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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5661 | 2025-10-06 |
Targeting the CD74 signaling axis suppresses inflammation and rescues defective hematopoiesis in RUNX1-familial platelet disorder
2025-Jan-08, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adn9832
PMID:39772771
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现CD74信号轴在RUNX1-家族性血小板障碍中的关键作用,并证明靶向该通路可改善造血缺陷 | 首次揭示CD74信号轴在FPD发病机制中的核心作用,并验证靶向CD74及其下游通路可逆转造血分化缺陷 | 样本量相对有限(单细胞RNA测序n=10),需要更大规模研究验证 | 探索RUNX1-家族性血小板障碍的发病机制并开发干预策略 | FPD患者造血干细胞和祖细胞(HSPCs) | 单细胞基因组学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 单细胞RNA测序10个样本,功能分析超过75个样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5662 | 2025-10-06 |
CCI: A Consensus Clustering-Based Imputation Method for Addressing Dropout Events in scRNA-Seq Data
2025-Jan-03, Bioengineering (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/bioengineering12010031
PMID:39851305
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研究论文 | 提出一种基于共识聚类的插补方法CCI,用于解决单细胞RNA测序数据中的dropout事件 | 通过基因子集采样进行聚类并汇总结果来定义细胞相似性,利用相似细胞信息进行基因表达水平插补 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中的dropout事件问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 共识聚类 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5663 | 2025-10-06 |
Evolution of a SHOOTMERISTEMLESS transcription factor binding site promotes fruit shape determination
2025-01, Nature plants
IF:15.8Q1
DOI:10.1038/s41477-024-01854-1
PMID:39668212
|
研究论文 | 本研究通过活细胞成像和单细胞RNA测序揭示了荠菜果实形状决定机制 | 发现单个顺式调控元件的独立进化决定了果实形状转变 | 研究主要集中于十字花科植物,在其他植物中的普适性有待验证 | 探究器官形态建成的分子机制 | 荠菜果实发育过程 | 植物发育生物学 | NA | 全器官活细胞成像,单细胞RNA测序 | NA | 图像,单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5664 | 2025-10-06 |
Linking tumor immune infiltration to enhanced longevity in recurrence-free breast cancer
2025-Jan, ESMO open
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.esmoop.2024.104109
PMID:39765189
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研究论文 | 本研究探讨了B细胞/免疫球蛋白基因特征与乳腺癌患者生存期的关系 | 首次发现14基因IGG特征与乳腺癌患者死亡风险降低41%-47%显著相关,并识别出其中7个关键基因与B细胞/T细胞克隆性密切相关 | 研究基于回顾性数据分析,需要前瞻性研究验证 | 探究肿瘤免疫浸润与乳腺癌患者长期生存的关系 | 9638名乳腺癌患者 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 空间GeoMx分析,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,临床数据 | 9638名乳腺癌患者(来自三个数据集) | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 5665 | 2025-10-06 |
Accurate identification of single-cell types via correntropy-based Sparse PCA combining hypergraph and fusion similarity
2025, Journal of applied statistics
IF:1.2Q2
DOI:10.1080/02664763.2024.2369955
PMID:39926175
|
研究论文 | 提出一种基于相关熵的稀疏PCA结合超图和融合相似度的单细胞类型识别新方法CHLSPCA | 创新性地将相关熵与PCA结合处理scRNA-seq数据中的噪声和异常值,并整合超图结构提取局部信息,同时引入高斯核函数和欧氏度量挖掘细胞间相似性信息 | NA | 解决单细胞RNA测序数据的高维度和噪声问题,提高细胞聚类准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | PCA, 稀疏PCA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5666 | 2025-07-22 |
Bulk RNA sequencing combined with single-cell RNA sequencing analysis revealed the ferroptosis immune target of osteoarthritis synovial fibroblasts
2025-Nov, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101587
PMID:40687616
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5667 | 2025-10-06 |
Derlin-3 manipulates the endoplasmic reticulum stress and IgG4 secretion of plasma cells in lung adenocarcinoma
2025-Aug, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03435-8
PMID:40369338
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研究论文 | 本研究探讨Derlin-3通过内质网应激调控肺腺癌肿瘤微环境中浆细胞IgG4分泌及巨噬细胞极化的机制 | 首次揭示Derlin-3在肺腺癌肿瘤微环境中通过Hrd1/p38/PRDM1通路调控浆细胞内质网应激和IgG4分泌的新机制 | 未明确Derlin-3调控Hrd1/p38/PRDM1通路的具体分子机制 | 探究Derlin-3在肺腺癌肿瘤微环境中的免疫调控功能 | 肺腺癌组织、B淋巴细胞、浆细胞、巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5668 | 2025-10-06 |
TREM-1 as a potential biomarker for malignant transformation risk in oral leukoplakia: Insights from bioinformatics and dual immunofluorescence analysis
2025-Aug, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2025.156088
PMID:40555060
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学和免疫荧光分析探讨TREM-1在口腔白斑恶性转化中的作用 | 首次发现TREM-1是口腔白斑恶性转化的独立风险因素,并确定巨噬细胞是其主要表达细胞 | 临床样本的Cox回归分析未能确认TREM-1表达与恶性转化的显著关联 | 研究TREM-1在口腔白斑恶性转化过程中的作用机制 | 口腔白斑患者组织和对照组织 | 生物信息学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 双标记免疫荧光, 生物信息学分析 | Cox回归模型, Kaplan-Meier分析 | 基因表达数据, 临床数据, 图像数据 | 69例口腔白斑组织和63例对照组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5669 | 2025-10-06 |
Heterogeneity of lymphoid cells in PBMCs in the acute phase of SFTS: single-cell transcriptome profiling
2025-Jul-25, Journal of biomedical research
IF:2.2Q3
DOI:10.7555/JBR.39.20250250
PMID:40685857
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析SFTS急性期患者外周血单个核细胞中淋巴细胞的异质性及糖皮质激素治疗的影响 | 首次在单细胞水平揭示SFTS急性期淋巴细胞功能异常机制及糖皮质激素治疗对免疫反应的调节作用 | 样本量较小(16名参与者),且未明确说明糖皮质激素治疗的具体方案和剂量 | 研究SFTS急性期淋巴细胞功能异常机制及糖皮质激素治疗对免疫细胞的影响 | SFTS急性期患者和健康志愿者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 严重发热伴血小板减少综合征 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 16名参与者(3名健康志愿者和13名SFTS急性期患者) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 5670 | 2025-10-06 |
A Deep Learning Approach to Assessing Cell Identity in Stem Cell-Based Embryo Models
2025-Jul-22, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2025_654
PMID:40690128
|
研究论文 | 开发了一种基于深度学习的集成模型,用于评估干细胞胚胎模型中细胞身份与发育保真度 | 首次将深度学习与单细胞RNA测序数据整合,创建了能够评估体外细胞类型身份并提供分类可靠性熵分数的工具 | NA | 评估干细胞胚胎模型中细胞类型与真实胚胎发育的相似程度 | 胚胎干细胞、胚胎体、体外分化细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5671 | 2025-10-06 |
IGCLAPS: an interpretable graph contrastive learning method with adaptive positive sampling for scRNA-seq data analysis
2025-Jul-21, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf411
PMID:40689508
|
研究论文 | 提出一种用于单细胞RNA测序数据分析的可解释图对比学习方法 | 开发了自适应正采样模块,基于表达相似性和软聚类标签动态识别真实正样本对 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中的细胞聚类性能 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图对比学习, 图变换器 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5672 | 2025-07-22 |
Cellular-resolution spatial transcriptomics of skin remodelling after fractional CO2 laser treatment
2025-Jul-21, Journal of the European Academy of Dermatology and Venereology : JEADV
IF:8.4Q1
DOI:10.1111/jdv.20870
PMID:40689597
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5673 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing in tuberculosis: Application and future perspectives
2025-Jul-20, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003095
PMID:39111829
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在结核病研究中的应用现状与未来展望 | 系统总结了scRNA-seq在结核病领域的应用潜力,并首次探讨其在临床生物标志物发现、宿主导向治疗和精准治疗研究中的具体价值 | 未涉及具体实验数据验证,主要基于文献综述和理论分析 | 探讨单细胞RNA测序技术在结核病研究中的应用前景和发展方向 | 结核病免疫机制和细胞异质性 | 单细胞组学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5674 | 2025-10-06 |
The Icarian flight of antibody-drug conjugates: target selection amidst complexity and tackling adverse impacts
2025-Jul-19, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1093/procel/pwaf002
PMID:39813112
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综述 | 本文综述抗体药物偶联物(ADCs)在靶点选择和应对毒性挑战方面的研究进展 | 重点探讨多靶点策略、pH依赖性抗体和掩蔽肽技术等创新方法,并强调单细胞测序和人工智能在优化靶点选择中的作用 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据验证 | 分析ADC开发面临的挑战并探讨提高其疗效和安全性的策略 | 抗体药物偶联物(ADCs)及其靶向治疗应用 | NA | 癌症 | 单细胞测序,人工智能 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5675 | 2025-10-06 |
