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当前共找到 10706 篇文献，本页显示第 5401 - 5420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5401 | 2025-10-06 |
EVscope: A Comprehensive Bioinformatics Pipeline for Accurate and Robust Analysis of Total RNA Sequencing from Extracellular Vesicles
2025-Jun-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.24.660984
PMID:40666973
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研究论文 | 开发了一个专门用于细胞外囊泡RNA测序数据分析的生物信息学流程EVscope | 采用优化的全基因组期望最大化算法，显著提高多映射读段分配精度，并首次生成基于EM的BigWig文件用于下游分析 | NA | 解决细胞外囊泡RNA测序数据分析中的技术挑战，提供标准化计算工作流程 | 细胞外囊泡RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | 期望最大化算法 | RNA测序数据 | NA | NA | 总RNA测序 | NA | NA |
| 5402 | 2025-10-06 |
Spatial Proofreading Amplification of in situ Transcript and Protein Signals
2025-Jun-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.11.659176
PMID:40661487
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研究论文 | 本文提出了一种受动力学校对原理启发的无酶信号放大方法，用于增强空间转录组学中的原位转录本和蛋白质信号 | 首次将动力学校对原理应用于信号放大，通过短寡核苷酸探针在靶位点的迭代沉积和光交联形成高度稳定的DNA组装体 | NA | 开发更明亮的信号放大方法以提高空间转录组学实验的检测效率和缩短成像时间 | 原位转录本和蛋白质信号 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，信号放大技术 | NA | 图像信号 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5403 | 2025-10-06 |
Uncovering Heterogeneous Effects via Localized Feature Selection
2025-Jun-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.03.657761
PMID:40661389
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研究论文 | 提出一种利用局部化特征选择方法识别疾病相关特征的创新框架 | 开发了基于局部化检验统计量的特征选择框架，能够针对个体特征识别疾病相关特征，并利用knockoffs方法控制选择集的噪声水平 | 未明确说明方法在更大规模数据集上的可扩展性和计算效率 | 开发能够识别个体层面异质性的疾病相关特征选择方法 | 阿尔茨海默病的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 局部化特征选择框架 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5404 | 2025-10-06 |
Genetic and genomic insights into male reproductive tract development
2025-Jun, Fertility and sterility
IF:6.6Q1
DOI:10.1016/j.fertnstert.2025.03.024
PMID:40174856
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综述 | 通过遗传和基因组学方法探讨男性生殖道发育机制的研究综述 | 整合单细胞测序数据构建发育图谱，首次系统识别269个MRT相关基因及其在关键发育阶段的表达模式 | 人类与小鼠模型表型术语存在差异，知识体系需要进一步统一 | 解析男性生殖道发育的遗传基础及其与成年疾病的关系 | 男性生殖道发育相关基因与细胞类型 | 基因组学 | 男性生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序, 空间分子测量 | NA | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 人类表型本体35个术语对应269个基因，含小鼠对比数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5405 | 2025-10-06 |
A systematic review of single-cell RNA sequencing applications and innovations
2025-Apr, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
综述 | 本文系统综述了单细胞RNA测序技术的应用与创新，重点关注胰岛细胞研究 | 全面总结了scRNA-seq在理解细胞类型、基因活性和细胞相互作用方面的最新进展 | 作为综述文章，不包含原始实验数据，主要基于现有文献分析 | 系统评估单细胞RNA测序技术的应用、创新和挑战 | 胰岛细胞及复杂组织中的细胞多样性 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5406 | 2025-10-06 |
Graph neural networks for single-cell omics data: a review of approaches and applications
2025-Mar-04, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf109
PMID:40091193
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综述 | 系统回顾图神经网络在单细胞组学数据分析中的应用方法和研究成果 | 首次系统综述了107个图神经网络及其六种变体在单细胞组学中的成功应用，并总结了77个常用公开数据集 | 当前研究存在潜在不足，未来需要进一步探索改进方向 | 探讨图神经网络在单细胞组学数据分析中的应用现状和发展前景 | 单细胞组学数据及其分析任务 | 机器学习 | NA | 单细胞测序技术 | 图神经网络(GNN)及其六种变体 | 单细胞组学数据 | 77个公开数据集 | NA | 单细胞表观基因组学, 单细胞转录组学, 空间转录组学, 蛋白质组学, 多组学 | NA | NA |
| 5407 | 2025-10-06 |
Retinoic acid antagonizes estrogen signaling to maintain adult uterine cell fate
2025-Feb-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2416089122
PMID:39874292
|
研究论文 | 本研究揭示了视黄酸通过拮抗雌激素信号维持成年小鼠子宫上皮细胞命运的重要机制 | 首次发现视黄酸与雌激素信号通路在维持成年子宫上皮细胞命运中的拮抗平衡机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类子宫中的类似机制需要进一步验证 | 探究成年子宫上皮细胞命运维持的分子机制 | 小鼠子宫上皮细胞 | 发育生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序，基因敲除模型 | 遗传学小鼠模型 | 基因表达数据，组织学图像 | 三种相关基因敲除小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5408 | 2025-10-06 |
Intercellular TIMP-1-CD63 signaling directs the evolution of immune escape and metastasis in KRAS-mutated pancreatic cancer cells
2025-Jan-18, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-024-02207-4
PMID:39825392
|
研究论文 | 本研究揭示了KRAS突变胰腺癌细胞通过TIMP-1-CD63信号通路逃避免疫清除和促进转移的机制 | 首次发现早期浸润巨噬细胞通过TIMP-1-CD63信号维持ERKactiveDUSP2low癌细胞群体，形成恶性循环促进胰腺癌进展 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 探究KRAS突变上皮细胞如何获得逃逸衰老和免疫清除能力，进展为晚期胰腺导管腺癌 | 胰腺导管腺癌(PDAC)细胞、巨噬细胞、基因工程小鼠模型 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, 数字空间转录组分析 | 基因工程小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 体内实验数据 | 原发PDAC肿瘤样本、人和小鼠原代胰腺癌细胞系、免疫健全小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5409 | 2025-10-06 |
FGFR2 directs inhibition of WNT signaling to regulate anterior fontanelle closure during skull development
2025-Jan-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204264
PMID:39775862
|
研究论文 | 本研究通过小鼠遗传学和单细胞转录组学揭示了FGFR2通过调控WNT信号通路影响前囟闭合的机制 | 首次发现FGFR2通过非自主性调控WNT信号通路影响前囟细胞分化，揭示了FGF-WNT信号回路在颅缝形成中的作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床应用需进一步验证 | 探究FGFR2如何调控前囟闭合的分子机制 | 小鼠前囟细胞和颅骨成骨前沿细胞 | 发育生物学 | 颅缝早闭综合征 | 单细胞转录组测序, 遗传学分析 | 小鼠遗传模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5410 | 2025-10-06 |
Immune cell single-cell RNA sequencing analyses link an age-associated T cell subset to symptomatic benign prostatic hyperplasia
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1585446
PMID:40692782
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析发现与年龄相关的T细胞亚群与症状性良性前列腺增生的关联 | 首次鉴定出与年龄相关的GZMKhi GZMBlow CD8+ T细胞亚群（Taa），并揭示其通过颗粒酶K介导的机制促进前列腺基质细胞衰老相关分泌表型 | 样本量有限，仅分析了少量年轻和老年前列腺样本 | 探究年龄相关免疫细胞变化在良性前列腺增生发病机制中的作用 | 人类前列腺组织中的免疫细胞和BPH患者来源的成纤维细胞 | 单细胞组学 | 前列腺疾病 | 单细胞RNA测序，ELISA，速度分析 | NA | 单细胞RNA测序数据，细胞因子测量数据 | 老年男性大小前列腺样本（≤40g和≥90g）及3个年轻器官捐赠者前列腺样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5411 | 2025-10-06 |
Mapping the immunological landscape and emerging immunotherapeutic strategies in cervical cancer: a comprehensive review
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1620501
PMID:40708940
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综述 | 本文全面综述宫颈癌免疫景观特征及新兴免疫治疗策略 | 整合单细胞RNA测序、空间转录组学等前沿技术解析肿瘤免疫微环境异质性 | 缺乏预测免疫治疗疗效的可靠生物标志物，患者间免疫景观存在高度异质性 | 开发针对宫颈癌的有效个体化免疫疗法 | 宫颈癌肿瘤免疫微环境（肿瘤细胞、免疫浸润细胞、基质成分） | 肿瘤免疫学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多重成像 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 影像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5412 | 2025-10-06 |
Gut-tropic α4β7+CD8+ T cells contribute to pancreatic β cell destruction in type 1 diabetes
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1623428
PMID:40709181
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研究论文 | 本研究揭示了肠道归巢CD8+ T细胞通过整合素α4β7介导迁移至胰岛并促进1型糖尿病β细胞破坏的新机制 | 首次发现肠道归巢CD8+ T细胞在1型糖尿病胰岛破坏中的关键作用，建立了肠道免疫系统与胰腺自身免疫的新联系 | 样本量有限，动物模型与人类疾病存在差异，机制研究仍需深入验证 | 阐明非特异性T细胞在1型糖尿病胰岛破坏中的机制和作用 | 1型糖尿病患者、健康对照者、NOD小鼠模型 | 免疫学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、细胞因子检测、细胞毒性分析 | NA | 基因表达数据、临床数据、实验数据 | 99例T1D患者、57例健康对照、10例T1D供体胰腺、11例自身抗体阳性供体、15例非糖尿病对照 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5413 | 2025-10-06 |
Exploring the comorbidity mechanisms of ITGB2 in rheumatoid arthritis and membranous nephropathy through integrated bioinformatics analysis
2025-Dec, Renal failure
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/0886022X.2025.2536730
PMID:40697036
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析探索ITGB2在类风湿关节炎和膜性肾病共病机制中的作用 | 首次通过整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据系统分析RA和MN的共病机制，发现ITGB2是关键的共享致病基因 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证 | 探索类风湿关节炎和膜性肾病的共同发病机制 | 类风湿关节炎和膜性肾病患者基因表达数据 | 生物信息学 | 类风湿关节炎, 膜性肾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 分子对接 | 随机森林算法, Monocle3, CellChat | 基因表达数据 | 从GEO和ImmPort数据库获取的多个数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5414 | 2025-10-06 |
Potential regulatory mechanism of overexpression of phosphatidylinositol glycan anchor biosynthesis class U on the glycolytic pathway in hepatocellular carcinoma
2025-Sep-05, Gene
IF:2.6Q2
DOI:10.1016/j.gene.2025.149603
PMID:40473062
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研究论文 | 本研究探讨PIGU在肝细胞癌糖酵解通路中的潜在分子调控机制 | 首次综合运用多组学数据和CRISPR筛选技术揭示PIGU通过调控糖酵解关键步骤促进肝癌发展的新机制 | 研究主要基于体外细胞实验，缺乏体内动物模型验证 | 探索PIGU在肝细胞癌糖酵解通路中的分子调控机制 | 肝细胞癌组织样本和SMMC-7721、Huh7细胞系 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | CRISPR基因编辑, 免疫组化, 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 细胞功能实验 | NA | RNA测序数据, 蛋白质组数据, 单细胞测序数据, 实验数据 | 3773例HCC样本(RNA), 234例HCC样本(IHC和蛋白质组), 22861个HCC细胞(单细胞测序) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 微阵列, 蛋白质组学 | NA | NA |
| 5415 | 2025-10-06 |
Identification of inflammation-related biomarkers and therapeutic targets for neurogenic bladder fibrosis via multi-omics analysis
2025-Sep, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110721
PMID:40618693
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研究论文 | 通过多组学分析识别神经源性膀胱纤维化的炎症相关生物标志物和治疗靶点 | 首次通过整合单细胞和bulk RNA测序数据，结合机器学习方法鉴定出HIF-1α等四个诊断标志物，并发现MEK抑制剂PD-0325901的治疗潜力 | 研究样本量有限，主要基于动物模型，临床验证需要进一步扩大 | 识别神经源性膀胱纤维化的诊断生物标志物并探索潜在治疗药物 | 神经源性膀胱纤维化大鼠模型和患者膀胱组织 | 生物信息学 | 神经源性膀胱疾病 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,机器学习,分子对接 | 机器学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 5416 | 2025-10-06 |
Leveraging machine learning and single-cell RNA sequencing strategies to develop a risk prognosis scoring based on liquid-liquid phase separation feature genes in pediatric hepatoblastoma
2025-Sep, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110685
PMID:40618698
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研究论文 | 本研究整合机器学习与单细胞RNA测序技术，基于液-液相分离特征基因开发了儿童肝母细胞瘤风险预后评分系统 | 首次系统分析液-液相分离在肝母细胞瘤中的作用，并建立了首个基于液-液相分离的肝母细胞瘤预后预测模型 | 研究依赖于公共数据库的RNA测序数据，需要进一步实验验证 | 开发基于液-液相分离特征基因的肝母细胞瘤风险预后评分系统 | 儿童肝母细胞瘤患者 | 机器学习 | 肝母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, RNA-seq, 机器学习算法 | 随机森林, SVM-RFE, Lasso回归 | RNA测序数据 | 多个GEO数据集（GSE133039, GSE75271, GSE81928, GSE132037, GSE186975） | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5417 | 2025-10-06 |
PANoptosis-driven molecular stratification in esophageal squamous cell carcinoma: A multi-omics prognostic model and FGFR-Targeted therapeutic validation
2025-Sep, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110688
PMID:40628169
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研究论文 | 本研究基于PANoptosis构建了食管鳞状细胞癌的多组学预后模型，并验证了FGFR靶向治疗的疗效 | 首次基于PANoptosis构建ESCC预后模型，发现FGFR抑制剂可通过抑制EMT和调控MYC/E2F通路发挥治疗作用 | 模型验证队列有限，需要更多前瞻性研究验证临床适用性 | 阐明PANoptosis在ESCC预后和治疗中的作用机制 | 食管鳞状细胞癌患者 | 生物信息学 | 食管癌 | 单变量Cox回归, LASSO Cox回归, 单细胞RNA测序, 基因集富集分析 | 预后风险模型 | 多组学数据, 微阵列数据, RNA-seq数据 | 多个队列的ESCC患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序, 微阵列 | NA | NA |
| 5418 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptional landscape of peripheral myeloid cells in autoimmune diseases
2025-Aug-15, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113026
PMID:40703454
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析自身免疫疾病中外周髓系细胞的转录景观 | 首次在14种自身免疫疾病中对351,905个髓系细胞进行大规模单细胞转录组分析，识别出13个具有独特免疫特征的髓系细胞亚群 | 研究主要关注外周髓系细胞，未涉及组织驻留髓系细胞或其他免疫细胞类型 | 揭示自身免疫疾病中髓系细胞的异质性和功能状态 | 375个单细胞RNA测序样本中的351,905个外周髓系细胞 | 单细胞生物学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序，伪时间分析，全基因组关联研究 | NA | 单细胞转录组数据，遗传数据 | 351,905个髓系细胞，来自375个样本，覆盖14种自身免疫疾病 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5419 | 2025-10-06 |
METAB-HTX: prospective, longitudinal cohort study evaluating cardiac and systemic metabolism after heart transplantation
2025-Aug, ESC heart failure
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/ehf2.15330
PMID:40375600
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研究论文 | 一项评估心脏移植后心脏和全身代谢变化的前瞻性纵向队列研究 | 首次系统性地对心脏移植患者进行长期代谢表型分析，结合多组学技术和先进影像学方法评估代谢恶化与心脏功能的关系 | 单中心研究，样本量相对有限（400例），观察性研究设计无法确定因果关系 | 探索心脏移植后代谢恶化与心脏功能受损和生存率的关系 | 心脏移植术后患者 | 医学研究 | 心血管疾病 | 第三代和第四代测序（短读长和长读长测序）、单细胞测序、心脏磁共振成像和波谱分析、回声心动图 | NA | 临床数据、影像数据、基因组数据、转录组数据 | 400例心脏移植术后患者，随访5年 | NA | 单细胞测序、转录组测序 | NA | NA |
| 5420 | 2025-10-06 |
Adverse effects of progestin-primed ovarian stimulation: combination of clinical study and single-cell analysis
2025-Aug, Reproductive biomedicine online
IF:3.7Q1
DOI:10.1016/j.rbmo.2025.104833
PMID:40467355
|
研究论文 | 通过临床研究和单细胞分析评估孕激素预处理卵巢刺激对生殖结局的不良影响 | 结合临床队列研究和单细胞RNA测序技术探究PPOS方案对生殖结局的影响机制 | 回顾性研究设计，样本量相对有限 | 比较PPOS与GnRH拮抗剂方案在辅助生殖中的效果差异 | 接受IVF治疗的不孕症患者及其卵泡壁颗粒细胞 | 生殖医学 | 不孕症 | 单细胞RNA测序, 逆概率处理加权 | NA | 临床数据, 基因表达数据 | 907例患者(临床研究), 16例患者(单细胞分析) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |