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当前共找到 10549 篇文献，本页显示第 581 - 600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 581 | 2026-04-01 |
Deciphering the Complexities of Pulmonary Hypertension: The Emergent Role of Single-Cell Omics
2025-Jan, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0145PS
PMID:39141563
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综述 | 本文综述了单细胞组学技术在肺动脉高压研究中的应用，探讨其如何推动对该疾病复杂性的理解 | 利用单细胞转录组学技术，超越传统批量分析的局限，揭示肺动脉高压中细胞亚型的相互作用和转化，为精准医疗提供新靶点 | 单细胞RNA测序分辨率需提升以捕获更精细的细胞变化，处理人体组织样本存在物流障碍，且需整合多种组学方法以全面理解疾病分子机制 | 探讨单细胞组学技术在肺动脉高压研究中的角色，以促进疾病理解、靶向药物开发和生物标志物发现 | 肺动脉高压中的细胞生态系统，包括内皮细胞、平滑肌细胞、周细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 582 | 2026-03-31 |
Single-cell analysis of ovarian myeloid cells identifies age-associated changes in macrophages and signaling dynamics†
2025-Aug-13, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf122
PMID:40459236
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和流式细胞术分析年轻与年老小鼠卵巢中的髓系细胞，揭示了与年龄相关的巨噬细胞亚群变化及信号通路动态 | 首次在年老小鼠卵巢中鉴定出独特的Cx3cr1lowCd81hi巨噬细胞亚群，并发现ANNEXIN和TGFβ信号通路的显著改变，为卵巢衰老相关的炎症和纤维化提供了新机制 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类样本，且样本量相对较小 | 探究卵巢衰老过程中髓系细胞的功能特征和信号动态变化 | 年轻（3个月）和年老（14-17个月）小鼠卵巢中的CD45+ CD11b+髓系细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术 | NA | RNA序列数据, 流式细胞数据 | 年轻和年老小鼠卵巢样本，具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 583 | 2026-03-31 |
The Advance of Single-Cell RNA Sequencing Applications in Ocular Physiology and Disease Research
2025-08-04, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15081120
PMID:40867565
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在眼生理学和疾病研究中的应用进展 | 系统总结了scRNA-seq如何通过单细胞水平的高分辨率分析，揭示眼部细胞异质性、识别疾病特异性基因谱，并推动新型生物标志物和治疗靶点的发现 | 作为一篇综述文章，未提出新的实验数据或方法，主要基于现有文献进行归纳总结 | 回顾和总结scRNA-seq技术在眼生理学和病理学研究中的应用进展与潜力 | 眼部组织，包括与近视、眼表和角膜疾病、青光眼、葡萄膜炎、视网膜疾病及眼部肿瘤相关的各类细胞 | 数字病理学 | 眼部疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 584 | 2026-03-31 |
Spatial Transcriptomics Decodes Breast Cancer Microenvironment Heterogeneity: From Multidimensional Dynamic Profiling to Precision Therapy Blueprint Construction
2025-07-24, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15081067
PMID:40867511
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综述 | 本文综述了空间转录组学技术在乳腺癌研究中的应用，重点探讨其在解析肿瘤异质性、表征肿瘤微环境、阐明疾病进展与转移机制以及预测治疗反应方面的作用 | 系统性地将空间转录组学定位为整合多组学数据的枢纽技术，并提出了其在构建乳腺癌精准治疗蓝图中的路线图 | 作为一篇综述文章，其局限性在于主要总结现有研究，而非提出新的原始数据或实验验证 | 旨在综合空间转录组学在乳腺癌研究中的应用，并探索其如何连接分子图谱与临床转化以推动精准治疗 | 乳腺癌及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 585 | 2026-03-31 |
Targeting Sodium Transport Reveals CHP1 Downregulation as a Novel Molecular Feature of Malignant Progression in Clear Cell Renal Cell Carcinoma: Insights from Integrated Multi-Omics Analyses
2025-07-15, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15071019
PMID:40723891
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析，揭示了钠离子转运相关基因CHP1下调是透明细胞肾细胞癌恶性进展的新分子特征 | 首次通过整合单细胞RNA测序、蛋白质组学等多组学数据，系统揭示了CHP1在ccRCC恶性进展中的下调模式及其作为预后生物标志物的潜力，并筛选出靶向CHP1的候选化合物 | 研究主要基于回顾性数据分析，需要进一步的体内外实验验证CHP1的功能机制和候选化合物的治疗效果 | 构建ccRCC的细胞和转录组全景图，揭示恶性进展过程中的基因表达动态 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC） | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序，蛋白质组学，免疫组化，分子对接，虚拟筛选 | 伪时间轨迹分析，Mfuzz聚类，细胞间通讯建模 | 单细胞转录组数据，蛋白质组数据，免疫组化图像，细胞系数据 | 90个scRNA-seq样本，包含534,227个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 586 | 2026-03-31 |
Podocyte YAP and TAZ hyperactivation drives glomerular epithelial proliferative diseases in mice and humans
2025-Jun-25, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adq3852
PMID:40560997
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研究论文 | 本研究通过免疫染色和空间转录组学分析，揭示了足细胞中YAP和TAZ的异常过度激活是驱动肾小球上皮细胞增殖性疾病的共同机制 | 首次发现足细胞YAP-TAZ过度激活是多种肾小球上皮增殖性疾病的共同驱动因子，为这类疾病提供了统一的致病机制解释 | 研究主要基于小鼠模型和人类活检样本，需要进一步验证在更广泛人群中的普适性 | 探究肾小球上皮细胞增殖性疾病的共同致病机制 | 人类肾活检样本（塌陷性肾小球病和ANCA血管炎诱导的新月体性肾小球肾炎患者）及小鼠模型 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 免疫染色，空间转录组学 | NA | 图像，空间转录组数据 | 人类肾活检样本（具体数量未明确说明） | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 587 | 2026-03-31 |
Pseudoassembly of k-mers
2025-May-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.11.653354
PMID:40463286
|
研究论文 | 本文介绍了一种通过彩色de Bruijn图识别基因组序列变异的方法，并实现了名为klue的程序进行伪组装 | 提出基于彩色de Bruijn图的伪组装方法，能够从单细胞RNA-seq数据中识别细胞类型特异性变异 | NA | 开发一种识别基因组序列变异的新方法 | 小鼠黑色素瘤模型中的单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA-seq | 彩色de Bruijn图 | 基因组序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 588 | 2026-03-31 |
Molecular and Biophysical Perspectives on Dormancy Breaking: Lessons from Yeast Spore
2025-05-11, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15050701
PMID:40427594
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综述 | 本文综述了当前关于细胞休眠分子机制的知识，特别聚焦于两种主要酵母模型，并总结了通过单细胞RNA-seq、蛋白质组学分析和活细胞成像等多方面方法揭示的基因表达、蛋白质组组成和活力的动态变化 | 整合了分子和生物物理视角，特别是通过研究细胞质流动性变化来理解休眠细胞调控，提供了对休眠和休眠打破过程的新理解 | NA | 阐明休眠和休眠打破的分子和生物物理原理 | 酵母孢子作为模型系统，以及广泛的物种如细菌、真菌、植物和缓步动物 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学分析, 活细胞成像 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 589 | 2026-03-30 |
Microbiota shape the colon epithelium controlling inter-crypt absorptive goblet cells via butyrate-GP R109A signalling
2025-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2573045
PMID:41208257
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学等方法，揭示了肠道微生物通过丁酸-GPR109A信号通路调控结肠上皮中具有吸收和分泌特征的非常规杯状细胞，从而影响结肠上皮细胞组成和功能 | 首次发现微生物通过丁酸及其受体GPR109A调控结肠隐窝间吸收性杯状细胞，揭示了微生物驱动上皮可塑性的新机制 | NA | 探究微生物来源信号如何影响结肠上皮细胞身份和功能 | 结肠上皮细胞，特别是非常规隐窝间杯状细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学，抗生素介导的微生物耗竭，无菌小鼠，小鼠定植实验 | NA | 转录组数据 | 小鼠和人类样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 590 | 2026-03-30 |
RAB25 modulates pit cell commitment by coordinating transforming growth factor-alpha secretion from gastric epithelial cells
2025-Dec-09, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08316-2
PMID:41365858
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研究论文 | 本文探讨了RAB25通过协调胃上皮细胞分泌转化生长因子-α来调控胃小凹细胞命运决定的作用 | 首次揭示RAB25在胃环境中通过调节TGFA分泌来维持正常谱系决定的生理功能，并关联到人类Ménétrier's疾病 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，人类疾病关联性证据尚有限 | 探究胃中EGFR配体来源及其调控机制，以理解谱系决定的分子基础 | 胃上皮细胞、小鼠模型、人类Ménétrier's疾病样本 | 单细胞生物学 | 胃疾病 | 单细胞RNA测序、小鼠原代细胞培养 | NA | 单细胞RNA测序数据、组织样本 | 未明确指定样本数量，涉及小鼠模型和人类疾病样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 591 | 2026-03-30 |
Integration of elemental imaging and spatial transcriptomic profiling for proof-of-concept metals-based pathway analysis of colon tumor microenvironment
2025-Oct-14, Metallomics : integrated biometal science
IF:2.9Q3
DOI:10.1093/mtomcs/mfaf034
PMID:41042257
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研究论文 | 本研究通过整合元素成像和空间转录组学，对结直肠癌肿瘤微环境中的金属依赖性信号通路进行了概念验证分析 | 首次将元素成像与空间转录组学整合，实现了组织范围内金属-基因相互作用的全面探索，突破了传统孤立研究金属或基因的局限 | 本研究仅为单样本概念验证，样本量有限，未来需要扩大患者队列进行验证 | 探索肿瘤微环境中金属丰度、转运机制、细胞分布与肿瘤进展相关生物通路（如代谢、胶原重塑）之间的复杂相互作用 | 结直肠癌肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 结直肠癌 | 元素成像、空间转录组学、基因表达相关性分析 | 空间多模态工作流程 | 图像、基因表达数据、细胞组成数据、组织病理学特征 | 单一样本（结直肠癌肿瘤） | NA | 空间转录组学、元素成像 | NA | NA |
| 592 | 2026-03-30 |
Conditional Ablation of PKCλ/ι in CD4+ T Cells Ameliorates Hepatic Fibrosis in Schistosoma japonicum-Infected Mice via T Follicular Helper (Tfh) Cell Suppression Coupled with Increased Follicular Regulatory T (Tfr) and Regulatory B (Breg) Cell Activities
2025-10-09, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15101430
PMID:41154658
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研究论文 | 本研究通过构建CD4+ T细胞特异性PKCλ/ι条件性敲除小鼠模型，探讨了PKCλ/ι在血吸虫感染诱导的肝纤维化中的作用机制 | 首次在CD4+ T细胞中条件性敲除PKCλ/ι，揭示了其通过调控Tfh/Tfr细胞平衡和Breg细胞功能来减轻肝纤维化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中验证；单细胞测序样本量有限；具体信号通路细节有待进一步阐明 | 探究PKCλ/ι在血吸虫感染诱导的肝纤维化中的免疫调节作用 | 感染日本血吸虫的小鼠模型，重点关注CD4+ T细胞、Tfh细胞、Tfr细胞和Breg细胞 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序，流式细胞术，RT-qPCR，ELISA，转录组分析 | 条件性基因敲除小鼠模型 | RNA测序数据，流式细胞数据，基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 593 | 2026-03-30 |
Transcriptome Analysis Unravels CD4+ T-Cell and Treg-Cell Differentiation in Ovarian Cancer
2025-08-27, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom15091241
PMID:41008548
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研究论文 | 本研究通过整合多个单细胞RNA-seq数据集，对卵巢癌中肿瘤浸润CD4+ T细胞和调节性T细胞（Tregs）的分化进行了全面的转录组分析 | 整合了七个多中心卵巢癌单细胞RNA-seq数据集，构建了强大的元数据资源，并利用BayesPrism算法从TCGA批量RNA-seq数据中量化Tregs，对患者进行分层 | 研究主要基于转录组数据，功能验证相对有限；样本来源为回顾性数据集，需要前瞻性研究进一步验证 | 研究卵巢癌中肿瘤浸润CD4+ T细胞，特别是调节性T细胞（Tregs）的分化、功能及其对预后的影响 | 卵巢癌患者肿瘤组织中的CD4+ T细胞和调节性T细胞（Tregs） | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | BayesPrism算法 | 转录组数据 | OCSCDs数据集包含7个数据集，总计137,648个单细胞；使用了TCGA数据集和5个独立的批量RNA-seq队列进行验证 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 594 | 2026-03-30 |
Interpretable niche-based cell‒cell communication inference using multi-view graph neural networks
2025-06, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-025-00809-6
PMID:40425827
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研究论文 | 本文介绍了一种基于空间转录组学的细胞间通讯推断工具STCase，利用多视图图神经网络识别细胞类型的生态位并揭示生态位特异性通讯事件 | 提出首个考虑生态位异质性的单细胞/斑点水平细胞间通讯推断方法，通过可解释的多视图图神经网络和CCC感知注意力机制 | NA | 开发能够捕捉生态位特异性细胞间通讯的计算工具 | 人类支气管腺体和口腔鳞状细胞癌组织 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 空间转录组学 | 多视图图神经网络 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 595 | 2026-03-30 |
Multimodal learning for mapping genotype-phenotype dynamics
2025-04, Nature computational science
IF:12.0Q1
DOI:10.1038/s43588-024-00765-7
PMID:39875699
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研究论文 | 本研究提出了一个计算集成遗传学框架，用于同时分析和解释基因型及其相关表型的高维景观，并开发了一个多模态基础模型来探索人类转录组学在细胞水平上的基因型-表型关系流形 | 整合单细胞RNA测序等高通量基因分型方法与语言模型等先进学习方法，构建了一个用于分析基因型-表型动态关系的多模态基础模型，能够以更高分辨率解析细胞异质性 | NA | 解析复杂基因表达模式如何产生复杂表型这一生物学基本问题，探索基因表达与表型表现之间的动态相互作用 | 人类转录组学数据，特别是内皮细胞中的von Willebrand因子（VWF）基因 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 语言模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 596 | 2026-03-29 |
Consensus Molecular Subtypes (CMS) Classification: a progress towards Subtype-Driven treatments in colorectal cancer
2025-Nov-24, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-025-04117-1
PMID:41276825
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综述 | 本文综述了结直肠癌共识分子分型（CMS）的分类、预后预测作用、识别方法及其在指导个体化治疗中的应用与挑战 | 系统总结了基于基因表达谱、免疫组化（IHC）和基于深度学习的图像分类器（imCMS）等多种CMS识别方法，并探讨了利用单细胞RNA测序解决肿瘤内异质性（ITH）等新兴策略 | 肿瘤内异质性（ITH）和技术障碍阻碍了CMS分类在临床中的广泛采用 | 回顾CMS分类在结直肠癌中的预后和预测作用，评估其指导个体化治疗的潜力，并探讨临床应用的障碍与解决方案 | 结直肠癌（CRC）及其共识分子亚型（CMS1-4） | 数字病理学 | 结直肠癌 | 基因表达谱分析，免疫组化（IHC），单细胞RNA测序，基于计算模型的图像分类（如深度学习） | 深度学习 | 基因表达数据，组织图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 597 | 2026-03-29 |
Lessons learned from spatial transcriptomic analyses in clear-cell renal cell carcinoma
2025-11, Nature reviews. Urology
DOI:10.1038/s41585-024-00980-x
PMID:39789293
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综述 | 本文总结了空间转录组学在透明细胞肾细胞癌研究中的应用和发现 | 首次系统回顾了空间转录组学在透明细胞肾细胞癌中的研究，揭示了肿瘤微环境的空间异性和相互作用 | 目前仅针对透明细胞肾细胞癌这一亚型，且技术应用尚处于早期阶段 | 探讨空间转录组学在肾细胞癌研究中的潜力和应用价值 | 透明细胞肾细胞癌的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 598 | 2026-03-29 |
Gene-regulatory programs that specify age-related differences during thymocyte development
2025-Jul-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115903
PMID:40570375
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研究论文 | 本研究构建了新生和成年小鼠T细胞发育的转录和染色质可及性图谱，揭示了年龄相关差异的基因调控程序 | 通过整合转录组和染色质可及性数据，结合CRISPR扰动与单细胞RNA测序，鉴定了调控T细胞发育年龄差异的保守转录因子Zbtb20 | 研究仅基于小鼠模型，未在人类样本中验证，且单细胞测序技术可能受限于细胞捕获效率和测序深度 | 探究T细胞发育过程中年龄相关差异的基因调控机制 | 新生和成年小鼠的胸腺细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序, 染色质可及性分析, CRISPR扰动 | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 新生和成年小鼠的胸腺细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 599 | 2026-03-29 |
SwarmMAP: Swarm Learning for Decentralized Cell Type Annotation in Single Cell Sequencing Data
2025-Jan-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.13.632775
PMID:39868099
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研究论文 | 本文开发了一种名为SwarmMAP的基于群体学习（Swarm Learning）的机器学习方法，用于在单细胞测序数据中以去中心化的方式自动进行细胞类型注释 | 首次将群体学习应用于单细胞测序数据的细胞类型注释，实现了在无需交换原始数据的情况下进行去中心化模型训练，解决了数据隐私和可扩展性问题 | 摘要中未明确提及具体的研究局限性 | 开发一种标准化、自动化且保护隐私的跨数据集细胞类型注释方法 | 人类心脏、肺和乳腺组织的单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 单细胞测序 | 基于Swarm Learning的机器学习模型 | 单细胞转录组数据 | 摘要中未提供具体样本数量，涉及多个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 600 | 2026-03-28 |
Protocol for decoding immune predictors of response to immunotherapy through pan-cancer multiomics analysis
2025-Dec-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104183
PMID:41187056
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研究论文 | 本文提出了一种通过单细胞RNA测序、单细胞免疫分析和质谱流式细胞术分析多种癌症中T细胞动态的方案 | 整合了单细胞多组学技术和基因调控网络分析，以识别与免疫检查点阻断反应相关的T细胞亚群和预测性生物标志物 | NA | 解码免疫治疗响应的免疫预测因子 | 多种癌症中的T细胞 | 数字病理学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序, 单细胞免疫分析, 质谱流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 免疫分析数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |