单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
6161	2025-04-25	The loss of dNK1/2 and EVT1 cells at the maternal-fetal interface is associated with recurrent miscarriage† 2025-Jan-14, Biology of reproduction IF:3.1Q2 DOI:10.1093/biolre/ioae136 PMID:39303127	研究论文	通过单细胞测序技术，研究发现复发性流产患者母胎界面中dNK1/2和EVT1细胞的缺失与疾病相关	发现了一个新的自然杀伤细胞亚群dNK1/2，并揭示了其在复发性流产中的缺失及其与EVT1细胞的相互作用机制	研究样本量未明确说明，且机制研究仍需进一步验证	探究复发性流产的细胞学特征和潜在机制	复发性流产患者和健康捐赠者的母胎界面组织	生殖医学	复发性流产	单细胞测序	NA	单细胞转录组数据	未明确说明
6162	2025-04-25	Single-Cell RNA-Seq Analysis of Hearts in Patients with Fetal Tetralogy of Fallot 2025, Cardiology IF:1.9Q3 DOI:10.1159/000540406 PMID:39097963	research paper	通过单细胞RNA测序分析胎儿法洛四联症患者心脏的细胞学特征和差异基因	首次在胎儿法洛四联症中应用单细胞RNA测序技术，识别出异常心肌细胞的六个不同细胞簇	样本量较小，仅包括一个健康胎儿心脏样本和一个TOF胎儿心脏样本	探索法洛四联症的细胞学特征和可能的疾病标志物差异基因	健康胎儿心脏和法洛四联症胎儿心脏的右心室样本	digital pathology	cardiovascular disease	single-cell RNA-seq	NA	RNA-seq data	2个样本（1个健康胎儿心脏和1个TOF胎儿心脏）
6163	2025-04-25	Identification of a Novel Activated NK-Associated Gene Score Associated with Diagnosis and Biological Therapy Response in Ulcerative Colitis 2025, Digestion IF:3.0Q2 DOI:10.1159/000540939 PMID:39182484	research paper	本研究建立了一个新型的激活NK相关基因（ANAG）评分，用于精确诊断溃疡性结肠炎（UC）并区分生物治疗的疗效	首次提出ANAG评分系统，用于UC的诊断和生物治疗反应的预测	研究样本来源有限，主要依赖公共数据库数据，未进行大规模临床验证	探究ANAG评分在UC诊断和生物治疗反应预测中的价值	溃疡性结肠炎患者组织和生物治疗反应数据	生物信息学	溃疡性结肠炎	RNA-seq, scRNA-seq, RT-qPCR, 免疫荧光	LASSO回归	基因表达数据	公共数据库中的bulk RNA-seq和scRNA-seq数据集，具体样本量未明确说明
6164	2025-04-25	CD14+ monocytes: the immune communication hub in early vasculitis symptoms of Kawasaki disease 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1557231 PMID:40207219	research paper	本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了川崎病（KD）血管炎早期免疫细胞通讯的动态变化，发现CD14+单核细胞在细胞间通讯中起核心作用	首次通过单细胞测序技术揭示CD14+单核细胞在KD血管炎早期免疫通讯中的核心作用，并鉴定出关键信号基因SELPLG和ITK	样本量较小（仅7例儿科患者），需要在更大队列中验证发现	研究川崎病病程中免疫细胞通讯的变化并寻找潜在生物标志物	川崎病患者的PBMCs（外周血单个核细胞）	免疫学	川崎病	scRNA-seq（单细胞RNA测序）	NA	单细胞转录组数据	7名川崎病儿科患者
6165	2025-04-25	Cancer-associated fibroblasts gene signature: a novel approach to survival prediction and immunotherapy guidance in colon cancer 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1532306 PMID:40264753	research paper	该研究通过单细胞测序分析识别结肠腺癌中成纤维细胞相关标记基因，开发了一个与成纤维细胞相关的基因特征，用于预测结肠腺癌患者的生存和指导免疫治疗	开发了一个包含11个CAFGs的预测特征，能够有效区分结肠腺癌患者的生存差异，并指导免疫治疗和化疗反应预测	研究依赖于RNA-seq和scRNA-seq数据，未涉及更多临床样本验证	研究结肠腺癌中癌症相关成纤维细胞（CAFs）的异质性，寻找生物标志物以预测生存和指导治疗	结肠腺癌患者和HCT116、HT29细胞系	digital pathology	colon cancer	single-cell sequencing analysis, bulk RNA-seq, scRNA-seq	NA	RNA-seq data	结肠腺癌患者队列和HCT116、HT29细胞系
6166	2025-04-25	Expression of innate immunity genes in human hematopoietic stem/progenitor cells - single cell RNA-seq analysis 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1515856 PMID:40264766	研究论文	通过单细胞RNA测序分析人类造血干细胞/祖细胞中先天免疫基因的表达	首次在单细胞分辨率下研究造血干细胞/祖细胞中complosome元素的表达，揭示了complosome作为造血新调节因子的作用	研究仅关注了特定基因的表达，未全面探索所有免疫相关基因的功能	探究人类造血干细胞/祖细胞中complosome系统元素及其他免疫相关蛋白的表达	人类造血干细胞/祖细胞（HSPCs），包括CD34+Lin-CD45+和CD133+Lin-CD45+两个群体	生物医学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	两个人类HSPC群体（CD34+Lin-CD45+和CD133+Lin-CD45+）及其亚群
6167	2025-04-25	Stimulation of regulatory dendritic cells suppresses cytotoxic T cell function and alleviates DEN-induced liver injury, fibrosis and hepatocellular carcinoma 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1565486 PMID:40264769	研究论文	研究通过口服激活TLR2的乳酸菌混合物刺激调节性树突状细胞，从而抑制细胞毒性T细胞功能，减轻DEN诱导的肝损伤、纤维化和肝细胞癌	首次证明通过口服特定乳酸菌混合物可以刺激调节性树突状细胞，进而抑制细胞毒性T细胞功能，减轻肝损伤和肿瘤发生	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体验证	探索调节性树突状细胞在肝损伤和肝细胞癌中的作用及其潜在治疗策略	野生型和TLR2敲除小鼠	免疫学	肝细胞癌	单细胞RNA测序、流式细胞术、组织学分析	小鼠模型	基因表达数据、单细胞转录组数据	野生型和TLR2敲除小鼠，具体数量未明确说明
6168	2025-04-25	Single-cell transcriptomic analysis identified resistant MDSCs and a stress-tolerant gene co-expression network as common MDSC features across multiple disease settings 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1565211 PMID:40264770	研究论文	通过单细胞转录组分析，鉴定了在多疾病环境中常见的耐药性MDSCs和耐压基因共表达网络	首次结合炎症信号和细胞压力（血清饥饿）诱导出具有保留MDSC特征的细胞群（rMDSCs），并鉴定出特定的基因共表达模块（黄色模块）	研究主要基于体外实验和已有数据集验证，缺乏更多体内实验的直接证据	鉴定MDSCs的共同分子特征，以帮助细胞分类	人源单核细胞性MDSCs（M-MDSCs）	单细胞转录组学	癌症	scRNA-seq	NA	单细胞RNA测序数据	GM-CSF+ IL-6诱导的人MDSCs及血清饥饿处理的PBMCs，外加已发表的批量及单细胞转录组数据集
6169	2025-04-25	Mapping immunotherapy potential: spatial transcriptomics in the unraveling of tumor-immune microenvironments in head and neck squamous cell carcinoma 2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1 DOI:10.3389/fimmu.2025.1568590 PMID:40264779	综述	本文综述了空间转录组学在头颈部鳞状细胞癌肿瘤-免疫微环境研究中的应用及其对免疫治疗的潜在影响	利用空间转录组学技术高分辨率解析肿瘤-免疫微环境的复杂组成和空间关系，为开发更有效的免疫治疗方法提供新视角	综述文章，未涉及具体实验数据验证	探索空间转录组学在头颈部鳞状细胞癌肿瘤-免疫微环境研究中的应用，以提高免疫检查点抑制剂治疗效果	头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)的肿瘤-免疫微环境(TIME)	数字病理学	头颈部鳞状细胞癌	空间转录组学(ST)	NA	基因表达空间数据	NA
6170	2025-04-25	A Novel Prognostic Signature Integrating Immune and Glycolytic Pathways for Enhanced Prognosis and Immunotherapy Prediction in Hepatocellular Carcinoma 2025, Journal of hepatocellular carcinoma IF:4.2Q2 DOI:10.2147/JHC.S510460 PMID:40264860	research paper	本研究旨在建立一个整合免疫和糖酵解相关基因的预后特征（IGRPS），以预测肝细胞癌（HCC）的预后和免疫治疗效果	首次结合免疫和糖酵解通路构建预后特征，并验证其在肿瘤免疫微环境（TIME）和免疫治疗预测中的作用	研究依赖于公共数据库数据，未进行大规模独立队列验证	开发肝细胞癌预后预测模型并评估其免疫治疗预测价值	肝细胞癌患者	digital pathology	hepatocellular carcinoma	RNA-seq, single-cell sequencing, WGCNA, Cox回归	multivariate Cox regression	RNA-seq数据	TCGA和GEO数据库中的HCC患者样本
6171	2025-04-25	Inflammatory Cell Interactions in the Rotator Cuff Microenvironment: Insights From Single-Cell Sequencing 2025, International journal of genomics IF:2.6Q2 DOI:10.1155/ijog/6175946 PMID:40265083	review	本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在探索肩袖损伤和修复过程中免疫细胞与非免疫细胞相互作用中的应用	利用scRNA-seq技术揭示肩袖微环境中免疫细胞与非免疫细胞的相互作用及其在炎症、组织修复和纤维化中的作用	综述性文章，未涉及具体实验数据或样本分析	探讨肩袖损伤和修复过程中免疫细胞与非免疫细胞的相互作用及其对炎症和组织修复的影响	肩袖微环境中的免疫细胞（如巨噬细胞、T细胞）和非免疫细胞（如成纤维细胞、肌成纤维细胞）	再生医学	肩袖损伤	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	NA
6172	2025-04-24	Construction and validation of renal cell carcinoma tumor cell differentiation-related prognostic classification (RCC-TCDC): an integrated bioinformatic analysis and clinical study 2025-Dec, Annals of medicine IF:4.9Q1 DOI:10.1080/07853890.2025.2490830 PMID:40248945	研究论文	该研究构建并验证了一个基于肾细胞癌肿瘤细胞分化相关预后基因的分子分类系统RCC-TCDC	首次整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，开发了基于肿瘤细胞分化特征的肾细胞癌预后分类系统	研究样本量有限，需要更大规模的外部验证	开发基于肿瘤细胞分化特征的肾细胞癌分子分类系统以实现精准风险分层和个体化治疗	肾细胞癌患者	生物信息学	肾细胞癌	scRNA-seq, bulk RNA-seq, 免疫组化染色	Lasso回归, 多变量预后模型	基因表达数据	TCGA-KIRC队列和新华队列370例肾肿瘤患者
6173	2025-04-24	Mitigating ambient RNA and doublets effects on single cell transcriptomics analysis in cancer research 2025-Jun-28, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217693 PMID:40185305	research paper	该论文探讨了在癌症研究中单细胞转录组学分析中环境RNA和双联体效应的问题，并提出了几种计算方法来缓解这些问题	提出使用计算方法如SoupX、DecontX和CellBender来评估和消除环境RNA污染，其中CellBender采用深度学习技术同时处理环境RNA污染和背景噪声	未提及具体方法的比较或在实际应用中的局限性	旨在提高单细胞转录组学数据的质量，以更准确地描述肿瘤微环境	单细胞转录组学数据	digital pathology	cancer	scRNA-seq	deep learning	gene expression profiles	NA
6174	2025-04-24	Apigenin inhibits recurrent bladder cancer progression by targeting VEGF-β 2025-Jun-28, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217676 PMID:40185304	研究论文	研究芹菜素通过靶向VEGF-β抑制复发性膀胱癌的进展	首次发现芹菜素通过靶向VEGF-β抑制膀胱癌进展，并揭示了VEGF-β在复发性膀胱癌中的上调及其与肿瘤恶性程度的相关性	研究主要基于体外实验，缺乏体内实验验证	探讨芹菜素抑制复发性膀胱癌进展的分子机制	复发性膀胱癌	癌症研究	膀胱癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、分子对接、体外实验	NA	基因表达数据、体外实验数据	NA
6175	2025-04-24	Single-cell transcriptomic analysis identifies tissue-specific fibroblasts as the main modulators of myeloid cells in peritoneal metastasis of different origin 2025-Jun-28, Cancer letters IF:9.1Q1 DOI:10.1016/j.canlet.2025.217678 PMID:40154914	研究论文	通过单细胞转录组分析，识别了不同来源腹膜转移中组织特异性成纤维细胞作为髓系细胞的主要调节者	发现了一种新型成纤维细胞亚群，仅在CRC腹膜转移和正常腹膜中检测到，并展示了其免疫调节特性	研究样本可能不足以代表所有腹膜转移情况，且体外共培养实验可能无法完全模拟体内微环境	探究CRC腹膜转移微环境中不同细胞类型间的相互作用	CRC腹膜转移患者和CRC患者的肿瘤及远处正常组织	数字病理	结直肠癌	单细胞RNA测序	NA	RNA-seq数据	CRC腹膜转移患者和CRC患者的肿瘤及远处正常组织样本
6176	2025-04-24	Exploring OLR1-mediated inflammatory mechanisms in the hematoma microenvironment of acute intracerebral hemorrhage 2025-May-07, Neuroscience IF:2.9Q2 DOI:10.1016/j.neuroscience.2025.03.035 PMID:40113072	研究论文	本研究探讨了氧化低密度脂蛋白受体1（OLR1）在急性脑出血血肿微环境中的作用及其对免疫反应和疾病进展的影响	首次全面分析了OLR1在脑出血血肿微环境中的表达及其与单核细胞和巨噬细胞活性的相关性，提出了OLR1作为生物标志物和治疗靶点的潜力	研究主要基于生物信息学分析和实验室验证，缺乏临床干预实验验证治疗效果	探索OLR1在脑出血病理机制中的作用，为开发新的治疗策略提供依据	脑出血患者的血肿微环境、外周血和脑组织样本	生物信息学	脑出血	生物信息学分析、scRNA-seq、qRT-PCR	NA	基因表达数据	来自GEO数据库的多个数据集，包括外周血、脑组织和血肿样本
6177	2025-04-24	Using Single-Cell RNA sequencing with Drosophila, Zebrafish, and mouse models for studying Alzheimer's and Parkinson's disease 2025-May-07, Neuroscience IF:2.9Q2 DOI:10.1016/j.neuroscience.2025.03.042 PMID:40154937	综述	本文综述了利用果蝇、斑马鱼和小鼠模型以及单细胞RNA测序技术研究阿尔茨海默病和帕金森病的优势和局限性	重点讨论了单细胞RNA测序技术如何通过提供疾病细胞和转录组特征的新见解革新该领域	未提及具体实验数据或样本量的限制	推进阿尔茨海默病和帕金森病的研究，以加速成功治疗干预的开发	果蝇、斑马鱼和小鼠模型	数字病理学	阿尔茨海默病和帕金森病	单细胞RNA测序	NA	转录组数据	NA
6178	2025-04-24	Single-cell RNA sequencing and functional analysis reveal the role of altered glycosylation levels of hepatic macrophages in liver cirrhosis 2025-May, Journal of gastroenterology IF:6.9Q1 DOI:10.1007/s00535-025-02218-y PMID:39888412	research paper	该研究通过单细胞RNA测序和功能分析，揭示了肝巨噬细胞糖基化水平改变在肝硬化中的作用	首次在单细胞水平上分析了肝硬化中糖基化相关基因的变化及其功能通路富集特征，并揭示了巨噬细胞在免疫调控中的核心作用	研究样本量有限，且未进行体内功能验证实验	探究肝硬化中糖基化修饰对免疫细胞行为的影响	肝硬化患者和健康对照者的肝组织样本	digital pathology	liver cirrhosis	single-cell RNA sequencing	NA	RNA-seq data	肝硬化患者和健康对照者的肝组织样本（具体数量未提及）
6179	2025-04-24	Maternal COVID-19 infection associated with offspring neurodevelopmental disorders 2025-May, Molecular psychiatry IF:9.6Q1 DOI:10.1038/s41380-024-02822-z PMID:39521839	research paper	该研究探讨了孕期母体COVID-19感染与后代神经发育障碍（NDDs）风险增加之间的关联及其潜在机制	揭示了COVID-19感染通过改变母体和胎儿免疫环境平衡，影响星形胶质细胞、内皮细胞和兴奋性神经元，从而增加后代NDDs风险的机制，并建立了基于47个独特基因的风险评分模型	潜在机制尚未完全阐明，且研究样本量未明确说明	探究孕期母体COVID-19感染与后代神经发育障碍的因果关系及分子机制	孕期感染COVID-19的母亲及其后代	医学研究	COVID-19, 神经发育障碍	单细胞转录组测序, 基于汇总数据的孟德尔随机化分析, 全表型关联研究	风险评分模型	转录组数据	NA
6180	2025-04-24	A Single-Cell Atlas Revealed Altered B Cells and Neutrophils Immune Signatures and Inflammatory Responses in SFTSV Infection 2025-May, Journal of medical virology IF:6.8Q1 DOI:10.1002/jmv.70354 PMID:40263930	research paper	该研究通过单细胞转录组测序技术，揭示了SFTSV感染期间B细胞和中性粒细胞的免疫特征及炎症反应的改变	首次在单细胞水平上描绘了SFTSV感染的免疫图谱，特别关注了B细胞和中性粒细胞的免疫特征变化	研究仅基于住院患者的PBMCs样本，可能无法完全反映体内所有免疫细胞的变化	探究SFTSV感染的免疫病理机制及其对免疫细胞的影响	SFTSV感染患者的PBMCs样本	免疫学	SFTSV感染	单细胞转录组测序	NA	转录组数据	住院SFTSV感染患者的PBMCs样本（具体数量未提及）