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当前共找到 10769 篇文献，本页显示第 5961 - 5980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5961 | 2025-10-06 |
Single-cell spatial transcriptomics reveals distinct patterns of dysregulation in non-neuronal and neuronal cells induced by the Trem2R47H Alzheimer's risk gene mutation
2025-Feb, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-024-02651-0
PMID:39103533
|
研究论文 | 通过单细胞空间转录组学分析Trem2R47H阿尔茨海默病风险基因突变对非神经元和神经元细胞的差异性调控模式 | 首次使用MERFISH空间转录组技术系统揭示Trem2突变在不同脑区细胞类型中的特异性转录调控，发现独立于淀粉样蛋白病理的神经元BDNF信号通路改变 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；样本数量相对有限（19个脑切片） | 探究Trem2R47H突变在阿尔茨海默病背景下对大脑不同细胞类型的转录调控影响 | 野生型、Trem2突变、5xFAD和Trem2;5xFAD基因型小鼠的皮层和皮层下脑区细胞 | 空间转录组学 | 阿尔茨海默病 | MERFISH空间转录组学 | 自定义分析流程 | 空间基因表达数据、神经病理学数据 | 19个小鼠脑切片 | NA | 空间转录组学 | MERFISH | MERFISH空间转录组技术 |
| 5962 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomic clocks reveal cell proximity effects in brain ageing
2025-Feb, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-024-08334-8
PMID:39695234
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研究论文 | 本研究通过构建空间分辨单细胞转录组脑图谱，开发空间衰老时钟模型揭示细胞邻近效应对脑衰老的影响 | 首次开发空间衰老时钟模型，系统揭示T细胞和神经干细胞通过邻近效应对脑组织衰老与再生的调控作用 | 研究主要基于小鼠模型，在人类组织中的适用性需要进一步验证 | 探究细胞间邻近效应在脑组织衰老过程中的作用机制 | 420万个脑细胞，涵盖20个不同年龄阶段和两种再生干预措施（运动和部分重编程） | 空间转录组学 | 神经退行性疾病 | 单细胞转录组测序，空间转录组学 | 机器学习，深度学习 | 空间转录组数据 | 420万个细胞，20个年龄阶段 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5963 | 2025-10-06 |
Deciphering the cell type-specific and zonal distribution of drug-metabolizing enzymes, transporters, and transcription factors in livers of mice using single-cell transcriptomics
2025-Feb, Drug metabolism and disposition: the biological fate of chemicals
DOI:10.1016/j.dmd.2024.100029
PMID:39919554
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研究论文 | 利用单细胞转录组学解析小鼠肝脏中药物代谢酶、转运蛋白和转录因子的细胞类型特异性及区域分布 | 首次系统性地表征了药物处理基因在不同肝脏细胞类型和区域中的基线mRNA富集情况 | 基于已发表的单细胞和细胞核转录组数据集进行分析，未进行新的实验验证 | 解析小鼠肝脏中药物处理基因的细胞类型特异性和区域分布特征 | 小鼠肝脏细胞（包括肝细胞、胆管细胞、内皮细胞、库普弗细胞、星状细胞、肌成纤维细胞和免疫细胞） | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组测序, 空间转录组学 | Seurat V5 | 单细胞转录组数据, 细胞核转录组数据 | 已发表的单细胞和细胞核转录组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5964 | 2025-10-06 |
Cell-specific transcriptional signatures of vascular cells in Alzheimer's disease: perspectives, pathways, and therapeutic directions
2025-Jan-29, Molecular neurodegeneration
IF:14.9Q1
DOI:10.1186/s13024-025-00798-0
PMID:39876020
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综述 | 本文综述了阿尔茨海默病中脑血管细胞特异性转录特征及其治疗前景 | 整合单细胞转录组学研究揭示AD脑血管细胞特异性转录特征及细胞间通讯异常 | 基于已发表文献的综述，未包含新的实验数据 | 探讨阿尔茨海默病中脑血管细胞的转录特征及潜在治疗方向 | 人脑尸检组织中的脑血管细胞（内皮细胞、壁细胞等）及其亚型 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学 | NA | 转录组数据,神经影像数据,神经病理数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 5965 | 2025-10-06 |
Organ-specific microenvironments drive divergent T cell evolution in acute graft-versus-host disease
2025-Jan-29, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.ads1298
PMID:39879321
|
研究论文 | 本研究通过非人灵长类动物模型探索急性移植物抗宿主病中组织特异性T细胞免疫反应的机制 | 首次在aGVHD模型中系统揭示不同器官微环境驱动T细胞转录程序分化的机制，证明这种分化与抗原特异性无关 | 研究基于非人灵长类动物模型，结果向人类临床转化的有效性需要进一步验证 | 探究组织特异性微环境在急性移植物抗宿主病中对T细胞编程的影响机制 | 非人灵长类动物急性移植物抗宿主病模型中的组织浸润T细胞 | 系统免疫学 | 移植物抗宿主病 | 多参数流式细胞术, 转录组分析, 单细胞RNA测序, TCR测序 | NA | 单细胞转录组数据, TCR序列数据, 流式细胞数据 | 非人灵长类动物aGVHD模型 | NA | 单细胞RNA测序, TCR测序 | NA | NA |
| 5966 | 2025-10-06 |
Meta-analyses of mouse and human prostate single-cell transcriptomes reveal widespread epithelial plasticity in tissue regression, regeneration, and cancer
2025-Jan-17, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01432-w
PMID:39825401
|
研究论文 | 通过小鼠和人类前列腺单细胞转录组的荟萃分析，揭示组织回归、再生和癌症中广泛的上皮细胞可塑性 | 首次使用随机矩阵理论去噪和最优传输方法比较跨物种上皮细胞群体，发现雄激素依赖的细胞可塑性机制 | 基于已有数据集的分析，可能受原始数据质量和样本来源限制 | 阐明前列腺组织稳态和肿瘤进展过程中上皮细胞状态的动态变化 | 小鼠和人类前列腺组织 | 单细胞转录组学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | 随机矩阵理论，最优传输算法 | 单细胞转录组数据 | 多个已发表和新的scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5967 | 2025-10-06 |
Transformer-based modeling of Clonal Selection and Expression Dynamics reveals resistance mechanisms in breast cancer
2025-Jan-10, NPJ systems biology and applications
IF:3.5Q1
DOI:10.1038/s41540-024-00485-8
PMID:39794360
|
研究论文 | 提出一种基于Transformer的深度学习模型TraCSED，用于分析乳腺癌中克隆选择和基因表达动态，揭示耐药机制 | 开发了首个基于Transformer的动态深度学习方法来建模克隆选择过程，能够识别与克隆选择相关的可解释基因程序及其时间动态 | 仅针对乳腺癌特定治疗药物进行研究，未验证在其他癌症类型或治疗方案的普适性 | 研究癌症细胞转录异质性及其对治疗反应的影响，识别耐药机制 | 乳腺癌细胞系，使用giredestrant（选择性ER拮抗剂和降解剂）或palbociclib（CDK4/6抑制剂）处理的细胞 | 机器学习 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，克隆条形码技术 | Transformer | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5968 | 2025-10-06 |
CSI-GEP: A GPU-based unsupervised machine learning approach for recovering gene expression programs in atlas-scale single-cell RNA-seq data
2025-Jan-08, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2024.100739
PMID:39788105
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研究论文 | 开发了一种基于GPU的无监督机器学习方法CSI-GEP，用于从大规模单细胞RNA测序数据中恢复基因表达程序 | 提出首个基于GPU的无监督学习方法，能够在大规模单细胞RNA测序数据中一致且可扩展地推断基因表达程序 | 未详细说明参数选择的具体方法，且仅在小鼠脑图谱和人类肿瘤数据集上验证 | 开发可扩展的无监督学习方法以更好地分析单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达程序 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 无监督机器学习 | 基因表达数据 | 220万个小鼠脑细胞及人类肿瘤和细胞系数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5969 | 2025-10-06 |
Hypoxia-inducible factor 2 regulates alveolar regeneration after repetitive injury in three-dimensional cellular and in vivo models
2025-Jan-08, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adk8623
PMID:39772774
|
研究论文 | 本研究通过三维细胞和体内模型揭示了缺氧诱导因子2在重复损伤后肺泡再生中的调控作用 | 首次发现HIF2信号通路在异常上皮细胞中的持续激活，并证明靶向抑制HIF2可促进功能性肺泡修复 | 研究主要基于动物模型和类器官，需要进一步验证在人类患者中的效果 | 探究特发性肺纤维化中异常上皮细胞出现和持续存在的机制 | IPF患者、小鼠模型、小鼠肺泡类器官、人远端肺类器官 | 数字病理学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序, 遗传谱系追踪 | NA | 基因表达数据 | IPF患者和小鼠模型的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5970 | 2025-10-06 |
A single-cell compendium of human cerebrospinal fluid identifies disease-associated immune cell populations
2025-Jan-02, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI177793
PMID:39744938
|
研究论文 | 通过整合公共数据集和自身研究，构建了包含139名受试者的人类脑脊液单细胞转录组图谱，揭示了神经系统疾病相关的免疫细胞群体 | 发现了CSF中特有的AREG+树突状细胞新亚群，并在多发性硬化症患者中更为丰富 | 研究主要基于现有数据集整合，可能受到原始数据质量和一致性的限制 | 建立脑脊液免疫细胞的单细胞转录组参考图谱，用于神经系统疾病研究 | 人类脑脊液和血液样本中的免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | 数据整合分析 | 单细胞转录组数据 | 139名受试者，包含135份脑脊液样本和58份血液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5971 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing before and after Light Chain Escape Reveals Intrapatient Multiple Myeloma Subpopulations with Divergent Osteolytic Gene Expression
2025-01-01, Cancer research communications
IF:2.0Q3
DOI:10.1158/2767-9764.CRC-24-0170
PMID:39699274
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究多发性骨髓瘤患者轻链逃逸现象，揭示与骨溶解基因表达相关的肿瘤亚群 | 首次在单细胞水平追踪轻链逃逸现象，发现LAMP5过表达与骨溶解风险的新关联 | 研究基于单个患者的纵向样本，样本量有限 | 理解多发性骨髓瘤中轻链逃逸现象的分子机制和临床意义 | 多发性骨髓瘤患者骨髓活检样本 | 单细胞组学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序，药物敏感性测试，拷贝数变异推断 | NA | 单细胞转录组数据，临床血清数据 | 1名患者在诊断时、首次复发和复发/难治时间点的系列骨髓活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5972 | 2025-10-06 |
Graph-Based 3-Dimensional Spatial Gene Neighborhood Networks of Single Cells in Gels and Tissues
2025, BME frontiers
IF:5.0Q1
DOI:10.34133/bmef.0110
PMID:40084126
|
研究论文 | 开发了3D空间基因邻域网络嵌入方法，用于识别亚细胞基因邻近关系和细胞间通讯中的关键亚细胞模式 | 结合3D成像空间转录组学和图深度学习，首次在三维空间中分析亚细胞基因邻近关系 | 三维空间数据复杂度增加，需要新的分析方法，未明确说明样本量大小 | 识别亚细胞基因邻近关系和细胞间通讯中的关键亚细胞模式 | 间充质干细胞、外周血单核细胞、小鼠下丘脑和皮层中的星形胶质细胞与神经元 | 空间转录组学 | NA | 3D成像空间转录组学、多重误差鲁棒荧光原位杂交(MERFISH) | 图自编码器 | 3D空间转录组数据、图像数据 | NA | NA | 空间转录组学、3D成像 | NA | NA |
| 5973 | 2025-10-06 |
Comprehensive sequencing of the lung neuroimmune landscape in response to asthmatic induction
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1518771
PMID:40181989
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研究论文 | 本研究通过多组学测序技术全面解析哮喘诱导下肺神经免疫图谱的转录组变化 | 首次结合单核RNA测序与空间转录组学揭示哮喘诱导下迷走神经节和肺组织中神经免疫转录组的细胞簇特异性及空间分布特征 | 研究仅使用小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究哮喘诱导如何改变肺神经免疫转录组 | 小鼠迷走神经节（结状/颈静脉神经节）和肺组织 | 空间转录组学 | 哮喘 | RNA测序, 单核RNA测序, 空间RNA测序 | NA | 转录组数据 | 初始状态和经链格孢诱导的哮喘小鼠模型 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学, 标准RNA测序 | NA | NA |
| 5974 | 2025-10-06 |
CRABP2 promotes peritoneal metastasis in CRC through TGF-β/Smad-mediated EMT signaling and invadopodia formation
2025-Oct, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111927
PMID:40505846
|
研究论文 | 本研究探讨CRABP2通过TGF-β/Smad介导的上皮间质转化信号和侵袭伪足形成促进结直肠癌腹膜转移的机制 | 首次揭示CRABP2作为腹膜转移相关基因通过调控侵袭伪足形成和EMT信号通路促进结直肠癌转移的新机制 | CRABP2在腹膜转移中的具体调控网络仍需进一步验证 | 阐明CRABP2在结直肠癌腹膜转移中的作用机制 | 结直肠癌细胞和患者样本 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 体外实验, 体内实验 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5975 | 2025-10-06 |
Identification of lactylation-related hub genes as novel therapeutic and diagnostic targets for thoracic aortic dissection
2025-Oct, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111944
PMID:40527360
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研究论文 | 本研究通过鉴定乳酸化相关枢纽基因，探索其在胸主动脉夹层中的治疗和诊断价值 | 首次系统研究乳酸化修饰在胸主动脉夹层中的作用，发现12个乳酸化相关枢纽基因并验证LDHA抑制剂的有效性 | 研究主要基于数据库分析和动物模型，需要进一步临床验证 | 探索乳酸化修饰在胸主动脉夹层发病机制中的作用并寻找新的治疗靶点 | 胸主动脉夹层患者组织样本和BAPN诱导的小鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, ROC分析, WGCNA | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 人类主动脉组织和BAPN诱导的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5976 | 2025-10-06 |
Rab27a+CAF exosomal miR-9-5p promotes osteosarcoma progression via CREBRF/MAPK signaling pathway
2025-Oct, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2025.111964
PMID:40581265
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研究论文 | 本研究揭示了Rab27a+癌相关成纤维细胞通过外泌体miR-9-5p抑制CREBRF并激活MAPK信号通路促进骨肉瘤进展的新机制 | 首次发现Rab27a+CAF来源的外泌体miR-9-5p通过CREBRF/MAPK信号轴调控骨肉瘤恶性进展和化疗耐药 | 研究主要聚焦于miR-9-5p/CREBRF/MAPK轴，可能存在其他未被探索的调控机制 | 探究癌相关成纤维细胞外泌体miRNA在骨肉瘤进展中的作用机制 | 骨肉瘤患者血清和组织样本、骨肉瘤细胞系、小鼠皮下移植瘤模型 | 肿瘤生物学 | 骨肉瘤 | 小RNA测序、单细胞RNA测序、qRT-PCR、双荧光素酶报告基因检测、CCK8、Edu染色、细胞周期分析、细胞凋亡检测 | NA | RNA测序数据、基因表达数据、功能实验数据 | 骨肉瘤患者血清和组织样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序,小RNA测序 | NA | NA |
| 5977 | 2025-10-06 |
Amorphous calcium zinc phosphate promotes macrophage-driven alveolar bone regeneration via modulation of energy metabolism and mitochondrial homeostasis
2025-Oct, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2025.06.053
PMID:40677756
|
研究论文 | 本研究开发了无定形钙锌磷酸盐纳米颗粒并通过调节巨噬细胞能量代谢促进牙槽骨再生 | 首次发现ACZP材料通过抑制IP3R/MCU通路、调节内质网-线粒体耦联和能量代谢方式（糖酵解向氧化磷酸化转换）来增强巨噬细胞的抗炎表型极化 | 研究仅在新西兰白兔模型中进行验证，尚未进行人体临床试验 | 探索钙磷酸盐材料促进骨形成的免疫调节机制并开发新型骨再生材料 | 巨噬细胞和新西兰白兔的牙槽骨缺损模型 | 组织工程与再生医学 | 牙槽骨缺损 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 新西兰白兔牙槽骨缺损模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5978 | 2025-10-06 |
Tumor-associated Schwann cells promote salivary adenoid cystic carcinoma stem-like reprogramming via IGF2/IGF1R induced histone H3 lysine 18 lactylation
2025-Sep-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217847
PMID:40466903
|
研究论文 | 本研究揭示了肿瘤相关雪旺细胞通过IGF2/IGF1R信号轴诱导组蛋白H3K18乳酸化修饰，促进唾液腺腺样囊性癌干细胞样重编程的分子机制 | 首次发现TA-SCs通过旁分泌IGF2信号提升组蛋白乳酸化水平，并阐明IGF2/IGF1R-H3K18la轴在SACC干细胞样重编程中的关键作用 | TA-SCs重编程的具体分子通路细节仍需进一步探索，临床转化潜力有待验证 | 探究肿瘤相关雪旺细胞在唾液腺腺样囊性癌进展和干细胞样重编程中的功能机制 | 唾液腺腺样囊性癌肿瘤微环境中的雪旺细胞和肿瘤细胞 | 肿瘤微环境研究 | 唾液腺腺样囊性癌 | 组织透明化三维成像, 单细胞RNA测序, 转录组分析 | NA | 图像数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5979 | 2025-10-06 |
Dynamic evolution of venetoclax resistance in acute myeloid leukemia unveiled by longitudinal single-cell RNA-seq
2025-Sep-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217853
PMID:40482912
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研究论文 | 通过纵向单细胞RNA测序揭示急性髓系白血病中venetoclax耐药的动态演化过程 | 首次在单细胞分辨率下系统描绘venetoclax治疗期间骨髓微环境重塑的动态过程，发现两种关键耐药机制并建立预后预测模型 | 样本量相对有限，需要在更大队列中进一步验证 | 研究急性髓系白血病患者对venetoclax治疗的耐药机制和骨髓微环境动态变化 | 接受DAV方案治疗的急性髓系白血病患者骨髓标本 | 单细胞测序分析 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | 预后预测模型 | 单细胞转录组数据 | AML患者治疗前后配对骨髓标本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5980 | 2025-10-06 |
Characterizing chromosome instability reveals its association with lipid-associated macrophages and clonal evolution of lymph node metastasis in esophageal squamous cell carcinoma
2025-Sep-28, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217874
PMID:40516322
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了染色体不稳定性在食管鳞癌淋巴结转移中的作用机制 | 首次发现染色体不稳定性通过易错DNA双链断裂修复途径与脂质相关巨噬细胞形成新型关联，促进淋巴结转移 | 研究样本量有限，机制验证仍需进一步实验 | 探究染色体不稳定性在食管鳞癌淋巴结转移中的作用及机制 | 食管鳞癌患者组织样本、类器官模型及淋巴结转移灶 | 癌症基因组学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 全外显子测序, 基因组测序, 空间蛋白质分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | 食管鳞癌临床标本及类器官模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |