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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5721 | 2025-10-06 |
Shared Lineage, Distinct Outcomes: Yap and Taz Loss Differentially Impact Schwann and Olfactory Ensheathing Cell Development Without Disrupting GnRH-1 Migration
2025-Feb-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.13.638196
PMID:40027653
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了嗅鞘细胞和雪旺细胞的共同起源及遗传差异,并探讨了Yap和Taz缺失对这两种细胞发育的不同影响 | 首次发现Yap和Taz缺失对嗅鞘细胞和雪旺细胞发育产生不同影响,同时证明GnRH-1神经元迁移不受这些变化影响 | 研究仅限于小鼠胚胎模型,尚未在人类或其他物种中验证 | 探究Hippo通路在嗅鞘细胞发育中的作用及其对GnRH-1神经元迁移的影响 | 小鼠胚胎鼻组织中的嗅鞘细胞、雪旺细胞、黑色素细胞和GnRH-1神经元 | 发育生物学 | 神经系统发育疾病 | 单细胞RNA测序,条件性基因敲除 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 单细胞转录组数据,组织学图像 | 小鼠胚胎鼻组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5722 | 2025-10-06 |
Comparison of CD30L and OX40L Reveals CD30L as a Promising Therapeutic Target in Atopic Dermatitis
2025-Feb, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16412
PMID:39589186
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研究论文 | 比较CD30L和OX40L在特应性皮炎中的作用,发现CD30L是一个有前景的治疗靶点 | 首次系统比较CD30L和OX40L在特应性皮炎中的作用,证明CD30L阻断具有与IL-13和OX40L阻断相似的治疗效果 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床效果需要进一步验证 | 评估CD30L作为特应性皮炎治疗靶点的潜力 | 人类AD皮肤病变样本和小鼠AD模型 | 免疫学 | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个AD患者皮肤病变的scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5723 | 2025-10-06 |
Connecting genomic results for psychiatric disorders to human brain cell types and regions reveals convergence with functional connectivity
2025-01-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55611-1
PMID:39755698
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研究论文 | 通过整合基因组关联研究与单细胞转录组图谱,识别精神疾病相关的关键脑细胞类型和脑区 | 首次将基因组关联研究结果与成人脑单细胞转录组图谱及功能磁共振连接性数据相结合,揭示精神疾病的细胞类型和脑区特异性 | 研究基于现有基因组关联研究数据,可能受样本量和人群特异性的限制 | 识别精神疾病和脑功能特征相关的关键脑细胞类型和脑区 | 精神分裂症、双相情感障碍、重度抑郁症患者及智力、教育程度、神经质相关人群 | 生物信息学 | 精神疾病 | 全基因组关联研究(GWAS), 单细胞RNA测序, 功能磁共振成像 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 神经影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 功能磁共振成像 | NA | NA |
| 5724 | 2025-10-06 |
Comprehensive analysis of pyroptosis-related genes in psoriasis and targeted gene editing of CASP1 and CASP5 using lipid nanoparticles to alleviate skin inflammation
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1639869
PMID:40771724
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研究论文 | 通过生物信息学分析焦亡相关基因在银屑病中的作用,并利用脂质纳米颗粒递送CRISPR-Cas9靶向编辑CASP1和CASP5基因以缓解皮肤炎症 | 首次系统分析焦亡相关基因在银屑病中的表达特征,并开发基于脂质纳米颗粒的基因编辑治疗策略 | 研究主要基于公共数据集和动物模型,需要进一步临床验证 | 探讨焦亡在银屑病发病机制中的作用并开发基因治疗新策略 | 银屑病患者数据、IMQ诱导的银屑病小鼠模型、角质形成细胞 | 生物信息学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序、CRISPR-Cas9基因编辑、生物信息学分析 | 机器学习算法、风险评分模型 | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 公共数据集中的银屑病患者样本、IMQ诱导的银屑病小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5725 | 2025-10-06 |
WISP1 drives esophageal squamous cell carcinoma progression via modulation of cancer-associated fibroblasts and immune microenvironment
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1586790
PMID:40771797
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研究论文 | 本研究探讨WISP1通过调控癌症相关成纤维细胞和免疫微环境促进食管鳞状细胞癌进展的机制 | 首次深入揭示WISP1在ESCC中通过调控CAFs功能和ECM重塑影响肿瘤进展的多重作用机制 | 研究主要基于公共数据库数据和体外实验,缺乏体内实验验证 | 探究WISP1在食管鳞状细胞癌中的表达特征、临床意义及其作用机制 | 食管鳞状细胞癌患者数据、癌症相关成纤维细胞和癌细胞系 | 生物信息学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序、生物信息学分析、细胞培养实验 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据、临床数据 | 从公共数据库获取的ESCC患者数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5726 | 2025-10-06 |