Identification of biomarkers for Laryngeal squamous cell carcinoma through Mendelian randomization and integrated bioinformatics analysis
2025-Jul-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03114-w
PMID:40679719
|
研究论文 | 通过整合多组学数据和孟德尔随机化方法,识别喉鳞状细胞癌的生物标志物并构建预后模型 | 首次系统分析泛凋亡相关基因在LSCC中的作用,结合单细胞RNA测序数据构建预后模型并验证其临床价值 | 样本量相对有限,需要更大规模的前瞻性研究验证模型的临床应用价值 | 识别喉鳞状细胞癌的生物标志物并构建预后预测模型 | 喉鳞状细胞癌患者样本和正常对照样本 | 生物信息学 | 喉癌 | RNA-seq, scRNA-seq, CNV分析, qRT-PCR | Lasso-Cox回归模型 | 基因表达数据, 单细胞测序数据, 拷贝数变异数据 | 训练集:114例LSCC和12例正常样本;验证集:270例LSCC样本;scRNA-seq:2例LSCC样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 5676 | 2025-10-06 |
Architecture mechanics mediated osteogenic progression in bone regeneration of artificial scaffolds
2025-Jul-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv8804
PMID:40680128
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了人工骨支架结构通过应力刺激调控骨再生的生物力学机制 | 首次阐明了支架结构诱导应力刺激(SASS)对细胞的生物力学机制,发现了SASS通过调控间充质干细胞粘着斑和成骨分化通路平衡骨重塑过程 | 研究仅针对石墨、富勒烯和金刚石三种支架材料,未涵盖其他生物材料体系 | 探究支架结构通过力学刺激调控骨再生的生物力学机制 | 骨间充质干细胞、破骨细胞、成骨细胞及临界尺寸骨缺损动物模型 | 骨组织工程 | 骨缺损 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5677 | 2025-10-06 |
Nicotinamide boosts oocyte quantity and quality by promoting N4-acetylation modification in lupus mice
2025-Jul-18, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adu0955
PMID:40680131
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术揭示烟酰胺通过促进N4-乙酰化修饰改善狼疮小鼠卵母细胞数量和质量的作用机制 | 首次绘制狼疮小鼠卵母细胞acC修饰图谱,揭示NAT10介导的acC修饰在卵母细胞发育异常中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类患者中验证 | 探究系统性红斑狼疮影响卵母细胞发育的分子机制及烟酰胺的治疗潜力 | 系统性红斑狼疮小鼠模型的卵母细胞 | 生殖医学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞转录组测序, 翻译组测序, acC-RNA免疫沉淀测序 | NA | 单细胞RNA测序数据, 翻译组数据, 表观遗传修饰数据 | 狼疮小鼠卵母细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 翻译组测序, 表观遗传学测序 | NA | NA |
| 5678 | 2025-10-06 |
Single cell transcriptomic profiling of eosinophils and airway immune cells in childhood asthma
2025-Jul-18, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.06.034
PMID:40684957
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研究论文 | 本研究通过优化单细胞RNA测序方法,显著提高了儿童哮喘患者鼻腔灌洗样本中粒细胞(特别是嗜酸性粒细胞)的检测效率 | 采用10x Genomics Flex平台结合定制化数据处理流程,实现了粒细胞检测量16倍以上的提升,首次在组织样本中成功捕获嗜酸性粒细胞和中性粒细胞亚群 | 研究仅针对鼻腔灌洗样本,未验证其他组织类型;样本量相对有限 | 优化单细胞RNA测序技术在粒细胞检测中的应用,探索儿童哮喘的免疫细胞特征 | 儿童哮喘患者的鼻腔灌洗样本中的免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 儿童哮喘患者鼻腔灌洗样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Genomics Flex | 10x Genomics Flex平台结合定制化数据处理流程 |
| 5679 | 2025-10-06 |
NPLOC4 constructs tumor immunosuppressive microenvironment in pan-cancer and hepatocellular carcinoma
2025-Jul-17, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
|
研究论文 | 本研究探讨NPLOC4在泛癌和肝细胞癌肿瘤免疫微环境中的作用及其作为免疫治疗靶点的潜力 | 首次系统揭示NPLOC4在肿瘤免疫微环境中的免疫抑制作用及其作为免疫治疗新靶点的潜力 | 研究主要基于公共数据库数据,部分发现需进一步实验验证 | 探究NPLOC4在肿瘤免疫微环境中的作用机制和治疗价值 | 多种肿瘤类型和肝细胞癌患者组织样本及肿瘤细胞系 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | qRT-PCR, 免疫组织化学, 单细胞测序分析 | NA | mRNA表达数据, 蛋白质表达数据, 单细胞测序数据 | 多个公共数据库数据及肝细胞癌患者癌组织和癌旁组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5680 | 2025-10-06 |
Single-Cell Transcriptome and Microbiome Profiling Uncover Ileal Immune Impairment in Intrauterine Growth-Retarded Piglets
2025-Jul-17, Current pharmaceutical design
IF:2.6Q2
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和微生物组分析揭示了宫内生长迟缓仔猪回肠免疫功能障碍的机制 | 首次结合单细胞RNA测序和16S rRNA测序技术,系统揭示了IUGR仔猪免疫细胞比例变化、信号通路异常及肠道菌群失调的关联机制 | 样本量较小(仅3对仔猪),且仅观察了7日龄时的表型变化 | 探究宫内生长迟缓仔猪的基因调控模式和微生物组变化 | 宫内生长迟缓仔猪和正常同窝仔猪的回肠组织和肠道内容物 | 单细胞组学 | 宫内生长迟缓 | 单细胞RNA测序, 16S rRNA扩增子测序 | SCENIC, 伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据, 微生物组数据 | 3只IUGR仔猪和3只正常同窝仔猪 | NA | 单细胞RNA测序, 16S rRNA测序 | NA | NA |