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当前共找到 10542 篇文献，本页显示第 681 - 700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 681 | 2026-05-12 |
GTestimate: improving relative gene expression estimation in scRNA-seq using the Good-Turing estimator
2025-01-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf084
PMID:41159548
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研究论文 | 提出了基于Good-Turing估计器的GTestimate方法，改进了scRNA-seq中相对基因表达估计并开发了验证方法cta-seq | 首次将Good-Turing估计器应用于单细胞RNA-seq数据标准化，解决传统方法忽略未观测基因的问题，并开发了细胞靶向PCR扩增方法cta-seq进行验证 | 未提及具体局限性，但依赖Seurat工作流可能限制了与其他工具的兼容性 | 改进单细胞RNA-seq数据中相对基因表达估计的准确性 | 单细胞RNA-seq数据中的相对基因表达估计 | 机器学习 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, PCR扩增 | Good-Turing估计器 | 基因表达数据 | 4个示例数据集 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 682 | 2026-05-12 |
Unsupervised multiscale clustering of single-cell transcriptomes to identify hierarchical structures of cell subtypes
2025-01-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf111
PMID:41066207
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研究论文 | 开发一种无监督多尺度聚类方法MSC，用于从单细胞转录组数据中识别细胞亚型的层次结构 | 提出多尺度聚类方法MSC，通过构建稀疏细胞-细胞关联网络，能够在多个分辨率下无监督识别新的细胞类型和亚型，并揭示有生物学意义的细胞层次结构 | 未在摘要中明确提及局限性 | 开发一种能够更精细解析单细胞RNA测序数据中细胞层次结构的无监督聚类方法 | 模拟银标准、金标准数据以及真实疾病单细胞RNA测序数据中的细胞群体 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | MSC（多尺度聚类） | 单细胞转录组数据 | NA（未明确样本数量） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 683 | 2026-05-12 |
Microglia phagocytosis of PNNs mediates PV-positive interneuron dysfunction and associated gamma oscillations in neuroinflammation-induced cognitive impairment in mice
2025-01-01, Neuropharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.neuropharm.2024.110205
PMID:39489286
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研究论文 | 研究揭示小胶质细胞吞噬周神经网介导PV阳性中间神经元功能障碍及γ振荡在神经炎症诱导的小鼠认知损伤中的作用 | 首次发现小胶质细胞通过ApoE介导的周神经网吞噬作用导致PV阳性中间神经元功能障碍和γ振荡异常，从而引发认知损伤，并通过抑制ApoE或过表达Hapln1改善损伤 | 研究仅使用小鼠模型，未在人类样本中验证；长期神经炎症的影响未评估 | 探讨神经炎症引起认知损伤中周神经网与ApoE的关联机制 | C57BL/6J小鼠和CX3CR1-CreERT2小鼠 | 数字病理学 | 认知障碍 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 684 | 2026-05-12 |
Spatial transcriptomics reveals Inhba/Smad2/E2f4 axis in Lrp2high thecal cell proliferation in androgen-induced PCOS mice
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1633254
PMID:40831751
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research paper | 利用空间转录组学揭示雄激素诱导的PCOS小鼠模型中Lrp2高表达膜细胞增殖的Inhba/Smad2/E2f4轴 | 首次通过空间转录组学在细胞分辨率下揭示PCOS小鼠卵巢中Lrp2高表达膜细胞亚群及其Inhba/Smad2/E2f4信号轴对细胞增殖的调控作用 | 研究基于小鼠模型，尚未在人类PCOS卵巢组织中进行验证；功能验证仅限于体外细胞实验，缺乏体内数据支持 | 阐明PCOS中膜细胞异常增殖的分子机制 | DHEA诱导的PCOS小鼠模型中的卵巢膜细胞 | spatial transcriptomics | 多囊卵巢综合征 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | DHEA诱导的PCOS小鼠模型卵巢组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 685 | 2026-05-12 |
