单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7416 篇文献，本页显示第 6841 - 6860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6841 | 2025-03-04 |
Dual function of MrgprB2 receptor-dependent neural immune axis in chronic pain
2025-Feb-28, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.02.037
PMID:40024332
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研究论文 | 本文研究了MrgprB2受体依赖的神经免疫轴在化疗药物诱导的神经性疼痛（CINP）中的双向调节作用 | 揭示了MrgprB2/Tryptase/PAR2轴在CINP疼痛发展和缓解中的双向作用，强调了MrgprB2作为早期干预CINP的关键靶点 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探讨MrgprB2介导的神经免疫相互作用在CINP中的双向调节作用 | 野生型小鼠、MrgprD敲除小鼠、肥大细胞缺陷小鼠、MrgprB2敲除小鼠和MrgprB2-Cre tdTomato小鼠 | 神经免疫学 | 神经性疼痛 | 钙成像、细胞因子抗体阵列、单细胞测序数据库挖掘、免疫荧光、Western blotting、共免疫沉淀（Co-IP） | NA | 实验数据 | 多种基因修饰小鼠模型 |
| 6842 | 2025-03-04 |
SpaceBar enables clone tracing in spatial transcriptomic data
2025-Feb-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.10.637514
PMID:39990434
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SpaceBar的细胞条形码策略，能够同时进行克隆追踪和空间转录组分析 | 创新点在于使用96个合成条形码序列，通过成像空间转录组学（seqFISH）进行检测，每个细胞被标记为条形码的组合，从而在复杂组织环境中区分克隆动态和环境驱动的转录调控 | NA | 研究目的是开发一种能够同时进行克隆追踪和空间转录组分析的方法 | 研究对象是黑色素瘤细胞在肿瘤异种移植模型中的克隆身份和空间基因表达 | 空间转录组学 | 黑色素瘤 | seqFISH | NA | 空间转录组数据 | NA |
| 6843 | 2025-03-04 |
Spatially distinct cellular and molecular landscapes define prognosis in triple negative breast cancer
2025-Feb-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.10.637503
PMID:39990419
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，深入探讨了三阴性乳腺癌（TNBC）中不同预后群体的细胞和分子异质性 | 首次利用空间转录组学技术，详细描绘了TNBC中不同预后群体的细胞和分子基础，揭示了上皮细胞及其微环境在转录水平上的显著差异 | 样本量相对较小，仅包括32名女性患者，且为回顾性研究，可能影响结果的普遍性 | 探讨TNBC中不同预后群体的细胞和分子异质性，以揭示预后差异的分子驱动因素 | 32名未经治疗的三阴性乳腺癌女性患者，分为良好预后组（GPx）和不良预后组（PPx） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学，GeoMX® Digital Spatial Profiler，卷积神经网络（CNN） | 卷积神经网络（CNN） | 空间转录组数据 | 32名女性患者（17名良好预后，15名不良预后） |
| 6844 | 2025-03-04 |
Single-cell transcriptomics of X-ray irradiated Drosophila wing discs reveals heterogeneity related to cell-cycle status and cell location
2025-Feb-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.10.627868
PMID:39990483
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术研究了X射线辐射对果蝇翅膀原基的影响，揭示了细胞周期状态和细胞位置相关的异质性 | 首次在果蝇翅膀原基中应用单细胞RNA测序技术，揭示了X射线辐射后细胞间的异质性，并引入了赫芬达尔-赫希曼指数来量化基因表达的异质性 | 研究仅限于果蝇翅膀原基，未涉及其他组织或生物体 | 研究X射线辐射对果蝇翅膀原基细胞的影响，特别是细胞异质性 | 果蝇翅膀原基细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确提及样本数量，但涉及果蝇翅膀原基的多个细胞 |
| 6845 | 2025-03-04 |
Molecularly-guided spatial proteomics captures single-cell identity and heterogeneity of the nervous system
2025-Feb-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.10.637505
PMID:39990460
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研究论文 | 本文介绍了利用空间单细胞蛋白质组学技术研究神经系统异质性的方法 | 通过免疫染色引导的激光捕获显微切割（LCM）结合液相色谱-质谱（LC-MS）技术，首次在异质性中枢神经系统中应用空间单细胞蛋白质组学 | 研究主要集中在中枢神经系统和周围神经系统的特定区域，未涵盖所有神经系统区域 | 研究神经系统中的单细胞异质性及其在神经疾病中的作用 | 大脑皮层、黑质、肠肌层神经节和神经束 | 蛋白质组学 | 神经疾病 | 免疫染色引导的激光捕获显微切割（LCM）结合液相色谱-质谱（LC-MS） | NA | 蛋白质组数据 | 多个大脑区域和神经组织的单细胞样本 |
| 6846 | 2025-03-04 |
A Benchmarking Study of Random Projections and Principal Components for Dimensionality Reduction Strategies in Single Cell Analysis
2025-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.04.636499
PMID:39974925
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研究论文 | 本研究系统评估了主成分分析（PCA）和随机投影（RP）方法在单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据降维中的性能，重点关注计算效率和下游分析效果 | 首次全面比较PCA和RP方法在scRNA-seq数据中的应用，特别是RP在计算速度和数据变异性保持方面的优势 | 研究主要基于公开数据集，可能无法完全代表所有单细胞数据的特性 | 评估和比较不同降维策略在单细胞分析中的效果 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | PCA, RP, SVD, 随机SVD, 稀疏随机投影, 高斯随机投影 | 单细胞RNA测序数据 | 多个公开的标记和未标记scRNA-seq数据集 |
| 6847 | 2025-03-04 |
Seq-Scope-eXpanded: Spatial Omics Beyond Optical Resolution
2025-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.04.636355
PMID:39975076
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研究论文 | 本文介绍了Seq-Scope-X，一种通过组织扩展实现亚微米分辨率的空间转录组学技术，突破了传统测序方法的限制 | Seq-Scope-X通过物理放大组织，减少了转录扩散效应，并将空间特征密度提高了一个数量级，实现了亚微米分辨率 | NA | 开发一种超越光学分辨率的空间转录组学技术，以更精确地解析细胞结构和功能 | 肝脏组织、脑组织、结肠组织、小鼠脾脏和人类扁桃体 | 空间组学 | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学 | NA | 转录组数据、蛋白质组数据 | NA |
| 6848 | 2025-03-04 |
scBSP: A fast and accurate tool for identifying spatially variable features from high-resolution spatial omics data
2025-Feb-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.02.636138
PMID:39974940
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研究论文 | 本文介绍了一个名为scBSP的开源工具，用于从高分辨率空间组学数据中识别空间可变特征 | scBSP利用稀疏矩阵操作显著提高了计算效率，能够在短时间内处理包含数百万细胞的高分辨率空间组学数据，并保持高准确性 | 未明确提及具体局限性 | 开发一个高效且准确的工具，用于识别高分辨率空间组学数据中的空间可变特征 | 高分辨率空间组学数据 | 空间组学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间组学数据 | 19,950个基因和181,367个点 |
| 6849 | 2025-03-04 |
The profiles of immunosuppressive microenvironment in the Lauren intestinal-type gastric adenocarcinoma
2025-Feb-01, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03938-5
PMID:39891785
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术，深入探讨了Lauren肠型胃腺癌（IGAC）中免疫抑制微环境的细胞亚群及其机制 | 首次详细描绘了IGAC中免疫抑制细胞亚群的组成及其功能，特别是HAVCR2+VCAM1+ Texs和LAYN+TNFRSF4+ Tregs的作用 | 样本量相对较小，仅包括15名中国患者，可能限制了结果的普遍性 | 研究IGAC中免疫抑制的机制，以发现增强免疫治疗效果的新靶点 | 15名诊断为IGAC的中国患者的肿瘤组织和对应的非癌性黏膜 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间分辨转录组学（SRT）、免疫荧光（IF）、流式细胞术（FCM） | NA | RNA测序数据、图像数据 | 15名中国IGAC患者的肿瘤组织和对应的非癌性黏膜 |
| 6850 | 2025-03-04 |
CFTR High Expresser BEST4+ cells are pH-sensing neuropod cells: new implications for intestinal physiology and Cystic Fibrosis disease
2025-Jan-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.24.634747
PMID:39974899
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，揭示了人类肠道中一种新型上皮细胞亚群BEST4+细胞，这些细胞在pH调节、GPCR酸感应受体、饱腹感、cGMP信号传导等方面具有特殊功能，并与囊性纤维化疾病相关 | 首次将BEST4+细胞与CFTR高表达细胞（CHE）亚群联系起来，并揭示了它们在肠道pH调节和囊性纤维化疾病中的潜在作用 | 研究主要基于大鼠模型，人类样本的验证仍需进一步研究 | 探讨BEST4+细胞在肠道生理和囊性纤维化疾病中的作用 | 人类和大鼠肠道中的BEST4+细胞 | 生物医学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 大鼠肠道样本 |
| 6851 | 2025-03-03 |
Multi-omics analysis to explore the molecular mechanisms related to keloid
2025-Apr, Burns : journal of the International Society for Burn Injuries
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.burns.2025.107396
PMID:39874886
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研究论文 | 本研究通过多组学分析探索了瘢痕疙瘩的分子机制，识别了关键基因和免疫细胞的作用，并提出了潜在的治疗靶点 | 结合bulk RNA测序、孟德尔随机化、免疫浸润分析和单细胞RNA测序，揭示了DUSP1和HOXA5在瘢痕疙瘩中的关键作用，并提出了IL17信号通路作为潜在治疗靶点 | 研究主要基于基因表达和免疫细胞分析，缺乏体内实验验证，且样本量未明确说明 | 识别瘢痕疙瘩的致病机制、关键基因和免疫细胞的作用，为靶向治疗提供新见解 | 瘢痕疙瘩组织 | 生物信息学 | 皮肤疾病 | bulk RNA测序、单细胞RNA测序、孟德尔随机化、免疫浸润分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 6852 | 2025-03-03 |
Single-cell RNA sequencing reveals a key regulator ZmEREB14 affecting shoot apex development and yield formation in maize
2025-Mar, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14537
PMID:39630144
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术揭示了影响玉米顶端分生组织发育和产量形成的关键调控因子ZmEREB14 | 首次在单细胞分辨率下揭示了玉米顶端分生组织的异质性，并鉴定了调控其发育的关键转录因子ZmEREB14 | 研究仅基于5天龄的玉米顶端分生组织，未涵盖其他发育阶段 | 探究玉米顶端分生组织发育的分子机制及其对产量形成的影响 | 玉米顶端分生组织 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 约12,700个细胞 |
| 6853 | 2025-03-03 |
Applications of Single-Cell Omics Technologies for Induced Pluripotent Stem Cell-Based Cardiovascular Research
2025-Feb-28, International journal of stem cells
IF:2.5Q3
DOI:10.15283/ijsc23183
PMID:39129179
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review | 本文综述了单细胞组学技术与诱导多能干细胞（iPSCs）在心血管研究中的应用，旨在深化对心脏生物学的理解 | 整合单细胞组学与iPSCs技术，探索其在心血管研究中的协同潜力，并展望单细胞/空间组学等新兴范式的前景 | NA | 通过单细胞组学技术揭示心脏健康和疾病的分子复杂性，推动心血管研究的发展 | 心脏细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，单细胞/空间组学 | NA | 基因组、转录组、蛋白质组数据 | NA |
| 6854 | 2025-03-03 |
A novel telomere-associated genes signature for the prediction of prognosis and treatment responsiveness of hepatocellular carcinoma
2025-Feb-27, Biological procedures online
IF:3.7Q1
DOI:10.1186/s12575-025-00271-8
PMID:40016654
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研究论文 | 本研究开发了一种基于18个端粒相关基因（TRGs）的肝细胞癌（HCC）预后风险模型，并通过多种实验验证了其预测准确性 | 首次通过孟德尔随机化（MR）分析确认了ASF1A与酒精性HCC之间的因果关系，为酒精性HCC的管理提供了新的理论基础 | 研究样本量相对较小，且主要依赖于TCGA数据库的数据，可能限制了模型的泛化能力 | 开发一种新的HCC预后模型，并探索端粒相关基因在HCC中的作用 | 肝细胞癌（HCC）患者及其相关基因 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组学、空间转录组学、Western blotting、Transwell迁移实验、伤口愈合实验、克隆形成实验 | Cox回归模型、LASSO回归模型 | 基因表达数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 374例HCC样本和50例正常肝组织样本 |
| 6855 | 2025-03-02 |
Single-cell analysis of cerebrospinal fluid reveals common features of neuroinflammation
2025-Jan-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2024.101733
PMID:39708811
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了不同炎症、感染和非炎症性神经系统疾病患者脑脊液中免疫细胞的功能特征 | 揭示了脑脊液在细胞组成和基因表达方面与外周血的区别，并发现不同神经炎症性疾病中脑脊液的细胞和转录景观具有显著的相似性 | 未明确提及样本量大小，可能限制了结果的广泛适用性 | 探索神经炎症中脑脊液免疫细胞的功能特征，以寻找多发性硬化症等疾病的新药物靶点 | 不同炎症、感染和非炎症性神经系统疾病患者的脑脊液 | 生物信息学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 6856 | 2025-03-02 |
Single-cell and spatial analysis reveals the interaction between ITLN1+ foam cells and SPP1+ macrophages in atherosclerosis
2025, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2025.1510082
PMID:40017519
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，揭示了ITLN1+泡沫细胞与SPP1+巨噬细胞在动脉粥样硬化中的相互作用 | 首次揭示了ITLN1+泡沫细胞与SPP1+巨噬细胞之间的相互作用及其在动脉粥样硬化中的关键作用 | 需要进一步验证这些机制以开发有效的免疫治疗策略 | 研究动脉粥样硬化中不同细胞群体的调控功能及其相互作用 | 血管平滑肌细胞（VSMC）衍生的ITLN1+泡沫细胞和SPP1+ FABP5+巨噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，空间转录组学分析 | NA | RNA测序数据，空间转录组数据 | NA |
| 6857 | 2025-03-02 |
Single-cell Analysis Highlights Anti-apoptotic Subpopulation Promoting Malignant Progression and Predicting Prognosis in Bladder Cancer
2025, Cancer informatics
IF:2.4Q3
DOI:10.1177/11769351251323569
PMID:40018511
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研究论文 | 本文通过单细胞分析揭示了膀胱癌中抗凋亡亚群在恶性进展和预后预测中的关键作用 | 识别了一个独特的抗凋亡肿瘤亚群，该亚群通过特定的信号通路与免疫和基质细胞相互作用，促进肿瘤进展，并开发了一个5基因风险模型来预测患者预后 | NA | 阐明膀胱癌肿瘤异质性对患者预后的影响，并探索抗凋亡亚群在肿瘤进展中的作用 | 膀胱癌肿瘤和类器官 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Cox回归模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 6858 | 2025-03-01 |
Single-cell immunopathology of recurrent acute generalized exanthematous pustulosis associated with vancomycin
2025-May, The journal of allergy and clinical immunology. Global
DOI:10.1016/j.jacig.2025.100426
PMID:40008097
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术研究了一位由万古霉素引发的复发性急性泛发性发疹性脓疱病（AGEP）患者的免疫病理机制和遗传风险因素 | 首次在AGEP患者中应用单细胞测序技术，揭示了TH17样效应细胞在AGEP皮肤炎症中的关键作用，并探讨了HLA-A∗32:01等遗传风险因素 | 研究仅基于单一病例，样本量有限，结果可能需要更大规模的研究验证 | 探讨AGEP的免疫病理机制和遗传风险因素 | 一位复发性AGEP患者 | 数字病理 | 皮肤疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因和蛋白质表达数据 | 1位患者，3个时间点的皮肤活检样本 |
| 6859 | 2025-03-01 |
Single-cell sequencing revealed the necessity of macrophages in brain microenvironment remodeling by breast cancer metastasis
2025-Mar, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102287
PMID:39837060
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了乳腺癌脑转移中巨噬细胞在脑微环境重塑中的必要性 | 首次在小鼠模型中进行乳腺癌脑转移的单细胞RNA测序，揭示了巨噬细胞亚群在中枢神经系统中的变化及其在免疫逃逸和营养供应中的作用 | 研究样本量较小，仅分析了三个脑手术标本和小鼠模型的数据 | 全面研究脑肿瘤微环境，识别促进脑转移的促肿瘤机制及关键分子 | 乳腺癌脑转移的脑手术标本和小鼠模型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 三个脑手术标本和小鼠模型 |
| 6860 | 2025-03-01 |
Comprehensive analysis and experiments identified ANXA1 as an unfavorable prognosticator in glioma
2025-Mar, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102286
PMID:39842212
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研究论文 | 本文通过生物信息学分析和实验验证了ANXA1在胶质瘤中的不利预后作用 | 首次通过单细胞测序技术揭示了ANXA1在胶质母细胞瘤细胞中的高表达及其在免疫细胞中的富集情况 | ANXA1在胶质瘤中的促癌机制及其与患者功能状态的相关性需要进一步研究 | 探讨ANXA1在胶质瘤中的预后价值及其对细胞增殖、迁移和侵袭的影响 | 胶质瘤患者和胶质瘤细胞 | 数字病理学 | 胶质瘤 | 实时定量PCR、Western blotting、单细胞测序 | NA | 基因表达数据、实验数据 | 两个队列的胶质瘤患者样本 |