本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!
如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!


除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5301 | 2025-10-05 |
Transcriptional profiling uncovers microglial HIF-1α signaling as a therapeutic target of radiation-induced brain injury
2025-Nov, Free radical biology & medicine
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示颅脑放疗后小胶质细胞中HIF-1α信号通路的特异性激活及其在辐射性脑损伤中的关键作用 | 首次在单细胞水平发现辐射特异性激活小胶质细胞HIF-1α信号通路,该现象在传统批量分析中无法检测 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类临床样本中验证 | 探索辐射性脑损伤的细胞分子机制并寻找治疗靶点 | 接受颅脑放疗的小鼠模型及其小胶质细胞 | 单细胞转录组学 | 辐射性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5302 | 2025-10-05 |
Multi-omics analysis of polyamine metabolism implicates NT5E/CD73 in the progression of pancreatic cancer
2025-Oct-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217887
PMID:40582491
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示多胺代谢在胰腺癌进展中的作用,并鉴定NT5E/CD73为关键调控基因 | 首次系统性地整合批量转录组学、单细胞RNA测序和功能实验,全面表征胰腺癌中多胺代谢的作用机制 | 多胺代谢在胰腺癌中的全面临床意义仍需进一步探索 | 研究多胺代谢在胰腺导管腺癌进展和免疫逃逸中的作用 | 胰腺导管腺癌(PDAC)肿瘤细胞和肿瘤微环境 | 多组学分析 | 胰腺癌 | 批量转录组学,单细胞RNA测序,功能实验 | 随机森林算法,主成分分析 | 转录组数据,单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 5303 | 2025-10-05 |
CEMIP2 sensitizes PDAC to chemotherapy through extracellular matrix remodeling by hyaluronan degradation
2025-Oct-10, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2025.217898
PMID:40623543
|
研究论文 | 本研究揭示CEMIP2通过降解透明质酸重塑细胞外基质,增强胰腺导管腺癌对化疗的敏感性 | 首次阐明CEMIP2通过透明质酸降解调节肿瘤微环境并增强化疗疗效的分子机制 | CEMIP2在肿瘤微环境中具体作用机制仍需进一步验证 | 探究CEMIP2在胰腺导管腺癌化疗敏感性中的作用机制 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者样本和PDAC小鼠模型 | 肿瘤生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 飞行时间质谱流式细胞术(CyTOF) | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 单细胞测序数据 | 临床PDAC标本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 5304 | 2025-10-05 |
The greater splanchnic nerve preferentially regulates neutrophils over macrophages in a rat model of septic peritonitis
2025-Oct, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2025.05.015
PMID:40389038
|
研究论文 | 本研究通过大鼠败血症腹膜炎模型,揭示内脏大神经通过调节中性粒细胞亚群平衡来影响细菌清除的新机制 | 首次证明内脏大神经在感染急性期通过选择性调节中性粒细胞亚群平衡(激活态与静止态)来影响细菌清除,而非通过巨噬细胞 | 研究仅关注急性感染期(24小时内),未评估长期效应;机制研究主要基于相关性分析 | 阐明内脏大神经在败血症感染过程中的免疫调节作用 | 大肠杆菌诱导的败血症腹膜炎大鼠模型 | 免疫学 | 败血症 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | 大鼠败血症模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5305 | 2025-10-05 |
Multimodal associations between brain morphology, immune-inflammatory markers, spatial transcriptomics, and behavioural symptoms in autism spectrum disorder
2025-Oct, Brain, behavior, and immunity
DOI:10.1016/j.bbi.2025.07.021
PMID:40721173
|
研究论文 | 本研究通过多模态方法探讨自闭症谱系障碍中攻击行为与脑形态、免疫炎症标志物和空间转录组学的关联 | 首次结合神经内分泌标志物、脑结构差异和空间转录组学综合分析ASD攻击行为的神经生物学机制,识别了前额叶-边缘系统-纹状体网络失衡与促炎状态的复杂相互作用 | 样本量较小(42名男性参与者),缺乏纵向数据,未考虑遗传和环境因素的影响,研究结果可能不适用于更广泛的自闭症人群 | 识别自闭症谱系障碍中攻击行为的潜在机制并为治疗策略提供依据 | 42名11-38岁男性自闭症谱系障碍患者(21名攻击性患者和21名非攻击性对照) | 神经科学 | 自闭症谱系障碍 | 多重检测分析、磁共振成像、变形基形态测量法、空间转录组学 | NA | 行为问卷数据、血浆生物标志物、脑影像数据、基因表达数据 | 42名男性ASD患者(21名攻击性,21名非攻击性),其中13名攻击性患者接受了MRI扫描 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5306 | 2025-10-05 |
Acrylamide-induced noradrenergic axon degeneration is promoted via a non-cell autonomous mechanism, involving microglial Tnfaip2/TNF-α and oxidative stress pathways
2025-Sep-15, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.139125
PMID:40664071
|
研究论文 | 本研究揭示了丙烯酰胺通过非细胞自主机制促进去甲肾上腺素能轴突退化的分子机制 | 首次发现丙烯酰胺通过小胶质细胞TNF-α和氧化应激通路以非细胞自主方式促进轴突退化 | 研究主要基于小鼠和细胞模型,人类相关性需进一步验证 | 探究环境毒物诱导认知功能障碍的神经退行性机制 | 小鼠脑组织、小胶质细胞BV2系、1C11神经元细胞系 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5307 | 2025-10-05 |
Mitoribosome-Targeting Antibiotics Suppress Osteoclastogenesis and Periodontitis-Induced Bone Loss by Blocking Mitochondrial Protein Synthesis
2025-Sep-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202501619R
PMID:40923938
|
研究论文 | 本研究探讨靶向线粒体核糖体的抗生素雷德唑胺通过抑制线粒体蛋白质合成来抑制破骨细胞分化和牙周炎骨丢失 | 首次发现雷德唑胺通过靶向线粒体功能抑制破骨细胞分化,为牙周炎治疗提供新策略 | 研究主要基于细胞系和动物模型,尚未进行临床试验验证 | 研究雷德唑胺抑制破骨细胞分化和牙周炎骨丢失的机制 | RAW264.7细胞、骨髓来源巨噬细胞(BMM)和牙周炎大鼠模型 | 单细胞测序分析 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、电子显微镜 | NA | 基因表达数据、细胞图像 | 健康个体和重度慢性牙周炎患者的牙周组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5308 | 2025-10-05 |
Longitudinal single-cell RNA model aids prediction of EGFR-TKI resistance
2025-Sep-04, Carcinogenesis
IF:3.3Q2
DOI:10.1093/carcin/bgaf038
PMID:40739818
|
研究论文 | 本研究利用纵向单细胞RNA测序数据探索肺腺癌EGFR-TKI耐药机制 | 首次在单细胞水平建立EGFR耐药评分系统并揭示代谢重编程在耐药中的作用 | 样本量有限,需要更大规模验证 | 研究肺腺癌EGFR-TKI耐药机制 | 肺腺癌患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5309 | 2025-10-05 |
Exploration of potential therapeutic target genes for preeclampsia through genetic analysis
2025-Sep, Journal of human hypertension
IF:2.7Q2
DOI:10.1038/s41371-025-01054-0
PMID:40715499
|
研究论文 | 通过遗传分析探索先兆子痫的潜在治疗靶基因 | 首次通过整合cis-eQTL、孟德尔随机化、SMR和共定位分析系统筛选先兆子痫的潜在药物靶基因 | 研究主要基于血液样本的eQTL数据,未直接使用胎盘组织数据 | 识别先兆子痫的潜在治疗靶基因 | 先兆子痫相关基因 | 生物信息学 | 先兆子痫 | cis-eQTL分析,孟德尔随机化,功能富集分析,SMR分析,共定位分析,单细胞RNA测序 | 孟德尔随机化模型 | 基因表达数据,遗传数据 | eQTLGen联盟提供的血液样本数据 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5310 | 2025-10-05 |
An engineered glioblastoma model yields macrophage-secreted drivers of invasion
2025-Aug-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.181903
PMID:40857405
|
研究论文 | 本研究通过工程化胶质母细胞瘤模型揭示肿瘤相关巨噬细胞分泌的侵袭驱动因子 | 结合工程化3D水凝胶肿瘤微环境模型与多组学分析,首次发现并验证TGFBI作为巨噬细胞分泌的可靶向促肿瘤因子 | 对肿瘤相关巨噬细胞功能的认知仍不完整,临床转化效果需进一步验证 | 研究肿瘤相关巨噬细胞与胶质母细胞瘤干细胞之间的相互作用机制 | 胶质母细胞瘤干细胞和M2极化巨噬细胞 | 肿瘤微环境研究 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞转录组学,蛋白质组学,3D水凝胶模型 | 工程化3D水凝胶肿瘤微环境模型 | 转录组数据,蛋白质组数据 | 胶质母细胞瘤患者单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5311 | 2025-10-05 |
Synovial tissue atlas in juvenile idiopathic arthritis reveals pathogenic niches associated with disease severity
2025-Jul-02, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adt6050
PMID:40601776
|
研究论文 | 本研究通过单细胞技术构建了幼年特发性关节炎滑膜组织图谱,揭示了与疾病严重程度相关的致病微环境 | 首次在初治JIA患儿中建立滑膜组织细胞图谱,识别了与关节炎严重程度相关的空间组织微环境和特定细胞群体 | 样本来自疾病早期初治患者,可能无法代表所有JIA亚型或疾病阶段 | 解析幼年特发性关节炎滑膜组织的细胞组成和空间结构,指导靶向治疗 | 幼年特发性关节炎患儿的滑膜组织活检样本、滑液和外周血 | 数字病理学 | 幼年特发性关节炎 | 单细胞RNA测序,多重免疫荧光,空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,免疫荧光图像 | 初治JIA患儿的滑膜组织活检样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 5312 | 2025-10-05 |
Comparative single cell analysis of transcriptional bursting reveals the role of genome organization on de novo transcript origination
2025-Mar-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.29.591771
PMID:38746255
|
研究论文 | 通过比较单细胞分析研究转录爆发在精子发生过程中对新转录本起源的作用 | 开发新的统计程序识别198个核心基因,揭示基因组组织对转录爆发和新基因起源的影响机制 | 仅在三密切相关的物种中进行研究,时间跨度2500-3000万年 | 研究转录爆发在精子发生过程中对新转录本起源的调控机制 | 三种密切相关的物种的生殖细胞 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, RNA荧光原位杂交 | 统计模型 | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 三种物种的生殖细胞样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5313 | 2025-10-05 |
NAD+ prevents chronic kidney disease by activating renal tubular metabolism
2025-Mar-10, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.181443
PMID:40059824
|
研究论文 | 本研究揭示了NAD+补充通过激活肾小管代谢预防慢性肾脏病的机制 | 首次在Alport综合征小鼠模型中应用单核RNA测序和空间转录组学技术,并首次报道该模型中转录水平的性别差异 | 研究仅限于Alport综合征小鼠模型,人类临床相关性尚需验证 | 探究NAD+补充保护慢性肾脏病的分子机制和涉及的细胞类型 | Alport综合征小鼠模型和肾近端小管细胞 | 肾脏病学 | 慢性肾脏病 | RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学, 正交成像技术, 生化分析 | 小鼠疾病模型 | 转录组数据, 图像数据, 生化数据 | Alport综合征小鼠模型 | NA | bulk RNA-seq, 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5314 | 2025-10-05 |
TCGAimmunosurv: An R package to identify genes associated with patient survival and immune cell state transitions using TCGA and single-cell RNA-seq data
2025-Dec, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 开发了一个名为TCGAimmunosurv的R软件包,用于整合TCGA大块RNA-seq数据和单细胞RNA-seq数据,识别与患者生存和免疫细胞状态转换相关的基因 | 开发了首个整合大块RNA-seq和单细胞RNA-seq数据的泛癌分析工具,能够进行突变特异性免疫动态分析 | 依赖于用户提供的单细胞数据集,分析结果可能受数据质量影响 | 识别与癌症患者生存和免疫细胞状态转换相关的驱动基因 | 癌症基因组数据和免疫细胞数据 | 生物信息学 | 癌症 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | 伪时间轨迹分析 | 基因表达数据 | TCGA数据库中的泛癌样本 | NA | 大块RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5315 | 2025-10-05 |
Crustacean cardioactive peptide (CCAP) negatively regulates sand-diving behaviour in kuruma shrimp, Penaeus japonicus
2025 Oct-Dec, Comparative biochemistry and physiology. Part B, Biochemistry & molecular biology
DOI:10.1016/j.cbpb.2025.111143
PMID:40812679
|
研究论文 | 本研究通过基因操作探究了甲壳动物心活肽对日本对虾潜沙行为的调控作用 | 首次在甲壳动物中证实CCAP基因对潜沙行为的负向调控作用,并揭示其对生理节律的潜在影响 | 未阐明CCAP调控行为的具体分子通路,观察时间较短(12小时内) | 探究甲壳动物心活肽(CCAP)在日本对虾潜沙行为中的遗传调控机制 | 日本对虾(Penaeus japonicus) | 分子生物学 | NA | cDNA克隆、RT-qPCR、原位杂交、RNA干扰、基因过表达 | NA | 基因表达数据、行为观察数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞转录组测序(前期研究提及) | NA | NA |
| 5316 | 2025-10-05 |
Reactive Oxygen Species-Responsive Hydrogel Microspheres Loaded with Epigallocatechin Gallate for Effective Osteoarthritis Therapy
2025-Sep-08, ACS biomaterials science & engineering
IF:5.4Q2
DOI:10.1021/acsbiomaterials.5c00564
PMID:40813306
|
研究论文 | 开发了一种活性氧响应的水凝胶微球系统用于靶向递送表没食子儿茶素没食子酸酯治疗骨关节炎 | 首次构建WYRGRL肽修饰的ROS响应型水凝胶微球递送系统,并通过单细胞转录组学和代谢组学联合分析揭示了Tomm70基因在治疗机制中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中进行验证 | 开发智能递送系统治疗骨关节炎 | 软骨细胞和OA小鼠模型 | 生物医学工程 | 骨关节炎 | 单细胞转录组学, 代谢组学 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据 | OA小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5317 | 2025-10-05 |
IGHA1 and IGHG1 Expression Panel Predicts Anti-PD-L1 Response in Muscle-Invasive Bladder Cancer
2025-Sep-08, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.70033
PMID:40919684
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和空间转录组分析,发现IGHA1和IGHG1表达模式可预测肌层浸润性膀胱癌对PD-L1抑制剂的治疗反应 | 首次结合单细胞测序和空间转录组技术揭示三级淋巴结构中B细胞克隆与免疫治疗反应的关系,并建立IGHA1/IGHG1预测模型 | 样本量相对有限,单细胞测序仅9个样本,空间转录组仅5个样本 | 探究肌层浸润性膀胱癌中三级淋巴结构与免疫球蛋白库的关系及其对免疫治疗反应的预测价值 | 肌层浸润性膀胱癌患者 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞测序, 空间转录组 | 表达特征预测模型 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 临床数据 | 单细胞测序9例(5例来自本中心,4例来自PRJNA662018),空间转录组5例(1例来自本中心,4例来自GSE169379),TCGA数据库405例,IMvigor210试验348例 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组 | NA | NA |
| 5318 | 2025-10-05 |
Cutting-edge technologies in neural regeneration
2025-Sep-05, Cell regeneration (London, England)
DOI:10.1186/s13619-025-00260-y
PMID:40911279
|
综述 | 本文综述了推动神经再生领域发展的前沿技术及其应用前景 | 系统整合了光遗传学、化学遗传学、3D培养模型、基因编辑、单细胞测序和3D成像等多项前沿技术,并展望了人工智能、高通量体内筛选和脑机接口技术的未来潜力 | 作为综述文章,未涉及具体实验数据和原始研究发现 | 探讨神经再生领域的最新技术进展和治疗策略开发 | 中枢神经系统损伤和神经功能障碍 | 神经科学 | 神经系统疾病 | 光遗传学、化学遗传学、3D培养、基因编辑、单细胞测序、3D成像、人工智能、高通量筛选、脑机接口 | NA | NA | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 5319 | 2025-10-05 |
Integrated machine learning-based RNA sequencing and single-cell analysis reveal RNA methylation regulation patterns in the immune microenvironment of Alzheimer's disease
2025-Sep-03, Neural regeneration research
IF:5.9Q1
DOI:10.4103/NRR.NRR-D-24-01650
PMID:40903964
|
研究论文 | 本研究通过整合机器学习、RNA测序和单细胞分析,揭示了阿尔茨海默病免疫微环境中RNA甲基化的调控模式 | 首次将机器学习与单细胞RNA测序相结合,系统分析阿尔茨海默病中RNA甲基化对免疫微环境的调控作用,并建立了风险预测模型 | 研究主要基于体外实验和生物信息学分析,需要进一步的体内实验验证 | 探索RNA甲基化在阿尔茨海默病免疫微环境中的调控机制及其与疾病进展的关系 | 阿尔茨海默病患者样本、神经元细胞、T细胞、B细胞和NK细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | RNA测序, 单细胞RNA测序, qRT-PCR, Western blot, 机器学习 | 机器学习算法, 风险预测模型, 列线图 | 转录组数据, 单细胞数据, 分子生物学数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5320 | 2025-10-05 |
Lhx2 specifically expressed in HSCs promotes liver regeneration and inhibits liver fibrosis
2025-Sep-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000001201
PMID:39693275
|
研究论文 | 本研究揭示了肝星状细胞特异性转录因子Lhx2在促进肝脏再生和抑制肝纤维化中的双重功能 | 首次发现Lhx2在肝星状细胞中特异性表达,并同时具备促进肝脏再生和抑制纤维化的双重功能 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证仍需进一步研究 | 鉴定肝星状细胞中同时促进再生和抑制纤维化的特异性靶点及其分子机制 | 小鼠和人类肝星状细胞,急慢性肝损伤模型 | 分子生物学 | 肝病 | RNA-seq,单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 急性和慢性肝损伤小鼠模型,人类肝组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |