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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5801 | 2025-10-06 |
Combination antiretroviral therapy and MCL-1 inhibition mitigate HTLV-1 infection in vivo
2025-Sep-04, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2025.06.023
PMID:40645177
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研究论文 | 本研究通过建立人源化小鼠模型,评估联合抗逆转录病毒疗法与MCL-1抑制剂对HTLV-1c感染的预防和治疗效果 | 首次发现HTLV-1c感染导致细胞内在凋亡失调,并证明MCL-1特异性抑制剂(而非其他BCL-2家族蛋白抑制剂)能有效清除HTLV-1c感染细胞 | 研究基于人源化小鼠模型,临床转化效果需进一步验证 | 开发针对HTLV-1c感染的有效预防和治疗策略 | 人源化小鼠模型和HTLV-1c感染细胞 | 传染病学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序, 细胞内流式细胞术 | 人源化小鼠模型 | 基因表达数据, 流式细胞数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 5802 | 2025-10-06 |
Bone marrow immune remodeling in depression: TNF/NF-κB mediated leukocyte redistribution and construction of an interpretable predictive model
2025-Sep-04, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.115487
PMID:40911995
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研究论文 | 本研究通过建立心理应激小鼠模型,系统研究了应激诱导的免疫失调机制,并构建了基于外周血参数的抑郁症预测模型 | 揭示了TNF/NF-κB通路介导的骨髓免疫重塑在应激诱导抑郁症中的调控作用,并构建了可解释的机器学习预测模型 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化价值需要进一步验证 | 探索抑郁症的神经免疫相互作用机制并开发临床诊断生物标志物 | 心理应激小鼠模型 | 机器学习 | 抑郁症 | 单细胞RNA测序,蛋白质相互作用网络,机器学习,SHAP分析 | 随机森林(RF) | 血液细胞参数,转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 心理应激小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5803 | 2025-10-06 |
Recognition of molecular clusters and a novel prognostic signature based on natural killer cell-related genes in skin cutaneous melanoma
2025-Sep-03, World journal of surgical oncology
IF:2.5Q1
DOI:10.1186/s12957-025-03975-z
PMID:40903770
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研究论文 | 基于自然杀伤细胞相关基因识别皮肤黑色素瘤的分子亚型并构建新型预后特征 | 首次基于NK细胞相关基因对皮肤黑色素瘤进行分子分型,并构建了12基因预后特征 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 开发皮肤黑色素瘤的预后预测模型和治疗靶点 | 皮肤黑色素瘤患者样本 | 生物信息学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, 实时定量PCR, 体细胞突变分析 | 多机器学习算法组合, Cox回归分析 | 基因表达数据, 临床数据 | 来自TCGA、GEO、GTEx等公共数据库的皮肤黑色素瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 5804 | 2025-10-06 |
NUTM2A-AS1 as a potential key regulator in cancer: unraveling its ceRNA networks and impact on tumor biology
2025-Sep-03, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03019-y
PMID:40903777
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综述 | 本文全面综述了长链非编码RNA NUTM2A-AS1在多种癌症中的ceRNA调控网络及其对肿瘤生物学的影响 | 系统揭示了NUTM2A-AS1作为ceRNA通过不同miRNA-mRNA轴在多种癌症中的调控机制,并首次整合其在八种不同癌症类型中的功能 | 主要基于现有文献综述,缺乏原创性实验验证和临床数据支持 | 阐明NUTM2A-AS1在癌症发生发展中的调控机制及其临床转化潜力 | NUTM2A-AS1长链非编码RNA及其在多种癌症中的ceRNA网络 | 生物信息学 | 多种癌症 | 生物信息学分析,CRISPR,单细胞RNA测序 | NA | 文献数据,表达谱数据,临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5805 | 2025-10-06 |
Establishment of Drosophila intestinal cell lines as tools for multiomic screening and deciphering intestinal biology
2025-Sep-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-17336-z
PMID:40897748
|
研究论文 | 本研究首次建立了果蝇肠道细胞系,为肠道生物学研究提供了新工具 | 首次成功建立果蝇肠道来源的细胞系,填补了该领域长期缺乏细胞系资源的空白 | NA | 建立果蝇肠道细胞系作为多组学筛选工具并解析肠道生物学 | 果蝇肠道细胞 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3个细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5806 | 2025-10-06 |
Single cell RNA seq reveals the pro-regenerative phenotype of thrombospondin-2 deficient dermal fibroblasts
2025-Sep-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-15839-3
PMID:40897801
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示血小板反应蛋白-2缺陷型真皮成纤维细胞具有促再生表型 | 首次在单细胞水平揭示TSP2缺陷导致真皮成纤维细胞异质性改变,发现Sox10+多能祖细胞富集和纤维化亚群减少 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需验证 | 探究TSP2缺陷对真皮成纤维细胞异质性和组织修复能力的影响 | 野生型和TSP2敲除小鼠皮肤成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 组织修复与再生 | 单细胞RNA测序, 免疫染色, 计算机模拟分析 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | WT和TSP2 KO小鼠皮肤成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5807 | 2025-10-06 |
Spatial transcriptomics of retinoblastoma: a visual window on intra-patient heterogeneity
2025-Sep-02, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-14814-5
PMID:40898088
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析视网膜母细胞瘤的组织学异质性,首次实现相邻分子亚型的空间定位 | 首次在视网膜母细胞瘤中实现分子亚型1和2的相邻空间定位,揭示组织学特征与分子谱的强相关性 | 仅分析单个病例样本,样本量有限,需要更多病例验证 | 探索视网膜母细胞瘤的组织学异质性与分子亚型的关系 | 视网膜母细胞瘤患者眼球切除标本中的不同分化区域 | 空间转录组学 | 视网膜母细胞瘤 | 空间转录组学,免疫组织化学 | 聚类分析 | 空间转录组数据,组织图像 | 1例原发性视网膜母细胞瘤病例,16个感兴趣区域 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5808 | 2025-10-06 |
A single-cell transcriptome atlas of pig skin reveals cellular heterogeneity from embryonic development to postnatal aging
2025-Sep-02, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02390-w
PMID:40898171
|
研究论文 | 构建了涵盖10个发育阶段的猪皮肤单细胞转录组图谱,揭示了从胚胎发育到出生后衰老的细胞异质性变化 | 首次在猪皮肤中构建从胚胎期到老年期的完整单细胞图谱,发现新型AUTS2⁺成纤维细胞亚型及其神经调节功能 | 研究主要基于猪模型,人类直接适用性需要进一步验证 | 解析皮肤从胚胎发育到衰老过程中的细胞动态变化和分子机制 | 荣昌猪皮肤组织 | 单细胞组学 | 皮肤衰老 | 单细胞RNA测序 | 伪时间轨迹分析,跨物种比较分析 | 单细胞转录组数据 | 443,529个细胞,涵盖胚胎第56天至出生后7年共10个发育阶段 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5809 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome analysis profiles cellular and molecular alterations in aortic tissue from patients with Behçet's syndrome
2025-Sep-01, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keaf252
PMID:40372706
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序分析白塞综合征患者主动脉组织的细胞和分子变化 | 首次在单细胞水平揭示白塞综合征患者主动脉组织的细胞组成变化和细胞间通讯异常 | 样本量较小(仅3例患者和3例对照),需更大样本验证 | 分析白塞综合征患者主动脉组织中不同细胞亚群的表达谱、表型、功能和细胞间通讯 | 白塞综合征患者和动脉粥样硬化患者的主动脉组织 | 数字病理学 | 白塞综合征 | 单细胞RNA测序 | Seurat, Harmony, CellChat | 单细胞转录组数据 | 6例参与者(3例白塞综合征,3例动脉粥样硬化) | SeekOne | 单细胞RNA测序 | SeekOne® MM High Flux Single Cell Transcriptome Kit V4.1 | SeekOne® MM高通量单细胞转录组试剂盒V4.1 |
| 5810 | 2025-10-06 |
LaGrACE: estimating gene program dysregulation with latent regulatory network
2025-Sep, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.1038/s44320-025-00115-3
PMID:40588571
|
研究论文 | 提出了一种名为LaGrACE的新方法,用于结合组学数据和临床信息评估基因程序的失调情况 | 开发了能够整合组学数据和临床信息来估计基因程序失调的新方法,并在单细胞分辨率下有效识别药物反应信号 | NA | 开发评估基因程序失调的方法以增强疾病亚群中分子机制的发现 | 合成数据、bulk RNA-seq临床数据集(乳腺癌、慢性阻塞性肺疾病)和单细胞RNA-seq药物扰动数据集 | 机器学习 | 乳腺癌,慢性阻塞性肺疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 潜在调控网络模型 | 基因表达数据, 临床数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5811 | 2025-10-06 |
A semi-supervised Bayesian approach for marker gene trajectory inference from single-cell RNA-seq data
2025-Sep-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf454
PMID:40802529
|
研究论文 | 提出了一种名为BayesTraj的半监督贝叶斯框架,用于从单细胞RNA测序数据中推断标记基因轨迹 | 将轨迹推断从无监督学习转变为半监督学习,整合谱系拓扑和标记基因表达的先验知识,通过概率混合模型和参数函数捕获基因动态 | 未明确说明方法对特定类型数据或实验条件的适用性限制 | 从静态单细胞转录组数据中准确推断细胞发育轨迹和命运转换 | 单细胞RNA测序数据中的细胞发育轨迹 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯概率模型,Hamiltonian Monte Carlo | 单细胞转录组数据 | 模拟数据集和真实数据集 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 5812 | 2025-10-06 |
Cytoplasmic dynamics are overlooked in single nuclei RNA-seq but can be rescued by CytoRescue, a generative AI model to recover cytoplasm enriched gene
2025-Aug-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.15.670239
PMID:40894560
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研究论文 | 开发了一种名为CytoRescue的生成式AI模型,用于恢复单核RNA测序数据中被削弱的细胞质富集基因表达信号 | 首次提出专门针对单核RNA测序数据中细胞质信号恢复的生成式AI模型,能够有效恢复细胞质富集基因的表达 | 未明确说明模型在哪些特定组织类型或条件下的适用性限制 | 解决单核RNA测序技术中细胞质信号缺失的根本限制,增强其转录组分析的全面性 | 单核RNA测序数据中的细胞质富集基因 | 机器学习 | 肺癌 | 单核RNA测序,生成式AI | 生成式AI模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 5813 | 2025-10-06 |
Spatial and multi-omic profiling reveals genes and pathways associated with cytotoxic lymphocyte infiltration in malignant rhabdoid tumor
2025-Aug-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7303174/v1
PMID:40894019
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和多组学分析揭示恶性横纹肌样瘤中细胞毒性淋巴细胞浸润的相关基因和通路 | 首次结合空间转录组学和多组学技术系统分析MRT肿瘤免疫微环境特征,发现候选肿瘤抗原多样性、抗原加工呈递基因上调与'热'肿瘤免疫微环境的强关联 | 样本量有限,未明确说明具体样本数量;部分基因名称在摘要中未完整呈现 | 探究恶性横纹肌样瘤中免疫细胞浸润的分子机制和特征 | 恶性横纹肌样瘤样本 | 空间转录组学 | 恶性横纹肌样瘤 | 空间转录组学, 多组学分析 | NA | 空间转录组数据, 多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 5814 | 2025-10-06 |
Systematic characterization of cell type-specific master metabolic regulators in Alzheimer's disease
2025-Aug-18, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7207381/v1
PMID:40894034
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研究论文 | 本研究开发了scFUMES算法,系统性地识别了阿尔茨海默病中细胞类型特异性的主要代谢调控因子 | 开发了整合多组学数据的scFUMES算法,首次在细胞类型特异性水平系统揭示了AD中的主要代谢调控因子及其网络基础 | 研究主要基于计算预测,实验验证相对有限,需要更多功能研究确认调控机制 | 揭示阿尔茨海默病中细胞类型特异性的代谢调控网络和主要代谢调控因子 | 人脑组织中的神经元、小胶质细胞等脑细胞类型 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 相互作用组学, 基因组学, 转录组学, 代谢组学 | scFUMES算法 | 多组学数据 | 来自大型人脑生物样本库的样本,涉及中颞回和背外侧前额叶皮层两个AD易感区域 | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学整合分析 | NA | NA |
| 5815 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptomic Changes in Patient-Derived Glioma and U87 Glioblastoma Cell Cultures Infected with the Oncolytic Virus VV-GMCSF-Lact
2025-07-20, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26146983
PMID:40725231
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析溶瘤病毒VV-GMCSF-Lact感染人胶质瘤细胞后的转录组变化 | 首次在单细胞水平比较患者来源胶质瘤细胞、非恶性脑细胞和U87胶质母细胞瘤细胞对溶瘤病毒的转录反应 | 研究仅针对特定溶瘤病毒株VV-GMCSF-Lact,未与其他病毒疗法比较 | 探究溶瘤病毒治疗胶质瘤的细胞特异性反应机制 | 患者来源胶质瘤细胞、非恶性脑细胞、U87胶质母细胞瘤细胞系 | 单细胞转录组学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 患者来源胶质瘤细胞培养物和U87细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5816 | 2025-10-06 |
Inflammatory, Functional, and Compositional Changes of the Uterine Immune Microenvironment in a Lymphangioleiomyomatosis Mouse Model
2025, Journal of cellular immunology
DOI:10.33696/immunology.7.227
PMID:40893807
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术探究淋巴管平滑肌瘤病小鼠模型中子宫免疫微环境的炎症、功能和组成变化 | 首次在子宫特异性Tsc2基因敲除小鼠模型中揭示子宫自然杀伤细胞功能失调促进LAMCore细胞肺转移的新机制 | 研究基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究淋巴管平滑肌瘤病中子宫免疫微环境变化与肿瘤细胞转移的关系 | 子宫特异性Tsc2基因敲除小鼠模型中的子宫免疫细胞 | 单细胞生物学 | 淋巴管平滑肌瘤病 | 单细胞RNA测序, ELISA, 流式细胞术, 免疫组化, 功能实验 | 基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据, 蛋白质浓度数据, 细胞表型数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5817 | 2025-10-06 |
Deciphering cellular heterogeneity and pathway dynamics in urinary samples: a UMAP-Based approach to understanding acute kidney injury
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1573469
PMID:40900831
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研究论文 | 本研究通过UMAP分析尿液单细胞RNA测序数据,揭示急性肾损伤中的细胞异质性和ECM相关通路变化 | 首次在AKI尿液样本中应用UMAP分析细胞异质性,并发现MAPK1在ECM通路中的关键调控作用 | 使用公开数据集,样本量有限,需要进一步实验验证临床意义 | 探索急性肾损伤尿液样本中的细胞组成和基因表达模式 | AKI和非AKI患者的尿液单核细胞 | 单细胞基因组学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | UMAP | 单细胞基因表达数据 | 公开数据集GSE180595中的AKI和非AKI患者尿液样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5818 | 2025-10-06 |
Tumor associated neutrophils promote prostate cancer progression by mediating neutrophil trap secretion through PSMA1- NF-κB-HIF-1α signaling axis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1467357
PMID:40901472
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研究论文 | 本研究通过整合临床数据分析、机器学习模型和单细胞测序技术,揭示了肿瘤相关中性粒细胞通过PSMA1-NF-κB-HIF-1α信号轴介导中性粒细胞陷阱分泌促进前列腺癌进展的新机制 | 首次发现PSMA1-NF-κB-HIF-1α信号轴调控中性粒细胞陷阱形成的新机制,并建立了基于6个基因的前列腺癌预后预测模型 | 回顾性研究设计,样本量未明确说明,需要在更大规模的前瞻性研究中验证 | 探索肿瘤相关中性粒细胞在前列腺癌进展中的作用机制并建立预后预测模型 | 前列腺癌患者临床数据、前列腺癌类器官模型 | 肿瘤免疫学 | 前列腺癌 | 单细胞测序、LASSO回归分析、机器学习、多变量回归分析、反卷积算法 | LASSO回归、机器学习模型 | 临床数据、基因表达数据、单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5819 | 2025-10-06 |
Elevated THOC5 expression in liver cancer and its implications for tumor progression and therapeutic response
2025, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2025.1596120
PMID:40901498
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研究论文 | 本研究探讨THOC5基因在多种癌症中的表达及其在肝细胞癌中的预后价值和治疗意义 | 首次系统分析THOC5在多种癌症中的表达模式,揭示其在肝细胞癌中的预后价值及与免疫治疗反应的关系 | 主要依赖公共数据集和体外实验,缺乏体内动物模型验证 | 研究THOC5基因在癌症中的表达特征、预后价值及治疗意义 | 多种癌症类型,特别关注肝细胞癌(LIHC) | 癌症生物学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, RNA-seq, 免疫组化, 蛋白质组分析, 伤口愈合实验, Transwell迁移实验 | NA | 基因表达数据, 蛋白质数据, 细胞功能数据 | 公共数据集中的多种癌症样本,肝细胞癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, RNA-seq, 蛋白质组分析 | NA | NA |
| 5820 | 2025-10-06 |
Uncovering key biomarkers, potential therapeutic targets and development of deep learning model in heart failure
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0330780
PMID:40901835
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研究论文 | 通过生物信息学分析和深度学习模型识别心力衰竭的关键生物标志物和潜在治疗靶点 | 结合多种生物信息学方法识别出四个关键基因,并首次开发基于卷积神经网络的诊断模型 | 基于公共数据库的回顾性分析,需要进一步实验验证 | 探索心力衰竭的分子机制并开发诊断模型 | 心力衰竭相关基因表达数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 基因表达分析, 单细胞RNA测序, 分子对接 | CNN | 基因表达数据 | 公共数据库中的心力衰竭相关样本 | NA | 单细胞RNA测序, 基因表达分析 | NA | NA |