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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6561 | 2025-10-06 |
Integrative analysis of T cell-associated markers in Ewing sarcoma reveals prognostic signatures and immune dynamics
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1586544
PMID:40607387
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和生物信息学分析,揭示了尤文肉瘤中T细胞相关标志物的预后价值及免疫动态特征 | 首次系统鉴定CLEC11A、BDP1和ID3作为尤文肉瘤T细胞相关预后标志物,并构建了具有高预测准确性的预后模型 | 样本量相对有限,需要更多独立队列验证模型的普适性 | 探索尤文肉瘤肿瘤微环境中T细胞相关标志物的预后价值及免疫调控机制 | 尤文肉瘤患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 尤文肉瘤 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 批量RNA测序, CIBERSORT算法 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 6562 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis of peripheral blood and pleural effusion reveals functional diversity of γδ T cells in tuberculosis infection
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1605827
PMID:40607390
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研究论文 | 通过单细胞测序分析结核病患者外周血和胸腔积液中γδ T细胞的功能多样性 | 首次在结核病患者中系统鉴定出7个γδ T细胞亚群,并发现效应性γδ2细胞在PBMC中占比最高(36.1%),组织驻留γδ2细胞在PFMC中占比最高(70.5%) | NA | 探索γδ T细胞在结核病免疫应答中的具体作用和亚群分化机制 | 结核病患者的外周血单个核细胞(PBMC)和结核性胸腔积液(TPE) | 免疫学 | 结核病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6563 | 2025-10-06 |
Decoding neuroinflammation in Alzheimer's disease: a multi-omics and AI-driven perspective for precision medicine
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1616899
PMID:40607399
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综述 | 本文探讨了利用多组学和人工智能方法解析阿尔茨海默病神经炎症机制的前景 | 整合单细胞RNA测序与AI分析及多组学平台,突破传统组织分析信号平均化的限制 | NA | 解码阿尔茨海默病复杂的免疫炎症网络,实现疾病亚型精准分类和早期诊断 | 阿尔茨海默病患者脑组织细胞 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | AI驱动分析 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6564 | 2025-10-06 |
Landscape analysis of matrix metalloproteinases reveals key prognostic markers for prostate cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1582992
PMID:40607407
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研究论文 | 本研究通过综合分析基质金属蛋白酶在前列腺癌中的作用,发现MMP11是关键预后标志物并通过重塑肿瘤微环境促进癌症进展 | 首次系统评估24种MMP在前列腺癌中的表达特征和预后价值,并证实MMP11通过调控肿瘤微环境促进前列腺癌进展的新机制 | 研究主要基于公共数据库分析,需要更多实验验证MMP11的具体作用机制 | 探索基质金属蛋白酶在前列腺癌中的全面作用及其临床意义 | 前列腺癌组织和细胞 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组测序,细胞功能实验 | COX回归分析 | 基因表达数据,单细胞数据,空间转录组数据 | 来自UCSC和GEO数据库的前列腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 6565 | 2025-10-06 |
The functional and clinical significance of nucleoporin NUP153 across human cancers: a systematic study based on multi-omics analysis and bench work validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1613688
PMID:40607419
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研究论文 | 通过多组学分析和实验验证系统研究核孔蛋白NUP153在人类癌症中的功能和临床意义 | 首次系统研究NUP153在多种癌症中的表达模式、突变特征、诊断价值及其与肿瘤免疫微环境的关系 | 需要进一步研究阐明NUP153在癌症中的具体分子机制并探索其临床适用性 | 探索核孔蛋白NUP153在人类癌症中的功能和临床意义 | 人类多种癌症类型,重点关注胃癌 | 生物信息学 | 多种癌症(胆管癌、结直肠癌、头颈鳞状细胞癌、胃癌等) | 多组学分析、免疫组织化学、RT-qPCR、单细胞分析、空间转录组学 | NA | 基因表达数据、药物敏感性数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 来自TCGA、GTEx等公共数据库的多种癌症样本,以及胃癌组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6566 | 2025-10-06 |
Identification and validation of a KRAS-macrophage-associated gene signature as prognostic biomarkers and potential therapeutic targets in melanoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1566432
PMID:40607411
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研究论文 | 本研究通过多平台数据分析识别并验证了KRAS-巨噬细胞相关基因特征作为黑色素瘤预后生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次构建了KRAS-巨噬细胞预后相关基因(KMPAG)特征,整合了单细胞RNA测序和临床数据分析,重新分类巨噬细胞亚群 | 研究主要基于公共数据库数据,需要更多实验验证和临床队列验证 | 探索KRAS信号通路在黑色素瘤肿瘤微环境中对巨噬细胞浸润的影响及其预后价值 | 皮肤 cutaneous 黑色素瘤(SKCM)患者和黑色素瘤细胞系 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 基因集富集分析, LASSO回归, 免疫组织化学, 功能实验 | LASSO回归模型, Monocle2算法, CellChat工具 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据, 临床数据 | 来自GEO和TCGA数据库的黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6567 | 2025-10-06 |
IFN-γ promotes the progression of iMCD by activating inflammatory monocytes
2025-Jul-03, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024027689
PMID:40163892
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了IFN-γ通过激活炎症性单核细胞促进特发性多中心Castleman病进展的机制 | 首次在单细胞水平系统描绘iMCD免疫图谱,发现CCL单核细胞通过IFN-II信号通路与NK/NKT细胞互动的关键机制 | 样本量相对有限(15例患者和4例健康对照),需要更大规模研究验证 | 探索iMCD疾病免疫发病机制并寻找新的治疗靶点 | 特发性多中心Castleman病患者的外周血单个核细胞、淋巴结和骨髓样本 | 单细胞组学 | 特发性多中心Castleman病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 15例iMCD患者和4例健康对照的外周血单个核细胞,以及淋巴结和骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6568 | 2025-10-06 |
Pathogenic mechanism of extracranial arteriovenous malformations: insights from clinical, pathological, and genetic analyses
2025-Jul-02, Virchows Archiv : an international journal of pathology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s00428-025-04158-7
PMID:40603544
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研究论文 | 通过临床、病理和遗传分析揭示颅外动静脉畸形的致病机制 | 首次报道AVMs中显著的基因型-表型相关性,发现MAP2K1突变型AVMs中异常小血管网络的特异性基因表达谱 | 回顾性研究设计,样本量较小(30例患者) | 阐明颅外动静脉畸形的发病机制与基因突变的关系 | 30例颅外动静脉畸形患者 | 数字病理学 | 血管畸形 | 空间转录组学,免疫组织化学,基因突变分析 | NA | 基因表达数据,病理图像,临床数据 | 30例颅外AVM患者 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6569 | 2025-10-06 |
FLI1 and GATA1 govern TLN1 transcription: new insights into FLI1-related platelet disorders
2025-Jul-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2024.286372
PMID:39744817
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研究论文 | 本研究揭示了FLI1基因变异通过影响与GATA1的协同转录活性导致talin-1缺陷和血小板功能障碍的新机制 | 首次发现FLI1与GATA1共同调控TLN1转录,并鉴定两个新型FLI1变异体(p.G307R和p.R340C) | 研究样本量有限,机制研究主要依赖体外实验 | 阐明FLI1变异对人类巨核细胞和血小板功能影响的分子机制 | FLI1基因变异患者、巨核细胞、血小板和细胞系 | 分子生物学 | 血小板疾病 | 单细胞RNA测序,染色质免疫沉淀测序,荧光素酶报告基因检测 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,测序数据 | FLI1变异患者样本和细胞系 | NA | single-cell RNA-seq, ChIP-seq | NA | NA |
| 6570 | 2025-10-06 |
Enhancing genetic transformation efficiency in cucurbit crops through AtGRF5 overexpression: Mechanistic insights and applications
2025-Jul, Journal of integrative plant biology
IF:9.3Q1
DOI:10.1111/jipb.13912
PMID:40213927
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研究论文 | 通过过表达AtGRF5基因显著提高葫芦科作物的遗传转化效率,并阐明其分子机制 | 发现AtGRF5通过促进愈伤组织增殖和增加致密细胞来增强遗传转化效率,开发了ABA诱导型AtGRF5表达系统以减轻多效性影响 | NA | 提高葫芦科作物的遗传转化和基因编辑效率 | 葫芦科作物(黄瓜等) | 植物生物技术 | NA | 单细胞RNA测序, DAP-seq, 时间序列转录组学 | NA | 基因表达数据, 测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6571 | 2025-10-06 |
Distinct transcriptional changes in hematopoietic progenitor subsets on LPS-induced emergency granulopoiesis
2025-Jul, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2025.104792
PMID:40316244
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了LPS诱导的应急粒细胞生成过程中不同造血祖细胞亚群的转录变化 | 首次在单细胞水平揭示非谱系定型多能祖细胞在炎症刺激下向髓系和红系祖细胞重编程的动态过程 | 研究仅使用小鼠模型,未在人类样本中验证 | 探究不同多能祖细胞亚群在LPS诱导的应急粒细胞生成中的作用 | 野生型小鼠的多能祖细胞(MPPs) | 单细胞生物学 | 感染性疾病 | 单细胞RNA测序, 移植实验, 假时序分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 对照组和LPS处理组小鼠的MPPs | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6572 | 2025-10-06 |
Differentiable graph clustering with structural grouping for single-cell RNA-seq data
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf347
PMID:40511990
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研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA测序数据的可微分图聚类方法,通过结构分组整合图聚类信息 | 设计了可微分聚类机制将离散的K路归一化割转化为可微分学习目标,通过谱松弛实现图聚类信息的整合 | 未在抽象中明确说明研究局限性 | 改进单细胞RNA测序数据的细胞聚类分析 | 单细胞RNA测序数据中的细胞亚群 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图神经网络, 自编码器, 图注意力自编码器 | 单细胞RNA测序数据 | 14个单细胞RNA测序基准数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6573 | 2025-10-06 |
T-cell differentiation stage block bias confers hypermethylation and mediastinal preference in T-cell lymphoblastic lymphoma
2025-Jul, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.70380
PMID:40579780
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了T淋巴母细胞淋巴瘤中T细胞分化阻滞模式的特征及其对肿瘤微环境和甲基化状态的影响 | 首次从T细胞分化阻滞角度系统阐明T-LBL与T-ALL的差异,发现DN/DP阶段阻滞模式驱动免疫抑制微环境和纵隔偏好,并揭示E2F2-UHRF1介导的抑癌基因高甲基化新机制 | 样本来源相对有限,需要更大规模队列验证研究结果 | 探究T淋巴母细胞淋巴瘤与T细胞急性淋巴细胞白血病之间的生物学差异和分子机制 | T淋巴母细胞淋巴瘤患者样本和T细胞急性淋巴细胞白血病数据 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序, 流式细胞术, 表达芯片 | NA | 单细胞转录组数据, 流式细胞数据, 体细胞突变数据 | NCH-TALL-LBL队列样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
| 6574 | 2025-10-06 |
Innovative Single-Cell Sequencing Techniques for B-Cell Analysis and Their Implications for Rational HIV-1 Vaccine Design
2025-Jul-01, Current HIV research
IF:0.8Q4
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在B细胞分析中的最新进展及其对HIV-1疫苗设计的启示 | 通过单细胞技术实现B细胞免疫库、基因表达和表型的多维度分析,为疫苗设计提供新视角 | NA | 探讨单细胞测序技术在传染病和疫苗接种背景下B细胞反应分析的应用 | B细胞及其在免疫反应中的动态变化 | 单细胞分析 | HIV-1感染 | 单细胞测序 | NA | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6575 | 2025-10-06 |
Diversity of mast cell subpopulations in the tumor microenvironment of colorectal cancer and their prognostic implications
2025-Jun-30, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-025-04119-8
PMID:40586903
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析结直肠癌肿瘤微环境中肥大细胞亚群的异质性及其预后意义 | 首次在结直肠癌中鉴定出三个功能各异的肥大细胞亚群,并发现它们分别具有促肿瘤和抗肿瘤的不同功能特征 | 样本量相对有限,需要更大规模的研究验证 | 探索结直肠癌肿瘤微环境中肥大细胞亚群的异质性及其与预后的关系 | 结直肠癌肿瘤微环境中的肥大细胞 | 单细胞生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,生物信息学分析 | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | 40例结直肠癌肿瘤样本的单细胞数据,整合HMU、GEO和TCGA队列的bulk RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 6576 | 2025-10-06 |
Low-dose radiotherapy enhances the efficacy of PD-L1 blockade and induces the abscopal effect
2025-Jun-30, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-011487
PMID:40588370
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研究论文 | 本研究证明低剂量放疗联合PD-L1阻断疗法能增强免疫检查点抑制剂在远处未照射肿瘤中的疗效并诱导远隔效应 | 首次系统比较低剂量与高剂量放疗联合PD-L1阻断的疗效,并揭示肿瘤相关巨噬细胞在远隔效应中的关键作用机制 | 研究仅使用小鼠肿瘤模型,尚未在人类临床试验中验证 | 探索低剂量放疗联合PD-L1阻断疗法在癌症治疗中的协同作用机制 | 免疫健全小鼠携带的MC38和CT26 murine肿瘤模型 | 癌症免疫治疗 | 癌症 | 单细胞RNA测序,肿瘤生长监测,巨噬细胞清除实验 | 动物模型 | 基因表达数据,肿瘤生长数据 | 多个小鼠肿瘤模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6577 | 2025-10-06 |
Peritoneal cavity-derived GATA6+ macrophages inhibit fibrosis through IL33 in endometrium
2025-Jun-29, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.06.088
PMID:40592367
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序发现腹膜腔来源的GATA6+巨噬细胞通过IL33抑制子宫内膜纤维化 | 首次鉴定子宫内膜中GATA6+巨噬细胞亚群,揭示其来源于腹膜腔大腹膜巨噬细胞并通过Lars-Fos信号轴激活IL33表达抑制纤维化 | NA | 探索子宫内膜巨噬细胞亚群的来源和功能机制 | 正常子宫内膜和宫腔粘连患者的子宫内膜组织 | 单细胞生物学 | 宫腔粘连 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6578 | 2025-10-06 |
The progress and trends of the mechanism of cardiopulmonary bypass-associated acute lung injury: A narrative review
2025-Jun-27, Medicine
IF:1.3Q2
DOI:10.1097/MD.0000000000043019
PMID:40587734
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综述 | 本文综述了体外循环相关急性肺损伤机制的研究进展与趋势 | 提出未来应聚焦炎症关键靶点并探索基因编辑和单细胞测序等先进技术 | 多年未取得突破性进展,导致管理策略和临床措施停滞 | 揭示体外循环相关急性肺损伤的潜在机制并寻找有效防治策略 | 心脏直视手术患者 | 医学研究 | 心血管疾病 | 基因编辑, 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 6579 | 2025-10-06 |
Transcriptional landscape of pleural mesothelioma patients in relation to NF2 gene mutational status
2025-Jun-09, Journal of the Egyptian National Cancer Institute
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s43046-025-00284-0
PMID:40484892
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研究论文 | 本研究通过分析胸膜间皮瘤患者的转录组数据,探讨NF2基因突变状态对肿瘤生物学特征和免疫微环境的影响 | 首次系统揭示NF2突变在胸膜间皮瘤中通过改变免疫细胞浸润、细胞因子信号传导和化疗敏感性影响肿瘤微环境的机制 | 样本量相对有限(82例),且为回顾性分析,需要进一步实验验证 | 阐明NF2基因突变对胸膜间皮瘤肿瘤生物学行为和治疗反应的影响 | 82例胸膜间皮瘤患者肿瘤样本 | 癌症基因组学 | 胸膜间皮瘤 | RNA测序,单细胞RNA测序,生物信息学分析 | 逻辑回归模型,差异表达分析,功能富集分析 | 转录组数据,临床数据 | 82例胸膜间皮瘤病例 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 6580 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing of Rabbit Sclera at Different Developmental Stages: Unveiling Scleral Cells Atlas and the Heterogeneity of Fibroblasts
2025-Jun-02, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.6.83
PMID:40576432
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了兔眼巩膜发育过程的细胞图谱,揭示了成纤维细胞的异质性和细胞间通讯网络 | 首次构建兔巩膜发育的单细胞转录组图谱,发现成纤维细胞亚型异质性、ECM重塑机制和跨物种保守特征 | 仅使用新西兰兔作为研究对象,样本时间点有限 | 阐明巩膜发育过程中成纤维细胞的异质性、分化轨迹和细胞间通讯 | 新西兰兔巩膜组织 | 单细胞转录组学 | 眼部疾病 | 单细胞RNA测序 | VIA, CellChat, AUCell, CACIMAR, hdWGCNA | 单细胞转录组数据 | 胚胎期25天和出生后7天、21天、180天四个发育阶段的兔巩膜组织 | BGI | 单细胞RNA测序 | BGISEQ-2000, DNBelab C Series Kit | DNBelab C系列单细胞RNA测序建库试剂盒,BGISEQ-2000测序平台 |