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当前共找到 10549 篇文献，本页显示第 6961 - 6980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6961 | 2025-10-06 |
Unveiling a novel cancer hallmark by evaluation of neural infiltration in cancer
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf082
PMID:40052442
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研究论文 | 通过评估肿瘤微环境中的神经浸润程度，揭示其作为癌症标志物的作用 | 提出癌症相关神经浸润评分(C-Neural评分)，首次系统评估神经浸润作为癌症标志物的重要性 | 研究基于回顾性数据分析，需要更多实验验证 | 探索神经浸润在肿瘤微环境中的作用及其作为癌症标志物的潜力 | 10种癌症类型的肿瘤样本 | 生物信息学 | 癌症 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 预测评分模型 | 基因表达数据 | 40个批量RNA-seq数据集和55个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 6962 | 2025-10-06 |
Integrating mitochondrial and lysosomal gene analysis for breast cancer prognosis using machine learning
2025-01-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86970-4
PMID:39865118
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研究论文 | 本研究通过机器学习整合线粒体和溶酶体基因分析，开发乳腺癌预后预测模型 | 首次将线粒体和溶酶体共调控因子结合用于乳腺癌预后预测，并发现SHMT2关键基因的功能 | 研究样本量未明确说明，需要进一步临床验证 | 开发乳腺癌预后预测模型，为患者分层和个性化干预提供基础 | 乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | 差异分析、拷贝数变异、单核苷酸多态性、相关性分析、WGCNA、单变量Cox回归、单细胞RNA测序 | CoxBoost + Survivor-SVM | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6963 | 2025-10-06 |
Real-world effectiveness and safety of oral azvudine versus nirmatrelvir‒ritonavir (Paxlovid) in hospitalized patients with COVID-19: a multicenter, retrospective, cohort study
2025-Jan-17, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02126-w
PMID:39819859
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研究论文 | 比较阿兹夫定与奈玛特韦-利托那韦在COVID-19住院患者中的真实世界疗效和安全性 | 首次通过大规模多中心回顾性队列研究比较两种药物的临床效果，并发现阿兹夫定对肝癌患者具有额外抗肿瘤作用 | 回顾性研究设计存在潜在偏倚，未采用随机分组 | 评估阿兹夫定与Paxlovid在COVID-19住院患者中的疗效和安全性差异 | COVID-19住院患者，特别是合并恶性肿瘤的患者 | 临床医学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序，Kaplan-Meier分析，Cox回归模型 | Cox回归模型 | 临床数据，实验数据 | 40,876名住院患者（倾向评分匹配后3,606名） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6964 | 2025-10-06 |
Novel insights from comprehensive analysis: The role of cuproptosis and peripheral immune infiltration in Alzheimer's disease
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0325799
PMID:40560886
|
研究论文 | 通过综合分析铜死亡和免疫浸润在阿尔茨海默病中的作用，识别了五个关键特征基因 | 首次系统研究铜死亡相关基因在阿尔茨海默病外周免疫细胞中的作用机制 | 样本来源主要依赖公共数据库，实验验证仅限于部分基因的qPCR验证 | 探索铜死亡相关基因在阿尔茨海默病发病机制中的作用 | 阿尔茨海默病患者的外周血细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 基因表达分析，机器学习，单细胞RNA测序，实时定量PCR，分子对接 | 四种机器学习模型 | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | GEO数据库中的阿尔茨海默病患者样本 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6965 | 2025-10-06 |
Optimization of clustering parameters for single-cell RNA analysis using intrinsic goodness metrics
2025, Frontiers in bioinformatics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fbinf.2025.1562410
PMID:40567596
|
研究论文 | 本研究利用内在质量指标优化单细胞RNA测序分析中的聚类参数 | 使用内在质量指标预测不同参数下聚类方法的准确性，并识别出可用于快速比较不同聚类参数配置的代理指标 | 仅使用了三个数据集和两种聚类方法，可能无法代表所有单细胞RNA测序数据的多样性 | 优化单细胞RNA测序分析中的聚类参数选择 | 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 线性混合回归模型, ElasticNet回归模型 | 单细胞RNA测序数据 | 三个来自不同解剖区域的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6966 | 2025-10-06 |
Stemness-driven clusters in ovarian cancer: immune characteristics and prognostic implications
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1577283
PMID:40567611
|
研究论文 | 本研究通过鉴定卵巢癌中的干细胞性相关亚型，建立了预后预测模型并发现AKAP12作为潜在治疗靶点 | 首次在卵巢癌中定义了三种干细胞性相关分子亚型，发现成纤维细胞在维持肿瘤干细胞特性中的关键作用，并鉴定AKAP12为新的干细胞性相关生物标志物 | 研究主要基于细胞系和有限临床样本，需要更大规模的前瞻性研究验证 | 探索卵巢癌中干细胞性相关亚型的特征及其治疗意义 | 卵巢癌患者、SKOV3细胞系、临床样本和卵巢癌类器官 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 转录组测序、单细胞RNA测序、免疫组织化学、功能验证实验 | WGCNA、LASSO回归、列线图 | 基因表达数据、单细胞数据、临床数据 | 卵巢癌患者队列和细胞系模型 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6967 | 2025-10-06 |
Hemoglobin-associated CALR in proximal tubule cells can be used as a biomarker for idiopathic membranous nephropathy
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1574852
PMID:40568201
|
研究论文 | 本研究通过尿液细胞RNA测序发现CALR基因可作为特发性膜性肾病的潜在生物标志物 | 首次发现血红蛋白相关CALR在近端肾小管细胞中的表达与IMN相关，并验证其作为诊断生物标志物的潜力 | 样本来源仅限于尿液和肾脏组织，需要更大规模研究验证临床适用性 | 识别特发性膜性肾病的尿液生物标志物并探究其疾病机制 | 特发性膜性肾病患者的尿液细胞和肾脏组织 | 生物信息学 | 肾脏疾病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 实时定量PCR | 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | RNA-seq, scRNA-seq | NA | NA |
| 6968 | 2025-10-06 |
Multi-omics analysis untangles the crosstalk between intratumor microbiome, lactic acid metabolism and immune status in lung squamous cell carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1603822
PMID:40568577
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示肺鳞状细胞癌中瘤内微生物组、乳酸代谢与免疫状态之间的相互作用关系 | 首次系统整合批量与单细胞转录组、基因组、瘤内微生物组和数字病理数据，建立了基于乳酸代谢模式的肺鳞癌分型系统，并开发了基于病理图像的深度学习预测模型 | 研究主要基于回顾性数据分析，需要进一步实验验证发现的机制通路 | 探索肺鳞状细胞癌中乳酸代谢模式与肿瘤生物学特征及免疫状态的关联 | 肺鳞状细胞癌患者的多组学数据 | 数字病理 | 肺癌 | 多组学分析, 单细胞转录组测序, 数字病理 | 深度学习, 机器学习 | 转录组数据, 基因组数据, 微生物组数据, 病理图像 | 多个数据集（具体样本数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 数字病理分析 | NA | NA |
| 6969 | 2025-10-06 |
Dual function of Gasdermin E: pyroptosis-mediated pan-cancer suppression versus HCC-specific oncogenic activity
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1626311
PMID:40568597
|
研究论文 | 本文探讨了Gasdermin E在肿瘤发生中的双重功能：通过焦亡介导的泛癌抑制作用与肝细胞癌特异性致癌活性 | 揭示了GSDME在肝细胞癌中异常过表达并通过非焦亡机制促进免疫抑制的独特现象 | 当前研究面临三大挑战：阐明HCC中GSDME过表达机制、明确非焦亡促癌途径分子枢纽、开发控制GSDME功能转换的精准策略 | 解析GSDME在肿瘤发生中的双重功能及其治疗潜力 | Gasdermin E蛋白及其在多种癌症中的表达和功能 | 癌症生物学 | 肝细胞癌、胃癌、结直肠癌、乳腺癌 | 表观遗传学分析、免疫细胞浸润分析 | NA | 分子生物学数据、表达谱数据 | NA | NA | 单细胞多组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 6970 | 2025-10-06 |
CCN1 Is a Therapeutic Target for Reperfused Ischemic Brain Injury
2025-Aug, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-024-01279-0
PMID:39028413
|
研究论文 | 本研究揭示CCN1是再灌注缺血性脑损伤的治疗靶点，通过干预脑膜淋巴系统调控系统性炎症 | 首次发现脑膜淋巴破坏通过降低CCN1表达减轻脑缺血再灌注损伤，并证实CCN1是脑-CLN轴炎症调控的关键介质 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化价值需进一步验证；CCN1作用机制尚未完全阐明 | 探究脑膜淋巴系统在缺血再灌注阶段调控系统性炎症的作用及机制 | 小鼠缺血再灌注脑损伤模型、脑膜淋巴管内皮细胞、脑浸润免疫细胞 | 神经科学 | 缺血性脑卒中 | 单细胞RNA测序、脑室内注射、空间记忆功能测试 | 动物疾病模型 | 基因表达数据、行为学数据、组织病理数据 | 未明确样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6971 | 2025-10-06 |
The human infertility single-cell testis atlas (HISTA): an interactive molecular scRNA-Seq reference of the human testis
2025-Jul, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.13637
PMID:38577799
|
研究论文 | 开发了一个名为HISTA的交互式单细胞RNA测序参考图谱，用于研究人类睾丸的基因表达 | 整合了来自多个供体、发育年龄和生育状态的单细胞RNA测序数据，创建了首个交互式人类睾丸分子图谱工具 | 数据集仅包含12个供者样本，样本量相对有限 | 构建人类睾丸单细胞转录组参考图谱，帮助科学家理解和研究人类精子发生过程 | 人类睾丸组织样本，包括健康成人对照、青少年和多种不孕症病例 | 生物信息学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | 机器学习 | 单细胞转录组数据 | 12个供者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6972 | 2025-10-06 |
Applications of spatial transcriptomics in studying spermatogenesis
2025-Jul, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.70043
PMID:40202007
|
综述 | 探讨空间转录组学技术在研究生精过程中的应用价值 | 系统阐述空间转录组学如何突破单细胞测序技术丢失空间信息的局限，在组织原位解析基因表达空间模式 | 作为综述文章未涉及具体实验数据验证 | 阐明空间转录组学在研究生精细胞发育调控机制中的应用前景 | 哺乳动物睾丸组织 | 空间转录组学 | 男性不育症 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6973 | 2025-10-06 |
spCLUE: a contrastive learning approach to unified spatial transcriptomics analysis across single-slice and multi-slice data
2025-Jun-23, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03636-0
PMID:40551235
|
研究论文 | 提出spCLUE框架，通过对比学习方法统一分析单切片和多切片空间转录组数据 | 结合多视图图网络、对比学习、注意力机制和批次提示模块，能够同时处理对齐和未对齐样本数据 | NA | 开发空间转录组数据分析工具，整合跨组织切片数据并识别一致的空间域 | 空间转录组数据中的spots（空间位点） | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | 多视图图网络, 对比学习, 注意力机制 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6974 | 2025-10-06 |
Distal electrical stimulation enhances neuromuscular reinnervation and satellite cell differentiation for functional recovery
2025-Jun-23, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04459-3
PMID:40551270
|
研究论文 | 本研究探讨远端电刺激通过促进神经肌肉接头再生和卫星细胞分化改善神经损伤后功能恢复的机制 | 首次结合单细胞RNA测序技术揭示远端电刺激对卫星细胞基因表达的调控作用，阐明其促进肌肉再生的分子机制 | 研究仅使用大鼠模型，样本量有限，电刺激参数尚未优化 | 研究远端电刺激对神经肌肉接头再生和卫星细胞活性的调控作用 | 斯普拉格-道利大鼠坐骨神经临界缺损模型 | 神经科学 | 周围神经损伤 | 单细胞RNA测序，组织学分析，生化检测，肌电图 | 动物模型 | 基因表达数据，组织图像，生理信号 | 未明确具体数量的大鼠样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6975 | 2025-10-06 |
CellMemory: hierarchical interpretation of out-of-distribution cells using bottlenecked transformer
2025-Jun-23, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03638-y
PMID:40551223
|
研究论文 | 本文提出了一种名为CellMemory的瓶颈Transformer模型，用于单细胞组学中分布外细胞的分层解释 | 受认知神经科学中全局工作空间理论启发，开发了具有改进泛化能力的瓶颈Transformer，无需预训练即可优于现有单细胞基础模型 | NA | 提高单细胞组学研究中分布外细胞的解释性和准确表示 | 分布外细胞、恶性细胞及其祖细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞组学、空间转录组学 | Transformer | 单细胞组学数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6976 | 2025-10-06 |
Predicting prognosis and immunotherapy response of ferroptosis-related genes in colorectal cancer
2025-Jun-23, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-02779-x
PMID:40551269
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据识别结直肠癌中铁死亡相关基因标志物，并评估其预后价值和免疫治疗反应 | 采用空间转录组、单细胞转录组和批量转录组数据整合的多组学分析方法，区别于以往研究 | NA | 识别与结直肠癌预后和免疫反应相关的铁死亡标志物 | 结直肠癌组织和铁死亡相关基因 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 空间转录组测序,单细胞转录组测序,批量转录组测序,免疫组织化学,Kaplan-Meier生存分析,ROC曲线,Lasso分析 | 预后模型 | 转录组数据,空间转录组数据,单细胞数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 6977 | 2025-10-06 |
Exploring the causal relationship between CX3CL1 and prostate cancer prognosis using Mendelian randomization
2025-Jun-22, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03001-4
PMID:40544418
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化方法探讨CX3CL1与前列腺癌预后的因果关系 | 首次使用孟德尔随机化方法验证CX3CL1与前列腺癌风险的因果关联，并结合单细胞测序分析其在肿瘤微环境中的表达特征 | 研究人群仅限于欧洲血统个体，可能限制结果在其他人群的普适性 | 探索炎症介质在前列腺癌发展和预后中的作用 | 前列腺癌患者和健康对照人群 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 全基因组关联研究(GWAS), 孟德尔随机化, 单细胞测序, 基因表达分析, 免疫细胞浸润分析 | 孟德尔随机化模型, meta分析模型 | 基因组数据, 基因表达数据, 临床预后数据 | GWAS数据涉及21,758名欧洲血统个体；前列腺癌数据集分别包含9,132例/173,493对照、7,847例/455,163对照、6,321例/354,873对照 | UK Biobank | 全基因组关联研究, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6978 | 2025-10-06 |
A comprehensive review of spatial transcriptomics data alignment and integration
2025-Jun-20, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf536
PMID:40568931
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综述 | 本文对空间转录组数据对齐和整合方法进行了全面回顾 | 提出了空间转录组数据对齐和整合的通用流程，并对24种相关工具进行了系统分类和评估 | 排除了仅关注单切片分析或多组学整合的工具，且在异质组织切片间实现稳健对齐仍面临挑战 | 回顾空间转录组数据对齐和整合方法，解释问题范围与挑战，并提出通用流程 | 空间转录组数据分析工具和方法 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组技术 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6979 | 2025-10-06 |
Diverse Landscape of Group 1 Innate Lymphoid Cells Predicts the Prognosis in Patients with Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2025-Jun-19, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17122047
PMID:40563696
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析头颈鳞状细胞癌患者中先天淋巴样细胞亚群的多样性及其预后预测价值 | 首次在头颈鳞癌中系统描绘了ieILC1/NK细胞的多样性景观，并发现ieILC1-1亚群具有最高免疫活性且主要来源于HPV阳性样本 | 研究基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 探索先天淋巴样细胞亚群在头颈鳞癌中的功能状态和预后意义 | 头颈鳞状细胞癌患者的免疫细胞 | 生物信息学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | 生存预测模型 | 单细胞RNA测序数据 | 95,809个免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6980 | 2025-10-06 |
The Role of Cardiac Fibroblast Heterogeneity in Myocardial Fibrosis and Its Novel Therapeutic Potential
2025-Jun-19, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26125882
PMID:40565343
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综述 | 本文综述了心脏成纤维细胞异质性在心肌纤维化中的作用及其新型治疗潜力 | 系统阐述了心脏成纤维细胞不同亚群的特征及其在细胞外基质重塑中的独特作用，并探讨了基于细胞异质性的精准抗纤维化治疗策略 | NA | 探讨心脏成纤维细胞异质性在心肌纤维化中的作用机制和治疗潜力 | 心脏成纤维细胞及其不同亚群 | 病理生理学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、谱系追踪、表观遗传分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |