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当前共找到 10537 篇文献，本页显示第 6061 - 6080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6061 | 2025-10-06 |
Hepatocellular carcinoma hosts cholinergic neural cells and tumoral hepatocytes harboring targetable muscarinic receptors
2025-Jan, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2024.101245
PMID:39717507
|
研究论文 | 本研究鉴定肝细胞癌中存在胆碱能神经细胞和表达靶向性毒蕈碱受体的肿瘤肝细胞 | 首次在人类肝细胞癌中发现密集的DCX+、synaptophysin+、NeuN+、VAChT+神经细胞簇，提出神经元评分新概念，揭示胆碱能极性重构与HCC进展的关联 | 研究主要基于回顾性队列和体外实验，需要前瞻性临床试验验证胆碱能药物的治疗效果 | 探索肝细胞癌中神经支配特征及其在肿瘤发生发展中的作用 | 人类肝细胞癌组织、TCGA数据集、欧洲验证队列、大鼠HCC模型、HCC细胞系 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序、生物信息学分析、细胞生物学研究、药理学研究 | NA | 组织样本、测序数据、临床数据 | 法国肝脏生物库、TCGA数据集、多个其他数据集、欧洲验证队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6062 | 2025-10-06 |
Melanocyte dysfunctions: future and promise of stem cells
2025, American journal of stem cells
IF:1.5Q4
DOI:10.62347/EOIC7075
PMID:40686746
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综述 | 本文综述了黑素细胞干细胞在皮肤色素沉着和相关疾病中的关键作用及其治疗潜力 | 系统整合了单细胞RNA测序、空间转录组学等前沿技术对黑素细胞干细胞生物学特性的最新发现 | 对黑素细胞功能障碍条件下黑素细胞干细胞特性的全面理解仍显不足 | 探讨黑素细胞干细胞在皮肤稳态维持和再生医学中的应用前景 | 人类黑素细胞和黑素细胞干细胞 | 再生医学 | 白癜风 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,基因编辑,全基因组测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 6063 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptome Analyses of Four Pain Related Genes in Osteosarcoma
2025, Cancer informatics
IF:2.4Q3
DOI:10.1177/11769351251331508
PMID:40686838
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究骨肉瘤中四个疼痛相关基因的表达模式 | 首次在骨肉瘤中利用单细胞RNA测序技术分析ARTN、PSPN、GDNF和NRTN这四个疼痛相关基因在不同细胞类型中的表达差异 | 仅分析了四个特定基因的表达模式，未深入探讨其功能机制 | 研究骨肉瘤中疼痛相关基因在不同细胞类型中的表达特征 | 人类骨肉瘤组织和16个骨肉瘤细胞系 | 单细胞转录组学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类骨肉瘤组织和16个骨肉瘤细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6064 | 2025-10-06 |
Integrated Single-Cell and Spatial Transcriptomic Analysis Identifies ISR-Related Genes Driving Immune Regulation in Parkinson's Disease
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S521744
PMID:40687147
|
研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组分析，识别帕金森病中驱动免疫调控的ISR相关基因 | 首次整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，系统识别帕金森病中与整合应激反应相关的关键基因及其在免疫调控中的作用 | 使用公开数据库数据，样本来源和数量可能受限；实验验证主要集中于DDIT4基因 | 探究整合应激反应相关基因在帕金森病进展中的作用机制 | 帕金森病患者脑组织样本、PD细胞模型和小鼠模型 | 数字病理学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, Lasso回归, 随机森林算法, GSEA, GSVA, CIBERSORT | 机器学习模型 | 转录组数据, 空间表达数据 | 来自GEO数据库的公开转录组数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6065 | 2025-10-06 |
Integrated Analysis of Ferroptosis- and Cellular Senescence-Related Biomarkers in Atherosclerosis Based on Machine Learning and Single-Cell Sequencing Data
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S529581
PMID:40687151
|
研究论文 | 通过机器学习和单细胞测序数据识别与动脉粥样硬化中铁死亡和细胞衰老相关的生物标志物 | 首次整合铁死亡和细胞衰老相关基因，结合WGCNA和多种机器学习算法识别动脉粥样硬化诊断标志物 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于动物模型 | 识别动脉粥样硬化中铁死亡和细胞衰老相关的关键基因 | 动脉粥样硬化基因表达数据、单细胞RNA测序数据、动物模型 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、生物信息学分析、机器学习 | 八种机器学习算法 | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | 从GEO数据库获取的多个动脉粥样硬化数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6066 | 2025-10-06 |
Leveraging multiple labeled datasets for the automated annotation of single-cell RNA and ATAC data
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.06.043
PMID:40687986
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研究论文 | 提出JIND-Multi框架，用于在多个标注数据集间转移细胞类型标签，实现单细胞RNA和ATAC数据的自动注释 | 首个能同时处理scRNA-Seq和scATAC-Seq数据的多数据集标签转移框架，无需配对RNA数据即可注释ATAC数据 | 需要同类型标注数据，对罕见细胞类型的适应性未充分验证 | 开发单细胞数据自动注释方法，解决细胞图谱构建中的批次效应和注释一致性问题 | 单细胞RNA测序和ATAC测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | JIND-Multi框架 | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 6067 | 2025-10-06 |
dandelionR: Single-cell immune repertoire trajectory analysis in R
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.06.047
PMID:40687995
|
研究论文 | 开发了一个R包dandelionR，用于单细胞免疫组库轨迹分析 | 首个基于R语言的单细胞免疫组库轨迹分析工具，实现了VDJ特征空间构建和基于扩散映射与吸收马尔可夫链的轨迹分析 | 目前仅提供基础功能，可能缺乏Python版本中的一些高级特性 | 开发单细胞RNA测序和免疫组库测序整合分析的R语言工具 | 淋巴细胞发育研究 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞免疫组库测序 | 扩散映射, 吸收马尔可夫链 | 基因表达数据, 免疫受体序列数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, scVDJ-seq | NA | NA |
| 6068 | 2025-10-06 |
Integrated multiomics analysis identifies PHLDA1+ fibroblasts as prognostic biomarkers and mediators of biological functions in pancreatic cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1592416
PMID:40688078
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学分析开发了一个7基因风险模型，识别PHLDA1+成纤维细胞作为胰腺癌的预后生物标志物和生物学功能介质 | 首次构建了基于7个基因的mCAF相关风险模型，并发现PHLDA1在肿瘤-基质相互作用中的关键介导作用 | CAF亚型的预后和功能贡献仍需进一步深入理解 | 研究胰腺癌中癌症相关成纤维细胞亚型的预后价值和功能作用 | 胰腺癌患者和肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞 | 生物信息学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序,共培养实验 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 6069 | 2025-10-06 |
S100A8/A9 in herpes zoster neuralgia: molecular mechanisms and therapeutic perspectives
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1615638
PMID:40688076
|
综述 | 本文系统阐述了S100A8/A9蛋白复合物在带状疱疹神经痛发病机制中的关键作用及治疗前景 | 首次系统揭示S100A8/A9通过TLR4/TNF信号通路调控神经炎症过程，并作为慢性疼痛转化的关键分子标志物 | 当前治疗策略存在局限性，需要更多临床验证 | 探讨S100A8/A9在带状疱疹神经痛发病机制中的作用及治疗潜力 | 带状疱疹相关神经性疼痛的分子机制 | 神经科学 | 带状疱疹神经痛 | 单细胞测序，多组学分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序，多组学分析 | NA | NA |
| 6070 | 2025-10-06 |
Integrative single-cell and spatial transcriptomics uncover ELK4-mediated mechanisms in NDUFAB1+ tumor cells driving gastric cancer progression, metabolic reprogramming, and immune evasion
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1591123
PMID:40688093
|
研究论文 | 通过整合单细胞和空间转录组学技术，揭示了ELK4介导的NDUFAB1+肿瘤细胞在胃癌进展、代谢重编程和免疫逃逸中的核心机制 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学识别出C1 NDUFAB1+胃癌细胞亚型，并发现其通过PARs信号通路与成纤维细胞和周细胞相互作用 | 研究主要基于体外实验验证，缺乏体内动物模型验证 | 探索胃癌肿瘤异质性及治疗抵抗机制，开发多靶点综合治疗策略 | 胃癌组织和细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 体外实验 | Seurat, Robust Cell Type Decomposition, CellChat, StLearn | 基因表达数据, 空间分布数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 6071 | 2025-10-06 |
Key immune regulators in retinal ischemia-reperfusion injury via RNA sequencing
2025, International journal of ophthalmology
IF:1.9Q2
DOI:10.18240/ijo.2025.07.06
PMID:40688775
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研究论文 | 本研究通过RNA测序技术探索视网膜缺血再灌注损伤中的免疫细胞浸润和分子机制 | 结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq分析，首次系统鉴定RIRI中的关键免疫调节基因及其在特定免疫细胞中的表达 | 研究主要关注急性期RIRI，未涉及慢性阶段的免疫调节机制 | 探索视网膜缺血再灌注损伤的免疫调控机制并识别潜在治疗靶点 | 视网膜缺血再灌注损伤模型 | 生物信息学 | 视网膜疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR | 差异基因表达分析, 加权基因共表达网络分析, 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6072 | 2025-10-06 |
HL-BscPF: Hybrid learning facilitates brain cell auto-identification in multiple pathologies
2025-Sep-15, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2025.123751
PMID:40414555
|
研究论文 | 提出混合学习框架HL-BscPF用于脑细胞自动分类和疾病相关通路分析 | 整合ItClust和TOSICA模型，结合自编码器降维和transformer架构提升预测精度 | 未明确说明样本量的具体数值和数据集来源限制 | 开发自动化细胞类型分类方法并揭示脑疾病相关通路 | 脑单细胞转录组数据，涵盖衰老、阿尔茨海默病、术后认知功能障碍和中风等神经病理状态 | 生物信息学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | 自编码器, transformer, 混合学习 | 单细胞转录组数据 | 四个脑特异性单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6073 | 2025-10-06 |
Integrated single-cell sequencing for the development of a GJA4-based precision immuno-prognostic model in melanoma
2025-Sep, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102450
PMID:40639089
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序数据开发了基于GJA4的黑色素瘤精准免疫预后模型 | 首次发现GJA4是肿瘤相关内皮细胞终末亚群的关键标志基因，并构建了基于GJA4的精准预后模型 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 探索肿瘤相关内皮细胞与肿瘤的相互作用机制，开发黑色素瘤精准预后模型 | 黑色素瘤患者、肿瘤相关内皮细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, RNA-seq, 微阵列 | 风险预测模型 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的黑色素瘤和胶质瘤患者数据 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 6074 | 2025-10-06 |
Novel multi-omics analysis revealing metabolic heterogeneity of breast cancer cell and subsequent development of associated prognostic signature
2025-Sep, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102444
PMID:40639090
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据揭示乳腺癌细胞的代谢异质性，并开发了相关的预后特征 | 首次通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA测序数据系统分析乳腺癌代谢异质性，构建了基于代谢特征的预后模型，并验证了PDCD1的致癌作用 | 研究样本量有限，需要在更大规模队列中验证代谢特征的预测效能 | 探究乳腺癌代谢异质性及其与肿瘤微环境的相互作用，开发预后预测工具 | 乳腺癌细胞和患者样本 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,WGCNA,机器学习 | 加权基因共表达网络分析,机器学习算法 | 基因表达数据,临床数据 | 多个队列的乳腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 6075 | 2025-10-06 |
Identification of hemocyte types and characterization of their immune function in the house fly based on morphological observation and single-cell RNA sequencing
2025-Aug, Insect biochemistry and molecular biology
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.ibmb.2025.104358
PMID:40617446
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研究论文 | 本研究结合形态学观察和单细胞RNA测序技术，对家蝇幼虫血细胞进行分类并分析其免疫功能 | 首次在家蝇中系统鉴定五种血细胞类型并阐明其特异性免疫功能 | 研究仅针对家蝇幼虫阶段，未涵盖成虫期血细胞特征 | 探究家蝇血细胞类型及其在免疫防御中的功能分工 | 家蝇幼虫血细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 形态学观察, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 显微镜图像 | 家蝇幼虫血细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6076 | 2025-10-06 |
