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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5521 | 2025-10-06 |
Transcriptomic analysis reveals novel targets in benign schwannoma using machine learning
2025-Jun-21, Neuroscience
IF:2.9Q2
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研究论文 | 本研究通过机器学习辅助的转录组和单细胞分析识别良性神经鞘瘤的关键免疫相关生物标志物,并构建疾病评估预测模型 | 首次识别出ANGPTL1、IL17RC、LTBR、OLR1和TGFBR1五个新型免疫相关生物标志物在良性神经鞘瘤中的功能作用 | 预测模型的曲线下面积仅为0.67,模型性能有待进一步提升 | 识别良性神经鞘瘤的关键免疫相关生物标志物并构建疾病评估预测模型 | 良性神经鞘瘤患者转录组数据和NF2基因敲除小鼠模型 | 机器学习 | 神经鞘瘤 | 转录组分析,单细胞RNA测序 | LASSO,SVM,Random Forest | 转录组数据 | GSE108524数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5522 | 2025-10-06 |
Immune reconstitution following allogeneic hematopoietic cell transplantation and CAR-T therapy: dynamics, determinants, and directions
2025-Jun, Best practice & research. Clinical haematology
DOI:10.1016/j.beha.2025.101634
PMID:40701740
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综述 | 总结异基因造血细胞移植和CAR-T治疗后免疫重建的动态过程、影响因素及优化策略 | 系统比较allo-HCT与CAR-T治疗后的免疫重建特征,提出个性化监测和治疗策略 | NA | 探讨免疫重建的动态过程及其对临床结果的影响 | 接受异基因造血细胞移植和CAR-T治疗的患者 | NA | 血液系统疾病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5523 | 2025-10-06 |
High-resolution comparative single-cell transcriptomics of doublesex-expressing neurons reveals evolutionary conservation and diversity of sexual circuits in Drosophila
2025-May-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.06.652433
PMID:40654601
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研究论文 | 通过单细胞转录组学比较分析果蝇属中表达doublesex基因的神经元,揭示性行为神经回路在进化中的保守性和多样性 | 首次在多个果蝇物种中系统比较性决定基因表达神经元的单细胞转录组,揭示细胞类型作为独立进化单元的特性 | 研究主要关注doublesex表达神经元,可能未涵盖所有参与性行为的神经元类型 | 探究神经回路在进化过程中的细胞和分子组成变化机制 | 果蝇属多个物种中表达doublesex基因的神经元细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 四个果蝇物种的雄性个体,包括一个物种的雌性数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5524 | 2025-10-06 |
Identification of podocyte molecular markers in diabetic kidney disease via single-cell RNA sequencing and machine learning
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0328352
PMID:40690456
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和机器学习识别糖尿病肾病中足细胞的分子标志物 | 结合单细胞RNA测序与多种机器学习算法首次系统鉴定糖尿病肾病足细胞特异性分子标志物ARHGEF26 | 研究主要聚焦早期糖尿病肾病,样本量有限 | 识别与糖尿病肾病相关的足细胞分子标志物 | 早期糖尿病肾病患者的足细胞 | 机器学习 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, Western blot | 多种机器学习算法 | 单细胞RNA测序数据 | 早期糖尿病肾病患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5525 | 2025-10-06 |
3D visualization of uterus and ovary: tissue clearing techniques and biomedical applications
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1610539
PMID:40692613
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综述 | 本文综述了组织透明化与三维可视化技术在子宫和卵巢研究中的最新进展与应用 | 系统评估了三种主要组织透明化技术(有机溶剂基、水凝胶基和水凝胶包埋法)在子宫和卵巢研究中的优缺点,并探索了与空间转录组学和AI分析工具的整合 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据验证 | 促进对组织透明化技术的理解,帮助研究人员选择适合子宫和卵巢研究的方法 | 子宫和卵巢组织 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 组织透明化技术、光片显微镜、多光子显微镜 | NA | 三维图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5526 | 2025-10-06 |
Cross-talk of m6A methylation modification and the tumor microenvironment composition in esophageal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1572810
PMID:40692788
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析探讨m6A甲基化修饰与食管癌肿瘤微环境组成的相互作用 | 首次在食管癌中系统分析m6A修饰模式与肿瘤微环境特征的关系,并开发了基于主成分分析的m6A评分系统 | 研究主要基于生物信息学分析,需要实验验证来确认机制 | 阐明m6A甲基化修饰在食管癌肿瘤微环境形成和免疫调节中的作用 | 食管癌患者样本和相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序,共识聚类算法,主成分分析 | 共识聚类算法 | 基因表达数据,临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的食管癌数据集 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 5527 | 2025-10-06 |
Integrating GEO Database, Mendelian Randomization, and Molecular Docking to Identify HLA-C as a Potential Therapeutic Target for Periodontitis
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/9163431
PMID:40692979
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研究论文 | 通过整合GEO数据库、孟德尔随机化和分子对接技术,识别HLA-C作为牙周炎的潜在治疗靶点 | 首次结合基因表达数据库、孟德尔随机化分析和分子动力学模拟验证HLA-C在牙周炎中的作用及甲硝唑的潜在治疗价值 | 研究主要基于生物信息学分析,缺乏实验验证 | 探索牙周炎的分子机制并识别关键治疗靶点 | 牙周炎患者基因表达数据 | 生物信息学 | 牙周炎 | 微阵列分析,单细胞RNA测序,分子对接,分子动力学模拟 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA),CIBERSORT,Seurat,CellChat | 基因表达数据 | GSE10334数据集 | NA | 单细胞RNA测序,微阵列 | NA | NA |
| 5528 | 2025-10-06 |
Tumor-associated bacteria activate PRDX1-driven glycolysis to promote immune evasion and PD-1 antibody resistance in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1599691
PMID:40693141
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤相关细菌通过激活PRDX1驱动的糖酵解促进肝细胞癌免疫逃避和PD-1抗体耐药的新机制 | 首次发现肿瘤内细菌通过NF-κB通路诱导PRDX1表达,进而驱动代谢重编程导致PD-1治疗耐药 | 样本量相对有限(29例临床样本),需在更大队列中验证 | 探究细菌感染如何通过重塑肿瘤代谢影响抗PD-1疗法疗效 | 肝细胞癌患者样本和原位肝癌小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 16S rRNA基因测序,单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 基因测序数据,流式细胞数据 | 29例HCC临床样本,12,487个单细胞,每组8只小鼠的动物模型 | NA | 16S rRNA测序,单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5529 | 2025-10-06 |
Identification and validation of the pivotal role of MANF gene in pancreatic β-cell aging using bioinformatics
2025-Sep, Biochemistry and biophysics reports
IF:2.3Q3
DOI:10.1016/j.bbrep.2025.102106
PMID:40688493
|
研究论文 | 通过生物信息学分析鉴定并验证MANF基因在胰腺β细胞衰老中的关键作用 | 首次确立MANF作为β细胞衰老过程中蛋白质稳态的守护者,为糖尿病治疗提供新靶点 | 研究主要基于动物模型和细胞实验,尚未进行人体临床试验 | 探索胰腺β细胞衰老的关键调控因子及其在糖尿病发病中的作用 | 食蟹猴、小鼠胰腺β细胞、MIN6细胞系 | 生物信息学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序、微阵列分析、生物信息学整合分析 | NA | 基因表达数据 | 年轻和年老食蟹猴单细胞RNA-seq数据、年轻和年老小鼠胰腺β细胞微阵列数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 5530 | 2025-10-06 |
Induction of host genes by nested genes during C. elegans development
2025-Aug-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113021
PMID:40686608
|
研究论文 | 本研究通过分析秀丽隐杆线虫发育过程中反向嵌套基因对宿主基因的转录调控作用 | 首次系统性地揭示了反向嵌套基因构型中嵌套基因能够诱导宿主基因在特定细胞类型中产生短转录本 | 研究主要聚焦于蛋白质编码基因,未涉及其他类型基因的嵌套调控 | 探索基因组拓扑结构中反向嵌套基因对宿主基因表达的调控机制 | 秀丽隐杆线虫胚胎发育过程中的基因表达调控 | 发育生物学 | NA | CRISPR基因组工程, 单分子荧光原位杂交, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 数百个蛋白质编码基因 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5531 | 2025-10-06 |
Unraveling asthma through single-cell RNA sequencing in understanding disease mechanisms
2025-Aug, The Journal of asthma : official journal of the Association for the Care of Asthma
DOI:10.1080/02770903.2025.2472358
PMID:40014380
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术的基本原理及其在哮喘研究中的应用,旨在增强对哮喘病理生理学的理解 | 系统总结了scRNA-seq在揭示哮喘免疫细胞异质性和功能状态方面的创新应用,为靶向治疗提供理论基础 | 数据整合方法需要进一步完善,当前研究结果的临床适用性有限,缺乏纵向和临床数据 | 阐明scRNA-seq的基本原理并总结其在哮喘研究中的应用,指导未来研究方向 | 哮喘相关细胞类型特别是免疫细胞和气道重塑细胞 | 单细胞组学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5532 | 2025-10-06 |
A robust diagnostic model for high-risk MASH: integrating clinical parameters and circulating biomarkers through a multi-omics approach
2025-Aug, Hepatology international
IF:5.9Q1
DOI:10.1007/s12072-025-10792-9
PMID:40205303
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研究论文 | 通过多组学方法整合临床参数和循环生物标志物,开发用于高风险MASH的稳健诊断模型 | 首次将蛋白质组学、转录组学和单细胞测序数据整合,识别出TREM2、IL18BP和LGALS3BP作为Kupffer细胞中的关键生物标志物,并构建了ABD-LTyG预测模型 | 样本量相对有限(发现队列144人,验证队列171人),需要在更大规模人群中进一步验证 | 开发用于高风险代谢功能障碍相关脂肪性肝炎(MASH)的诊断模型 | MASLD患者,特别是高风险MASH患者(NAS≥4+F≥2) | 生物医学信息学 | 代谢功能障碍相关脂肪性肝病 | 蛋白质组学分析,转录组分析,单细胞RNA测序,免疫荧光双标记,LASSO回归 | ABD-LTyG预测模型(包含AST、BMI、TB、维生素D、TyG、LGALS3BP和TREM2) | 蛋白质组数据,转录组数据,单细胞测序数据,临床参数,血液样本 | 发现队列144人,验证队列171人 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学, 转录组学 | NA | NA |
| 5533 | 2025-10-06 |
Bone marrow tumor microenvironment profiling predicts distinct immunosuppressive phenotypes and immunotherapy potential in AML patients
2025-Aug, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2025.118287
PMID:40555045
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研究论文 | 通过骨髓肿瘤微环境分析预测AML患者不同的免疫抑制表型和免疫治疗潜力 | 开发了新的巨核细胞/红细胞和髓单核细胞/单核细胞多基因标志物,改进了AML微环境分类,克服了传统的热-冷肿瘤分类方法 | 研究主要基于生物信息学分析和体外共培养实验,需要进一步的体内验证 | 解析急性髓系白血病的免疫景观并预测免疫治疗反应 | 成人和儿童AML患者队列及AML细胞系 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序,共培养实验,生物信息学分析 | xCell算法,TIDE算法,Celligner匹配 | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | 成人和儿童AML患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5534 | 2025-10-06 |
Chlorpromazine induces hyposalivation by inhibiting muscarinic Ca2+ signaling in salivary glands
2025-Jul-23, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-025-04438-8
PMID:40699237
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研究论文 | 本研究揭示了氯丙嗪通过抑制毒蕈碱Ca2+信号通路导致唾液分泌减少的分子机制 | 首次发现氯丙嗪通过同时抑制内质网Ca2+释放和储存操纵性钙内流来抑制唾液腺Ca2+信号 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,尚未在人体进行验证 | 探究氯丙嗪引起唾液分泌减少的分子机制 | 小鼠模型和人类唾液腺细胞 | 分子药理学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 钙信号检测 | NA | 基因表达数据, 钙成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5535 | 2025-10-06 |
Pulmonary fibrosis and exosomes: pathways to treatment
2025-Jul-23, Molecular biology reports
IF:2.6Q3
DOI:10.1007/s11033-025-10855-y
PMID:40699390
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综述 | 探讨肺纤维化中外泌体的作用机制及其治疗潜力 | 整合单细胞RNA测序对成纤维细胞异质性的新发现,并探讨工程化纳米颗粒-外泌体杂合体的治疗前景 | 现有动物模型难以完全模拟慢性特发性肺纤维化病程 | 解析肺纤维化的分子机制及外泌体的治疗潜力 | 特发性肺纤维化疾病机制与外泌体功能 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5536 | 2025-10-06 |
Cerulenin partially corrects the disrupted developmental transcriptomic signature in Huntington's disease striatal medium spiny neurons
2025-Jul-21, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxaf029
PMID:40336225
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析亨廷顿病纹状体中型多棘神经元的发育轨迹,并发现药物Cerulenin可部分纠正其发育转录组异常 | 首次在人类iPSC分化的MSN发育模型中系统揭示HD相关转录组异常,并通过L1000数据库筛选发现Cerulenin具有部分纠正作用 | 研究仅验证了Cerulenin的部分纠正效果,尚未进行完整的机制解析和体内验证 | 探究突变HTT蛋白对中型多棘神经元发育的影响及潜在治疗策略 | 亨廷顿病诱导多能干细胞分化的纹状体中型多棘神经元 | 神经科学 | 亨廷顿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | HD iPSC和同基因对照分化的神经元群体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5537 | 2025-10-06 |
Biomimetic phosphorus dendrimer multi-epitope nanovaccine enhances humoral and cellular immune response against African swine fever virus
2025-Jul-21, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03593-7
PMID:40685337
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研究论文 | 本研究开发了一种靶向树突状细胞的非洲猪瘟病毒仿生纳米疫苗,通过增强体液和细胞免疫反应提供保护 | 首次将DC靶向纳米抗体与ASFV多表位抗原结合,并利用磷树枝状大分子和病毒感染的巨噬细胞膜构建仿生纳米疫苗 | 研究仅在鼠模型中进行验证,尚未在猪体中进行临床试验 | 开发有效的非洲猪瘟病毒疫苗 | 非洲猪瘟病毒(ASFV)抗原和鼠免疫系统 | 免疫学 | 非洲猪瘟 | 单细胞RNA测序, 纳米疫苗构建技术 | NA | 基因表达数据, 免疫反应数据 | 鼠脾脏细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5538 | 2025-10-06 |
An adeno-associated virus gene therapy strategy for anti-obesity treatment by nanocarrier-based delivery systems
2025-Jul-21, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03595-5
PMID:40685368
|
研究论文 | 本研究通过纳米载体递送AAV基因疗法增强肠道内分泌细胞中Scg2表达,探索抗肥胖治疗新策略 | 开发了能够长期粘附肠道上皮的交联纳米颗粒载体系统,首次证明Scg2在调节代谢激素GLP-1和PYY分泌中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中进行验证 | 探索通过基因疗法治疗代谢紊乱和肥胖的新方法 | 无菌小鼠、常规饲养小鼠、高脂饮食小鼠和ob/ob基因型小鼠 | 基因治疗 | 肥胖症 | 单细胞转录组分析、多组学分析、AAV基因递送 | NA | 转录组数据、代谢组数据 | 多种基因型小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5539 | 2025-10-06 |
Differential expression pattern of CC chemokine receptor 7 guides precision treatment of hepatocellular carcinoma
2025-Jul-21, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02308-6
PMID:40685403
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研究论文 | 本研究通过分析CC趋化因子受体7在肝细胞癌中的差异表达模式,指导肝癌精准治疗 | 首次揭示肿瘤细胞来源与基质细胞来源的CCR7表达具有相反效应,并发现VEGF-C通过激活淋巴管生成和CCL21/CCR7轴促进三级淋巴结构形成 | 临床前研究结果需要进一步临床试验验证 | 探索肝细胞癌微环境中CCR7的差异表达模式及其对精准治疗的指导意义 | 肝细胞癌患者组织和细胞系 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 组织芯片、空间转录组、单细胞测序、CRISPR-Cas9基因编辑 | NA | 图像、转录组数据、单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 5540 | 2025-10-06 |
Exploring Immunogenetic Mechanisms in Parkinson's Disease Using Single-Cell Transcriptomics and Mendelian Randomization
2025-Jul-21, Current pharmaceutical biotechnology
IF:2.2Q3
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学和孟德尔随机化方法探索帕金森病的免疫遗传机制 | 首次结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析揭示帕金森病中免疫细胞浸润和转录调控的新机制 | 受限于人群异质性和因果关系推断的挑战 | 探究帕金森病的免疫遗传机制 | 帕金森病患者和对照组的免疫细胞 | 生物信息学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 表达数量性状位点分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |