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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6221 | 2025-10-06 |
Medulloblastoma: biology and immunotherapy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1602930
PMID:40677711
|
综述 | 本文综述了髓母细胞瘤的生物学特征及免疫治疗最新进展 | 整合单细胞转录组学对髓母细胞瘤亚型的新发现,系统探讨肿瘤微环境与免疫治疗的关联机制 | NA | 探讨髓母细胞瘤生物学特性与免疫治疗策略的协同应用 | 髓母细胞瘤及其肿瘤微环境组分 | NA | 髓母细胞瘤 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 6222 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomic analysis of 4NQO-induced tongue cancer revealed cellular lineage diversity and evolutionary trajectory
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1592044
PMID:40678065
|
研究论文 | 通过空间转录组学分析4NQO诱导的舌癌,揭示细胞谱系多样性和进化轨迹 | 首次结合人工智能算法和空间转录组学技术系统描绘4NQO诱导舌癌的空间时间演化过程,识别出13个细胞亚群和肿瘤侵袭相关开关基因 | 基于化学诱导的舌癌模型,与人类自发舌癌可能存在差异 | 阐明化学诱导舌癌的细胞谱系多样性和肿瘤进化轨迹 | 4NQO诱导的舌癌组织 | 空间转录组学 | 舌癌 | 空间转录组测序, AI算法 | AI分类器 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6223 | 2025-10-06 |
FN1 from cancer-associated fibroblasts orchestrates pancreatic cancer metastasis via integrin-PI3K/AKT signaling
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1595523
PMID:40678072
|
研究论文 | 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞中FN1通过整合素-PI3K/AKT信号轴驱动胰腺癌转移的分子机制 | 首次发现FN1在转移性CAF亚群中高表达,并通过整合素受体激活PI3K/AKT通路,同时证明其双重作用:直接促进肿瘤侵袭和间接形成免疫抑制微环境 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析,缺乏体内动物模型验证 | 阐明癌症相关成纤维细胞在胰腺导管腺癌转移中的具体分子机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)、癌症相关成纤维细胞(CAFs) | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 转录组测序、单细胞测序、Western blotting、qRT-PCR、Transwell迁移实验 | NA | 基因表达数据、单细胞数据、临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、转录组测序 | NA | NA |
| 6224 | 2025-10-06 |
Cooling Blood and Detoxicating Formula Treats Psoriasis Through RHCG-Related Mechanisms
2025, International journal of genomics
IF:2.6Q2
DOI:10.1155/ijog/5132158
PMID:40678620
|
研究论文 | 本研究探讨凉血解毒方通过RHCG相关机制治疗银屑病的潜力 | 首次结合网络药理学、单细胞RNA测序和空间转录组学技术系统揭示凉血解毒方治疗银屑病的作用机制,并发现RHCG是关键作用靶点 | 需要进一步的临床验证和机制研究 | 探索凉血解毒方治疗银屑病的治疗潜力和作用机制 | 银屑病实验模型 | 生物医学 | 银屑病 | 网络药理学,单细胞RNA测序,空间转录组学,分子对接 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 6225 | 2025-10-06 |
Evaluating transcriptional tumour microenvironment response to immunotherapy using microarray analysis: From harvesting tumours to data analysis
2025, Methods in cell biology
DOI:10.1016/bs.mcb.2025.01.004
PMID:40683680
|
研究论文 | 本文介绍了一种使用微阵列转录组分析评估肿瘤对免疫治疗反应的实验方案 | 提供了一种在不需要单细胞RNA测序详细程度的情况下,经济有效地评估肿瘤微环境对免疫治疗转录反应的方法 | 该方法分辨率低于单细胞RNA测序,仅适用于研究广泛的转录反应 | 评估肿瘤微环境对免疫治疗的转录反应 | 肿瘤组织和肿瘤微环境 | 生物信息学 | 肿瘤 | 微阵列转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 微阵列分析 | NA | NA |
| 6226 | 2025-10-06 |
Guidelines for the assessment of high endothelial venule functionality and health
2025, Methods in cell biology
DOI:10.1016/bs.mcb.2025.02.001
PMID:40683671
|
指南 | 本文开发了评估高内皮微静脉在应激条件下功能状态的操作指南 | 首次建立了系统性评估HEV在炎症和淋巴结转移等应激条件下功能变化的标准化方法 | 未提及具体验证数据或临床应用范围 | 建立高内皮微静脉功能评估的共识指南 | 高内皮微静脉 | 病理学 | 炎症性疾病 | 免疫荧光染色,单细胞RNA测序 | NA | 蛋白质表达数据,RNA表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6227 | 2025-10-06 |
Secretory IgA dysfunction underlies poor prognosis in Fusobacterium-infected colorectal cancer
2025-Dec, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2528428
PMID:40667611
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了具核梭杆菌通过破坏IgA浆细胞发育和分泌型IgA产生导致结直肠癌预后不良的机制 | 首次发现具核梭杆菌通过破坏肿瘤相关巨噬细胞与IgA浆细胞间的通讯,损害黏膜免疫并增加细菌浸润 | 样本量相对有限(42例患者),且动物模型结果向人类临床转化的有效性需进一步验证 | 探究具核梭杆菌感染导致结直肠癌预后不良的免疫机制 | 结直肠癌患者组织样本和无菌小鼠模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 42例结直肠癌患者组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6228 | 2025-10-06 |
Thymic Microenvironment Remodeling in Cancer Cachexia as a Determinant of Checkpoint Inhibitor Efficacy and Toxicity
2025-Aug, Journal of cachexia, sarcopenia and muscle
DOI:10.1002/jcsm.13874
PMID:40665793
|
研究论文 | 本研究探讨癌症恶病质通过破坏胸腺微环境影响T细胞阴性选择,进而调节免疫检查点抑制剂疗效与毒性的机制 | 首次揭示癌症恶病质通过胸腺髓质成纤维细胞成熟障碍导致T细胞阴性选择受损,并发现血清自身抗体水平与ICI疗效的临床关联 | 研究主要基于小鼠模型,临床样本量有限,需要更大规模验证 | 探究癌症恶病质对胸腺退化的影响及其与免疫检查点抑制剂治疗的关联 | 肝癌恶病质小鼠模型和接受抗PD-1/L1抗体治疗的晚期癌症患者 | 免疫学 | 肝癌 | 单细胞测序, 免疫荧光, 流式细胞术, 单细胞TCR测序, 共培养实验 | 原位肝癌小鼠模型 | 单细胞测序数据, 流式细胞数据, 临床随访数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 | NA | NA |
| 6229 | 2025-10-06 |
ECM1 expression in chronic liver disease: Regulation by EGF/STAT1 and IFNγ/NRF2 signalling
2025-Aug, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2025.101423
PMID:40671832
|
研究论文 | 本研究揭示了ECM1在慢性肝病中的调控机制,发现EGF/STAT1信号维持ECM1表达而IFNγ/NRF2信号抑制其表达 | 首次阐明EGF/EGFR/STAT1信号通路通过STAT1 S727磷酸化维持ECM1表达,以及IFNγ通过诱导STAT1 Y701磷酸化和NRF2核转位抑制ECM1的双重调控机制 | 样本量相对有限(小鼠模型2-6只,患者22例),需要更大规模研究验证 | 探究肝细胞中ECM1在病理生理条件下的调控机制 | AML12细胞、小鼠和人类原代肝细胞、小鼠和患者肝组织 | 分子生物学 | 慢性肝病 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, 启动子分析, 功能测定 | NA | 基因表达数据, 测序数据 | 小鼠模型2-6只,Western饮食喂养小鼠8-10只,慢性肝病患者22例 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6230 | 2025-10-06 |
Rod-shaped microglia represent a morphologically distinct subpopulation of disease-associated microglia
2025-Jul-16, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03504-5
PMID:40671004
|
研究论文 | 本研究在小鼠模型中鉴定了一种形态独特的杆状小胶质细胞亚群,并探讨其形成机制 | 首次发现杆状小胶质细胞是神经退行性疾病早期出现的独特活化亚群,其形成不依赖C1q介导的突触修剪机制 | 研究仅基于GCLC缺陷小鼠模型,尚未在其他神经退行性疾病模型中验证 | 探究小胶质细胞形态变化与基因表达谱的关联机制 | 谷胱甘肽缺陷诱导氧化应激的GCLC缺陷小鼠模型中的小胶质细胞 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单核RNA测序, 通路富集分析, 分子分析 | NA | 基因表达数据, 形态学数据 | GCLC缺陷小鼠皮质组织 | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 6231 | 2025-10-06 |
Campylobacter jejuni regulates cell cycle progression to potentiate host cell invasion
2025-Jul-16, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02348-z
PMID:40671100
|
研究论文 | 本研究揭示了空肠弯曲菌通过调节宿主细胞周期进程来增强细胞入侵能力 | 首次发现空肠弯曲菌通过调控宿主细胞G1期来促进细菌入侵和炎症反应 | 研究主要使用INT 407细胞系,未在体内模型或原代细胞中验证 | 探究空肠弯曲菌如何通过调控宿主细胞周期来增强其致病性 | 空肠弯曲菌感染的INT 407人上皮细胞 | 细胞生物学 | 肠道感染 | 流式细胞术,单细胞RNA测序,RT-qPCR,共聚焦显微镜,ELISA | NA | 基因表达数据,细胞图像,细胞周期数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6232 | 2025-10-06 |
Vagal Stimulation Rescues HFpEF by Altering Cardiac Resident Macrophage Function
2025-Jul-15, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.125.326236
PMID:40662221
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了经皮迷走神经刺激通过调节心脏驻留巨噬细胞功能改善射血分数保留型心衰的机制 | 首次发现tVNS通过改变心脏驻留巨噬细胞亚群的功能(减少CCR2+巨噬细胞及其Spp1表达,同时诱导TLF+/MHC2+巨噬细胞表达Igf1)来改善HFpEF | 研究基于小鼠模型,需要在人类患者中进一步验证 | 探究迷走神经刺激改善HFpEF的心脏驻留巨噬细胞机制 | HFpEF小鼠模型 | 心血管研究 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,超声心动图 | NA | 基因表达数据,心脏功能数据 | 对照组、HFpEF+假刺激组、HFpEF+tVNS组小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6233 | 2025-10-06 |
Tumor-intrinsic ENO1 inhibition promotes antitumor immune response and facilitates the efficacy of anti-PD-L1 immunotherapy in bladder cancer
2025-Jul-15, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03464-x
PMID:40665335
|
研究论文 | 本研究通过CRISPR筛选和RNA测序发现ENO1是膀胱癌抗PD-L1免疫治疗疗效的关键调控因子 | 首次发现ENO1通过SPPO-ITGA4/ITGB1通路调控CD8 T细胞功能和肿瘤相关巨噬细胞极化,揭示了肿瘤内在ENO1在免疫逃避中的新机制 | 研究主要聚焦于膀胱癌,其他癌症类型中的适用性需要进一步验证 | 探索膀胱癌免疫治疗耐药机制并寻找新的治疗靶点 | 膀胱癌样本和肿瘤微环境中的免疫细胞 | 癌症免疫学 | 膀胱癌 | CRISPR-Cas9筛选, RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 临床膀胱癌样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 6234 | 2025-10-06 |
Integration of scRNA-seq and ST-seq identifies hyperproliferative RRM2+ cells features and therapeutic targets in gastric cancer
2025-Jul-15, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06847-y
PMID:40665360
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和空间转录组测序技术,识别胃癌中过度增殖的RRM2+细胞特征并发现治疗靶点 | 首次结合scRNA-seq和ST-seq技术系统解析胃癌中过度增殖细胞的表型可塑性,发现RRM2过表达的关键作用并验证其抑制剂奥沙利胺的抗肿瘤效果 | 样本量相对有限(40个scRNA-seq样本和6个ST样本),需要更大规模研究验证 | 探究胃癌中过度增殖细胞的特征及其在肿瘤进展中的作用机制 | 人类胃组织样本,涵盖肿瘤进展不同阶段 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 40个scRNA-seq样本和6个ST样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6235 | 2025-10-06 |
Paradigms, innovations, and biological applications of RNA velocity: a comprehensive review
2025-Jul-02, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf339
PMID:40668554
|
综述 | 本文对RNA速度的计算方法、创新应用和生物学意义进行了系统性综述 | 首次将RNA速度模型系统分类为稳态方法、轨迹方法和状态外推方法,并全面比较了各类方法的假设前提和计算策略 | 模型假设存在局限性,预处理流程和可视化方法仍需优化 | 梳理RNA速度领域的发展现状,为动态转录组研究提供实施指南 | RNA速度计算方法及其在生物学研究中的应用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | Velocyto, scVelo等RNA速度模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 6236 | 2025-10-06 |
Cardiac fibroblasts regulate myocardium and coronary vasculature development in the murine heart via the collagen signaling pathway
2025-Jul-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.102305
PMID:40591485
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和细胞消融技术揭示了心脏成纤维细胞通过胶原信号通路调控心肌和冠状动脉血管发育的机制 | 首次系统阐明心脏成纤维细胞通过胶原信号通路直接调控心肌细胞和血管内皮细胞发育的时空动态关系 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类心脏发育中验证;长期消融后的代偿机制仍需进一步研究 | 探究心脏发育过程中成纤维细胞对心肌和血管发育的调控作用 | 小鼠心脏发育过程中的成纤维细胞、心肌细胞和血管内皮细胞 | 发育生物学 | 心脏发育缺陷 | 单细胞mRNA测序、RNA染色、白喉毒素A消融系统 | NA | 单细胞RNA测序数据、组织染色图像 | 不同发育阶段的小鼠心脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6237 | 2025-10-06 |
Multi-Omics Analysis and Real-World Data Validation of Serine Metabolism-Related Genes in Colorectal Cancer
2025-Jul, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70721
PMID:40660426
|
研究论文 | 通过多组学分析和真实世界数据验证,研究丝氨酸代谢相关基因在结直肠癌中的作用 | 首次对丝氨酸代谢相关基因进行泛癌分析,并在结直肠癌中深入探索其表达模式、预后意义及与肿瘤微环境的关联 | 研究主要基于公共数据库和回顾性队列,需要进一步前瞻性研究验证 | 阐明丝氨酸代谢相关基因在结直肠癌中的表达模式、遗传改变和临床意义 | 结直肠癌患者组织和细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 转录组学、基因组学、表观遗传学、单细胞RNA测序、免疫组化 | NA | 基因表达数据、临床数据、单细胞测序数据 | TCGA和GTEx数据库中的泛癌数据,两个独立的结直肠癌真实世界队列 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6238 | 2025-10-06 |
Bayesian inference of fitness landscapes via tree-structured branching processes
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf193
PMID:40662787
|
研究论文 | 提出了一种基于树结构分支过程的贝叶斯推理方法FiTree,用于从单细胞肿瘤突变树中学习适应性景观 | 将表型适应性参数化与贝叶斯推理方案结合,统一了癌症进展的概率图模型与群体遗传学 | 未明确说明模型的计算复杂度或在大规模数据集上的可扩展性限制 | 推断肿瘤进化中的适应性景观,理解突变间的表型相互作用 | 单细胞肿瘤突变树和急性髓系白血病数据集 | 计算生物学 | 急性髓系白血病 | 单细胞测序 | 树结构多类型分支过程模型,贝叶斯推理 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6239 | 2025-10-06 |
Fast and scalable Wasserstein-1 neural optimal transport solver for single-cell perturbation prediction
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf253
PMID:40662778
|
研究论文 | 提出一种基于Wasserstein-1的快速可扩展神经最优传输求解器,用于单细胞扰动预测 | 采用Wasserstein-1对偶公式简化优化过程,避免了复杂的极小极大优化问题,并通过对抗训练恢复传输映射 | W1对偶仅揭示传输方向,不直接提供唯一最优传输映射,需要额外步骤确定传输步长 | 开发快速可扩展的最优传输求解器用于单细胞扰动响应预测 | 单细胞扰动数据分布映射 | 机器学习 | NA | 最优传输理论,对抗训练 | 神经网络 | 单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6240 | 2025-10-06 |
Incorporating hierarchical information into multiple instance learning for patient phenotype prediction with single-cell RNA-sequencing data
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf241
PMID:40662783
|
研究论文 | 提出一种将层次信息整合到基于注意力的多示例学习框架中的新方法,用于单细胞RNA测序数据的患者表型预测 | 在基于注意力的多示例学习框架中同时考虑细胞和细胞类型的层次结构信息 | NA | 提高单细胞RNA测序数据患者表型预测的性能和可解释性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞和细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 基于注意力的多示例学习 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |