单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 5983 篇文献，本页显示第 5661 - 5680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5661 | 2025-02-04 |
DUX4-stimulated genes define the antiviral response to herpesviruses in human trophoblasts
2025-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.22.634317
PMID:39896594
|
研究论文 | 本文研究了人类滋养层细胞对七种致畸病毒的反应，发现疱疹病毒诱导了DUX4刺激基因（DSGs）的表达，这些基因在滋养层细胞中具有独特的抗病毒功能 | 揭示了DUX4及其刺激基因（DSGs）在滋养层细胞中作为抗疱疹病毒防御机制的关键作用，填补了滋养层细胞对致畸病毒反应理解的空白 | 研究仅限于七种致畸病毒，且主要关注疱疹病毒，未涵盖所有可能的病毒类型 | 探讨滋养层细胞对致畸病毒的抗病毒反应机制 | 人类滋养层细胞 | 分子生物学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 人类滋养层细胞器官样体 |
| 5662 | 2025-02-04 |
CD8 + T cells mediate vaccination-induced lymphatic containment of latent Mycobacterium tuberculosis infection following immunosuppression, while B cells are dispensable
2025-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.23.634479
PMID:39896630
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5663 | 2025-02-04 |
Accurate tiling of spatial single-cell data with Tessera
2025-Jan-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.17.633630
PMID:39896464
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5664 | 2025-02-04 |
Single Cell Transcriptome Signatures of Sarcoidosis in Lung Immune Cell Populations
2025-Jan-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.20.633917
PMID:39896662
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5665 | 2025-02-03 |
Periductal fibroblasts participate in liver homeostasis, fibrosis, and tumorigenesis
2025-Apr-07, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20232123
PMID:39888328
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，研究了肝脏中不同成纤维细胞群体的生理功能及其在肝纤维化和肿瘤发生中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术鉴定了Cd34和Dpt作为肝成纤维细胞特异性基因，并揭示了它们在肝纤维化和肝内胆管癌中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 研究肝脏中不同成纤维细胞群体的生理功能及其在肝纤维化和肿瘤发生中的作用 | 小鼠肝脏中的成纤维细胞 | 生物医学 | 肝纤维化, 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠肝脏组织样本 |
| 5666 | 2025-02-03 |
Sp3 ameliorated experimental autoimmune encephalomyelitis by triggering Socs3 in Th17 cells
2025-Jan-28, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.01.051
PMID:39884649
|
研究论文 | 本研究探讨了Sp3在Th17细胞介导的实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）中的作用及其分子机制 | 揭示了Sp3通过上调Socs3抑制RORγt表达及Stat3和Smad2/3的磷酸化，从而改善EAE症状的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类患者中进行验证 | 探索Sp3对Th17细胞介导的EAE的影响及其分子机制 | 实验性自身免疫性脑脊髓炎（EAE）模型小鼠及Th17细胞 | 免疫学 | 多发性硬化症 | scRNA-seq数据分析、流式细胞术、ELISA、PCR、WB、免疫荧光和报告基因技术 | NA | 基因表达数据、细胞数据 | Sp3+/+CD4Cre小鼠和Sp3+/-基因敲除小鼠 |
| 5667 | 2025-01-31 |
Epidermal stem cell derived exosomes-induced dedifferentiation of myofibroblasts inhibits scarring via the miR-203a-3p/PIK3CA axis
2025-Jan-29, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03157-9
PMID:39881312
|
研究论文 | 本研究通过比较转录组学和单细胞测序技术，探讨了表皮干细胞来源的外泌体（EpiSC-EVs）通过miR-203a-3p/PIK3CA轴抑制肌成纤维细胞去分化，从而减少瘢痕形成的机制 | 首次揭示了EpiSC-EVs通过miR-203a-3p抑制PIK3CA表达和PI3K/AKT/mTOR通路过度激活，从而促进肌成纤维细胞去分化的分子机制 | 研究主要基于体外和动物模型，尚未进行临床试验验证其安全性和有效性 | 探索抑制瘢痕形成的分子机制和潜在治疗方法 | 肌成纤维细胞和瘢痕组织 | 细胞生物学 | 瘢痕 | 比较转录组学、单细胞测序、miRNA测序、超速离心、过滤、Western blotting、免疫荧光 | NA | 转录组数据、单细胞数据、miRNA数据 | NA |
| 5668 | 2025-02-02 |
Cholesterol restriction primes antiviral innate immunity via SREBP1-driven noncanonical type I IFNs
2025-Jan, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.1038/s44319-024-00346-9
PMID:39668245
|
研究论文 | 本文探讨了胆固醇代谢与先天免疫反应之间的关系，特别是通过SREBP1驱动的非经典I型干扰素（IFN）表达来增强RIG-I依赖的抗病毒反应 | 揭示了胆固醇合成限制通过SREBP1转录因子依赖的方式诱导非经典I型IFN（如IFN-ω）的表达，从而增强RIG-I介导的信号传导 | 研究主要集中于特定细胞类型和小鼠模型，尚未在更广泛的生物体或临床环境中验证 | 研究胆固醇代谢如何影响先天免疫反应，特别是RIG-I依赖的抗病毒反应 | 特定细胞类型和小鼠模型 | 免疫学 | 病毒感染 | 化学筛选、单细胞转录组分析 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型和特定细胞类型 |
| 5669 | 2025-02-01 |
Single-cell transcriptomics of bronchoalveolar lavage during PRRSV infection with different virulence
2025-Jan-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-54676-2
PMID:39875369
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术，评估了不同毒力PRRSV感染期间支气管肺泡灌洗液中免疫细胞组成的变化及其临床结果 | 揭示了高毒力和中等毒力PRRSV感染在肺损伤时间点、免疫细胞组成变化及机制上的差异，特别是发现了抗炎M2样巨噬细胞在肺恢复中的作用 | 研究主要关注PRRSV感染，结果可能不直接适用于其他呼吸道病毒感染 | 理解PRRSV不同毒力水平对免疫细胞组成和临床结果的影响，以促进疾病管理和疫苗开发 | 支气管肺泡灌洗液中的免疫细胞 | 生物信息学 | 猪繁殖与呼吸综合征 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 5670 | 2025-02-01 |
RASGRF2 as a potential pathogenic gene mediating the progression of alcoholic hepatitis to alcohol-related cirrhosis and hepatocellular carcinoma
2025-Jan-28, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01853-4
PMID:39875737
|
研究论文 | 本研究通过多转录组数据库分析，确定了酒精性肝炎（AH）和肝细胞癌（HCC）之间的潜在共享基因，并验证了RASGRF2作为核心共享基因的作用 | 首次通过多转录组数据库和机器学习算法筛选出AH和HCC之间的共享基因，并验证了RASGRF2在AH向酒精性肝硬化（AC）和HCC进展中的致病作用 | 研究主要依赖于转录组数据和体外实验，缺乏体内实验验证 | 确定AH和HCC之间的共享基因，并验证其在疾病进展中的作用 | 酒精性肝炎（AH）、酒精性肝硬化（AC）和肝细胞癌（HCC） | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 转录组分析、免疫浸润分析、单细胞转录组分析、空间转录组分析 | 机器学习算法 | 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 | 多个转录组数据库和独立验证队列的数据 |
| 5671 | 2025-02-01 |
Prognostic models of immune-related cell death and stress unveil mechanisms driving macrophage phenotypic evolution in colorectal cancer
2025-Jan-28, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06143-9
PMID:39875913
|
研究论文 | 本文构建了一个与免疫相关的细胞死亡和应激（ICDS）预后模型，揭示了肿瘤细胞通过铜死亡下调GAL3ST4表达以抑制M2样巨噬细胞极化的机制 | 首次构建了ICDS预后模型，并揭示了肿瘤细胞通过铜死亡调控巨噬细胞极化的新机制 | 研究主要基于转录组数据，缺乏更多实验验证 | 揭示结直肠癌中免疫细胞浸润、程序性细胞死亡和应激之间的复杂相互作用，以指导治疗策略和改善患者预后 | 结直肠癌患者的转录组数据 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序、生化实验 | 机器学习模型 | 转录组数据 | 来自TCGA和GEO数据库的大量结直肠癌样本 |
| 5672 | 2025-02-01 |
UBE2J1 is identified as a novel plasma cell-related gene involved in the prognosis of high-grade serous ovarian cancer
2025-Jan-28, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06135-9
PMID:39876019
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序数据识别了高浆液性卵巢癌（HGSOC）中的关键免疫细胞类型，并揭示了UBE2J1作为HGSOC的新型预后标志物和致癌基因 | 首次将UBE2J1识别为HGSOC的新型预后标志物和致癌基因，揭示了其在细胞增殖、侵袭、迁移和肿瘤生长中的关键作用 | 研究主要依赖于公共数据库的数据，缺乏独立验证队列 | 识别HGSOC中的关键免疫细胞标志物并探索其在肿瘤进展和治疗反应中的作用 | 高浆液性卵巢癌（HGSOC）患者和细胞系 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序、CCK-8、Transwell、克隆形成、伤口愈合、免疫荧光和体内肿瘤生长实验 | NA | 单细胞测序数据、批量测序数据 | 来自GEO和TCGA数据库的HGSOC样本 |
| 5673 | 2025-02-01 |
Retinal Phenotypes and Single-cell Sequencing Analysis of Ush2a Knockout Mice
2025-Jan-28, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110247
PMID:39884543
|
研究论文 | 本研究通过CRISPR/Cas9技术构建了Ush2a基因敲除小鼠模型，并进行了听觉脑干反应测试、视网膜电图、HE染色和视网膜单细胞RNA测序，以探索Usher综合征中视网膜退化的机制 | 成功构建了Ush2a基因敲除小鼠模型，并首次通过单细胞RNA测序构建了视网膜细胞的初步调控图谱 | 在20个月大的Ush2a基因敲除小鼠中未发现明显的视网膜形态和电生理表型 | 探索Usher综合征中视网膜退化的分子机制 | Ush2a基因敲除小鼠和野生型小鼠 | 遗传学 | Usher综合征 | CRISPR/Cas9, 单细胞RNA测序 | Ush2a基因敲除小鼠模型 | RNA测序数据 | Ush2a基因敲除小鼠和野生型小鼠 |
| 5674 | 2025-02-01 |
Integrating representation learning, permutation, and optimization to detect lineage-related gene expression patterns
2025-Jan-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56388-7
PMID:39870610
|
研究论文 | 本文开发了一种名为PORCELAN的方法，用于识别与细胞谱系紧密相关的基因或子树，并应用于小鼠肺癌模型和胚胎发育的单细胞RNA测序数据 | PORCELAN方法结合了表示学习、排列和优化技术，能够识别与细胞谱系紧密相关的基因或子树，为研究细胞状态记忆提供了新工具 | 方法主要应用于小鼠模型和C. elegans的胚胎发育数据，尚未在更广泛的生物系统中验证 | 研究细胞谱系相关的基因表达模式，特别是在肺癌进展和胚胎发育中的细胞状态记忆 | 小鼠肺癌模型、小鼠和C. elegans的胚胎发育 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 表示学习、排列和优化 | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠肺癌模型、小鼠和C. elegans的胚胎发育数据 |
| 5675 | 2025-02-01 |
Computational Identification of Migrating T cells in Spatial Transcriptomics Data
2025-Jan-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.23.619870
PMID:39484480
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为ReMiTT的计算方法，利用空间转录组数据追踪T细胞在肿瘤组织中的迁移模式 | ReMiTT方法首次利用空间转录组数据追踪T细胞迁移，揭示了迁移路径上的关键基因和通路 | 研究主要基于计算模型，缺乏实验验证 | 研究T细胞在肿瘤微环境中的迁移模式及其与肿瘤免疫逃逸的关系 | T细胞 | 数字病理学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | ReMiTT | 空间转录组数据 | 多个肿瘤样本 |
| 5676 | 2025-02-01 |
Rethinking large scale phylogenomics with EukPhylo v1.0, a flexible toolkit to enable phylogeny-informed data curation and analyses of diverse eukaryotic lineages
2025-Jan-21, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.19.607962
PMID:39416055
|
研究论文 | 本文介绍了EukPhylo v1.0，一个模块化、用户友好的工具包，用于通过系统发育信息的数据整理和分析多样化的真核生物谱系 | EukPhylo v1.0提供了一个模块化的管道，能够通过系统发育信息进行污染去除、同源基因家族估计以及多序列比对和基因树的生成，解决了微真核生物特别是不可培养谱系在系统发育分析中的挑战 | 尽管EukPhylo v1.0在数据整理和分析方面表现出色，但其依赖于用户提供的基因家族数据集，可能限制了其在某些特定研究中的适用性 | 旨在通过开发EukPhylo v1.0工具包，改进真核生物系统发育分析的数据整理和分析方法 | 多样化的真核生物、细菌和古菌 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序、系统发育分析 | NA | 基因序列数据 | 1,000种多样化的真核生物、细菌和古菌 |
| 5677 | 2025-02-01 |
The Role of Dectin-1-Akt-RNF146 Pathway in β-Glucan Induced Immune Trained State of Monocyte in Sepsis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S482213
PMID:39881796
|
研究论文 | 本文探讨了Dectin-1-Akt-RNF146通路在β-葡聚糖诱导的单核细胞免疫训练状态中的作用，特别是在脓毒症中的应用 | 揭示了RNF146和Akt在脓毒症免疫抑制期的作用，并发现β-葡聚糖预处理可通过Dectin-1-Akt-mTOR通路逆转免疫抑制，促进免疫训练状态 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系，尚未在人类患者中进行验证 | 研究脓毒症中免疫训练状态的分子机制及其潜在治疗靶点 | 脓毒症患者的外周血单核细胞、脓毒症小鼠模型及小鼠单核/巨噬细胞系RAW264.7 | 免疫学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 小鼠双打击模型、RAW264.7细胞系 | RNA测序数据、细胞实验数据 | 脓毒症患者的外周血单核细胞、小鼠模型及RAW264.7细胞系 |
| 5678 | 2025-02-01 |
Therapeutic potential and mechanisms of umbilical cord mesenchymal stem cells differentiating into tendon cells and promotion of rotator cuff tendon-bone healing
2025 Jan-Dec, Journal of tissue engineering
IF:6.7Q1
DOI:10.1177/20417314251315185
PMID:39882545
|
研究论文 | 本文探讨了脐带间充质干细胞（UCMSCs）分化为肌腱细胞的机制及其在促进肩袖肌腱-骨愈合中的潜力 | 通过单细胞测序分析分化过程中的关键细胞亚群和信号通路，并发现Hes1基因的过表达显著促进了UCMSCs向肌腱细胞的分化 | 研究主要基于体外实验和动物模型，尚未进行临床试验 | 探索UCMSCs分化为肌腱细胞的机制及其在肩袖损伤修复中的应用 | 脐带间充质干细胞（UCMSCs）和肩袖肌腱损伤 | 细胞治疗 | 肩袖损伤 | 单细胞测序 | 动物模型 | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 5679 | 2025-01-31 |
Single-cell transcriptomic profiling of maize cell heterogeneity and systemic immune responses against Puccinia polysora Underw
2025-Feb, Plant biotechnology journal
IF:10.1Q1
DOI:10.1111/pbi.14519
PMID:39612313
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，解析了玉米对Puccinia polysora感染的细胞异质性及系统免疫反应 | 首次创建了玉米叶片在真菌攻击下的单细胞图谱，并重建了易感品系N110和抗病品系R99在感染期间的细胞轨迹，揭示了R99在不同叶片细胞类型中的多样化调控程序 | NA | 解析玉米对Puccinia polysora感染的细胞异质性及系统免疫反应机制 | 玉米叶片细胞 | 植物病理学 | 玉米锈病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 易感品系N110和抗病品系R99的玉米叶片细胞 |
| 5680 | 2025-01-31 |
Airway stenosis: classification, pathogenesis, and clinical management
2025-Feb, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70076
PMID:39866837
|
综述 | 本文综述了气道狭窄（AS）的分类、发病机制及临床管理，并探讨了基于发病机制开发的多种治疗方法 | 本文综合了AS的多种发病机制，并探讨了基于这些机制的新型治疗方法，如基因治疗、干细胞治疗等 | 尽管提出了多种治疗方法，但许多仍处于临床前阶段，尚未广泛应用于临床 | 揭示AS的发病机制并加速其临床转化 | 气道狭窄（AS）患者 | NA | 气道狭窄 | 单细胞RNA测序、16S rRNA基因测序、shotgun宏基因组测序 | NA | NA | NA |