Lymphoma B cells remodel bone marrow stromal cells into extracellular matrix-producing cancer-associated fibroblasts
2025-Jul-22, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2024015616
PMID:40305664
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研究论文 | 本研究揭示了淋巴瘤B细胞通过重塑骨髓基质细胞为细胞外基质生成型癌症相关成纤维细胞，促进疾病进展的机制 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定出小鼠LepR+骨髓间充质干细胞与恶性B细胞之间存在双向相互作用，并揭示了其向ECM/TGFβ肌纤维母细胞样癌症相关成纤维细胞转化的特异性重编程过程 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类样本中直接相互作用的机制仍需进一步验证 | 探究B细胞淋巴瘤中骨髓基质微环境重塑的动力学和分子机制 | 滤泡性淋巴瘤患者骨髓样本和淋巴瘤B细胞骨髓异种移植小鼠模型 | 单细胞生物学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 滤泡性淋巴瘤患者骨髓样本和淋巴瘤小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6077 | 2025-10-06 |
Novel Copper-Responsive Cell Subtypes in Oyster Gills: scRNA-Seq Uncovers Detoxification Strategy and Intraspecific Accumulation Variation
2025-Jul-22, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.5c05244
PMID:40639921
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建牡蛎鳃细胞图谱，揭示铜积累差异的细胞调控网络和解毒策略 | 首次在牡蛎鳃中鉴定出铜特异性积累的嗜铜细胞，并发现其丰度与铜含量直接相关（R=0.92） | NA | 研究牡蛎鳃对金属的吸收和解毒机制 | 牡蛎鳃细胞 | 单细胞组学 | 金属中毒 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 高铜积累和低铜积累牡蛎的鳃组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6078 | 2025-10-06 |
Single-cell analysis reveals CD34+CD90+ endothelial cells promote tumor metastasis in gallbladder cancer
2025-Jul-18, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01040-2
PMID:40681742
|
研究论文 | 通过单细胞分析鉴定出促进胆囊癌转移的CD34+CD90+内皮细胞亚群 | 首次在胆囊癌中发现具有EndoMT特性的CD34+CD90+内皮细胞亚群，并证实其通过TGF-β信号通路促进肿瘤转移 | 未明确说明样本数量和研究人群特征 | 探究肿瘤内皮细胞在胆囊癌转移中的作用机制 | 胆囊癌患者的内皮细胞和肿瘤细胞 | 单细胞分析 | 胆囊癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6079 | 2025-10-06 |
Using machine learning to discover DNA metabolism biomarkers that direct prostate cancer treatment
2025-Jul-18, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-11457-1
PMID:40681784
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研究论文 | 通过整合多组学数据和机器学习方法，发现DNA代谢基因在前列腺癌预后和治疗中的生物标志物作用 | 首次系统性地整合转录组数据、单细胞RNA测序和机器学习模型，揭示DNA代谢基因在前列腺癌免疫微环境和治疗反应中的关键作用 | 研究主要基于TCGA队列数据，需要更多独立队列验证；样本量相对有限 | 探索DNA代谢基因在前列腺癌进展、免疫调节和治疗反应中的作用机制 | 前列腺癌患者样本和正常细胞 | 机器学习 | 前列腺癌 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 基因富集分析 | CoxBoost算法, 机器学习模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | TCGA队列和外部验证数据集（具体样本数未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 6080 | 2025-10-06 |
SCNT: an R package for data analysis and visualization of single-cell and spatial transcriptomics
2025-Jul-18, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06209-x
PMID:40681987
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研究论文 | 开发了一个用于单细胞和空间转录组数据分析和可视化的R软件包 | 整合了Seurat和ggplot2等工具，支持Seurat与H5ad格式的无缝转换，提供高分辨率空间可视化功能 | 目前支持的ST平台有限，多组学数据整合功能有待加强 | 解决单细胞和空间转录组数据分析与可视化的挑战 | 单细胞和空间转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间数据 | 公共PBMC数据集, Visum和Visium HD人类肾脏组织数据 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | Visium, Visium HD | 10x Visium, 10x Visium HD |