Identification of Dendritic Cell-Associated Genes in COPD Based on Bioinformatics
2025, International journal of chronic obstructive pulmonary disease
IF:2.7Q2
DOI:10.2147/COPD.S543753
PMID:41185886
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研究论文 | 通过生物信息学预测和实验验证，识别慢性阻塞性肺疾病（COPD）肺组织中与树突状细胞相关的基因 | 首次利用单细胞RNA测序和加权基因共表达网络分析综合鉴定COPD中树突状细胞相关基因，并通过体内外实验验证了RASGRP3、C1QB、BLOC1S2和VSIG4的表达变化 | 未提供明确局限性信息 | 利用生物信息学预测和实验验证，识别COPD患者肺组织中与树突状细胞相关的关键基因 | COPD患者肺组织及香烟烟雾诱导的肺气肿小鼠模型 | 生物信息学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RNA测序（RNA-seq）、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、实时定量PCR（RT-qPCR）、蛋白质印迹法（Western blot） | NA | 基因表达数据 | 多个公开数据集（GSE196638、GSE26296、GSE38974）及小鼠模型（香烟烟雾诱导肺气肿小鼠和骨髓来源树突状细胞） | NA | scRNA-seq、RNA-seq | NA | NA |
| 686 | 2026-05-12 |
ER Stress-Related Biomarkers in Chronic Obstructive Pulmonary Disease: A Comprehensive Transcriptome, Mendelian Randomization, and Machine-Learning Analysis
2025, International journal of chronic obstructive pulmonary disease
IF:2.7Q2
DOI:10.2147/COPD.S548160
PMID:41328289
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研究论文 | 通过转录组分析、孟德尔随机化和机器学习方法，识别慢性阻塞性肺疾病（COPD）中内质网应激相关基因DNAJB1作为风险基因及其诊断价值 | 首次整合单细胞测序、孟德尔随机化和机器学习方法，系统鉴定DNAJB1作为COPD风险基因，并建立包含9个关键基因的诊断生物标志物组合 | 研究基于公开数据集，需要进一步在独立队列中验证；孟德尔随机化揭示的因果关联需更深入的机制研究证实 | 探究内质网应激相关基因DNAJB1在COPD发病中的风险角色及临床诊断价值 | 慢性阻塞性肺疾病患者及对照样本的转录组数据和遗传变异数据 | 机器学习 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序、微阵列分析、孟德尔随机化 | 机器学习分类器 | 基因表达数据、遗传变异数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、微阵列分析 | NA | NA |
| 687 | 2026-05-12 |
Two-Step Positive Selection Method for the Magnetic Isolation of Lymphatic Endothelial Cells
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4706-6_2
PMID:40859071
|
研究论文 | 描述了一种利用双抗体磁珠分选法从组织中分离淋巴内皮细胞（LEC）的方法 | 采用两步阳性选择策略，结合双抗体标记，高效富集稀有淋巴内皮细胞，解决了常规分离方法中LEC纯度低的问题 | 未提及与其他分离方法的直接比较，可能对组织来源和细胞状态有依赖性 | 开发一种可靠的稀有细胞分离方法，用于研究淋巴内皮细胞在生理和病理状态下的功能 | 淋巴内皮细胞（LEC） | 分子生物学 | NA | 磁珠分选 | NA | 细胞 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 688 | 2026-05-10 |
Hypoxia Affects Stem Cell Fate in Patient-Derived Ileum Enteroids in a HIF-1α-Dependent Manner
2025-Dec-23, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells15010031
PMID:41511315
|
研究论文 | 本研究探讨缺氧如何通过HIF-1α依赖性方式影响患者来源回肠类器官中干细胞命运 | 首次证明生理性缺氧通过HIF-1α稳定化直接调控肠道上皮干细胞命运，揭示氧梯度在隐窝-绒毛轴中维持肠道稳态的机制 | 未明确说明，但可能包括类器官模型与体内环境的差异及样本量限制 | 研究氧气可用性如何影响肠道干细胞增殖和分化 | 患者来源的人回肠类器官（肠类器官） | 数字病理学 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 患者来源的人回肠类器官（具体数量未提及） | Illumina | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | Illumina NovaSeq | 批量RNA测序和单细胞RNA测序于Illumina NovaSeq平台 |
| 689 | 2026-05-10 |
Accurate imputation of pathway-specific gene expression in spatial transcriptomics with PASTA
2025-Dec-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67421-0
PMID:41397970
|
研究论文 | 提出一种名为PASTA的空间通路基因表达插补方法，利用细胞类型和空间邻近性提高预测准确性 | 创新性地将通路信息整合到空间转录组基因表达插补过程中，利用邻近细胞及同类型细胞的相似表达模式提高预测鲁棒性和生物学相关性 | 标题和摘要未明确提及方法的局限性 | 准确预测空间转录组中未测量的基因表达，特别是在通路水平上实现稳定且具有生物学意义的插补 | 空间转录组数据中未测量的基因表达 | 机器学习 | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | PASTA（通路导向空间基因插补模型） | 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 690 | 2026-05-10 |
Differential Localization of β-Catenin Protein in CTNNB1 Mutant Endometrial Cancers Results in Distinct Transcriptional Profiles
2025-Sep, Modern pathology : an official journal of the United States and Canadian Academy of Pathology, Inc
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.modpat.2025.100791
PMID:40348058
|
研究论文 | CTNNB1突变型子宫内膜癌中β-catenin蛋白差异定位导致不同的转录谱 | 首次揭示突变型β-catenin蛋白在子宫内膜癌中的不同亚细胞定位（细胞核 vs 膜/细胞质）与独特转录谱的关联，并发现TROP2作为潜在治疗靶点 | 未提及 | 研究具有CTNNB1外显子3突变的子宫内膜样子宫内膜癌中，β-catenin蛋白核定位与非核定位对下游基因表达的影响 | CTNNB1突变型子宫内膜样子宫内膜癌肿瘤组织 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 | 10x Genomics | 空间转录组学 | NA | 基于蛋白定位选择感兴趣区域（ROIs）进行空间转录组分析 |
| 691 | 2026-05-10 |
A STAT3/integrin axis accelerates pancreatic cancer initiation and progression
2025-Aug-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116010
PMID:40701148
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研究论文 | 本文发现STAT3/整合素轴通过调控ITGB3表达加速胰腺癌的起始与进展，并揭示其表观遗传调控机制 | 首次发现STAT3通过结合ITGB3增强子区域调控其表达，建立18基因预后特征，为胰腺癌分层治疗提供新靶点 | 未在临床样本中验证18基因特征的实际应用，缺乏体内动物模型对机制的直接验证 | 阐明STAT3通路在胰腺导管腺癌进展中的下游调控机制及临床意义 | 缺氧或制瘤素M处理的胰腺导管腺癌细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | ChIP-seq, 单细胞转录组学 | NA | 测序数据 | 未指定样本数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台进行单细胞转录组分析 |
| 692 | 2026-05-10 |
A Spatially Coordinated Keratinocyte-Fibroblast Circuit Recruits MMP9+ Myeloid Cells to Drive IFN-I-Driven Inflammation in Photosensitive Autoimmunity
2025-Aug-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.19.670635
PMID:40894544
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学等方法，揭示紫外线B通过角化细胞-成纤维细胞-髓系细胞环路驱动光敏感性自身免疫的机制 | 首次发现MMP9+ CD14+髓系细胞是光敏感性的关键效应细胞，并描述了角化细胞-成纤维细胞-髓系细胞多细胞炎症级联环路 | 研究主要基于人类体外模型和临床样本，可能未完全复制体内微环境的复杂性 | 阐明紫外线B暴露如何触发皮肤特异性自身免疫的分子机制 | 皮肤红斑狼疮和皮肌炎患者皮肤组织及健康对照皮肤 | 数字病理学 | 皮肤红斑狼疮, 皮肌炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 (seqFISH+), 紫外线B激发, 体外模型 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 涉及皮肤红斑狼疮和皮肌炎患者皮损及非皮损皮肤样本，健康对照皮肤样本，具体数量未在摘要中说明 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | seqFISH+ | NA |
| 693 | 2026-05-10 |
High KYNU Expression Is Associated with Poor Prognosis, KEAP1/STK11 Mutations, and Immunosuppressive Metabolism in Patient-Derived but Not Murine Lung Adenocarcinomas
2025-May-16, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17101681
PMID:40427178
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研究论文 | 本研究发现了肺腺癌中KYNU基因的双峰表达与患者预后不良相关，并揭示了其与KEAP1/STK11突变及免疫抑制代谢的关系 | 首次揭示KYNU在肺腺癌患者来源肿瘤中与KEAP1/STK11共突变相关且具有免疫抑制代谢表型，而在小鼠模型中表达模式与人类不一致，凸显了物种差异 | 小鼠肺腺癌模型无法忠实再现人类KYNU的表达模式，给临床前模型研究带来挑战 | 发现肺腺癌中与预后相关的双峰表达基因，揭示其潜在致癌基因型及新的治疗见解 | 肺腺癌患者肿瘤样本及其对应的免疫微环境、代谢状态和小鼠模型 | 机器学习 | 肺腺癌, 胰腺癌, 肾癌, 黑色素瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 代谢组学 | 聚类模型 | 转录组数据, 单细胞转录组数据, 代谢组数据 | 多个肺腺癌数据集，具体样本量未提及 | NA | 单细胞RNA-seq, 代谢组学 | NA | NA |
| 694 | 2026-05-10 |
Defining pathogenic IL-17 and CSF-1 gene expression signatures in chronic graft-versus-host disease
2025-May-08, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024025337
PMID:39977705
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术在慢性移植物抗宿主病中定义致病性IL-17和CSF-1基因表达特征 | 利用信息丰富的临床前慢性移植物抗宿主病模型，通过单细胞测序“逆向工程”定义小鼠血液中可随时间变化的IL-17和CSF-1特征，用于评估患者 | 靶向治疗仅对部分患者有效，且费用高昂、美国以外地区难以获取，目前依赖试错法使用 | 定义致病性IL-17和CSF-1基因表达特征，以促进选择合适治疗和识别高危个体进行预防性治疗 | 慢性移植物抗宿主病（cGVHD）患者和临床前模型小鼠 | 机器学习 | 慢性移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 70%的cGVHD诊断患者和一半移植后100天发展为cGVHD的患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序系统 |
| 695 | 2026-05-10 |
Single-cell transcriptomic analysis reveals efferocytosis signature predicting immunotherapy response in hepatocellular carcinoma
2025-05, Digestive and liver disease : official journal of the Italian Society of Gastroenterology and the Italian Association for the Study of the Liver
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/j.dld.2025.01.196
PMID:39904693
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析开发了与胞葬作用相关的基因签名（ER.Sig），用于预测肝细胞癌患者的预后和免疫治疗反应 | 首次结合单细胞和bulk转录组数据，利用十种机器学习算法构建胞葬作用相关基因签名，并多组学验证其在预测免疫治疗反应中的价值 | 数据来源于公共数据库，缺乏独立的外部验证队列；研究仅基于转录组水平，未进行功能实验验证 | 开发胞葬作用相关基因签名以预测肝细胞癌患者的预后和免疫治疗反应 | 肝细胞癌患者 | 机器学习和数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序和bulk RNA测序 | 随机生存森林模型（与其他九种算法比较后选择） | 转录组数据（单细胞和bulk层面） | 多个公共数据集，包括肝细胞癌患者样本和IMvigor210免疫治疗队列 | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | NA | NA |
| 696 | 2026-05-10 |
B-cell interleukin 1 receptor 1 modulates the female adipose tissue immune microenvironment during aging
2025-Feb-13, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae219
PMID:39378334
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研究论文 | 该论文研究了B细胞白细胞介素1受体1（Il1r1）在衰老过程中调节雌性脂肪组织免疫微环境的作用 | 首次通过B细胞特异性敲除Il1r1小鼠模型，揭示了IL-1β-B细胞信号在衰老脂肪组织炎症反应中的性别特异性作用 | 研究仅关注了小鼠模型，未在人类样本中验证；且主要分析了雌性脂肪组织，对雄性机制探讨不足 | 探究IL-1β信号如何通过B细胞影响衰老相关脂肪组织炎症和代谢功能 | 小鼠内脏白色脂肪组织（vWAT）中的免疫细胞 | 免疫学 | 衰老相关代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据 | B细胞特异性Ilr1敲除小鼠（BKO）及对照小鼠的脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 697 | 2026-05-09 |
CD146+ CAFs mediate immunosuppression in gastric cancer via COL4A1: potential therapeutic targets
2025-Dec-21, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013577
PMID:41423274
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序鉴定胃癌中CD146+癌症相关成纤维细胞亚群，并揭示其通过COL4A1介导免疫抑制的机制，为靶向治疗提供新靶点 | 首次发现CD146+ CAFs亚群在胃癌中的免疫抑制作用，并阐明JAG1-NOTCH3/PI3K/AKT信号轴调控COL4A1分泌及M2型巨噬细胞极化的分子机制，提出CD146和COL4A1作为潜在治疗靶点 | 未提及具体限制 | 识别胃癌特异性癌症相关成纤维细胞亚群，阐明其免疫抑制作用的分子机制 | 胃癌组织中的癌症相关成纤维细胞和匹配的正常成纤维细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 9对患者肿瘤及相邻正常组织样本，共8,322个高质量成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 698 | 2026-05-09 |
Epidermal Loss of PRMT5 Leads to the Emergence of an Atypical Basal Keratinocyte-Like Cell Population and Defective Epidermal Stratification
2025-Dec, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.04.008
PMID:40339790
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研究论文 | 本研究通过条件性敲除小鼠模型，发现PRMT5缺失导致基底角质细胞样异常细胞群出现和表皮分层缺陷 | 首次揭示PRMT5通过抑制Cdkn1a表达来阻止基底角质细胞衰老，为先天性皮肤病的表观遗传调控提供新见解 | NA | 探究PRMT5在体内维持角质细胞干细胞表型的作用及其机制 | 条件性敲除Prmt5的小鼠表皮 | 机器学习 | 先天性皮肤病 | 单细胞RNA测序、转座酶可及染色质高通量测序 | NA | 单细胞转录组数据、染色质可及性数据 | 条件性敲除Prmt5小鼠及其对照 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、单细胞ATAC测序 | 10x Chromium | NA |
| 699 | 2026-05-09 |
High Shear Stress-Induced Endothelial Piezo1 Downregulation Promotes Intracranial Aneurysm Formation via the PDGF-BB/PDGFRβ Paracrine Signaling Pathway
2025-Dec, CNS neuroscience & therapeutics
IF:4.8Q1
DOI:10.1002/cns.70715
PMID:41457305
|
研究论文 | 本研究揭示了高剪切应力通过下调内皮细胞Piezo1表达，激活YAP/β-catenin通路促进PDGF-BB分泌，进而诱导血管平滑肌细胞表型转化并促进颅内动脉瘤形成的机制 | 首次阐明内皮Piezo1通过PDGF-BB/PDGFRβ旁分泌信号通路介导高剪切应力与颅内动脉瘤形成的机械生物学耦合机制 | 未提及具体局限性 | 探究高剪切应力下内皮Piezo1调控颅内动脉瘤形成的机械生物学机制 | 人类颅内动脉瘤标本、内皮细胞、血管平滑肌细胞、Piezo1基因敲除小鼠颅内动脉瘤模型 | 机器学习和数字病理学未涉及，属于基础医学研究 | 颅内动脉瘤 | CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、细胞间通讯分析 | NA | 基因表达数据、组织样本 | 人类颅内动脉瘤样本、小鼠模型（8周龄雄性Piezo1flox/flox小鼠） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 700 | 2026-05-09 |
Three-dimensional cell spheroid technology: Recent advances and emerging strategies in cartilage regeneration
2025-11, Acta biomaterialia
IF:9.4Q1
DOI:10.1016/j.actbio.2025.10.001
PMID:41046113
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综述 | 本文综述了三维细胞球体技术在软骨再生中的最新进展和新兴策略，重点讨论了其形成机制、工程策略和临床应用，并分析了大规模生产和免疫安全等关键挑战 | 系统总结了三维细胞球体技术在软骨再生中的优势，包括模拟体内微环境、增强细胞间相互作用、促进细胞外基质生成，同时提出结合智能生物材料和机器学习等新兴解决方案以实现个性化标准化生产 | 临床转化受限于细胞球体的长期稳定性有限、大规模生产困难和体内植入后的免疫排斥反应 | 总结三维细胞球体技术在软骨再生领域的最新发展和未来方向，促进临床转化应用 | 三维细胞球体技术及其在软骨损伤修复、骨关节炎模型构建、药物筛选平台开发中的应用 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 三维细胞球体技术、单细胞RNA测序 | 机器学习 | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |