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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6641 | 2025-10-06 |
Cambridge Neoadjuvant Cancer of the Prostate (CANCAP03): A Window Study into the Effects of Olaparib ± Degarelix in Primary Prostate Cancer
2025-Jun-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-1304
PMID:40358364
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研究论文 | 本研究探讨奥拉帕尼联合或不联合地加瑞克在新诊断前列腺癌中的疗效及生物学机制 | 首次在无同源重组修复基因突变的前列腺癌患者中研究PARP抑制剂联合雄激素阻断的疗效机制 | 样本量有限,为单中心研究 | 研究PARP抑制剂和雄激素阻断联合治疗对原发性前列腺癌的生物学效应 | 前列腺癌患者 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA测序,单细胞RNA测序,免疫组化,基因测序 | NA | 组织样本,基因表达数据 | 未明确样本数量的前列腺癌患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6642 | 2025-10-06 |
Dissection of the immune landscape in psoriatic arthritis defines immunoproteasome up-regulation in treatment resistance
2025-06-06, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adu0284
PMID:40478933
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析银屑病关节炎患者滑膜液免疫图谱,发现免疫蛋白酶体上调与治疗耐药性相关 | 首次在银屑病关节炎耐药患者中发现免疫蛋白酶体和MHC I类基因表达上调,并通过功能实验验证其治疗潜力 | 样本量相对有限(41例PsA患者和9例OA对照),需要更大规模研究验证 | 探索银屑病关节炎治疗耐药性的免疫学机制 | 银屑病关节炎患者和骨关节炎对照患者的滑膜液免疫细胞 | 单细胞基因组学 | 银屑病关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 41例银屑病关节炎患者和9例骨关节炎对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6643 | 2025-10-06 |
Fusion of spatiotemporal and network models to prioritize multiscale effects in single-cell perturbations
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf277
PMID:40545244
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研究论文 | 提出Perturb-STNet框架,通过融合时空和网络模型来识别单细胞扰动中的多尺度效应 | 开发了首个基于网络的时空模型框架,能够对单细胞扰动数据中的空间和时间差异表达调控因子进行排序 | 方法在复杂多细胞/多组织系统中的验证仍需进一步扩展 | 识别驱动发育和疾病过程的时空差异表达调控因子 | 单细胞扰动数据中的调控因子、细胞和邻域相互作用 | 计算生物学 | 肺癌、黑色素瘤、结肠炎 | 单细胞成像、空间转录组学 | 网络时空模型 | 单细胞时空数据 | 合成数据、肺癌数据、小鼠黑色素瘤模型、结肠炎数据 | NA | CODEX单细胞成像、MERFISH空间转录组学 | NA | CODEX单细胞成像时间序列数据、MERFISH空间转录组学时间序列数据 |
| 6644 | 2025-07-02 |
Correction to: ScInfeR: an efficient method for annotating cell types and sub-types in single-cell RNA-seq, ATAC-seq, and spatial omics
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf337
PMID:40580031
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6645 | 2025-10-06 |
T-B cell cooperation in ectopic lymphoid follicles propagates CNS autoimmunity
2025-04-25, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adn2784
PMID:40279405
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研究论文 | 本研究揭示了脑膜异位淋巴滤泡中T细胞与B细胞的广泛合作如何促进中枢神经系统自身免疫 | 首次通过活体成像直接观察T17-B细胞在脑膜异位淋巴滤泡中的持久抗原特异性接触,并发现中枢神经系统T细胞依赖B细胞维持促炎细胞因子谱 | 研究采用实验性自身免疫性脑脊髓炎模型,可能不完全反映人类多发性硬化症的复杂病理过程 | 探究脑膜异位淋巴滤泡在中枢神经系统自身免疫中的作用机制 | T细胞、B细胞及其在中枢神经系统的相互作用 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序,活体成像 | T辅助17细胞过继转移实验性自身免疫性脑脊髓炎模型 | 基因表达数据,影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6646 | 2025-10-06 |
Identification of Recurrence-associated Gene Signatures and Machine Learning-based Prediction in IDH-Wildtype Histological Glioblastoma
2025-Apr-14, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-025-02345-4
PMID:40227386
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研究论文 | 本研究通过基因共表达网络分析和机器学习方法,识别IDH野生型胶质母细胞瘤复发相关基因并建立预测模型 | 首次在IDH野生型组织学胶质母细胞瘤中鉴定8个复发相关基因,并开发了基于随机森林的高精度预测模型 | 研究样本量相对有限,需要更多独立队列验证模型的泛化能力 | 探索胶质母细胞瘤复发的分子机制并建立复发预测模型 | IDH野生型组织学胶质母细胞瘤患者 | 机器学习 | 胶质母细胞瘤 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA), RT-qPCR, 单细胞RNA测序, 机器学习 | 随机森林(RF) | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | CGGA-693队列190例, CGGA-325队列111例, 另有两个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 6647 | 2025-10-06 |
Psychological stress increases skin infection through the action of TGFβ to suppress immune-acting fibroblasts
2025-04-11, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.ads0519
PMID:40215323
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和脂质组学分析揭示了心理压力通过TGFβ抑制真皮成纤维细胞免疫功能从而增加皮肤感染的机制 | 首次发现心理压力通过脑-皮肤轴介导的TGFβ信号通路抑制成纤维细胞产生抗菌肽cathelicidin的免疫防御功能 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类中得到验证 | 探究心理压力增加皮肤感染易感性的分子机制 | 小鼠模型中的真皮成纤维细胞 | 免疫学 | 皮肤感染 | 单细胞转录组学, 脂质组学分析 | NA | 基因表达数据, 脂质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6648 | 2025-10-06 |
Eutopic macrophages facilitate endometriosis progression via ferroptosis-mediated release of S100A9
2025-Apr-03, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf027
PMID:40493892
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现子宫内膜异位症患者在位内膜中S100A9+巨噬细胞亚群通过铁死亡释放S100A9促进疾病进展 | 首次揭示在位内膜中S100A9+巨噬细胞亚群通过铁死亡机制促进子宫内膜异位症发展的新机制 | NA | 探究巨噬细胞在子宫内膜异位症发病机制中的具体作用 | 子宫内膜异位症患者组织样本和小鼠模型 | 单细胞生物学 | 子宫内膜异位症 | 单细胞RNA测序, 体外实验, 小鼠模型 | NA | 基因表达数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6649 | 2025-10-06 |
Lysine methyltransferase SETD7 coordinates the emergence of mature and senescent subpopulations during the decidualization of endometrial stromal cells
2025-Apr-03, Molecular human reproduction
IF:3.6Q1
DOI:10.1093/molehr/gaaf028
PMID:40570096
|
研究论文 | 本研究揭示了组蛋白甲基转移酶SETD7在子宫内膜基质细胞蜕膜化过程中调控细胞命运分化的新机制 | 首次发现SETD7通过稳定雌激素受体蛋白而非其组蛋白甲基化活性来调控蜕膜化,并鉴定其为细胞命运分化的关键调节因子 | 研究主要基于体外细胞模型和公共数据库分析,缺乏体内实验验证 | 探究SETD7在子宫内膜基质细胞蜕膜化过程中的调控作用 | 子宫内膜基质细胞(EnSC) | 表观遗传学 | 复发性流产 | 单细胞RNA测序, mRNA微阵列 | 基因敲除模型 | 基因表达数据 | 公共数据库中的单细胞RNA测序数据和子宫内膜组织mRNA微阵列数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6650 | 2025-10-06 |
IL-4 induces CD22 expression to restrain the effector program of virtual memory T cells
2025-02-07, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.adk4841
PMID:39919198
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现CD22作为IL-4诱导的虚拟记忆CD8 T细胞表面标志物,并揭示其抑制T细胞效应程序的作用机制 | 首次发现CD22可作为IL-4诱导的虚拟记忆CD8 T细胞选择性表面标志物,并揭示CD22对T细胞效应程序的固有调控功能 | 寄生虫感染模型中IL-4依赖性T细胞激活和扩张的具体调控机制仍需进一步阐明 | 探究IL-4依赖性虚拟记忆CD8 T细胞激活和扩张的调控机制 | 虚拟记忆CD8 T细胞 | 免疫学 | 寄生虫感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6651 | 2025-10-06 |
Gonadal sex and temperature independently influence germ cell differentiation and meiotic progression in Trachemys scripta
