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当前共找到 10618 篇文献，本页显示第 5341 - 5360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5341 | 2025-10-06 |
The novel diagnostic markers for systemic lupus erythematosus and periodontal disease
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1614044
PMID:40766309
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析识别系统性红斑狼疮和牙周病的共同诊断标志物 | 首次通过WGCNA和机器学习方法识别出LY96和TMEM140作为SLE和PD的共同诊断标志物 | 研究主要基于公共数据库的微阵列数据，需要进一步实验验证 | 探索系统性红斑狼疮和牙周病的共同遗传标志物及其诊断治疗价值 | 系统性红斑狼疮和牙周病患者基因表达数据 | 生物信息学 | 系统性红斑狼疮,牙周病 | 微阵列分析,单细胞RNA测序,免疫组织化学 | 随机森林 | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE61635,GSE16134,GSE10334,GSE50772) | NA | 单细胞RNA测序,微阵列 | NA | NA |
| 5342 | 2025-10-06 |
Integrating proteomics and machine learning reveals characteristics and risks of lymph node-independent distant metastasis in colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1622528
PMID:40766310
|
研究论文 | 本研究通过整合蛋白质组学和机器学习方法，揭示了结直肠癌中不依赖淋巴结转移的远处转移特征和风险 | 首次开发了淋巴结非依赖性转移基因特征来预测I-II期结直肠癌患者的同步远处转移风险，并发现ITGA11在早期转移中的关键作用 | 样本量相对较小（12例患者），需要在更大规模队列中进一步验证 | 探索结直肠癌中不依赖淋巴结转移的远处转移的生物学特征和预测方法 | 结直肠癌患者组织样本和SW480细胞系 | 机器学习 | 结直肠癌 | 数据非依赖性采集质谱、单细胞RNA测序、免疫组织化学、伤口愈合实验、transwell实验 | 机器学习模型 | 蛋白质组数据、转录组数据、单细胞数据 | 12例结直肠癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱分析 | NA | NA |
| 5343 | 2025-10-06 |
Single-cell and multi-omics analysis reveals the role of stem cells in prognosis and immunotherapy of lung adenocarcinoma patients
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1634830
PMID:40766320
|
研究论文 | 通过单细胞和多组学分析构建基于干细胞的预后模型，用于预测肺腺癌患者的生存和免疫治疗反应 | 首次通过单细胞RNA测序识别干细胞群体，结合多组学数据和多种机器学习算法构建干细胞预后模型，能够预测免疫治疗反应和肿瘤免疫微环境特征 | 模型验证主要依赖回顾性队列，需要在前瞻性研究中进一步验证 | 研究干细胞在肺腺癌预后和免疫治疗中的作用 | 肺腺癌患者 | 机器学习 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 多组学分析, 机器学习 | CoxBoost+Enet, 多种机器学习算法 | 基因表达数据, 突变数据, 拷贝数变异数据 | 7个独立肺腺癌队列和免疫治疗数据集，外加内部医院队列 | NA | 单细胞RNA测序, 多组学分析 | NA | NA |
| 5344 | 2025-10-06 |
Inferring Metabolic Flux from Gene Expression Data Using METAFlux
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4566-6_10
PMID:40779111
|
研究论文 | 开发了一种名为METAFlux的计算方法，用于从基因表达数据推断代谢通量 | 首次将通量平衡分析(FBA)应用于从bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据推断代谢反应活性 | 依赖于代谢组学技术的当前限制，可能无法完全表征肿瘤代谢组 | 解决肿瘤代谢重编程研究的计算分析缺口 | 恶性肿瘤细胞和肿瘤微环境中的细胞 | 计算生物学 | 癌症 | 通量平衡分析(FBA), RNA测序 | METAFlux | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5345 | 2025-10-06 |
Inferring Phenotypes of Copy Number Clones in Cancer Populations Using TreeAlign
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4566-6_7
PMID:40779108
|
研究论文 | 介绍使用TreeAlign方法联合分析单细胞全基因组测序和单细胞RNA测序数据中的拷贝数和基因表达 | 开发了能够匹配scRNA数据与scWGS推断克隆的系统发育感知方法，能够稳健建模基因剂量对基因表达的影响 | 需要同时具备单细胞RNA测序和单细胞全基因组测序数据，两种模式的联合测量并不常见 | 在单细胞水平上关联表达变化与拷贝数变化 | 癌症细胞群体中的拷贝数克隆 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序, 单细胞全基因组测序 | TreeAlign | 基因表达数据, 拷贝数变异数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞全基因组测序 | NA | NA |
| 5346 | 2025-10-06 |
Single cell analyses of the HIV reservoir in the CNS and CSF: recent insights and implications
2025-Sep-01, Current opinion in HIV and AIDS
IF:4.5Q1
DOI:10.1097/COH.0000000000000958
PMID:40742782
|
综述 | 本综述重点介绍了单细胞组学技术在解析HIV在中枢神经系统和脑脊液中病毒储存库的最新进展 | 应用多种单细胞组学技术揭示HIV在中枢神经系统中的持续存在机制和细胞特异性特征 | NA | 探讨单细胞技术对HIV中枢神经系统储存库研究的推动作用 | HIV感染者的尸检脑组织和脑脊液样本 | 单细胞组学 | HIV感染 | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, ATAC-seq, CITE-seq, AIRR-seq, 多组学平台, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组, 表观基因组, 空间转录组 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5347 | 2025-08-08 |
Single-cell sequencing technologies: a multiomics toolbox for investigating HIV-1 persistence
2025-Sep-01, Current opinion in HIV and AIDS
IF:4.5Q1
DOI:10.1097/COH.0000000000000966
PMID:40772512
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5348 | 2025-10-06 |
Insight into pericytes in glioblastoma angiogenesis: In vivo tracking by two-photon microscopy and proteomic profiling
2025-Aug-07, Animal models and experimental medicine
IF:3.8Q2
DOI:10.1002/ame2.70073
PMID:40772404
|
研究论文 | 本研究通过双光子显微镜活体追踪和蛋白质组学分析，揭示了胶质母细胞瘤中周细胞在血管生成中的时空动态和分子重编程 | 首次结合活体成像和蛋白质组学技术，系统揭示了周细胞在胶质母细胞瘤血管生成中的时空动态和分子重编程机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究胶质母细胞瘤中周细胞的时空动态和分子变化在肿瘤血管生成中的作用 | PDGFRβ阳性周细胞、胶质母细胞瘤血管系统 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 双光子显微镜、LC-MS/MS蛋白质组学、单细胞RNA测序、流式细胞分选 | 转基因小鼠模型 | 图像、蛋白质组数据、基因表达数据 | 转基因小鼠模型，FACS分选的Pdgfrb+细胞 | NA | 蛋白质组学,单细胞RNA测序 | LC-MS/MS | 液相色谱-串联质谱分析 |
| 5349 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals potential novel insights into appendage-patterning and joint-development in a spider
2025-Aug-07, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.70069
PMID:40772585
|
研究论文 | 通过单细胞测序技术分析蜘蛛胚胎中与附肢模式和关节发育相关的细胞簇及其标记基因 | 发现了参与节肢动物关节发育的新遗传因子（dysf、spz3、svp）并在远缘螯肢动物中验证其进化起源 | 研究结果主要基于基因表达模式分析，功能验证实验尚不充分 | 探索节肢动物附肢模式和关节发育的遗传机制 | 蜘蛛Parasteatoda tepidariorum胚胎和收割者Phalangium opilio的直系同源基因 | 发育生物学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 蜘蛛胚胎细胞簇 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5350 | 2025-10-06 |
N-Oxide-Driven Heme-Activatable Biomolecule Labeling for Visualization of Labile Heme in Living Cells and Mouse Brain
2025-Aug-06, Journal of the American Chemical Society
IF:14.4Q1
DOI:10.1021/jacs.5c04990
PMID:40720736
|
研究论文 | 开发了一种基于N-氧化物驱动血红素激活的生物分子标记策略，用于活细胞和小鼠脑中不稳定血红素的可视化检测 | 首次报道了N-氧化物驱动的不稳定血红素激活探针，能够在活体系统中实现选择性标记和检测 | NA | 开发新型化学探针以研究不稳定血红素在生理和病理过程中的作用 | 不稳定血红素（原卟啉IX与铁离子复合物） | 化学生物学 | NA | 荧光成像、3D组织可视化、蛋白质组学、单细胞RNA测序 | NA | 图像、蛋白质组数据、转录组数据 | 活细胞和小鼠脑组织 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5351 | 2025-10-06 |
Unveiling the Role of Sdc4+ Monocytes in NASH: A Single-Cell RNA Sequencing Study
2025-Aug-06, Immunological investigations
IF:2.9Q3
DOI:10.1080/08820139.2025.2544180
PMID:40768295
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究揭示了Sdc4+单核细胞在非酒精性脂肪性肝炎中的作用机制 | 首次在单细胞水平揭示NASH中单核细胞亚群的异质性和功能转化，发现Sdc4+单核细胞的特异性作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究单核细胞在非酒精性脂肪性肝炎发病机制中的作用 | NASH小鼠和患者的肝脏非实质细胞，特别是单核细胞亚群 | 单细胞组学 | 非酒精性脂肪性肝炎 | 单细胞RNA测序, 转染, 共培养, 免疫荧光, qPCR | NA | 单细胞转录组数据 | NASH和对照小鼠的肝脏非实质细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5352 | 2025-10-06 |
Function of chemokines in embryo implantation
2025-Aug-06, Placenta
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.placenta.2025.07.092
PMID:40769846
|
综述 | 本文综述了趋化因子在胚胎植入过程中通过调节免疫微环境维持母胎免疫稳态的核心作用 | 系统整合了趋化因子网络在胚胎植入关键过程中的调控机制，并强调单细胞测序等新技术在解码趋化因子介导调控中的应用 | 作为综述文章，未涉及原始实验研究，主要基于现有文献综合分析 | 探讨趋化因子在胚胎植入过程中的功能机制 | 胚胎植入过程中的趋化因子网络和免疫微环境 | 生殖免疫学 | 生殖系统疾病 | 单细胞测序、微流控、人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5353 | 2025-10-06 |
Multi-omics prediction of axillary treatment response and tumour microenvironment alterations in lymph node-positive luminal breast cancer
2025-Aug-04, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07877-6
PMID:40759637
|
研究论文 | 本研究开发了一种多组学模型用于预测淋巴结阳性luminal乳腺癌患者新辅助化疗后的腋窝治疗反应 | 首次结合影像组学、临床病理特征和单细胞RNA测序构建多组学预测模型，并探索了肿瘤免疫微环境与治疗反应的关系 | 回顾性研究设计，样本量有限（仅5名患者的14个样本），需要更大规模的前瞻性验证 | 预测luminal乳腺癌患者新辅助化疗后的病理淋巴结完全缓解状态，以减少不必要的腋窝手术 | 淋巴结阳性的luminal乳腺癌患者 | 数字病理 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，影像组学分析 | 多组学预测模型 | 影像数据，临床数据，病理数据，单细胞RNA测序数据 | 两个中心的回顾性数据，包含5名患者的14个单细胞测序样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5354 | 2025-10-06 |
Optimized summary-statistic-based single-cell eQTL meta-analysis
2025-Aug-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-08808-3
PMID:40759673
|
研究论文 | 本文比较了不同策略并为跨单细胞RNA测序数据集的eQTL加权荟萃分析提供最佳实践建议 | 提出了针对单细胞eQTL研究的联邦加权荟萃分析方法，解决了基因型数据共享隐私限制和技术差异问题 | 单细胞研究样本量有限，不同数据集存在mRNA捕获效率、实验方案和测序策略的技术差异 | 提高检测细胞类型特异性表达数量性状位点(eQTLs)的统计功效 | 跨多个单细胞RNA测序数据集的eQTL汇总统计量 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 加权荟萃分析模型 | 基因表达数据、基因型数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 5355 | 2025-10-06 |
Semi-supervised contrastive learning variational autoencoder Integrating single-cell multimodal mosaic datasets
2025-Aug-04, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06239-5
PMID:40759922
|
研究论文 | 提出基于变分自编码器的半监督对比学习框架scGCM，用于整合单细胞多模态镶嵌数据集并消除批次效应 | 开发了灵活的整合框架，专门针对单细胞多模态镶嵌数据（部分模态缺失）的整合问题，结合了半监督对比学习和变分自编码器技术 | 未在摘要中明确说明研究的局限性 | 整合单细胞多模态镶嵌数据并消除批次效应 | 单细胞多模态镶嵌数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序技术 | 变分自编码器(VAE), 对比学习 | 单细胞多模态组学数据 | 多个数据集（未指定具体样本数量） | NA | 单细胞多模态组学 | NA | NA |
| 5356 | 2025-10-06 |
Repurposed clindamycin suppresses pyroptosis in tumor-associated macrophages through Inhibition of caspase-1
2025-Aug-04, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-025-03478-5
PMID:40759978
|
研究论文 | 本研究通过计算生物学方法发现克林霉素可抑制肿瘤相关巨噬细胞中caspase-1活性并减少细胞焦亡 | 开发了结合单细胞转录组学、网络分析和分子对接的新型计算流程，首次发现克林霉素对caspase-1的抑制作用 | 研究主要为体外实验验证，尚未进行体内动物模型验证 | 开发肿瘤相关巨噬细胞免疫调节的药物重定位方法 | 肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)，特别是葡萄膜黑色素瘤和多发性骨髓瘤来源的TAMs | 计算生物学 | 葡萄膜黑色素瘤，多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组学，网络分析，多标准决策技术，药效团对接模拟，分子对接 | 计算分析流程 | 单细胞转录组数据，基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5357 | 2025-10-06 |
A programmed decline in ribosome levels governs human early neurodevelopment
2025-Aug-04, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-025-01708-8
PMID:40760247
|
研究论文 | 本研究揭示了人类早期神经发育过程中核糖体水平程序性下降的调控机制及其对神经发育障碍的影响 | 首次发现神经上皮分化过程中核糖体水平的程序性下降，并阐明AIRIM/C1orf109变异通过影响特定转录本翻译导致神经发育缺陷的机制 | 研究主要基于人类大脑类器官模型，需要在体内系统中进一步验证 | 探究核糖体生物合成减少如何导致组织和发育特异性神经发育缺陷 | 人类大脑类器官和神经上皮细胞 | 发育生物学 | 神经发育障碍 | 蛋白质组学, 单细胞RNA测序, 单类器官翻译分析 | 人类大脑类器官模型 | 蛋白质组数据, 单细胞转录组数据, 翻译效率数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5358 | 2025-10-06 |
Identification of IQGAP3 prognostic potential and involvement in immune cell infiltration in LUAD
2025-Aug-04, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-02976-8
PMID:40760442
|
研究论文 | 本研究探讨IQGAP3在肺腺癌中的预后价值及其通过RAS-ERK信号通路调控肿瘤进展和免疫细胞浸润的机制 | 首次系统揭示IQGAP3通过激活RAS-ERK信号通路诱导T细胞耗竭并上调PD-L1表达的新机制 | 研究主要基于临床标本和动物模型，需要进一步验证IQGAP3作为治疗靶点的临床转化潜力 | 阐明IQGAP3在肺腺癌进展和肿瘤免疫微环境调控中的作用机制 | 肺腺癌临床标本、LUAD细胞系、C57BL/6小鼠皮下移植瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 肺腺癌 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, CCK-8, 集落形成, EdU掺入, 迁移侵袭实验, RT-qPCR, Western blotting, 多重免疫荧光染色 | NA | RNA测序数据, 实验数据, 影像数据 | 临床标本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 5359 | 2025-10-06 |
Blocking CXCR4+ CD4+ T cells reprograms Treg-mediated immunosuppression via modulating the Rho-GTPase/NF-κB signaling axis
2025-Aug-04, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-025-01515-8
PMID:40760450
|
研究论文 | 本研究揭示了阻断CXCR4+ CD4+ T细胞通过调节Rho-GTPase/NF-κB信号轴重编程Treg介导的免疫抑制机制 | 首次阐明CXCR4通过调控Rho-GTPase/NF-κB信号轴驱动Treg细胞介导的免疫抑制机制 | NA | 探究CXCR4在调节肿瘤微环境中Treg细胞介导的免疫抑制作用 | CD4+ T细胞、调节性T细胞(Treg)、小鼠宫颈癌模型、人类宫颈癌类器官 | 免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 磷酸化蛋白质组学, ChIP-seq | NA | 转录组数据, 表观遗传数据, 蛋白质组数据, 临床试验数据 | 多个癌症类型的单细胞RNA-seq数据集, 两个临床试验数据集(NCT02826486和NCT04516616) | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 5360 | 2025-10-06 |
Identification and validation of ANXA3 and SOCS3 as biomarkers for acute myocardial infarction related to sphingolipid metabolism
2025-Aug-04, Hereditas
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s41065-025-00515-3
PMID:40760666
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和机器学习方法鉴定并验证了ANXA3和SOCS3作为与鞘脂代谢相关的急性心肌梗死生物标志物 | 首次将鞘脂代谢相关基因与急性心肌梗死联系起来，并通过单细胞RNA测序确定了关键细胞类型及其功能 | 研究基于公共数据集，需要进一步实验验证生物标志物的临床实用性 | 探索鞘脂代谢相关基因在急性心肌梗死中的作用，为临床诊断提供支持 | 急性心肌梗死患者基因表达数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 机器学习, 人工神经网络, 分子对接, RT-qPCR | 人工神经网络(ANN) | 基因表达数据 | 基于GSE48060和GSE123342两个数据集 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |