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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6281 | 2025-10-06 |
Spatial Analysis Identifies CD147 as a Novel Marker of High-Grade Childhood Posterior Fossa Ependymoma
2025-Jul, Laboratory investigation; a journal of technical methods and pathology
DOI:10.1016/j.labinv.2025.104175
PMID:40250710
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研究论文 | 通过空间表型分析发现CD147是儿童后颅窝高级别室管膜瘤的新型标志物 | 首次在儿童PFA-EPN中通过空间表型分析鉴定CD147作为高级别肿瘤的新型标志物,并揭示CD147+小胶质细胞在肿瘤进展中的关键作用 | 样本量较小(G2 n=5,G3 n=7),仅针对后颅窝A型室管膜瘤 | 研究儿童后颅窝室管膜瘤肿瘤微环境的空间异质性及其与肿瘤分级的关系 | 儿童后颅窝A型室管膜瘤(WHO 2级和3级)肿瘤样本 | 数字病理学 | 室管膜瘤 | 多重免疫荧光,单细胞RNA测序 | 空间表型分析 | 图像,基因表达数据 | 12例肿瘤样本(5例G2,7例G3) | NA | 空间表型分析,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6282 | 2025-10-06 |
Asperosaponin VI Promotes Osteoporotic Fracture Healing by Targeting Piezo1 to Enhance the Coupling of LEPR+ BMSCs and PODXL+ ECs
2025-Jul, Phytotherapy research : PTR
IF:6.1Q1
DOI:10.1002/ptr.8523
PMID:40393465
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研究论文 | 本研究揭示了Asperosaponin VI通过靶向Piezo1增强LEPR+ BMSCs与PODXL+ ECs的偶联,促进骨质疏松性骨折愈合 | 首次发现Asperosaponin VI可靶向Piezo1激活Piezo1/ERK1/2/YAP/VEGF信号通路,促进骨形成和血管生成的偶联 | 研究主要基于动物模型,临床转化效果需进一步验证 | 阐明骨质疏松性骨折的分子发病机制并开发新的治疗方案 | LEPR+骨髓间充质干细胞和PODXL+内皮细胞 | 分子生物学 | 骨质疏松性骨折 | 单细胞RNA测序,分子对接,CETSA,DARTS,三维培养,免疫荧光,流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据,蛋白质表达数据 | 卵巢切除结合股骨骨折小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6283 | 2025-10-06 |
Single-cell mutational burden distributions in birth-death processes
2025-Jul, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013241
PMID:40623094
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研究论文 | 本文通过引入动力学矩阵分析单细胞突变负荷分布与位点频率谱、细胞分裂分布之间的关系 | 开发了新的数学框架——动力学矩阵,首次统一分析三种突变统计分布并推导了死亡情况下的近似表达式 | NA | 研究肿瘤细胞群体中突变积累的统计分布规律 | 肿瘤细胞群体的突变分布 | 计算生物学 | 癌症 | 单细胞测序 | 动力学矩阵 | 突变数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 6284 | 2025-10-06 |
Age-dependent accumulation of mitochondrial tRNA mutations in mouse kidneys linked to mitochondrial kidney diseases
2025-Jul, Nature aging
IF:17.0Q1
DOI:10.1038/s43587-025-00909-y
PMID:40579478
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研究论文 | 本研究通过基因编辑技术创建携带线粒体tRNA突变的小鼠模型,揭示了这些突变在肾脏中的年龄依赖性积累规律及其与线粒体肾病的关系 | 首次利用DddA衍生的胞嘧啶碱基编辑器技术构建多种致病性线粒体tRNA突变小鼠模型,并结合多组学技术揭示肾脏不同细胞类型的异质性突变动态 | 研究仅限于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究线粒体DNA突变在衰老过程中的组织特异性积累模式及其与线粒体肾病的机制联系 | 携带三种不同致病性线粒体tRNA突变的基因编辑小鼠模型 | 生物医学 | 线粒体肾病 | DddA-derived cytosine base editor, mtscATAC-seq, 单细胞RNA测序, 空间增强分辨率组学测序 | 基因编辑小鼠模型 | 基因组数据, 转录组数据, 表观基因组数据 | 三种不同突变类型的小鼠模型 | NA | 单细胞ATAC-seq, 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 线粒体单细胞转座酶可及染色质测序(mtscATAC-seq) |
| 6285 | 2025-10-06 |
Identification of Prognostic Biomarkers in Gene Expression Profile of Neuroblastoma Via Machine Learning
2025-Jun, Pediatric discovery
DOI:10.1002/pdi3.70009
PMID:40666234
|
研究论文 | 通过机器学习方法识别神经母细胞瘤基因表达谱中的预后生物标志物 | 提出了一种基于网络的整合机器学习方法,结合bulk和单细胞RNA测序数据发现神经母细胞瘤预后相关生物标志物 | NA | 识别神经母细胞瘤的预后生物标志物和治疗靶点 | 神经母细胞瘤基因表达数据 | 机器学习 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | 支持向量机 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6286 | 2025-10-06 |
Integration of mass cytometry and single-cell RNA-sequencing of cells in bronchoalveolar lavage
2025-Apr, BioTechniques
IF:2.2Q4
DOI:10.1080/07366205.2025.2505347
PMID:40384395
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研究论文 | 本研究通过整合质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术,对支气管肺泡灌洗液中的细胞群体进行联合分析 | 首次在同一支气管肺泡灌洗液样本中同时应用单细胞RNA测序和质谱流式细胞术进行互补验证 | 研究样本仅来自健康参与者,未包括疾病状态样本 | 评估单细胞RNA测序与蛋白质检测方法在细胞群体表征中的一致性和互补性 | 支气管肺泡灌洗液中的细胞群体 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术 | NA | 单细胞RNA表达数据,蛋白质表达数据 | 健康参与者的支气管肺泡灌洗液样本 | NA | 单细胞RNA测序,质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 6287 | 2025-10-06 |
Inhibition of methylthioadenosine phosphorylase provides protection from experimental acute kidney injury
2025-Feb-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.19.639065
PMID:40027701
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研究论文 | 本研究探讨抑制甲基硫腺苷磷酸化酶(MTAP)对实验性急性肾损伤的保护作用 | 首次提出MTAP抑制作为急性肾损伤的新型肾脏保护策略 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床适用性有待验证 | 开发急性肾损伤的新型治疗策略 | 急性肾损伤小鼠模型和人类单细胞RNA测序数据 | 肾脏病学 | 急性肾损伤 | RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 6288 | 2025-10-06 |
Topologically associating domains of chromatin on single-cell Hi-C data: a survey of bioinformatic tools and applications in the light of artificial intelligence
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1602234
PMID:40666074
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综述 | 本文综述了基于单细胞Hi-C数据的染色质拓扑关联域生物信息学工具及其在人工智能背景下的应用 | 首次系统综述了单细胞水平TAD结构计算分析中的人工智能策略,特别关注深度神经网络在处理大规模单细胞Hi-C数据中的优势 | 单细胞Hi-C数据存在超稀疏性、噪声干扰、实验伪影和细胞异质性等挑战 | 探讨单细胞Hi-C数据中拓扑关联域的计算分析方法及其在人工智能时代的发展趋势 | 染色质拓扑关联域(TADs) | 生物信息学 | NA | 单细胞Hi-C测序 | 深度神经网络 | 基因组三维结构数据 | NA | NA | 单细胞Hi-C | NA | NA |
| 6289 | 2025-10-06 |
SPP1+ tumor-associated macrophages define a high-risk subgroup and inform personalized therapy in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1606195
PMID:40666097
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk RNA-seq数据,建立了基于SPP1和FOLR2特征的肝细胞癌TAMs新型分类系统 | 超越传统的M1/M2范式重新定义TAMs异质性,将TAMs轨迹基因与HCC患者分层联系起来 | TAMs的临床和治疗意义仍需进一步探索 | 探索肝细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞的临床和治疗意义 | 肝细胞癌患者和肿瘤相关巨噬细胞 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq,轨迹分析,多重免疫荧光 | 无监督聚类 | RNA测序数据,基因表达数据 | 大规模单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6290 | 2025-10-06 |
Integration of single-cell RNA and bulk RNA sequencing revealed malignant ductal cell heterogeneity and prognosis signatures in pancreatic cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1579184
PMID:40666516
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序揭示胰腺癌中恶性导管细胞的异质性及其预后标志物 | 首次通过整合单细胞和bulk RNA测序识别出ANLN、NT5E和CTSV作为胰腺癌新型预后生物标志物,并揭示恶性导管细胞与巨噬细胞之间的促肿瘤相互作用机制 | 样本量相对有限(74个单细胞RNA测序样本),需要在更大队列中进一步验证 | 探索胰腺癌中恶性导管细胞的异质性并鉴定预后相关基因标志物 | 胰腺癌患者样本中的恶性导管细胞和肿瘤微环境细胞 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,染色体拷贝数变异分析,非负矩阵分解,机器学习特征选择 | 非负矩阵分解,机器学习特征选择算法 | 单细胞RNA测序数据,bulk RNA测序数据 | 74个单细胞RNA测序样本,TCGA数据集和两个独立验证队列 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 6291 | 2025-10-06 |
Identification and validation of genes related to stem cells and telomere maintenance mechanisms as biomarkers for breast cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1618193
PMID:40666524
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研究论文 | 通过整合转录组和单细胞RNA测序分析,鉴定并验证与干细胞和端粒维持机制相关的乳腺癌生物标志物 | 首次整合转录组和单细胞RNA测序分析干细胞相关基因和端粒维持机制相关基因在乳腺癌中的作用,并识别关键细胞亚群 | 样本量较小(8对样本),需要更大规模研究验证 | 探索干细胞相关基因和端粒维持机制相关基因作为乳腺癌生物标志物的潜力 | 乳腺癌肿瘤组织和配对癌旁正常组织 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, RT-qPCR, LASSO算法, PPI网络分析 | LASSO | RNA测序数据, 单细胞数据 | 8对乳腺癌肿瘤和癌旁组织(共16个样本) | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 6292 | 2025-10-06 |
Thymic hyperplasia in myasthenia gravis: a narrative review
2025, Mediastinum (Hong Kong, China)
DOI:10.21037/med-25-12
PMID:40666538
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综述 | 本文综述了早发型重症肌无力中胸腺滤泡增生的病理特征、免疫机制及研究进展 | 整合了单细胞和空间转录组学等新兴技术对胸腺增生机制的研究前景 | 基于文献综述,缺乏原始实验数据验证 | 探讨早发型重症肌无力中胸腺增生的病理机制和未来研究方向 | 乙酰胆碱受体抗体阳性重症肌无力患者的胸腺病理 | 病理学 | 重症肌无力 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 胸腺类器官模型 | NA | 文献数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6293 | 2025-10-06 |
Targeting KIT With Antibody-Drug Conjugates in Chromophobe Renal Cell Carcinoma
2025-Aug, Clinical genitourinary cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1016/j.clgc.2025.102359
PMID:40408838
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研究论文 | 本研究探讨了在染色质肾细胞癌中使用靶向KIT的抗体-药物偶联物的治疗潜力 | 首次发现KIT在染色质肾细胞癌中高表达,并证明靶向KIT的抗体-药物偶联物能有效抑制癌细胞活力 | 研究样本量有限,仅测试了5个细胞系,尚未进行临床试验 | 评估KIT作为染色质肾细胞癌治疗靶点的可行性 | 染色质肾细胞癌细胞系、转移性肿瘤标本、正常肾细胞 | 癌症研究 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序、Western blot分析、免疫组化染色 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据、细胞活力数据 | 15个转移性ChRCC标本、5个ChRCC细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6294 | 2025-10-06 |
SOX11 and GLIS2: Novel Biomarkers for Understanding the Progression of Oral Leukoplakia
2025-Aug, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.100872
PMID:40543136
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据,鉴定SOX11和GLIS2作为口腔白斑进展的新型生物标志物 | 首次发现SOX11和GLIS2作为口腔白斑特异性分子标志物,并揭示其通过调控上皮间质转化和血管生成影响疾病进展 | 样本量有限,需要更大规模研究验证生物标志物的临床应用价值 | 探索口腔白斑进展的分子机制并鉴定关键生物标志物 | 口腔白斑组织样本和TCGA数据库中的口腔鳞状细胞癌数据 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,免疫组织化学染色 | NA | 基因表达数据,生存数据,组织图像 | 患者口腔白斑组织样本和TCGA数据库OSCC样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 6295 | 2025-10-06 |
Decoding Cellular Landscapes: Unravelling Periodontitis and Periapical Periodontitis at the Single-Cell Frontier
2025-Aug, International dental journal
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.identj.2025.100851
PMID:40554261
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析牙周炎和根尖周炎在牙槽骨中的基因表达差异和细胞异质性 | 首次在单细胞水平系统比较牙周炎和根尖周炎的细胞异质性,识别了疾病特异性关键基因和关键细胞类型 | 研究依赖于公共数据库数据,样本来源和数量可能有限 | 阐明牙周炎和根尖周炎在牙槽骨中的关键基因表达差异和细胞异质性 | 牙周炎和根尖周炎患者的牙槽骨组织 | 单细胞生物学 | 牙周疾病 | 单细胞RNA测序,实时定量PCR | SingleR细胞注释 | 单细胞RNA测序数据 | 来自GEO数据库的两个数据集(GSE171213和GSE181688) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6296 | 2025-10-06 |
Integrated Analyses to Identify the Roles of GPX1 in Frailty and Hypertension
2025-Aug, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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研究论文 | 通过整合分析鉴定GPX1在衰弱和高血压中的作用 | 首次采用双样本孟德尔随机化分析评估2532个可成药基因对衰弱和高血压的因果效应,并通过单细胞RNA测序验证GPX1的作用机制 | 研究主要基于遗传学分析,需要进一步实验验证GPX1的具体作用机制 | 识别衰弱和高血压的有效治疗靶点 | 老年人群体中的衰弱和高血压疾病 | 生物信息学 | 老年疾病 | 双样本孟德尔随机化分析,RNA表达谱分析,单细胞RNA测序,中介孟德尔随机化分析,分子对接 | 孟德尔随机化模型 | 遗传数据,RNA表达数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6297 | 2025-10-06 |
An unbiased genomewide screen uncovers 7 genes that drive hematopoietic stem cell fate from mouse embryonic stem cells
2025-Jul-17, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024027742
PMID:40209065
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研究论文 | 通过全基因组CRISPR激活筛选发现7个驱动小鼠胚胎干细胞向造血干细胞分化的关键基因 | 首次采用无偏见的全基因组CRISPR激活筛选方法,在胚胎干细胞中胚层分化阶段鉴定出7个能够诱导造血干细胞生成的新基因 | 研究仅限于小鼠胚胎干细胞模型,尚未在人类细胞中验证 | 探索调控造血干细胞体外生成的分子机制 | 小鼠胚胎干细胞及其分化产生的造血干细胞和祖细胞 | 干细胞生物学 | 血液系统疾病 | CRISPR激活筛选、单细胞RNA测序、胚胎体分化 | NA | 基因表达数据、移植实验数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6298 | 2025-10-06 |
Systemic administration of an RNA binding and cell-penetrating antibody targets therapeutic RNA to multiple mouse models of cancer
2025-Jul-16, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adk1868
PMID:40668891
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研究论文 | 开发了一种肿瘤靶向、细胞穿透和RNA结合的单克隆抗体TMAB3,能够形成稳定的抗体/RNA复合物,实现RNA在多种癌症模型中的特异性递送 | 首次报道了能够同时结合RNA、穿透细胞并靶向肿瘤的抗体平台,实现了RNA在肿瘤细胞中的特异性递送 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人体中进行验证 | 开发能够特异性递送治疗性RNA到肿瘤细胞的抗体平台 | 胰腺癌、髓母细胞瘤和黑色素瘤的小鼠模型 | 癌症治疗 | 胰腺癌,髓母细胞瘤,黑色素瘤 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | RNA测序数据,流式细胞数据 | 多种小鼠癌症模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6299 | 2025-10-06 |
A Machine Learning-Based Strategy Predicts Selective and Synergistic Drug Combinations for Relapsed Acute Myeloid Leukemia
2025-Jul-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-3840
PMID:40354625
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研究论文 | 开发基于机器学习的策略预测复发急性髓系白血病的个性化和协同药物组合 | 利用单细胞转录组学和单药反应谱通过机器学习预测个性化药物组合,针对治疗耐药白血病细胞 | 初步实验阶段,需要更多临床验证 | 改善复发/难治性急性髓系白血病患者的治疗结果 | 急性髓系白血病患者样本 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | 单细胞转录组学,药物反应分析 | 机器学习 | 基因表达数据,药物反应数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6300 | 2025-10-06 |
Blocking calcium-MYC regulatory axis inhibits early dedifferentiation of chondrocytes and contributes to cartilage regeneration
2025-Jul-15, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04483-3
PMID:40660304
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示了软骨细胞早期去分化的钙-MYC调控轴机制,并提出抑制钙信号可促进软骨再生 | 首次发现钙内流通过下调MYC表达导致SOX5/SOX6水平降低,从而驱动软骨细胞早期去分化,为优化软骨再生系统提供了新策略 | 研究主要基于体外扩增的耳廓软骨细胞,尚未在体内模型或临床样本中验证 | 阐明软骨细胞去分化的分子机制并探索促进软骨再生的新方法 | 体外扩增的耳廓软骨细胞 | 组织工程 | 软骨缺损 | 单细胞测序, 转座酶可及染色质测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, 染色质可及性数据 | 不同传代次数的软骨细胞(P3和P6) | NA | 单细胞RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |