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当前共找到 10538 篇文献，本页显示第 5141 - 5160 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5141 | 2025-10-05 |
Molecular characterization and functional prioritization of CD46, IL6R, KLRC1, LEAP2 and SMOX as candidate targets in acute kidney injury
2025-Aug, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.146096
PMID:40683494
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研究论文 | 通过多组学整合框架鉴定并验证急性肾损伤的候选治疗靶点 | 建立遗传信息指导的多组学整合框架，系统筛选具有治疗潜力的候选靶点，并结合计算药物重定位和实验验证 | NA | 识别和验证急性肾损伤的潜在治疗靶点 | CD46、IL6R、KLRC1、LEAP2和SMOX基因及其编码蛋白 | 生物信息学 | 急性肾损伤 | 多组学整合分析、bulk RNA测序、单细胞RNA测序、计算机药物重定位 | NA | 基因组数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 5142 | 2025-10-05 |
Computational methods for alternative polyadenylation and splicing in post-transcriptional gene regulation
2025-Aug, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-025-01496-z
PMID:40804481
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综述 | 全面概述选择性多聚腺苷酸化和选择性剪接的计算分析方法及其在转录后基因调控中的作用 | 系统总结了单细胞RNA测序专用的APA和AS分析技术，提供了从群体到单细胞水平的基因调控新见解 | 作为综述文章，主要总结现有方法而非提出新算法，依赖已有文献的覆盖范围 | 探讨选择性多聚腺苷酸化和选择性剪接在转录后基因调控中的计算分析方法 | 基因转录本和调控机制 | 生物信息学 | NA | RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5143 | 2025-10-05 |
Single-cell analysis unveils immune dysregulation and EBV-driven lymphoproliferative disorder in pediatric liver transplant recipients
2025-Jul, Human immunology
IF:3.1Q3
DOI:10.1016/j.humimm.2025.111309
PMID:40263002
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示小儿肝移植受者中EB病毒驱动的淋巴增殖性疾病的免疫失调机制 | 首次在单细胞水平系统描绘PTLD患者的免疫微环境特征，揭示EBV感染特异性靶向记忆B细胞和浆细胞的机制 | 样本量有限，未涉及组织样本分析，未能验证功能性恢复策略 | 阐明小儿肝移植后EBV相关淋巴增殖性疾病的免疫病理机制 | 小儿肝移植受者外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 淋巴增殖性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 四组人群：EBV阳性PTLD患者、EBV阳性非PTLD移植受者、EBV阴性移植受者、健康儿童 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5144 | 2025-10-05 |
A survey of biclustering and clustering methods in clustering different types of single-cell RNA sequencing data
2025-Jan-15, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elaf010
PMID:40795763
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综述 | 本文系统综述了双聚类和聚类方法在不同类型单细胞RNA测序数据分析中的应用与性能比较 | 首次系统评估5种双聚类和21种聚类方法在10个真实scRNA-seq数据集上的性能，并从六个维度量化数据集特性以推荐最适合的方法 | 仅评估了有限数量的方法（5种双聚类和21种聚类），且仅使用10个公开数据集，可能无法覆盖所有场景 | 评估当前无监督方法在单细胞RNA测序数据分析中的发展现状，总结各方法的优缺点和改进策略 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 双聚类方法, 聚类方法 | 基因表达数据 | 10个公开真实数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5145 | 2025-10-05 |
Discovery of Multiple Effects of Reactive Oxygen Species on Lung Adenocarcinoma at the Single-cell and Bulk Tissue Levels
2025, Current medicinal chemistry
IF:3.5Q2
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研究论文 | 本研究在单细胞和批量组织水平上探讨了活性氧对肺腺癌的影响机制 | 首次在单细胞和批量组织水平系统分析ROS对LUAD的多重影响，并开发了ROS相关基因特征 | 未明确说明样本来源和具体样本量 | 探究ROS在肺腺癌发展和治疗中的作用机制 | 肺腺癌组织和细胞 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序，批量转录组测序 | LASSO回归，逐步多元回归 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5146 | 2025-10-05 |
Enhancing Single-Cell RNA-Seq Data Completeness With a Graph Learning Framework
2025 Jan-Feb, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2024.3492384
PMID:39504287
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研究论文 | 提出基于变分图自编码器的单细胞RNA测序数据插补方法VAImpute，用于检测和填补dropout事件 | 利用细胞/基因间的copula相关性构建图网络，通过变分图自编码器学习数据固有分布来预测dropout事件 | NA | 提高单细胞RNA测序数据的完整性，减少dropout事件的影响 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分图自编码器 | 基因表达矩阵 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5147 | 2025-10-05 |
RORα-activated mitophagy attenuating hypoxic-ischemic encephalopathy via suppression of microglial cGAS-STING axis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1592737
PMID:40799648
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研究论文 | 本研究揭示RORα通过激活线粒体自噬抑制小胶质细胞cGAS-STING轴，从而减轻缺氧缺血性脑病的神经炎症 | 首次发现RORα通过调控线粒体自噬抑制mtDNA-cGAS-STING-NLRP3信号通路的新机制 | 研究主要基于动物模型，尚未在人类临床样本中验证 | 探究RORα在缺氧缺血性脑病中调控小胶质细胞神经炎症的分子机制 | HIE大鼠模型和体外培养的小胶质细胞 | 神经科学 | 缺氧缺血性脑病 | 单细胞RNA测序, WGCNA, LASSO回归, RT-qPCR, Western Blot, ELISA | 动物疾病模型, 细胞模型 | 基因表达数据, 蛋白质数据, 行为学数据 | HIE大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5148 | 2025-10-05 |
Resolving the spatial and cellular architecture of intra-tumor heterogeneity by multi-region dissection of lung adenocarcinoma
2025-Sep, Journal of genetics and genomics = Yi chuan xue bao
DOI:10.1016/j.jgg.2025.02.006
PMID:39993622
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研究论文 | 通过多区域肺腺癌活检样本的空间转录组学和单细胞RNA测序分析，揭示肿瘤内异质性的空间和细胞结构 | 首次系统描绘肺腺癌不同区域（核心、边缘、正常区域）中癌细胞亚群的空间分布特征及其与免疫细胞的共定位关系 | 研究样本数量有限，仅基于活检样本分析，未进行功能验证实验 | 解析肺腺癌肿瘤内异质性的空间结构和细胞组成 | 肺腺癌患者的多区域活检样本（肿瘤核心、肿瘤边缘、正常区域） | 数字病理学 | 肺癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 多区域肺腺癌活检样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5149 | 2025-10-05 |
Dissecting key contributions of TH2 and TH17 cytokines to atopic dermatitis pathophysiology
2025-Sep, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.05.007
PMID:40409379
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研究论文 | 本研究通过细胞模型揭示TH2和IL-22细胞因子在特应性皮炎病理机制中的关键作用 | 首次系统比较TH2、TH17和TH22细胞因子对表皮表型的特异性影响，并发现TH2+IL-22组合最能模拟AD病理特征 | 研究基于体外细胞模型，可能与体内真实环境存在差异 | 解析特应性皮炎相关细胞因子如何驱动特异性表皮疾病标志 | 原代和永生化角质形成细胞来源的人表皮等效物 | 皮肤生物学 | 特应性皮炎 | 单细胞空间转录组学，转录组分析 | 细胞刺激模型 | 转录组数据，形态学数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞空间转录组学 | NA | NA |
| 5150 | 2025-10-05 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomic Profiling of Penile Squamous Cell Carcinoma Reveals Dynamics of Tumor Differentiation and Immune Microenvironment
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202500216
PMID:40470730
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组技术揭示阴茎鳞状细胞癌的肿瘤分化动态和免疫微环境特征 | 首次结合单核RNA测序和高分辨率空间转录组学解析PSCC的发育轨迹和肿瘤微环境，发现独立于HPV感染状态的肿瘤分化模式及具有干细胞特征的Tum_1亚型 | 研究样本量有限，主要聚焦于PSCC，部分结论需要其他鳞状细胞癌类型的进一步验证 | 探究阴茎鳞状细胞癌的发育轨迹和肿瘤微环境特征 | 阴茎鳞状细胞癌组织样本 | 数字病理学 | 阴茎癌 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5151 | 2025-10-05 |
Single-Cell RNA Sequencing Delineates Renal Anti-Fibrotic Mechanisms Mediated by TRPC6 Inhibition
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202501175
PMID:40525246
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示TRPC6抑制介导的肾脏抗纤维化机制 | 首次通过单细胞RNA测序定义了TRPC6抑制剂SH045处理的肾脏保护性细胞组成和细胞类型特异性转录程序，并发现新型内皮细胞亚群ECRIN | 研究主要基于小鼠模型和有限的患者样本，临床转化需要进一步验证 | 探究TRPC6抑制在慢性肾脏病中的抗纤维化机制 | 小鼠单侧输尿管梗阻模型、慢性缺血再灌注损伤模型及慢性肾脏病患者肾脏样本 | 单细胞组学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, Western blot | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质数据 | 小鼠疾病模型和慢性肾脏病患者肾脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5152 | 2025-10-05 |
NDRG1-Driven Lactate Accumulation Promotes Lung Adenocarcinoma Progression Through the Induction of an Immunosuppressive Microenvironment
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202501238
PMID:40539245
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研究论文 | 本研究揭示了NDRG1通过稳定LDHA促进乳酸积累，诱导免疫抑制微环境从而推动肺腺癌进展的机制 | 首次发现NDRG1通过抑制LDHA泛素化稳定其表达，促进乳酸积累和组蛋白H3K18乳酸化，驱动免疫抑制微环境形成 | 样本量相对有限，需要更多临床验证 | 探究NDRG1在肺腺癌免疫抑制微环境形成中的作用机制 | 肺腺癌患者样本和临床数据 | 癌症生物学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析, 临床数据分析 | NA | 基因表达数据, 临床数据, 测序数据 | 30个LUAD样本（单细胞RNA测序），29,863例患者和55,586例对照（GWAS），220例LUAD患者（临床数据） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5153 | 2025-10-05 |
Metabolic Stress-Induced Choline Kinase α (CHKA) Activation in Endothelial Subpopulation Contributes to Diabetes-Associated Microvascular Dysfunction
2025-Sep, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202417045
PMID:40548950
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研究论文 | 本研究探讨代谢应激诱导的胆碱激酶α在特定内皮细胞亚群中的激活对糖尿病相关微血管功能障碍的贡献机制 | 首次通过单细胞RNA测序鉴定视网膜血管中三个不同的内皮细胞亚群，发现CHKA高表达亚群与血管生成活性增强相关，并揭示CHKA通过NAD-SIRT1-Notch信号通路调控内皮功能障碍的新机制 | NA | 阐明糖尿病微血管功能障碍的分子机制 | 内皮细胞亚群、糖尿病小鼠模型、临床样本 | 单细胞生物学 | 糖尿病微血管并发症 | 单细胞RNA测序、基因沉默、孟德尔随机化研究 | NA | 单细胞转录组数据、临床数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5154 | 2025-10-05 |
Spatial colocalization and molecular crosstalk of myofibroblastic CAFs and tumor cells shape lymph node metastasis in oral squamous cell carcinoma
2025-Sep, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011791
PMID:40906645
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据揭示了肌成纤维性癌症相关成纤维细胞与口腔鳞癌细胞的共定位及分子互作在淋巴结转移中的关键作用 | 首次发现myCAFs与OSCC细胞在侵袭前沿的空间共定位形成促进淋巴结转移的微环境，并鉴定出由ECM-CD44轴介导的分子互作机制 | 研究样本量相对有限，机制验证主要依赖体外实验和公共数据 | 探究口腔鳞癌淋巴结转移的分子机制 | 口腔鳞癌患者组织样本和细胞系 | 数字病理学 | 口腔鳞癌 | 单细胞转录组测序, 空间转录组分析, 免疫组织化学, 体外共培养 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 90例侵袭前沿样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 5155 | 2025-10-05 |
DISCO: A DIFFUSION MODEL FOR SPATIAL TRANSCRIPTOMICS DATA COMPLETION
2025-Sep, Proceedings. International Conference on Image Processing
DOI:10.1109/icip55913.2025.11084277
PMID:40909878
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研究论文 | 提出一种基于扩散模型的空间转录组数据补全框架DISCO | 首次将扩散模型应用于空间转录组数据补全，结合图神经网络编码器和双重扩散模块 | 未明确说明模型在极端数据缺失情况下的性能限制 | 解决空间转录组数据中大规模缺失区域的问题 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 扩散模型, 图神经网络 | 扩散模型, GNN | 空间基因表达数据 | 多个测序平台、物种和数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5156 | 2025-10-05 |
Spatial Transcriptomics and Single Cell-RNASeq Reveals Cellular Heterogeneity of SARS-CoV-2 in Lung Tissues and Global Mutational Patterns in COVID-19 Patients
2025-Sep, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70586
PMID:40910395
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，揭示了COVID-19患者肺组织中SARS-CoV-2的细胞异质性及全球突变模式 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，在空间维度上定位SARS-CoV-2病毒基因表达热点区域，并关联免疫细胞浸润模式 | 研究样本来源地域有限，突变分析主要基于GISAID数据库的公开数据 | 解析COVID-19患者肺组织中SARS-CoV-2的细胞异质性特征和病毒突变模式 | COVID-19患者的肺组织样本和GISAID数据库中的SARS-CoV-2序列数据 | 空间转录组学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 生物信息学分析 | Seurat, Pseudotime分析, CellChat分析 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 基因组序列数据 | 未明确样本数量，包含轻度和重度COVID-19患者肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5157 | 2025-10-05 |
Identification of Core gene expression alterations regulated by gut microbiota in tumor progression and immunotherapy resistance through integrative pan-cancer analysis
2025-Sep, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.146911
PMID:40819753
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研究论文 | 通过整合性泛癌分析识别肠道微生物在肿瘤进展和免疫治疗耐药中调控的核心基因表达变化 | 开发了微生物相关特征评分方法，首次在33种癌症类型和29种正常组织中系统性量化肠道微生物驱动的转录改变 | 研究主要基于计算分析方法，实验验证相对有限 | 阐明肠道微生物在肝细胞癌进展中的具体作用机制及其下游靶点 | 33种癌症类型和29种正常组织，重点研究肝细胞癌 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞分析，空间转录组学，机器学习 | 机器学习算法 | 基因表达数据，单细胞数据，空间转录组数据 | 33种癌症类型和29种正常组织 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 5158 | 2025-10-05 |
Integrative spatial multi-omics identifies the TEK receptor tyrosine kinase as a central biomacromolecule of endothelial-immune interactions in glioblastoma
2025-Sep, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.146964
PMID:40834945
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研究论文 | 本研究通过整合空间多组学分析发现TEK受体酪氨酸激酶是胶质母细胞瘤中内皮-免疫相互作用的核心生物大分子 | 首次通过整合空间多组学方法系统揭示TEK在胶质母细胞瘤微环境中的核心作用，并发现其作为可药物化靶点的潜力 | 研究主要基于体外实验和计算模拟，需要进一步的体内实验验证 | 探索胶质母细胞瘤微环境中血管-免疫轴的关键调控分子 | 胶质母细胞瘤微环境中的内皮细胞、恶性细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,全基因组关联研究,结构基药物筛选,分子对接,分子动力学模拟 | NA | 基因组数据,转录组数据,空间转录组数据,蛋白质结构数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 5159 | 2025-10-05 |
Steatohepatitis alters lymphocytes cytotoxicity and localization, accelerating colorectal liver metastases
2025-Aug-28, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2025.101222
PMID:40882404
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研究论文 | 本研究探讨脂肪性肝炎如何通过改变淋巴细胞毒性和定位来加速结直肠癌肝转移 | 首次揭示MASH通过改变CD8+T细胞和NK细胞的定位与功能，而非单纯数量变化，来促进肝转移的新机制 | 研究基于小鼠模型，需要人类样本验证；未详细探讨其他免疫细胞亚群的作用 | 阐明MAFLD中代谢应激引起的肝脏免疫细胞变化及其对结直肠癌肝转移早期阶段的影响 | 小鼠模型中的肝脏免疫细胞和MC38癌细胞 | 免疫肿瘤学 | 结直肠癌肝转移 | 单细胞RNA测序，RT-PCR，免疫组织化学 | NA | 基因表达数据，组织图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5160 | 2025-10-05 |
Nitrogen-Driven Orchestration of Lateral Root Development: Molecular Mechanisms and Systemic Integration
2025-Aug-21, Biology
DOI:10.3390/biology14081099
PMID:40906392
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综述 | 本文系统综述了氮素如何通过分子机制调控植物侧根发育过程及其系统整合 | 整合了单细胞转录组学和先进成像技术揭示的侧根对氮素响应的细胞异质性，强调了氮素作为主调节器通过分子枢纽同步营养感应与根形态发生的动态重编程机制 | 作为综述文章，主要整合现有研究而非提出新的实验证据 | 阐明氮素感知、信号传导及其与侧根发育途径整合的分子机制，旨在提高作物氮素利用效率 | 植物侧根发育过程，包括起始、原基形成、出现和伸长 | 植物分子生物学 | NA | 单细胞转录组学，先进成像技术 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |