单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 10572 篇文献，本页显示第 6381 - 6400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6381 | 2025-10-06 |
A cluster-based cell-type deconvolution of spatial transcriptomic data
2025-Jul-19, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf714
PMID:40705925
|
研究论文 | 提出一种基于聚类的空间转录组数据细胞类型反卷积方法DECLUST | 通过识别包含基因表达和空间坐标的空间聚类来保持组织空间结构，并在聚类层面进行反卷积以克服单个点低表达水平的挑战 | 未提及方法在更广泛组织类型或疾病模型中的验证情况 | 开发更准确的空间转录组数据细胞类型反卷积方法 | 人类乳腺癌组织、人类卵巢癌和小鼠脑组织的空间转录组数据 | 空间转录组学 | 乳腺癌,卵巢癌 | 空间转录组学 | 聚类分析 | 空间转录组数据 | 模拟人类乳腺癌数据集和两个真实数据集（人类卵巢癌、小鼠脑） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6382 | 2025-10-06 |
Machine learning-based integration develops a hypoxia-derived signature for improving outcomes in glioma
2025-Jul-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112023
PMID:40585359
|
研究论文 | 本研究通过机器学习整合开发了缺氧相关基因签名，用于改善胶质瘤患者的预后预测 | 首次基于单细胞RNA测序分析揭示胶质瘤缺氧微环境的细胞异质性通讯，并建立11基因缺氧特征签名 | NA | 开发胶质瘤缺氧相关预后预测工具并指导治疗决策 | 胶质瘤患者 | 机器学习 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR | 机器学习 | 基因表达数据 | 六个队列的胶质瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6383 | 2025-10-06 |
Immune and Inflammatory Properties of Megakaryocytes
2025-Jul-10, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14141053
PMID:40710306
|
综述 | 本综述探讨巨核细胞在健康和疾病状态下的免疫与炎症功能特性 | 揭示了巨核细胞通过单细胞RNA测序发现的具有免疫功能的亚群，这些细胞表达免疫标志物并参与病原体吞噬和抗原呈递 | NA | 系统总结巨核细胞新发现的免疫和炎症功能特性 | 巨核细胞及其免疫亚群 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6384 | 2025-10-06 |
A Meta-Review of Spatial Transcriptomics Analysis Software
2025-Jul-10, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells14141060
PMID:40710313
|
综述 | 对空间转录组学分析软件进行系统性评估与比较的元综述 | 整合多个基准测试研究结果，首次系统比较不同软件在四个关键分析领域的性能表现 | 未开发新软件或算法，主要基于现有文献进行总结归纳 | 为研究人员选择适合的空间转录组学分析软件提供指导 | 空间转录组学分析软件 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据与空间坐标数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6385 | 2025-10-06 |
High-precision immune-related plasma proteomics profiling predicts response to immunotherapy in patients with triple-negative breast cancer
2025-Jul-04, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
|
研究论文 | 本研究通过高精度血浆蛋白质组学分析预测三阴性乳腺癌患者对免疫治疗的应答 | 首次发现ARG1、NOS3和CD28血浆蛋白与免疫治疗应答相关，并开发了血浆免疫预测评分系统 | 回顾性研究，样本量相对有限 | 开发非侵入性生物标志物预测三阴性乳腺癌患者对免疫治疗的应答 | 195名接受抗PD-1免疫治疗的三阴性乳腺癌患者 | 蛋白质组学 | 乳腺癌 | 高精度蛋白质组学分析，单细胞RNA测序 | NA | 血浆蛋白质组数据，单细胞RNA测序数据 | 195名TNBC患者的配对基线、治疗中和治疗后血浆样本 | NA | 蛋白质组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6386 | 2025-10-06 |
scGGC: a two-stage strategy for single-cell clustering through cellular gene pathway construction
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf368
PMID:40698866
|
研究论文 | 提出一种名为scGGC的两阶段单细胞聚类方法，通过构建细胞基因通路整合图自编码器和生成对抗网络技术 | 构建包含细胞-细胞和细胞-基因关系的邻接矩阵来捕捉复杂相互作用，并通过选择高置信度样本进行对抗神经网络训练来提升聚类性能 | NA | 解决单细胞RNA测序数据聚类分析中的高维度、噪声和稀疏性挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图自编码器, 生成对抗网络 | 基因表达数据 | 九个公开可用的scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6387 | 2025-10-06 |
Applications and techniques of single-cell RNA sequencing across diverse species
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf354
PMID:40698863
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在不同物种中的应用和技术进展 | 全面总结了scRNA-seq在模式和非模式物种中的跨物种应用潜力，特别是在生态基因组学等新兴领域的应用 | 存在技术和资金障碍，限制了在非模式生物和复杂细胞组成组织中的应用 | 探讨单细胞RNA测序技术的应用范围和技术发展 | 各种物种的单细胞转录组 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6388 | 2025-10-06 |
Path-MGCN: a pathway activity-based multi-view graph convolutional network for determining spatial domains
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf365
PMID:40698867
|
研究论文 | 开发了一种基于通路活性的多视图图卷积网络Path-MGCN，用于空间转录组数据中的空间域识别 | 首次将通路水平功能背景整合到空间域识别中，通过多视图图卷积网络自适应融合空间和功能邻近性信息 | NA | 开发准确且可解释的空间转录组数据分析框架，解析组织异质性 | 人类背外侧前额叶皮层、乳腺癌组织和鼠脑组织 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学，基因集变异分析 | 多视图图卷积网络，注意力机制，零膨胀负二项式解码器 | 空间转录组数据 | 多个数据集（人类背外侧前额叶皮层、乳腺癌和鼠脑组织） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6389 | 2025-10-06 |
GRANet: a graph residual attention network for gene regulatory network inference
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf349
PMID:40708222
|
研究论文 | 提出一种名为GRANet的图残差注意力网络，用于基因调控网络推断 | 利用残差注意力机制自适应学习复杂基因调控关系，并整合多维生物特征进行更全面的推断 | NA | 改进单细胞水平基因调控网络推断的准确性 | 基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图残差注意力网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6390 | 2025-10-06 |
Multiplexed imaging to reveal tissue dendritic cell spatial localisation and function
2025-Jul, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.14962
PMID:38969618
|
综述 | 本文综述了多重成像技术在揭示组织树突状细胞空间定位和功能方面的应用 | 利用新兴的多重成像技术解决传统方法无法提供细胞空间信息的问题，填补了树突状细胞空间定位研究的空白 | 作为综述文章，未包含原始实验数据，主要依赖已有文献进行总结 | 探讨多重成像技术在树突状细胞空间定位和功能研究中的应用 | 组织中的树突状细胞及其亚群 | 数字病理 | NA | 多重成像技术 | NA | 图像数据 | NA | NA | 空间成像技术 | NA | NA |
| 6391 | 2025-10-06 |
M2 Macrophage-Derived Extracellular Vesicles Reprogram Immature Neutrophils into Anxa1hi Neutrophils to Enhance Inflamed Bone Regeneration
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202416159
PMID:40277454
|
研究论文 | 本研究揭示了M2巨噬细胞来源的细胞外囊泡通过重编程未成熟中性粒细胞为Anxa1hi中性粒细胞来增强炎症性骨再生 | 首次发现M2巨噬细胞来源的细胞外囊泡可重编程中性粒细胞成熟轨迹，产生具有修复功能的Anxa1中性粒细胞亚群 | NA | 探索M2巨噬细胞在牙周炎骨再生中的作用机制 | 牙周组织中的巨噬细胞和中性粒细胞 | 单细胞生物学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6392 | 2025-10-06 |
Gas Bubbles from Biodegradable Magnesium Implants Convey Mechanical Cues and Promote Immune Cell Stimulation
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202503123
PMID:40349156
|
研究论文 | 本研究探讨镁植入物降解产生的气泡如何通过机械和炎症途径影响组织愈合和免疫细胞反应 | 首次系统揭示镁植入物气泡在多个生物尺度和时间尺度上对邻近组织和细胞行为的机械生物学影响 | 研究仅在大鼠模型中进行，缺乏人类临床数据验证 | 探究可降解镁植入物产生气泡的生物学意义及其对组织修复的影响机制 | 大鼠软组织中镁植入物周围的气泡、组织细胞和免疫细胞 | 生物医学工程 | 植入物相关组织反应 | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据、组织形态学数据 | 大鼠植入模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6393 | 2025-10-06 |
Blood Biomarker-Based Predictive Indicator for Liver Metastasis in Alpha-Fetoprotein-Producing Gastric Cancer and Multi-Omics Tumor Microenvironment Insights
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202503499
PMID:40433893
|
研究论文 | 本研究开发了基于血液生物标志物的预测指标ANLiM评分，用于预测甲胎蛋白产生型胃癌的肝转移和免疫治疗反应 | 首次结合AFP和中性粒细胞-淋巴细胞比率开发ANLiM评分，并通过多组学分析揭示肝转移AFPGC的免疫抑制微环境特征 | 回顾性研究设计，样本量相对有限（317例患者） | 开发甲胎蛋白产生型胃癌肝转移的预测指标并探索其肿瘤微环境特征 | 317例甲胎蛋白产生型胃癌患者 | 肿瘤学 | 胃癌 | 多变量逻辑回归模型，全外显子组测序，蛋白质组分析，单细胞RNA测序，多重免疫荧光 | 逻辑回归模型，列线图 | 临床数据，基因组数据，蛋白质组数据，单细胞转录组数据 | 317例患者 | NA | 全外显子组测序，蛋白质组分析，单细胞RNA测序，空间转录omics | NA | NA |
| 6394 | 2025-10-06 |
A Dual Approach with Organoid and CRISPR Screening Reveals ERCC6 as a Determinant of Cisplatin Resistance in Osteosarcoma
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202500632
PMID:40476445
|
研究论文 | 本研究通过骨肉瘤类器官模型和CRISPR筛选技术，揭示了ERCC6基因在骨肉瘤顺铂耐药性中的关键作用机制 | 首次结合患者来源骨肉瘤类器官模型和CRISPR筛选技术，发现ERCC6通过调控BAX基因的可变剪接影响顺铂耐药性 | 研究主要基于体外和动物模型，尚未进行临床验证 | 探究骨肉瘤顺铂耐药性的分子机制 | 骨肉瘤患者来源类器官和骨肉瘤细胞系 | 癌症生物学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, CRISPR筛选, 组织病理学分析 | 类器官模型, 细胞系模型 | 基因表达数据, 测序数据, 病理图像 | 患者来源骨肉瘤类器官和骨肉瘤细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 6395 | 2025-10-06 |
Rewriting the dendritic cell code in cancer-from subset identity to immunotherapeutic design
2025-Jul, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.70108
PMID:40667699
|
综述 | 本文系统解析树突状细胞在癌症免疫中的功能特化及其被肿瘤微环境重编程的机制，并探讨相关免疫治疗策略 | 整合空间转录组学和单细胞研究最新发现，揭示关键DC-T细胞生态位，提出基于DC亚群特异性的情境感知免疫治疗新范式 | 作为综述文章，未包含原始实验数据，主要基于已有研究进行整合分析 | 阐明树突状细胞在肿瘤免疫中的重编程机制并探索免疫治疗新策略 | 树突状细胞亚群（cDC1、cDC2、pDCs、DC3s、tDCs、moDCs等）及其与肿瘤微环境的相互作用 | 免疫学 | 癌症 | 空间转录组学、单细胞研究 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞研究 | NA | NA |
| 6396 | 2025-10-06 |
Featured Immune Characteristics of Periodontitis and Primary Sjögren's Syndrome Revealed by Single-Cell Transcriptome Analyses
2025-Jul, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70713
PMID:40696268
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示牙周炎和原发性干燥综合征的免疫特征 | 首次在单细胞水平比较牙周炎和原发性干燥综合征的免疫细胞景观，发现两种疾病共有的CD8 naive T细胞耗竭机制 | 数据来源于公共数据库，样本量有限，需要进一步实验验证 | 比较牙周炎和原发性干燥综合征在单细胞水平的免疫特征异同 | 健康对照者、牙周炎患者和原发性干燥综合征患者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 牙周炎, 原发性干燥综合征 | 单细胞RNA测序 | Seurat, NicheNetr | 单细胞转录组数据 | 来自NCBI和NGDC数据库的PBMC样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6397 | 2025-10-06 |
APOBEC3C-Mediated NF-κB Activation Promotes Malignant Progression of Gliomas
2025-Jul, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.70224
PMID:40704619
|
研究论文 | 本研究探讨APOBEC3C在胶质瘤恶性进展中的作用机制及其临床意义 | 首次揭示APOBEC3C通过NF-κB信号通路促进胶质瘤上皮间质转化过程 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内实验验证 | 分析APOBEC3C在胶质瘤中的临床病理特征、免疫学特性及预后价值，并验证其介导胶质瘤恶性进展的具体机制 | 胶质瘤患者和胶质瘤细胞系 | 生物信息学 | 胶质瘤 | mRNA-seq, 单细胞测序, Western blot, Transwell实验, 细胞划痕实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 蛋白质印迹数据 | CGGA数据库693例胶质瘤患者，TCGA数据库697例胶质瘤患者，另加CGGA单细胞测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6398 | 2025-10-06 |
Pan-cancer analysis of enhancer-induced MIR17HG and validation as a SIRT1-promoting factor in colorectal cancer
2025-Jun-30, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-02841-y
PMID:40586938
|
研究论文 | 通过泛癌分析揭示MIR17HG的致癌作用及其在结直肠癌中通过HSF1增强子激活的调控机制 | 首次发现HSF1通过增强子活性驱动MIR17HG过表达，并证实其通过SIRT1促进结直肠癌进展 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限 | 探索MIR17HG在癌症中的致癌作用及其调控机制 | 多种肿瘤类型及结直肠癌 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 生物信息学分析，单细胞测序，虚拟筛选 | NA | 基因表达数据，单细胞测序数据 | 23种肿瘤类型和11种肿瘤类型的表达数据 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 6399 | 2025-10-06 |
Epidermal γδ T cells, CD8 T cells and macrophages are increased in number in alopecia areata and express BST2 as part of an interferon-driven antiviral gene signature
2025-Jun-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.26.661822
PMID:40667382
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现斑秃皮肤中表皮γδ T细胞、CD8 T细胞和巨噬细胞数量增加，并表达干扰素驱动的抗病毒基因标记物BST2 | 首次发现表皮γδ T细胞和巨噬细胞参与斑秃发病机制，并确定BST2作为干扰素驱动免疫激活的标志物 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 阐明斑秃发病机制中除CD4和CD8 T细胞外其他免疫细胞的作用 | C3H/HeJ小鼠斑秃模型和人类斑秃皮肤样本 | 免疫学 | 斑秃 | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6400 | 2025-10-06 |
TET3 facilitates bladder cancer progression through targeted modulation of stemness pathways
2025-Jun-26, Medical oncology (Northwood, London, England)
DOI:10.1007/s12032-025-02857-4
PMID:40569530
|
研究论文 | 本研究揭示TET3通过调控干细胞特性通路促进膀胱癌进展的分子机制 | 首次在膀胱癌中系统阐明TET3通过调控干细胞特性通路促进肿瘤进展的作用机制 | 未明确TET3调控干细胞特性的具体下游靶点及信号通路细节 | 探究TET3在膀胱癌进展中的作用机制及潜在治疗价值 | 膀胱癌细胞系及动物模型 | 癌症生物学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序，功能实验，体内肿瘤生长分析，组织学分析 | NA | 基因表达数据，组织图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |