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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5261 | 2025-10-06 |
Themis differentially regulates T follicular helper cell differentiation during early and late stages of chronic viral infection
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1638178
PMID:40777021
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研究论文 | 本研究揭示了Themis在慢性病毒感染期间对滤泡辅助性T细胞分化的双阶段调控作用 | 首次发现Themis在慢性病毒感染早期促进TFH细胞分化,而在晚期抑制其分化的时间依赖性调控机制 | 研究仅限于LCMV病毒感染模型,未在其他慢性病毒感染模型中验证 | 探究Themis在慢性病毒感染期间对CD4⁺ T细胞分化为TFH细胞的调控机制 | 野生型和Themis条件性基因敲除小鼠的CD4⁺ T细胞 | 免疫学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,组织学分析,过继细胞转移 | NA | 基因表达数据,细胞表型数据 | 小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5262 | 2025-10-06 |
Revolutionizing cervical cancer treatment: single-cell sequencing of TSPAN1+ tumor EPCs and immune checkpoints to assess drug sensitivity and optimize therapy
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1574174
PMID:40777026
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研究论文 | 通过单细胞测序和多组学分析研究宫颈癌肿瘤微环境中TSPAN1+肿瘤上皮细胞亚型与免疫检查点的相互作用及其对药物敏感性的影响 | 首次在宫颈癌中系统鉴定TSPAN1+肿瘤上皮细胞亚型,并揭示其与免疫检查点的相互作用对治疗反应的调控机制 | 研究样本量有限,需要更大规模验证;机制研究尚需进一步实验证实 | 优化宫颈癌个性化治疗策略 | 宫颈癌肿瘤微环境中的肿瘤上皮细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞测序, 多组学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 5263 | 2025-10-06 |
Blood samples collected under anesthesia can be used as a source of non-diseased controls for immune-based assays
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1618080
PMID:40777034
|
研究论文 | 评估麻醉诱导后采集的血液样本是否适合作为免疫学研究的健康对照 | 首次系统评估吸入麻醉对儿童免疫系统即时影响,为使用麻醉期间采集的样本作为健康对照提供依据 | 样本量有限,仅针对特定麻醉方案(一氧化二氮和七氟醚),未评估其他麻醉药物或长期影响 | 研究麻醉诱导是否影响血液免疫细胞组成和功能,验证其作为健康对照样本的适用性 | 接受择期牙科手术的儿童血液样本 | 免疫学 | NA | 多参数流式细胞术, bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 流式细胞数据, RNA测序数据 | 未明确具体样本数量(儿童血液样本) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Genomics平台 | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
| 5264 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing combined with machine learning to identify glioma biomarkers and therapeutic targets
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1629102
PMID:40777122
|
研究论文 | 本研究结合单细胞测序和机器学习方法识别胶质瘤生物标志物和治疗靶点 | 首次将单细胞测序数据与机器学习结合,识别分化相关基因特征并揭示泛素化在胶质母细胞瘤中的重要作用 | 研究基于公共数据库数据,需要进一步实验验证 | 探索胶质瘤异质性,识别与胶质母细胞瘤复发相关的关键生物标志物 | 胶质瘤组织和细胞系 | 机器学习 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序,转录组分析 | LASSO,SVM-RFE,加权相关网络分析 | 单细胞RNA测序数据,转录组数据 | 来自GEO数据库(GSE159416, GSE159605, GSE186057)和TCGA数据库的样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5265 | 2025-10-06 |
Dual Roles of SIRT7 Inhibition by Oroxylin A Reprogram HSCs Fate: PRMT5 Succinylation-Driven Senescence and Ecto-Calreticulin-Dependent NK Cell Immune Clearance in Liver Fibrosis
2025, Research (Washington, D.C.)
DOI:10.34133/research.0808
PMID:40777599
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研究论文 | 本研究揭示了木蝴蝶素A通过抑制SIRT7的双重作用调控肝星状细胞命运的新机制 | 首次发现SIRT7抑制可通过PRMT5琥珀酰化依赖性降解诱导细胞衰老,同时通过外露钙网蛋白促进NK细胞免疫清除的双重调控机制 | 酶活性缺失突变体SIRT7(H187Y)仍能抑制ecto-CRT表达,表明该过程不依赖其去琥珀酰酶活性,具体机制仍需进一步研究 | 探究木蝴蝶素A在肝纤维化中通过调控SIRT7抑制肝星状细胞活化的分子机制 | 肝星状细胞(HSCs)、自然杀伤细胞(NK cells) | 分子生物学 | 肝纤维化 | 单细胞转录组测序、生物信息学分析、Western blotting、免疫荧光、免疫共沉淀 | NA | 基因表达数据、蛋白质数据 | 人类样本、动物模型和原代培养细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5266 | 2025-10-06 |
PCLDA: An interpretable cell annotation tool for single-cell RNA-sequencing data based on simple statistical methods
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.07.019
PMID:40778314
|
研究论文 | 提出了一种基于简单统计方法的可解释单细胞RNA测序数据细胞注释工具PCLDA | 在保持原始假设、计算效率和可解释性的同时,通过两个新颖的增强模块显著提升了性能和鲁棒性 | NA | 开发准确、一致且可解释的单细胞RNA测序数据细胞类型注释方法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | PCA, LDA | 基因表达数据 | 22个公共scRNA-seq数据集和35个不同的评估场景 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5267 | 2025-10-06 |
Pan-cancer analysis of acetylcholinesterase (AChE) expression by a data-driven approach: future directions of AChE in cancer neuroscience
2025-Oct-08, Chemico-biological interactions
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.cbi.2025.111647
PMID:40651751
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研究论文 | 通过数据驱动方法对乙酰胆碱酯酶(AChE)进行泛癌分析,揭示其在癌症神经科学中的潜在作用 | 首次从泛癌角度系统分析AChE表达特征,并利用单细胞RNA测序数据预测其在胶质母细胞瘤进展中的功能 | 研究基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证 | 探索AChE表达与癌症发展和预后的相关性 | 多种癌症类型及其配对正常组织 | 生物信息学 | 泛癌分析(包括胰腺癌、胶质母细胞瘤、黑色素瘤等) | 生物信息学分析,单细胞RNA测序 | 生存分析模型 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GTEx数据库的泛癌数据集 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5268 | 2025-10-06 |
The m5C reader Alyref regulates cardiac remodeling post-myocardial infarction by modulating extracellular matrix protein synthesis in cardiac fibroblasts
2025-Oct, Biochimica et biophysica acta. Molecular cell research
DOI:10.1016/j.bbamcr.2025.120011
PMID:40562236
|
研究论文 | 本研究揭示了m5C阅读器Alyref通过调控心脏成纤维细胞外基质蛋白合成影响心肌梗死后心脏重塑的机制 | 首次发现m5C阅读器Alyref在心肌梗死后心脏重塑中的关键作用,并阐明其通过Fbln1/Loxl1通路调控细胞外基质蛋白合成的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和原代细胞实验,尚未在人类临床样本中验证 | 探究m5C修饰在心肌梗死后心脏重塑中的作用机制 | 心肌梗死小鼠模型和缺氧诱导的原代新生小鼠心脏成纤维细胞 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 生物信息学分析、免疫荧光、组织病理学、Western blot、腺相关病毒感染、RNA免疫沉淀测序、单细胞测序 | NA | 测序数据、图像数据、蛋白质印迹数据 | 小鼠心肌梗死模型和原代心脏成纤维细胞 | NA | 单细胞RNA测序,RNA免疫沉淀测序 | NA | NA |
| 5269 | 2025-10-06 |
Current insight into HIV-1 persistence from single-cell transcriptome profiling in acutely treated cohorts of infection
2025-Sep-01, Current opinion in HIV and AIDS
IF:4.5Q1
DOI:10.1097/COH.0000000000000962
PMID:40638066
|
综述 | 本文综述了利用单细胞转录组学技术研究急性HIV-1感染患者中病毒储存库细胞特征的最新进展 | 应用单细胞RNA测序技术揭示HIV-1感染急性期治疗队列中病毒储存库细胞的异质性和分子标记 | NA | 探讨单细胞转录组学在解析HIV-1病毒持久性机制中的应用 | HIV感染者的免疫细胞 | 生物信息学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 数十万个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5270 | 2025-10-06 |
CYBB as a potential therapeutic target through influencing ferroptosis and macrophage in ovarian cancer
2025-Aug-09, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02891-8
PMID:40782134
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和体外实验验证了CYBB基因在卵巢癌中通过调控铁死亡和巨噬细胞极化影响肿瘤进展的关键作用 | 首次揭示CYBB基因在卵巢癌中铁死亡与肿瘤相关巨噬细胞之间的调控关系,并证明其通过影响巨噬细胞极化参与肿瘤微环境调控 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏体内动物模型验证 | 探索铁死亡与肿瘤相关巨噬细胞在卵巢癌进展中的相互作用机制,寻找潜在治疗靶点 | 卵巢癌相关基因、铁死亡相关基因、巨噬细胞 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 生物信息学分析、单细胞测序、体外细胞实验、共培养模型 | NA | 基因表达数据、单细胞测序数据 | 4410个免疫相关卵巢基因和483个铁死亡相关基因 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 5271 | 2025-10-06 |
Single cell approaches define the murine leptomeninges:cortical brain interface as a distinct cellular neighborhood comprised of neural and nonneural cell types
2025-Aug-08, eNeuro
IF:2.7Q3
DOI:10.1523/ENEURO.0046-25.2025
PMID:40780964
|
研究论文 | 本研究通过单细胞技术揭示了小鼠大脑皮层与软脑膜界面由神经和非神经细胞类型组成的独特细胞微环境 | 首次系统性地定义了大脑界面屏障的细胞组成,发现了转录特征独特的PDGFRα阳性软脑膜细胞、边界星形胶质细胞和组织驻留巨噬细胞三种主要细胞类型 | 研究仅限于成年小鼠皮层界面,发育过程中的动态变化和人类中的适用性尚未验证 | 阐明大脑表面与脑膜界面屏障的细胞组成和相互作用机制 | 成年小鼠大脑皮层与软脑膜界面细胞 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞空间转录组学, 形态谱系追踪, 免疫染色 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 形态学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 5272 | 2025-10-06 |
LSGI: interpretable spatial gradient analysis for spatial transcriptomics data
2025-Aug-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03716-1
PMID:40781324
|
研究论文 | 提出用于空间转录组数据的可解释空间梯度分析计算框架LSGI | 开发了首个系统识别空间转录组梯度(STG)的计算框架,能够识别具有显著梯度模式的肿瘤通路 | NA | 分析空间转录组数据中的梯度模式,揭示肿瘤空间异质性 | 肿瘤空间转录组数据集 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间转录组测序 | LSGI计算框架 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5273 | 2025-10-06 |
Combining single-cell and bulk RNA sequencing to identify CAF-related signature for prognostic prediction and treatment response in patients with melanoma
2025-Aug-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-14979-w
PMID:40781483
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研究论文 | 本研究结合单细胞和bulk RNA测序数据,构建了黑色素瘤中癌症相关成纤维细胞(CAF)相关特征用于预后预测和治疗反应评估 | 首次通过整合单细胞和bulk RNA测序数据构建CAF相关特征,能够预测黑色素瘤患者对化疗和免疫治疗的疗效 | 研究样本量有限,需要在更大规模队列中进一步验证 | 构建CAF相关特征用于黑色素瘤患者的预后预测和治疗反应评估 | 黑色素瘤患者 | 生物信息学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, LASSO回归, 免疫组化, 免疫荧光, qPCR | LASSO回归模型 | 基因表达数据 | TCGA数据集和GSE65904验证队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5274 | 2025-10-06 |
Targeting immune microenvironment in cervical cancer: current research and advances
2025-Aug-08, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06896-3
PMID:40781691
|
综述 | 本文全面探讨宫颈癌免疫微环境的组成特征、研究进展及免疫治疗策略 | 整合高分辨率空间图谱和单细胞测序技术揭示肿瘤免疫微环境异质性,系统评估不同疾病阶段和治疗方法的差异 | NA | 通过靶向肿瘤免疫微环境改善宫颈癌患者治疗效果 | 宫颈癌肿瘤免疫微环境 | 肿瘤免疫学 | 宫颈癌 | 空间图谱技术, 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5275 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome profiling reveals blast cell heterogeneity and identifies novel therapeutic target IKZF2 in t(8;21) acute myeloid leukaemia
2025-Aug-08, British journal of haematology
IF:5.1Q1
DOI:10.1111/bjh.70077
PMID:40781784
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示t(8;21)急性髓系白血病中白血病细胞的异质性,并识别IKZF2作为潜在治疗靶点 | 首次在单细胞水平揭示t(8;21)AML的肿瘤内异质性,发现造血干细胞样亚群,并鉴定IKZF2为该亚群的关键调控因子 | NA | 研究t(8;21)急性髓系白血病的细胞异质性和复发机制 | t(8;21)急性髓系白血病患者样本和小鼠模型 | 单细胞生物学 | 急性髓系白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5276 | 2025-10-06 |
Unlocking the secret of glioblastoma multiforme: the role of lactylation in tumor progression, drug resistance and immune microenvironment
2025-Aug-07, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-025-03933-5
PMID:40770332
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研究论文 | 本研究探讨乳酸化修饰在胶质母细胞瘤恶性进展、替莫唑胺耐药和免疫微环境中的作用 | 首次系统研究乳酸化相关基因在GBM中的作用,建立基于TMZ耐药乳酸化相关基因的风险预测模型 | 研究主要基于公共数据库的单细胞数据,需要更多临床样本验证 | 阐明乳酸化修饰在胶质母细胞瘤发生发展中的分子机制 | 胶质母细胞瘤细胞及患者数据 | 生物信息学 | 胶质母细胞瘤 | scRNA-seq, 差异基因表达分析, 体内外实验验证 | 风险预测模型 | 单细胞RNA测序数据 | 公共数据库中的GBM单细胞数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5277 | 2025-10-06 |
Empagliflozin targeted the immune-related gene PIK3CA in type 2 diabetes mellitus treatment: network pharmacology analysis and experimental evidence
2025-Aug-07, Diabetology & metabolic syndrome
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s13098-025-01895-2
PMID:40770763
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研究论文 | 本研究通过网络药理学分析和实验验证探讨恩格列净在2型糖尿病治疗中通过靶向免疫相关基因PIK3CA发挥作用的机制 | 首次发现恩格列净可直接靶向PIK3CA基因并调节PI3K/AKT信号通路,揭示了其在2型糖尿病中的免疫调节新机制 | 研究主要基于细胞实验,缺乏动物模型和临床样本的进一步验证 | 探究恩格列净在2型糖尿病治疗中的免疫相关作用机制 | 2型糖尿病患者基因数据和高糖诱导的RAW264.7巨噬细胞 | 生物信息学与分子生物学 | 2型糖尿病 | 网络药理学分析、分子对接、单细胞RNA测序、qRT-PCR、Western blotting | NA | 基因表达谱、单细胞RNA测序数据、实验数据 | 109个免疫相关差异表达基因,RAW264.7巨噬细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5278 | 2025-10-06 |
Distinct molecular patterns in R6/2 HD mouse brain: Insights from spatiotemporal transcriptomics
2025-Aug-06, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2025.05.014
PMID:40482637
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研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单核RNA测序技术,揭示了亨廷顿病R6/2小鼠大脑中区域特异性、时间依赖性和细胞类型特异性的分子调控通路 | 首次将10x Genomics Visium空间转录组学与匹配的单核RNA测序整合应用于亨廷顿病小鼠模型,揭示了时空动态的基因表达变化和细胞特异性调控通路 | 研究仅限于R6/2小鼠模型,结果可能不完全适用于人类亨廷顿病;样本时间点有限,可能遗漏某些关键发育阶段的动态变化 | 探索亨廷顿病发病机制中的分子调控网络和时空动态变化 | R6/2亨廷顿病小鼠模型的大脑组织(出生后第0天、4周和12周) | 空间转录组学 | 亨廷顿病 | 空间转录组学,单核RNA测序 | NA | 空间基因表达数据,单细胞RNA测序数据 | R6/2小鼠大脑在三个时间点(P0、4周、12周)的分析 | 10x Genomics | 空间转录组学,单核RNA测序 | 10x Visium | 10x Visium空间转录组学平台整合单核RNA测序 |
| 5279 | 2025-10-06 |
Identification and characterization of early human photoreceptor states and cell-state-specific retinoblastoma-related features
2025-Aug-06, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.101918
PMID:40767624
|
研究论文 | 通过全长单细胞RNA测序识别人类光感受器发育状态及视网膜母细胞瘤相关特征 | 首次使用全长scRNA-seq解析光感受器发育轨迹,发现早期视锥前体细胞特异性表达特征与视网膜母细胞瘤发生相关 | 研究主要基于转录组数据,需要进一步功能验证 | 解析人类视锥和视杆细胞发育差异及其与视网膜母细胞瘤发生的关系 | 人类光感受器细胞(视锥和视杆细胞) | 单细胞基因组学 | 视网膜母细胞瘤 | 全长单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | 全长单细胞RNA测序 |
| 5280 | 2025-10-06 |
WGCNA and single-cell analysis reveal ferroptosis-related gene signatures for hepatocellular carcinoma prognosis and therapy
2025-Aug-06, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03335-z
PMID:40767898
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研究论文 | 通过WGCNA和单细胞分析揭示铁死亡相关基因在肝细胞癌预后和治疗中的表达特征 | 首次结合WGCNA和单细胞RNA测序技术系统分析铁死亡相关基因在肝细胞癌中的表达异质性及其临床意义 | 研究基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证 | 研究铁死亡相关基因在肝细胞癌中的表达特征及其与临床预后的关系 | 肝细胞癌患者基因表达数据 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | WGCNA, 单细胞RNA测序, 生存分析, 功能富集分析 | 基因共表达网络分析 | 基因表达数据 | 来自TCGA和GEO数据库的肝细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |