单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
5621	2025-02-13	Mesenchymal Stem Cells Prevent SLC39A14-Dependent Hepatocyte Ferroptosis through Exosomal miR-16-5p in Liver Graft 2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202411380 PMID:39680749	研究论文	本文研究了间充质干细胞通过外泌体miR-16-5p预防肝移植中SLC39A14依赖的肝细胞铁死亡	首次发现SLC39A14在肝移植中的促铁死亡作用，并揭示了hBMSCs通过外泌体miR-16-5p下调SLC39A14表达的治疗机制	未提及具体样本量及实验设计的局限性	探究肝移植中肝细胞损伤的机制及间充质干细胞的治疗作用	肝移植中的肝细胞及人骨髓来源的间充质干细胞	生物医学	肝移植相关疾病	单细胞RNA测序分析	NA	RNA测序数据	NA
5622	2025-02-13	Aberrant Chitinase 3-Like 1 Expression in Basal Cells Contributes to Systemic Sclerosis Fibrosis 2025-Feb, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany) DOI:10.1002/advs.202310169 PMID:39686726	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了系统性硬化症（SSc）中基底细胞异常表达的几丁质酶3样1（Chi3L1）在纤维化过程中的作用，并探讨了其作为潜在生物标志物和治疗靶点的可能性	首次在SSc患者中识别出高表达Chi3L1的基底细胞亚群，并揭示了Chi3L1通过IL-17RA介导的纤维化机制	研究主要基于小鼠模型和体外实验，需要进一步在人体临床试验中验证Chi3L1和IL-17RA作为治疗靶点的有效性和安全性	探讨系统性硬化症纤维化的分子机制，并寻找潜在的治疗靶点	系统性硬化症患者的皮肤细胞和小鼠模型	生物医学研究	系统性硬化症	单细胞RNA测序	小鼠模型	RNA测序数据	SSc患者和健康对照的皮肤细胞样本
5623	2025-02-13	A Bi-Specific T Cell-Engaging Antibody Shows Potent Activity, Specificity, and Tumor Microenvironment Remodeling in Experimental Syngeneic and Genetically Engineered Models of GBM 2025-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2024.12.18.628714 PMID:39763755	研究论文	本文研究了一种双特异性T细胞接合抗体（BTE）在实验性同源和基因工程胶质母细胞瘤（GBM）模型中的活性、特异性及肿瘤微环境重塑效果	在具有完整免疫系统的原位和基因工程小鼠模型中评估BTE的功能，填补了以往研究主要在免疫缺陷动物模型中进行的空白	研究主要基于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	探讨BTE在胶质母细胞瘤中的治疗机制和效果	胶质母细胞瘤（GBM）	生物医学	胶质母细胞瘤	多色流式细胞术、单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、多重免疫荧光、多参数磁共振成像（MRI）	NA	实验数据	多个GBM临床前模型中的小鼠
5624	2025-01-23	Finding and Profiling Renal Cells with Spatial Transcriptomics 2025-Jan-22, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1 DOI:10.1681/ASN.0000000632 PMID:39836482	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA	NA
5625	2025-02-13	TGFBR2 High mesenchymal glioma stem cells phenocopy regulatory T cells to suppress CD4+ and CD8+ T cell function 2025-Jan-08, bioRxiv : the preprint server for biology DOI:10.1101/2025.01.07.631757 PMID:39829747	研究论文	本研究通过多方面的分析方法，揭示了TGFBR2高表达的间充质胶质瘤干细胞（GSCs）通过模仿调节性T细胞（Tregs）来抑制CD4+和CD8+ T细胞功能的机制	首次发现并描述了TGFBR2驱动的免疫抑制性GSC状态，并确定了其与TGF-β II型受体的特异性关联	研究主要基于体外实验和患者来源的细胞，尚未在体内模型中验证这些发现	探索胶质母细胞瘤（GBM）中肿瘤微环境的免疫抑制机制，特别是GSCs在其中的作用	胶质母细胞瘤中的间充质胶质瘤干细胞（GSCs）	肿瘤免疫学	胶质母细胞瘤	单细胞测序，生物信息学分析，分子和药理学操作	NA	临床和实验数据集，单细胞测序数据	患者来源的GBM神经球和临床GBM标本
5626	2025-02-13	Differentiation signals induce APOBEC3A expression via GRHL3 in squamous epithelia and squamous cell carcinoma 2025-Jan, The EMBO journal DOI:10.1038/s44318-024-00298-9 PMID:39548236	研究论文	本文通过单细胞RNA测序研究了APOBEC3A和APOBEC3B在健康和恶性黏膜上皮中的表达，并通过免疫组织化学、空间转录组学和功能实验验证了关键观察结果	研究发现APOBEC3A的表达主要局限于终末分化细胞，并需要grainyhead-like转录因子3（GRHL3），而在鳞状细胞癌中，GRHL3的表达和活性扩展到一部分进行DNA复制的细胞，同时APOBEC3A的表达也扩展到增殖细胞	研究未涉及APOBEC3A和APOBEC3B在其他类型癌症中的表达和作用	研究APOBEC3A和APOBEC3B在健康和恶性黏膜上皮中的表达及其在肿瘤发展中的作用	健康和恶性黏膜上皮细胞	分子生物学	鳞状细胞癌	单细胞RNA测序、免疫组织化学、空间转录组学	NA	RNA测序数据、免疫组织化学数据、空间转录组数据	NA
5627	2025-02-13	Multi-omics analysis reveals distinct gene regulatory mechanisms between primary and organoid-derived human hepatocytes 2025-Jan-01, Disease models & mechanisms IF:4.0Q1 DOI:10.1242/dmm.050883 PMID:39878507	研究论文	本文通过整合单细胞转录组和染色质可及性分析，揭示了原代人肝细胞和肝类器官来源的肝细胞之间基因调控机制的差异	首次揭示了AP-1因子与肝细胞特异性转录因子（如HNF4A）在调控区域共定位的潜在合作机制，并发现ELF3在肝类器官来源的肝细胞中独特表达且与肝标志基因表达负相关	研究主要基于体外模型，可能无法完全反映体内肝细胞的复杂调控网络	研究肝细胞发育和疾病的基因调控机制	原代人肝细胞和肝类器官来源的肝细胞	基因组学	肝病	单细胞转录组分析，染色质可及性分析	NA	单细胞RNA-seq数据，染色质可及性数据	NA
5628	2025-02-12	Fibroblast Activation Protein-α Expression in Cancer-Associated Fibroblasts Shows the Poor Survival of Colorectal Cancer via Immune-Mediated Pathways : Implications of FAP in Cancer-Associated Fibroblasts Link Immune Dysregulation to Adverse Survival in Colorectal Cancer 2025-Mar, Annals of surgical oncology IF:3.4Q1 DOI:10.1245/s10434-024-16593-y PMID:39623187	研究论文	本研究探讨了癌症相关成纤维细胞（CAFs）中成纤维细胞激活蛋白-α（FAP）的表达对结直肠癌（CRC）患者生存的影响及其与肿瘤免疫微环境（TIME）的关系	通过免疫组织化学染色和单细胞RNA测序技术，揭示了FAP高表达与CRC患者生存率低及免疫抑制性肿瘤微环境的相关性	研究样本量相对较小，且主要依赖于回顾性数据，可能影响结果的普遍性	探讨FAP在CRC患者生存和肿瘤免疫微环境中的作用	178名接受手术切除的CRC患者及10名未治疗的CRC患者的CAFs	数字病理学	结直肠癌	免疫组织化学染色（IHC），单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	病理切片图像，基因表达数据	178名患者的180个病理切片，10名未治疗患者的CAFs
5629	2025-02-12	Exploring the therapeutic efficacy difference in claudin18.2-targeted cell therapy revealed by single-cell sequencing 2025-Feb-21, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2025.111768 PMID:39925434	研究论文	本文通过单细胞测序技术探索了CLDN18.2靶向细胞疗法的疗效差异	首次通过单细胞测序技术分析了CLDN18.2靶向CAR T细胞疗法在胃癌患者中的疗效差异，并发现了与疗效相关的关键因素	样本量较小，仅涉及5名患者，且仅分析了治疗后的3天和7天的数据	探索CLDN18.2靶向CAR T细胞疗法在胃癌患者中的疗效差异及其相关因素	接受CT041 CAR T细胞治疗的CLDN18.2阳性胃癌患者	数字病理学	胃癌	单细胞测序	NA	单细胞测序数据	5名患者的外周血和腹水样本
5630	2025-02-12	Single-cell and spatial transcriptomics reveal pre-metastatic subsets and therapeutic targets in penile carcinoma 2025-Feb-21, iScience IF:4.6Q1 DOI:10.1016/j.isci.2025.111765 PMID:39925432	研究论文	本研究通过单细胞和空间转录组学技术，揭示了阴茎癌中的预转移亚群及其治疗靶点	发现了MMP3+SPP1+预转移亚群和CK2α过表达，并验证了Silmitasertib作为潜在治疗药物的抗肿瘤效果	样本量相对较小，仅包括6个原发阴茎癌和6个转移淋巴结样本	研究阴茎癌中的肿瘤异质性及其预转移亚群，以优化治疗方案	阴茎癌的原发和转移样本	数字病理学	阴茎癌	单细胞RNA测序、空间转录组学、细胞实验	NA	RNA测序数据、空间转录组数据	6个原发阴茎癌样本、6个转移淋巴结样本、4个晚期阴茎癌样本、98个单细胞数据集、6个空间数据集
5631	2025-02-12	PFKFB3 decreases α-ketoglutarate production while partial PFKFB3 knockdown in macrophages ameliorates arthritis in tumor necrosis factor-transgenic mice 2025-Feb-20, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114102 PMID:39870011	研究论文	本研究探讨了PFKFB3在类风湿性关节炎（RA）患者巨噬细胞中的病理意义及其对巨噬细胞活化的调节作用	揭示了PFKFB3通过调节巨噬细胞活化和α-酮戊二酸产生在RA中的新机制	研究主要基于细胞和小鼠模型，尚未在人类中进行大规模验证	探讨PFKFB3在RA患者巨噬细胞中的作用及其对疾病发展的影响	RA患者的PBMCs、THP-1细胞、条件性PFKFB3敲除小鼠的骨髓源性巨噬细胞	生物医学	类风湿性关节炎	共免疫沉淀、单细胞测序	条件性基因敲除小鼠模型	细胞实验数据、基因表达数据	RA患者PBMCs、THP-1细胞、条件性PFKFB3敲除小鼠
5632	2025-02-12	m6A related metabolic genes in breast cancer and their relationship with prognosis 2025-Feb-20, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114121 PMID:39889412	研究论文	本研究探讨了m6A相关代谢基因在乳腺癌中的作用及其与预后的关系	首次通过单细胞转录组数据分析乳腺癌患者外周血中的m6A相关代谢基因，并构建了乳腺癌风险模型	研究主要基于转录组数据，缺乏对蛋白质水平和功能实验的深入验证	探讨m6A相关代谢基因在乳腺癌中的调控作用及其对预后的影响	乳腺癌患者的外周血单细胞转录组数据和TCGA中的乳腺癌及对照转录组数据	生物信息学	乳腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RNA测序（RNA-seq）、实时定量PCR（qRT-PCR）、Western blot（WB）	Lasso-Cox回归模型	转录组数据	乳腺癌患者的外周血单细胞转录组数据和TCGA中的乳腺癌及对照转录组数据
5633	2025-02-12	Dapagliflozin alleviated seizures and cognition impairment in pilocarpine induced status epilepticus via suppressing microglia-mediated neuroinflammation and oxidative stress 2025-Feb-20, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114117 PMID:39889414	研究论文	本研究探讨了Dapagliflozin通过抑制小胶质细胞介导的神经炎症和氧化应激，减轻癫痫持续状态（SE）引起的癫痫发作和认知障碍的效果	首次揭示了Dapagliflozin通过抑制SGLT2调节小胶质细胞介导的神经炎症和氧化应激，对SE及其相关认知障碍的神经保护作用	研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，尚未在人类临床试验中验证	探讨Dapagliflozin对癫痫持续状态（SE）引起的癫痫发作和认知障碍的治疗效果	雄性C57BL/6小鼠和BV2细胞	神经科学	癫痫	单细胞转录组分析、免疫荧光染色、免疫组化、流式细胞术、Western blot、RT-qPCR、ELISA	NA	基因表达数据、行为数据、生化数据	雄性C57BL/6小鼠和BV2细胞
5634	2025-02-12	Exploring the dynamic responses of group 3 innate lymphoid cells at different times in response to LPS challenge 2025-Feb-20, International immunopharmacology IF:4.8Q1 DOI:10.1016/j.intimp.2025.114162 PMID:39889415	研究论文	本研究探讨了第3组先天性淋巴细胞（ILC3s）在不同时间对LPS挑战的动态响应	结合微阵列数据和单细胞RNA测序数据，分析了ILC3亚群的功能，并发现了肠道ILC3s可能迁移至肺部的证据	研究主要依赖于已有数据库的数据，缺乏实验验证	阐明ILC3s在急性炎症中对LPS挑战的动态响应	第3组先天性淋巴细胞（ILC3s）	免疫学	肺炎	微阵列数据、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术、qRT-PCR	NA	基因表达数据	NA
5635	2025-02-12	Cardiac Reprogramming and Gata4 Overexpression Reduce Fibrosis and Improve Diastolic Dysfunction in Heart Failure With Preserved Ejection Fraction 2025-Feb-11, Circulation IF:35.5Q1 DOI:10.1161/CIRCULATIONAHA.123.067504 PMID:39673349	研究论文	本文研究了心脏重编程和Gata4过表达在保留射血分数心力衰竭（HFpEF）中减少纤维化和改善舒张功能的效果	首次在HFpEF模型中验证了心脏重编程和Gata4过表达的治疗效果，并揭示了其通过抑制心脏成纤维细胞（CFs）激活来减少纤维化的机制	研究主要基于小鼠模型，人类CFs的效果仍需进一步验证	探讨心脏重编程和Gata4过表达在HFpEF中的治疗效果及其机制	Tcf21iCre/Tomato/MGTH2A转基因小鼠和人类心脏成纤维细胞	心血管疾病	心力衰竭	RNA测序（RNA-seq），单细胞RNA测序（scRNA-seq），空间转录组学	转基因小鼠模型	基因表达数据	转基因小鼠和人类心脏成纤维细胞
5636	2025-02-12	Highly efficient combination of multiple single cells using a deterministic single-cell combinatorial reactor 2025-Feb-11, Lab on a chip IF:6.1Q2 DOI:10.1039/d4lc00951g PMID:39679936	研究论文	本文介绍了一种新型微流控设备，结合多层互连Si/SiO控制电路，用于高效组合多个单细胞	引入了确定性单细胞组合反应器（DSCR）设备，通过局部电场实现单细胞的高效捕获和组合	NA	实现多个单细胞的高效组合，以促进单细胞转录组分析和细胞间相互作用的研究	PC3细胞	微流控技术	NA	微流控技术	NA	细胞图像	三组不同荧光染料标记的PC3细胞
5637	2025-02-12	Exploring Parkinson's through the Lens of Genomics and Bioinformatics 2025-Feb-10, Cold Spring Harbor perspectives in medicine IF:7.8Q1 DOI:10.1101/cshperspect.a041621 PMID:39929729	研究论文	本文探讨了基因组学和生物信息学在帕金森病研究中的应用，旨在揭示该疾病的分子机制并寻找新的治疗靶点	应用单细胞转录组学技术揭示了帕金森病中细胞类型特异性的失调和脆弱性，超越了多巴胺能神经元的损失	未具体提及研究的局限性	通过基因组学和生物信息学技术解析帕金森病的分子机制，寻找新的治疗靶点	帕金森病的遗传和分子机制	生物信息学	帕金森病	基因分型、基因组测序、转录组学、单细胞转录组学	NA	基因组数据、转录组数据	大规模人类群体或模式生物
5638	2025-02-12	Mapping T cell dynamics to molecular profiles through behavior-guided transcriptomics 2025-Feb-10, Nature protocols IF:13.1Q1 DOI:10.1038/s41596-024-01126-4 PMID:39930061	研究论文	本文介绍了一种名为行为引导转录组学（BGT）的扩展协议，用于整合T细胞活体成像数据与单细胞转录组学，以分析与动态T细胞行为相关的基因程序	BGT协议结合了BEHAV3D平台的活体成像数据和单细胞RNA测序技术，能够揭示与T细胞动态行为相关的分子驱动因素，从而发现新的生物标志物	该协议需要用户具备基本的细胞培养、成像和编程技能，且实验周期较长，需要一个月时间完成	研究目的是通过整合T细胞活体成像数据和单细胞转录组学，揭示与T细胞动态行为相关的分子机制，以增强癌症免疫治疗的疗效	研究对象为患者来源的肿瘤类器官（PDO）和工程化T细胞的共培养体系	数字病理学	癌症	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、荧光激活细胞分选（FACS）	NA	图像、转录组数据	NA
5639	2025-02-12	uN2CpolyG-mediated p65 nuclear sequestration suppresses the NF-κB-NLRP3 pathway in neuronal intranuclear inclusion disease 2025-Feb-07, Cell communication and signaling : CCS IF:8.2Q1 DOI:10.1186/s12964-025-02079-1 PMID:39920690	研究论文	本研究揭示了uN2CpolyG通过与p65直接相互作用并隔离p65，抑制NF-κB-NLRP3通路并损害自噬的分子机制	首次揭示了uN2CpolyG通过隔离p65抑制NF-κB-NLRP3通路的分子机制，为NIID提供了新的治疗靶点	研究主要基于细胞模型和果蝇模型，尚未在人体中进行验证	阐明uN2CpolyG与NF-κB-NLRP3通路之间的分子相互作用	NIID患者的皮肤组织、HEK-293T和U87-MG细胞模型、果蝇模型	分子生物学	神经退行性疾病	单细胞RNA测序	细胞模型、果蝇模型	基因表达数据	NIID患者的皮肤组织、HEK-293T和U87-MG细胞、果蝇模型
5640	2025-02-12	The Role of Jianpi Jiedu Recipe in Modulating the CRC Microenvironment 2025-Feb-07, Combinatorial chemistry & high throughput screening IF:1.6Q3 DOI:10.2174/0113862073339913241214051331 PMID:39931853	研究论文	本研究探讨了健脾解毒方（JPJDR）在调节结直肠癌（CRC）微环境中的作用及其机制	首次系统性地研究了JPJDR在CRC微环境中的调节作用，并发现其通过下调HMGB1和MT2A基因表达来调节CRC微环境	研究主要基于单细胞RNA测序数据和体外实验，缺乏体内实验验证	探讨JPJDR在CRC治疗中的抗肿瘤机制	结直肠癌（CRC）微环境中的细胞类型，包括恶性CRC细胞、免疫细胞和基质细胞	数字病理	结直肠癌	单细胞RNA测序、RT-qPCR	NA	RNA测序数据	多个已发表研究中的单细胞RNA测序数据（PMID: 32451460, 32103181, 32561858）