本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6321 | 2025-10-06 |
Investigating the role of tumor cell heterogeneity and angiogenesis genes in the prognosis of multiple myeloma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1610833
PMID:40636123
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组和单细胞RNA测序数据,探讨肿瘤细胞异质性和血管生成相关基因在多发性骨髓瘤预后中的作用 | 首次发现C1亚群中CREB3L2高表达与血管生成抑制及肿瘤细胞增殖迁移的关联,并构建了基于血管生成和转录因子的预后模型 | 研究依赖于公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性验证 | 探索肿瘤细胞异质性和血管生成相关基因对多发性骨髓瘤预后的影响 | 多发性骨髓瘤患者 | 生物信息学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, CNV分析, 转录因子分析, 细胞通讯分析, 免疫浸润分析 | 预后预测模型 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6322 | 2025-10-06 |
A bibliometric analysis of studies related to the nuclear factor kappa B signaling pathway in knee osteoarthritis between 2004 and 2023
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1572161
PMID:40636390
|
文献计量分析 | 对2004-2023年间核因子κB信号通路在膝骨关节炎研究中发表文献进行文献计量分析 | 首次系统分析NF-κB信号通路在膝骨关节炎领域的研究趋势和热点演变 | 缺乏实时可视化NF-κB活性的体内成像技术 | 识别NF-κB信号通路在膝骨关节炎研究中的主要领域和趋势 | 752篇相关研究文献 | 文献计量学 | 膝骨关节炎 | 文献计量分析 | NA | 文献数据 | 752篇研究文献 | NA | 单细胞转录组, 空间转录组 | NA | NA |
| 6323 | 2025-10-06 |
Delineation of single-cell Altas provides new insights for development of coronary artery lesions in Kawasaki disease: bad and good signaling molecules
2025, Frontiers in pediatrics
IF:2.1Q2
DOI:10.3389/fped.2025.1596643
PMID:40636515
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析川崎病冠状动脉病变患者的免疫细胞图谱,揭示疾病发展的分子机制 | 首次在单细胞水平系统描绘川崎病冠状动脉病变患者的免疫细胞图谱,发现SPI1和MT2A的表达异常与B细胞发育紊乱相关 | 样本量较小(仅12个样本),缺乏独立验证队列 | 探索川崎病冠状动脉病变发展的分子机制 | 川崎病患者的周围血单核细胞 | 单细胞组学 | 川崎病 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析,细胞通讯分析 | 单细胞RNA测序数据 | 12个样本(3组KD非CAL患者治疗前后,3组KD CAL患者治疗前后) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6324 | 2025-10-06 |
Identification of Shared Biomarkers in Chronic Kidney Disease and Diabetic Nephropathy Using Single-Cell Sequencing
2025, Diabetes, metabolic syndrome and obesity : targets and therapy
DOI:10.2147/DMSO.S514319
PMID:40636753
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术识别慢性肾脏病和糖尿病肾病的共享生物标志物 | 首次在单细胞水平系统比较CKD和DN的共享生物标志物,发现MX1、IRF7、STAT1和ISG15在两种疾病中的共同表达特征 | 样本量较小(仅9例),仅使用血液样本而未包含肾脏组织样本 | 识别慢性肾脏病和糖尿病肾病的共享生物标志物,探索其诊断和治疗潜力 | 人类血液样本中的免疫细胞 | 单细胞组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | 差异表达分析,蛋白质相互作用网络分析 | 单细胞转录组数据 | 9例人类血液样本(3例对照,3例CKD,3例DN) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6325 | 2025-10-06 |
Comparison of single-cell long-read and short-read transcriptome sequencing via cDNA molecule matching: quality evaluation of the MAS-ISO-seq approach
2025-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqaf089
PMID:40630932
|
研究论文 | 通过cDNA分子匹配比较单细胞长读长和短读长转录组测序方法,评估MAS-ISO-seq方法的质量 | 首次通过细胞条形码和UMI匹配的cDNA分子直接比较长读长和短读长单细胞转录组测序方法 | 仅使用10x Genomics 3' cDNA平台,未评估其他单细胞技术平台 | 评估长读长和短读长单细胞转录组测序方法的可比性和偏差 | 单细胞转录组测序数据 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序,cDNA测序 | NA | 基因表达数据,转录本序列 | NA | 10x Genomics, Illumina, Pacific Biosciences | 单细胞RNA-seq,长读长测序,短读长测序 | 10x Chromium, Illumina测序平台, PacBio测序平台 | 10x Genomics 3' cDNA,Illumina短读长测序,Pacific Biosciences长读长测序 |
| 6326 | 2025-10-06 |
Identify critical genes of breast cancer and corresponding leading natural product compounds of potential therapeutic targets
2025-Aug, Molecular diversity
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11030-024-11035-z
PMID:39656376
|
研究论文 | 通过多组学分析识别乳腺癌关键基因及潜在天然产物治疗靶点 | 整合WGCNA、差异基因表达、ChIP-seq、scRNA-seq和空间转录组学数据,首次系统筛选靶向角鲨烯环氧酶的天然产物化合物 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证 | 识别乳腺癌关键基因和潜在天然产物治疗靶点 | 乳腺癌基因和天然产物化合物 | 生物信息学 | 乳腺癌 | WGCNA, 差异基因表达分析, ChIP-seq, scRNA-seq, 空间转录组学, 虚拟筛选 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, ChIP-seq | NA | NA |
| 6327 | 2025-10-06 |
RNA binding proteins PCBP1 and PCBP2 regulate pancreatic β cell translation
2025-Aug, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2025.102175
PMID:40451383
|
研究论文 | 本研究探讨RNA结合蛋白PCBP1和PCBP2在胰腺β细胞翻译调控中的协同作用 | 首次揭示PCBP1和PCBP2通过共同调控翻译起始因子和核糖体mRNAs网络来维持β细胞全局翻译的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类β细胞中的具体机制仍需进一步验证 | 探究PCBP1和PCBP2在β细胞稳态和翻译调控中的功能关系 | 胰腺β细胞 | 分子生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, Western blot, RNA免疫沉淀, CRISPR-Cas9, shRNA, 嘌呤霉素标记 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 蛋白质相互作用数据 | β细胞特异性Pcbp1和Pcbp1/2双敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6328 | 2025-10-06 |
METRNL represses beta-to-alpha cell trans-differentiation to maintain beta cell function under diabetic metabolic stress in mice
2025-Aug, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06459-7
PMID:40495021
|
研究论文 | 本研究揭示METRNL蛋白在糖尿病代谢应激下通过抑制β细胞向α细胞转分化来维持β细胞功能 | 首次发现METRNL在胰岛β细胞中的特异性表达及其通过调控KLF6和c-Jun通路防止β细胞转分化的新机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类胰岛细胞中验证 | 探究METRNL在维持胰岛β细胞功能和身份认同中的作用机制 | 小鼠胰岛β细胞 | 分子生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序,葡萄糖刺激胰岛素分泌实验,基因敲除 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,生理指标数据 | 未明确样本数量,使用正常饮食和高脂饮食喂养的小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6329 | 2025-10-06 |
FAM83A Promotes the Progression and Metastasis of Head and Neck Squamous Cell Carcinoma via PKM2-Mediated Aerobic Glycolysis
2025-Jul-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500989RR
PMID:40637278
|
研究论文 | 本研究揭示了FAM83A通过PKM2介导的有氧糖酵解促进头颈部鳞状细胞癌进展和转移的机制 | 首次发现FAM83A与PKM2在HNSCC中的关系,阐明FAM83A通过Wnt/β-catenin信号通路激活PKM2转录的分子机制 | NA | 探究FAM83A在头颈部鳞状细胞癌代谢中的作用及其与PKM2的调控关系 | 头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)细胞系和临床样本 | 癌症代谢研究 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | 基因表达数据, 代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6330 | 2025-10-06 |
Myeloid MAS-driven macrophage efferocytosis promotes resolution in ischemia-stressed mouse and human livers
2025-Jul-09, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adr2725
PMID:40632838
|
研究论文 | 本研究揭示了MAS受体通过PKA/CREB信号通路调控KLF4/MERTK轴,促进巨噬细胞对衰老中性粒细胞的清除,从而缓解肝脏缺血再灌注损伤 | 首次发现MAS/KLF4/MERTK轴在巨噬细胞胞葬作用中的调控机制,并通过单细胞RNA测序和空间转录组学证实其在肝脏缺血再灌注损伤中的保护作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类肝脏样本验证相对有限 | 探究MAS受体在髓系细胞先天免疫和肝组织稳态维持中的具体作用机制 | 小鼠模型和人类肝脏样本中的巨噬细胞和衰老中性粒细胞 | 单细胞生物学 | 肝脏缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 活体成像, 基因敲除 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 影像数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6331 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis reveals the malignant characteristics of tumour cells and the immunosuppressive landscape in HER2-positive inflammatory breast cancer
2025-Jul-08, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03454-z
PMID:40624675
|
研究论文 | 通过单细胞转录组技术揭示HER2阳性炎性乳腺癌肿瘤细胞的恶性特征和免疫抑制微环境 | 首次在单细胞水平系统比较HER2阳性炎性乳腺癌与非炎性乳腺癌的肿瘤微环境差异,发现PTN分子过表达与肿瘤侵袭性及免疫抑制微环境的强相关性 | 样本量较小(仅3例患者),缺乏功能性实验验证 | 阐明HER2阳性炎性乳腺癌肿瘤微环境的细胞组成和分子特征 | HER2阳性炎性乳腺癌患者的肿瘤组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 3例HER2阳性炎性乳腺癌患者,共15,832个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6332 | 2025-10-06 |
Analysis of Single-Cell RNA-Seq Data to Investigate Tumor Cell Heterogeneity in Uroepithelial Bladder Cancer and Predict Immunotherapy Response
2025-Jul-08, Current cancer drug targets
IF:2.3Q3
|
研究论文 | 通过分析膀胱尿路上皮癌的单细胞RNA测序数据,研究肿瘤细胞异质性并预测免疫治疗反应 | 识别了与血管生成和肿瘤转移相关的缺氧肿瘤亚群,并基于肿瘤干细胞基因构建了免疫检查点抑制剂反应预测模型 | 研究基于现有数据集进行meta分析,需要进一步实验验证 | 研究膀胱尿路上皮癌中肿瘤干细胞与肿瘤微环境的相互作用及其对免疫治疗反应的影响 | 膀胱尿路上皮癌单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序,机器学习 | 多种机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 6333 | 2025-10-06 |
Pancreatic alpha and beta cell fate choice is directed by apical-basal polarity dynamics
2025-Jul-07, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.02.008
PMID:40056911
|
研究论文 | 本研究揭示了胰腺内分泌祖细胞顶端-基底极性动态调控α和β细胞命运选择的机制 | 首次发现顶端-基底极性是调控多能胰腺内分泌祖细胞向α或β细胞分化的主要决定因素 | NA | 探索细胞外信号如何通过顶端-基底极性调控多能祖细胞分化命运 | 人类胰腺Neurogenin3内分泌祖细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6334 | 2025-10-06 |
Genomic evolution reshapes cell-type diversification in the amniote brain
2025-Jul-07, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.04.014
PMID:40367951
|
研究论文 | 本研究通过构建羊膜动物大脑单细胞图谱,揭示了细胞类型在进化过程中的保守性与多样性 | 首次创建了涵盖龟、斑胸草雀、鸽子、小鼠和猕猴的130多万个端脑和小脑细胞的单细胞空间转录组图谱,发现了鸟类特异性浦肯野细胞亚型 | 研究仅涵盖五种代表性物种,可能无法完全代表所有羊膜动物的进化多样性 | 探索羊膜动物大脑在3.2亿年进化过程中细胞类型多样化的基因组演化机制 | 龟、斑胸草雀、鸽子、小鼠和猕猴的端脑和小脑细胞 | 空间转录组学 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据、空间转录组数据 | 超过130万个细胞,来自5个物种 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6335 | 2025-10-06 |
Single-nucleus rna sequencing identifies universal camk1d upregulation and dysregulated c-ltmr subtypes as key drivers of paclitaxel-induced neuropathy
2025-Jul-07, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-025-10065-z
PMID:40622640
|
研究论文 | 通过单核RNA测序揭示紫杉醇诱导神经病变的关键分子机制 | 首次发现Camk1d基因普遍上调及C-LTMR亚型失调是紫杉醇诱导神经病变的关键驱动因素 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究紫杉醇诱导神经性疼痛的分子机制 | 小鼠背根神经节细胞 | 单细胞转录组学 | 神经病变 | 单核RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 紫杉醇处理小鼠的背根神经节细胞 | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 6336 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic analysis identifies systemic immunosuppressive myeloid cells and local monocytes/macrophages as key regulators in polytrauma-induced immune dysregulation
2025-Jul-07, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-025-00444-x
PMID:40623986
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示了多发性创伤诱导免疫失调的关键调控细胞群及其分子机制 | 首次同时研究全身和局部免疫细胞,识别出TIM细胞群和CD1d标志物,发现Anxa1-Fpr2和Spp1-Cd44信号轴 | 基于大鼠模型的研究,需要进一步验证在人类中的适用性 | 探究多发性创伤诱导免疫失调的细胞和分子基础及其对骨愈合的影响 | 多发性创伤大鼠模型中的血液、骨髓和局部缺损软组织 | 单细胞组学 | 创伤后骨不连 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多发性创伤大鼠模型的组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6337 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic profiling of immune landscape in triple-negative breast cancer during neoadjuvant chemotherapy
2025-Jul-07, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-025-00549-3
PMID:40624003
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析三阴性乳腺癌新辅助化疗过程中的免疫景观变化 | 首次在S100АMHC单核细胞群中发现髓源性抑制细胞特征并建立MDSC评分系统 | 样本量有限,需要在更大队列中验证发现 | 探究三阴性乳腺癌新辅助化疗疗效与免疫系统功能状态的关系 | 三阴性乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 响应者和非响应者TNBC患者,以及独立验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6338 | 2025-10-06 |
Integrated bioinformatics analysis identifies CHAD association with osteoporosis and in vitro chondrogenic effects of Wogonin
2025-Jul-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-05861-w
PMID:40624035
|
研究论文 | 通过整合生物信息学分析鉴定CHAD与骨质疏松症的关联,并验证汉黄芩素在体外对软骨形成的促进作用 | 首次采用多组学生物信息学方法识别CHAD作为骨质疏松症的潜在关键基因,并结合中药化合物进行实验验证 | 仅进行了体外初步实验验证,缺乏动物模型和临床数据支持 | 探索骨质疏松症的新型治疗靶点和中药替代疗法 | 骨质疏松症相关差异表达基因和中药化合物 | 生物信息学 | 骨质疏松症 | 整合生物信息学分析,分子对接,单细胞RNA测序,qRT-PCR | 分子对接模型 | 基因表达数据,化合物结构数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 6339 | 2025-10-06 |
Neurogenomic and behavioral principles shape freezing dynamics and synergistic performance in Drosophila melanogaster
2025-Jul-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61313-z
PMID:40624091
|
研究论文 | 本研究通过大规模行为实验和基因组分析揭示了果蝇集体防御行为的神经基因组机制 | 首次发现果蝇群体中遗传多样性通过视觉神经元发育相关基因(Ptp99A和kirre)调控冻结行为,提出基因组水平高阶关联研究新方法 | 研究主要聚焦果蝇模型,结果在其他物种中的普适性需要进一步验证 | 探究集体防御行为的神经和遗传基础 | 黑腹果蝇(Drosophila melanogaster) | 神经科学, 行为遗传学 | NA | GWAS, 单细胞转录组测序, 功能验证实验, 动物-计算机交互实验, 基于代理的模拟 | NA | 行为数据, 基因组数据, 转录组数据 | 大规模果蝇群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6340 | 2025-10-06 |
Novel single-cell preservation and RNA sequencing technology unlocks field studies for Plasmodium natural infections
2025-Jul-07, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-08765-x
PMID:40624152
|
研究论文 | 开发并验证了适用于疟原虫自然感染现场研究的单细胞RNA保存和测序技术 | 首次将单细胞RNA测序技术应用于疟原虫自然感染现场研究,解决了在资源有限环境中开展单细胞研究的挑战 | 目前仅在恶性疟原虫中验证,尚未在其他疟原虫物种中广泛应用 | 开发适用于现场研究的疟原虫单细胞RNA保存和测序方法 | 恶性疟原虫单细胞 | 单细胞测序 | 疟疾 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 6个样本,包含22,345个恶性疟原虫单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |