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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5241 | 2025-10-06 |
Natural killer cell as a potential predictive biomarker for early immune checkpoint inhibitor-associated cardiovascular adverse events: a retrospective cohort study
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1556373
PMID:40740863
|
研究论文 | 本研究探讨外周免疫细胞对免疫检查点抑制剂相关心血管不良事件的预测价值 | 首次发现基线NK细胞比例可作为早期免疫检查点抑制剂相关心血管不良事件的潜在预测生物标志物 | 回顾性研究设计,样本量有限,需要更大规模的前瞻性研究验证 | 评估外周免疫细胞在预测早期免疫检查点抑制剂相关心血管不良事件中的价值 | 接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者 | 生物医学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,倾向评分匹配,受试者工作特征曲线分析 | 逻辑回归模型 | 单细胞RNA测序数据,临床数据 | 203名患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5242 | 2025-10-06 |
Multi-Omics Analysis Combined with Machine Learning Identified FABP4 in Smooth Muscle Cells as a Pathogenic Factor in Atherosclerosis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S519114
PMID:40740974
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研究论文 | 本研究通过多组学分析和机器学习方法,识别出平滑肌细胞中的FABP4作为动脉粥样硬化的致病因子 | 首次结合单细胞RNA测序和机器学习技术鉴定出与动脉粥样硬化相关的Scissor+平滑肌细胞亚群,并发现FABP4作为关键致病因子 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,需要进一步体内实验验证 | 探索平滑肌细胞在动脉粥样硬化发病机制中的作用并寻找治疗靶点 | 平滑肌细胞(SMCs),特别是与动脉粥样硬化相关的Scissor+ SMCs亚群 | 生物信息学,机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,机器学习,qRT-PCR,药物预测 | LASSO回归,随机森林,支持向量机 | 基因表达数据,单细胞测序数据 | 475个Scissor+ SMCs和1363个Scissor- SMCs,来自多个公共数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5243 | 2025-10-06 |
High fat diet-induced loss of pituitary plasticity in aging female mice with ablated leptin signaling in somatotropes
2025, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2025.1617109
PMID:40741169
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研究论文 | 本研究探讨高脂饮食对缺乏生长激素细胞瘦素受体的老年雌性小鼠垂体转录组功能的影响 | 首次揭示高脂饮食通过下调翻译调控通路和减少多潜能细胞表达来损害垂体可塑性 | 研究仅限于小鼠模型,未在人类中验证;样本量相对有限 | 研究高脂饮食对缺乏生长激素细胞瘦素受体的老年雌性小鼠垂体功能的影响 | 10月龄缺乏生长激素细胞瘦素受体的雌性小鼠及其同窝对照小鼠 | 单细胞转录组学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序,代谢笼监测,葡萄糖耐量测试 | NA | 单细胞转录组数据,血清激素数据 | 老年雌性突变小鼠和对照小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5244 | 2025-10-06 |
Endothelial Tgfbr2 Deficiency Ameliorate Liver Fibrosis Through Regulating Angiocrine Signalling and Macrophage Accumulation
2025-Sep, Liver international : official journal of the International Association for the Study of the Liver
IF:6.0Q1
DOI:10.1111/liv.70227
PMID:40747899
|
研究论文 | 本研究探讨了肝窦内皮细胞中TGF-β信号通过调节血管分泌信号和巨噬细胞积累在肝纤维化中的作用 | 首次揭示内皮细胞特异性Tgfbr2缺失通过调节血管分泌信号和巨噬细胞趋化改善肝纤维化的机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床转化价值需进一步验证 | 研究肝窦内皮细胞中TGF-β信号在肝纤维化进程中的具体作用机制 | 肝窦内皮细胞、巨噬细胞、肝纤维化小鼠模型 | 单细胞基因组学 | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序, RNA测序, qPCR, western blotting, 流式细胞术 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 组织学图像, 流式细胞数据 | 健康个体和肝硬化患者的单细胞RNA测序数据集, 内皮细胞特异性Tgfbr2敲除小鼠 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 5245 | 2025-10-06 |
Tumor Necrosis Factor Receptor Superfamily Member 12A Enhances Retinal Ganglion Cell Survival and Promotes Axon Regeneration
2025-Aug-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500988RR
PMID:40747811
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析发现Tnfrsf12a/Fn14能增强视网膜神经节细胞存活并促进轴突再生 | 首次发现Tnfrsf12a/Fn14在αRGCs/ipRGCs中富集于轴突再生相关生物过程,并证实其双重神经保护和再生功能 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在更高等哺乳动物验证 | 探索增强视网膜神经节细胞存活和轴突再生的转录通路 | 小鼠视网膜神经节细胞 | 神经科学 | 视神经损伤 | 单细胞RNA测序,AAV病毒载体,免疫染色,电生理记录 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据,电生理数据 | 小鼠视神经损伤模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5246 | 2025-10-06 |
A primer on single-cell RNA-seq analysis using dendritic cells as a case study
2025-Jul, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.15009
PMID:39245787
|
综述 | 本文以树突状细胞为例,为免疫学家提供单细胞RNA测序分析的全面入门指南 | 通过树突状细胞这一典型免疫细胞案例,系统整合单细胞转录组学分析工具与方法,填补了该领域实践指导的空白 | 作为入门指南未涉及高级分析方法,且主要聚焦于树突状细胞这一特定细胞类型 | 为免疫学家提供单细胞转录组学分析的实践指导,促进该技术在免疫学研究中的应用 | 树突状细胞及其亚群 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5247 | 2025-10-06 |
When is prostate cancer really cancer?
2025-Mar-01, Journal of the National Cancer Institute
DOI:10.1093/jnci/djae200
PMID:39350309
|
综述 | 探讨前列腺癌分级组1是否应被归类为癌症的国际研讨会观点总结 | 提出基于空间转录组学证据重新定义前列腺癌诊断标准,挑战传统病理学分类 | 患者在没有癌症诊断情况下是否愿意接受持续监测尚不明确 | 降低前列腺癌死亡率同时减少过度诊断和过度治疗带来的危害 | 前列腺癌分级组1的诊断标准和临床意义 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学 | NA | 组织切片 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5248 | 2025-10-06 |
Generating Neuroimmune Assembloids Using Human Induced Pluripotent Stem Cell (iPSC)-Derived Cortical Organoids and Microglia
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/7651_2024_554
PMID:38976205
|
研究论文 | 开发了一种利用人诱导多能干细胞衍生的皮质类器官和小胶质细胞生成神经免疫组装体的新方法 | 首次将小胶质细胞整合到皮质类器官中形成神经免疫组装体,确保小胶质细胞的长期存活和成熟 | 未明确说明组装体的长期稳定性和功能验证的充分性 | 建立包含免疫细胞的脑类器官模型以研究神经系统疾病 | 人诱导多能干细胞衍生的皮质类器官和小胶质细胞 | 干细胞与类器官技术 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序,免疫染色,冷冻切片 | 类器官模型 | 单细胞转录组数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5249 | 2025-10-06 |
Unveiling the Immune Landscape of Delirium through Single-Cell RNA Sequencing and Machine Learning: Towards Precision Diagnosis and Therapy
2025-Jan, Psychogeriatrics : the official journal of the Japanese Psychogeriatric Society
IF:1.7Q3
DOI:10.1111/psyg.13233
PMID:39814058
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和机器学习揭示谵妄免疫景观,探索PI3K-Akt信号通路基因作为生物标志物的潜力 | 首次结合单细胞RNA测序和机器学习方法系统分析术后谵妄的免疫分子机制 | 样本量相对有限(30例患者和30例对照),需要更大规模研究验证 | 识别术后谵妄的预测和诊断生物标志物 | 术后谵妄患者和健康对照者的外周血样本 | 机器学习 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, RT-qPCR | 六种机器学习模型 | 基因表达数据 | 60个样本(30例患者和30例对照) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 5250 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic profiling uncovers cellular complexity and microenvironment in gastric tumorigenesis associated with Helicobacter pylori
2025-Aug, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2024.10.012
PMID:39414226
|
研究论文 | 通过单细胞转录组测序揭示幽门螺杆菌相关胃肿瘤发生过程中的细胞异质性和微环境特征 | 首次构建了涵盖胃炎、肠上皮化生和胃癌的胃肿瘤发生单细胞图谱,揭示了不同细胞谱系的癌症相关表达特征和细胞间通讯网络 | 样本量相对有限(18例标本),需要在更大队列中验证发现 | 解析幽门螺杆菌驱动的胃肿瘤发生过程中的细胞异质性和分子机制 | 人类胃组织标本(胃炎、胃肠上皮化生和胃癌) | 单细胞组学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,免疫组化,qRT-PCR,生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据,组织学数据,公共数据库数据 | 18例胃组织标本(胃炎、胃肠上皮化生和胃癌),另有人类胃组织验证队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5251 | 2025-10-06 |
Characterization of stem cell landscape and identification of stemness-related gene ENY2 in colorectal cancer by intergrated transcriptomic analysis
2025-Dec, Global medical genetics
IF:1.2Q4
DOI:10.1016/j.gmg.2025.100067
PMID:40735504
|
研究论文 | 通过整合单细胞转录组分析鉴定结直肠癌干细胞景观并发现干细胞相关基因ENY2 | 首次通过整合多组单细胞数据系统描绘结直肠癌干细胞景观,并发现ENY2作为新的干细胞相关生物标志物 | 样本量较小(仅9个原发结直肠癌样本),ENY2在结直肠癌中的研究有限 | 阐明结直肠癌干细胞异质性及其潜在机制 | 结直肠癌患者肿瘤样本 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据,基因表达数据 | 9个原发结直肠癌样本 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 单细胞RNA测序平台 |
| 5252 | 2025-07-31 |
Single-cell transcriptome analysis of in vivo and in vitro human pancreas development
2025-Nov, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2025.101573
PMID:40735693
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5253 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Critical Role of SEC16B in Lung Metastasis of Osteosarcoma
2025-Aug, FASEB bioAdvances
IF:2.5Q3
DOI:10.1096/fba.2024-00161
PMID:40735296
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示SEC16B在骨肉瘤肺转移中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序识别出与骨肉瘤肺转移密切相关的C1肿瘤细胞亚群,并发现SEC16B基因的下调在肺转移中起关键作用 | 样本量相对有限(6个原发肿瘤样本,2个肺转移样本,4个正常骨组织样本) | 探究骨肉瘤肺转移的分子机制并识别关键调控基因 | 骨肉瘤患者组织样本(原发肿瘤、肺转移灶)和正常骨组织 | 单细胞测序分析 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, qRT-PCR, Transwell实验 | hdWGCNA, CytoTRACE, Scissor, CellphoneDB, CSOmap | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | 12个单细胞RNA测序样本(6原发+2转移+4正常)+ 8个批量RNA测序样本(4原发+4转移) | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 5254 | 2025-10-06 |
High cGAS-STING expression associates with improved efficacy of neoadjuvant chemo-immunotherapy in head and neck squamous cell carcinoma
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1584061
PMID:40735041
|
研究论文 | 本研究探讨cGAS-STING表达水平与头颈鳞癌新辅助化疗免疫疗法疗效的关联 | 首次在头颈鳞癌患者中证实cGAS-STING表达与NACI疗效的正相关性,并揭示其通过增强T细胞活化和肿瘤-T细胞相互作用发挥作用的机制 | 样本量较小(38例患者),需更大规模研究验证 | 评估cGAS和STING表达作为头颈鳞癌新辅助化疗免疫疗法疗效预测生物标志物的潜力 | 头颈鳞癌患者 | 癌症免疫学 | 头颈鳞癌 | 免疫组织化学, bulk RNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 单细胞数据 | 38例头颈鳞癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 5255 | 2025-10-06 |
PM2.5 Induces Cell-Specific Transcriptomic Alterations in the Lungs of Juvenile Mice
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S514437
PMID:40735270
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了PM2.5暴露对幼年小鼠肺部不同细胞类型的特异性转录组影响 | 首次在幼年动物模型中系统揭示PM2.5对肺部不同细胞类型的特异性转录调控机制 | 研究仅基于小鼠模型,需在人类样本中进一步验证 | 探究PM2.5对幼年肺部细胞类型特异性分子机制的影响 | 幼年小鼠肺部细胞 | 单细胞生物学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序,基因本体论分析,KEGG通路分析,苏木精-伊红染色 | NA | 单细胞转录组数据,组织病理学图像 | 幼年小鼠肺部细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5256 | 2025-10-06 |
Disulfidptosis-Related Genes as Novel Biomarkers and Therapeutic Targets in Dilated Cardiomyopathy
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S525114
PMID:40735269
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研究论文 | 本研究通过分析扩张型心肌病中双硫死亡相关基因的表达特征,建立了诊断模型并验证了核心基因的病理作用 | 首次将双硫死亡机制与扩张型心肌病关联,发现19个差异表达基因并建立高精度诊断模型 | 研究样本量有限,机制研究仍需进一步深入验证 | 探索双硫死亡相关基因在扩张型心肌病中的生物标志物和治疗靶点价值 | 扩张型心肌病患者和健康对照的基因表达数据,DCM小鼠模型 | 生物信息学 | 扩张型心肌病 | RNA-seq,单细胞RNA-seq,机器学习 | 支持向量机(SVM) | 基因表达数据 | 多个GEO数据集,包含DCM患者和健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5257 | 2025-07-31 |
Editorial: Single-cell sequencing of the immune microenvironment in cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1660831
PMID:40735316
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 5258 | 2025-10-06 |
Targeting the KLF5/PI3K/AKT axis as a therapeutic strategy to overcome neoadjuvant chemoresistance in colorectal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1593639
PMID:40735324
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了KLF5/PI3K/AKT轴在结直肠癌新辅助化疗耐药中的关键作用 | 首次在单细胞水平系统解析结直肠癌化疗耐药机制,并建立KLF5调控网络风险评分模型用于预后预测 | NA | 探索结直肠癌新辅助化疗耐药机制并寻找有效治疗策略 | 结直肠癌患者样本和动物模型 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, InferCNV, 差异表达基因分析, 通路富集分析, 细胞通讯分析, SCENIC, 高通量药物筛选 | 风险评分模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5259 | 2025-10-06 |
An integrated approach for analyzing spatially resolved multi-omics datasets from the same tissue section
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1614288
PMID:40735471
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研究论文 | 开发了一种在相同组织切片上整合空间转录组学和空间蛋白质组学分析的实验与计算框架 | 首次在相同组织切片上实现空间转录组和空间蛋白质组的整合分析,确保组织形态和空间背景的一致性 | 仅在人肺癌样本中进行了验证,尚未在其他疾病类型中测试 | 开发空间多组学整合分析方法,研究肿瘤免疫微环境 | 人肺癌组织样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, H&E染色 | Weave软件 | 空间转录组数据, 空间蛋白质组数据, 图像数据 | NA | NA | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 5260 | 2025-10-06 |
Collection of Growing Bovine Oocytes and Library Preparation for Single-Cell RNA Sequencing
2025, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-4658-8_4
PMID:40736790
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研究论文 | 本文详细介绍了用于单细胞RNA测序分析的生长中牛卵母细胞收集和文库制备的详细实验方案 | 提供了针对牛卵母细胞的单细胞RNA测序标准化实验流程 | NA | 建立牛卵母细胞单细胞RNA测序的实验方法 | 生长中的牛卵母细胞 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |