单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7469 篇文献，本页显示第 6641 - 6660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6641 | 2025-04-01 |
Single-cell network biology enabling cell-type-resolved disease genetics
2025-Mar-27, Genomics & informatics
DOI:10.1186/s44342-025-00042-7
PMID:40148916
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review | 本文综述了基于单细胞RNA测序技术的细胞类型特异性基因网络模型及其在疾病遗传学中的应用 | 提出了基于单细胞RNA测序数据的细胞类型特异性基因网络模型，为疾病遗传学提供了细胞层面的解析 | 未提及具体的技术实施难点或数据局限性 | 探索细胞类型特异性基因网络在疾病遗传学中的作用 | 单细胞RNA测序数据和基因网络模型 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | 基因网络模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 6642 | 2025-04-01 |
Integrated single-cell and bulk transcriptomic analysis identifies a novel macrophage subtype associated with poor prognosis in breast cancer
2025-Mar-27, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03750-w
PMID:40148933
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研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组分析，识别出一种与乳腺癌不良预后相关的新型巨噬细胞亚型 | 发现了一种新型巨噬细胞亚型M_Macrophage-SPP1-C1Q，并开发了基于随机森林的预测模型Macro.RF | 未提及具体样本量限制或数据来源的局限性 | 研究乳腺癌肿瘤微环境中肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的异质性及其临床意义 | 乳腺癌患者的单细胞RNA测序和批量RNA测序数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序（RNA-seq） | 随机森林（RF） | RNA测序数据 | NA |
| 6643 | 2025-04-01 |
Loss of OBSCN expression promotes bladder cancer progression but enhances the efficacy of PD-L1 inhibitors
2025-Mar-27, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01379-w
PMID:40149008
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研究论文 | 本研究探讨了OBSCN基因表达缺失在膀胱癌进展中的作用及其对PD-L1抑制剂疗效的影响 | 首次报道了OBSCN在膀胱癌中的作用，发现OBSCN低表达患者预后较差但对PD-L1抑制剂反应更好 | 研究主要基于公共数据库和有限样本量的组织芯片，需要更多独立队列验证 | 探索膀胱癌免疫逃逸的内在机制，寻找预测性生物标志物和干预新靶点 | 膀胱癌患者和癌细胞系 | 肿瘤免疫学 | 膀胱癌 | RNA测序、免疫组化(IHC)、Western blot、单细胞测序分析 | COX回归模型、Kaplan-Meier生存分析 | 基因表达数据、临床数据、组织样本 | 80例膀胱癌患者组织样本(来自曙光医院)和TCGA等公共数据库数据 |
| 6644 | 2025-04-01 |
Single-cell multiome and spatial profiling reveals pancreas cell type-specific gene regulatory programs driving type 1 diabetes progression
2025-Mar-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.13.637721
PMID:40027657
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研究论文 | 通过单细胞多组学和空间转录组学揭示了胰腺细胞类型特异性基因调控程序在1型糖尿病进展中的作用 | 首次在多达32名非糖尿病、自身抗体阳性和1型糖尿病胰腺供体中进行了单核多组学和空间转录组学分析，揭示了1型糖尿病进展中的细胞类型特异性调控程序 | 样本量相对有限（32名供体），且仅针对胰腺组织进行研究 | 揭示1型糖尿病在胰腺中的进展机制 | 非糖尿病、自身抗体阳性和1型糖尿病胰腺供体的853,005个细胞 | 生物医学 | 1型糖尿病 | 单核多组学、空间转录组学 | NA | 单细胞基因组数据、空间转录组数据 | 32名胰腺供体的853,005个细胞 |
| 6645 | 2025-04-01 |
Current Applications of Single-Cell RNA Sequencing in Glioblastoma: A Scoping Review
2025-Mar-14, Brain sciences
IF:2.7Q3
DOI:10.3390/brainsci15030309
PMID:40149830
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综述 | 本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在胶质母细胞瘤（GBM）中的应用，重点关注其在解决肿瘤复杂性和治疗耐药性以及改善患者预后方面的潜力 | 通过scRNA-seq技术揭示GBM的复杂细胞和免疫景观，为改进诊断和个性化治疗铺平道路 | 仅纳入2009年至2024年间发表的英文或西班牙语研究，可能遗漏其他语言的重要研究 | 探索scRNA-seq在GBM诊断、预后、治疗及癌症生物学理解中的临床应用 | 胶质母细胞瘤（GBM）的肿瘤微环境和细胞亚群 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 24项研究，其中11项关注GBM样本的肿瘤微环境和细胞亚群，5项研究GBM癌症生物学，3项研究疾病预后，3项应用转化研究，2项解决治疗相关问题 |
| 6646 | 2025-04-01 |
Multi-Omics Analysis of the Anoikis Gene CASP8 in Prostate Cancer and Biochemical Recurrence (BCR)
2025-Mar-07, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines13030661
PMID:40149637
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研究论文 | 通过多组学分析探讨前列腺癌中Anoikis基因CASP8的作用及其与生化复发（BCR）的关系 | 首次通过单细胞和空间转录组学分析探索Anoikis基因集在前列腺癌细胞中的表达模式，并构建了一个能更好预测前列腺癌BCR的预测模型 | 未提及具体样本量，可能影响结果的普遍性 | 探讨Anoikis基因CASP8在前列腺癌和生化复发中的作用及机制 | 前列腺癌细胞和生化复发（BCR）患者 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组学、空间转录组学、基于汇总数据的孟德尔随机化（SMR） | 四基因预后模型 | 转录组数据 | NA |
| 6647 | 2025-04-01 |
Editorial for Brain Sciences Special Issue "Advances in Restorative Neurotherapeutic Technologies"
2025-Mar-05, Brain sciences
IF:2.7Q3
DOI:10.3390/brainsci15030273
PMID:40149794
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评论 | 这篇社论介绍了《脑科学》特刊《恢复性神经治疗技术的进展》的主要内容 | 强调了从组织学技术到单细胞RNA测序等技术创新对神经科学进步的推动作用 | NA | 介绍恢复性神经治疗技术的最新进展 | 神经科学领域的技术创新 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 6648 | 2025-04-01 |
Integrated Spheroid-to-Population Framework for Evaluating PFHpA-Associated Metabolic Dysfunction and Steatotic Liver Disease
2025-Mar-04, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5960979/v1
PMID:40092438
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研究论文 | 本研究旨在通过整合人类流行病学数据和体外实验结果，探讨短链全氟烷基物质PFHpA对代谢功能障碍相关脂肪性肝病(MASLD)发展的影响 | 首次建立从3D肝球体到人群研究的整合框架来评估PFHpA的肝毒性机制，并应用LUCID模型分析暴露-组学特征-疾病风险的关联 | 研究主要基于肥胖青少年队列，结果可能不适用于普通人群 | 阐明PFHpA在MASLD发病中的作用机制 | 接受减重手术的肥胖青少年队列和3D人肝球体模型 | NA | 脂肪性肝病 | 单细胞转录组学、多组学整合分析、LUCID模型 | LUCID | 血浆样本、肝脏活检组织、单细胞转录组数据、蛋白质组和代谢组数据 | Teen-LABS队列中的肥胖青少年(具体人数未明确说明)和3D人肝球体模型 |
| 6649 | 2025-02-28 |
Publisher Correction: Single-Cell RNA sequencing reveals mitochondrial dysfunction in microtia chondrocytes
2025-Feb-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-90745-2
PMID:40011623
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6650 | 2025-04-01 |
A Complete Spatial Map of Mouse Retinal Ganglion Cells Reveals Density and Gene Expression Specializations
2025-Feb-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.10.637538
PMID:39990332
|
research paper | 研究通过空间转录组学和机器学习技术，全面绘制了小鼠视网膜神经节细胞（RGCs）亚型的空间分布图 | 首次全面揭示了小鼠视网膜神经节细胞亚型的空间分布及其基因表达的空间变异，特别是与天空视觉和ART区域相关的特异性分布 | 研究结果与灵长类动物黄斑区的基因表达相关性有限，提示小鼠与灵长类中央视觉的特化可能存在差异 | 探索小鼠视网膜神经节细胞亚型的空间分布及其基因表达的空间变异 | 小鼠视网膜神经节细胞（RGCs） | 空间转录组学 | NA | en-face cryosectioning, 空间转录组学, 机器学习 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 6651 | 2025-04-01 |
Single-Cell RNA sequencing reveals mitochondrial dysfunction in microtia chondrocytes
2025-01-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-85169-x
PMID:39762337
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小耳症软骨细胞中的线粒体功能障碍 | 首次在小耳症软骨细胞中发现线粒体功能障碍，并识别出与线粒体功能相关的关键基因 | 研究样本仅限于单侧非综合征性小耳症患者，结果可能不适用于其他类型的小耳症 | 探究小耳症软骨细胞中线粒体功能障碍的机制 | 小耳症患者和健康对照者的软骨细胞 | 数字病理学 | 小耳症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 小耳症患者和健康对照者的软骨样本 |
| 6652 | 2025-04-01 |
Spatial transcriptomics unveils estrogen-modulated immune responses and structural alterations in the ectocervical mucosa of depot medroxyprogesterone acetate users
2025-01-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-83775-9
PMID:39762272
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研究论文 | 本研究利用高分辨率空间转录组学技术，揭示了使用长效醋酸甲羟孕酮（DMPA）避孕药后，宫颈黏膜中雌激素调节的免疫反应和结构变化 | 首次应用空间转录组学技术揭示DMPA使用者的宫颈黏膜分子标记的空间定位及其与雌激素调控的关联 | 研究样本来自肯尼亚性工作者，可能限制了结果的普遍性 | 探究DMPA对宫颈黏膜屏障功能的影响及其分子机制 | 使用DMPA或非激素避孕药的肯尼亚性工作者的宫颈组织样本 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 空间转录组学、基因集富集分析、免疫组化 | 无监督聚类 | 基因表达数据、免疫组化图像 | 来自肯尼亚性工作者的宫颈组织样本（具体数量未明确提及） |
| 6653 | 2025-03-30 |
Targeted editing of CCL5 with CRISPR-Cas9 nanoparticles enhances breast cancer immunotherapy
2025-Apr, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-02032-6
PMID:39870938
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研究论文 | 本研究探讨了使用CRISPR-Cas9技术与FCPCV纳米颗粒靶向编辑CCL5基因，以增强乳腺癌免疫治疗的疗效 | 创新性地结合CRISPR-Cas9技术与FCPCV纳米颗粒靶向编辑CCL5基因，为乳腺癌免疫治疗提供了新策略 | 研究中未提及长期副作用或临床应用的具体障碍 | 提高乳腺癌免疫治疗的疗效 | 乳腺癌细胞和人源化小鼠模型 | 基因编辑与免疫治疗 | 乳腺癌 | CRISPR-Cas9, scRNA-seq | 人源化小鼠模型 | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量，但包括体外实验和体内小鼠模型 |
| 6654 | 2025-03-30 |
Unraveling anoikis in glioblastoma: insights from single-cell sequencing and prognostic modeling
2025-Mar-26, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03752-8
PMID:40140848
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和预后模型探讨了胶质母细胞瘤中anoikis的作用及其在肿瘤进展和预后中的重要性 | 利用单细胞测序和机器学习算法构建了anoikis相关基因的预后模型，并验证了关键基因SLC43A3在肿瘤组织中的上调及其与不良预后的关联 | 研究依赖于公开数据库的数据，可能受到数据质量和样本量的限制 | 探讨anoikis在胶质母细胞瘤进展和预后中的作用 | 胶质母细胞瘤患者和细胞系 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞测序、转录组测序 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | 来自TCGA、GEO和CGGA数据库的多组数据 |
| 6655 | 2025-03-30 |
Radiotherapy-resistant prostate cancer cells escape immune checkpoint blockade through the senescence-related ataxia telangiectasia and Rad3-related protein
2025-Mar, Cancer communications (London, England)
DOI:10.1002/cac2.12636
PMID:39698847
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research paper | 该研究揭示了放疗抵抗的前列腺癌细胞通过衰老相关的ATR蛋白逃避免疫检查点阻断的分子机制 | 首次发现细胞质ATR通过磷酸化CD86并增强其与E3连接酶MARCH1的相互作用，从而促进前列腺癌细胞逃避免疫检测 | 研究主要基于LNCaP细胞系和小鼠模型，临床样本验证有限 | 阐明前列腺癌细胞对放疗后免疫检查点阻断抵抗的分子机制 | 放疗抵抗的前列腺癌细胞 | 肿瘤免疫学 | 前列腺癌 | scRNA-seq, 免疫组化, 免疫共沉淀, 突变分析, Western blotting | 小鼠异种移植模型 | RNA测序数据, 蛋白质相互作用数据 | LNCaP细胞系和临床患者样本 |
| 6656 | 2025-03-30 |
Targeting Mesothelin Enhances Personalized Neoantigen Vaccine Induced Antitumor Immune Response in Orthotopic Pancreatic Cancer Mouse Models
2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202407976
PMID:39887656
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研究论文 | 本研究探讨了靶向间皮素（MSLN）如何增强个性化新抗原疫苗在胰腺癌小鼠模型中的抗肿瘤免疫反应 | 发现MSLN表达与肿瘤中细胞毒性T细胞呈负相关，并证明抗MSLN抗体与新抗原肽疫苗联合使用可显著提高T细胞浸润和抗肿瘤效果 | 研究主要基于小鼠模型，人类胰腺癌组织中的验证仍需进一步研究 | 探索提高胰腺癌免疫治疗效果的新策略 | 胰腺癌小鼠模型和人类胰腺癌组织 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 多免疫荧光染色、单细胞转录组分析 | 小鼠皮下和原位胰腺癌模型 | 组织微阵列数据、单细胞转录组数据 | 三个数据集和多个组织微阵列样本 |
| 6657 | 2025-03-30 |
NGR-Modified CAF-Derived exos Targeting Tumor Vasculature to Induce Ferroptosis and Overcome Chemoresistance in Osteosarcoma
2025-Mar, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202410918
PMID:39889249
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研究论文 | 本研究探讨了使用NGR修饰的CAF来源的外泌体靶向肿瘤血管，通过促进自噬依赖性铁死亡来逆转骨肉瘤化疗耐药性的潜力 | 首次利用NGR修饰的CAF来源的外泌体递送circ_0004872编码的小肽，通过促进自噬依赖性铁死亡逆转骨肉瘤化疗耐药性 | NA | 克服骨肉瘤化疗耐药性 | 骨肉瘤细胞 | 肿瘤治疗 | 骨肉瘤 | 单细胞转录组分析、高通量测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 6658 | 2025-03-30 |
A single-cell atlas of normal and KRASG12D-malformed lymphatic vessels
2025-Jan-28, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.185181
PMID:39874106
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序构建了正常和KRASG12D畸变的淋巴管图谱，揭示了KRAS突变对淋巴管成熟的损害机制 | 首次构建了正常和KRASG12D畸变淋巴管的单细胞图谱，并发现KRAS突变会损害淋巴管成熟 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类样本中验证 | 阐明KRAS介导的复杂淋巴管异常(CLAs)的具体机制 | 野生型小鼠和KrasG12D小鼠的肺淋巴管内皮细胞(LECs) | 单细胞测序 | 复杂淋巴管异常 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 成年野生型小鼠和KrasG12D小鼠的肺淋巴管内皮细胞，整合了4个发育阶段的数据 |
| 6659 | 2025-03-30 |
RBM47 is a novel immunotherapeutic target and prognostic biomarker in gliomas
2025-01-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-84719-z
PMID:39757245
|
研究论文 | 本研究探讨了RNA结合蛋白RBM47在胶质瘤免疫景观和肿瘤免疫反应中的作用 | 首次全面研究了RBM47在胶质瘤中的免疫调节作用，并证实其作为独立预后预测因子的价值 | 研究主要基于生物信息学分析，需要更多实验验证RBM47的具体作用机制 | 探究RBM47在胶质瘤免疫微环境中的作用及其作为免疫治疗靶点的潜力 | 胶质瘤患者和正常组织 | 肿瘤免疫学 | 胶质瘤 | 生物信息学分析、免疫组化、免疫荧光、单细胞测序 | NA | 基因表达数据、临床数据 | TCGA训练组和CGGA验证组的数据 |
| 6660 | 2025-03-30 |
Unraveling the PANoptosis Landscape in Osteosarcoma: A Single-Cell Sequencing and Machine Learning Approach to Prognostic Modeling and Tumor Microenvironment Analysis
2025, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/6915258
PMID:40151638
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习方法，探索了骨肉瘤中的PANoptosis（包括细胞焦亡、凋亡和坏死性凋亡）景观，并开发了一个稳健的预后模型 | 首次在骨肉瘤中整合单细胞测序和101种机器学习算法构建预后模型，揭示了PANoptosis在肿瘤微环境中的关键作用 | 需要进一步临床验证模型在指导个性化治疗中的实用性 | 探索骨肉瘤中PANoptosis的分子特征并开发预后预测模型 | 骨肉瘤患者样本 | 数字病理 | 骨肉瘤 | scRNA-seq, 机器学习 | CoxBoost等101种算法 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库(GSE162454)的单细胞数据及TARGET和GEO数据库的批量转录组数据 |