单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 3296 篇文献，本页显示第 681 - 700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 681 | 2025-04-07 |
Channel synapse mediates neurotransmission of airway protective chemoreflexes
2025-Apr-02, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.03.007
PMID:40187347
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研究论文 | 本研究揭示了小鼠喉咙中Pou2f3化学感应细胞家族通过通道突触与迷走神经元通信，介导气道保护性化学反射的神经传递 | 发现了Pou2f3上皮细胞通过CALHM1/3通道突触作为气道保护性反射的化学感应终末器官，并揭示了其在气道防御程序中的作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中进行验证 | 研究喉咙中化学物质引起的神经反射机制，以保护气道免受吸入和感染 | 小鼠喉咙中的Pou2f3化学感应细胞家族和迷走神经元 | 神经生物学 | 慢性咳嗽 | 单细胞转录组学、光遗传学刺激 | 小鼠基因敲除模型 | 基因表达数据、行为数据 | NA |
| 682 | 2025-04-07 |
Update on mast cell biology
2025-Apr, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.12.1092
PMID:39800266
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review | 本文回顾了2022年至2024年间关于肥大细胞（MCs）生物学的重要研究进展 | 利用单细胞RNA测序等技术揭示了肥大细胞的异质性及其在健康和疾病中的表型 | NA | 探讨肥大细胞在过敏炎症性疾病中的核心作用及其生物学特性 | 肥大细胞（MCs） | NA | 过敏炎症性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | NA | NA |
| 683 | 2025-04-07 |
IL-25 Enhances B Cell Responses in Type 2 Inflammation Through IL-17RB Receptor
2025-Apr, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16472
PMID:39829150
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research paper | 本研究探讨了IL-25通过IL-17RB受体增强B细胞在2型炎症中的反应 | 揭示了IL-25/IL-17RB通路在B细胞中的新作用及其在2型炎症中的潜在治疗靶点 | 研究主要基于体外实验和有限的组织样本，需要进一步的体内验证 | 研究IL-25受体IL-17RB在B细胞中的表达及其在2型炎症中的作用 | 外周血来源的B细胞和鼻息肉组织中的B细胞 | 免疫学 | 慢性鼻窦炎伴鼻息肉(CRSwNP)和哮喘 | 流式细胞术、RT-PCR、单细胞RNA测序 | NA | 细胞和分子数据 | 外周血B细胞和鼻息肉组织样本 |
| 684 | 2025-04-07 |
scTrans: Sparse attention powers fast and accurate cell type annotation in single-cell RNA-seq data
2025-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012904
PMID:40184563
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研究论文 | 介绍了一种基于Transformer的模型scTrans，用于单细胞RNA测序数据中的细胞类型注释，旨在减少信息损失并提高注释速度和准确性 | 使用稀疏注意力机制利用所有非零基因，有效降低输入数据维度同时最小化信息损失 | 未明确提及具体局限性 | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型注释的速度和准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | Transformer | RNA测序数据 | 31种不同组织的小鼠细胞图谱数据，接近百万细胞 |
| 685 | 2025-04-07 |
Spatial transcriptomics reveals tryptophan metabolism restricting maturation of intratumoral tertiary lymphoid structures
2025-Apr-01, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.03.011
PMID:40185093
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术揭示了色氨酸代谢在肝细胞癌中限制肿瘤内三级淋巴结构成熟的作用 | 首次发现恶性细胞塑造的色氨酸富集代谢微环境导致三级淋巴结构成熟偏离，并证明抑制色氨酸代谢可促进肿瘤内三级淋巴结构成熟并与抗PD-1治疗产生协同效应 | 研究仅聚焦于肝细胞癌，其他癌症类型中三级淋巴结构成熟的调控机制尚不明确 | 探究驱动三级淋巴结构成熟的关键因素及其在肿瘤免疫治疗中的作用 | 肝细胞癌中的三级淋巴结构及其微环境 | 空间转录组学 | 肝细胞癌 | 近单细胞空间转录组测序 | NA | 空间转录组数据 | NA |
| 686 | 2025-04-07 |
Rorγt-positive dendritic cells are required for the induction of peripheral regulatory T cells in response to oral antigens
2025-Apr-01, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.03.020
PMID:40185101
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research paper | 该研究探讨了RORγt阳性树突状细胞在口服抗原诱导外周调节性T细胞中的作用 | 通过删除Rorc编码RORγt的特定顺式调控元件，开发了一种RORγt抗原呈递细胞减少的小鼠模型，揭示了淋巴样RORγt树突状细胞在维持肠道免疫平衡中的关键作用 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 研究RORγt阳性树突状细胞在外周调节性T细胞诱导中的作用及其对肠道免疫平衡的影响 | 小鼠模型中的RORγt阳性树突状细胞和调节性T细胞 | 免疫学 | 炎症性肠病, 食物过敏 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 谱系追踪 | 小鼠基因敲除模型 | 基因表达数据, 细胞表型数据 | 基因修饰小鼠及其对照 |
| 687 | 2025-04-07 |
Single-cell meta-analysis of T cells reveals clonal dynamics of response to checkpoint immunotherapy
2025-Mar-28, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.100842
PMID:40187353
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研究论文 | 通过单细胞元分析揭示T细胞克隆在检查点免疫治疗响应中的动态变化 | 首次利用大规模单细胞RNA测序和T细胞受体测序数据，揭示了T细胞克隆的动态变化与免疫检查点抑制剂治疗响应的关联 | 研究仅涵盖6种癌症类型，可能不适用于所有癌症类型 | 探究T细胞克隆动态变化与免疫检查点抑制剂治疗响应的关系 | 767,606个T细胞和460个样本 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序/T细胞受体测序 | NA | 单细胞测序数据 | 460个样本（涵盖6种癌症类型） |
| 688 | 2025-04-07 |
Competing dynamic gene regulatory networks involved in fibroblast reprogramming to hematopoietic progenitor cells
2025-Mar-25, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2025.102473
PMID:40185089
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研究论文 | 本研究通过开发一种诱导系统，将成纤维细胞重编程为造血祖细胞，并研究了重编程过程中的基因调控网络 | 揭示了SCL和LMO2转录因子通过调控FLI1、GATA1/2和KLF14等靶基因诱导造血程序的机制，并发现抑制神经元命运的竞争信号通路可提高重编程效率 | 研究仅针对成纤维细胞重编程为造血祖细胞的过程，可能不适用于其他细胞类型的重编程 | 提高体细胞直接重编程为造血细胞的效率和可控性 | 成纤维细胞和造血祖细胞 | 基因调控与细胞重编程 | NA | 转录组和表观基因组分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、表观遗传数据 | 未明确说明样本数量，但涉及不同重编程阶段的细胞 |
| 689 | 2025-04-07 |
Protocol to recover single-cell gene expression profiles from spatial transcriptomics data using cluster computing
2025-Mar-21, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103636
PMID:39946238
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research paper | 提出了一种名为scResolve的计算协议，用于从低分辨率空间转录组数据中恢复单细胞基因表达谱 | 开发了scResolve协议，利用集群计算环境并行处理数据，加速从多细胞分辨率数据中恢复单细胞基因表达谱的过程 | 未提及该方法在特定类型数据上的性能限制或适用范围 | 解决空间转录组技术在单细胞分辨率分析上的限制 | 空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 空间转录组技术（如Visium） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 690 | 2025-04-07 |
Lineage Tracing Reveals Clone-Specific Responses to Doxorubicin in Triple-Negative Breast Cancer
2025-Mar-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.18.643980
PMID:40166195
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研究论文 | 使用谱系追踪系统ClonMapper结合单细胞RNA测序技术，研究三阴性乳腺癌对阿霉素的克隆特异性反应 | 揭示了在阿霉素治疗过程中，三阴性乳腺癌中不存在预先存在的耐药性特征，并发现两种转录组学上不同的克隆亚群持续存在 | 研究仅基于模型系统，未涉及临床患者数据 | 阐明三阴性乳腺癌对阿霉素治疗的克隆特异性反应 | 三阴性乳腺癌模型 | 癌症研究 | 三阴性乳腺癌 | 谱系追踪系统ClonMapper, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 691 | 2025-04-07 |
Continuous replenishment of the dysfunctional CD8 T cell axis is associated with response to chemoimmunotherapy in advanced breast cancer
2025-Mar-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.101973
PMID:39983715
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序技术，研究了转移性三阴性乳腺癌患者对化疗联合免疫检查点阻断治疗的免疫反应 | 揭示了晚期功能失调的CD8 T细胞克隆扩增与治疗反应之间的关联，并提出了基线克隆扩增作为潜在反应预测因子的新观点 | 样本量较小（27名患者），且仅针对三阴性乳腺癌这一特定亚型 | 探究肿瘤免疫微环境如何决定对化疗免疫治疗的免疫和临床反应 | 27名转移性三阴性乳腺癌患者的40份活检样本 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | scRNA-seq, scTCR-seq | NA | 单细胞测序数据 | 27名患者的40份活检样本 |
| 692 | 2025-04-07 |
Interferon-γ-stimulated antigen-presenting cancer-associated fibroblasts hinder neoadjuvant chemoimmunotherapy efficacy in lung cancer
2025-Mar-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102017
PMID:40056907
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research paper | 该研究揭示了抗原呈递癌症相关成纤维细胞(apCAFs)如何通过干扰素γ刺激和PD-L2-RGMB轴阻碍非小细胞肺癌新辅助化疗免疫治疗(NCIT)的疗效 | 首次发现apCAFs通过IFN-γ-JAK1/2-STAT1-IFI6/27通路扩增，并通过PD-L2-RGMB轴促进FOXP1调节性T细胞积累，从而削弱NCIT效果 | 研究样本量未明确说明，且机制研究主要在体外模型中进行 | 探究非小细胞肺癌新辅助化疗免疫治疗疗效受限的机制 | 非小细胞肺癌患者和癌症相关成纤维细胞 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞测序分析 | NA | 单细胞测序数据 | 未明确说明 |
| 693 | 2025-04-07 |
Immune-featured stromal niches associate with response to neoadjuvant immunotherapy in oral squamous cell carcinoma
2025-Mar-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102024
PMID:40107247
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组学分析口腔鳞状细胞癌患者肿瘤微环境中的基质细胞，探索其对免疫治疗反应的关联 | 揭示了免疫化疗应答者中特定的基质细胞变化及其在肿瘤微环境中的作用，为免疫治疗提供了新的治疗靶点 | 样本量较小（22例患者），且仅针对口腔鳞状细胞癌，结果可能不适用于其他癌症类型 | 探索肿瘤基质细胞在肿瘤微环境中的作用及其对免疫治疗反应的影响 | 22例口腔鳞状细胞癌患者的肿瘤标本 | 肿瘤免疫学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 22例口腔鳞状细胞癌患者的配对肿瘤标本 |
| 694 | 2025-04-07 |
BET inhibitor in combination with BCG vaccine enhances antitumor efficacy and orchestrates T cell reprogramming for melanoma
2025-Mar-18, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.101995
PMID:40107246
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研究论文 | 本文探讨了BET抑制剂NHWD-870与BCG疫苗联合使用在治疗黑色素瘤中的效果及其对T细胞的重编程作用 | 首次展示了NHWD-870与BCG疫苗联合治疗黑色素瘤的潜力，并揭示了其对T细胞免疫激活状态的重编程机制 | 研究主要基于小鼠模型和PDX模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探索提高黑色素瘤免疫治疗效果的新策略 | 黑色素瘤 | 肿瘤免疫治疗 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组分析、PDX模型 | 人源化PDX模型 | 转录组数据 | 人源化荷瘤小鼠模型 |
| 695 | 2025-04-07 |
Human Neonatal MR1T Cells Have Diverse TCR Usage, are Less Cytotoxic and are Unable to Respond to Many Common Childhood Pathogens
2025-Mar-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.17.643805
PMID:40166301
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research paper | 该研究探讨了新生儿MR1T细胞的TCR使用多样性、细胞毒性降低以及对常见儿童病原体反应能力的限制 | 揭示了新生儿MR1T细胞在TCR使用上的多样性、细胞毒性和促炎能力降低，以及对常见儿童病原体反应能力的限制 | 研究样本量较小（n=5），且仅针对特定病原体的反应能力进行了评估 | 了解新生儿MR1T细胞的免疫特性及其在新生儿败血症中的作用 | 新生儿和成人的MR1T细胞 | 免疫学 | 新生儿败血症 | 单细胞RNA测序/TCR测序（scRNA-seq/scTCR-seq） | NA | 基因表达数据、TCR序列数据 | 5名新生儿和5名成人的MR1-5-OP-RU-tetramer(+)细胞 |
| 696 | 2025-04-07 |
Periplakin Attenuates Liver Fibrosis Via Reprogramming CD44Low Cells into CD44High Liver Progenitor Cells
2025-Mar-17, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2025.101498
PMID:40107450
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研究论文 | 本文研究了periakin（PPL）通过将CD44Low细胞重编程为CD44High肝祖细胞（LPCs）来减轻肝纤维化的机制 | 发现PPL能够促进LPCs的扩增，并将PPL+CD44Low细胞重编程为PPL+CD44High LPCs，从而减轻肝纤维化 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本的应用和验证尚需进一步研究 | 探索PPL在肝纤维化中的作用及其机制 | 肝纤维化患者和小鼠模型中的肝祖细胞（LPCs） | 肝脏疾病研究 | 肝纤维化 | 单细胞测序、腺病毒过表达 | 小鼠模型 | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 人类和小鼠的肝纤维化样本 |
| 697 | 2025-04-07 |
Intrinsic OASL expression licenses interferon induction during influenza A virus infection
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.14.643375
PMID:40166309
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研究论文 | 本文研究了在甲型流感病毒(IAV)感染期间，宿主细胞内在OASL表达对干扰素(IFN)诱导的调控作用 | 揭示了IFN非依赖性的ISGs内在表达在促进IFN诱导中的新作用，为先天免疫激活中细胞间异质性的调控机制提供了新见解 | 研究主要聚焦于IAV感染模型，对其他病毒感染的普适性尚不明确 | 探究宿主细胞在病毒感染期间调控IFN诱导潜能的特异性因素 | 甲型流感病毒(IAV)感染的细胞 | 免疫学 | 流感 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | NA |
| 698 | 2025-04-07 |
Activation of CREB drives acinar cells to ductal reprogramming and promotes pancreatic cancer progression in animal models of alcoholic pancreatitis
2025-Mar-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.05.574376
PMID:38903082
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research paper | 本研究探讨了CREB激活在酒精性慢性胰腺炎（ACP）中促进胰腺癌细胞进展的机制 | 揭示了CREB与致癌Kras G12D/+在ACP背景下促进胰腺癌进展的分子协同作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本分析有限 | 探究CREB在酒精性胰腺炎相关胰腺癌进展中的作用机制 | 小鼠模型和人类胰腺疾病（慢性胰腺炎和胰腺导管腺癌）组织样本 | 分子病理学 | 胰腺癌 | western blotting, 磷酸激酶阵列, 定量PCR, 单细胞RNA测序 | Ptf1a CreERTM/+;LSL-Kras G12D/+ (KC) 遗传小鼠模型 | 基因表达数据, 组织样本 | 多种基因工程小鼠模型和人类胰腺疾病组织样本 |
| 699 | 2025-04-07 |
Sandwich Therapy with Radionuclide Combined with Intralesional Injections Based on Differences in the Spatial Structure Components of Keloids
2025-Mar, Aesthetic plastic surgery
IF:2.0Q2
DOI:10.1007/s00266-024-04442-y
PMID:39402198
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research paper | 本研究设计了一种基于瘢痕疙瘩空间结构成分差异的改良‘三明治’疗法，结合放射性核素和病灶内注射，以减少并发症 | 基于单细胞测序和影像学分析瘢痕疙瘩的空间结构差异，设计出新型‘三明治’疗法 | 样本量较小（40例患者，41个病灶），需进一步扩大研究验证疗效 | 开发一种减少瘢痕疙瘩治疗并发症的新型疗法 | 瘢痕疙瘩患者及其病灶组织 | digital pathology | keloid | 单细胞测序、超声、病理染色（H&E、CD34、eNOS） | NA | 基因表达数据、超声影像、病理切片 | 40例患者，41个病灶 |
| 700 | 2025-04-07 |
Decoding functional hematopoietic progenitor cells in the adult human lung
2025-Feb-27, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024027884
PMID:40014797
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研究论文 | 研究发现成人肺中存在功能性造血祖细胞，其频率与骨髓相似，并能在小鼠中增殖和植入 | 首次在成人肺中发现功能性造血祖细胞，并揭示其具有独特的免疫、巨核细胞/血小板和红细胞相关通路激活特征 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类肺中造血祖细胞的具体功能和调控机制仍需进一步研究 | 探索成人肺中是否存在功能性造血祖细胞及其特性 | 成人肺组织中的CD34+造血祖细胞 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |