单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
5581	2025-02-18	TIMD4hiMHCⅡhi Macrophages Preserve Heart Function Through Retnla 2025-Jan, JACC. Basic to translational science DOI:10.1016/j.jacbts.2024.08.009 PMID:39906591	研究论文	本文通过遗传命运映射和单细胞RNA测序技术，确认了TIMD4MHCⅡ巨噬细胞亚群的存在，并发现其通过Retnla基因保护心脏功能	首次确认TIMD4MHCⅡ巨噬细胞亚群的存在，并揭示其通过Retnla基因保护心脏功能的机制	未详细探讨TIMD4MHCⅡ巨噬细胞在其他疾病中的作用	研究TIMD4MHCⅡ巨噬细胞在心脏功能保护中的作用	TIMD4MHCⅡ巨噬细胞	生物医学	心血管疾病	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
5582	2025-02-17	Inhibiting ceramide synthase 5 expression in microglia decreases neuroinflammation after spinal cord injury 2025-Oct-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1 DOI:10.4103/NRR.NRR-D-23-01933 PMID:39610106	研究论文	本文研究了抑制小胶质细胞中神经酰胺合成酶5（ceramide synthase 5）表达对脊髓损伤后神经炎症的影响	首次揭示了神经酰胺合成酶5在脊髓损伤后小胶质细胞焦亡和神经炎症中的关键作用，并发现其通过NLRP3信号通路介导这一过程	研究主要基于小鼠模型和细胞共培养系统，尚未在人类中进行验证	探讨小胶质细胞在脊髓损伤后调控神经炎症反应的分子机制	小胶质细胞、脊髓损伤小鼠模型、PC12-BV2细胞共培养系统	神经科学	脊髓损伤	单细胞RNA测序、siRNA注射、分子抑制剂注射	小鼠脊髓损伤模型、PC12-BV2细胞共培养系统	RNA测序数据、细胞实验数据	未明确说明具体样本数量，但涉及小鼠模型和细胞实验
5583	2025-02-17	Developmental Origins and Oncogenesis in Medulloblastoma 2025-Feb-14, Annual review of neuroscience IF:12.1Q1 DOI:10.1146/annurev-neuro-112723-061540 PMID:39952636	研究论文	本文探讨了髓母细胞瘤的发育起源和致癌机制，特别是通过单细胞转录组学研究揭示了潜在的细胞谱系脆弱性和恶性转化的机制	通过单细胞转录组学研究揭示了髓母细胞瘤的细胞起源和恶性转化机制，强调了遗传-表观遗传改变在肿瘤形成中的作用	未提及具体的研究样本数量或实验设计细节	理解髓母细胞瘤的细胞起源和致癌机制，以预防肿瘤形成和复发	髓母细胞瘤的细胞起源、遗传和表观遗传改变	癌症研究	髓母细胞瘤	单细胞转录组学	NA	转录组数据	NA
5584	2025-02-17	PD-L1 Promotes Immunological Tolerance and Enhances Visual Protection of hESC-RPE Grafts in Retinal Degeneration 2025-Feb-14, Cell proliferation IF:5.9Q2 DOI:10.1111/cpr.70007 PMID:39953740	研究论文	本研究探讨了PD-L1过表达在人类胚胎干细胞衍生的视网膜色素上皮（hESC-RPE）移植中对免疫排斥的抑制作用及其对视网膜退行性疾病的视觉保护效果	提出了一种无需删除MHC基因的PD-L1过表达策略，保留了hESC-RPE对NK细胞的免疫抑制功能，并显著提高了移植物的存活率和视觉保护效果	研究主要基于动物模型，尚未在人体中进行验证	提高hESC-RPE移植治疗年龄相关性黄斑变性（AMD）的效率	人类胚胎干细胞衍生的视网膜色素上皮（hESC-RPE）	生物医学工程	年龄相关性黄斑变性（AMD）	单细胞转录组学	NA	基因表达数据	视网膜退行性模型中的hESC-RPE移植物
5585	2025-02-17	Analysis of microarray and single-cell RNA-seq identifies gene co-expression, cell-cell communication, and tumor environment associated with metabolite interconversion enzyme in prostate cancer 2025-Feb-13, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-01926-4 PMID:39946051	研究论文	本研究通过基因表达微阵列数据、单细胞RNA测序、癌基因和肿瘤抑制基因，利用生物信息学技术分析了前列腺癌中与代谢物互变酶相关的差异表达基因的相互作用网络	这种分析在之前的研究中尚未有记录	NA	提供关于前列腺癌中差异表达基因的分子特性和通路的新视角，并揭示在前列腺癌发生和进展中起关键作用的潜在生物标志物	前列腺癌	生物信息学	前列腺癌	基因表达微阵列、单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	NA
5586	2025-02-17	Integrative machine learning model of RNA modifications predict prognosis and treatment response in patients with breast cancer 2025-Feb-13, Cancer cell international IF:5.3Q1 DOI:10.1186/s12935-025-03651-y PMID:39948551	研究论文	本研究通过整合多种RNA修饰，开发了一个基于机器学习的RNA修饰特征模型（CMRS），用于预测乳腺癌患者的预后和治疗反应	首次整合九种RNA修饰，开发了CMRS模型，并揭示了RNA修饰在乳腺癌预后和治疗中的重要作用	研究为回顾性分析，需要前瞻性研究进一步验证CMRS模型的临床适用性	探索RNA修饰在乳腺癌预后和治疗中的作用，并开发预测模型	乳腺癌患者	机器学习	乳腺癌	单细胞RNA测序，免疫浸润分析，免疫组化	CMRS模型	RNA测序数据，单细胞RNA测序数据，免疫组化数据	15个独立的乳腺癌队列
5587	2025-02-17	Long Non-Coding RNAs in Ovarian Cancer: Mechanistic Insights and Clinical Applications 2025-Jan-30, Cancers IF:4.5Q1 DOI:10.3390/cancers17030472 PMID:39941838	综述	本文综述了长链非编码RNA（lncRNA）在卵巢癌中的多面角色及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力	强调了lncRNA在卵巢癌中的双重作用，既可作为致癌基因也可作为肿瘤抑制基因，并探讨了其在诊断和治疗中的潜力	综述性文章，缺乏原始实验数据支持	探讨lncRNA在卵巢癌发病机制中的作用及其在诊断和治疗中的应用潜力	卵巢癌中的长链非编码RNA（lncRNA）	癌症生物学	卵巢癌	单细胞测序、生物信息学、组学方法	NA	文献数据、组学数据	NA
5588	2025-02-17	Robust Cluster Prediction Across Data Types Validates Association of Sex and Therapy Response in GBM 2025-Jan-28, Cancers IF:4.5Q1 DOI:10.3390/cancers17030445 PMID:39941811	研究论文	本文利用基因微阵列数据训练了一个能够跨平台预测的模型，验证了性别与胶质母细胞瘤治疗反应之间的关联	使用稳健的集成机器学习方法，训练了一个能够在RNA-seq和潜在的单细胞RNA-seq等多平台上进行预测的模型	预测特征集仅对女性患者有效，对男性患者的应用产生了意外结果	验证性别与胶质母细胞瘤治疗反应之间的关联	胶质母细胞瘤患者	机器学习	胶质母细胞瘤	基因微阵列数据、RNA-seq、scRNA-seq	集成机器学习	基因表达数据	NA
5589	2025-02-17	Stem cell expression of CXCR4 regulates tissue composition in the vomeronasal organ 2025-Jan-01, Journal of cell science IF:3.3Q3 DOI:10.1242/jcs.263451 PMID:39639824	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序、免疫荧光染色和谱系追踪技术，揭示了CXCR4在增殖干细胞和基底神经元谱系中的表达，并探讨了其在犁鼻器组织组成中的作用	首次发现CXCR4在增殖干细胞和基底神经元谱系中的表达，并揭示了其在神经元成熟和非神经元细胞类型中的调控作用	研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类或其他动物模型中验证	探讨CXCR4在犁鼻器组织组成和细胞分化中的作用	小鼠的犁鼻器组织	细胞生物学	NA	单细胞RNA测序、免疫荧光染色、谱系追踪	NA	RNA测序数据、图像数据	小鼠模型
5590	2025-02-16	Cannabidiol restores hematopoietic stem cell stemness in mouse through Atf2-Lrp6 axis after acute irradiation 2025-Feb, MedComm IF:10.7Q1 DOI:10.1002/mco2.70092 PMID:39949985	研究论文	本研究探讨了大麻二酚（CBD）在急性辐射后通过Atf2-Lrp6轴恢复小鼠造血干细胞干性的作用	发现CBD通过上调Atf2转录因子恢复造血干细胞的干性，并揭示了Atf2-Lrp6轴在辐射损伤修复中的关键作用	研究仅限于小鼠模型，尚未在人体中进行验证	探索CBD在急性辐射后对造血干细胞的保护作用及其分子机制	小鼠造血干细胞	生物医学	辐射损伤	单细胞RNA测序	NA	基因表达数据	小鼠模型
5591	2025-02-16	Heterogeneity in Cancer 2025-Jan-28, Cancers IF:4.5Q1 DOI:10.3390/cancers17030441 PMID:39941808	综述	本文讨论了癌症异质性在诊断、预后和治疗中的临床意义，强调了需要个性化方法来克服癌症多样性的挑战	强调了新兴分子诊断和分析技术在理解癌症异质性多维复杂性中的作用，并探讨了异质性在治疗抵抗和转移性病变复发中的作用	NA	探讨癌症异质性对诊断、预后和治疗的影响，并探索克服这些挑战的个性化方法	癌症患者及其转移性病变	肿瘤学	癌症	下一代测序（NGS）、单细胞转录组学、液体活检技术、人工智能	NA	分子数据	NA
5592	2025-02-16	Deciphering the Role of Cancer Stem Cells: Drivers of Tumor Evolution, Therapeutic Resistance, and Precision Medicine Strategies 2025-Jan-24, Cancers IF:4.5Q1 DOI:10.3390/cancers17030382 PMID:39941751	综述	本文全面分析了癌症干细胞（CSCs）在肿瘤进展、复发和传统治疗抵抗中的核心作用，并探讨了其在精准医学中的潜力	详细讨论了Wnt、Notch和Hedgehog等关键信号通路作为治疗靶点的潜力，并探索了CRISPR/Cas9和单细胞测序等新兴技术在解析CSCs异质性和指导治疗策略中的变革性潜力	讨论了CSCs驱动的肿瘤异质性和休眠带来的挑战，以及如何通过新型治疗和靶向方法缓解这些障碍	旨在通过多学科方法结合创新技术、先进治疗和协作研究，解决CSCs的复杂性，推动个性化医学的发展	癌症干细胞（CSCs）及其与肿瘤微环境（TME）的动态相互作用	肿瘤学	癌症	CRISPR/Cas9, 单细胞测序	NA	NA	NA
5593	2025-02-15	Screening Co-Diagnostic Genes for Lung Adenocarcinoma and Myocardial Infarction and Analysis of the Molecular Functions and Drug Value of the Genes 2025-Feb-11, Endocrine, metabolic & immune disorders drug targets DOI:10.2174/0118715303374928250130113050 PMID:39950480	研究论文	本研究通过生物信息学分析发现肺腺癌和心肌梗死的共同诊断基因，并分析其分子功能和潜在药物价值	首次发现MMP9作为肺腺癌和心肌梗死的共同诊断基因，并揭示其在炎症和免疫调节中的作用	研究主要依赖于生物信息学分析，需要进一步的实验验证	发现肺腺癌和心肌梗死的共同诊断基因，分析其分子功能和潜在药物价值	肺腺癌和心肌梗死的基因表达数据	生物信息学	肺癌, 心血管疾病	生物信息学分析, WGCNA, PPI网络, LASSO, SVM-RFE, 单细胞测序	LASSO, SVM-RFE	基因表达数据	从TCGA和GEO数据库中获取的肺腺癌和心肌梗死数据集
5594	2025-02-14	DRIM modulates Src activation and regulates angiogenic functions in vascular endothelial cells 2025-Mar, Cell biology international IF:3.3Q3 DOI:10.1002/cbin.12265 PMID:39648301	研究论文	本研究探讨了DRIM蛋白在血管内皮细胞中的作用及其通过调节Src激酶影响细胞生长、迁移和血管生成的功能	首次发现DRIM在血管内皮细胞中丰富表达，并揭示了其在调节Src激酶活性及下游信号通路中的关键作用	研究主要基于体外实验，缺乏体内实验验证DRIM在血管生成中的具体作用	探究DRIM蛋白在血管内皮细胞中的功能及其分子机制	人类血管内皮细胞	细胞生物学	NA	单细胞测序分析、蛋白质分馏法、细胞成像、蛋白质组学分析、蛋白质相互作用测定	NA	蛋白质数据、细胞成像数据	NA
5595	2025-02-14	Kushenol O Regulates GALNT7/NF-κB axis-Mediated Macrophage M2 Polarization and Efferocytosis in Papillary Thyroid Carcinoma 2025-Mar, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology IF:6.7Q1 DOI:10.1016/j.phymed.2025.156373 PMID:39864368	研究论文	本研究探讨了kushenol O对甲状腺乳头状癌（PTC）细胞增殖和侵袭能力的影响及其潜在作用机制	首次揭示了kushenol O通过调节GALNT7/NF-κB轴介导的巨噬细胞M2极化和efferocytosis在PTC中的作用	研究主要基于细胞实验，缺乏体内实验验证	探讨kushenol O在PTC治疗中的潜在机制	甲状腺乳头状癌细胞	肿瘤免疫学	甲状腺癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、qRT-PCR、EdU检测、CCK-8	NA	基因表达数据、细胞实验数据	PTC细胞系
5596	2025-02-14	A novel gene signature for predicting outcome in colorectal cancer patients based on tumor cell-endothelial cell interaction via single-cell sequencing and machine learning 2025-Feb-15, Heliyon IF:3.4Q1 DOI:10.1016/j.heliyon.2025.e42237 PMID:39944338	研究论文	本文通过单细胞测序和机器学习技术，开发了一种基于肿瘤细胞与内皮细胞相互作用的新基因特征，用于预测结直肠癌患者的预后	创新点在于结合单细胞RNA测序和机器学习算法，识别了与结直肠癌预后相关的肿瘤细胞与内皮细胞相互作用的分子特征，并开发了新的预后标志物	研究主要基于计算分析，缺乏实验验证，且样本来源和数据集的多样性可能影响结果的普适性	研究目的是通过分析肿瘤细胞与内皮细胞的相互作用，开发一种新的基因特征，以提高结直肠癌患者的预后预测精度	研究对象为结直肠癌患者的肿瘤细胞和内皮细胞	数字病理学	结直肠癌	单细胞RNA测序, 机器学习	机器学习算法	RNA测序数据, 转录组数据	多个数据库中的结直肠癌患者样本
5597	2025-02-14	Resolving Leukemia Heterogeneity and Lineage Aberrations with HematoMap 2025-Feb-13, Genomics, proteomics & bioinformatics DOI:10.1093/gpbjnl/qzaf005 PMID:39945785	研究论文	本文介绍了一种名为HematoMap的工具，用于解析白血病的异质性和谱系异常	通过单细胞RNA测序数据和余弦距离算法，构建了正常造血过程的参考层次结构，并开发了LASSO评分模型来揭示AML和BCP-ALL患者的谱系异常	研究依赖于单细胞RNA测序数据，可能受限于数据质量和样本量	理解白血病的细胞起源和疾病起始及发展的机制	急性髓性白血病（AML）和B细胞前体急性淋巴细胞白血病（BCP-ALL）样本	数字病理学	白血病	单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（RNA-seq）	LASSO评分模型	RNA测序数据	25名健康捐赠者的100,000多个骨髓单核细胞
5598	2025-02-14	Characterization of ferroptosis-related genes in aplastic anaemia: an integrated analysis of bulk and single-cell RNA sequencing data 2025-Feb-12, Acta haematologica IF:1.7Q3 DOI:10.1159/000543656 PMID:39938486	研究论文	本研究通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，探讨了与再生障碍性贫血（AA）相关的铁死亡关键基因	首次在AA中整合使用批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，揭示了铁死亡相关基因在AA中的作用	研究依赖于公共数据库的数据，可能受限于数据的质量和样本量	探索再生障碍性贫血中铁死亡相关基因的作用	再生障碍性贫血患者和对照组的RNA测序数据	生物信息学	再生障碍性贫血	RNA测序（RNA-seq），单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	RNA测序数据	NA
5599	2025-02-14	Analyzing and Validating the Role of Genes Related to Glucagon-like Peptide-1 Signaling in the Prognosis of Pancreatic Cancer 2025-Feb-12, Current medicinal chemistry IF:3.5Q2 DOI:10.2174/0109298673367232250102015441 PMID:39945264	研究论文	本研究旨在开发与胰高血糖素样肽-1（GLP-1）信号相关的可靠预后工具，以指导胰腺癌（PC）的治疗	开发了一个基于GLP-1信号的RiskScore模型，用于评估胰腺癌的预后，并通过单细胞RNA-seq和免疫浸润分析验证了其有效性	研究依赖于公开数据库的数据，可能存在数据偏差，且样本量有限	开发一个可靠的预后评估模型，以改善胰腺癌的诊断和治疗	胰腺癌患者	生物信息学	胰腺癌	RNA-seq, 单细胞RNA-seq (scRNA-seq), CIBERSORT算法, ssGSEA方法, GSEA	RiskScore模型, nomogram模型	RNA-seq数据, 单细胞RNA-seq数据	来自UCSCXena和GEO数据库的胰腺癌患者数据，GSE156405队列用于单细胞RNA-seq分析
5600	2025-02-14	Single Cell RNA Sequencing in Colorectal Cancer Immunology: Recent Updates, Application, and Emerging Challenges 2025-Feb-12, Current molecular medicine IF:2.2Q3 DOI:10.2174/0115665240355043250130110501 PMID:39945269	综述	本文综述了单细胞RNA测序在结直肠癌免疫学中的最新进展、应用及面临的挑战	单细胞RNA测序技术的引入，使得研究者能够分析单个免疫细胞，克服了传统批量RNA测序的局限性，为癌症免疫反应和免疫治疗靶点的研究提供了新的视角	尽管单细胞RNA测序技术在癌症研究中展现出巨大潜力，但其在临床应用中仍面临技术和数据分析的挑战	探讨单细胞RNA测序技术在结直肠癌免疫学中的应用及其在推动个性化免疫治疗发展中的潜力	结直肠癌及其免疫反应	数字病理学	结直肠癌	单细胞RNA测序	NA	RNA序列数据	NA