Autonomic nervous system development-related signature as a novel predictive biomarker for immunotherapy in pan-cancers
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1611890
PMID:40771813
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研究论文 | 开发基于自主神经系统发育相关特征的泛癌免疫治疗预测模型 | 首次将自主神经系统发育相关特征作为免疫治疗预测生物标志物,构建了跨癌种的预测模型 | 需要进一步临床验证,样本来源多样可能影响模型泛化能力 | 开发新的免疫治疗预测生物标志物以提高治疗反应预测准确性 | 多种癌症类型的单细胞和批量RNA测序数据,临床样本 | 机器学习 | 泛癌研究 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序,RT-PCR,免疫组化 | 随机森林,多种机器学习方法 | RNA测序数据,基因表达数据 | 34个单细胞RNA测序数据集和8个批量RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 5727 | 2025-10-06 |
Machine learning analysis of ARVC informed by sodium channel protein-based interactome networks
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1611342
PMID:40771922
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研究论文 | 本研究通过机器学习分析结合钠通道蛋白互作网络,识别并验证了山柰酚作为治疗致心律失常性右室心肌病的潜在化合物 | 首次将机器学习模型与基于单细胞RNA测序的蛋白质互作网络相结合,用于预测ARVC治疗化合物 | 研究主要基于大鼠模型和心脏类器官验证,尚未进行临床前动物模型或临床试验 | 识别治疗致心律失常性右室心肌病的新型化合物 | ARVC大鼠模型、心脏类器官、钠通道蛋白SCN5A | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, Western blotting, ELISA, MEA, Masson染色 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据, 蛋白质互作网络数据 | ARVC大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5728 | 2025-10-06 |
Deciphering the tumor ecosystem dynamics undergoing immunochemotherapy therapy across multiple cancer types unveils the immunosuppressive role of S100A4 in fibroblasts by promoting PD-L1 expression in tumor cells
2025, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2025.1613296
PMID:40772225
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研究论文 | 通过跨癌种单细胞测序揭示S100A4在成纤维细胞中通过促进肿瘤细胞PD-L1表达介导免疫抑制和治疗抵抗的作用机制 | 构建首个跨癌种单细胞图谱,发现CAFs分泌的S100A4是驱动PD-L1上调的保守介质 | 需要在更大队列和机制研究中进一步验证 | 解析新辅助治疗期间肿瘤生态系统动态变化,识别免疫抑制和治疗抵抗的关键介质 | 五种实体瘤(食管鳞癌、食管胃结合部癌、结直肠癌、宫颈癌、三阴性乳腺癌) | 数字病理 | 多癌种 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, Western blot | 非负矩阵分解 | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | 五种癌症类型的单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5729 | 2025-10-06 |
Targeting SPATS2 in lung adenocarcinoma: implications for prognosis and immune-based therapy
2025-Aug-08, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03179-7
PMID:40779087
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研究论文 | 本研究探讨SPATS2在肺腺癌中的表达模式及其与预后和免疫治疗的关系 | 首次系统评估SPATS2在肺腺癌中的多功能作用,包括其与基因组变异、免疫浸润和线粒体功能的关联 | 研究主要基于生物信息学分析,实验验证仅限于体外细胞模型,需要更多体内实验验证 | 阐明SPATS2在肺腺癌发生发展中的作用机制及其临床意义 | 肺腺癌患者组织样本和A549细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 转录组分析, 单细胞RNA测序, siRNA干扰, 线粒体功能检测 | 生物信息学分析模型, 细胞模型 | 转录组数据, 基因组数据, 单细胞测序数据, 实验数据 | 来自TCGA、GTEx、GEO和TISCH数据库的多组数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 5730 | 2025-10-06 |
Integrating single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics reveals the therapeutic effect of nitazoxanide in head and neck squamous cell carcinoma
2025-Aug-08, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03372-8
PMID:40779144
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了硝唑尼特在头颈部鳞状细胞癌中的治疗作用机制 | 首次将单细胞RNA测序与空间转录组学相结合研究硝唑尼特在HNSCC中的作用,并发现其通过调控NKX2-3、PINK1、BIRC5和CDKN2A基因影响自噬过程 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验验证,缺乏体内实验和临床数据支持 | 探索硝唑尼特在头颈部鳞状细胞癌中的治疗潜力及其作用机制 | 头颈部鳞状细胞癌(HNSCC) | 生物信息学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,差异表达分析,功能富集分析,风险预后模型,WGCNA,突变分析,L1000FWD分析 | 风险预后模型,列线图模型 | 基因表达数据,单细胞数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 5731 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals the sphingolipid metabolism pathway plays an important role in leaf senescence in tobacco
2025-Aug-06, BMC plant biology
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12870-025-07051-2
PMID:40764913
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了烟草叶片衰老过程中鞘脂代谢通路的重要作用 | 首次在衰老烟草叶片中构建单细胞转录组图谱,发现鞘脂代谢通路基因在衰老过程中显著上调 | 研究仅基于转录组数据,需要进一步实验验证SPT等基因在叶片衰老中的具体调控机制 | 阐明烟草叶片衰老过程的分子机制 | 烟草叶片组织 | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 17,100个高质量细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5732 | 2025-10-06 |
β-Sitosterol improves murine ulcerative colitis by inhibiting the expression of ribosomal proteins and the attempted polarization of type 1 macrophages
2025-Aug-05, International journal of colorectal disease
IF:2.5Q1
DOI:10.1007/s00384-025-04974-y
PMID:40762728
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研究论文 | 本研究证实β-谷甾醇通过抑制核糖体信号通路关键基因表达和MΦ1巨噬细胞极化,改善小鼠溃疡性结肠炎症状 | 首次揭示β-谷甾醇通过调控核糖体蛋白表达抑制MΦ1巨噬细胞极化的新机制 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人体验证 | 探究β-谷甾醇对溃疡性结肠炎的治疗作用及分子机制 | 溃疡性结肠炎小鼠模型和RAW264.7巨噬细胞系 | 单细胞生物学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序, KEGG分析, 流式细胞术, ELISA, Western blotting, qRT-PCR | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, 细胞因子数据 | 溃疡性结肠炎小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5733 | 2025-10-06 |
Clock pathway inhibitor overcomes tumor immune-exclusion via regulation of fibrocyte differentiation
2025-Aug-05, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01066-6
PMID:40764393
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研究论文 | 本研究通过时钟通路抑制剂调控纤维细胞分化,克服肿瘤免疫排斥并增强免疫检查点抑制剂疗效 | 首次发现时钟通路调控纤维细胞向αSMA癌症相关成纤维细胞分化,并证明时钟抑制剂可将免疫排斥型肿瘤转化为免疫活跃型肿瘤 | 研究主要基于肺腺癌模型,在其他癌症类型中的适用性需要进一步验证 | 探索克服肿瘤免疫排斥的新策略,提高免疫检查点抑制剂治疗效果 | 肺腺癌组织、肿瘤微环境中的纤维细胞和癌症相关成纤维细胞 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5734 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome sequencing (scRNA-seq) reveals dynamic gene expression trajectories regulating vascular cell senescence in Hylocereus undatus
2025-Aug-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149718
PMID:40774524
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了火龙果采后维管细胞衰老过程中的基因表达动态变化 | 首次在火龙果中构建单细胞图谱,识别维管细胞衰老的关键调控因子HuCEP和HuSCPL48,并发现物质运输和能量代谢相关基因的显著上调 | 研究仅聚焦于火龙果果皮组织,未涉及其他水果或植物器官的验证 | 探索火龙果采后维管细胞衰老的分子机制 | 火龙果(Hylocereus undatus)果皮组织 | 植物生物学 | NA | 单细胞转录组测序(scRNA-seq) | SCODE | 单细胞RNA测序数据 | 13个细胞簇,其中维管细胞主要位于簇10 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5735 | 2025-10-06 |
Local inflammation at the salmon louse (Lepeophtheirus salmonis) attachment site contributes to copepodid rejection in coho salmon (Oncorhynchus kisutch)
2025-Aug, Cell and tissue research
IF:3.2Q3
DOI:10.1007/s00441-025-03976-0
PMID:40464919
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研究论文 | 本研究比较了四种鲑鱼对鲑鱼虱的易感性,并分析了银鲑和大西洋鲑在寄生虫附着部位的细胞反应差异 | 首次结合组织学、蛋白质组学和空间转录组学分析鲑鱼对寄生虫的局部炎症反应机制 | 仅在前两次试验中未能成功感染所有物种,可能影响结果的一致性 | 探究不同鲑鱼物种对鲑鱼虱的易感性及宿主防御机制 | 大西洋鲑和太平洋鲑物种(粉鲑、银鲑和奇努克鲑) | 寄生虫学 | 寄生虫感染 | 组织学分析、蛋白质组学、空间转录组学 | NA | 组织样本、蛋白质数据、基因表达数据 | 四种鲑鱼物种在感染后12、24、36、48、60和168小时采集的皮肤和鳍样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5736 | 2025-10-06 |
Inflammatory monocyte-derived amphiregulin mediates intestinal fibrosis in Crohn's disease by activating PI3K/AKT
2025-Aug, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1016/j.mucimm.2025.05.008
PMID:40480418
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研究论文 | 本研究揭示了炎症性单核细胞来源的双调蛋白通过激活PI3K/AKT通路促进克罗恩病肠道纤维化的机制 | 首次阐明炎症性单核细胞来源的AREG通过PI3K/AKT通路驱动肠道纤维化的具体分子机制 | 动物模型与人类疾病存在差异,需要进一步临床验证 | 阐明双调蛋白介导肠道纤维化的分子机制 | 克罗恩病患者组织标本、小鼠结肠炎模型、人肠道成纤维细胞 | 分子病理学 | 克罗恩病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 动物模型 | NA | 基因表达数据, 组织样本 | CD患者狭窄与非狭窄病变组织,肠憩室正常组织,野生型和Areg基因敲除小鼠 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5737 | 2025-10-06 |
Prediction and validation based on scRNA-seq: ETS2 targets CEBPB to mediate osteoclast differentiation in osteoarthritis progression
2025-Aug, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145639
PMID:40602581
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现ETS2通过靶向CEBPB调控破骨细胞分化,从而影响骨关节炎进展 | 首次揭示ETS2作为关键转录因子通过靶向CEBPB调控破骨细胞分化在骨关节炎进展中的作用机制 | 研究主要基于小鼠DMM模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 识别驱动破骨细胞介导的骨关节炎进展的关键分子靶点并探索其潜在机制 | 破骨细胞、骨关节炎小鼠模型 | 单细胞基因组学 | 骨关节炎 | scRNA-seq, ATAC-seq, Cut&Tag, 体外扰动实验, 体内实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, 表观基因组数据 | DMM模型小鼠 | NA | single-cell RNA-seq, ATAC-seq | NA | NA |
| 5738 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing and PANDORA-seq reveal the pivotal role of piRNA in heat stress-induced testicular injury
2025-Aug, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145674
PMID:40609925
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和PANDORA-seq技术揭示了piRNA在热应激诱导睾丸损伤中的关键作用 | 首次发现piRNA是热应激反应最敏感的小RNA,并鉴定出piR_021767作为精子发生障碍的关键调控因子 | 研究主要基于小鼠模型,在猪等哺乳动物中的验证仍需进一步研究 | 探究piRNA在热应激诱导睾丸损伤中的分子机制 | 猪精液质量数据和小鼠睾丸热应激模型 | 单细胞组学 | 男性生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序,PANDORA-seq,双荧光素酶报告实验 | NA | 单细胞RNA测序数据,小RNA测序数据 | 23,385个猪数据点和小鼠睾丸热应激模型 | NA | 单细胞RNA测序,小RNA测序 | NA | NA |
| 5739 | 2025-10-06 |
Hypoxia-induced cellular responses in the gills of juvenile Eleutheronema tetradactylum: Insights from single-cell RNA sequencing
2025-Aug, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145749
PMID:40617425
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序等技术首次揭示了四指马鲅鳃组织在缺氧应激下的细胞异质性和分子响应机制 | 首次结合单细胞RNA测序、批量RNA测序和形态学评估,系统解析四指马鲅鳃组织在缺氧条件下的细胞异质性和分子响应机制 | 研究仅针对幼鱼鳃组织,未涉及其他组织或发育阶段;候选生物标志物的功能验证仍需进一步研究 | 阐明四指马鲅对缺氧应激的细胞和分子响应机制 | 四指马鲅幼鱼鳃组织 | 单细胞生物学 | 缺氧应激 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 苏木精-伊红染色, 透射电子显微镜 | NA | 基因表达数据, 组织形态图像 | 幼鱼鳃组织样本(缺氧与常氧条件对比) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 5740 | 2025-10-06 |
Causal Association Between Immune Cell Traits and Risk of Multiple Malignant and Nonmalignant CNS Diseases: A Mendelian Randomization and Single-Cell Transcriptomic Analysis
2025-Aug, Brain and behavior
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/brb3.70632
PMID:40760788
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研究论文 | 通过孟德尔随机化和单细胞转录组分析,揭示免疫细胞特征与多种中枢神经系统疾病的因果关系 | 首次大规模整合731种免疫细胞特征与13种脑部疾病,结合eQTL和单细胞RNA测序数据建立胶质母细胞瘤风险标志 | 研究结果可能受到人群特异性和数据来源的限制 | 阐明免疫细胞特征与中枢神经系统疾病的因果关系 | 731种免疫细胞特征与13种脑部疾病(包括胶质母细胞瘤、阿尔茨海默病、肌萎缩侧索硬化等) | 生物信息学 | 中枢神经系统疾病 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA测序, 表达数量性状位点分析, 非负矩阵分解 | 孟德尔随机化模型, NMF | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |