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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5161 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA-seq Reveals Increased and Activated Post-Capillary Venule Endothelial Cells in Erythrodermic Psoriasis
2025-Aug, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02216-x
PMID:39786459
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了红皮病型银屑病中毛细血管后微静脉内皮细胞显著增加和激活的现象 | 首次在单细胞水平发现红皮病型银屑病中毛细血管后微静脉内皮细胞的异常增加和激活状态 | 样本量相对有限,需要更大规模研究验证 | 探究红皮病型银屑病中血管内皮细胞的病理变化 | 人类和小鼠的红皮病型银屑病皮肤组织样本 | 单细胞组学 | 银屑病 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,流式细胞术 | 轨迹分析 | 单细胞转录组数据,图像数据,流式数据 | 人类患者活检样本和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5162 | 2025-10-06 |
A Functional Variant rs2122031 in ATG7 Is Associated with the Risk of Radiation Pneumonitis
2025-Aug, American journal of respiratory cell and molecular biology
IF:5.9Q1
DOI:10.1165/rcmb.2024-0238OC
PMID:39847703
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研究论文 | 本研究探讨了自噬相关基因ATG7的功能性变异rs2122031与放射性肺炎风险的关联 | 首次发现ATG7基因的功能性变异与放射性肺炎风险相关,并通过多组学方法验证了其分子机制 | 样本量相对有限(301例患者),仅分析了5个自噬相关基因的13个SNP | 研究自噬相关基因遗传变异与放射性肺炎风险的关联 | 接受放疗的301例患者、成纤维细胞和条件性基因敲除小鼠 | 医学遗传学 | 放射性肺炎 | MassArray基因分型、Sanger测序、qRT-PCR、免疫组化、单细胞RNA测序 | Cox风险比例模型 | 基因型数据、临床影像数据、基因表达数据 | 301例患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5163 | 2025-10-06 |
Gene regulatory networks and essential transcription factors for de novo-originated genes
2025-Aug, Nature ecology & evolution
IF:13.9Q1
DOI:10.1038/s41559-025-02747-y
PMID:40659874
|
研究论文 | 本研究通过计算方法和单细胞RNA测序数据识别调控de novo基因表达的关键转录因子 | 首次揭示了转录因子在调控de novo基因表达中的特异性作用,并发现某些转录因子更倾向于调控de novo基因 | 研究主要基于果蝇模型,在哺乳动物中的普适性需要进一步验证 | 探究de novo起源基因的调控网络和关键转录因子 | 果蝇中的de novo基因及其调控机制 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 计算方法, 遗传学工具, 基因组学工具 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5164 | 2025-10-06 |
Resolving the design principles that control post-natal vascular growth and scaling
2025-Jul-16, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2025.101324
PMID:40628258
|
研究论文 | 本研究通过多尺度实验和计算方法揭示了出生后主动脉生长的设计原则 | 发现了主动脉扩张遵循独特的生长原则,包括与血流对齐的两个时空协调的增殖波,以及通过细胞挤出维持稳态尺寸的新机制 | 研究主要关注主动脉,其他器官的生长原则可能不同 | 解析控制出生后血管生长和尺寸缩放的设计原则 | 小鼠主动脉组织 | 计算生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 数学建模 | 数学模型 | 基因表达数据, 细胞增殖数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5165 | 2025-10-06 |
Unveiling the mechanisms of CEBPD-orchestrated TAM polarization through RGS2/PAR2 pathway and its impact on ICB efficacy in clear cell renal cell carcinoma
2025-Jul-13, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010898
PMID:40659446
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研究论文 | 本研究揭示CEBPD通过RGS2/PAR2轴调控透明细胞肾细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞极化并影响免疫检查点阻断剂疗效的机制 | 首次发现CEBPD作为关键转录因子通过RGS2/PAR2轴调控TAM极化状态,并证实其与ICB疗效的关联 | NA | 探索CEBPs在ccRCC免疫微环境中调控TAM极化的机制及其对免疫检查点阻断治疗的影响 | 透明细胞肾细胞癌中的肿瘤相关巨噬细胞 | 肿瘤免疫学 | 肾细胞癌 | 单细胞转录组测序, 蛋白质印迹, 免疫荧光, 体外极化实验, 染色质免疫沉淀测序, 双荧光素酶报告实验, 电泳迁移率变动分析 | NA | 转录组数据, 蛋白质数据, 临床标本数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5166 | 2025-10-06 |
Neuroprotectin D1 and GPR37 protect against chemotherapy-induced peripheral neuropathy and the transition from acute to chronic pain
2025-Jun, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2025.107746
PMID:40287118
|
研究论文 | 本研究揭示了神经保护素D1及其受体GPR37在化疗引起的周围神经病变中对急性疼痛向慢性疼痛转变的保护作用 | 首次发现GPR37在初级感觉神经元中的表达及其在化疗神经病变中防止疼痛慢性化的关键作用,并证实NPD1通过GPR37依赖机制保护感觉神经元 | 研究主要基于动物模型,人类样本验证有限;GPR37在不同细胞类型中的具体作用机制仍需进一步阐明 | 探究NPD1/GPR37信号通路在化疗引起的周围神经病变和疼痛慢性化过程中的保护机制 | 小鼠背根神经节神经元和巨噬细胞,人类背根神经节样本 | 神经科学 | 化疗引起的周围神经病变 | 空间转录组学,基因敲除,原代细胞培养,行为学测试 | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,行为学数据,组织学数据 | 野生型和Gpr37敲除小鼠,人类背根神经节样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5167 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics reveal unique subpopulations of infiltrating macrophages and dendritic cells following AKI
2025-Jun-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00059.2025
PMID:40331777
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了急性肾损伤后肾脏浸润巨噬细胞和树突状细胞的独特亚群特征 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和CITE测序技术,系统揭示了肾脏浸润免疫细胞在缺血性急性肾损伤中的时空动态变化和转录特征 | 研究聚焦于缺血再灌注损伤模型,可能不适用于其他类型的肾损伤 | 阐明急性肾损伤后肾脏浸润巨噬细胞和树突状细胞的时空分布和转录特征 | 肾脏浸润巨噬细胞(KIMs)和肾脏树突状细胞(KDCs) | 单细胞生物学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, CITE测序 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 5168 | 2025-10-06 |
Chevreul: An R Bioconductor Package for Exploratory Analysis of Full-Length Single Cell Sequencing
2025-Jun-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.27.656486
PMID:40501968
|
研究论文 | 介绍Chevreul——一个用于单细胞RNA测序数据处理和可视化的R Bioconductor包及交互式Shiny应用 | 专门支持全长RNA测序数据的分析,包括外显子覆盖度和转录本异构体推断,并提供批处理校正功能 | NA | 开发一个易于使用的单细胞RNA测序数据分析工具 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5169 | 2025-10-06 |
Constructing a cross-tissue human knee single-cell atlas identified osteoarthritis reduces regenerative tissue stem cells while increasing inflammatory pain macrophages
2025-May-05, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6247502/v1
PMID:40386432
|
研究论文 | 构建首个跨组织人类膝关节单细胞图谱,揭示骨关节炎减少再生性组织干细胞同时增加炎症疼痛巨噬细胞 | 首次构建包含关节软骨、半月板、滑膜和软骨下骨的膝关节骨关节炎综合单细胞图谱,发现组织间活跃通讯机制 | NA | 研究骨关节炎的跨组织分子机制和细胞组成变化 | 人类膝关节组织(关节软骨、半月板、滑膜、软骨下骨) | 单细胞组学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5170 | 2025-10-06 |
Multi-omics integrative analysis reveals novel genetic loci and candidate genes for ischemic stroke
2025-Sep-09, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2025.102633
PMID:40777745
|
研究论文 | 通过整合多组学数据识别缺血性脑卒中的新遗传位点和候选基因 | 首次整合三大GWAS数据库进行meta分析,发现124个新的IS相关位点,并开发基于大语言模型的智能助手StrokeGene | 遗传研究的发现需要进一步功能验证,样本来源限于现有数据库 | 探索缺血性脑卒中的遗传基础和新致病机制 | 人类遗传数据和动物模型 | 生物信息学 | 缺血性脑卒中 | GWAS meta分析, eQTL, pQTL, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 共定位分析 | 大语言模型 | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据 | 三大GWAS数据库(GWAS Catalog, MEGASTROKE, Open GWAS)的整合数据 | NA | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析 | NA | NA |
| 5171 | 2025-10-06 |
Multi-omics insights of immune cells in the risk and prognosis of idiopathic membranous nephropathy
2025-Aug-10, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08642-3
PMID:40783650
|
研究论文 | 本研究通过多组学数据分析揭示了CD39调节性T细胞在特发性膜性肾病风险与预后中的关键作用 | 首次通过孟德尔随机化分析确定CD39 Tregs与IMN的因果关系,并构建了107个复合机器学习模型识别MN | 研究样本量有限,需要更大规模验证 | 探究免疫细胞在特发性膜性肾病风险与预后中的作用机制 | 731种免疫细胞表型与特发性膜性肾病患者 | 生物信息学 | 肾脏疾病 | 多组学分析, 孟德尔随机化, 多重免疫荧光染色, 单细胞转录组分析, 流式细胞术 | 机器学习模型 | 基因组数据, 转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5172 | 2025-10-06 |
Mitochondrial metabolic reprogramming in colorectal cancer: mechanisms of resistance and future clinical interventions
2025-Aug-09, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-025-02670-y
PMID:40783392
|
综述 | 探讨结直肠癌中线粒体代谢重编程在治疗抵抗中的作用机制及潜在临床干预策略 | 系统阐述线粒体代谢重编程作为结直肠癌治疗抵抗的核心适应机制,并评估空间转录组学等新技术在个性化治疗中的转化价值 | NA | 分析线粒体代谢重编程导致结直肠癌治疗抵抗的机制并探索临床干预方向 | 结直肠癌细胞及其线粒体代谢机制 | NA | 结直肠癌 | 空间转录组学, 蛋白质组学, 患者来源类器官 | NA | NA | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5173 | 2025-10-06 |
CAR-engineered cytolytic Tregs reverse pulmonary fibrosis and remodel the fibrotic niche with limited CRS
2025-Aug-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.182050
PMID:40627450
|
研究论文 | 本研究开发了靶向FAP1的CAR工程化细胞毒性调节T细胞,用于治疗特发性肺纤维化 | 结合CAR-T细胞的靶向杀伤优势和Treg细胞的免疫抑制功能,首次开发CAR-cTregs治疗肺纤维化 | 研究基于博来霉素诱导的肺纤维化模型,尚未在人体临床试验中验证 | 开发治疗特发性肺纤维化的新型细胞免疫疗法 | FAP1+肺泡成纤维细胞和CAR工程化细胞毒性调节T细胞 | 细胞免疫治疗 | 特发性肺纤维化 | 单细胞转录组测序,CAR-T细胞工程 | NA | 基因表达数据,病理学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5174 | 2025-10-06 |
Regulation of cortical neurogenesis by MED13L via transcriptional priming and its implications for MED13L syndrome
2025-Aug-08, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-08532-8
PMID:40775066
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研究论文 | 本研究通过基因敲除小鼠模型揭示了MED13L通过转录启动调控大脑皮层神经发生的分子机制 | 首次发现MED13L通过结合中介体复合物启动关键发育基因的转录激活,阐明了MED13L综合征的发育机制 | 研究基于小鼠模型,在人类中的直接适用性需要进一步验证 | 探究MED13L综合征的发育和分子机制 | MED13L基因敲除小鼠模型 | 神经发育生物学 | 神经发育障碍 | 单细胞转录组学,免疫荧光,多组学分析 | 基因敲除动物模型 | 基因表达数据,蛋白质定位数据 | MED13L敲除胚胎和成年小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq,多组学分析 | NA | NA |
| 5175 | 2025-10-06 |
A human NK cell progenitor that originates in the thymus and generates KIR+NKG2A- NK cells
2025-Aug-08, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.adv9650
PMID:40779632
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研究论文 | 本研究发现了人类胸腺来源的NK细胞前体细胞,能够生成KIR+NKG2A- NK细胞 | 首次鉴定出胸腺来源的cILC1前体细胞(thyILC1),揭示了胸腺依赖性NK细胞分化途径 | NA | 探索KIR+NKG2A- NK细胞的发育起源和分化途径 | 人类天然杀伤细胞(NK细胞)和先天淋巴样细胞(ILC) | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 包括健康供体和22q11.2缺失综合征患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5176 | 2025-10-06 |
Rapid generation of functional vascular organoids via simultaneous transcription factor activation of endothelial and mural lineages
2025-Aug-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.05.014
PMID:40516530
|
研究论文 | 开发了一种通过同时激活内皮和壁细胞谱系转录因子快速生成功能性血管类器官的方法 | 通过正交激活ETV2和NKX3.1转录因子,实现内皮细胞和壁细胞的高效共分化,5天内生成无需ECM包埋的功能性3D血管类器官 | NA | 建立快速生成功能性血管类器官的平台,用于血管建模、疾病研究和再生细胞治疗 | 诱导多能干细胞(iPSCs)、血管类器官、免疫缺陷小鼠 | 再生医学 | 血管疾病 | 单细胞RNA测序、多西环素诱导系统、修饰RNA系统 | NA | 基因表达数据、成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5177 | 2025-10-06 |
Bacterial ADP-heptose triggers stem cell regeneration in the intestinal epithelium following injury
2025-Aug-07, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2025.06.009
PMID:40651470
|
研究论文 | 本研究揭示了细菌代谢物ADP-庚糖通过ALPK1-TIFA信号通路触发肠道干细胞再生机制 | 首次发现细菌ADP-庚糖通过激活ALPK1-TIFA信号通路诱导肠道损伤后再生干细胞(revSCs)的形成 | ALPK1-TIFA信号通路在生理环境中的具体功能仍需进一步研究 | 探究ALPK1-TIFA信号通路在肠道上皮干细胞再生中的作用机制 | 肠道上皮干细胞、潘氏细胞 | 细胞生物学 | 肠道损伤 | 单细胞转录组测序、谱系追踪 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5178 | 2025-10-06 |
Mendelian randomization analysis of inflammatory biomarkers and hepatocellular carcinoma risk: genetic causality and single-cell transcriptomics
2025-Aug-07, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-03357-7
PMID:40775116
|
研究论文 | 通过孟德尔随机化分析和单细胞转录组学验证炎症生物标志物与肝细胞癌风险的因果关系 | 首次结合孟德尔随机化分析和单细胞转录组学方法系统评估炎症生物标志物与肝细胞癌的因果关系 | 样本量有限(仅4个HCC样本),需要更大规模研究验证 | 探究炎症生物标志物与肝细胞癌风险的因果关系 | 肝细胞癌患者和炎症生物标志物 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 孟德尔随机化分析,单细胞RNA测序 | MR Egger,加权中位数,逆方差加权,加权模式,简单模式 | 遗传数据,单细胞转录组数据 | 4个肝细胞癌样本(BT1306,BT1307,scrSOL004,scrSOL006) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5179 | 2025-10-06 |
Integrative multi-omics reveals a regulatory and exhausted T-cell landscape in CLL and identifies galectin-9 as an immunotherapy target
2025-Aug-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61822-x
PMID:40775219
|
研究论文 | 通过整合多组学分析揭示慢性淋巴细胞白血病中T细胞的调控和耗竭状态,并鉴定galectin-9作为免疫治疗靶点 | 首次整合单细胞RNA测序、质谱流式细胞术和组织成像技术,系统揭示CLL淋巴结中T细胞的独特特征,并发现galectin-9作为新的免疫治疗靶点 | 研究样本来源有限,主要基于患者样本和小鼠模型,需要进一步临床验证 | 探索慢性淋巴细胞白血病中T细胞耗竭的机制并寻找免疫治疗新靶点 | CLL患者的血液、骨髓和淋巴结T细胞,以及CLL小鼠模型 | 单细胞多组学 | 慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术, 组织成像, T细胞受体测序 | predicTCR分类器 | 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据, 组织图像数据 | CLL患者多个组织部位样本及小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 质谱流式细胞术, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5180 | 2025-10-06 |
Multi-omics data reveal that SAA1 + fibroblasts exacerbate periodontitis by regulating macrophage inflammation and chemotaxis
2025-Aug-07, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06925-1
PMID:40775345
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研究论文 | 本研究通过多组学技术揭示了SAA1+成纤维细胞通过调节巨噬细胞炎症和趋化作用加剧牙周炎的机制 | 首次系统鉴定SAA1+成纤维细胞亚群在牙周炎中的关键作用,阐明其通过分泌趋化因子介导巨噬细胞浸润并促进炎症的新机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系实验,在人类临床样本中的验证仍需进一步开展 | 探究牙周微环境中细胞间相互作用的调控网络,寻找牙周炎治疗新靶点 | 牙周组织细胞、小鼠牙周炎模型、L929细胞、RAW264.7巨噬细胞 | 单细胞组学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量转录组测序, 生物信息学分析, 动物实验, 细胞共培养 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 批量转录组数据 | 65,979个牙周组织细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |