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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 561 | 2025-12-12 |
Streamlining single-cell spatial transcriptomics for human kidney tissue
2025 Sep-Oct, BioTechniques
IF:2.2Q4
DOI:10.1080/07366205.2025.2591484
PMID:41324332
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研究论文 | 本文介绍了一种新的细胞区域归一化方法和流程,用于从NanoString CosMx单细胞空间转录组平台数据中注释15种肾脏细胞类型,并比较健康与疾病样本 | 开发了一种新颖的细胞区域归一化方法,提高了空间转录组数据分析的敏感性,并将流程集成到BioTuring SpatialX平台,使无生物信息学背景的用户也能进行空间数据分析 | 未明确说明样本量是否足够大以代表更广泛的疾病群体,且可能依赖于特定平台(CosMx)的数据 | 简化单细胞空间转录组学分析流程,以促进人类肾脏组织的研究和疾病比较 | 人类肾脏组织样本,包括两个健康肾脏活检和两个疾病样本(糖尿病肾病) | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 4个样本(2个健康肾脏活检,2个疾病样本) | NanoString | 单细胞空间转录组学 | CosMx | NanoString CosMx单细胞分辨率空间转录组平台 |
| 562 | 2025-12-12 |
Cancer-associated fibroblast-derived fibulin-5 promotes radioresistance in non-small-cell lung cancer
2025-Aug-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116018
PMID:40711881
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研究论文 | 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞(CAFs)通过分泌Fibulin-5促进非小细胞肺癌放疗抵抗的机制 | 首次发现CAFs来源的Fibulin-5通过整合素αVβ5受体激活Src-STAT3通路,下调ACSL4,抑制辐射诱导的铁死亡,从而介导放疗抵抗 | NA | 鉴定预测放疗疗效的CAFs表达分子并阐明非小细胞肺癌的放疗抵抗机制 | 非小细胞肺癌 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学,单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 563 | 2025-12-12 |
Super-resolution imaging informed scRNA sequencing analysis reveals the critical role of GDF15 in rejuvenating aged hematopoietic stem cells
2025-Jun, Blood science (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/BS9.0000000000000236
PMID:40416726
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研究论文 | 本研究通过结合超分辨率成像与单细胞RNA测序,揭示了GDF15在调控衰老造血干细胞线粒体形态与功能中的关键作用 | 首次将活细胞超分辨率显微镜与单细胞RNA测序技术整合,建立了线粒体形态与分子特征之间的直接关联,并发现了GDF15在衰老造血干细胞中线粒体信号传导的新功能 | 研究样本量相对较小(约200个细胞),且仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 探究衰老造血干细胞中线粒体形态变化的分子机制及其对细胞命运的影响 | 年轻与衰老小鼠的造血干细胞 | 单细胞组学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序, 超分辨率显微镜 | 生物信息学分析流程 | 图像数据, 基因表达数据 | 约200个来自年轻和衰老小鼠的造血干细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 564 | 2025-12-12 |
STAT3 signaling enhances tissue expansion during postimplantation mouse development
2025-Apr-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115506
PMID:40188437
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研究论文 | 本研究探讨了STAT3信号在小鼠胚胎植入后发育过程中对组织扩张的增强作用 | 揭示了STAT3在胚胎发育时间控制中的新角色,特别是在需要快速细胞分裂的组织中,如植入后外胚层和造血谱系 | 研究主要基于小鼠模型,人类相关性仅通过STAT3突变与身材矮小的关联间接暗示 | 探究STAT3信号在胚胎植入后发育过程中的功能 | 小鼠胚胎、Stat3敲除胚胎干细胞、野生型细胞 | 发育生物学 | NA | RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 小鼠外胚层组织、Stat3敲除胚胎干细胞 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 565 | 2025-12-12 |
Heterogeneity of tertiary lymphoid structures predicts the response to neoadjuvant therapy and immune microenvironment characteristics in triple-negative breast cancer
2025-Feb, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-024-02917-y
PMID:39658606
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序、多重免疫荧光染色和影像组学技术,评估了三阴性乳腺癌患者新辅助治疗前后三级淋巴结构的异质性及其与肿瘤微环境和治疗反应的关系 | 首次系统评估了三阴性乳腺癌中三级淋巴结构的异质性,并开发了基于影像的生物标志物评分系统来预测其状态和新辅助治疗效果 | 未明确说明样本量大小,且研究可能受限于单中心数据 | 探究三级淋巴结构在三阴性乳腺癌新辅助治疗中的免疫调节作用及其预测价值 | 三阴性乳腺癌患者样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 多重免疫荧光染色, 影像组学 | NA | RNA序列数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 566 | 2025-12-12 |
Deciphering the Complexities of Pulmonary Hypertension: The Emergent Role of Single-Cell Omics
2025-Jan, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0145PS
PMID:39141563
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综述 | 本文综述了单细胞组学技术在肺动脉高压研究中的应用,探讨了其如何推动对该疾病复杂性的理解 | 强调了单细胞转录组学在揭示肺动脉高压中细胞生态系统、识别新型治疗靶点以及通过连接组分析阐明细胞相互作用方面的创新作用 | 面临单细胞RNA测序分辨率需提升、人体组织样本处理存在物流障碍以及需要整合多种组学方法以全面理解疾病分子基础的挑战 | 探讨单细胞组学技术在肺动脉高压研究中的角色,以促进精准医疗目标的实现 | 肺动脉高压中的细胞类型,包括内皮细胞、平滑肌细胞、周细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 567 | 2025-12-11 |
IL-1β-mediated suppression of CIITA attenuates IFN-γ-induced MHC-II expression on Fibroblasts
2025-Dec-10, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-025-02575-4
PMID:41366425
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研究论文 | 本研究揭示了IL-1β通过抑制CIITA表达来减弱IFN-γ诱导的成纤维细胞MHC-II表达的分子机制 | 首次在成纤维细胞中确定了IFN-γ/STAT1/CIITA轴是MHC-II表达的核心调控通路,并发现IL-1β是该通路的新型抑制剂 | 研究主要在体外细胞模型中进行,体内肿瘤微环境的复杂性可能影响机制的普适性 | 探究肿瘤相关成纤维细胞中MHC-II表达的上游细胞因子调控机制 | 癌症相关成纤维细胞 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 流式细胞术、转录组分析、qRT-PCR、慢病毒转导、CRISPR/Cas9基因编辑、scRNA-seq、ATAC-seq、ChIP-seq | NA | 流式细胞数据、转录组数据、表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序、ATAC测序、ChIP测序 | NA | NA |
| 568 | 2025-12-11 |
Exploring the pathogenic mechanism of RNH1 in colorectal cancer based on eQTL, Multi-omics and deep learning
2025-Dec-10, Journal of applied genetics
IF:2.0Q3
DOI:10.1007/s13353-025-01029-4
PMID:41366589
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研究论文 | 本研究基于eQTL、多组学和深度学习探索RNH1在结直肠癌中的致病机制 | 首次结合SMR、单细胞RNA测序、空间转录组测序和深度学习生存神经网络(DeepSurv)系统研究RNH1在结直肠癌中的作用,并关联新发现的细胞死亡方式——双硫死亡 | 研究主要基于生物信息学分析和体外验证,缺乏体内实验验证RNH1的具体分子机制 | 探索RNH1在结直肠癌中的致病机制及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | 结直肠癌组织样本、RNH1基因 | 机器学习 | 结直肠癌 | eQTL分析、多组学分析、深度学习、单细胞RNA测序、空间转录组测序、RNA测序、qPCR | DeepSurv(深度学习生存神经网络) | 基因组数据、转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 未明确具体样本数量,但包括结直肠癌患者癌组织和正常组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组测序, RNA测序 | NA | NA |
| 569 | 2025-12-11 |
Identification of Crohn's disease subtypes in single cell RNA sequencing signatures of treatment naïve samples across the paediatric gastrointestinal tract
2025-Dec-10, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjaf225
PMID:41369126
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,在未接受治疗的儿科克罗恩病患者中,识别了疾病亚型并揭示了跨胃肠道区域的转录组特征 | 开发了聚类稳定性评估工作流程以确保结果稳健性,并首次在未治疗儿科患者中应用张量分解技术,将供体分层为临床有意义的组别 | 研究样本量有限,且疾病异质性可能影响细胞比例分析的准确性 | 研究克罗恩病发病初期的单细胞转录组特征,以识别疾病亚型和潜在治疗靶点 | 未接受治疗的儿科克罗恩病患者的回肠、结肠和直肠活检组织 | 单细胞转录组学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | 张量分解 | 单细胞转录组数据 | 未明确具体数量,但为儿科克罗恩病队列的活检样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 570 | 2025-12-11 |
Turkey oviduct epithelial organoids express region-associated markers and avian influenza virus receptor†
2025-Dec-10, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf274
PMID:41369270
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫荧光染色验证了火鸡输卵管上皮类器官的区域特异性标记物和禽流感病毒受体表达 | 首次构建了火鸡生殖道的单细胞图谱框架,并验证了类器官模型在保留区域分子特征和病毒受体表达方面的适用性 | 样本量较小(仅涉及两只性成熟母鸡),且为探索性研究,需要进一步验证和扩展 | 验证火鸡输卵管上皮类器官模型的区域特异性标记物和禽流感病毒受体表达,以支持其作为体外模型的应用 | 火鸡(Meleagris gallopavo)的输卵管六个区域(漏斗部、膨大部、峡部、子宫、子宫阴道连接部和阴道)的组织及衍生类器官 | 单细胞组学 | 禽流感 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、批量RNA测序、免疫荧光染色 | 类器官模型 | RNA序列数据、图像数据 | 两只性成熟母鸡的输卵管组织,衍生类器官样本(n=2用于批量RNA测序,n=4用于免疫荧光染色) | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 571 | 2025-12-11 |
Microglia Display Heterogeneous Initial Responses to Disseminated Tumor Cells
2025-Dec-10, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-3425
PMID:41369553
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研究论文 | 本研究通过体内命运图谱成像、单细胞RNA测序和全息光转换技术,揭示了小胶质细胞在脑转移早期对播散肿瘤细胞的异质性反应 | 首次结合多种技术追踪同一动物体内肿瘤命运和小胶质细胞早期动态反应,发现小胶质细胞表型可通过抑制TGF-β信号或删除肿瘤抗原CD24a/CD47进行调控 | 研究主要聚焦早期转移阶段,未全面探讨晚期转移中系统免疫抑制的影响 | 探究脑转移早期小胶质细胞的异质性反应及其调控机制 | 小鼠模型中的播散肿瘤细胞和脑内小胶质细胞 | 数字病理学 | 脑转移癌 | 单细胞RNA测序, 全息光转换技术 | NA | 图像, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 572 | 2025-12-11 |
Clusterin Drives Fiber Endocytosis by Mesothelial Cells to Resolve Liver Fibrosis
2025-Dec-10, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2025.08.022
PMID:41369634
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研究论文 | 本研究揭示了簇集蛋白(CLU)通过其受体LRP2驱动间皮细胞纤维内吞以缓解肝纤维化的新机制,并设计了一种模拟CLU的肽段CLUtide,展示了其治疗潜力 | 首次发现CLU由中央静脉周围衰老肝细胞分泌,并通过LRP2受体特异性作用于肝间皮细胞,诱导其增殖、迁移并内吞纤维,从而缓解肝纤维化;并成功设计出具有治疗潜力的模拟肽CLUtide | 研究主要在动物模型中进行,CLUtide的临床疗效和安全性尚未在人体中得到验证 | 探究簇集蛋白(CLU)在肝纤维化中的作用机制及治疗潜力 | 肝纤维化患者和小鼠模型、CLU基因敲除小鼠、间皮细胞特异性LRP2敲除小鼠 | 数字病理学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序、免疫荧光 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据、图像数据 | 患者和小鼠的肝组织样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 573 | 2025-12-11 |
Exploring the role of PANoptosis in idiopathic pulmonary fibrosis based on scRNA-seq and bulk-seq
2025-Dec-10, Clinical and experimental medicine
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s10238-025-01990-8
PMID:41369928
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序和转录组数据,探索PANoptosis在特发性肺纤维化发病机制中的作用 | 首次将PANoptosis(一种整合了细胞焦亡、凋亡和坏死性凋亡的新型程序性细胞死亡形式)的概念引入特发性肺纤维化研究,并基于此构建了诊断预测模型 | 研究主要基于公共数据集和动物模型,需要在更大规模的人类临床样本中进行验证 | 阐明PANoptosis在特发性肺纤维化发病机制中的作用,并开发基于相关基因的诊断预测模型 | 特发性肺纤维化患者及动物模型的肺组织 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | 单细胞RNA测序,转录组测序,qRT-PCR | 加权基因共表达网络分析,机器学习方法 | 基因表达数据 | 基于公共数据集GSE227136(具体样本数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 574 | 2025-12-11 |
Vinculin influences essential processes in enteric nervous system development and Hirschsprung disease pathogenesis
2025-Dec-09, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI198531
PMID:41364504
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研究论文 | 本研究探讨了Vinculin在肠神经系统发育及先天性巨结肠症发病机制中的作用 | 首次将Vinculin突变与先天性巨结肠症关联,并通过单细胞和空间转录组学揭示了其在细胞间互作和信号通路中的枢纽作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限,且未深入探讨VCL在其他神经系统疾病中的潜在作用 | 阐明Vinculin在肠神经系统发育和先天性巨结肠症中的功能机制 | Vinculin基因突变、小鼠模型(Vcl条件敲除和Ptn敲除)、肠神经系统细胞 | 生物医学研究 | 先天性巨结肠症 | 全基因组测序、单细胞转录组学、空间RNA测序、体外实验 | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 575 | 2025-12-11 |
CD8+ T cells in the tumor microenvironment modulate response to endocrine therapy in breast cancer
2025-Dec-09, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI188458
PMID:41364532
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研究论文 | 本研究探讨了肿瘤免疫微环境(TIME)中CD8+ T细胞通过分泌CXCL11调控激素受体阳性(HR+)乳腺癌对内分泌治疗(如来曲唑)的反应 | 首次揭示了CD8+ T细胞通过CXCL11-CXCR3/CXCR7轴促进HR+乳腺癌细胞在雌激素剥夺条件下的生长,从而介导内分泌治疗耐药 | 研究主要基于体外细胞系实验和有限的患者活检样本,缺乏大规模临床队列验证,且体内机制和临床转化潜力需进一步探索 | 阐明肿瘤免疫微环境如何影响激素受体阳性乳腺癌对内分泌治疗的反应 | 激素受体阳性乳腺癌患者活检组织、HR+乳腺癌细胞系(MCF7、T47D)及CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | RNA测序、循环免疫荧光、空间转录组学、细胞共培养 | NA | 组织切片图像、基因表达数据、空间转录组数据 | 接受来曲唑治疗的HR+乳腺癌患者治疗前后活检样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 576 | 2025-12-11 |
Nectin-4 reduces T cell effector function and is a therapeutic target in pancreatic cancer
2025-Dec-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.194290
PMID:41364531
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研究论文 | 本研究通过多色流式细胞术、免疫组化和单细胞RNA测序分析,揭示了Nectin-4在胰腺癌中抑制T细胞效应功能,并作为治疗靶点,使用抗体药物偶联物enfortumab vedotin在患者来源的PDAC类器官中抑制肿瘤生长 | 首次发现Nectin-4(而非CD155)与胰腺癌不良预后相关,并证明其能抑制T细胞效应细胞因子产生,为PDAC提供了新的治疗靶点 | 研究主要基于体外实验和患者样本分析,缺乏体内动物模型验证,且临床疗效需进一步在患者中测试 | 探索胰腺导管腺癌(PDAC)中TIGIT轴配体和受体的作用,并评估Nectin-4作为治疗靶点的潜力 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者肿瘤和血液样本、患者来源的PDAC类器官 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 多色流式细胞术、免疫组化、单细胞RNA测序 | NA | 图像、文本(基因表达数据) | 来自不同阶段PDAC患者的肿瘤和血液样本,以及患者来源的PDAC类器官 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 577 | 2025-12-11 |
Longitudinal profiling of tumor and immune compartments uncovers patterns of dysregulation and associations with response in multiple myeloma
2025-Dec-09, Blood cancer discovery
IF:11.5Q1
DOI:10.1158/2643-3230.BCD-25-0205
PMID:41364805
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研究论文 | 本研究通过多组学分析,揭示了多发性骨髓瘤中肿瘤与免疫微环境的动态相互作用,并识别了与治疗反应相关的生物标志物 | 首次在纵向研究中结合单细胞RNA测序和批量测序,全面剖析了多发性骨髓瘤的免疫微环境变化,并发现了幼稚B细胞重建作为持久反应的新生物标志物 | 样本量相对有限(102名患者),且主要基于骨髓样本,可能无法完全代表全身性免疫状态 | 探究多发性骨髓瘤治疗反应和疾病进展的免疫相关因素 | 多发性骨髓瘤患者及其骨髓样本中的肿瘤细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 全基因组测序 | NA | 基因表达数据, 基因组数据 | 243个骨髓样本(来自102名患者,共631,226个细胞)和209个样本的批量测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 全基因组测序 | NA | NA |
| 578 | 2025-12-11 |
RAB25 modulates pit cell commitment by coordinating transforming growth factor-alpha secretion from gastric epithelial cells
2025-Dec-09, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08316-2
PMID:41365858
|
研究论文 | 本文探讨了RAB25通过协调胃上皮细胞分泌转化生长因子-α来调控胃小凹细胞分化的生理作用 | 首次揭示了RAB25在胃环境中通过调节TGFA分泌来维持正常细胞谱系分化的生理机制,并关联了人类Ménétrier's疾病 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类疾病关联性证据尚需进一步验证 | 探究胃中EGFR信号调控细胞谱系分化的分子机制 | 胃上皮细胞、小鼠模型、人类Ménétrier's疾病样本 | 单细胞组学 | 胃疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 579 | 2025-12-11 |
Early skin seeding regulatory T cells modulate PPARγ-dependent skin pigmentation
2025-Dec-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66229-2
PMID:41365874
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研究论文 | 本文研究了新生儿皮肤中早期定居的调节性T细胞(ETregs)如何通过调控PPARγ信号通路影响皮肤色素沉着 | 首次揭示了ETregs在出生后第一周对皮肤色素沉着的关键作用,并发现其通过PPARγ信号通路调控毛囊黑色素干细胞 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据仅来自白癜风患者的单细胞转录组分析,样本量有限 | 探究早期皮肤定居Tregs在皮肤发育和色素沉着中的功能机制 | 小鼠新生儿皮肤调节性T细胞、毛囊黑色素干细胞、PPARγ信号通路 | 免疫学与皮肤生物学 | 白癜风 | 单细胞转录组分析、基因表达谱分析、免疫细胞耗竭 | NA | 单细胞转录组数据、基因表达数据 | 小鼠新生儿皮肤样本,人类白癜风患者和健康对照的皮肤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 580 | 2025-12-11 |
Functional KCC2 expression marks an evolutionarily conserved population of early-maturing interneurons in the perinatal cortex
2025-Dec-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67270-x
PMID:41365903
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研究论文 | 本研究通过识别和表征小鼠皮层中一类表达KCC2的早期成熟中间神经元,揭示了GABA能功能成熟在中间神经元亚群中的异质性,并证明了该群体在人类中的进化保守性 | 首次在小鼠皮层中识别出一类在胚胎期就表达KCC2、出生时即具有超极化GABA反应的早期成熟中间神经元亚群,并证明其在人类中存在进化保守性 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据的验证仍需进一步扩展;对早期成熟中间神经元的具体功能回路贡献尚未完全阐明 | 探究皮层中间神经元GABA能反应功能成熟的时间模式异质性,并寻找早期成熟中间神经元的分子标记 | 小鼠及人类皮层中间神经元 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,差异基因表达分析 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据,电生理记录数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |