单细胞与空转测序相关文章

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当前共找到 10776 篇文献,本页显示第 6841 - 6860 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
6841 2025-10-06
GeneDX-PBMC: An adversarial autoencoder framework for unlocking Alzheimer's disease biomarkers using blood single-cell RNA sequencing data
2025-Jun, Computers in biology and medicine IF:7.0Q1
研究论文 本研究开发了一个结合自编码器和分类器的深度学习框架,通过血液单细胞RNA测序数据识别阿尔茨海默病的生物标志物 采用对抗自编码器框架整合差异表达基因和传统方法常忽略的细微遗传变异,首次在PBMC单细胞水平系统分析AD相关基因 单核细胞数据存在限制需依赖随机森林分类器处理,样本来源仅限于外周血单核细胞 识别阿尔茨海默病的血液生物标志物和治疗靶点 阿尔茨海默病患者和认知正常对照者的外周血单核细胞 机器学习 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序 对抗自编码器, 随机森林 基因表达数据 AD患者和正常对照的PBMC样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6842 2025-10-06
Targeting BATF2-RGS2 axis reduces T-cell exhaustion and restores anti-tumor immunity
2025-May-30, Molecular cancer IF:27.7Q1
研究论文 本研究揭示BATF2-RGS2轴在调控T细胞耗竭和肿瘤免疫逃逸中的关键作用 首次发现BATF2通过转录调控RGS2驱动T细胞耗竭,并证明靶向该轴可增强抗肿瘤免疫 样本量较小(6例患者),主要基于小鼠模型,临床转化需进一步验证 探究RGS2在肺癌免疫调控中的作用及BATF2-RGS2轴的调控机制 肺癌患者样本、小鼠模型、CD8+ T细胞、3LL癌细胞 免疫学 肺癌 单细胞转录组分析、荧光素酶报告基因检测、体外共培养 基因敲除小鼠模型、肿瘤类器官模型 转录组数据、细胞实验数据 6例肺癌患者,多种基因型小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
6843 2025-10-06
Identification of Synovial Lymphatics in the TMJ and their Roles in Arthritis and Pain
2025-May-30, Research square
研究论文 本研究首次发现颞下颌关节中存在滑膜淋巴管,并揭示其在关节炎和疼痛中的作用机制 首次在颞下颌关节中鉴定出滑膜淋巴系统,并证明淋巴功能障碍会驱动关节炎和疼痛的发生 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限 探究颞下颌关节滑膜淋巴系统的存在及其在关节炎和疼痛中的作用 基因报告小鼠、人类组织样本 生物医学研究 颞下颌关节关节炎 基因报告技术、组织透明化、3D体积成像、功能遗传学、单细胞RNA测序 NA 图像、基因表达数据 小鼠模型和人类组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6844 2025-10-06
sciLaMA: A Single-Cell Representation Learning Framework to Leverage Prior Knowledge from Large Language Models
2025-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 提出一种名为sciLaMA的单细胞表示学习框架,通过整合多模态大语言模型的基因嵌入与单细胞RNA测序数据 开发了配对VAE架构,将静态基因嵌入与scRNA-seq表格数据相结合,生成上下文感知的细胞和基因表示 未在摘要中明确说明研究局限性 解决单细胞RNA测序数据分析中的技术和方法学挑战 单细胞RNA测序数据 机器学习 NA 单细胞RNA测序 配对VAE, 大语言模型 基因表达表格数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
6845 2025-10-06
MIC-Drop-seq: Scalable single-cell phenotyping of mutant vertebrate embryos
2025-May-29, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 开发了一种结合高通量基因编辑和单细胞RNA测序的技术平台,用于斑马鱼胚胎的大规模遗传筛选 将多重混合CRISPR液滴技术与多重单细胞RNA测序相结合,实现了在脊椎动物胚胎中进行大规模基因功能筛选 技术主要应用于斑马鱼胚胎模型,在其他脊椎动物中的应用仍需验证 建立可扩展的基因功能映射平台,研究脊椎动物发育过程中的基因功能 斑马鱼胚胎 单细胞测序技术 发育生物学 单细胞RNA测序, CRISPR基因编辑 NA 单细胞基因表达数据 1000个斑马鱼胚胎,靶向50个转录调控因子 NA 单细胞RNA测序 MIC-Drop-seq 多重混合CRISPR液滴与多重单细胞RNA测序结合平台
6846 2025-10-06
Spatiotemporal transcriptomic analysis during cold ischemic injury to the murine kidney reveals compartment-specific changes
2025-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 利用空间转录组技术分析小鼠肾脏冷缺血损伤期间的时空转录组变化 首次在肾脏冷缺血损伤中应用空间转录组技术进行全转录组表征,并开发了计算工作流程识别区室特异性变化 研究基于小鼠模型,结果向人类临床转化的有效性需进一步验证 揭示冷缺血损伤的分子机制及其对肾脏移植结局的影响 小鼠肾脏组织 空间转录组学 肾脏疾病 空间转录组学 NA 空间转录组数据 小鼠肾脏样本(0-48小时冷缺血时间系列) NA 空间转录组学 NA NA
6847 2025-10-06
Bridging Large Language Models and Single-Cell Transcriptomics in Dissecting Selective Motor Neuron Vulnerability
2025-May-12, ArXiv
PMID:40463696
研究论文 提出一个利用大语言模型和单细胞转录组学分析选择性运动神经元易损性的新框架 首次将基因特异性文本注释与单细胞RNA测序数据结合,通过表达加权平均生成生物学背景化的细胞嵌入表示 NA 解析选择性运动神经元易损性,改进细胞类型识别和功能分析 单细胞RNA测序数据中的细胞 自然语言处理,计算生物学 运动神经元疾病 单细胞RNA测序 大语言模型,BioBERT,SciBERT 文本,基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
6848 2025-10-06
Oligodendroglia vulnerability in the human dorsal striatum in Parkinson's disease
2025-05-05, Acta neuropathologica IF:9.3Q1
研究论文 通过单核RNA测序和空间转录组学揭示帕金森病患者背侧纹状体中少突胶质细胞的脆弱性 首次在人类帕金森病背侧纹状体中系统鉴定出15种少突胶质细胞亚类,其中4种为疾病特异性群体,并发现其热休克蛋白过表达、髓鞘形成异常和细胞通讯受损等特征 研究样本量未明确说明,仅提及分析了约20万个少突胶质细胞核 阐明帕金森病中少突胶质细胞的多样性及其在疾病中的变化 人类尾状核和壳核(背侧纹状体)组织样本 数字病理学 帕金森病 单核RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 约200,000个少突胶质细胞核(来自帕金森病患者和对照脑组织捐赠者) NA 单核RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
6849 2025-10-06
General and individualized changes in T cell immunity during aging
2025-May-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
综述 本文综述了T细胞免疫在衰老过程中的普遍性和个体化变化 系统区分了T细胞衰老的普遍性变化(影响所有个体)和特异性变化(个体独有),并整合了单细胞测序技术的新发现 NA 探讨衰老过程中T细胞亚群、转录组和TCR谱系的变化规律 人类T细胞免疫系统 免疫学 衰老相关疾病 单细胞测序 NA 转录组数据、TCR序列数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
6850 2025-10-06
Single-Cell Profiling of Mononuclear Cells Identifies Transcriptomics Signatures Differentiating Prostate Cancer From Benign Prostatic Hyperplasia
2025-May, Genes, chromosomes & cancer
研究论文 通过单细胞RNA测序分析前列腺癌和良性前列腺增生患者外周血单核细胞的转录组特征差异 首次在单细胞水平揭示前列腺癌与良性前列腺增生患者外周血免疫细胞的转录组差异和免疫微环境特征 样本量较小(4例前列腺癌和3例良性前列腺增生),需要更大规模研究验证 识别区分前列腺癌和良性前列腺增生的转录组生物标志物 前列腺癌和良性前列腺增生患者的外周血单核细胞 单细胞转录组学 前列腺癌 单细胞RNA测序 差异基因表达分析、通路分析、CellChat分析 单细胞转录组数据 7例患者(4例前列腺癌,3例良性前列腺增生) NA 单细胞RNA测序 NA NA
6851 2025-10-06
Single-cell sequencing reveals shared clonal signatures in nonmalignant B and tumor cells in T-prolymphocytic leukemia
2025-May, Blood neoplasia
