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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 6041 | 2025-10-06 |
Two Specialized Intrinsic Cardiac Neuron Types Safeguard Heart Homeostasis and Stress Resilience
2025-Jun-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.13.659555
PMID:40661461
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研究论文 | 通过单细胞转录组学等技术发现心脏内存在两种分子特征不同的神经元亚型,分别负责维持心脏稳态和应激韧性 | 首次在分子水平识别出两种功能特化的心脏内神经元亚型,并阐明其各自在维持冠状动脉灌注和心脏电稳定性中的独特作用 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类心脏中验证 | 探索心脏内在神经系统的分子和功能组织 | 小鼠心脏内在神经元 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学、高分辨率成像、细胞特异性遗传工具 | NA | 基因表达数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6042 | 2025-10-06 |
Stc1-expressing myofibroblasts are a developmentally distinct lineage cleared through intrinsic apoptosis in the neonatal lung
2025-Jun-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.12.659126
PMID:40661545
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研究论文 | 本研究通过建立遗传标记小鼠模型,揭示了表达Stc1的次级嵴肌成纤维细胞(SCMF)是发育过程中独特的细胞谱系,并通过内在凋亡途径在新生儿肺中被清除 | 首次建立了能够特异性标记发育性短暂SCMF的遗传工具,并证明SCMF与肺泡管肌成纤维细胞(DMF)具有不同的祖细胞群和生态位 | 研究主要基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明肺肌成纤维细胞不同谱系在发育和疾病中的独特贡献 | 小鼠肺组织中的次级嵴肌成纤维细胞(SCMF)和肺泡管肌成纤维细胞(DMF) | 发育生物学 | 肺发育疾病 | 单细胞RNA测序, 胚胎谱系追踪, 遗传操作 | 遗传工程小鼠模型 | 基因表达数据, 细胞谱系数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6043 | 2025-10-06 |
ASXL1 truncating mutations drive leukemic resistance to T cell attack
2025-Jun-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.29.656798
PMID:40661385
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研究论文 | 本研究通过整合分子分析和免疫功能研究,揭示了ASXL1截断突变通过抑制HLA-I表达驱动白血病对T细胞攻击产生耐药性的新机制 | 首次发现ASXL1截断突变是DLI耐药性的遗传基础,并阐明其通过Polycomb非依赖性机制抑制HLA-I表达的免疫逃逸通路 | 研究主要基于白血病细胞系K562和有限的患者队列,需要在更广泛的样本中验证 | 鉴定驱动白血病对供体淋巴细胞输注(DLI)产生耐药性的分子机制 | 接受DLI治疗的白血病患者和K562白血病细胞系 | 癌症免疫学 | 白血病 | 全外显子组测序, 靶向突变panel测序, 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, CRISPR基因编辑 | NA | 基因组测序数据, 单细胞转录组数据, 表观遗传数据 | 138,152个骨髓单个髓系细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 6044 | 2025-10-06 |
Single-cell multi-omic analysis of mesenchymal cells reveals molecular signatures and putative regulators of lung allograft fibrosis
2025-Jun-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.27.625698
PMID:40661599
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研究论文 | 通过单细胞多组学技术分析肺移植受体间充质细胞的分子特征,揭示肺移植物纤维化的调控机制 | 首次结合单细胞转录组和染色质可及性分析揭示CEBPD作为CLAD相关间充质细胞的关键调控因子 | 样本量有限,早期时间点差异不明显,需要更大队列验证 | 探索肺移植后慢性移植物功能障碍的分子机制 | 肺移植受体的支气管肺泡灌洗液中的间充质细胞 | 单细胞多组学 | 肺移植相关疾病 | 单细胞多组学测序, siRNA敲低, 染色质可及性分析 | 逻辑回归模型 | 单细胞RNA测序数据, 染色质可及性数据 | 肺移植受体支气管肺泡灌洗液样本(含CLAD和非CLAD对照组) | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 6045 | 2025-10-06 |
Splicing regulatory dynamics for precision analysis and treatment of heterogeneous leukemias
2025-May-07, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adr1471
PMID:40333990
|
研究论文 | 开发OncoSplice计算方法分析白血病剪接调控动态并发现新的治疗靶点 | 开发无监督计算方法OncoSplice,在无剪接因子突变情况下发现新的白血病分子亚型,并验证PRMT5抑制剂对白血病剪接异常的治疗效果 | 未明确说明样本量的具体数字和研究队列的详细特征 | 研究剪接调控在白血病中的作用机制并探索治疗策略 | 成人和儿童急性髓系白血病(AML) | 生物信息学 | 白血病 | 长读长单细胞RNA测序 | 无监督计算方法 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6046 | 2025-10-06 |
Epitenon-derived cells comprise a distinct progenitor population that contributes to both fibrosis and regeneration following acute flexor tendon injury in a spatially-dependent manner
2025-May-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.30.526242
PMID:36778469
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研究论文 | 本研究通过遗传谱系追踪和单细胞RNA测序技术,揭示了腱外膜来源细胞在肌腱损伤后同时参与纤维化和再生过程的空间依赖性作用 | 首次明确鉴定腱外膜作为重要的祖细胞群来源,这些细胞在肌腱损伤后同时参与纤维化和再生过程,具有空间依赖性特征 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探索肌腱损伤后参与纤维化和再生过程的细胞群体及其作用机制 | 小鼠肌腱损伤模型和人类腱周瘢痕组织 | 单细胞生物学 | 肌腱损伤 | 遗传谱系追踪, 单细胞RNA测序, 免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 小鼠肌腱损伤模型和人类瘢痕组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6047 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial analyses reveal the effect of VSIG4+S100A10+TAMs on the immunosuppression of glioblastoma and anti-PD-1 immunotherapy
2025-May, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.142415
PMID:40127797
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间分析揭示了VSIG4+S100A10+TAMs在胶质母细胞瘤免疫抑制和抗PD-1免疫治疗中的作用 | 首次发现VSIG4+S100A10+TAM是GBM不良预后的独立预后指标,并在抗PD-1免疫治疗无应答患者中显著积累 | 样本量相对有限(16例患者样本),需要更大规模研究验证 | 探索胶质母细胞瘤中肿瘤相关巨噬细胞异质性及其对免疫治疗疗效的影响 | 胶质母细胞瘤患者样本和肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 流式细胞术, 多重免疫荧光, bulk RNA-seq | NA | 基因表达数据, 空间定位数据, 细胞表型数据 | 16例胶质母细胞瘤患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 6048 | 2025-10-06 |
SCassist: An AI Based Workflow Assistant for Single-Cell Analysis
2025-Apr-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.22.650107
PMID:40492199
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研究论文 | 开发了一个基于大型语言模型的单细胞RNA测序数据分析辅助工具SCassist | 首次将大型语言模型集成到单细胞RNA测序数据分析工作流中,提供参数推荐和结果解释 | NA | 简化单细胞RNA测序数据分析流程,降低使用门槛 | 单细胞RNA测序数据分析工作流 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | LLM(大型语言模型) | 单细胞RNA测序数据 | NA | Google, OpenAI, Meta | 单细胞RNA-seq | Gemini, GPT, Llama3 | 基于大型语言模型的单细胞数据分析辅助工具 |
| 6049 | 2025-10-06 |
Histopathologic Evaluation and Single-Cell Spatial Transcriptomics of the Colon Reveal Cellular and Molecular Abnormalities Linked to J-Pouch Failure in Patients with Inflammatory Bowel Disease
2025-Jan-28, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.27.635092
PMID:39974918
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研究论文 | 本研究通过组织病理学评估和单细胞空间转录组学分析结肠组织,揭示与炎症性肠病患者J型储袋失败相关的细胞和分子异常 | 首次结合组织病理学特征和单细胞空间转录组学技术系统分析J型储袋失败的预测因素和分子机制 | 回顾性研究设计,单细胞空间转录组学仅分析了部分患者亚群 | 探究与炎症性肠病患者J型储袋失败相关的组织病理学特征和分子机制 | 接受回肠储袋肛管吻合术(IPAA)的炎症性肠病患者 | 数字病理学 | 炎症性肠病 | 单细胞空间转录组学,组织病理学评估 | NA | 空间转录组数据,组织病理图像 | 417名患者队列,部分患者进行单细胞空间转录组分析 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 6050 | 2025-10-06 |
The chromatin remodeler ADNP regulates neurodevelopmental disorder risk genes and neocortical neurogenesis
2025-Jan-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2405981122
PMID:39808658
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研究论文 | 本研究揭示了染色质重塑复合物ChAHP通过调控神经发育障碍风险基因和神经发生过程在脑发育中的关键作用 | 首次发现Adnp通过两步过程调控大脑皮层上层神经元生成:维持祖细胞增殖和调控神经元基因表达程序 | 研究主要基于小鼠模型,在人类中的直接相关性需要进一步验证 | 探究染色质重塑复合物ChAHP在神经发育和神经发育障碍中的作用机制 | 小鼠新皮层发育过程中的神经祖细胞和分化神经元 | 神经发育生物学 | 神经发育障碍 | 单细胞转录组学, cut&run-seq, 组织学方法 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 染色质结合数据, 组织图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6051 | 2025-10-06 |
SOD2 expression in patients with triple-negative breast cancer is associated with tumor-infiltrating lymphocytes and prognosis
2025-Aug, Breast cancer research and treatment
IF:3.0Q2
DOI:10.1007/s10549-025-07775-7
PMID:40634732
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研究论文 | 本研究探讨了三阴性乳腺癌中SOD2表达与肿瘤浸润淋巴细胞及预后的关系 | 首次系统揭示SOD2表达与三阴性乳腺癌免疫微环境特征和临床预后的关联 | 样本来源多样且部分为回顾性分析,需进一步功能验证实验 | 探究SOD2在三阴性乳腺癌中的表达特征及其临床意义 | 三阴性乳腺癌患者组织样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 免疫组织化学,蛋白质组学,RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | 组织切片图像,蛋白质表达数据,基因表达数据 | 组织芯片229例手术样本和144例新辅助化疗前活检样本,TCGA数据库91例,公共数据库534例 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6052 | 2025-10-06 |
SLC3A2 as a key anoikis-related gene for prognosis and tumor microenvironment remodeling in melanoma
2025-Jul-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03125-7
PMID:40643718
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研究论文 | 本研究通过整合机器学习和单细胞分析,鉴定SLC3A2作为黑色素瘤预后和肿瘤微环境重塑的关键失巢凋亡相关基因 | 首次系统评估101种机器学习算法组合构建黑色素瘤预后模型,并通过单细胞分析揭示失巢凋亡在肿瘤微环境重塑中的关键作用 | 研究主要基于公共数据库数据,需要进一步实验验证模型的临床适用性 | 识别黑色素瘤中失巢凋亡相关的预后标志物并探索其与肿瘤微环境的关系 | 黑色素瘤患者和细胞系 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 机器学习, shRNA敲低, 集落形成实验, Transwell迁移实验 | 随机生存森林, 梯度提升机, Cox回归 | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 临床数据 | 多个黑色素瘤队列(TCGA, GSE19234, GSE22153, GSE65904)和单细胞数据集GSE215120 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 6053 | 2025-10-06 |
Zwilch kinetochore protein affects the prognosis of cancer patients by participating in cell proliferation, enhancing cell communication, and reshaping the tumor microenvironment
2025-Jul-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02981-7
PMID:40643756
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研究论文 | 本研究探讨Zwilch动粒蛋白通过参与细胞增殖、增强细胞通讯和重塑肿瘤微环境影响癌症患者预后的机制 | 首次系统揭示ZWILCH在多种癌症中的普遍高表达特征及其通过细胞通讯和肿瘤微环境重塑影响预后的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证 | 探究ZWILCH在肿瘤发生发展中的作用机制及其临床意义 | 多种癌症类型及其肿瘤微环境 | 生物信息学 | 多种癌症 | 全转录组分析,空间转录组分析,单细胞转录组分析,GSEA,GSVA,KEGG富集分析,Aucell,全基因组CRISPR筛选 | 单变量Cox回归分析 | 转录组数据,功能蛋白数据 | 多种癌症患者样本 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6054 | 2025-10-06 |
Exploring the role of PANoptosis related genes in the prognosis of oral squamous cell carcinoma subtypes based on multi-omics analysis
2025-Jul-11, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03154-2
PMID:40643861
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研究论文 | 基于PANoptosis相关基因通过多组学分析探索口腔鳞状细胞癌亚型的预后作用 | 首次基于PANoptosis相关基因对OSCC进行分子分型,并构建包含8个基因的预后模型 | 研究主要基于TCGA数据库,需要外部验证队列确认结果的普适性 | 探索PANoptosis相关基因在口腔鳞状细胞癌预后中的作用 | 口腔鳞状细胞癌患者 | 生物信息学 | 口腔鳞状细胞癌 | RNA-seq, DNA甲基化测序, 单细胞RNA测序, qRT-PCR | Cox回归模型, 聚类算法 | 基因组数据, 转录组数据, 表观遗传数据 | TCGA数据库中的OSCC患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, DNA甲基化测序 | NA | NA |
| 6055 | 2025-10-06 |
Construction of a macrophage-related prognostic signature and assessment of immune checkpoint inhibitor efficacy of HCC
2025-Jul-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-06937-3
PMID:40645977
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研究论文 | 本研究构建了肝细胞癌中巨噬细胞相关的预后基因特征,并评估了其预测免疫检查点抑制剂疗效的能力 | 首次基于单细胞RNA测序构建了八基因巨噬细胞相关预后特征,并深入揭示了PLAUR通过PI3K/AKT/mTOR通路促进免疫抑制极化和肿瘤进展的机制 | 研究样本量有限,需要更多独立队列验证基因特征的临床适用性 | 开发肝细胞癌预后生物标志物和免疫检查点抑制剂疗效预测工具 | 肝细胞癌患者、巨噬细胞亚型、PLAUR基因功能 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 功能实验 | 预后模型, 细胞通讯分析 | 基因表达数据, 单细胞数据, 临床数据 | TCGA-LIHC队列和配对肝癌与正常肝组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6056 | 2025-10-06 |
Comprehensive analysis of Mendelian randomization and scRNA-seq identify key prognostic genes and relevant functional roles in colorectal cancer
2025-Jul-11, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-10354-x
PMID:40646181
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和单细胞测序识别结直肠癌关键预后基因MMRN1和SLC6A19及其功能机制 | 首次结合孟德尔随机化分析与单细胞测序技术系统鉴定结直肠癌预后关键基因 | NA | 识别结直肠癌关键预后基因并探索其分子机制 | 结直肠癌相关基因和细胞 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, qRT-PCR | 单变量Cox分析, 列线图模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 6057 | 2025-10-06 |
Comparison of local effects and systemic T-cell responses in patients with breast cancer treated by radiofrequency ablation versus microwave ablation
2025-Jul-11, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03896-7
PMID:40646574
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研究论文 | 比较射频消融与微波消融治疗乳腺癌的局部效果和系统性T细胞免疫反应 | 首次报道实体瘤热消融后外周T细胞溶解功能差异,通过单细胞RNA测序揭示微波消融激活树突状细胞脂肪酸代谢的机制 | 需要未来临床试验验证研究结果 | 比较两种热消融疗法在乳腺癌治疗中的局部效果和免疫反应差异 | 60名乳腺癌患者 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 流式细胞术, ELISA, qRT-PCR, 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据, 血液样本, 基因表达数据 | 60例乳腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6058 | 2025-10-06 |
Multimodal evaluation of cerebrospinal fluid from breast cancer leptomeningeal metastases using circulating tumor cell detection, single-cell sequencing, and proteomics
2025-Jul-10, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06671-4
PMID:40640833
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研究论文 | 通过多模态方法评估乳腺癌软脑膜转移患者的脑脊液,包括循环肿瘤细胞检测、单细胞测序和蛋白质组学分析 | 首次结合循环肿瘤细胞检测、单细胞RNA测序和细胞因子分析对乳腺癌软脑膜转移患者的脑脊液进行综合分子分析 | 研究仅基于单例患者样本,样本量有限 | 开发用于监测乳腺癌中枢神经系统转移治疗反应的微创方法 | HER2阳性乳腺癌软脑膜转移患者的脑脊液样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 细胞因子分析, 循环肿瘤细胞检测 | NA | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质组学数据, 细胞计数数据 | 1例患者的系列脑脊液样本 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 6059 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing dataset of hearts from wild type and Cyp26b1 knockout mouse embryos
2025-Jul-09, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-025-05497-5
PMID:40634327
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析野生型和Cyp26b1基因敲除小鼠胚胎心脏的转录组变化 | 首次在四个发育时间点对Cyp26b1敲除小鼠心脏进行单细胞转录组分析,揭示其在心肌细胞中的特异性转录变化 | 研究仅关注胚胎期E10.5-E13.5发育阶段,未涉及更晚期发育或成年表型 | 探究Cyp26b1基因在心脏发育中的作用及其与左心室致密化不全的潜在关联 | 野生型和Cyp26b1基因敲除小鼠胚胎的心脏组织 | 单细胞组学 | 心肌病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 134,499个高质量细胞(57,923个野生型,62,488个敲除型) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 6060 | 2025-10-06 |
Novel Cell-to-Cell Communications Between Macrophages and Fibroblasts Regulate Obesity-Induced Adipose Tissue Fibrosis
2025-Jul-01, Diabetes..
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db24-0762
PMID:40063503
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研究论文 | 本研究通过单细胞分析技术揭示了肥胖诱导的脂肪组织纤维化中巨噬细胞与成纤维细胞之间的新型细胞通讯机制 | 发现了表达Mincle的巨噬细胞亚群通过分泌Osm调控成纤维细胞胶原基因表达的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 | 探究肥胖诱导的脂肪组织纤维化过程中的细胞间通讯机制 | 饮食诱导肥胖小鼠的脂肪组织及人类肥胖脂肪组织 | 单细胞生物学 | 肥胖相关代谢疾病 | 单细胞转录组分析,空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | 饮食诱导肥胖小鼠模型及人类肥胖脂肪组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |