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当前共找到 10736 篇文献，本页显示第 6461 - 6480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6461 | 2025-10-06 |
Differential cellular communication inference framework for large-scale single-cell RNA-sequencing data
2025-Jun, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf084
PMID:40585304
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研究论文 | 提出一个可推广的计算框架scSeqCommDiff，用于从大规模单细胞转录组数据中推断和分析两种实验条件下的差异细胞通讯 | 开发了统计和网络计算方法，能够快速且内存高效地表征改变的细胞间通讯，并提供了用户友好的交互式分析工具CClens | 未明确说明框架在特定实验设计或数据类型的适用性限制 | 开发计算框架以支持大规模单细胞RNA测序数据中的差异细胞通讯分析 | 单细胞转录组数据，包括细胞图谱和肌萎缩侧索硬化症患者与健康受试者的单核转录组数据 | 生物信息学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，单核转录组学 | 统计模型，网络分析方法 | 单细胞转录组数据 | 大规模数据集，包括细胞图谱 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 6462 | 2025-10-06 |
iGTP: learning interpretable cellular embedding for inferring biological mechanisms underlying single-cell transcriptomics
2025-May-01, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf296
PMID:40551620
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研究论文 | 提出了一种可解释的生成式转录程序框架iGTP，用于单细胞转录组数据的细胞嵌入表示和生物学机制推断 | 设计了结合转录程序空间和蛋白质-蛋白质相互作用的可解释生成模型框架，能够同时从TP和PPI层面提供生物学见解 | NA | 开发可解释的深度学习框架用于单细胞转录组数据的生物学机制分析 | 单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 变分自编码器, 图神经网络, 潜在扩散模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6463 | 2025-10-06 |
Prior chemotherapy deteriorates T-cell quality for CAR T-cell therapy in B-cell non-Hodgkin's lymphoma
2025-Apr-09, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010709
PMID:40210237
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研究论文 | 本研究评估化疗对B细胞非霍奇金淋巴瘤患者T细胞功能的影响及其对CAR T细胞疗法的意义 | 首次通过多组学方法系统揭示化疗导致T细胞分化状态改变和耗竭标志物上调，直接影响CAR T细胞疗效 | 样本量有限，仅针对B细胞非霍奇金淋巴瘤患者，未涉及其他癌症类型 | 评估既往化疗对T细胞功能的影响及其对CAR T细胞疗法效果的潜在负面影响 | B细胞非霍奇金淋巴瘤患者的T细胞 | 免疫治疗 | B细胞非霍奇金淋巴瘤 | 多参数流式细胞术,单细胞RNA测序,全基因组DNA甲基化阵列,体外功能测试 | NA | 单细胞转录组数据,表观遗传数据,功能实验数据 | 两个B细胞非霍奇金淋巴瘤患者队列（治疗前vs化疗后） | NA | 单细胞RNA测序,DNA甲基化分析 | NA | NA |
| 6464 | 2025-10-06 |
Ash1l loss-of-function results in structural birth defects and altered cortical development
2025-Jan-07, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awae218
PMID:38943682
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研究论文 | 本研究探讨组蛋白甲基转移酶ASH1L功能缺失对小鼠结构出生缺陷和皮质发育的影响 | 首次系统揭示ASH1L在皮质神经元命运决定和分化轨迹中的关键作用，通过单细胞RNA测序发现突变神经元呈现异常聚类模式 | 研究仅使用小鼠模型，未在人类组织中验证；样本量有限（如单细胞测序样本数未明确说明） | 探究ASH1L功能缺失对胚胎发育、颅面骨骼形成和大脑皮质发育的影响机制 | Ash1l基因敲除小鼠模型（cre诱导型外显子4缺失） | 发育神经生物学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, EdU标记, 假时序分析 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据, 组织图像数据 | 胚胎期e18.5: n=77, 出生时p0: n=41, 鼻骨测量: n=31, SATB2神经元计数: n=6/基因型, EdU标记: n=4/基因型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6465 | 2025-10-06 |
Deciphering normal and cancer stem cell niches by spatial transcriptomics: opportunities and challenges
2025-Jan-07, Genes & development
IF:7.5Q1
DOI:10.1101/gad.351956.124
PMID:39496456
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综述 | 探讨空间转录组学技术在解析正常干细胞和癌症干细胞微环境中的应用与挑战 | 系统评述空间转录组学技术如何揭示干细胞微环境的时空特征及细胞间相互作用 | 技术局限性对微环境特征解析造成阻碍，需要计算工具辅助解决 | 研究干细胞微环境的分子特征及其在肿瘤异质性和治疗抵抗中的作用 | 正常干细胞和癌症干细胞及其微环境 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学, 单细胞转录组学, 二代测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 6466 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomics of vascularized human brain organoids decipher lineage-specific stress adaptation in fetal hypoxia-reoxygenation injury
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.117001
PMID:40585969
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研究论文 | 本研究通过建立血管化人脑类器官模型，解析胎儿缺氧-复氧损伤中谱系特异性应激适应机制 | 开发了首个整合皮质和血管类器官的血管化人脑类器官模型，揭示了人类特异性神经血管病理机制和动物模型无法捕捉的细胞间通讯网络 | 模型虽能模拟中晚期妊娠神经发育，但仍无法完全复制体内复杂微环境 | 解析人类胎儿缺氧损伤中细胞类型特异性机制并寻找治疗靶点 | 血管化人皮质类器官中的神经祖细胞、神经元、小胶质细胞和功能血管系统 | 单细胞转录组学 | 胎儿缺氧性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | 血管化人脑类器官模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6467 | 2025-10-06 |
Endothelium-specific sensing of mechanical signals drives epidermal aging through coordinating retinoid metabolism
2025, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.112299
PMID:40585982
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研究论文 | 本研究揭示了内皮细胞通过机械信号感知协调视黄醇代谢驱动皮肤衰老的机制 | 首次发现内皮细胞通过整合素介导的机械转导协调成纤维细胞-内皮-表皮三方轴调控视黄醇代谢的新机制 | 研究主要基于模型系统验证，人体直接证据仍需进一步确认 | 探究机械信号感知在内皮细胞介导皮肤衰老过程中的作用机制 | 人皮肤样本、衰老小鼠模型和皮肤类器官系统 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,RT-qPCR,免疫荧光染色,HE染色 | NA | 基因表达数据,图像数据,机械性能数据 | 年轻、中年和老年人类皮肤样本，衰老小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 6468 | 2025-10-06 |
Epithelial cells with high TOP2A expression promote cervical cancer progression by regulating the transcription factor FOXM1
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1604960
PMID:40589640
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术识别了宫颈癌中高表达TOP2A的上皮细胞亚群及其在肿瘤进展中的关键作用 | 首次在单细胞水平识别了高表达TOP2A的上皮细胞亚群，并揭示其通过LAMC1-(ITGA3-ITGB1)信号通路调控肿瘤微环境的机制 | NA | 探索宫颈癌进展过程中上皮细胞的分子特征，为精准靶向治疗提供新靶点 | 宫颈癌患者的上皮细胞 | 单细胞测序分析 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | Slingshot, Cellchat, SCENIC | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6469 | 2025-10-06 |
ScRNA-seq combined with ATAC-seq analysis to explore the metabolic balance mechanism of CCl4-induced liver inflammatory injury
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1600685
PMID:40589742
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和ATAC测序联合分析探索CCl4诱导的肝脏炎症损伤的代谢平衡机制 | 首次结合scRNA-seq和ATAC-seq技术系统研究CCl4诱导的慢性肝损伤中代谢平衡恢复机制，发现Zhx2和Zbtb20在代谢平衡调节中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，需要进一步在人类样本中验证；机制研究仍待深入 | 探索四氯化碳诱导的肝损伤后细胞代谢机制 | CCl4诱导的慢性肝损伤小鼠模型 | 生物信息学 | 药物性肝损伤 | scRNA-seq, ATAC-seq, RNA-seq, 功能富集分析, 转录因子分析 | NA | 基因组学数据, 表观基因组学数据, 转录组学数据 | 小鼠肝组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, ATAC测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 6470 | 2025-10-06 |
Sphingosine-1-phosphate stimulates colorectal cancer tumor microenvironment angiogenesis and induces macrophage polarization via macrophage migration inhibitory factor
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1564213
PMID:40589755
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据和体外实验，阐明鞘氨醇-1-磷酸在结直肠癌肿瘤微环境中通过巨噬细胞移动抑制因子促进血管生成和诱导巨噬细胞极化的机制 | 首次在单细胞转录组水平揭示S1P通过MIF通路调控肿瘤相关巨噬细胞极化和血管生成的作用机制 | 研究主要基于体外细胞实验，需要进一步的体内实验验证 | 探究S1P在结直肠癌肿瘤微环境中的作用机制及其对血管生成和巨噬细胞极化的影响 | 结直肠癌肿瘤微环境中的肿瘤细胞和巨噬细胞 | 肿瘤微环境研究 | 结直肠癌 | RNA-seq, scRNA-seq, 免疫组化染色, 空间转录组学 | 细胞水平实验模型 | 转录组数据, 单细胞数据, 蛋白质表达数据 | 人类组织样本和细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 6471 | 2025-10-06 |
Therapeutic implications of cancer-associated fibroblast heterogeneity: insights from single-cell and multi-omics analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1580315
PMID:40589759
|
研究论文 | 通过单细胞和多组学分析探索癌症相关成纤维细胞异质性及其在肿瘤微环境中的功能作用 | 识别了四种CAF亚群并开发了基于预后基因的风险评分模型，首次系统揭示CAF异质性对免疫治疗敏感性的影响 | 研究样本量有限，需要更大规模验证；实验验证仅针对HIP1R基因 | 探索癌症相关成纤维细胞异质性及其在肿瘤进展和治疗抵抗中的功能作用 | 癌症相关成纤维细胞(CAFs)及其亚群 | 单细胞分析 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 多组学分析, siRNA干扰, qPCR, Western blotting | Cox回归, LASSO回归, 风险评分模型 | 单细胞RNA测序数据, 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6472 | 2025-10-06 |
Cell types and neuronal genetic architecture in the rat CSF-contacting nucleus and the role of 5-HT in this nucleus in mediating morphine addiction through the brain-CSF circuit
2025, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2025.1603486
PMID:40589789
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术解析了大鼠脑脊液接触核的细胞组成和基因表达特征，并探讨了其在吗啡成瘾中的作用机制 | 首次系统描绘脑脊液接触核的单细胞转录组图谱，发现该核团通过调节5-HT释放参与吗啡成瘾的新机制 | 研究主要聚焦大鼠模型，人类相关性需要进一步验证；机制研究仍处于探索阶段 | 阐明脑脊液接触核的细胞组成和基因表达特征，探讨其在吗啡成瘾中的功能作用 | 大鼠脑脊液接触核 | 神经科学 | 药物成瘾 | 单细胞RNA测序, GO分析, KEGG通路分析, 条件性位置偏爱测试, 化学遗传学技术, ELISA, UPLC-MS | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据, 行为学数据, 生化检测数据 | 单细胞测序数据已存入中国国家生物信息中心(编号: CRR790158) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6473 | 2025-10-06 |
Spatial Transcriptomic Analyses of Spermatogenesis
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4698-4_3
PMID:40601269
|
研究论文 | 本章概述了空间转录组技术及其在精子发生研究中的应用 | 将空间转录组技术应用于精子发生研究，解决了传统转录组方法无法保留组织空间结构的问题 | 仅提供了基于小鼠睾丸的示例分析，方法适用范围有待进一步验证 | 开发空间转录组技术在精子发生研究中的应用方法 | 小鼠睾丸组织和精子发生过程 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据，组织切片图像 | 小鼠睾丸组织样本 | Curio Biosciences | 空间转录组学 | Seeker (SlideSeq V2) | Curio Biosciences Seeker平台（基于SlideSeq V2技术） |
| 6474 | 2025-10-06 |
TSC2/mTORC1 integrates deoxynivalenol signals recognized by membrane receptors IR and EGFR to restrict intestinal stem cell function
2025-Aug-15, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.138769
PMID:40466374
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研究论文 | 本研究揭示脱氧雪腐镰刀菌烯醇(DON)通过膜受体IR和EGFR调控TSC2/mTORC1通路从而限制肠道干细胞功能的分子机制 | 首次发现DON与膜受体IR/EGFR胞外域的直接相互作用，并阐明其通过TSC2/mTORC1通路调控肠道干细胞功能的完整信号传导机制 | 研究主要基于猪肠道类器官和IPEC-J2细胞系，在人体内的直接适用性需要进一步验证 | 探究DON毒素如何通过膜受体信号通路影响肠道干细胞功能 | 猪肠道干细胞、猪肠道类器官、IPEC-J2细胞系 | 分子生物学 | 肠道疾病 | 单细胞RNA测序, 等温滴定量热法, 类器官培养 | NA | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6475 | 2025-10-06 |
Cancer stem cells-derived exosomal TSPAN8 enhances non-stem cancer cells stemness and promotes malignant progression in PDAC
2025-Jul, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03412-1
PMID:40251391
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研究论文 | 本研究揭示了胰腺导管腺癌中癌症干细胞通过富含TSPAN8的外泌体增强非干细胞癌细胞的干性并促进恶性进展的机制 | 首次发现癌症干细胞分泌的富含TSPAN8的外泌体可通过激活Sonic Hedgehog信号通路增强非干细胞癌细胞的干性 | 具体靶向治疗策略仍需进一步研究 | 探索胰腺导管腺癌中癌症干细胞与非干细胞癌细胞间的通讯机制及其在恶性进展中的作用 | 胰腺导管腺癌(PDAC)细胞系和动物模型 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,外泌体分析 | NA | 基因表达数据,功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6476 | 2025-10-06 |
Neuroprotective liver portal area macrophages attenuate hepatic inflammation
2025-Jul, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-025-02190-y
PMID:40537510
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研究论文 | 本研究通过整合全肝叶成像和单细胞RNA测序技术，发现了一种具有神经保护功能的肝脏门静脉区巨噬细胞亚群 | 首次识别出CX3CR1+CD63+肝脏门静脉区巨噬细胞(LPAMs)这一新亚群，揭示了其与交感神经的相互作用及其在肝脏免疫稳态中的保护功能 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类肝脏中得到验证 | 探究肝脏巨噬细胞亚群的空间分布和功能特性 | 小鼠肝脏中的CX3CR1+细胞 | 单细胞生物学 | 非酒精性脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序,全肝叶成像 | NA | 单细胞转录组数据,空间成像数据 | 小鼠肝脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6477 | 2025-10-06 |
Infiltrative classical monocyte-derived and SPP1 lipid-associated macrophages mediate inflammation and fibrosis in ANCA-associated glomerulonephritis
2025-Jun-30, Nephrology, dialysis, transplantation : official publication of the European Dialysis and Transplant Association - European Renal Association
DOI:10.1093/ndt/gfae292
PMID:39694817
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示ANCA相关性肾小球肾炎中经典单核细胞来源巨噬细胞和SPP1脂质相关巨噬细胞介导炎症和纤维化的机制 | 首次在ANCA相关性肾小球肾炎中鉴定出四种主要巨噬细胞亚群，特别是发现经典单核细胞来源巨噬细胞和SPP1脂质相关巨噬细胞分别介导炎症和纤维化过程 | 样本量较小（仅5名活动期AGN患者），缺乏纵向随访数据 | 探究ANCA相关性肾小球肾炎中肾脏巨噬细胞的异质性及其在疾病发病机制中的作用 | ANCA相关性肾小球肾炎患者、狼疮性肾炎患者和肾切除对照者的肾脏CD45+免疫细胞 | 单细胞转录组学 | ANCA相关性肾小球肾炎 | 单细胞RNA测序, 免疫染色, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 免疫组织化学数据, 流式细胞数据 | 25,485个新鲜获取的未冻存高质量肾脏CD45+免疫细胞，来自5名活动期AGN患者、1名狼疮性肾炎患者和1名肾切除对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6478 | 2025-10-06 |
Identification of key genes and development of an identifying machine learning model for sepsis
2025-Jun-30, Inflammation research : official journal of the European Histamine Research Society ... [et al.]
IF:4.8Q2
DOI:10.1007/s00011-025-02068-7
PMID:40583108
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研究论文 | 通过整合多器官单细胞RNA测序和机器学习方法识别脓毒症关键基因并构建诊断模型 | 首次结合心脏和肺组织的单细胞RNA测序数据识别脓毒症关键基因，并采用支持向量机递归特征消除方法构建诊断模型 | 需要进一步研究验证发现结果，仅基于公共数据集分析 | 识别脓毒症关键基因并开发诊断模型 | 小鼠心脏和肺组织样本，人类基因同源物 | 机器学习 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | SVM-RFE | 基因表达数据 | 5个GEO数据集（GSE207363, GSE207651, GSE185263, GSE69063, GSE134347） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6479 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing has revealed the palmitoylation landscape in lung adenocarcinoma and identified ABHD17C as a novel biomarker
2025-Jun-27, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2025.05.024
PMID:40582697
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了肺腺癌中的蛋白质棕榈酰化修饰景观，并鉴定出ABHD17C作为新型生物标志物 | 首次在单细胞水平系统描绘肺腺癌棕榈酰化修饰图谱，发现C4上皮亚型与肿瘤转移相关，鉴定ABHD17C为关键调控因子 | NA | 探索肺腺癌中蛋白质棕榈酰化修饰的异质性及其在肿瘤进展中的作用 | 肺腺癌上皮细胞 | 单细胞生物学 | 肺腺癌 | 单细胞测序，拷贝数变异分析，伪时间分析，富集分析，细胞间通讯分析 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6480 | 2025-10-06 |
Uncovering minimal pathways in melanoma initiation
2025-Jun-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-60742-0
PMID:40571713
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了黑色素瘤起始的最小通路，发现仅携带Braf突变的裸鼠也能产生缓慢生长的肿瘤 | 发现仅Braf单突变即可诱导黑色素瘤形成，并鉴定出神经嵴样细胞作为恶性前体细胞 | 无法找到解释大多数肿瘤发生的从头突变或结构变异 | 探索黑色素瘤起始的最小遗传通路 | 小鼠黑色素瘤模型 | 癌症生物学 | 黑色素瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |