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当前共找到 10384 篇文献，本页显示第 681 - 700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 681 | 2025-12-10 |
Deciphering Precursor Cell Dynamics in Esophageal Preneoplasia via Genetic Barcoding and Single-Cell Transcriptomics
2025-Aug-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.26.637920
PMID:40060545
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研究论文 | 本研究通过结合遗传条形码技术与单细胞RNA测序，追踪食管癌前病变细胞的谱系，揭示了高可塑性祖细胞样群体及其在肿瘤早期发生中的作用 | 首次将遗传条形码与单细胞RNA测序结合用于食管癌前病变细胞谱系追踪，并开发了新的评分系统来映射高可塑性细胞 | NA | 阐明食管癌前病变细胞的起源、轨迹及其在早期肿瘤发生中的动态 | 食管癌前病变细胞 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 遗传条形码，单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 682 | 2025-12-10 |
A systematic review of single-cell RNA sequencing applications and insights in Oryza sativa response to environmental stresses
2025-Jul-19, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-025-10836-1
PMID:40682700
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综述 | 本文系统综述了2017年至2024年间水稻单细胞RNA测序（scRNA-seq）的应用，重点关注其在解析水稻对环境胁迫响应中的作用 | 首次针对水稻的scRNA-seq研究进行系统性综述，填补了该领域在全面回顾方面的空白，并整合了ATCT-seq、snRNA-seq和Stereo-seq等最新转录组技术进展 | 作为综述文章，未进行原始实验研究，依赖现有文献的总结，可能无法涵盖所有相关研究或技术细节 | 系统概述scRNA-seq在水稻研究中的应用，特别是其在理解水稻对不同环境胁迫响应机制中的作用，以促进作物改良策略 | 水稻（Oryza sativa）及其组织（根、叶、小花、种子），以及其在低氮、高盐、缺铁和褐飞虱抗性等胁迫条件下的响应 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、ATCT-seq、snRNA-seq、Stereo-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 683 | 2025-12-10 |
Single-cell RNA sequencing identifies accumulation of Fcgr2b+ virtual memory like CD8 T cells with cytotoxic and inflammatory potential in aged mouse white adipose tissue
2025-Jun-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.27.661935
PMID:40631318
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序，识别了老年小鼠白色脂肪组织中具有细胞毒性和炎症潜能的Fcgr2b+虚拟记忆样CD8 T细胞的积累 | 比较了生理衰老与高脂饮食诱导的肥胖，首次在老年小鼠白色脂肪组织中鉴定出Fcgr2b+CD49d-虚拟记忆样CD8 T细胞，并揭示了其细胞毒性和炎症功能 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证；样本量相对较小，可能影响统计效力 | 比较衰老与肥胖状态下白色脂肪组织的炎症机制，识别独特的调控靶点 | 年轻和老年小鼠的性腺白色脂肪组织（gWAT）基质血管组分（SVF） | 单细胞组学 | 肥胖相关炎症 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞数据 | 年轻小鼠（正常或高脂饮食）和老年小鼠（正常饮食）的白色脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 684 | 2025-12-10 |
Strain-Specific Tropism and Transcriptional Responses of Enterovirus D68 Infection in Human Spinal Cord Organoids
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.27.661907
PMID:40666885
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了人类脊髓类器官中肠道病毒D68感染的细胞嗜性和转录反应，揭示了不同病毒株的差异感染模式 | 首次在人类脊髓类器官模型中，通过单细胞RNA测序揭示了EV-D68不同毒株（B2和B3）在神经元和胶质细胞中的特异性嗜性差异 | 研究基于类器官模型，可能无法完全模拟体内复杂的免疫环境和组织架构 | 探究EV-D68感染导致急性弛缓性脊髓炎的细胞机制和宿主反应 | 人类脊髓类器官（hSCOs） | 单细胞组学 | 神经系统感染性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，使用诱导多能干细胞衍生的脊髓类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 685 | 2025-12-10 |
Spatial Transcriptomics Analysis Uncovers ER stress in MANF-deficient Purkinje Cells Underlying Alcohol-induced Cerebellar Vulnerability in Mice
2025-Jun-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.19.660571
PMID:40667236
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研究论文 | 本研究通过生成小脑Purkinje细胞特异性MANF敲除小鼠模型，结合空间转录组学分析，揭示了MANF缺失如何以性别特异性方式增加酒精诱导的ER应激和小脑脆弱性 | 首次利用空间转录组学和高通量原位分析技术，在MANF敲除小鼠中揭示了性别特异性的转录组景观变化及ER应激相关基因表达，阐明了MANF在保护Purkinje细胞免受酒精神经毒性中的作用机制 | 研究主要基于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类；性别差异的分子机制尚未完全阐明；样本量可能有限，需进一步验证 | 探究MANF是否通过调节ER应激来保护小脑Purkinje细胞免受酒精诱导的神经毒性，并分析其性别特异性效应 | 小脑Purkinje细胞特异性MANF敲除小鼠，包括雄性和雌性个体 | 空间转录组学 | 酒精诱导的神经退行性疾病 | 空间转录组学，高通量原位分析 | MANF敲除小鼠模型 | 转录组数据，行为学数据，组织学数据 | MANF敲除小鼠（雄性和雌性），具体数量未在摘要中明确说明 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 686 | 2025-12-10 |
Overexpression of Meis factors in late-stage retinal progenitors yields complex effects on temporal patterning and neurogenesis
2025-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.01.651492
PMID:40654906
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研究论文 | 本研究探讨了Meis1和Meis2转录因子在小鼠出生后晚期视网膜祖细胞中过表达对时间模式化和神经发生的影响 | 首次在晚期视网膜祖细胞中系统研究Meis1和Meis2过表达对时间身份和神经发生能力的影响，揭示了这两个因子在调控神经发生进程中的不同作用 | 过表达Meis因子未能完全重编程晚期祖细胞，且未诱导早期出生细胞类型，表明存在其他关键调控因子 | 探究Meis转录因子在晚期视网膜祖细胞中对时间模式和神经发生的调控作用 | 出生后小鼠的视网膜祖细胞 | 发育生物学 | NA | 电穿孔转染、单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 687 | 2025-12-10 |
scSwinTNet: A Cell Type Annotation Method for Large-Scale Single-Cell RNA-Seq Data Based on Shifted Window Attention
2025-Apr, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2024.3487174
PMID:39466872
|
研究论文 | 本文提出了一种基于移位窗口注意力机制的大规模单细胞RNA测序数据细胞类型注释方法scSwinTNet | scSwinTNet是首个使用预训练的移位窗口注意力模型来注释单细胞RNA测序数据中细胞类型的模型，无需先验知识即可准确注释 | NA | 开发一种自动化、高精度的细胞类型注释工具，以应对单细胞数据量的指数增长并减少数据偏差影响 | 人类和小鼠组织中的单细胞RNA测序数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | 基于移位窗口的自注意力模型 | 基因表达数据 | 399,760个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 688 | 2025-12-10 |
High throughput identification of genetic regulators of microglial inflammatory processes in Alzheimer's disease
2025-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.09.642133
PMID:40161839
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研究论文 | 本研究通过CRISPRi筛选和单细胞RNA测序，系统探究了阿尔茨海默病GWAS变异如何影响人类小胶质细胞的炎症反应 | 首次结合CRISPRi高通量筛选与单细胞RNA测序，在hiPSC衍生的小胶质细胞中系统鉴定AD遗传风险因子对炎症反应的调控作用，并揭示了这些变异在功能上汇聚于调节小胶质细胞状态 | 研究主要依赖体外细胞模型和病毒模拟物刺激，可能无法完全模拟体内复杂的AD病理环境 | 探究阿尔茨海默病遗传风险因子对小胶质细胞炎症反应的调控机制 | 人类诱导多能干细胞衍生的小胶质细胞 | 单细胞组学 | 阿尔茨海默病 | CRISPR抑制筛选，单细胞RNA测序，CROP-seq | NA | 单细胞转录组数据 | 针对119个AD GWAS位点进行CRISPRi筛选 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 689 | 2025-12-10 |
Long-read sequencing transcriptome quantification with lr-kallisto
2025-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.19.604364
PMID:39071335
|
研究论文 | 本文介绍了lr-kallisto方法，用于长读长测序数据的转录本定量分析，并展示了其在ONT数据上的应用和改进 | 开发了lr-kallisto方法，将kallisto的短读长RNA-seq定量技术适配到长读长测序平台，并证明外显子捕获能提高定量准确性 | 未提及具体样本量或数据集的局限性，可能依赖于特定长读长平台（如ONT） | 实现长读长测序数据中转录本异构体的快速准确定量 | RNA转录本，特别是全长转录本异构体 | 自然语言处理 | NA | 长读长测序，外显子捕获 | kallisto模型适配 | RNA测序数据 | NA | Oxford Nanopore Technologies | 长读长RNA测序 | ONT平台 | Oxford Nanopore长读长测序数据，结合外显子捕获技术 |
| 690 | 2025-12-10 |
PI3 as a Common Hub Gene Linking Atopic Dermatitis and Ulcerative Colitis Through Immune Cell Recruitment Mechanisms
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S527507
PMID:40901026
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析识别了特应性皮炎和溃疡性结肠炎之间的共同枢纽基因PI3及其在免疫细胞招募机制中的作用 | 首次将PI3确定为连接AD和UC的枢纽基因，并揭示了其通过CCL和CXCL趋化因子招募M1巨噬细胞、CD4 T细胞和中性粒细胞的共同免疫机制 | 研究主要基于公共数据库的转录组数据，缺乏实验验证；样本量有限且可能受批次效应影响 | 识别AD和UC之间的共同枢纽基因和免疫学特征，阐明两种疾病的共享发病机制 | 特应性皮炎和溃疡性结肠炎患者组织样本 | 生物信息学 | 特应性皮炎,溃疡性结肠炎 | RNA-seq,单细胞RNA测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 来自GSE121212和GSE75214数据集的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 691 | 2025-12-10 |
Cannabidiol Reprograms Glucose Metabolism in Colorectal Adenocarcinoma by Targeting HIF-1α/LDHA Pathway
2025, The American journal of Chinese medicine
DOI:10.1142/S0192415X25500958
PMID:41219135
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研究论文 | 本研究探讨了大麻二酚通过靶向HIF-1α/LDHA通路，重编程结直肠腺癌葡萄糖代谢的抗肿瘤机制 | 首次揭示大麻二酚通过抑制HIF-1α/LDHA通路来靶向肿瘤代谢重编程，并发现其与糖酵解抑制剂2-DG具有协同作用 | 研究主要基于体外实验和单细胞转录组学分析，缺乏体内动物模型的全面验证 | 探究大麻二酚在结直肠腺癌中的抗肿瘤作用机制，特别是其对肿瘤代谢重编程的影响 | 结直肠腺癌细胞系及组织样本 | 肿瘤代谢研究 | 结直肠癌 | 单细胞转录组学、网络药理学、蛋白质组学、代谢测定 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据、代谢数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 692 | 2025-12-10 |
Strain-specific tropism and transcriptional responses of enterovirus D68 infection in human spinal cord organoids
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1698639
PMID:41347238
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了人类脊髓类器官中肠道病毒D68感染的细胞嗜性和转录反应，揭示了不同病毒株在神经元和胶质细胞中的差异感染模式 | 首次在人类脊髓类器官模型中，通过单细胞分辨率揭示了EV-D68不同毒株（B2和B3）的细胞嗜性差异及其宿主转录响应，为急性弛缓性脊髓炎的发病机制提供了新见解 | 研究基于类器官模型，可能无法完全模拟体内复杂的脊髓微环境；样本规模有限，且仅分析了两种病毒株 | 探究肠道病毒D68感染导致急性弛缓性脊髓炎的细胞嗜性和感染动力学机制 | 源自诱导多能干细胞的人类脊髓类器官 | 单细胞组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，但涉及健康及感染两种EV-D68毒株（B2和B3）的脊髓类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 693 | 2025-12-10 |
Multi-Omics Analysis and Experimental Validation Identify RAD51 as a Key Biomarker in OSCC
2025 Jan-Dec, IET systems biology
IF:1.9Q3
DOI:10.1049/syb2.70048
PMID:41350246
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和实验验证，识别RAD51作为口腔鳞状细胞癌的关键生物标志物 | 整合多组学数据（包括单细胞转录组学）和实验验证，首次系统阐明RAD51在OSCC中的功能及其与免疫浸润和化疗耐药性的关联 | 研究主要基于细胞系HSC-3进行实验验证，缺乏体内模型或临床样本的直接验证 | 阐明RAD51在口腔鳞状细胞癌中的具体功能和调控机制，评估其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 | 口腔鳞状细胞癌（OSCC）细胞系HSC-3及相关的多组学数据 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 多组学分析、单细胞RNA测序、siRNA敲低、功能测定（增殖、迁移、侵袭、ROS积累、化疗敏感性） | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据、实验数据 | 使用OSCC细胞系HSC-3进行实验，多组学分析涉及多个癌症数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 694 | 2025-12-09 |
CD33 drives cutaneous melanoma: mendelian randomization confirms causality, multi-omics and in vitro experiments reveal M2 macrophage polarization-mediated progression
2025-Dec-08, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004100
PMID:41346267
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化、多组学分析和体外实验，揭示了CD33通过促进M2巨噬细胞极化驱动皮肤黑色素瘤发展的因果机制 | 首次综合运用孟德尔随机化、多组学转录组分析和体外实验验证，系统证实了CD33与皮肤黑色素瘤之间的因果关系，并阐明了其通过M2巨噬细胞极化介导肿瘤进展的具体机制 | 研究主要基于公共数据库的汇总数据和体外实验，缺乏体内模型或临床样本的直接验证，且对CD33调控M2极化的具体信号通路尚未完全阐明 | 探索皮肤黑色素瘤的新型治疗靶点并阐明其作用机制 | 皮肤黑色素瘤及其肿瘤微环境中的免疫细胞（特别是巨噬细胞/树突状细胞） | 生物信息学与计算生物学 | 皮肤黑色素瘤 | 孟德尔随机化、基于汇总数据的孟德尔随机化、共定位分析、批量转录组测序、单细胞转录组测序、体外细胞实验 | NA | 基因组关联研究汇总数据、蛋白质数量性状位点数据、批量转录组数据、单细胞转录组数据 | FinnGen队列（皮肤黑色素瘤：3194病例/314193对照；原位黑色素瘤：980病例/313899对照；葡萄膜黑色素瘤：293病例/345118对照）、731个免疫细胞特征（N=3757）、TCGA/GTEx/GENT2数据库转录组数据、GEO单细胞数据集 | NA | 批量RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 695 | 2025-12-09 |
Tfh2 and a subset of Tfh1 cells associate with antibody-mediated immunity to malaria
2025-Dec-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.196828
PMID:41118256
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA-Seq和VDJ-Seq技术，揭示了人类外周血Tfh细胞在疟疾感染期间的异质性，并识别出与抗体介导免疫相关的特定Tfh亚群 | 发现基于CCR7表达可将pTfh1细胞进一步分为两个功能不同的亚群，并证明只有Tfh1-CCR7+和Tfh2细胞与保护性抗体产生正相关 | 研究样本量有限，且仅在控制性人类疟疾感染模型中进行，未涵盖自然感染或长期免疫反应 | 探究人类Tfh细胞在疟疾感染期间的异质性及其与抗体介导免疫的关联 | 健康个体在控制性人类疟疾感染前后的外周血Tfh细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA-Seq, VDJ-Seq | NA | 单细胞转录组数据, VDJ序列数据 | 健康个体在感染前后的外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 696 | 2025-12-09 |
[Novel progress in exploring drug resistance mechanisms of breast cancer by single-cell sequencing technology]
2025-Dec-08, Zhonghua bing li xue za zhi = Chinese journal of pathology
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 697 | 2025-12-09 |
[Fibroblast heterogeneity and functional roles in interstitial lung diseases: insights from histopathology and single-cell transcriptomics analyses]
2025-Dec-08, Zhonghua bing li xue za zhi = Chinese journal of pathology
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 698 | 2025-12-09 |
Glioblastoma-associated fibroblasts enhance vascular stiffness and confer to poor prognosis
2025-Dec-08, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004114
PMID:41355159
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，在胶质母细胞瘤中鉴定出一种独特的COL6A3+胶质瘤相关成纤维细胞亚群，并揭示了其通过COL6A3-ITGA1信号通路导致血管功能障碍和缺氧，从而促进肿瘤进展的机制 | 首次在胶质母细胞瘤中鉴定出COL6A3+胶质瘤相关成纤维细胞亚群，并阐明其通过介导内皮细胞硬度增加来驱动血管功能障碍和缺氧的新机制 | 未明确说明样本量大小及具体来源，且GAFs来源于髓系细胞的机制仍需进一步验证 | 探究胶质母细胞瘤中癌症相关成纤维细胞的功能及其在肿瘤微环境中的作用机制 | 胶质母细胞瘤组织、COL6A3+胶质瘤相关成纤维细胞、血管内皮细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序、空间转录组学分析、CRISPR-Cas9基因敲除 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 699 | 2025-12-09 |
Targeting Itga8 Mitigates Neurogenic Bladder Fibrosis Driven by Trem2⁺ Macrophage-Derived Fn1 via FAK/RhoA/ROCK Signaling
2025-Dec-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202510631
PMID:41355531
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了神经源性膀胱纤维化中Itga8⁺成纤维细胞的作用，并发现Trem2⁺巨噬细胞通过分泌Fn1激活Itga8介导的FAK/RhoA/ROCK信号通路，促进纤维化进程 | 首次在神经源性膀胱纤维化中鉴定出Itga8⁺成纤维细胞亚群，并阐明其通过FAK/RhoA/ROCK信号通路协调细胞骨架重塑，同时揭示了Trem2⁺巨噬细胞通过Fn1-Itga8相互作用驱动纤维化的新机制 | 研究主要基于动物模型，人类样本验证不足；Itga8靶向治疗的具体临床转化路径尚未明确 | 探究神经源性膀胱纤维化的分子机制并寻找潜在治疗靶点 | 神经源性膀胱纤维化模型中的成纤维细胞和巨噬细胞 | 单细胞组学 | 神经源性膀胱疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 700 | 2025-12-09 |
Metformin Restores Mitochondrial Function and Neurogenesis in POLG Patient-Derived Brain Organoids
2025-Dec-08, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417721
PMID:41355579
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研究论文 | 本研究利用患者来源的诱导多能干细胞（iPSC）构建的皮质类器官模型，探究了二甲双胍对POLG相关线粒体功能障碍和神经发生障碍的治疗潜力 | 首次在POLG患者来源的脑类器官模型中，通过单细胞RNA-seq揭示不同神经元亚型的特异性脆弱性，并证明二甲双胍能恢复线粒体功能和神经发生 | 研究基于体外类器官模型，可能无法完全模拟体内复杂环境；治疗剂量和时间窗口需进一步优化 | 评估二甲双胍对POLG相关线粒体功能障碍和神经退行性疾病的治疗潜力 | POLG患者来源的诱导多能干细胞（iPSC）构建的皮质类器官 | NA | POLG相关线粒体疾病 | 单细胞RNA-seq，非靶向代谢组学，功能测定（线粒体膜电位、质量、氧化应激、钙测量） | NA | 单细胞转录组数据，代谢组数据，功能测定数据 | 患者来源的iPSC皮质类器官 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |