单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202501-202512] [清除筛选条件]
当前共找到 10557 篇文献,本页显示第 5621 - 5640 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
5621 2025-10-06
Comparison of differences in transcriptional and genetic profiles between intra-central nervous system and extra-central nervous system large B-cell lymphoma
2025-02, Neoplasia (New York, N.Y.)
研究论文 通过多组学测序比较中枢神经系统内和中枢神经系统外大B细胞淋巴瘤的转录和遗传特征差异 首次通过单细胞RNA测序和全外显子测序系统揭示PCNS-DLBCL特有的B细胞亚群、免疫抑制微环境和BCR-NFkB/TLR通路突变特征 样本量相对有限(93例患者),且为观察性研究 探索PCNS-DLBCL的特定发病机制和治疗靶点 PCNS-DLBCL、继发性CNS-DLBCL和颅外DLBCL患者的肿瘤样本 数字病理学 淋巴瘤 单细胞RNA测序, 全外显子测序, 多组学测序 NA 转录组数据, 基因组数据 93例患者肿瘤样本 NA 单细胞RNA-seq, 全外显子组测序 NA NA
5622 2025-10-06
Overexpression of CX3CL1-CX3CR1 Signaling in the Stria Vascularis rather than the Basilar Membrane May Be the Trigger for Inflammaging in the Cochlea
2025, ORL; journal for oto-rhino-laryngology and its related specialties
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析发现CX3CL1-CX3CR1信号通路在耳蜗血管纹基底细胞中的过表达可能是老年性听力损失中炎症衰老的触发因素 首次通过单细胞RNA测序揭示CX3CL1-CX3CR1信号通路在耳蜗不同区域的分布差异及其在炎症衰老中的特异性作用 仍需进一步的体内干预实验验证研究结论 探究CX3CL1-CX3CR1信号通路在耳蜗炎症衰老中的作用机制 年轻和老年小鼠的耳蜗组织及BV2细胞系 单细胞转录组学 老年性听力损失 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 实时定量PCR, Western blot, 细胞迁移实验 NA 单细胞转录组数据, 图像数据, 蛋白质数据 年轻和老年小鼠的耳蜗组织 NA 单细胞RNA测序 NA NA
5623 2025-10-06
Single-cell sequencing on PBMCs from patients with HA and HB with inhibitors reveals different immune responses to FVIII and FIX
2025-Aug-12, Blood advances IF:7.4Q1
研究论文 通过单细胞测序分析血友病A和血友病B伴抑制剂患者外周血单个核细胞的免疫应答差异 首次在单细胞水平比较血友病A和血友病B伴抑制剂患者对FVIII和FIX的不同免疫应答机制 样本量较小(各5例患者),需更大样本验证 探索血友病A和血友病B患者对FVIII和FIX的不同免疫应答机制 血友病A和血友病B伴抑制剂患者的外周血单个核细胞 单细胞组学 血友病 单细胞测序 NA 单细胞转录组数据 5例HA患者和5例HB患者,共75,051个细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
5624 2025-10-06
DARLIN mouse for in vivo lineage tracing at high efficiency and clonal diversity
2025-08, Nature protocols IF:13.1Q1
研究论文 介绍DARLIN小鼠模型用于高效谱系追踪的逐步实验方案 整合三个条形码阵列并结合Cas9和TdT提高编辑多样性,理论上可产生10^10个独特谱系条形码 需要熟悉测序文库构建和Linux操作,单细胞分析中条形码回收率约70% 开发高效谱系追踪技术研究组织发育和稳态中的细胞历史与动力学 小鼠模型中的细胞谱系 生物信息学 NA 单细胞测序,bulk测序,CRISPR-Cas9编辑 NA 基因组测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
5625 2025-10-06
Single-Cell RNA-Seq Reveals Aging-Related Impairment of Microglial Efferocytosis Contributing to Apoptotic Cells Accumulation After Retinal Injury
2025-Aug, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示衰老导致小胶质细胞清除凋亡细胞功能受损,造成视网膜损伤后凋亡细胞积累 首次在单细胞水平系统揭示衰老通过影响小胶质细胞清除凋亡细胞功能导致视网膜损伤后凋亡细胞积累的机制 研究主要基于小鼠模型,人类视网膜衰老的验证尚需进一步研究 阐明衰老对视网膜小胶质细胞清除凋亡细胞功能的影响及其机制 年轻和老年小鼠视网膜细胞,BV2小胶质细胞系 单细胞转录组学 年龄相关性视网膜疾病 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 74,412个视网膜细胞来自年轻和老年小鼠 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5626 2025-10-06
Circadian Gene BMAL1 Regulation of Cellular Senescence in Thyroid Aging
2025-Aug, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了昼夜节律基因BMAL1通过调控NFKBIA表达影响甲状腺细胞衰老的机制 首次发现昼夜节律核心基因BMAL1在甲状腺衰老过程中的关键作用及其通过NF-κB通路调控细胞衰老的新机制 研究样本量有限,机制研究主要基于动物模型和细胞系实验,在人体中的直接验证不足 探究甲状腺衰老的分子机制及昼夜节律基因在其中的作用 人类甲状腺组织、甲状腺特异性Bmal1敲除小鼠模型、甲状腺细胞系 单细胞生物学 甲状腺疾病 单细胞RNA测序, 转录组测序, 基因敲除 动物模型, 细胞系模型 单细胞转录组数据, 基因表达数据 年轻、中年和老年组的人类甲状腺样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5627 2025-10-06
Cross-Analysis of Single-Cell Transcriptomic Datasets Reveals Conserved Neurogenic Gene Signatures and New Insights Into Neural Stem Cell Aging
2025-Aug, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 通过跨分析单细胞转录组数据集揭示神经干细胞保守的神经源性基因特征及其在衰老过程中的变化 识别了神经干细胞中保守的基因表达谱,提出了新的标记物作为标准化参考,并利用伪时间推断分析揭示神经干细胞的时间动态 依赖公开可用的单细胞RNA测序数据集,可能存在数据质量和注释不一致的问题 解决神经干细胞分子分类和功能研究中的挑战,优化其分类框架 海马体成人神经干细胞 单细胞转录组学 神经退行性疾病 单细胞RNA测序 伪时间推断分析 单细胞转录组数据 多个公开单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
5628 2025-10-06
Linking single-cell transcriptomes with secretion using SEC-seq
2025-07, Nature protocols IF:13.1Q1
研究论文 开发了一种名为SEC-seq的新方法,能够将单个细胞的转录组与其分泌蛋白量关联起来 首次实现了在单细胞水平上同时测量转录组和分泌蛋白量的技术,通过纳米孔技术和寡核苷酸条形码标记系统 需要特定的纳米孔技术和设备,可能对某些实验室来说设备要求较高 研究细胞分泌表型与基因表达状态之间的关联 T细胞、间充质基质细胞、浆细胞等分泌型细胞 单细胞多组学 NA 单细胞RNA测序,流式细胞术,微流控技术 NA 单细胞转录组数据,分泌蛋白定量数据 数千个单细胞 NA 单细胞RNA-seq NA 微流控油包水乳液系统
5629 2025-10-06
TRain: T-cell receptor automated immunoinformatics
2025-Mar-06, BMC bioinformatics IF:2.9Q1
研究论文 开发了一个名为TRain的自动化生物信息学工具,用于简化从T细胞受体序列到三维TCR-pMHC复合物结构预测的流程 首次提供了一个整合的自动化流程,将单细胞测序数据转换为完整的TCR氨基酸序列,并自动化进行TCR结构建模和与pMHC的对接预测 依赖于现有的TCR特异性建模流程和RosettaDock工具,可能受限于这些工具的准确性和局限性 开发自动化工具简化TCR-pMHC复合物结构预测流程 T细胞受体和肽-MHC复合物 生物信息学 免疫相关疾病 单细胞测序,蛋白质结构建模,分子对接 RosettaDock 序列数据,结构数据 NA NA 单细胞测序 NA NA
5630 2025-10-06
β-Catenin mediated TAM phenotype promotes pancreatic cancer metastasis via the OSM/STAT3/LOXL2 axis
2025-02, Neoplasia (New York, N.Y.)
研究论文 本研究揭示了β-连环蛋白通过调控肿瘤相关巨噬细胞表型促进胰腺癌转移的新机制 首次发现β-连环蛋白信号在TAM中特异性激活,并鉴定出β-连环蛋白/OSM-STAT3/LOXL2信号轴在TAM诱导的胰腺癌进展中的关键作用 研究主要基于细胞系和动物模型,需要进一步在临床样本中验证 探究肿瘤相关巨噬细胞促进胰腺导管腺癌进展的分子机制 胰腺导管腺癌细胞、THP-1来源的巨噬细胞、Panc02肺转移模型 肿瘤生物学 胰腺癌 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 体外共培养, 体内转移模型 NA 基因表达数据, 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
5631 2025-10-06
Tcf21 as a founder transcription factor in specifying Foxd1 cells to the juxtaglomerular cell lineage
2025-Jan-01, American journal of physiology. Renal physiology
研究论文 本研究揭示了转录因子Tcf21在Foxd1阳性基质祖细胞向肾小球旁细胞谱系分化过程中的关键作用 首次通过整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序分析,揭示了Tcf21在肾脏发育早期阶段对Foxd1细胞向肾小球旁细胞分化的关键调控作用 研究主要基于小鼠模型,人类肾脏发育中的类似机制仍需进一步验证 探究Tcf21转录因子在Foxd1阳性基质祖细胞向肾小球旁细胞分化过程中的作用机制 小鼠肾脏Foxd1阳性基质祖细胞和肾小球旁细胞 发育生物学 肾脏发育疾病 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 免疫染色, 原位杂交 小鼠基因敲除模型 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据, 组织图像数据 2,054个细胞(来自E12、E18、P5和P30时间点的GFP阳性基质谱系细胞) NA 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 NA NA
5632 2025-10-06
Identification and Construction of a R-loop Mediated Diagnostic Model and Associated Immune Microenvironment of COPD through Machine Learning and Single-Cell Transcriptomics
2025-Aug, Inflammation IF:4.5Q2
研究论文 通过机器学习和单细胞转录组学构建R-loop介导的COPD诊断模型并分析其免疫微环境特征 首次系统研究R-loop调节因子在COPD中的作用,利用12种机器学习算法识别关键R-loop调节因子,建立基于14个R-loop调节因子的风险评分模型并发现两种不同COPD亚型 研究样本量未明确说明,部分发现仅在动物模型中验证 探索R-loop调节因子在慢性阻塞性肺疾病(COPD)发病机制中的作用并构建诊断模型 COPD患者肺组织、小鼠肺组织 机器学习, 单细胞转录组学 慢性阻塞性肺疾病 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, RT-PCR 机器学习算法(12种算法150种组合) 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
5633 2025-10-06
PD-L1 Promotes Immunological Tolerance and Enhances Visual Protection of hESC-RPE Grafts in Retinal Degeneration
2025-Aug, Cell proliferation IF:5.9Q2
研究论文 本研究探讨PD-L1过表达在改善人胚胎干细胞来源视网膜色素上皮细胞移植治疗年龄相关性黄斑变性中的免疫保护作用 提出无需删除MHC基因仅通过PD-L1过表达即可增强hESC-RPE移植物存活和视觉保护的新策略 研究主要聚焦于PD-L1的免疫调节作用,未全面评估其他免疫检查点的潜在影响 探索PD-L1过表达对hESC-RPE移植免疫耐受和视觉功能保护的作用机制 人胚胎干细胞来源视网膜色素上皮细胞和视网膜退行性病变模型 细胞治疗 年龄相关性黄斑变性 单细胞转录组测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
5634 2025-10-06
Exploration of heterogeneity and recurrence signatures in hepatocellular carcinoma
2025-Aug, Molecular oncology IF:5.0Q1
研究论文 本研究通过整合分析肝细胞癌的单细胞RNA测序数据,揭示了复发肿瘤的异质性特征并构建了复发预后模型 首次系统揭示肝细胞癌复发过程中的细胞异质性变化,识别MIF-(CD74+CXCR4)信号通路的关键作用,并开发了基于机器学习的新型复发风险评分模型 研究样本量有限,需要更大规模队列验证模型的普适性 探索肝细胞癌复发异质性特征并开发预后预测模型 肝细胞癌患者样本和小鼠移植模型 生物信息学 肝细胞癌 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, 机器学习, RT-qPCR, 免疫组化 机器学习模型 基因表达数据, 单细胞数据 未明确样本数量 NA 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq NA NA
5635 2025-10-06
Time, the final frontier
2025-Aug, Molecular oncology IF:5.0Q1
评论 本文主张将时间动态维度整合到癌症研究中,强调从传统终点实验向数据驱动的连续方法转变 提出将时间动态分析作为癌症研究的新前沿,强调开发活体成像技术、时间组学方法和计算工具来探索肿瘤演化过程 NA 推动癌症研究从静态分析向动态时间维度整合的范式转变 肿瘤生态系统及其时间演化过程 数字病理学 癌症 活体成像技术、时间组学方法、计算分析 NA 时间序列数据、空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
5636 2025-10-06
Taurine from tumour niche drives glycolysis to promote leukaemogenesis
2025-Aug, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术发现肿瘤微环境中的牛磺酸通过驱动糖酵解促进白血病发生 首次系统描绘白血病进展过程中基质信号的动态变化,鉴定牛磺酸-TAUT轴作为侵袭性髓系白血病的关键依赖性通路 研究主要聚焦于髓系白血病,对其他类型白血病的适用性需进一步验证 探索肿瘤微环境对白血病干细胞的支持机制 白血病干细胞、骨髓基质细胞、小鼠模型和患者来源的急性髓系白血病细胞 单细胞生物学 白血病 单细胞RNA测序、CRISPR筛选、多组学分析 基因敲除小鼠模型 单细胞转录组数据、基因表达数据 未明确说明具体样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
5637 2025-10-06
Exploiting the endothelial-immune axis to improve radiotherapy efficacy
2025-Aug-01, The British journal of radiology
综述 探讨放射治疗中内皮细胞与免疫系统的相互作用机制及其对治疗效果的影响 提出通过靶向内皮-免疫轴来增强放射治疗疗效的新策略 NA 改善放射治疗的疗效并减少副作用 血管内皮细胞与免疫细胞在放射治疗中的相互作用 数字病理学 肿瘤 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA NA
5638 2025-10-06
Cytokine-induced reprogramming of human macrophages toward Alzheimer's disease-relevant molecular and cellular phenotypes in vitro
2025-Jul-22, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 研究细胞因子混合物对人THP-1巨噬细胞向阿尔茨海默病相关表型重编程的作用 首次使用特定细胞因子组合(IL-4、CSF1、IL-34和TGF-β)在体外将人巨噬细胞重编程为AD相关表型 研究仅限于体外THP-1巨噬细胞模型,未在体内验证 开发阿尔茨海默病相关的体外巨噬细胞模型 人THP-1巨噬细胞 单细胞生物学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序,转录组分析,功能测定 NA 基因表达数据,单细胞测序数据 THP-1巨噬细胞系 NA 单细胞RNA测序 NA NA
5639 2025-10-06
Generation and long-term culture of human cerebellar organoids from pluripotent stem cells
2025-06, Nature protocols IF:13.1Q1
研究论文 开发了一种从人多能干细胞生成和长期培养人类小脑类器官的方案 首次建立了能够复制胎儿小脑细胞多样性和独特细胞结构特征的人类小脑类器官模型 NA 研究人类小脑发育和疾病 人类小脑类器官 发育神经生物学 小脑疾病 单细胞转录组学、免疫组织化学、钙动力学、电生理学 NA 转录组数据、图像数据、电生理数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
5640 2025-10-06
Targeting of arachidonic acid-modulated autophagy to enhance the sensitivity of ROS1 + or ALK + non-small cell lung cancer to crizotinib therapy
2025-Mar-31, Translational lung cancer research IF:4.0Q1
研究论文 本研究揭示了花生四烯酸通过调节自噬流促进ROS1+或ALK+非小细胞肺癌对克唑替尼耐药的机制 首次发现STAT3磷酸化失活和PTGS2下调导致花生四烯酸积累,进而通过促进自噬流驱动克唑替尼耐药的新机制 研究主要基于细胞系模型,尚未进行体内动物实验验证 阐明克唑替尼耐药机制并寻找克服耐药的新治疗策略 ROS1+或ALK+非小细胞肺癌细胞系(HCC78和H3122) 癌症生物学 非小细胞肺癌 单细胞RNA测序,代谢组学分析 细胞耐药模型 基因表达数据,代谢物数据 2种细胞系,3个类器官样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
回到顶部