Jun-14, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02951-z
PMID:40517220
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，识别与上皮间质转化相关的癌症相关成纤维细胞特征基因，并构建肺腺癌预后模型 | 首次整合单细胞和bulk转录组数据识别EMT相关的CAF特征基因，并构建具有临床价值的预后风险评分模型 | 需要进一步研究验证这些发现的临床适用性和生物学机制 | 识别EMT相关的CAF特征基因并构建肺腺癌预后模型 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | Cox回归, LASSO回归, 风险评分模型 | RNA测序数据, 临床信息 | TCGA和GEO数据库中的肺腺癌患者数据 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 6993 | 2025-10-06 |
Enhanced cytotoxicity of aging associated NKG2C + CD8 + T cells in ankylosing spondylitis via HLA-B27
2025-Jun-14, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-025-03585-w
PMID:40517268
|
研究论文 | 本研究探讨了衰老与强直性脊柱炎发病机制的共同机制，发现HLA-B27通过激活PI3K-Akt信号通路增强NKG2C+CD8+T细胞的细胞毒性 | 首次揭示HLA-B27通过PI3K-Akt信号通路驱动衰老相关NKG2C+CD8+T细胞细胞毒性增强的机制 | 样本量相对有限（87例患者），动物模型与人类疾病存在物种差异 | 探索衰老与强直性脊柱炎发病的共同机制并确定潜在治疗靶点 | 强直性脊柱炎患者、匹配对照、胶原诱导关节炎小鼠模型、HLA-B27转基因小鼠 | 免疫学 | 强直性脊柱炎 | 多维流式细胞术、单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | 流式细胞数据、RNA测序数据 | 87例AS患者及匹配对照 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
| 6994 | 2025-10-06 |
Exercise alters transcriptional profiles of senescence and gut barrier integrity in intestinal crypts of aging mice
2025-Jun-13, npj aging
IF:4.1Q2
DOI:10.1038/s41514-025-00242-z
PMID:40514364
|
研究论文 | 本研究探讨了运动如何通过改变衰老小鼠肠道隐窝中衰老相关转录谱和肠道屏障完整性来影响肠道健康 | 首次在单细胞水平揭示运动通过调控DNA复制、细胞周期进程和核糖体生物合成相关基因表达来抑制肠道干细胞衰老的分子机制 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证；机制研究仍需进一步深入 | 探究运动对衰老过程中肠道干细胞功能和肠道屏障完整性的影响 | 衰老小鼠模型的肠道隐窝细胞 | 单细胞转录组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 衰老小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6995 | 2025-10-06 |
Resolving spatial subclonal genomic heterogeneity of loss of heterozygosity and extrachromosomal DNA in gliomas
2025-Jun-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59805-z
PMID:40514380
|
研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学、肿瘤/正常DNA测序和bulk RNA测序，解析胶质瘤中空间亚克隆基因组异质性 | 首次结合空间转录组学与DNA测序技术系统揭示胶质瘤中染色体外DNA（ecDNA）和杂合性缺失的空间异质性模式 | 样本量有限（初始队列11例胶质瘤，验证队列6例胶质母细胞瘤），需要更大规模研究验证 | 解析胶质瘤中DNA水平体细胞拷贝数变化的空间组织特征 | 胶质瘤患者肿瘤组织（包含不同病理类型的初始队列和高级别胶质母细胞瘤验证队列） | 空间转录组学 | 胶质瘤 | 空间转录组学, 肿瘤/正常DNA测序, bulk RNA测序 | NA | 空间转录组数据, DNA测序数据, RNA测序数据 | 初始队列11例胶质瘤，验证队列6例高级别胶质母细胞瘤 | NA | 空间转录组学, DNA测序, RNA测序 | NA | NA |
| 6996 | 2025-10-06 |
Gαi3: a crucial biomarker and therapeutic target in bladder cancer
2025-Jun-13, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00989-4
PMID:40514424
|
研究论文 | 本研究探讨了Gαi3在膀胱癌中的表达、功能和作用机制 | 首次系统揭示Gαi3通过Akt-mTOR通路促进膀胱癌进展，并发现其受转录因子GATA4调控 | 研究主要基于细胞系和动物模型，临床样本验证相对有限 | 阐明Gαi3在膀胱癌发生发展中的生物学功能和治疗潜力 | 膀胱癌细胞系、患者组织样本和裸鼠移植瘤模型 | 癌症生物学 | 膀胱癌 | 生物信息学分析、单细胞测序、shRNA沉默、CRISPR/Cas9基因编辑、Western blot | NA | 基因表达数据、蛋白质印迹数据、单细胞测序数据 | 多种膀胱癌细胞系和患者组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6997 | 2025-10-06 |
Identification of biomarkers associated with exhausted CD8 + T cells in the tumor microenvironment of intrahepatic cholangiocarcinoma based on Mendelian randomization and bioinformatics analysis
2025-Jun-13, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02970-w
PMID:40514625
|
研究论文 | 通过整合多种生物信息学方法和单细胞RNA测序数据，鉴定肝内胆管癌肿瘤微环境中耗竭CD8+T细胞相关生物标志物 | 首次结合BayesPrism去卷积、WGCNA和汇总孟德尔随机化方法分析肝内胆管癌肿瘤微环境中的耗竭CD8+T细胞 | NA | 鉴定肝内胆管癌肿瘤微环境中与耗竭CD8+T细胞相关的生物标志物和治疗靶点 | 肝内胆管癌肿瘤微环境中的细胞亚群，特别是耗竭CD8+T细胞 | 生物信息学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序, BayesPrism去卷积, WGCNA, 汇总孟德尔随机化 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6998 | 2025-10-06 |
Development of a circadian-related prognostic signature highlights RBM17 as a stemness regulator in liver cancer
2025-Jun-13, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03843-6
PMID:40514677
|
研究论文 | 本研究开发了基于昼夜节律基因的肝癌预后特征，并揭示RBM17通过促进癌症干细胞表型驱动肝癌进展 | 首次整合单细胞、批量和空间转录组学解析昼夜节律基因失调与肿瘤微环境的关联，并鉴定RBM17作为肝癌干细胞性调控因子 | 未明确说明样本量大小，机制研究仍需进一步验证 | 阐明昼夜节律失调影响肝癌进展的分子机制并开发预后预测模型 | 肝癌患者样本和实验模型 | 生物信息学 | 肝癌 | 多组学分析，机器学习，单细胞转录组测序，空间转录组测序，体内外实验 | 机器学习算法 | 基因组数据，转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学，批量RNA测序 | NA | NA |
| 6999 | 2025-10-06 |
TORC: Target-Oriented Reference Construction for supervised cell-type identification in scRNA-seq
2025-Jun-10, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03614-6
PMID:40495172
|
研究论文 | 本文提出了一种用于单细胞RNA测序监督细胞类型识别的目标导向参考数据构建方法 | 开发了首个针对单细胞RNA测序监督细胞类型识别的参考数据选择和构建方法，能够缓解参考数据与目标数据之间的数据分布和细胞类型组成差异 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 监督学习方法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 7000 | 2025-10-06 |
UDA-seq: universal droplet microfluidics-based combinatorial indexing for massive-scale multimodal single-cell sequencing
2025-Jun, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02586-y
PMID:39833568
|
研究论文 | 开发了一种通用的液滴微流控组合索引方法UDA-seq，用于大规模多模态单细胞测序 | 通过引入后索引步骤增强通量，并系统适配现有基于液滴的单细胞多模态方法，实现单次实验从数十个临床活检样本生成超过10万个高质量单细胞数据集 | NA | 开发通用型单细胞多模态测序工作流程，提高自动化程度和临床适用性 | 多种组织和细胞类型，包括临床活检标本 | 单细胞测序技术 | 癌症 | 单细胞多模态测序，液滴微流控技术 | NA | 单细胞多模态数据（RNA、VDJ、染色质、CRISPR扰动） | 从36个冷冻临床活检标本中生成超过100,000个高质量单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，单细胞多组学 | NA | 液滴微流控平台 |