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当前共找到 10557 篇文献，本页显示第 5601 - 5620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5601 | 2025-10-06 |
Deciphering the senescence-based tumoral heterogeneity and characteristics in pancreatic cancer: Results from parallel bulk and single-cell transcriptome data
2025-01, IUBMB life
IF:3.7Q2
DOI:10.1002/iub.70001
PMID:39865528
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研究论文 | 通过整合分析批量与单细胞RNA测序数据，揭示胰腺癌中基于细胞衰老的肿瘤异质性特征 | 首次在批量和单细胞水平并行分析胰腺癌的衰老相关异质性，识别关键衰老相关基因并验证其功能 | 基于公共数据库的回顾性分析，需要进一步实验验证 | 解析胰腺癌中基于细胞衰老的肿瘤异质性及其特征 | 胰腺癌患者组织样本和胰腺癌细胞 | 生物信息学 | 胰腺癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, ssGSEA算法, infercnv算法 | 无监督聚类分析 | 转录组数据, 单细胞转录组数据 | 来自TCGA-PAAD、PACA-AU、PACA-CA和GSE154778数据集的胰腺癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 5602 | 2025-10-06 |
Integrated analysis of scRNA-seq and bulk RNA-seq data reveals the key targets of the combination of cisplatin and saikosaponin D in gastric cancer cells
2025-Sep-08, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152359
PMID:40674817
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据分析，揭示柴胡皂苷D联合顺铂治疗胃癌细胞的关键靶点 | 首次整合单细胞和批量RNA测序数据，系统分析柴胡皂苷D增强胃癌细胞对顺铂敏感性的分子机制，发现FAK/AKT/mTOR信号通路的关键作用 | 研究主要基于细胞系实验，缺乏体内动物模型验证；样本量相对有限 | 探究柴胡皂苷D增强胃癌细胞对顺铂敏感性的分子机制和潜在治疗靶点 | 胃癌细胞系（AGS和SGC-7901）及TCGA-GTEx数据库中的胃腺癌数据 | 生物信息学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 实时PCR, 蛋白质印迹, 网络药理学, 分子对接 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据 | 胃癌细胞系和TCGA-GTEx数据库样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 5603 | 2025-10-06 |
HSD17B2 serves as a novel tumor-suppressive regulator in colorectal cancer progression
2025-Sep-08, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.152396
PMID:40706248
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现HSD17B2是结直肠癌进展中的新型肿瘤抑制因子 | 首次系统鉴定HSD17B2在结直肠癌中的肿瘤抑制功能，并通过多数据集整合分析和功能验证证实其作用机制 | 研究主要基于数据库分析和细胞系实验，缺乏更深入的体内机制研究和临床前验证 | 探索结直肠癌发病机制中的关键分子调控因子 | 结直肠癌组织、人结直肠癌细胞系(Caco-2, HT-29, HCT-116)和AOM/DSS诱导的小鼠结直肠癌模型 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 转录组分析, 单细胞RNA测序, 差异表达分析, WGCNA分析 | NA | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 多个GEO数据集(GSE103512, GSE39923, GSE44076, GSE68468, GSE221575)和3个人类结直肠癌细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 5604 | 2025-10-06 |
Integrating transcriptomics, network analysis, and single-cell RNA sequencing to identify and validate key target genes of gynostemma in the treatment of non-alcoholic fatty liver disease
2025-Sep-01, European journal of pharmaceutical sciences : official journal of the European Federation for Pharmaceutical Sciences
IF:4.3Q1
DOI:10.1016/j.ejps.2025.107214
PMID:40706769
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研究论文 | 本研究通过整合转录组学、网络分析和单细胞RNA测序，探索绞股蓝治疗非酒精性脂肪肝的靶基因和机制 | 首次结合网络分析、机器学习算法和单细胞RNA测序系统鉴定绞股蓝治疗NAFLD的关键靶基因PIM1、TYMS和SLC29A1 | 研究主要基于生物信息学分析和体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证 | 探索绞股蓝治疗非酒精性脂肪肝的分子机制和关键靶基因 | 非酒精性脂肪肝疾病相关的基因表达数据和HepG2、HuH7、QSG7701肝细胞系 | 生物信息学 | 非酒精性脂肪肝 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, 网络分析, 机器学习, RT-qPCR | 机器学习算法, WGCNA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | 2569个差异表达基因, 1279个关键模块基因, 532个靶基因, 3种肝细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序 | NA | NA |
| 5605 | 2025-10-06 |
Excitatory synaptic transmission is differentially modulated by opioid receptors along the claustro-cingulate pathway
2025-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.31.646444
PMID:40236172
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研究论文 | 本研究探讨阿片受体在CLA-ACC神经通路中对兴奋性突触传递的调控机制 | 首次揭示KOR、MOR和DOR阿片受体在扣带皮层-屏状核通路中对兴奋性突触传递的差异化调控作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在更高阶物种中验证 | 阐明阿片受体在扣带皮层-屏状核神经环路中对谷氨酸能信号传递的调控机制 | 小鼠扣带皮层第五层锥体神经元和屏状核神经元 | 神经科学 | 疼痛感知障碍 | 空间转录组学, 脑片电生理学, 光遗传学, 药理学方法 | NA | 电生理信号, 基因表达数据 | 小鼠脑组织样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5606 | 2025-10-06 |
Benchmarking spatial transcriptomics technologies with the multi-sample SpatialBenchVisium dataset
2025-Mar-28, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03543-4
PMID:40156041
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研究论文 | 本研究通过构建SpatialBenchVisium数据集，对10x Genomics Visium空间转录组技术进行基准测试 | 创建了首个包含多种组织处理方案的空间转录组参考数据集，系统比较了不同样本处理方法的数据质量 | 研究仅针对小鼠脾脏组织，未验证其他组织类型 | 评估空间转录组技术的性能和数据质量 | 小鼠脾脏组织在疟疾感染反应中的空间基因表达 | 空间转录组学 | 疟疾感染 | 空间转录组技术，单细胞RNA测序 | NA | 空间基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | 多个小鼠脾脏组织样本 | 10x Genomics | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | 10x Visium | 10x Visium平台，包含新鲜冷冻和FFPE样本处理，支持手动和CytAssist组织放置 |
| 5607 | 2025-10-06 |
An insight into COVID-19 host immunity at single-cell resolution
2025, International reviews of immunology
IF:4.3Q2
DOI:10.1080/08830185.2024.2443420
PMID:39707914
|
综述 | 基于单细胞转录组学研究，系统描述COVID-19感染和疫苗接种过程中宿主免疫细胞的分子行为变化 | 首次在单细胞分辨率下系统总结先天性和适应性免疫细胞在COVID-19感染和疫苗接种过程中的动态变化 | 仅基于过去3-4年发表的研究，未包含最新进展 | 探究SARS-CoV-2感染过程中宿主免疫反应的细胞和分子机制 | 先天性和适应性免疫细胞类型及状态 | 单细胞生物学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5608 | 2025-10-06 |
Next-generation deconvolution of the tumor microenvironment with omnideconv
2025, Methods in cell biology
DOI:10.1016/bs.mcb.2025.01.003
PMID:40683686
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研究论文 | 介绍了一个名为omnideconv的R软件包，用于整合多种肿瘤微环境细胞反卷积方法 | 开发了统一框架整合多种反卷积算法，简化了使用流程并统一了数据语义 | NA | 开发标准化工具来简化肿瘤微环境细胞组成的计算分析 | 乳腺癌肿瘤微环境中的恶性和正常细胞 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 反卷积算法 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 5609 | 2025-10-06 |
VEGFA and APOE regulate distinct functional states of mast cells in hepatocellular carcinoma: A single-cell transcriptome analysis
2025-Sep, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.146131
PMID:40683486
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示肝细胞癌中肥大细胞的功能异质性及其对预后的影响 | 首次在肝细胞癌中鉴定出四种功能不同的肿瘤相关肥大细胞亚群，并发现VEGFA和APOE分别调控其促癌和抑癌功能状态 | 样本量相对有限，需要更大规模的研究验证发现 | 研究肝细胞癌中肥大细胞的异质性及其在肿瘤发展中的双重作用 | 肝细胞癌患者肿瘤组织和癌旁组织 | 单细胞转录组学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，多重免疫组化，细胞功能实验 | NA | 单细胞转录组数据，免疫组化数据，公共数据库数据 | 32例HCC患者肿瘤组织，5例癌旁组织，90对验证用肿瘤和癌旁组织 | NA | 单细胞RNA测序，多重免疫组化 | NA | NA |
| 5610 | 2025-10-06 |
Deciphering the role of CAPZA2 in neurodevelopmental disorders: insights from mouse models
2025-Jul-15, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08385-1
PMID:40659881
|
研究论文 | 通过小鼠模型研究CAPZA2基因在神经发育障碍中的作用机制 | 首次系统揭示CAPZA2基因缺陷导致神经发育障碍的分子机制和表型特征 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类临床样本中验证 | 探究CAPZA2基因在神经发育障碍中的致病机制 | CAPZA2杂合敲除和点突变小鼠模型 | 神经科学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序,行为学分析,形态学分析 | 基因编辑小鼠模型 | 基因表达数据,行为数据,形态学数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5611 | 2025-10-06 |
SPaSE: Spatially resolved pathology scores using optimal transport on spatial transcriptomics data
2025-Jul-16, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101301
PMID:40480226
|
研究论文 | 开发了一种基于最优传输算法的空间病理评分方法SPaSE，用于分析空间转录组数据 | 首次将最优传输算法应用于空间转录组数据分析，能够量化每个空间位置的病理影响程度 | 未明确说明算法的计算复杂度和在大规模数据集上的可扩展性 | 开发空间分辨的病理评分方法以识别组织中的病理变化区域 | 心肌梗死小鼠模型、创伤性脑损伤小鼠模型、杜氏肌营养不良小鼠模型以及人类心肌梗死数据 | 空间转录组学 | 心血管疾病, 神经系统疾病, 肌肉疾病 | 空间转录组技术, 最优传输算法 | 最优传输模型 | 空间转录组数据 | 多个小鼠疾病模型和人类疾病数据 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5612 | 2025-10-06 |
Aging induces T cells with distinct transcriptomic profiles and functions in brain-associated tissues
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1619196
PMID:40534878
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现衰老诱导脑相关组织中CD4+和CD8+T细胞转录组向效应记忆表型转变，并鉴定出具有潜在保护功能的CD153+ CD4+T细胞亚群 | 首次在脑相关组织（脑膜和脉络丛）中系统揭示衰老诱导的T细胞转录组变化，并发现CD153+ CD4+T细胞在衰老大脑中的潜在保护功能 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证；功能机制研究仍需深入 | 探究衰老对非淋巴组织中T细胞转录组和功能特性的影响 | 年轻和年老小鼠脑相关组织（脑膜、脉络丛、海马体）中的CD4+和CD8+T细胞 | 单细胞生物学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），流式细胞术，抗体清除实验 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | 年轻和年老小鼠的脑相关组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5613 | 2025-10-06 |
Microglia Single-Cell RNA-Seq Enables Robust and Applicable Markers of Biological Aging
2025-Aug, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70095
PMID:40371813
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据开发基于小胶质细胞的生物年龄标记物 | 首次在单细胞水平开发基于小胶质细胞的生物年龄时钟，采用无监督频率汇总方法平衡准确性、可解释性和计算效率 | 研究依赖于现有单细胞数据集，需要进一步实验验证 | 开发稳健且适用的生物年龄标记物 | 人类和小鼠的小胶质细胞 | 生物信息学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | 无监督频率汇总方法 | 单细胞转录组数据，批量RNA测序数据 | 三个不同的单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5614 | 2025-10-06 |
Aging Compromises Terminal Differentiation Program of Cytotoxic Effector Lineage and Promotes Exhaustion in CD8+ T Cells Responding to Coronavirus Infection
2025-Aug, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70109
PMID:40396260
|
研究论文 | 本研究通过小鼠冠状病毒感染模型揭示衰老如何通过调控关键转录因子损害CD8+T细胞的终末分化程序并促进T细胞耗竭 | 首次发现衰老会损害（而非促进）病毒特异性CD8+T细胞的终末分化程序，并鉴定出ZEB2和KLF2转录因子在此过程中的关键调控作用 | 研究基于小鼠冠状病毒感染模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究衰老对冠状病毒感染中病毒特异性T细胞分化程序的影响机制 | 年轻和年老小鼠的CD8+T细胞、CD4+T细胞及髓系细胞 | 免疫学 | 冠状病毒感染 | bulk转录组测序, 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 不同年龄组的小鼠T细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5615 | 2025-10-06 |
Cellular hierarchies of embryonal tumors with multilayered rosettes are shaped by oncogenic microRNAs and receptor-ligand interactions
2025-Jun, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-025-00964-9
PMID:40419763
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研究论文 | 通过单细胞转录组学和空间成像技术揭示胚胎性多层菊花团肿瘤的细胞层级结构及其调控机制 | 首次系统解析ETMR肿瘤的细胞层级结构，发现C19MC微RNA簇在干细胞样细胞中的主导表达及其调控网络，并识别出可靶向的致癌信号通路 | 样本量较小（11例患者样本），需要更大规模研究验证发现 | 探究胚胎性多层菊花团肿瘤的细胞异质性和致病机制 | 胚胎性多层菊花团肿瘤患者样本 | 数字病理学 | 儿科脑肿瘤 | 单细胞转录组学，多重空间成像，microRNA-mRNA结合全基因组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，空间成像数据 | 11例ETMR患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 5616 | 2025-10-06 |
Differential memory enrichment of cytotoxic CD4 T cells in Parkinson's disease patients reactive to α-synuclein
2025-May-14, NPJ Parkinson's disease
DOI:10.1038/s41531-025-00981-6
PMID:40368950
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研究论文 | 本研究探讨帕金森病患者中对α-突触核蛋白有反应的细胞毒性CD4 T细胞的记忆富集差异 | 首次发现CELSR2在PD患者CD4效应记忆T细胞中高表达，并揭示Granulysin CD4细胞毒性T细胞在PD_R患者中减少 | 样本量有限，未涵盖所有PD患者亚型，机制研究尚不完善 | 深入理解对α-突触核蛋白有反应的帕金森病患者T细胞亚群的病理变化 | 帕金森病患者和健康对照者的外周血T细胞 | 免疫学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 基因表达数据,蛋白质表达数据 | 帕金森病患者和健康对照者（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5617 | 2025-10-06 |
Sex-dependent effects of peptidylarginine deiminases on neutrophil function and long-term outcomes after spinal cord injury
2025-May-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.08.652924
PMID:40463031
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研究论文 | 本研究探讨肽酰精氨酸脱亚氨酶对脊髓损伤后中性粒细胞功能和长期预后的性别依赖性影响 | 首次描述脊髓损伤后PAD介导的中性粒细胞功能存在性别差异，强调临床前研究需纳入两性样本的重要性 | 未观察到PAD4缺失对运动功能恢复的影响，组织保护效应存在性别差异但机制尚不明确 | 探究PADs在脊髓损伤恢复中的作用及性别差异 | 小鼠脊髓损伤模型中的中性粒细胞功能 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序，基因敲除模型，pan-PAD抑制剂处理 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据，组织学数据，行为学数据 | 未明确样本数量的小鼠实验模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5618 | 2025-10-06 |
BDNF-GABA signaling in astrocytes: enhancing neural repair after SCI through MSC therapies
2025-05, Spinal cord
IF:2.1Q1
DOI:10.1038/s41393-025-01077-x
PMID:40229538
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研究论文 | 通过生物信息学分析探索星形胶质细胞在脊髓损伤修复中的作用机制及间充质干细胞治疗的潜在价值 | 首次整合单细胞转录组、空间转录组和bulk RNA-seq数据，系统揭示BDNF调控的GABA信号通路在星形胶质细胞介导的神经修复中的关键作用 | 基于公共数据库的回顾性分析，缺乏实验验证 | 探索脊髓损伤后星形胶质细胞的变化及其在间充质干细胞治疗中的作用机制 | 星形胶质细胞、间充质干细胞、诱导多能干细胞 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | scRNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq, GSEA | NA | 转录组数据 | 来自GEO数据库的公共数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5619 | 2025-10-06 |
Regulatory mechanisms of the Hippo/YAP axis by G-protein coupled estrogen receptor in gastric signet-ring cell carcinoma
2025-09, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2025.101199
PMID:40554953
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研究论文 | 本研究揭示了G蛋白偶联雌激素受体通过调控Hippo/YAP信号轴在胃印戒细胞癌中的致癌机制 | 首次在胃印戒细胞癌中发现GPER通过竞争性结合ARRB2抑制LATS1介导的YAP磷酸化，并揭示GPER与YAP之间存在的正反馈循环机制 | 研究主要基于细胞系和异种移植模型，缺乏临床患者样本的验证 | 阐明GPER在胃印戒细胞癌中调控Hippo/YAP信号轴的功能机制 | 胃印戒细胞癌细胞系和裸鼠异种移植模型 | 癌症生物学 | 胃癌 | 单细胞测序，体外细胞功能实验，体内异种移植模型 | NA | 测序数据，实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5620 | 2025-10-06 |
Novel Transcriptomic Signatures in Fibrostenotic Crohn's Disease: Dysregulated Pathways, Promising Biomarkers, and Putative Therapeutic Targets
2025-Jun-13, Inflammatory bowel diseases
IF:4.5Q1
DOI:10.1093/ibd/izaf021
PMID:39977234
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研究论文 | 本研究通过转录组学分析探索克罗恩病纤维狭窄的分子特征，识别关键生物标志物和治疗靶点 | 首次系统揭示克罗恩病纤维狭窄的独特转录组特征，结合机器学习方法识别特异性基因表达模式 | 样本量较小（仅9例患者），需要在更大队列中验证发现 | 探索克罗恩病纤维狭窄的转录组特征及其生物学机制 | 克罗恩病患者手术切除的纤维狭窄肠道组织 | 转录组学 | 克罗恩病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, qPCR | 随机森林 | RNA测序数据 | 9例克罗恩病患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | 10x Chromium Controller | 10x Chromium单细胞测序平台 |