2025-Jan-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2413191121
PMID:39793067
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研究论文 | 本研究探讨温度和性腺性别对红耳龟生殖细胞分化和减数分裂进程的独立影响 | 首次在温度依赖性性别决定物种中证明温度对生殖细胞性分化的直接影响独立于性腺体细胞 | 研究仅针对单一TSD物种(红耳龟),结果可能不适用于其他物种 | 探究温度是否直接影响生殖细胞分化和性别认同的其他方面 | 红耳龟(Trachemys scripta)胚胎和生殖细胞 | 发育生物学 | NA | 减数分裂铺片分析,单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据,细胞形态数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6652 | 2025-10-06 |
Inonotus obliquus (chaga) ameliorates folic acid-induced renal fibrosis in mice: the crosstalk analysis among PT cells, macrophages and T cells based on single-cell sequencing
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1556739
PMID:40160460
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术探讨了桦褐孔菌(Chaga)改善叶酸诱导的小鼠肾纤维化的细胞和分子机制 | 首次应用单细胞RNA测序技术研究桦褐孔菌治疗肾纤维化的作用,揭示了近端肾小管细胞、巨噬细胞和T细胞之间的相互作用网络 | 需要进一步的实验验证以确定其临床应用价值 | 探究桦褐孔菌治疗肾纤维化的潜在机制 | 叶酸诱导的肾纤维化小鼠模型 | 单细胞测序 | 肾纤维化 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, UPLC-MS, 组织学染色 | NA | 单细胞基因表达数据, 空间转录组数据, 组织学图像 | 82,496个肾脏细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6653 | 2025-10-06 |
Corrigendum: Inonotus obliquus (chaga) ameliorates folic acid-induced renal fibrosis in mice: the crosstalk analysis among PT cells, macrophages and T cells based on single-cell sequencing
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1629322
PMID:40510421
|
correction | 本文是对先前发表文章的更正说明 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6654 | 2025-10-06 |
Candida albicans: a historical overview of investigations into an important human pathogen
2025-Jan-01, Canadian journal of microbiology
IF:1.8Q4
DOI:10.1139/cjm-2025-0036
PMID:40522159
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综述 | 回顾白色念珠菌研究的历史发展,从早期临床观察到现代高通量基因组技术 | 整合多组学方法推进精准真菌学时代,追踪真菌种群基因组学的进化适应 | NA | 理解白色念珠菌的分子生物学、致病性和耐药机制 | 机会性致病真菌白色念珠菌 | NA | 侵袭性念珠菌病 | 全基因组测序,功能基因组学,单细胞转录组学,CRISPR-Cas9基因组编辑,多组学方法 | NA | 基因组数据,转录组数据 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 6655 | 2025-10-06 |
PIK3R1 and G0S2 are human placenta-specific imprinted genes associated with germline-inherited maternal DNA methylation
2025-Dec, Epigenetics
IF:2.9Q2
DOI:10.1080/15592294.2025.2523191
PMID:40568952
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研究论文 | 本研究通过全基因组筛选发现并表征了两个人类胎盘特异性印记基因PIK3R1和G0S2 | 首次识别出胎盘特异性印记基因,这些基因与仅在胚胎植入前和胚外谱系中存在的瞬时种系DMRs相关 | 未发现这些基因在宫内生长受限或先兆子痫的胎盘样本中存在甲基化和表达差异 | 扩展胎盘特异性印记基因列表并研究其特性 | 人类胎盘组织、配子、囊胚和各种体细胞组织 | 表观遗传学 | 妊娠并发症 | 全基因组甲基化测序、单细胞RNA测序 | NA | 甲基化数据、RNA-seq数据 | 多种组织类型样本(包括配子、囊胚、胎盘等) | NA | 单细胞RNA-seq、全基因组甲基化分析 | NA | NA |
| 6656 | 2025-10-06 |
Development and Validation of a Flow-Dependent Endothelialized 3D Model of Intracranial Atherosclerotic Disease
2025-Aug, Translational stroke research
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s12975-024-01310-4
PMID:39537986
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研究论文 | 开发并验证了一种基于患者特异性成像的流动依赖性内皮化3D颅内动脉粥样硬化疾病模型 | 首次创建了基于患者特异性神经影像的可内皮化并承受流动力的可重复ICAD模型,结合单细胞RNA测序分析流动依赖性内皮基因表达 | 依赖于神经影像数据的质量,模型复杂度可能限制高通量应用 | 开发用于研究颅内动脉粥样硬化疾病机制和治疗方法的实验模型 | 大脑中动脉的3D模型和人类内皮细胞 | 数字病理 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,计算流体动力学,共聚焦显微镜 | 3D生物模型 | 图像,基因表达数据 | 使用SAMMPRIS临床试验的影像数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6657 | 2025-10-06 |
Role of stem-like cells in chemotherapy resistance and relapse in pediatric T-cell acute lymphoblastic leukemia
2025-Jun-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61222-1
PMID:40579412
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究儿童T细胞急性淋巴细胞白血病中干细胞样细胞在化疗耐药和复发中的作用 | 首次在T-ALL中通过纵向单细胞研究鉴定出具有干细胞特征的耐药细胞亚群 | 样本量相对有限(13对匹配样本+5例非复发患者) | 探究T-ALL复发和化疗耐药的机制 | 儿童T细胞急性淋巴细胞白血病患者样本 | 单细胞测序分析 | 急性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18例样本(13对匹配诊断-复发样本+5例非复发诊断样本) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6658 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial analyses of the GDF family in tumors, with a focus on the prognostic and biological role of GDF15 in hepatocellular carcinoma
2025-Jun-27, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01431-9
PMID:40579699
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组分析GDF家族在肿瘤中的作用,重点关注GDF15在肝细胞癌中的预后和生物学功能 | 首次基于单细胞和空间转录组对GDF亚家族进行系统性泛癌分析,揭示了GDF15在肝细胞癌肿瘤微环境中的新作用机制 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证部分仅限于肝细胞癌细胞系 | 系统分析GDF亚家族在多种癌症中的表达特征及其临床意义 | 33种癌症类型,重点关注肝细胞癌 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组, 功能获得和缺失实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 细胞系实验数据 | 33种癌症类型的数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
| 6659 | 2025-10-06 |
ETMR stem-like state and chemo-resistance are supported by perivascular cells at single-cell resolution
2025-Jun-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60442-9
PMID:40562749
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示胚胎性多层菊形团肿瘤的异质性及肿瘤微环境中周细胞对肿瘤干细胞状态和化疗耐药性的支持作用 | 首次在单细胞水平系统揭示ETMR肿瘤微环境中PDGFRβ周细胞通过细胞外基质相互作用支持肿瘤干细胞信号传导和化疗耐药性 | 研究主要基于模型系统,需要在更多临床样本中验证 | 探究ETMR肿瘤异质性及肿瘤微环境中的细胞通讯机制 | 人类和小鼠原代ETMR肿瘤细胞、体外培养细胞、3D前脑类器官ETMR模型 | 单细胞生物学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 空间转录组学 | 3D类器官模型 | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 约250,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6660 | 2025-10-06 |
Reduction of NFX1-123 and HPV 16 E6 and E7 Decreased Telomerase and CENP-F in Cervical Cancer Cell Lines
2025-Jun-19, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers17122044
PMID:40563693
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研究论文 | 本研究通过敲除NFX1-123和HPV 16 E6/E7,探讨了它们在宫颈癌细胞系中对端粒酶和CENP-F的调控作用 | 首次在HPV相关癌症中研究NFX1-123对端粒酶活性的调控作用,并发现其与HPV 16致癌基因在调控hTERT、端粒酶和CENP-F中的共同作用 | 研究仅限于宫颈癌细胞系,需要进一步在更多细胞模型和体内实验中验证 | 研究NFX1-123在HPV相关癌症中对端粒酶活性的调控机制 | 宫颈癌细胞系(CaSki和SiHa细胞)以及TCGA数据库中的宫颈癌和HPV阳性头颈癌原发肿瘤数据 | 癌症生物学 | 宫颈癌 | 基因敲除、单细胞RNA测序、基因敲低 | NA | 单细胞RNA测序数据、基因表达数据、临床数据库数据 | 宫颈癌细胞系和TCGA数据库中的原发肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |