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当前共找到 10620 篇文献，本页显示第 501 - 520 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 501 | 2026-02-14 |
Tfh2 and a subset of Tfh1 cells associate with antibody-mediated immunity to malaria
2025-Dec-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.196828
PMID:41118256
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和VDJ测序，揭示了人类外周血T滤泡辅助细胞在疟疾感染期间的异质性，并识别出与抗体介导的免疫相关的特定亚群 | 发现pTfh1细胞可进一步分为CCR7+和CCR7-两个亚群，且只有Tfh1-CCR7+和Tfh2细胞与保护性抗体产生正相关，这超越了传统的CXCR3/CCR6分类 | 研究基于受控人类疟疾感染模型，可能无法完全反映自然感染情况；样本量未明确说明，可能影响统计效力 | 探究人类T滤泡辅助细胞在疟疾感染期间的异质性及其与抗体介导免疫的关联 | 健康个体在受控人类疟疾感染前后的外周血T滤泡辅助细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序, VDJ测序 | NA | 单细胞转录组数据, VDJ序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 502 | 2026-02-14 |
Kidney diseases and single-cell sequencing research: a bibliometric analysis from 2015 to 2024
2025-Dec, Renal failure
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/0886022X.2025.2521457
PMID:40545992
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文献计量分析 | 本文对2015年至2024年间使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）进行肾脏疾病研究的出版物进行了文献计量分析 | 首次系统性地通过文献计量学方法评估了scRNA-seq在肾脏疾病研究中的应用格局和新兴趋势，识别了主要贡献国家、机构、作者及研究热点 | 分析基于Web of Science Core Collection数据库，可能未涵盖所有相关出版物；且为回顾性分析，无法预测未来具体技术发展 | 评估scRNA-seq技术在肾脏疾病研究领域的应用现状、发展趋势及研究热点 | 2015年至2024年间发表的关于scRNA-seq在肾脏疾病中应用的学术出版物 | 生物信息学与计算生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 文献元数据 | 1,210篇出版物 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 503 | 2026-02-14 |
Tumoroid model recreates clinically relevant phenotypes of high grade serous ovarian cancer (HGSC) cells, carcinoma associated fibroblasts, and macrophages
2025-Jun-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6614892/v1
PMID:40585272
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研究论文 | 本研究开发了一种包含卵巢癌细胞、间充质干细胞和巨噬细胞的异质三组分肿瘤球模型，用于模拟高级别浆液性卵巢癌的临床相关表型 | 首次构建了包含三种关键细胞成分的异质肿瘤球模型，成功重现了HGSC的化疗耐药、癌症干细胞富集、迁移、侵袭和上皮-间质转化等关键表型 | 模型中使用的是细胞系而非原代肿瘤细胞，且仅包含三种细胞类型，可能无法完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性 | 研究高级别浆液性卵巢癌肿瘤微环境中不同细胞成分的相互作用及其对疾病表型的影响 | 高级别浆液性卵巢癌细胞（OVCAR3、OVCAR4、OVCAR8）、原代间充质干细胞、U937来源的M2样巨噬细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、侵袭实验、迁移实验 | 3D肿瘤球模型 | 基因表达数据、细胞表型数据 | 使用三种卵巢癌细胞系、原代MSCs和U937巨噬细胞构建的肿瘤球模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 504 | 2026-02-14 |
A metabolic-radioimmune signature predicts therapy response and immune reprogramming in non-small cell lung cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1693277
PMID:41306526
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研究论文 | 本研究系统探讨了非小细胞肺癌（NSCLC）中放疗诱导的肿瘤微环境（TME）代谢重塑，并基于放疗抵抗相关代谢基因（RRMGs）建立了一个预测模型，以优化治疗分层和放疗增敏剂发现 | 首次系统整合了NSCLC肿瘤细胞、肿瘤引流淋巴结（TDLNs）的批量转录组数据和肿瘤组织的单细胞RNA-seq数据，利用scFEA算法重建代谢通量图，并识别出7个关键的RRMGs构建预后模型，同时预测并实验验证了新的放疗增敏剂 | 研究主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平或代谢组学的直接验证；模型在独立队列中的验证AUC相对较低（0.618），可能需要更多样本进一步验证；实验验证仅限于细胞水平，缺乏体内模型或临床前研究 | 优化NSCLC的放疗治疗分层，发现新的放疗增敏剂，并理解放疗诱导的代谢重编程如何驱动治疗抵抗 | 非小细胞肺癌（NSCLC）的肿瘤细胞、肿瘤引流淋巴结（TDLNs）和免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq, 批量转录组分析, WGCNA, Cox回归, CIBERSORT, TIDE算法, scFEA算法, qRT-PCR, 蛋白质印迹, 分子对接 | 预后风险模型（基于RRMGs）, 列线图 | 转录组数据, 单细胞RNA-seq数据 | TCGA放疗队列和独立放疗免疫治疗队列的数据，具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 505 | 2026-02-14 |
SLC12A7 serves as a prognostic and immunotherapeutic biomarker identified by multi-omics analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1712579
PMID:41668766
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现SLC12A7在多种癌症中上调，与不良预后相关，并可能作为免疫治疗靶点 | 首次对SLC12A7进行泛癌分析，结合单细胞RNA测序数据揭示其在肿瘤微环境中的异质性，并通过体外实验验证其在肝细胞癌中的促癌功能 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，体外实验仅针对肝细胞癌细胞系，缺乏体内验证和临床样本的直接验证 | 阐明SLC12A7在癌症中的潜在致癌作用，评估其作为预后生物标志物和免疫治疗靶点的价值 | 多种癌症类型，重点关注肝细胞癌（HCC） | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 转录组学分析，单细胞RNA测序，体外功能实验 | NA | 转录组数据，临床数据，单细胞RNA测序数据 | 来自TCGA、GTEx、cBioPortal、TIMER 2.0和GEO数据库的多个癌症数据集，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 506 | 2026-02-14 |
Integrated single-cell and spatial transcriptomics combined with whole-exome sequencing reveal key hub genes and epithelial heterogeneity in bladder cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1748105
PMID:41669266
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组、空间转录组和全外显子组测序数据，揭示了膀胱癌上皮细胞的异质性，并鉴定了与肿瘤突变负荷相关的关键枢纽基因 | 首次整合单细胞RNA-seq、空间转录组和WES数据，结合TMB分析，系统解析膀胱癌上皮细胞亚群，并利用Ro/e算法识别出关键的TMB相关上皮亚群Epi14 | 样本量相对有限（13个单细胞样本，30个WES样本），且为回顾性研究，需要更大规模的前瞻性队列验证 | 阐明膀胱癌上皮细胞的异质性及其在肿瘤发生发展中的作用，并鉴定与肿瘤突变负荷相关的关键基因 | 膀胱癌患者组织样本中的上皮细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA-seq, 全外显子组测序, 空间转录组学, qPCR, Western blot | 随机生存森林, UMAP, Monocle2, CellChat, CytoTRACE, spacexr, PROGENy | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 外显子组测序数据, 批量转录组数据 | 13个单细胞RNA-seq样本, 514个批量转录组样本, 30个WES样本, 共77,263个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 全外显子组测序 | NA | NA |
| 507 | 2025-12-31 |
Bulk and single-cell transcriptome analysis reveal shared key genes and patterns of immune dysregulation in systemic lupus erythematosus and sepsis
2025-Dec-30, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01350-y
PMID:41462079
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 508 | 2026-02-13 |
Spatial transcriptomics and immunophenotyping uncover chronic inflammation-induced immune adaptations favoring dysplasia development in patients at risk of colitis-associated cancer
2025-Nov-08, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjaf184
PMID:41081629
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和免疫表型分析，揭示了慢性炎症诱导的免疫适应如何促进炎症性肠病患者中结肠炎相关癌症的发育 | 结合GeoMx数字空间分析和成像质谱流式技术，首次在组织学未发炎的结肠中识别出代谢和应激反应通路上调，以及CD8+上皮内T细胞减少与癌症风险的关联 | 样本量较小（发现队列11例，验证队列最多18例），且为观察性研究，无法确定因果关系 | 确定慢性炎症诱导的免疫细胞重编程在炎症性肠病患者中促进结肠炎相关癌症发展的机制 | 结肠炎相关癌症患者、散发性结直肠癌患者、有或无发育不良的炎症性肠病患者 | 数字病理学 | 结肠炎相关癌症 | 空间转录组学、成像质谱流式、免疫组织化学、免疫荧光 | NA | 空间转录组数据、成像质谱数据、组织图像 | 发现队列11例（CAC和SCRC患者），验证队列包括CAC患者10例、SCRC患者14例，以及IBD患者有发育不良6例、无发育不良18例 | NA | 空间转录组学, 成像质谱流式 | GeoMx | GeoMx数字空间分析 |
| 509 | 2026-02-13 |
Exploring the regulatory mechanisms of paraptosis-related prognostic genes in gastric cancer using single-cell sequencing and transcriptome analysis
2025-Oct-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-20037-2
PMID:41094022
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和转录组分析，探索了胃癌中类凋亡相关基因的调控机制及其预后价值 | 首次将单细胞RNA测序与TCGA转录组数据结合，系统性地鉴定了胃癌中8个与类凋亡相关的预后基因，并构建了有效的风险预测模型 | 研究主要基于公共数据库的回顾性数据，缺乏前瞻性临床队列验证，且未进行深入的体外或体内功能实验验证 | 探究类凋亡相关基因在胃癌中的功能、预后意义及对肿瘤微环境的影响，为临床预后评估和治疗策略提供新见解 | 胃癌患者 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析 | 回归分析模型，风险预测模型，列线图 | 单细胞RNA测序数据，转录组数据 | 未明确具体样本数量，数据来源于公共数据库（TCGA等） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 510 | 2026-02-13 |
ER-phagy Activation by AMFR Attenuates Cardiac Fibrosis Post-Myocardial Infarction via mTORC1 Pathway
2025-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504552
PMID:40673870
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研究论文 | 本研究探讨了自分泌运动因子受体（AMFR）通过激活内质网选择性自噬（ER-phagy）抑制心肌梗死后心脏纤维化的机制 | 首次揭示了AMFR通过催化FAM134B的K27和K33连接泛素化来增强ER-phagy活性，进而抑制mTORC1通路，从而减轻心脏纤维化 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验，尚未在人类临床样本中进行验证 | 探究ER-phagy在心肌梗死后心脏纤维化中的作用及其调控机制 | 小鼠心脏组织、心脏成纤维细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 511 | 2026-02-13 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Heterogeneity in Differentiation Trajectory and Tumor Microenvironment Leading to More Aggressive Phenotypes of Papillary Thyroid Cancer in Children and Young Adult Patients
2025-Oct, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417672
PMID:40719066
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序揭示了儿童及年轻成人甲状腺乳头状癌的异质性、分化轨迹及肿瘤微环境特征，并指出其更具侵袭性的表型 | 首次在儿童及年轻成人PTC患者中通过单细胞RNA测序系统描绘了肿瘤生态系统异质性，发现其缺乏成人患者中存在的'温和状态'恶性甲状腺细胞群，并揭示了emCAFs_LAMP5在促进肿瘤血管生成和转移中的关键作用 | 样本量相对较小（11例患者），且研究为观察性，需要更大规模队列和功能实验验证 | 阐明儿童及年轻成人甲状腺乳头状癌的肿瘤生态系统异质性及其与临床侵袭性的关系 | 11例儿童及年轻成人甲状腺乳头状癌患者的肿瘤及癌旁组织 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 11例患者（儿童及年轻成人）的肿瘤及癌旁组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 512 | 2026-02-13 |
Crosstalk between the microbiota and intestinal dendritic cells in IBD
2025-Sep-30, Seminars in immunopathology
IF:7.9Q1
DOI:10.1007/s00281-025-01062-9
PMID:41028655
|
综述 | 本文综述了肠道常规树突状细胞（cDCs）在炎症性肠病（IBD）中的功能，以及微生物群对cDC生物学的影响 | 总结了单细胞测序技术如何帮助定义cDCs及其亚群，并探讨了微生物群在IBD背景下对cDC功能的影响 | cDCs在IBD中的确切作用仍不明确，特别是微生物群如何影响其功能 | 理解cDCs在肠道和IBD中的功能，以及微生物群在cDC生物学中的作用，以开发新的IBD治疗策略 | 肠道常规树突状细胞（cDCs）和肠道微生物群 | 自然语言处理 | 炎症性肠病 | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 513 | 2026-02-13 |
Metabolic state uncovers prognosis insights of esophageal squamous cell carcinoma patients
2025-Mar-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06087-0
PMID:40098145
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研究论文 | 本研究首次通过整合代谢物-蛋白质相互作用网络与多尺度转录组学数据，全面绘制了食管鳞状细胞癌微环境的代谢图谱 | 首次在ESCC微环境中全面映射代谢景观，基于代谢状态组成识别了与预后相关的独特亚型 | 研究主要基于转录组数据，缺乏直接的代谢物验证实验 | 探索ESCC微环境中代谢状态与患者预后的关系 | 食管鳞状细胞癌患者样本 | 数字病理学 | 食管鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 64个ESCC样本中的208,659个细胞，以及两个独立队列（n=79和119） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 514 | 2026-02-13 |
A Latent Activated Olfactory Stem Cell State Revealed by Single-Cell Transcriptomic and Epigenomic Profiling
2025-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.26.564041
PMID:37961539
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和表观基因组分析，揭示了嗅觉上皮干细胞在损伤诱导再生过程中的潜在激活状态 | 结合单细胞基因表达和可及染色质谱分析，识别了激活干细胞中的转录异质性，并发现了一组在损伤前就表观遗传学上准备就绪的静息细胞 | NA | 研究嗅觉上皮干细胞在损伤诱导再生过程中的分子机制 | 嗅觉上皮干细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组和表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 515 | 2026-02-12 |
Distinct immune landscapes between murine and human periodontitis
2025-Dec-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.114073
PMID:41659164
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较了人类牙周炎与小鼠结扎模型的免疫景观差异，并评估了Pg补充对模型可转化性的影响 | 首次系统性地比较了人类牙周炎与小鼠结扎模型的单细胞免疫景观，揭示了B/浆细胞和巨噬细胞在比例和激活状态上的显著差异 | Pg补充未能减少小鼠与人类之间的免疫学差异，模型的可转化性有限 | 评估小鼠结扎模型作为人类牙周炎研究模型的适用性 | 人类牙周炎患者和小鼠结扎模型的牙龈组织 | 单细胞组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 小鼠结扎、结扎+Pg和对照组牙龈组织，整合人类数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 516 | 2026-02-12 |
[Expression Characteristics and Prognostic Study of PPP1R13L in Brain Metastases
of Lung Adenocarcinoma]
2025-Nov-20, Zhongguo fei ai za zhi = Chinese journal of lung cancer
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序和临床样本分析，探讨了PPP1R13L基因编码的iASPP蛋白在肺腺癌脑转移组织中的表达特征及其临床意义 | 首次在肺腺癌脑转移的肿瘤微环境中，结合单细胞测序和临床样本，揭示了PPP1R13L作为上调差异基因在特定上皮细胞亚群中的高表达，并发现其阳性细胞与成纤维细胞之间的相互作用通过COL1A1-CD44配体-受体对激活细胞-基质粘附相关通路 | 单细胞测序样本量较小（仅4例肺腺癌脑转移和2例少突胶质细胞瘤组织），且临床样本来自单一医院，可能存在选择偏倚 | 分析肺腺癌脑转移患者的肿瘤微环境特征，并探索PPP1R13L在脑转移组织中的表达及其临床意义 | 肺腺癌脑转移患者的脑组织、临床样本及公共数据库中的肺腺癌和正常肺组织单细胞测序数据 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞测序, 免疫组织化学 | NA | 单细胞测序数据, 临床病理数据, 图像数据 | 单细胞测序：4例肺腺癌脑转移和2例少突胶质细胞瘤组织；临床分析：50例肺腺癌脑转移患者的石蜡切片和临床数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 517 | 2026-02-12 |
Atlas-Guided Discovery of Transcription Factors for T Cell Programming
2025-Nov-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.01.03.522354
PMID:36711632
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研究论文 | 本文通过整合转录组和表观遗传数据，构建了CD8+ T细胞状态的综合图谱，并利用CRISPR筛选与单细胞RNA测序技术，鉴定了调控T细胞分化的关键转录因子 | 开发了一个综合图谱平台，结合了转录和表观遗传数据，并首次通过体内Perturb-seq技术系统性地识别了调控T细胞状态的转录因子，包括新发现的ZSCAN20和JDP2 | 研究主要基于小鼠模型，人类T细胞验证数据有限，且未涵盖所有可能的T细胞状态或疾病环境 | 系统定义驱动CD8+ T细胞不同状态的转录因子，以优化免疫疗法设计 | CD8+ T细胞，特别是终末耗竭T细胞（TEXterm）和组织驻留记忆T细胞（TRM） | 免疫学 | 癌症和慢性感染 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），CRISPR筛选，表观遗传分析 | NA | 转录组数据，表观遗传数据 | 涉及九个CD8+ T细胞状态，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 518 | 2026-02-12 |
Divergence between neural and retinal lineage specification during human brain development by signal transduction
2025-Oct-22, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2025.10.034
PMID:41135878
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研究论文 | 本研究利用基因工程人类胚胎干细胞衍生的脑类器官，探讨了p70 S6激酶1（S6K1）在人类大脑发育中的作用 | 首次在人类脑类器官模型中揭示S6K1信号通路在神经元与视网膜谱系分化中的精细调控作用，并区分了细胞自主与非自主功能 | 研究基于体外类器官模型，可能无法完全模拟体内大脑发育的复杂性 | 阐明S6K1在人类大脑发育过程中的功能机制 | S6K1缺失的人类胚胎干细胞衍生的背侧前脑类器官 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，ATAC测序 | 脑类器官模型 | 基因表达数据，染色质可及性数据 | 早期（5周）和晚期（14周）阶段的脑类器官 | NA | 单细胞RNA-seq，ATAC-seq | NA | NA |
| 519 | 2026-02-12 |
VISTA Uncovers Missing Gene Expression and Spatial-induced Information for Spatial Transcriptomic Data Analysis
2025-Oct-07, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-7564369/v1
PMID:41282090
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研究论文 | 本文介绍了一种名为VISTA的新方法，用于预测空间转录组学数据中未观测基因的表达水平 | VISTA结合变分推理和几何深度学习，联合建模单细胞RNA-seq数据和空间转录组学数据，并引入不确定性量化，以解决空间转录组学技术中基因数量有限的问题 | NA | 旨在通过预测未观测基因的表达，增强空间转录组学数据的分析能力，以更好地理解空间诱导的细胞状态和特征 | 空间转录组学数据和单细胞RNA-seq数据 | 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 变分推理, 几何深度学习 | 基因表达数据 | 四个空间转录组学数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 520 | 2026-02-12 |
Variational inference of single cell time series
2025-Sep-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.29.610389
PMID:39257806
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SNOW的深度学习算法，用于解卷积单细胞时间序列数据，以分离时间依赖和独立成分 | 提出SNOW算法，能够构建有生物学意义的潜在空间、去除批次效应并生成真实的单细胞时间序列 | NA | 解决单细胞RNA测序时间序列数据分析中的挑战，如时间与细胞类型贡献的解卷积、区分真实动态与批次效应 | 单细胞RNA测序时间序列数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |