单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 6059 篇文献，本页显示第 5641 - 5660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5641 | 2025-02-12 |
Gene Expression Variations Induced by Sevoflurane in Glia and Glioma Cells and the Role of EPHA3 in Sevoflurane's Anti-Glioma Effect
2025-Feb-07, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究通过分析七氟醚处理的单细胞转录组数据，揭示了七氟醚通过免疫炎症反应、神经元分化和血脑屏障维持等信号通路产生麻醉效应，并发现EPHA3基因在七氟醚抗胶质瘤效应中的关键作用 | 首次揭示了七氟醚通过影响DAAM2和EPHA3等基因表达来影响胶质瘤患者生存率，并发现EPHA3在七氟醚抑制胶质瘤细胞侵袭和迁移中的关键作用 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析，缺乏临床验证 | 探讨七氟醚对神经系统疾病（如胶质瘤）影响的分子机制 | 胶质细胞和胶质瘤细胞 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA |
| 5642 | 2025-02-12 |
Tgfβ signaling stimulates glycolysis to promote the genesis of synovial joint interzone in developing mouse embryonic limbs
2025-Jan-10, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adq4991
PMID:39772668
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了小鼠胚胎膝关节原基，发现糖酵解基因在发育中的滑膜关节间区细胞中高度表达，并揭示了Tgfβ信号通过激活mTOR和Hif1α刺激糖酵解，促进软骨细胞向间区细胞的转化 | 首次揭示了Tgfβ信号通过激活mTOR和Hif1α刺激糖酵解，促进软骨细胞向滑膜关节间区细胞的转化 | 研究主要基于小鼠胚胎模型，尚未在人类或其他动物模型中验证 | 研究滑膜关节间区细胞形成的分子机制 | 小鼠胚胎膝关节原基 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 小鼠胚胎膝关节原基 |
| 5643 | 2025-02-12 |
TDO2 + cancer-associated fibroblasts mediate cutaneous squamous cell carcinoma immune escape via impeding infiltration of CD8 + T cells
2025-Jan-03, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03921-0
PMID:39751882
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研究论文 | 本研究探讨了TDO2在皮肤鳞状细胞癌（cSCC）相关成纤维细胞中的表达及其在免疫逃逸中的作用 | 首次报道了TDO2在cSCC相关成纤维细胞中的高表达及其通过抑制CD8+T细胞浸润介导免疫逃逸的机制 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据和小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探索cSCC的发病机制及TDO2在其中的作用 | 皮肤鳞状细胞癌（cSCC）及其相关成纤维细胞 | 癌症研究 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 未明确提及具体样本数量，但包括小鼠模型 |
| 5644 | 2025-02-12 |
Identification of EGR1 as a Key Diagnostic Biomarker in Metabolic Dysfunction-Associated Steatotic Liver Disease (MASLD) Through Machine Learning and Immune Analysis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S499396
PMID:39925925
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研究论文 | 本研究通过机器学习和免疫分析，识别出EGR1作为代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD）的关键诊断生物标志物 | 首次结合机器学习方法和免疫分析技术，识别出EGR1作为MASLD的关键基因，并验证其在疾病发病机制中的重要作用 | 研究依赖于公开的基因表达数据集，可能受到数据质量和样本量的限制 | 识别MASLD的有效诊断生物标志物，以帮助理解其发病机制 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病（MASLD） | 机器学习 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 微阵列数据分析、单细胞RNA测序 | LASSO、SVM、随机森林（RF） | 基因表达数据 | 六个GEO数据集，包括训练集和验证集 |
| 5645 | 2025-02-12 |
Accurate identification of single-cell types via correntropy-based Sparse PCA combining hypergraph and fusion similarity
2025, Journal of applied statistics
IF:1.2Q2
DOI:10.1080/02664763.2024.2369955
PMID:39926175
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研究论文 | 本文提出了一种新的单细胞类型识别方法CHLSPCA，通过结合correntropy和PCA处理scRNA-seq数据中的噪声和异常值，并利用超图提取数据的局部结构信息，以提高聚类效果 | 创新性地将correntropy与PCA结合处理噪声和异常值，并引入超图提取局部结构信息，同时使用高斯核函数和欧几里得度量挖掘细胞间的相似性信息，并引入稀疏约束以获得稀疏主成分 | 未提及具体的数据集规模或实验限制 | 提高单细胞RNA测序数据的聚类效果，促进对细胞异质性的理解 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | CHLSPCA（结合correntropy的稀疏PCA） | 单细胞RNA测序数据 | 未提及具体样本数量 |
| 5646 | 2025-02-12 |
Crosstalk of SPINK4 Expression With Patient Mortality, Immunotherapy and Metastasis in Pan-Cancer Based on Integrated Multi-Omics Analyses
2025, OncoTargets and therapy
IF:2.7Q3
DOI:10.2147/OTT.S487126
PMID:39926372
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研究论文 | 本文通过整合多组学分析，探讨了SPINK4表达与患者死亡率、免疫治疗和转移在泛癌中的相互作用 | 揭示了SPINK4在泛癌过程中的关键作用，特别是在肿瘤微环境、干细胞评分和化疗敏感性中的关联 | 研究主要基于TCGA数据集，可能缺乏对其他独立数据集的验证 | 探讨SPINK4在不同癌症类型中的具体功能和影响 | 泛癌患者和结肠腺癌细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 多组学分析、单细胞测序、伤口愈合实验、Transwell实验 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | TCGA数据集中的泛癌患者样本和结肠腺癌细胞系（HCT116和RKO） |
| 5647 | 2025-02-11 |
Exploring Origin-Dependent Susceptibility of Smooth Muscle Cells to Aortic Diseases Through Intersectional Genetics
2025-Feb-10, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本文通过开发一种先进的双重组酶介导的交集遗传系统，研究不同发育起源的平滑肌细胞对主动脉疾病的易感性 | 开发了一种新的双重组酶介导的交集遗传系统，能够精确靶向不同发育起源的平滑肌细胞，并结合单细胞RNA测序技术研究TGF-β信号在不同主动脉段的影响 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探索不同发育起源的平滑肌细胞对主动脉疾病的易感性，并研究其机制 | 小鼠的平滑肌细胞 | 遗传学 | 主动脉疾病 | 双重组酶介导的交集遗传系统，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
| 5648 | 2025-02-11 |
Key Considerations on CITE-Seq for Single-Cell Multiomics
2025-Feb-09, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.202400011
PMID:39924789
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综述 | 本文综述了CITE-Seq技术，一种同时分析单个细胞中基因表达和蛋白质丰度的先进单细胞测序方法 | 本文详细介绍了CITE-Seq的工作流程，并提供了使用抗体衍生标签（ADTs）染色细胞的关键考虑因素 | 本文主要基于微孔单细胞分析系统，可能不涵盖所有CITE-Seq应用场景 | 探讨CITE-Seq技术在单细胞多组学分析中的应用 | 单个细胞中的基因表达和蛋白质丰度 | 单细胞测序 | NA | CITE-Seq, 单细胞mRNA测序, 抗体衍生标签（ADTs） | NA | 基因表达数据, 蛋白质丰度数据 | NA |
| 5649 | 2025-02-11 |
Integration of single-cell and bulk RNA-sequencing data to construct and validate a signature based on NK cell marker genes to predict immunotherapy response and prognosis in colorectal cancer
2025-Feb-07, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01842-7
PMID:39920524
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研究论文 | 本研究旨在构建基于NK细胞标记基因的签名，以预测结直肠癌患者的免疫治疗反应和预后 | 通过整合单细胞RNA测序数据和TCGA结直肠癌样本的WGCNA分析，识别出NK细胞相关的核心基因和特征基因，并构建了一个新的预后签名 | 研究依赖于公开数据集，可能受到数据质量和样本选择的限制 | 预测结直肠癌患者的免疫治疗反应和预后 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），加权基因共表达网络分析（WGCNA） | LASSO回归分析 | RNA测序数据 | 587个TCGA结直肠癌样本，124和201个GEO验证样本 |
| 5650 | 2025-02-11 |
TAp63γ is the primary isoform of TP63 for tumor suppression but not development
2025-Feb-06, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02326-x
PMID:39915463
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研究论文 | 本文探讨了TP63基因的不同亚型在肿瘤抑制和发育中的作用，特别是TAp63γ的功能 | 首次通过CRISPR-cas9技术生成p63γ缺陷小鼠模型，揭示了TAp63γ在肿瘤抑制中的主要作用，而非发育 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需进一步验证 | 探索TP63基因不同亚型在肿瘤抑制和发育中的具体功能 | TP63基因的不同亚型，特别是TAp63γ | 分子生物学 | 肿瘤 | CRISPR-cas9, 单细胞RNA测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | p63γ缺陷小鼠 |
| 5651 | 2025-02-11 |
MiR-18a-LncRNA NONRATG-022419 pairs targeted PRG-1 regulates diabetic induced cognitive impairment by regulating NGF\BDNF-Trkb signaling pathway
2025-Feb-06, Proteome science
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12953-025-00239-2
PMID:39915794
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研究论文 | 本研究探讨了糖尿病诱导的认知功能障碍（DCD）中PRG-1的分子机制和细胞异质性，以及其在突触可塑性调节中的作用 | 揭示了PRG-1通过NGF/BDNF-Trkb信号通路在DCD中的突触可塑性调节作用，并发现了miR-18a-LncRNA NONRATG-022419对PRG-1的靶向调控 | 研究主要基于体外高糖诱导的HT22细胞损伤模型，尚未在体内模型中验证 | 探讨糖尿病诱导的认知功能障碍（DCD）的分子机制和细胞异质性，以及PRG-1在该过程中的功能作用 | 海马细胞、HT22细胞 | 分子生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RNA转录组分析 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 5652 | 2025-02-11 |
Retinoic acid antagonizes estrogen signaling to maintain adult uterine cell fate
2025-Feb-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2416089122
PMID:39874292
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研究论文 | 本研究通过遗传学证据揭示了视黄酸（RA）和雌激素信号在维持成年小鼠子宫上皮细胞命运中的拮抗作用 | 首次提供了RA和雌激素信号在维持成年子宫上皮细胞命运中拮抗作用的遗传学证据，并揭示了RA信号缺失导致的细胞命运转变和免疫细胞浸润 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中进行验证 | 探讨RA和雌激素信号在维持成年子宫上皮细胞命运中的作用 | 小鼠子宫上皮细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 三种相关小鼠遗传模型 |
| 5653 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA sequencing of human blood eosinophils reveals plasticity and absence of canonical cell subsets
2025-Feb, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.16213
PMID:38934897
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5654 | 2025-02-10 |
Single-cell Sequencing Traces Mitochondrial Transfers
2025-Jan-15, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae092
PMID:39724171
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5655 | 2025-02-10 |
Hypoxia regulates small extracellular vesicle biogenesis and cargo sorting through HIF-1α/HRS signaling pathway in head and neck squamous cell carcinoma
2025-Mar, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111546
PMID:39631619
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研究论文 | 本研究探讨了缺氧条件下头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）细胞中小细胞外囊泡（sEVs）的生物生成和货物分选的机制 | 揭示了缺氧通过HIF-1α/HRS信号通路调控sEVs生物生成和货物分选的新机制 | 研究主要集中于HNSCC细胞，未涉及其他类型癌症细胞 | 研究缺氧对头颈部鳞状细胞癌中小细胞外囊泡生物生成和货物分选的影响 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）细胞 | 细胞生物学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 空间转录组学和免疫组织化学 | NA | 细胞实验数据 | NA |
| 5656 | 2025-02-09 |
Immune mechanisms in multiple sclerosis: CD3 levels on CD28+ CD4+ T cells link antibody responses to human herpesvirus 6
2025-Mar, Cytokine
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.cyto.2025.156866
PMID:39884183
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研究论文 | 本研究通过孟德尔随机化分析探讨了抗体介导的免疫反应与多发性硬化症（MS）之间的联系，并揭示了CD28+ CD4+ T细胞上CD3水平通过改变人类疱疹病毒6（HHV-6）的比例对MS进展的影响 | 揭示了CD28+ CD4+ T细胞上CD3水平通过改变HHV-6比例对MS进展的影响，为HHV-6介导的MS生物学机制提供了新的见解 | 抗体介导的免疫反应与MS之间的确切因果关系仍不明确 | 探讨抗体介导的免疫反应与多发性硬化症（MS）之间的关联，并识别可能参与MS发病和进展的特定感染病原体 | 多发性硬化症（MS）患者和对照组 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞测序，孟德尔随机化分析 | NA | 基因表达数据 | MS患者和对照组 |
| 5657 | 2025-02-09 |
Massively parallel flow-cytometry-based screening of hematopoietic lineage cell populations from up to 25 donors simultaneously
2025-Feb, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2024.11.014
PMID:39608688
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研究论文 | 本研究旨在开发一种方法，允许对造血来源细胞表面标记进行高维度和技术统一的筛选 | 该方法能够在技术上统一的方式下筛选数百万细胞上的数百个标记，从而识别和表征稀有细胞群体的变化 | 虽然该方法能够处理大量细胞，但对于极低丰度的细胞群体，仍可能遗漏某些调控异常 | 开发一种高维度且技术统一的细胞表面标记筛选方法，以识别和表征稀有细胞群体的变化 | 造血来源的细胞群体 | 生物信息学 | NA | 流式细胞术、单细胞RNA测序（RNAseq） | 机器学习算法 | 细胞表面标记数据 | 25个供体的细胞样本 |
| 5658 | 2025-02-09 |
MetaLigand: A database for predicting non-peptide ligand mediated cell-cell communication
2025-Jan-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.14.633094
PMID:39868215
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研究论文 | 本文介绍了MetaLigand，一个基于R语言和网络访问的工具，用于预测非肽配体介导的细胞间通讯 | MetaLigand通过整合自动管道和手动整理的数据，提高了预测非肽配体丰度的准确性，并支持单细胞RNA测序和空间转录组数据 | NA | 研究非肽配体在细胞间通讯中的作用，并开发工具预测其生产和受体相互作用 | 非肽配体（NPLs）及其受体 | 生物信息学 | 年龄相关性黄斑变性 | RNA-seq, scRNA-seq, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 233种非肽配体 |
| 5659 | 2025-02-08 |
Creatine promotes endometriosis progression by inducing M2 polarization of peritoneal macrophages
2025-Mar-01, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-24-0278
PMID:39679878
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研究论文 | 本研究揭示了肌酸（CR）通过诱导腹膜巨噬细胞的M2极化，促进子宫内膜异位症（EM）的血管生成、纤维化和病变进展，为潜在的治疗策略提供了新的见解 | 首次发现肌酸在子宫内膜异位症中通过诱导腹膜巨噬细胞的M2极化，促进病变进展，为治疗提供了新的靶点 | 研究主要基于体外实验，需要进一步的体内实验验证 | 探讨肌酸在子宫内膜异位症中的作用机制 | 子宫内膜异位症患者的腹膜巨噬细胞 | NA | 子宫内膜异位症 | 单细胞测序、RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 子宫内膜异位症患者与无病女性的腹膜巨噬细胞 |
| 5660 | 2025-02-08 |
TEAD3 and TEAD4 play overlapping role in bovine preimplantation development
2025-Mar-01, Reproduction (Cambridge, England)
DOI:10.1530/REP-24-0307
PMID:39679917
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研究论文 | 本研究探讨了TEAD3和TEAD4在牛胚胎植入前发育中对滋养外胚层命运决定的重叠作用 | 揭示了TEAD3和TEAD4在牛胚胎植入前发育中的冗余功能，与小鼠模型中的发现形成对比 | 研究仅限于牛胚胎，未涉及其他哺乳动物 | 确定TEAD3在牛胚胎植入前发育中的功能角色 | 牛胚胎植入前发育 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序、RNA干扰、碱基编辑技术 | NA | RNA测序数据、免疫荧光数据 | 未明确提及样本数量 |