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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5641 | 2025-10-06 |
Osteocyte connexin hemichannels and prostaglandin E2 release dictate bone marrow mesenchymal stromal cell commitment
2025-Feb-18, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2412144122
PMID:39937859
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研究论文 | 本研究揭示了骨细胞连接蛋白43半通道通过释放前列腺素E2调控骨髓间充质干细胞谱系分化的关键机制 | 首次发现骨细胞Cx43半通道通过PGE2释放调控BM-MSPC命运决定,揭示了骨细胞与间充质干细胞间的新型通讯机制 | 研究主要基于转基因小鼠模型,人类组织验证尚不充分 | 探究骨细胞如何通过Cx43半通道调控骨髓间充质干细胞的谱系定向分化 | 转基因小鼠模型的骨髓间充质干细胞和祖细胞 | 细胞生物学 | 骨骼疾病 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据,细胞表型数据 | 两种Cx43突变转基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5642 | 2025-10-06 |
Divergent Clinical and Immunologic Outcomes Based on STK11 Co-mutation Status in Resectable KRAS-Mutant Lung Cancers Following Neoadjuvant Immune Checkpoint Blockade
2025-Jan-17, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-24-2983
PMID:39545922
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研究论文 | 本研究探讨了可切除KRAS突变肺癌中STK11共突变状态对新辅助免疫检查点阻断治疗后临床和免疫学结果的影响 | 首次在可切除NSCLC新辅助免疫治疗背景下揭示KRAS/STK11共突变的临床意义,并通过单细胞转录组学发现T细胞转录命运的差异 | 样本量有限(7个KRASmut/STK11wt肿瘤和6个KRASmut/STK11mut肿瘤),需要更大规模研究验证 | 评估KRAS和STK11共突变对可切除非小细胞肺癌新辅助免疫治疗疗效的影响 | 可切除的KRAS突变非小细胞肺癌患者 | 癌症免疫学 | 肺癌 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 13个肿瘤样本(7个KRASmut/STK11wt,6个KRASmut/STK11mut) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5643 | 2025-10-06 |
Impact of Curcumin on the IL-17A-Mediated p53-Fibrinolytic System: Mouse Proteomics and Integrated Human Fibrosis scRNAseq Insights
2025-Aug, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02167-3
PMID:39424752
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研究论文 | 本研究探讨姜黄素通过调节IL-17A介导的p53-纤溶系统对急性肺损伤向特发性肺纤维化发展的影响机制 | 首次整合小鼠蛋白质组学与人类肺纤维化单细胞RNA测序数据,揭示IL-17A在p53-纤溶系统中的新作用及姜黄素的调节机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据验证相对有限 | 阐明IL-17A在急性肺损伤向肺纤维化进展中的作用机制及姜黄素的治疗潜力 | C57BL/6小鼠和人类IPF肺组织标本 | 生物信息学 | 肺纤维化 | 蛋白质组学,单细胞RNA测序,分子对接 | Schroedinger分子对接模型 | 蛋白质组数据,单细胞RNA测序数据 | 20例IPF患者和10例对照肺组织标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5644 | 2025-10-06 |
Multiple Machine Learning Identifies Key Gene PHLDA1 Suppressing NAFLD Progression
2025-Aug, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02164-6
PMID:39496918
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研究论文 | 本研究通过多种机器学习方法鉴定出PHLDA1基因在抑制非酒精性脂肪肝疾病进展中的关键作用 | 首次通过整合多种机器学习策略和单细胞RNA测序数据,系统鉴定PHLDA1作为NAFLD的新型生物标志物,并验证其在细胞和小鼠模型中的功能 | 研究主要基于公共数据库数据,临床样本验证有限,机制研究仍需深入 | 识别非酒精性脂肪肝疾病的新型生物标志物和治疗靶点 | 非酒精性脂肪肝疾病相关基因表达数据、细胞模型和小鼠模型 | 机器学习 | 非酒精性脂肪肝疾病 | 差异表达分析,WGCNA,机器学习,ROC分析,单细胞RNA测序,基因集富集分析 | 多种机器学习策略 | 基因表达数据,转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 三个NAFLD数据集中的23个重叠差异表达基因 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5645 | 2025-10-06 |
Comprehensive Analysis of Sialylation-Related Gene Profiles and Their Impact on the Immune Microenvironment in Periodontitis
2025-Aug, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02177-1
PMID:39609348
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研究论文 | 通过综合分析唾液酸化相关基因谱及其对牙周炎免疫微环境的影响 | 首次系统鉴定牙周炎中唾液酸化相关核心基因并构建诊断模型,结合单细胞测序揭示唾液酸化对单核细胞发育和细胞通讯的影响 | 研究基于公共数据集,需要实验验证;样本量有限 | 识别与牙周炎相关的唾液酸化相关基因并探索其对牙周免疫微环境的影响 | 牙周炎患者 | 生物信息学 | 牙周炎 | 单细胞测序,差异表达分析,机器学习,加权基因共表达网络分析,伪时间序列分析,细胞通讯分析 | 机器学习诊断模型 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5646 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA-seq Reveals Increased and Activated Post-Capillary Venule Endothelial Cells in Erythrodermic Psoriasis
2025-Aug, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02216-x
PMID:39786459
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了红皮病型银屑病中毛细血管后微静脉内皮细胞显著增加和激活的现象 | 首次在单细胞水平发现红皮病型银屑病中毛细血管后微静脉内皮细胞的异常增加和激活状态 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证 | 探究红皮病型银屑病中血管内皮细胞的病理变化 | 人类和小鼠的红皮病型银屑病皮肤组织样本 | 单细胞组学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,流式细胞术 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据,图像数据,流式数据 | 人类患者活检样本和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5647 | 2025-10-06 |
Resolving the design principles that control post-natal vascular growth and scaling
2025-Jul-16, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101324
PMID:40628258
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研究论文 | 本研究通过多尺度实验和计算方法揭示了出生后主动脉生长的设计原则 | 发现了主动脉扩张遵循独特的生长原则,包括与血流对齐的两个时空协调的增殖波,以及通过细胞挤出维持稳态尺寸的新机制 | 研究主要关注主动脉,其他器官的生长原则可能不同 | 解析控制出生后血管生长和尺寸缩放的设计原则 | 小鼠主动脉组织 | 计算生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 数学建模 | 数学模型 | 基因表达数据, 细胞增殖数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5648 | 2025-10-06 |
Unveiling the mechanisms of CEBPD-orchestrated TAM polarization through RGS2/PAR2 pathway and its impact on ICB efficacy in clear cell renal cell carcinoma
2025-Jul-13, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010898
PMID:40659446
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研究论文 | 本研究揭示CEBPD通过RGS2/PAR2轴调控透明细胞肾细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞极化并影响免疫检查点阻断剂疗效的机制 | 首次发现CEBPD作为关键转录因子通过RGS2/PAR2轴调控TAM极化状态,并证实其与ICB疗效的关联 | NA | 探索CEBPs在ccRCC免疫微环境中调控TAM极化的机制及其对免疫检查点阻断治疗的影响 | 透明细胞肾细胞癌中的肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 肾细胞癌 | 单细胞转录组测序, 蛋白质印迹, 免疫荧光, 体外极化实验, 染色质免疫沉淀测序, 双荧光素酶报告实验, 电泳迁移率变动分析 | NA | 转录组数据, 蛋白质数据, 临床标本数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5649 | 2025-10-06 |
Chevreul: An R Bioconductor Package for Exploratory Analysis of Full-Length Single Cell Sequencing
2025-Jun-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.27.656486
PMID:40501968
|
研究论文 | 介绍Chevreul——一个用于单细胞RNA测序数据处理和可视化的R Bioconductor包及交互式Shiny应用 | 专门支持全长RNA测序数据的分析,包括外显子覆盖度和转录本异构体推断,并提供批处理校正功能 | NA | 开发一个易于使用的单细胞RNA测序数据分析工具 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5650 | 2025-10-06 |
Constructing a cross-tissue human knee single-cell atlas identified osteoarthritis reduces regenerative tissue stem cells while increasing inflammatory pain macrophages
2025-May-05, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6247502/v1
PMID:40386432
|
研究论文 | 构建首个跨组织人类膝关节单细胞图谱,揭示骨关节炎减少再生性组织干细胞同时增加炎症疼痛巨噬细胞 | 首次构建包含关节软骨、半月板、滑膜和软骨下骨的膝关节骨关节炎综合单细胞图谱,发现组织间活跃通讯机制 | NA | 研究骨关节炎的跨组织分子机制和细胞组成变化 | 人类膝关节组织(关节软骨、半月板、滑膜、软骨下骨) | 单细胞组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5651 | 2025-10-06 |
Multi-omics integrative analysis reveals novel genetic loci and candidate genes for ischemic stroke
2025-Sep-09, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2025.102633
PMID:40777745
|
研究论文 | 通过整合多组学数据识别缺血性脑卒中的新遗传位点和候选基因 | 首次整合三大GWAS数据库进行meta分析,发现124个新的IS相关位点,并开发基于大语言模型的智能助手StrokeGene | 遗传研究的发现需要进一步功能验证,样本来源限于现有数据库 | 探索缺血性脑卒中的遗传基础和新致病机制 | 人类遗传数据和动物模型 | 生物信息学 | 缺血性脑卒中 | GWAS meta分析, eQTL, pQTL, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 共定位分析 | 大语言模型 | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | 三大GWAS数据库(GWAS Catalog, MEGASTROKE, Open GWAS)的整合数据 | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析 | NA | NA |
| 5652 | 2025-10-06 |
Multi-omics insights of immune cells in the risk and prognosis of idiopathic membranous nephropathy
2025-Aug-10, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08642-3
PMID:40783650
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研究论文 | 本研究通过多组学数据分析揭示了CD39调节性T细胞在特发性膜性肾病风险与预后中的关键作用 | 首次通过孟德尔随机化分析确定CD39 Tregs与IMN的因果关系,并构建了107个复合机器学习模型识别MN | 研究样本量有限,需要更大规模验证 | 探究免疫细胞在特发性膜性肾病风险与预后中的作用机制 | 731种免疫细胞表型与特发性膜性肾病患者 | 生物信息学 | 肾脏疾病 | 多组学分析, 孟德尔随机化, 多重免疫荧光染色, 单细胞转录组分析, 流式细胞术 | 机器学习模型 | 基因组数据, 转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5653 | 2025-10-06 |
Mitochondrial metabolic reprogramming in colorectal cancer: mechanisms of resistance and future clinical interventions
2025-Aug-09, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02670-y
PMID:40783392
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综述 | 探讨结直肠癌中线粒体代谢重编程在治疗抵抗中的作用机制及潜在临床干预策略 | 系统阐述线粒体代谢重编程作为结直肠癌治疗抵抗的核心适应机制,并评估空间转录组学等新技术在个性化治疗中的转化价值 | NA | 分析线粒体代谢重编程导致结直肠癌治疗抵抗的机制并探索临床干预方向 | 结直肠癌细胞及其线粒体代谢机制 | NA | 结直肠癌 | 空间转录组学, 蛋白质组学, 患者来源类器官 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5654 | 2025-10-06 |
CAR-engineered cytolytic Tregs reverse pulmonary fibrosis and remodel the fibrotic niche with limited CRS
2025-Aug-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182050
PMID:40627450
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研究论文 | 本研究开发了靶向FAP1的CAR工程化细胞毒性调节T细胞,用于治疗特发性肺纤维化 | 结合CAR-T细胞的靶向杀伤优势和Treg细胞的免疫抑制功能,首次开发CAR-cTregs治疗肺纤维化 | 研究基于博来霉素诱导的肺纤维化模型,尚未在人体临床试验中验证 | 开发治疗特发性肺纤维化的新型细胞免疫疗法 | FAP1+肺泡成纤维细胞和CAR工程化细胞毒性调节T细胞 | 细胞免疫治疗 | 特发性肺纤维化 | 单细胞转录组测序,CAR-T细胞工程 | NA | 基因表达数据,病理学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5655 | 2025-10-06 |
Regulation of cortical neurogenesis by MED13L via transcriptional priming and its implications for MED13L syndrome
2025-Aug-08, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08532-8
PMID:40775066
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研究论文 | 本研究通过基因敲除小鼠模型揭示了MED13L通过转录启动调控大脑皮层神经发生的分子机制 | 首次发现MED13L通过结合中介体复合物启动关键发育基因的转录激活,阐明了MED13L综合征的发育机制 | 研究基于小鼠模型,在人类中的直接适用性需要进一步验证 | 探究MED13L综合征的发育和分子机制 | MED13L基因敲除小鼠模型 | 神经发育生物学 | 神经发育障碍 | 单细胞转录组学,免疫荧光,多组学分析 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据,蛋白质定位数据 | MED13L敲除胚胎和成年小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq,多组学分析 | NA | NA |
| 5656 | 2025-10-06 |
A human NK cell progenitor that originates in the thymus and generates KIR+NKG2A- NK cells
2025-Aug-08, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv9650
PMID:40779632
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研究论文 | 本研究发现了人类胸腺来源的NK细胞前体细胞,能够生成KIR+NKG2A- NK细胞 | 首次鉴定出胸腺来源的cILC1前体细胞(thyILC1),揭示了胸腺依赖性NK细胞分化途径 | NA | 探索KIR+NKG2A- NK细胞的发育起源和分化途径 | 人类天然杀伤细胞(NK细胞)和先天淋巴样细胞(ILC) | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 包括健康供体和22q11.2缺失综合征患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5657 | 2025-10-06 |
Mendelian randomization analysis of inflammatory biomarkers and hepatocellular carcinoma risk: genetic causality and single-cell transcriptomics
2025-Aug-07, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03357-7
PMID:40775116
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研究论文 | 通过孟德尔随机化分析和单细胞转录组学验证炎症生物标志物与肝细胞癌风险的因果关系 | 首次结合孟德尔随机化分析和单细胞转录组学方法系统评估炎症生物标志物与肝细胞癌的因果关系 | 样本量有限(仅4个HCC样本),需要更大规模研究验证 | 探究炎症生物标志物与肝细胞癌风险的因果关系 | 肝细胞癌患者和炎症生物标志物 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序 | MR Egger,加权中位数,逆方差加权,加权模式,简单模式 | 遗传数据,单细胞转录组数据 | 4个肝细胞癌样本(BT1306,BT1307,scrSOL004,scrSOL006) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5658 | 2025-10-06 |
Integrative multi-omics reveals a regulatory and exhausted T-cell landscape in CLL and identifies galectin-9 as an immunotherapy target
2025-Aug-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61822-x
PMID:40775219
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研究论文 | 通过整合多组学分析揭示慢性淋巴细胞白血病中T细胞的调控和耗竭状态,并鉴定galectin-9作为免疫治疗靶点 | 首次整合单细胞RNA测序、质谱流式细胞术和组织成像技术,系统揭示CLL淋巴结中T细胞的独特特征,并发现galectin-9作为新的免疫治疗靶点 | 研究样本来源有限,主要基于患者样本和小鼠模型,需要进一步临床验证 | 探索慢性淋巴细胞白血病中T细胞耗竭的机制并寻找免疫治疗新靶点 | CLL患者的血液、骨髓和淋巴结T细胞,以及CLL小鼠模型 | 单细胞多组学 | 慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术, 组织成像, T细胞受体测序 | predicTCR分类器 | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, 组织图像数据 | CLL患者多个组织部位样本及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5659 | 2025-10-06 |
Multi-omics data reveal that SAA1 + fibroblasts exacerbate periodontitis by regulating macrophage inflammation and chemotaxis
2025-Aug-07, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06925-1
PMID:40775345
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研究论文 | 本研究通过多组学技术揭示了SAA1+成纤维细胞通过调节巨噬细胞炎症和趋化作用加剧牙周炎的机制 | 首次系统鉴定SAA1+成纤维细胞亚群在牙周炎中的关键作用,阐明其通过分泌趋化因子介导巨噬细胞浸润并促进炎症的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系实验,在人类临床样本中的验证仍需进一步开展 | 探究牙周微环境中细胞间相互作用的调控网络,寻找牙周炎治疗新靶点 | 牙周组织细胞、小鼠牙周炎模型、L929细胞、RAW264.7巨噬细胞 | 单细胞组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量转录组测序, 生物信息学分析, 动物实验, 细胞共培养 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量转录组数据 | 65,979个牙周组织细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 5660 | 2025-10-06 |
scTail: precise polyadenylation site detection and its alternative usage analysis from reads 1 preserved 3' scRNA-seq data
2025-Aug-07, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03710-7
PMID:40775355
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研究论文 | 开发了一种名为scTail的计算方法,利用3'单细胞RNA测序数据中的第一链reads精确检测polyA位点并分析其替代使用 | 首次利用3' scRNA-seq中常被忽略的第一链reads进行PAS检测,并结合第二链reads实现替代PAS使用的量化分析 | NA | 开发精确检测polyA位点及其替代使用的计算方法 | 3'单细胞RNA测序数据中的第一链和第二链reads | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 计算方法 | 测序reads | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | 3' scRNA-seq |