研究论文 本研究通过单细胞测序揭示T细胞前淋巴细胞白血病中非恶性B细胞与肿瘤细胞共享的克隆特征 首次在单细胞水平证实T-PLL中非恶性B细胞与克隆性T细胞存在共享突变 样本量有限(16例患者),仅对9例患者获得复发样本 阐明T细胞前淋巴细胞白血病的克隆起源和进化动力学 16例T-PLL患者的非恶性细胞和肿瘤细胞 单细胞基因组学 白血病 靶向二代测序, 液滴数字PCR, 单细胞多组学分析 NA 基因组DNA, 细胞表面蛋白标记 16例T-PLL患者,其中9例有配对的诊断和复发样本 Mission Bio 单细胞多组学 Tapestri Platform Mission Bio Tapestri单细胞分析平台
6852 2025-10-06
In mice, discrete odors can selectively promote the neurogenesis of sensory neuron subtypes that they stimulate
2025-Mar-11, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 研究发现特定气味能选择性促进小鼠嗅觉感觉神经元亚型的神经发生 首次证明离散气味能特异性加速对其敏感的嗅觉神经元亚型的生成速率 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在其它哺乳动物中验证 探究嗅觉刺激如何影响特定嗅觉感觉神经元亚型的神经发生 小鼠嗅觉感觉神经元 神经科学 NA 单细胞RNA测序, 亚型特异性神经元出生日期标记 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
6853 2025-10-06
A tumor cornification and immune-infiltration-based scheme for anti-PD-1 plus chemotherapy response in advanced squamous cell lung carcinoma
2025-Feb-14, Med (New York, N.Y.)
研究论文 本研究基于肿瘤角质化和免疫浸润特征建立了一个预测晚期肺鳞癌患者抗PD-1联合化疗疗效的新方案 首次提出基于肺鳞癌免疫浸润和角质化特征分类(LICC)的方案,并发现SPRR3+肿瘤细胞通过CD24-SIGLEC10轴介导免疫逃逸的新机制 研究样本量相对有限,需要更大规模的前瞻性研究验证LICC方案的临床适用性 探索预测肺鳞癌患者抗PD-1免疫治疗联合化疗疗效的生物标志物 晚期肺鳞癌患者 肿瘤免疫学 肺鳞癌 RNA测序,流式细胞术,多重免疫组织化学,单细胞RNA测序 NA RNA测序数据,流式细胞数据,免疫组化数据 349例来自ORIENT-12临床试验的肺鳞癌样本,外加其他临床队列验证 NA RNA-seq,单细胞RNA-seq,流式细胞术,多重免疫组织化学 NA NA
6854 2025-10-06
Early downmodulation of tumor glycolysis predicts response to fasting-mimicking diet in triple-negative breast cancer patients
2025-Feb-04, Cell metabolism IF:27.7Q1
研究论文 本研究探讨模拟禁食饮食联合化疗对三阴性乳腺癌患者的治疗效果及机制 首次发现高糖酵解癌细胞在治疗早期出现糖酵解通路下调可预测三阴性乳腺癌患者对模拟禁食饮食的治疗反应 样本量较小(30例患者),需更大规模临床试验验证 评估周期性模拟禁食饮食联合术前化疗对早期三阴性乳腺癌患者的疗效 30例早期三阴性乳腺癌患者 肿瘤代谢研究 三阴性乳腺癌 RNA测序, 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 30例早期三阴性乳腺癌患者 NA 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 NA NA
6855 2025-10-06
Cross-cellular analysis of chromatin accessibility markers H3K4me3 and DNase in the context of detecting cell-identity genes: An "all-or-nothing" approach
2025-02, Journal of bioinformatics and computational biology IF:0.9Q4
研究论文 通过分析染色质可及性标记H3K4me3和DNase,提出跨细胞染色质开放度(CCO)水平来预测细胞特异性基因 首次提出跨细胞染色质开放度(CCO)概念,并证明其与基因必需性状态的相关性 仅使用两种分化实验进行验证,数据来源可能有限 研究染色质可及性标记与细胞特异性基因检测的关联 不同细胞系中的染色质可及性标记(H3K4me3和DNase) 表观遗传学 NA 染色质可及性分析,scRNA-Seq,bulk RNA-Seq NA 表观基因组数据,基因表达数据 多个细胞系 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序,染色质可及性分析 NA NA
6856 2025-10-06
Single-cell and spatial characterization of plasmablast-like lymphoma cells in primary central nervous system lymphoma
2025-Feb, Blood neoplasia
研究论文 通过单细胞和空间多组学分析揭示了原发性中枢神经系统淋巴瘤中浆母细胞样淋巴瘤细胞的异质性和微环境特征 首次在PCNSL中鉴定出具有浆母细胞特征的淋巴瘤亚群,并揭示了其空间分布异质性和与微环境的独特相互作用 样本量相对有限,需要更大规模的研究验证发现 阐明PCNSL的细胞和空间异质性及微环境特征 原发性中枢神经系统淋巴瘤患者样本 数字病理学 淋巴瘤 单细胞测序, 空间多组学分析, B细胞受体分析, 免疫组织化学染色 NA 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 蛋白质表达数据 PCNSL患者队列(扩展研究中约40%患者具有PBL特征亚群) NA 单细胞RNA-seq, 空间多组学 NA NA
6857 2025-10-06
Deciphering the Regulatory Networks of the Migrasome-Associated Cell Subpopulation in Heterotopic Ossification via Multi-Omics Analysis
2025-Jun-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 通过多组学分析揭示异位骨化中迁移体相关细胞亚群的调控网络 首次识别出间充质谱系细胞作为关键的迁移体相关细胞亚型,并确定Ppib和Tagln为关键分子,构建了其调控网络和空间分布模式 研究主要基于公共数据库数据,实验验证可能有限 阐明异位骨化的关键生物分子网络和调控机制 异位骨化组织样本 生物信息学 异位骨化 单细胞转录组测序, 批量转录组测序, 空间转录组测序, 多组学分析 高维加权基因共表达网络分析, 机器学习 转录组数据, 空间转录组数据 来自GEO数据库的多个数据集和临床样本 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 批量RNA-seq NA NA
6858 2025-10-06
Integrating Single-Cell and Experimental Analyses Uncover Macrophage Ferroptosis Is a Key Event in the Development of Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2025-Jun-30, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 通过整合单细胞测序和实验分析,揭示巨噬细胞铁死亡是慢性阻塞性肺疾病发展的关键事件 首次结合单细胞测序和实验验证,系统阐明香烟烟雾通过诱导巨噬细胞铁死亡促进COPD发展的机制 研究主要基于公共数据库和小鼠模型,需要进一步人类样本验证 探究香烟烟雾诱导的巨噬细胞铁死亡在COPD发病机制中的作用 COPD患者肺组织、RAW264.7细胞系、BMDM细胞、COPD小鼠模型 单细胞生物学 慢性阻塞性肺疾病 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 免疫组化, qRT-PCR, western blotting NA 单细胞测序数据, 基因表达数据, 蛋白质表达数据 公共数据库GSE171541和GSE173896的单细胞数据,体外和体内细胞系实验 NA 单细胞RNA测序 NA NA
6859 2025-10-06
Quantitative measurement of phenotype dynamics during cancer drug resistance evolution using genetic barcoding
2025-Jun-20, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 提出一种通过遗传谱系追踪和种群规模数据推断癌症耐药性动态的数学框架 无需直接测量耐药表型即可推断耐药性动态的数学框架 未直接测量耐药表型,依赖推断方法 理解癌症耐药性进化机制 结直肠癌细胞系SW620和HCT116 计算生物学 结直肠癌 遗传条形码技术、单细胞RNA测序、单细胞DNA测序 数学框架 遗传谱系追踪数据、种群规模数据 两种结直肠癌细胞系 NA 单细胞RNA测序,单细胞DNA测序 NA NA
6860 2025-10-06
ISCU-p53 axis orchestrates macrophage polarization to dictate immunotherapy response in esophageal squamous cell carcinoma
2025-Jun-20, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示食管鳞状细胞癌中ISCU-p53轴通过调控巨噬细胞极化影响免疫治疗反应的机制 首次发现ISCU通过胞质滞留p53促进M2巨噬细胞极化的新机制,并证明靶向ISCU可增强抗PD-1抗体疗效 NA 探索食管鳞状细胞癌免疫治疗反应差异的分子机制 食管鳞状细胞癌患者的肿瘤微环境细胞 单细胞生物学 食管鳞状细胞癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 接受PD-1抑制剂治疗的部分缓解、疾病稳定患者及未接受术前治疗的手术患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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