单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 6102 篇文献，本页显示第 5381 - 5400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5381 | 2025-03-12 |
High expression of stearoyl-coenzyme A desaturase in colorectal cancer oncogenic functions and its potential as a therapeutic target
2025-Feb-27, World journal of gastrointestinal surgery
IF:1.8Q2
DOI:10.4240/wjgs.v17.i2.100237
PMID:40061980
|
研究论文 | 本文探讨了硬脂酰辅酶A去饱和酶（SCD）在结直肠癌（CRC）中的临床和病理意义，并评估了氯化硝基喹啉（NC）与SCD的靶向亲和力 | 首次整合多中心高通量数据，结合单细胞测序和分子对接技术，明确了SCD在CRC中的致癌功能及其作为治疗靶点的潜力 | 研究主要基于体外实验和数据分析，缺乏体内实验验证 | 探索SCD在CRC中的临床和病理意义，并评估NC与SCD的靶向亲和力 | 结直肠癌组织和细胞 | 癌症研究 | 结直肠癌 | 高通量数据分析、免疫组化染色、CRISPR敲除筛选、单细胞测序、分子对接 | NA | mRNA表达数据、蛋白质表达数据、单细胞测序数据 | 2482个CRC样本和1334个非癌性结直肠组织对照 |
| 5382 | 2025-03-12 |
A humanized mouse model system mimics prenatal Zika infection and reveals premature differentiation of neural stem cells
2025-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.21.639556
PMID:40060457
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研究论文 | 本文开发了一种人源化小鼠模型系统，模拟了产前寨卡病毒感染，并揭示了神经干细胞的过早分化 | 开发了一种人源化、免疫活性小鼠模型系统，能够模拟从轻度到重度的产前寨卡病毒感染，并通过单细胞RNA测序揭示了寨卡病毒感染对大脑皮层转录组的影响 | 模型系统虽然模拟了人类表型谱，但仍需进一步验证其在临床转化中的可靠性 | 开发一种可靠的、临床可转化的实验系统，模拟人类产前寨卡病毒感染的情况 | 人源化小鼠模型 | 生物医学 | 寨卡病毒感染 | 单细胞RNA测序 | 人源化小鼠模型 | RNA测序数据 | 未明确提及样本数量 |
| 5383 | 2025-03-12 |
PLXNB1 and other signaling drives a pathologic astrocyte state contributing to cognitive decline in Alzheimer's Disease
2025-Feb-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.24.639868
PMID:40060644
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研究论文 | 本文通过单核转录组数据分析，揭示了阿尔茨海默病中一种特定星形胶质细胞亚群Ast10在认知衰退中的关键作用及其信号驱动机制 | 首次通过大规模单核转录组数据分析，识别出Ast10星形胶质细胞亚群在阿尔茨海默病和衰老相关认知衰退中的关键作用，并揭示了其信号驱动机制 | 研究主要依赖于转录组数据，未涉及蛋白质水平的功能验证，且样本来源主要为已故个体，可能无法完全反映活体中的动态变化 | 探讨阿尔茨海默病中星形胶质细胞亚群Ast10在认知衰退中的作用及其信号驱动机制 | 869个不同来源的脑组织样本，包括阿尔茨海默病患者和健康对照 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单核转录组测序（snRNAseq），空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 869个脑组织样本 |
| 5384 | 2025-03-12 |
Molecular differences between young and mature stria vascularis from organotypic explants and transcriptomics
2025-Feb-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.111832
PMID:40028281
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研究论文 | 本文通过开发新生和成熟小鼠的全组织外植模型，研究了耳蜗血管纹（SV）的分子差异及其在听力损失中的作用 | 开发了新生和成熟小鼠的全组织外植模型，并首次通过单细胞RNA测序揭示了SV增殖和维持的关键基因和通路 | 研究主要基于小鼠模型，可能无法完全反映人类SV的生物学特性 | 研究耳蜗血管纹（SV）的分子差异及其在听力损失中的作用 | 新生和成熟小鼠的耳蜗血管纹（SV）及其周围组织 | 分子生物学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 新生和成熟小鼠的耳蜗血管纹（SV）及其周围组织 |
| 5385 | 2025-03-12 |
A Nerve-Fibroblast Axis in Mammalian Lung Fibrosis
2025-Feb-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.09.09.611003
PMID:39314391
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研究论文 | 本文揭示了哺乳动物肺纤维化中神经-成纤维细胞轴的存在及其在纤维化过程中的作用 | 发现了α1-肾上腺素受体表达的肌成纤维细胞在纤维化肺中接收交感神经来源的去甲肾上腺素输入，并定义了一个由异常模式化的交感神经和α1-肾上腺素受体亚型D表达的肌成纤维细胞组成的纤维化单位 | NA | 研究肺纤维化的机制，特别是肌成纤维细胞在纤维化过程中的作用 | 小鼠和人类纤维化肺组织 | 生物医学 | 肺纤维化 | 光学清除、全肺成像、细胞特异性基因删除、药理学干预、交感神经共培养、精确切割肺切片、支气管肺泡灌洗液分析、单细胞RNA测序 | NA | 图像、RNA测序数据、组织样本 | 来自不同形式肺纤维化患者的肺成纤维细胞 |
| 5386 | 2025-03-12 |
Subepicardial adipose genes contribute to the deterioration of heart failure preserved ejection fraction
2025, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2025.1501397
PMID:40060963
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研究论文 | 本研究探讨了内脏脂肪细胞基因对心力衰竭保留射血分数（HFpEF）恶化的影响，并通过单细胞测序数据、细胞系和人类样本验证了关键基因的表达 | 通过Venn图和蛋白质-蛋白质相互作用网络筛选出与内脏脂肪细胞相关的差异表达基因，并验证了这些基因在HFpEF患者中的表达及其对细胞衰老的影响 | 研究主要依赖于生物信息学分析和体外实验，缺乏大规模的临床验证 | 探讨内脏脂肪细胞基因在HFpEF恶化中的作用，并寻找潜在的治疗靶点 | 内脏脂肪细胞基因、HFpEF患者的心肌细胞和纤维细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞测序、蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 人类样本、细胞系 |
| 5387 | 2025-03-12 |
scLTNN: an innovative tool for automatically visualizing single-cell trajectories
2025, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbaf033
PMID:40061870
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scLTNN的创新工具，用于自动可视化单细胞轨迹 | 结合人工神经网络和分布模型，创建了scLTNN工具，能够自动推断细胞的起源和终端状态，并以最小的计算资源和时间准确描绘细胞发育轨迹 | NA | 开发一种新的工具，用于自动推断和可视化单细胞RNA测序数据中的细胞命运轨迹 | 人类骨髓细胞、小鼠胰腺内分泌谱系和斑马鱼胚胎的轴向中胚层谱系 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 人工神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | 人类骨髓细胞、小鼠胰腺内分泌谱系和斑马鱼胚胎的轴向中胚层谱系 |
| 5388 | 2025-03-12 |
Application of Spatial Omics in the Cardiovascular System
2025, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0628
PMID:40062231
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综述 | 本文探讨了空间组学技术在心血管系统研究中的应用，包括空间转录组学、空间蛋白质组学、空间代谢组学、空间基因组学和空间表观组学 | 空间组学技术的应用为心血管疾病的分子和细胞基础提供了更深入的见解，并强调了其在心血管科学中的关键贡献 | 未具体提及研究的局限性 | 探讨空间组学技术在心血管疾病研究中的应用及其对精准医学、靶向治疗和个性化治疗的贡献 | 心血管系统 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 空间转录组学、空间蛋白质组学、空间代谢组学、空间基因组学、空间表观组学 | NA | 多组学数据 | NA |
| 5389 | 2025-03-11 |
TREM2 as a Therapeutic Target in Atherosclerosis
2025-Apr, Cell biology international
IF:3.3Q3
DOI:10.1002/cbin.12279
PMID:39891588
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review | 本文回顾了TREM2从基础研究到作为动脉粥样硬化治疗靶点的历程，并探讨了其临床应用的可能性 | 揭示了TREM2在泡沫巨噬细胞存活和动脉粥样硬化进展中的重要性，并提出了TREM2作为治疗靶点的潜力 | NA | 探讨TREM2作为动脉粥样硬化治疗靶点的可行性和临床应用前景 | 动脉粥样硬化中的泡沫巨噬细胞和TREM2表达 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 5390 | 2025-03-11 |
Spatial-Temporal Diversity of Extrachromosomal DNA Shapes Urothelial Carcinoma Evolution and Tumor-Immune Microenvironment
2025-Mar-11, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-24-1532
PMID:40062518
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研究论文 | 本文通过计算分析方法研究了595例尿路上皮癌（UC）患者全基因组测序数据中的染色体外DNA（ecDNA），揭示了ecDNA在肿瘤进化和免疫微环境中的作用 | 首次系统性地分析了ecDNA在尿路上皮癌中的时空多样性及其对肿瘤进化和免疫微环境的影响，揭示了ecDNA通过结构重排驱动克隆进化的机制 | 研究主要基于尿路上皮癌患者的数据，可能不适用于其他类型的癌症 | 研究ecDNA在尿路上皮癌中的时空多样性及其对肿瘤进化和免疫微环境的影响 | 595例尿路上皮癌患者的全基因组测序数据 | 基因组学 | 尿路上皮癌 | 全基因组测序、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、RNA数据 | 595例尿路上皮癌患者 |
| 5391 | 2025-03-11 |
Neoplastic immune mimicry potentiates breast tumor progression
2025-Mar-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.17.633673
PMID:39896558
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研究论文 | 本文探讨了乳腺癌进展中肿瘤细胞通过去分化程序增强适应性，并发现部分去分化的肿瘤细胞表达白细胞表面受体蛋白，称为“免疫拟态” | 首次提出并验证了乳腺癌细胞通过表达白细胞表面受体蛋白进行免疫拟态的现象，并发现这种拟态与肿瘤的侵袭性和治疗抵抗性相关 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据和细胞系模型，尚未在更大规模的临床样本中进行验证 | 研究乳腺癌进展中肿瘤细胞的去分化及其对肿瘤侵袭性和治疗抵抗性的影响 | 乳腺癌细胞、人类乳腺癌单细胞RNA测序数据集、乳腺癌细胞系、小鼠转基因和细胞系来源的乳腺肿瘤模型 | 肿瘤生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据、组织病理学样本 | 公共人类乳腺癌单细胞RNA测序数据集、乳腺癌细胞系、小鼠模型 |
| 5392 | 2024-10-04 |
A Single-Cell RNA Sequencing Atlas of the Chronic Obstructive Pulmonary Disease Distal Lung to Predict Cell-Cell Communication
2025-Mar, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0232LE
PMID:39356793
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5393 | 2025-03-11 |
STEAM: Spatial Transcriptomics Evaluation Algorithm and Metric for clustering performance
2025-Feb-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.17.636505
PMID:40027655
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研究论文 | 本文提出了一种名为STEAM的空间转录组学评估算法和指标，用于评估聚类性能的一致性和可靠性 | STEAM通过机器学习分类和预测方法，结合空间邻近性和基因表达模式，提供了一个用户友好的计算框架，用于评估聚类结果的稳健性和可重复性 | 由于缺乏真实标签，验证聚类一致性和可重复性仍然具有挑战性 | 开发一个计算评估框架，以严格且无偏见地评估空间转录组学数据的聚类性能 | 空间转录组学数据 | 空间生物学 | NA | 机器学习分类和预测方法 | NA | 空间转录组学和蛋白质组学数据 | 多个公共数据集，涵盖多细胞到单细胞分辨率 |
| 5394 | 2025-03-11 |
Joint imputation and deconvolution of gene expression across spatial transcriptomics platforms
2025-Feb-19, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.17.638195
PMID:40027720
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SIID的算法，用于从不同空间转录组学技术的数据中重建潜在的基因表达矩阵 | SIID算法通过空间对齐和联合非负因子分解模型，能够准确估算缺失的基因表达并从混合的空间转录组数据中推断细胞类型的基因表达特征 | NA | 整合不同空间转录组学技术的数据，以克服单个技术的局限性，实现未测量基因的表达估算和低空间分辨率技术的混合表达解卷积 | 人类乳腺癌和结肠癌组织的10x Xenium-Visium配对数据 | 数字病理学 | 乳腺癌, 结肠癌 | 空间转录组学技术 | 联合非负因子分解模型 | 基因表达数据 | NA |
| 5395 | 2025-03-11 |
Identification and Pharmacological Targeting of Treatment-Resistant, Stem-like Breast Cancer Cells for Combination Therapy
2025-Feb-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.08.562798
PMID:38798673
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，识别并药理学靶向治疗耐药、干细胞样乳腺癌细胞，用于联合治疗 | 利用单细胞RNA测序和CROP-seq实验验证，识别出能够逆转化疗耐药性癌症干细胞样细胞转录状态的药物，并发现阿苯达唑与紫杉醇的联合使用具有显著协同效应 | 研究样本量较小，仅涉及七名转移性乳腺癌患者 | 开发基于机制的联合疗法，靶向互补的肿瘤亚群 | 乳腺癌患者中的癌症干细胞样细胞 | 癌症研究 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, CROP-seq | NA | RNA测序数据 | 七名转移性乳腺癌患者 |
| 5396 | 2025-03-11 |
Single-Cell Omics for Transcriptome CHaracterization (SCOTCH): isoform-level characterization of gene expression through long-read single-cell RNA sequencing
2025-Feb-06, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.29.590597
PMID:38746128
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SCOTCH的计算方法套件，用于通过长读长单细胞RNA测序在异构体水平上表征基因表达 | SCOTCH方法利用长读长的独特优势，通过动态阈值和读长映射分数的子外显子识别策略，精确对齐读长到已知异构体并发现新异构体，解决了长读长单细胞数据中常见的模糊映射挑战 | NA | 开发一种新的计算方法来更准确地分析单细胞转录组复杂性 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 长读长单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 5397 | 2025-03-10 |
Endothelial senescence induced by PAI-1 promotes endometrial fibrosis
2025-Mar-06, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02377-0
PMID:40050610
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研究论文 | 本文研究了PAI-1诱导的内皮细胞衰老如何促进子宫内膜纤维化 | 通过单细胞测序和实验验证，揭示了PAI-1在子宫内膜纤维化中的作用机制，并提出了抑制PAI-1作为治疗子宫内膜纤维化的新策略 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探讨子宫内膜纤维化的病理机制及潜在治疗方法 | 子宫内膜纤维化患者和小鼠模型 | 生物医学 | 子宫内膜纤维化 | 单细胞测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | IUA患者和小鼠模型 |
| 5398 | 2025-03-10 |
Exploring the Expanded Role of Astrocytes in Primate Brain Evolution via Changes in Gene Expression
2025-Feb-05, Brain, behavior and evolution
DOI:10.1159/000544004
PMID:39907990
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综述 | 本文探讨了灵长类大脑进化中星形胶质细胞基因表达和基因调控的变化 | 通过新的技术如诱导多能干细胞和单细胞RNA测序，动态和复杂地理解星形胶质细胞 | 主要关注灵长类动物，未涉及其他哺乳动物的星形胶质细胞进化 | 理解星形胶质细胞在灵长类大脑进化中的作用及其在神经系统疾病中的角色 | 灵长类动物中的星形胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病, 帕金森病 | 诱导多能干细胞, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 5399 | 2025-03-09 |
Targeting Caveolin-1 for enhanced rotator cuff repair: findings from single-cell RNA sequencing
2025-Mar-05, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02359-2
PMID:40044676
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探索了肩袖损伤组织中细胞亚群的异质性，并评估了Caveolin-1（Cav-1）的调节作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了Cav-1在肩袖损伤中的负相关作用及其通过运动或靶向治疗调节的潜力 | 研究主要基于动物模型，尚未在人类临床试验中验证 | 探索Cav-1在肩袖损伤修复中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 肩袖损伤组织中的细胞亚群 | 生物医学研究 | 肩袖损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Cav-1敲除和过表达模型 | RNA测序数据 | 动物模型中的肩袖损伤组织 |
| 5400 | 2025-03-09 |
PCBP2 promotes immune evasion via cGAS-STING pathway in biochemical recurrence of prostate cancer
2025-Mar, APL bioengineering
IF:6.6Q1
DOI:10.1063/5.0250173
PMID:40051782
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研究论文 | 本研究探讨了前列腺癌（PCa）中与免疫逃逸相关的基因（CIERGs），并开发了用于预测生化复发（BCR）的签名 | 通过单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，鉴定了48个与BCR显著相关的CIERGs，并开发了一个基于CIERGs的风险签名，揭示了PCBP2通过抑制cGAS-STING通路促进PCa细胞增殖、迁移和侵袭的机制 | 研究主要依赖于公共数据库的数据，可能缺乏实验验证的广泛性 | 探索前列腺癌中与免疫逃逸相关的基因，并开发预测生化复发的签名 | 前列腺癌患者 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA-seq, scRNA-seq | LASSO回归 | RNA测序数据 | TCGA-PRAD和GSE70769队列的数据 |