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当前共找到 10542 篇文献，本页显示第 521 - 540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2026-05-21 |
Redox Regulation of Microvascular Physiology and Pathophysiology: Insights into Therapeutic Strategies and Limitations
2025-10, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1177/15230864251372607
PMID:41020442
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综述 | 探讨氧化还原调控在微血管生理与病理中的作用，并评估现有治疗策略及其局限性 | 强调微血管与大型血管在氧化还原反应中的差异，并引入单细胞RNA测序揭示不同血管床内皮细胞的独特基因特征 | 技术挑战限制了对活性氧/活性氮水平与微血管结局的可靠关联；缺乏针对微血管氧化还原信号的特效治疗方法 | 阐明氧化还原介导的微血管功能障碍在多种疾病中的机制，并推动靶向治疗的发展 | 微血管系统（包括细胞存活与死亡、血管生成、血管扩张、屏障功能等） | 心血管领域 | 心血管疾病, 自身免疫性疾病, 感染性疾病, 血红蛋白病, 炎症性疾病, 血管炎, 代谢性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 522 | 2026-05-21 |
Pancreatic tumor microenvironment reprogramming via alloantigenexpressing virotherapy elicits tumor rejection and improves immunotherapy response
2025-Sep-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.15.675641
PMID:41000962
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研究论文 | 通过表达异体抗原的溶瘤病毒疗法重塑胰腺肿瘤微环境，引发肿瘤排斥并改善免疫治疗效果 | 提出利用急性移植排斥机制，通过重组溶瘤病毒载体表达小鼠MHC I类异体抗原（rVMG-H-2Kk），诱导肿瘤特异性抗原错配反应，将免疫冷肿瘤转化为热肿瘤 | 该疗法也诱导了补偿性免疫抑制通路，包括抗病毒反应基因和免疫检查点受体（如PDL-2）的上调 | 开发一种新型免疫治疗平台，通过异体抗原表达重塑肿瘤微环境，增强免疫检查点抑制剂疗效 | 胰腺导管腺癌（PDAC）小鼠模型及肿瘤微环境 | 机器学习 | 胰腺癌 | 溶瘤病毒疗法、空间转录组学、多重免疫组化、免疫表型分析 | NA | 空间转录组数据、免疫组化图像 | 两个独立免疫活性PDAC小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 523 | 2026-05-21 |
Investigating intestinal farnesoid X receptor functions at the intestinal mucosal barrier and in the intestinal microbiota in a biliary obstruction mouse model
2025-08-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00223.2024
PMID:40623002
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研究论文 | 本研究利用肠道特异性敲除小鼠模型，探究了法尼醇X受体在胆汁淤积小鼠模型中对肠道黏膜屏障及肠道菌群的作用和机制 | 首次通过肠道特异性敲除小鼠模型和单细胞测序技术，揭示了FXR在胆汁淤积疾病中直接调控肠道屏障功能和肠道菌群的具体分子机制，特别是发现FXR可能通过调节再生胰岛衍生蛋白3γ来影响肠道功能 | 未提供明确局限性信息 | 阐明法尼醇X受体在胆汁淤积疾病中对肠道黏膜屏障和肠道菌群的调节作用及分子机制 | 肠道特异性FXR敲除小鼠及其胆汁淤积模型（胆管结扎手术） | 生物医学 | 胆汁淤积疾病 | 基因敲除、胆管结扎手术、单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | 肠道特异性FXR敲除小鼠及野生型小鼠，具体样本量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 524 | 2026-05-21 |
Scalable and unsupervised discovery from raw sequencing reads using SPLASH2
2025-Jul, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-024-02381-2
PMID:39313645
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研究论文 | 介绍SPLASH2，一种基于高效k-mer计数方法的快速可扩展实现，用于从多种测序技术的大规模数据集中检测调控序列变异 | 提出SPLASH2算法，实现了从原始测序reads中无监督、可扩展的发现，无需参考基因组或注释，并能有效处理大规模单细胞和批量RNA-seq数据 | NA | 开发一种快速、可扩展的算法，用于从原始测序数据中无监督发现调控序列变异 | 单细胞RNA-seq数据和癌症细胞系百科全书（CCLE）的批量RNA-seq数据 | 机器学习 | 癌症 | RNA-seq，k-mer计数 | NA | 测序数据 | 包含单细胞RNA-seq和CCLE批量RNA-seq数据 | Illumina | 单细胞RNA-seq，批量RNA-seq | Illumina NovaSeq | NA |
| 525 | 2026-05-21 |
CO-Releasing Polyoxometalates Nanozyme with Gut Mucosal Immunity and Microbiota Homeostasis Remodeling Effects for Restoring Intestinal Barrier Integrity
2025-May, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202500116
PMID:40079617
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研究论文 | 本研究介绍了一种一氧化碳释放的多金属氧酸盐纳米酶（PMC），通过协同调节肠道黏膜免疫和微生物群稳态修复肠道屏障，用于治疗炎症性肠病 | 首次将一氧化碳释放与多金属氧酸盐纳米酶结合，实现靶向积累、活性氧清除及响应性一氧化碳释放的多重治疗效果，并通过单细胞RNA测序揭示其调控巨噬细胞极化和肠道干细胞Notch通路的机制 | 未提及具体局限性 | 开发一种具有肠道屏障修复能力的多功能纳米酶用于炎症性肠病治疗 | 炎症性肠病患者及溃疡性结肠炎模型小鼠 | 机器学习 | 炎症性肠病，溃疡性结肠炎 | 单细胞RNA测序, 16S rRNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 16S rRNA测序 | 10x Chromium, NA | NA |
| 526 | 2026-05-21 |
Central FGF19 signaling enhances energy homeostasis and adipose tissue thermogenesis through sympathetic activation in obese mice
2025-04-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
DOI:10.1152/ajpendo.00488.2024
PMID:40059865
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研究论文 | 研究中枢FGF19信号通过交感神经激活增强肥胖小鼠能量稳态和脂肪组织产热的作用 | 发现中枢FGF19主要通过刺激交感神经活动和脂肪组织产热来改善能量稳态，而不仅仅是减少食物摄入 | 在交感神经活动减弱的情况下，FGF19的效应消失，表明其作用依赖于完整的交感神经通路 | 探究中枢FGF19对能量稳态和脂肪组织产热的影响及其机制 | 饮食诱导的肥胖小鼠 | 机器学习 | 肥胖和代谢性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 成年小鼠下丘脑样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞RNA测序平台用于下丘脑单细胞测序 |
| 527 | 2026-05-21 |
Single-cell transcriptomics predict novel potential regulators of acute epithelial restitution in the ischemia-injured intestine
2025-03-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00194.2024
PMID:39853303
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研究论文 | 利用单细胞转录组学预测缺血损伤肠道中急性上皮修复的潜在新调控因子 | 首次通过单细胞转录组学鉴定吸收性肠细胞亚群，预测CSF-1作为年龄依赖性上皮修复的上游调控因子，并在猪模型中验证其功能 | 研究主要在猪模型中进行，人类相关性需进一步验证；CSF-1功能验证仅初步限于离体实验 | 识别并预测缺血损伤肠道中上皮修复的潜在分子调控因子，为新生儿肠道损伤治疗提供新靶点 | 缺血损伤的猪空肠黏膜上皮细胞，特别是吸收性肠细胞亚群 | 单细胞转录组学 | 肠道缺血损伤 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 猪模型，包括幼猪和新生猪，具体样本数未详述 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 528 | 2026-05-21 |
Two-Stage Multi-View Graph Spectral Clustering for Single-Cell RNA-Seq Data
2025, Current genomics
IF:1.8Q3
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研究论文 | 提出了一种用于单细胞RNA测序数据的两阶段多视图图谱聚类方法，通过构建多视图特征空间并分阶段优化相似图，提升了细胞类型聚类准确性 | 首次将两阶段多视图学习框架应用于scRNA-seq数据聚类，通过加权学习和结构学习分别优化属性图和结构图，克服了单视图特征空间不足的问题 | 未讨论方法在处理视图间差异极大或数据噪声过高时的鲁棒性，且未涉及计算复杂度或可扩展性分析 | 设计一种能充分利用细胞间结构关系信息的多视图聚类方法，提高单细胞RNA-seq数据中细胞类型分布的识别精度 | 来自八个不同规模真实scRNA-seq数据集的细胞样本 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 图谱聚类（结合加权学习和结构学习） | 基因表达数据（单细胞转录组数据） | 八个不同规模的真实scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 529 | 2026-05-20 |
Construction of an early diagnostic model for pulmonary hypertension based on aging-related signature genes and identification of potential therapeutic targets
2025-12-29, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-28921-7
PMID:41461777
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研究论文 | 基于衰老相关特征基因构建肺动脉高压早期诊断模型并识别潜在治疗靶点 | 首次整合多数据集转录组分析，利用三种机器学习方法筛选衰老相关特征基因，构建高精度诊断列线图，并发现TUL-XXI039作为多靶点潜在治疗化合物 | 研究基于已有数据集和体外模型，缺乏大规模临床验证及体内实验证据 | 开发肺动脉高压早期诊断生物标志物并探索衰老靶向治疗策略 | 肺动脉高压患者转录组数据及体外缺氧诱导的肺动脉平滑肌细胞模型 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 转录组分析、单细胞RNA测序、qPCR、分子对接 | LASSO回归、随机森林、支持向量机、列线图 | 基因表达数据 | 训练队列及多个独立验证队列（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 530 | 2026-05-20 |
Spatial transcriptomic profiling of decalcified murine musculoskeletal samples via Xenium Prime 5K
2025-Dec-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.22.693132
PMID:41509209
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研究论文 | 详细描述了利用Xenium Prime 5K平台对小鼠脱钙骨骼肌组织进行空间转录组分析的完整样本处理流程 | 首次提出针对小鼠骨骼肌组织的完整样本处理流程，包括经心灌注、固定、脱钙、石蜡处理及共嵌入策略，实现了高质量空间转录组数据生成，并保留了关键解剖背景 | 未提及明显的局限性，但可实现性可能受限于特定组织类型和平台成本 | 开发一个能够高效生成小鼠骨骼肌组织空间转录组数据的样本处理流程 | 成年小鼠完整膝关节、胫骨和腰椎骨样本 | 数字病理学 | 不适用 | 基于成像的空间转录组学 | 不适用 | 空间转录组数据 | 成年小鼠的多个肌肉骨骼组织样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Xenium Prime 5K | 10x Genomics Xenium Prime 5K平台进行成像型空间转录组分析 |
| 531 | 2026-05-20 |
Resistance of endothelial cells to SARS-CoV-2 infection in vitro
2025-12-23, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01205-25
PMID:41347787
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研究论文 | 本研究重新评估了内皮细胞对SARS-CoV-2的易感性，发现培养的或原位的内皮细胞均不容易被活病毒直接感染 | 首次在体外培养及人肺切片原位实验中证明，无论培养还是天然的人内皮细胞均不易直接受SARS-CoV-2感染，这挑战了之前认为内皮细胞是病毒靶点的观点 | 研究主要基于体外实验，可能无法完全模拟体内复杂环境；且样本量有限，结果需要进一步在动物模型或临床研究中验证 | 探讨内皮细胞对SARS-CoV-2的易感性，以澄清其在COVID-19血管炎症中的角色 | 人肺、主动脉内皮细胞、内皮祖细胞以及人肺切片中的原位内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、荧光成像、ELISA、RT-qPCR、假病毒试验 | NA | 图像、基因表达数据 | 内皮细胞来自肺、主动脉和祖细胞培养物，以及人肺切片中的原位细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 用于人肺切片的单细胞RNA测序，捕获与SARS-CoV-2病毒基因组对齐的分子标识符 |
| 532 | 2026-05-20 |
PHD-MS: Multiscale Domain Identification for Spatial Transcriptomics via Persistent Homology
2025-Nov-11, ArXiv
PMID:41293536
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研究论文 | 该论文提出一种基于持续同调的多尺度空间结构识别方法PHD-MS，用于空间转录组学数据中不同形态尺度的组织结构解析 | 首次将拓扑数据分析中的持续同调方法应用于空间转录组学领域，实现跨形态尺度的空间结构识别，超越了传统单尺度聚类方法的局限性 | 对前沿区域等异质性区域的结构解析可能仍需进一步优化 | 开发一种能同时识别空间转录组数据中多尺度组织结构的新算法 | 多种组织类型的空间转录组数据 | 机器学习 | NA | 空间转录组学 | 持续性同调 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 533 | 2026-05-20 |
Video - Visual Integration of Drosophila Enhancer Organization: A tool for integrating and visualizing chromatin accessibility, in vivo transcription factor binding and motif occurrence in tissue-specific differentially expressed genes
2025-Oct-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.10.27.684897
PMID:41279708
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研究论文 | 介绍VIDEO工具，用于整合和可视化果蝇增强子组织中的染色质可及性、体内转录因子结合及基序出现情况 | 提供了首个交互式网络工具，能够整合染色质可及性、转录因子结合和基序出现数据，在组织特异性上下文中探索基因调控 | 未在正文中明确说明其局限性，但可能受限于果蝇模型及预设的数据类型和基因列表来源 | 开发一个网络分析工具，以可视化和整合组织特异性差异表达基因中保守转录因子结合基序、染色质可及性和转录因子结合数据 | 果蝇组织特异性差异表达基因及其近端增强子区域 | 生物信息学 | NA | RNA-seq, ATAC-seq, ChIP-seq, 原位杂交, 微阵列, 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据、染色质可及性数据、转录因子结合数据 | NA（工具演示涉及唾液腺和胚胎后肠的特定基因集） | NA | NA | NA | NA |
| 534 | 2026-05-20 |
Single-Cell and Bulk RNA Sequencing Reveal Tumor Cell Characteristics and Communication Features of Primary and Lymphatic Metastatic Hypopharyngeal Squamous Cell Carcinoma
2025-10, Head & neck
DOI:10.1002/hed.28195
PMID:40395022
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研究论文 | 通过单细胞和 bulk RNA 测序揭示原发性和淋巴转移性下咽鳞状细胞癌的肿瘤细胞特征及通讯特点 | 首次系统比较原发灶与淋巴转移灶中恶性上皮细胞的基因表达差异和细胞通讯特征，并基于配体-受体对构建预后预测模型，有效区分淋巴结转移状态 | 未明确提及样本大小和外部验证队列，可能影响模型泛化性 | 探究下咽鳞癌淋巴结转移的关键驱动因素和潜在治疗靶点，建立预后预测工具 | 下咽鳞状细胞癌原发肿瘤和淋巴转移样本中的恶性上皮细胞 | RNA测序 | 下咽鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | 配体-受体对模型（4-LRs模型） | 单细胞RNA测序数据、bulk RNA测序数据 | 训练集、测试集和整个队列，具体样本数未明确 | NA | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序 | NA | NA |
| 535 | 2026-05-20 |
Single-cell sequencing insights into the transcriptional landscape of cerebral cavernous malformations
2025-09-30, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-025-10011-x
PMID:41028361
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综述 | 综述单细胞测序在脑海绵状血管畸形转录景观中的应用，探讨多种细胞类型的转录特征及治疗策略 | 首次系统综述单细胞RNA测序技术在脑海绵状血管畸形模型中的应用，聚焦内皮细胞、周细胞、成纤维细胞、星形胶质细胞和免疫细胞的转录景观及其对疾病进展的贡献 | 未提及具体局限性 | 总结单细胞RNA测序技术在脑海绵状血管畸形研究中的最新进展，并识别针对不同细胞群的潜在治疗策略 | 脑海绵状血管畸形相关细胞类型，包括内皮细胞、周细胞、成纤维细胞、星形胶质细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 脑部血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 536 | 2026-05-20 |
KC1036, a multi-kinase inhibitor with anti-angiogenic activity, can effectively suppress the tumor growth of Ewing sarcoma
2025-09-18, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-025-10008-6
PMID:40965696
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研究论文 | 论文研究了多激酶抑制剂KC1036通过抗血管生成活性抑制尤文肉瘤肿瘤生长的有效性 | 首次通过单细胞RNA测序解析尤文肉瘤肿瘤微环境中的细胞间通讯网络，并基于此网络推断出多激酶抗血管生成抑制剂对尤文肉瘤的治疗潜力，进一步验证了新型多激酶抑制剂KC1036优于现有药物 | 研究仅限于临床前模型（CDX和PDX模型），未涉及人体临床试验 | 探索新型多激酶抑制剂KC1036对尤文肉瘤的治疗效果及其潜在机制 | 尤文肉瘤细胞系、CDX小鼠模型和PDX小鼠模型 | 机器学习 | 尤文肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 涉及多种尤文肉瘤细胞系和两种动物模型（CDX和PDX），未提供具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 未提及具体平台详细信息 |
| 537 | 2026-05-20 |
Benchmarking sketching methods on spatial transcriptomics data
2025-Sep-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.26.672376
PMID:40909701
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研究论文 | 系统比较了空间转录组学中不同草图采样方法的性能 | 首次针对空间转录组数据系统评估草图采样方法，提出结合空间信息和表达信息的平滑加权策略以平衡组织覆盖与转录组异质性 | 未在更多多样化组织类型或更高分辨率平台上验证，且模拟数据可能不完全反映真实空间异质性 | 探索现有草图采样方法在空间转录组分析中的适用性及空间偏差影响 | 真实空间转录组数据集（小鼠卵巢、MERFISH脑组织、人乳腺癌、肺）及模拟数据 | 机器学学习 | 乳腺癌、肺癌 | 空间转录组测序 | 随机化SVD、空间加权矩阵 | 空间转录组表达数据及空间坐标 | 四个真实数据集（含小鼠卵巢、人乳腺癌等）及模拟数据 | NA | 空间转录组学 | MERFISH | MERFISH脑组织数据，其他数据集平台未明确 |
| 538 | 2026-05-20 |
Regulation of Collecting Lymphatic Vessel Contractile Function by TRPV4 Channels
2025-Sep, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.124.322100
PMID:40371469
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和功能实验，揭示了TRPV4通道在收集淋巴管收缩功能调控中的作用机制，包括TRPV4+髓系细胞与淋巴肌细胞或淋巴内皮细胞之间的相互作用 | 首次系统研究了TRPV4通道在收集淋巴管中的表达模式和功能角色，揭示了TRPV4+髓系细胞通过分泌前列腺素激活TXA2受体导致淋巴管收缩失调的新机制 | 未提及明显的局限性 | 探究TRPV4通道在收集淋巴管中的表达和功能角色及其与淋巴系统疾病的关系 | 小鼠收集淋巴管和乳腺癌相关淋巴水肿患者的活检样本 | 数字病理学 | 淋巴系统疾病, 乳腺癌相关淋巴水肿 | 单细胞RNA测序, 共聚焦显微镜, 功能实验 | NA | 基因表达数据, 图像数据, 功能测量数据 | 小鼠收集淋巴管和乳腺癌相关淋巴水肿患者的活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 539 | 2026-05-20 |
In Vivo and In Vitro Analysis of Cathepsin D in Bone Homeostasis and Osteoporosis
2025-09-01, Journal of musculoskeletal & neuronal interactions
IF:1.7Q4
PMID:40889199
|
research paper | 通过体内与体外分析，探究组织蛋白酶D在骨稳态与骨质疏松中的作用 | 首次利用单细胞测序数据鉴定CTSD在骨质疏松与非骨质疏松状态下的差异表达，并结合体外与体内实验验证其对成骨分化和骨矿物质密度的影响 | 未详细提及具体局限性 | 探索组织蛋白酶D作为骨质疏松潜在生物标志物和治疗靶点的作用 | 人类股骨头组织、人间充质干细胞、小鼠 | machine learning | geriatric disease | single-cell sequencing, RT-qPCR, western blot, immunofluorescence staining, alizarin red staining | NA | single-cell sequencing data, gene expression data, histological staining data | 人类股骨头组织样本（来自GEO数据库），人间充质干细胞（体外实验），卵巢切除小鼠（体内实验） | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 540 | 2026-05-20 |
Identification of High-Risk Cells in Single-Cell Spatially Resolved Transcriptomics Data Using DEGAS Spatial Smoothing
2025-Aug-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.30.635803
PMID:39975321
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研究论文 | 利用DEGAS空间平滑方法在单细胞空间转录组数据中识别高风险细胞 | 通过潜在表示和域自适应技术将疾病属性从患者转移到单细胞RNA测序数据中的单个细胞，解决现有方法无法关联单个细胞与疾病特征的问题 | 未明确说明具体局限性 | 评估DEGAS方法在多种单细胞空间转录组平台数据中的适用性，并识别组织样本中的高风险细胞和区域 | 肝细胞癌和皮肤黑色素瘤组织样本，以及新生成的II型糖尿病Xenium数据集 | 机器学习 | 肝细胞癌, 皮肤黑色素瘤, II型糖尿病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 潜在表示模型, 域自适应模型 | 基因表达数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Xenium | 10x Xenium平台用于II型糖尿病数据集生成 |