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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6181 | 2025-10-06 |
Persistent dopamine-dependent remodeling of the neural transcriptome in response to pregnancy and postpartum
2025-Jun-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.20.639313
PMID:40060435
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研究论文 | 本研究通过全脑转录组分析揭示了怀孕和产后经历通过多巴胺依赖的转录机制诱导持久神经适应的分子机制 | 首次确定多巴胺是调控怀孕和产后神经适应的核心调节因子,发现H3多巴胺化这一新型组蛋白修饰在介导神经可塑性中的关键作用 | 研究主要聚焦于海马背侧形成区,其他脑区的适应性变化可能未被完全探索 | 阐明怀孕和产后经历诱导持久神经适应的分子机制 | 小鼠和人类的海马背侧形成区,特别是背侧下托 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序,全脑转录组分析,化学遗传学 | NA | 转录组数据,表观基因组数据,行为数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6182 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis revealed critical causative candidates for down syndrome-related lung diseases
2025-May-30, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2025.05.009
PMID:40451386
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示唐氏综合征相关肺部疾病的关键致病候选因子 | 首次使用Dp16小鼠模型结合单细胞转录组技术系统研究21号染色体三体对肺部疾病的影响机制 | 研究主要基于小鼠模型,需要进一步在人类样本中验证 | 探索21号染色体三体导致唐氏综合征相关肺部疾病的分子机制 | Dp16小鼠模型(携带人类21号染色体同源区域片段重复) | 单细胞生物学 | 唐氏综合征相关肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | Dp16小鼠和对照小鼠的肺组织细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6183 | 2025-10-06 |
A visual-omics foundation model to bridge histopathology image with transcriptomics
2025-Apr-16, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5183775/v1
PMID:40321764
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研究论文 | 开发了一个名为OmiCLIP的视觉-组学基础模型,用于连接组织病理学图像与转录组学数据 | 首次提出将转录组数据转化为“句子”形式,并开发了整合组织学图像与转录组学的视觉-组学基础模型 | NA | 开发能够整合组织病理学图像与转录组学数据的计算方法 | 组织切片图像和转录组学数据 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 基础模型 | 图像, 文本 | 220万对组织图像和转录组数据,涵盖32个器官 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium空间转录组数据 |
| 6184 | 2025-10-06 |
Parenchymal and inflammatory responses to ozone exposure in the aging healthy and surfactant protein C mutant lung
2025-Mar-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00261.2024
PMID:39832482
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研究论文 | 本研究探讨臭氧暴露对年轻、中年和老年小鼠肺组织的结构和免疫反应影响,特别关注表面活性蛋白C突变的影响 | 首次结合年龄因素和SP-C基因突变,利用空间转录组学分析臭氧暴露对肺组织的区域特异性影响 | 研究仅使用小鼠模型,结果向人类外推需谨慎;仅考察了急性暴露效应,缺乏长期暴露数据 | 理解臭氧暴露在老年和遗传易感群体中加剧肺损伤的机制 | 年轻(8-14周)、中年(44-52周)和老年(>80周)小鼠,包括野生型和SP-C突变型 | 呼吸毒理学 | 呼吸系统疾病 | 流式细胞术, 空间转录组学 | 动物模型 | 图像, 转录组数据, 流式细胞数据 | 多年龄段小鼠群体(具体数量未明确) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 6185 | 2025-10-06 |
Effects of maternal edible THC consumption on offspring lung growth and function in a rhesus macaque model
2025-Mar-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
DOI:10.1152/ajplung.00360.2024
PMID:39903192
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研究论文 | 本研究通过恒河猴模型探讨母体食用THC对后代肺发育和功能的影响 | 首次在灵长类动物模型中系统评估产前食用THC对后代肺发育的长期影响,并整合影像学、肺功能测试和多组学分析 | 样本量有限,仅使用恒河猴模型,结果外推到人类需谨慎 | 确定子宫内THC暴露是否对后代肺发育和功能产生有害影响 | 怀孕恒河猴及其后代婴儿 | NA | NA | 磁共振成像, 肺功能测试, 批量RNA测序, 全基因组亚硫酸氢盐测序, 空间RNA测序 | NA | 影像数据, 生理功能数据, 分子数据 | 怀孕恒河猴及其后代婴儿 | NA | 批量RNA测序, 全基因组亚硫酸氢盐测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6186 | 2025-10-06 |
SeuratExtend: streamlining single-cell RNA-seq analysis through an integrated and intuitive framework
2025-Jan-06, GigaScience
IF:11.8Q1
DOI:10.1093/gigascience/giaf076
PMID:40627366
|
研究论文 | 介绍SeuratExtend——一个基于Seurat框架构建的综合性R软件包,通过整合关键工具和数据库来简化单细胞RNA测序数据分析 | 在广泛采用的Seurat框架基础上构建,通过统一R接口整合多种Python工具和数据库,提供优化的可视化功能和精心设计的配色方案 | NA | 开发一个集成化、直观的单细胞RNA测序数据分析框架 | 单细胞RNA测序数据分析工具和数据库 | 生物信息学 | 肿瘤相关疾病,自身炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6187 | 2025-10-06 |
Molecular insights into glioblastoma progression: role of CHCHD2P9 in tumor heterogeneity and prognosis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1581850
PMID:40630954
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现CHCHD2P9是胶质母细胞瘤终末亚群的关键标志物,其高表达与不良预后相关 | 首次发现CHCHD2P9在胶质瘤进展中的关键作用,并建立基于CHCHD2P9的风险预后模型 | 未明确说明样本具体数量,机制研究可能不够深入 | 探究胶质母细胞瘤异质性及预后相关分子机制 | 胶质母细胞瘤亚群细胞 | 数字病理学 | 脑癌/胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 细胞实验, 流式细胞术 | 风险预后模型 | 单细胞RNA测序数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6188 | 2025-10-06 |
Immunogenic cell death-related biomarkers in heart failure probed by transcriptome and single-cell sequencing
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1560903
PMID:40630963
|
研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞测序识别并验证了心力衰竭中三个免疫原性细胞死亡相关生物标志物 | 首次系统识别并验证了心力衰竭中CD163、FPR1和VSIG4这三个免疫原性细胞死亡相关生物标志物 | 研究主要基于公共数据库数据,需要更多实验验证 | 识别心力衰竭中免疫原性细胞死亡相关生物标志物并探索其机制 | 心力衰竭患者和动物模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 实时定量PCR | 机器学习, 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE57338、GSE3586、GSE5406、GSE183852) | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 6189 | 2025-10-06 |
Taurine-mediated metabolic immune crosstalk indicates and promotes immunosuppression with anti-PD-1 resistance in bladder cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1618439
PMID:40630945
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和批量转录组分析,揭示了膀胱癌中牛磺酸代谢失调如何重塑肿瘤微环境并驱动免疫抑制 | 开发了牛磺酸代谢失调指数(TMs)作为预后生物标志物,揭示了牛磺酸代谢通过Notch信号和EGFR通路促进免疫抑制的新机制 | 研究主要基于计算分析和体外共培养验证,需要进一步的体内实验验证 | 阐明牛磺酸代谢在膀胱癌免疫抑制中的作用机制,为免疫治疗提供新靶点 | 膀胱癌患者样本和肿瘤微环境中的各类细胞 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量转录组分析, 共培养系统 | 机器学习, 生存模型 | 基因表达数据, 单细胞数据, 空间转录组数据 | TCGA队列患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 6190 | 2025-10-06 |
Gut microbial Nordihydroguaiaretic acid suppresses macrophage pyroptosis to regulate epithelial homeostasis and inflammation
2025-Dec, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2518338
PMID:40596758
|
研究论文 | 本研究揭示肠道微生物代谢产物NDGA通过抑制巨噬细胞焦亡调节肠道上皮稳态和炎症的机制 | 首次发现衰老相关肠道菌群失调导致NDGA减少,并通过GSDMD/NR4A1/NLRP3轴调控巨噬细胞焦亡影响结肠炎易感性 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;机制研究尚未完全阐明NDGA的具体作用靶点 | 探究衰老相关肠道菌群失调在炎症性肠病恶化中的作用机制 | 野生型和IL-10缺陷小鼠、IBD患者和老年人粪便样本 | 免疫学 | 炎症性肠病 | 粪便微生物移植、16S rDNA测序、代谢组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因测序数据、代谢物数据、单细胞转录组数据 | 小鼠模型和人类粪便样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, 16S rDNA测序 | NA | NA |
| 6191 | 2025-10-06 |
RETRACTION: Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Intratumoral Heterogeneity in Lung Adenocarcinoma
2025-Aug, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24531
PMID:40346999
|
撤稿声明 | 因同行评审过程存在问题而撤回已发表的单细胞转录组分析研究论文 | NA | NA | NA | NA | NA | 肺腺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6192 | 2025-10-06 |
Tracing Early Migratory Neurons in the Developing Nose Using Contactin-2 (Cntn2) CreERT2
2025-Aug, Genesis (New York, N.Y. : 2000)
DOI:10.1002/dvg.70021
PMID:40580015
|
研究论文 | 本研究通过构建Cntn2CreERT2诱导性小鼠品系,追踪发育过程中鼻子区域的早期迁移神经元 | 开发了新型的Cntn2CreERT2诱导性小鼠品系,首次实现对嗅觉系统早期迁移神经元的时间可控性追踪和操作 | 研究主要聚焦于啮齿类动物模型,结果向其他物种的推广性需要进一步验证 | 研究胚胎发育过程中嗅觉系统神经元的迁移机制 | 啮齿类动物发育过程中鼻子区域的早期迁移神经元,特别是终末神经神经元 | 发育神经生物学 | NA | 单细胞RNA测序,遗传谱系追踪,Cre-loxP系统 | NA | 基因表达数据,组织学图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6193 | 2025-10-06 |
Cellular heterogeneity and patterning strategies as revealed by upper respiratory epithelium single cell atlas
2025-Jul-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112845
PMID:40612507
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序结合空间验证构建了小鼠上呼吸道上皮细胞图谱 | 首次结合单细胞RNA测序与空间验证揭示上呼吸道上皮细胞的18种类型及其三维空间分布模式 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 解析上呼吸道上皮细胞的异质性和空间分布模式 | 小鼠上呼吸道上皮细胞 | 单细胞生物学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序,空间转录组验证 | NA | 单细胞转录组数据,空间分布数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6194 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Highlights a Contribution of Human Amniotic Mesenchymal Stem Cells-Derived Exosomes to Androgenetic Alopecia
2025-Jul-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500853R
PMID:40622121
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示人羊膜间充质干细胞外泌体通过Wnt/β-catenin信号通路促进雄激素性脱发模型小鼠毛发生长的分子机制 | 首次在单细胞水平解析hAMSC-exo促进毛发生长的细胞图谱和分子机制,发现其通过增强毛囊细胞与真皮乳头细胞间的通讯并改善线粒体功能 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人体验证;机制研究主要聚焦Wnt/β-catenin通路,可能存在其他未探索的调控途径 | 探索人羊膜间充质干细胞外泌体对雄激素性脱发的治疗作用及分子机制 | 雄激素性脱发模型小鼠的背部皮肤组织 | 单细胞组学 | 雄激素性脱发 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6195 | 2025-10-06 |
Impact of IKCa Channels on CD34+ Cells in Arteriole Remodeling in Angiotensin II-Induced Hypertension Model Mice
2025-Jul-09, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
|
研究论文 | 本研究探讨了IKCa通道在Ang II诱导的高血压模型中CD34+细胞介导的动脉内皮修复作用 | 首次揭示非骨髓来源的CD34+细胞通过IKCa通道调控ERK/P38信号通路参与高血压血管修复的新机制 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人体中验证 | 阐明高血压条件下内皮修复的细胞分子机制 | CD34+细胞在Ang II诱导的高血压小鼠动脉重塑中的作用 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,transwell迁移实验,膜片钳技术,骨髓移植 | NA | 基因表达数据,图像数据,电生理数据 | Ang II处理的高血压模型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6196 | 2025-10-06 |
Proneural-Mesenchymal hybrid glioblastoma cells are resistant to therapy and dependent on nuclear import
2025-Jul-08, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf160
PMID:40627673
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研究论文 | 本研究揭示了胶质母细胞瘤中同时表达前神经和间充质标记的混合细胞亚群对常规疗法具有耐药性 | 首次发现并表征了胶质母细胞瘤中前神经-间充质混合细胞亚群,揭示了其通过核质转运机制介导治疗抵抗的新机制 | 研究主要基于患者来源的细胞系和动物模型,临床转化价值仍需进一步验证 | 探索胶质母细胞瘤细胞可塑性及其治疗抵抗的分子机制 | 胶质母细胞瘤细胞,特别是前神经-间充质混合细胞亚群 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 单细胞ChIP测序, 核蛋白质组学, 高分辨率成像, 正交小鼠模型 | 动物模型, 细胞模型 | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 影像数据 | 多个患者来源的细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ChIP测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6197 | 2025-10-06 |
Peripheral immune imbalance in pediatric fulminant myocarditis revealed by single-cell sequencing and plasma proteomics
2025-Jul-08, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00343-5
PMID:40629105
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研究论文 | 通过单细胞测序和血浆蛋白质组学揭示儿童暴发性心肌炎的外周免疫失衡特征 | 首次系统描绘儿童暴发性心肌炎急性期和恢复期的外周免疫细胞图谱,发现多种独特细胞类型及CXCR4、S100A家族基因的广泛高表达 | 样本量有限,未明确验证IL-10和TGFB1在治疗中的具体作用机制 | 解析暴发性心肌炎的外周免疫病理机制 | 儿童暴发性心肌炎患者外周血单个核细胞和血浆样本 | 单细胞组学 | 心肌炎 | 单细胞RNA测序, TCR/BCR分析, 血浆蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据, TCR/BCR序列数据, 蛋白质组数据 | 儿童暴发性心肌炎患者急性期和恢复期样本 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 6198 | 2025-10-06 |
Opposite regulation of intestinal and intrahepatic CD8+ T cells controls alcohol-associated liver disease progression
2025-Jul-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-334412
PMID:40199574
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研究论文 | 本研究揭示了肠道和肝内CD8+ T细胞的相反调控在酒精性肝病进展中的关键作用 | 首次发现肠道和肝内CD8+ T细胞在酒精性肝病中呈现相反的变化趋势,并证明BCL2在调控这些细胞存活中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仍需扩大 | 探究肠道和肝内CD8+ T淋巴细胞在酒精性肝病中的调控机制及其贡献 | 酒精性肝病患者和野生型、CD8特异性Bcl2转基因及Cd8基因敲除小鼠 | 免疫学 | 酒精性肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、细胞功能数据 | 酒精性肝病患者和多种基因型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6199 | 2025-10-06 |
Regulation of revival stem cell differentiation by CREPT/RPRD1B during intestinal regeneration
2025-Jul-07, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-025-01434-6
PMID:40624542
|
研究论文 | 本研究揭示了CREPT/RPRD1B在肠道再生过程中调控复苏干细胞分化的机制 | 首次发现CREPT/RPRD1B蛋白在肠道再生过程中对复苏干细胞分化的关键调控作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性尚需进一步验证 | 探究肠道再生过程中复苏干细胞分化的调控机制 | 小鼠肠道复苏干细胞 | 干细胞生物学 | 肠道损伤修复 | 单细胞转录组分析,谱系追踪,基因敲除 | Villin-Cre介导的CREPT敲除小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据,组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6200 | 2025-10-06 |
Glioma promotes macrophage immunosuppressive phenotype through ANXA1 in a methionine metabolism-dependent manner
2025-Jul-06, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03112-y
PMID:40618309
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研究论文 | 本研究探讨了胶质瘤中甲硫氨酸代谢与肿瘤免疫抑制微环境的关系,发现胶质瘤通过ANXA1以甲硫氨酸代谢依赖的方式促进巨噬细胞免疫抑制表型 | 首次揭示胶质瘤细胞通过甲硫氨酸代谢上调ANXA1表达,促进巨噬细胞M2极化和免疫抑制微环境形成 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析,需要更多体内实验验证 | 探究甲硫氨酸代谢在胶质瘤免疫抑制微环境形成中的作用机制 | 胶质瘤患者队列、胶质瘤细胞、巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 体外实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 胶质瘤患者队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |