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当前共找到 10572 篇文献，本页显示第 5081 - 5100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5081 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA profiling of colorectal granular-type laterally spreading tumor uncovers progression trajectory toward carcinoma and transcriptional signatures favoring lateral morphogenesis
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1552841
PMID:41018078
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究结直肠颗粒型侧向发育型肿瘤的转录特征及其向癌变的进展轨迹 | 首次在单细胞水平揭示LST-Gs的化生分化特征及其与肿瘤进展的关联，发现Arp2/3复合物在高度分化细胞中的显著上调 | 样本量有限，研究主要关注转录组层面，缺乏功能性验证实验 | 阐明结直肠颗粒型侧向发育型肿瘤的形态发生机制和向癌发展的进化轨迹 | 结直肠颗粒型侧向发育型肿瘤、突起型腺瘤和正常黏膜组织 | 单细胞测序 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5082 | 2025-10-05 |
Predicting the prognosis of hepatocellular carcinoma based on genes related to polyamine metabolism
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.19985
PMID:41018906
|
研究论文 | 基于多胺代谢相关基因构建肝细胞癌预后预测模型 | 首次基于多胺代谢相关基因对肝细胞癌进行分子分型并构建预后预测模型 | 研究主要基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 开发肝细胞癌预后预测模型并探索潜在治疗靶点 | 肝细胞癌患者和HuH-7细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, CCK8实验, 伤口愈合实验, Transwell实验 | Cox回归, Lasso回归, 列线图 | 基因表达数据, 临床数据 | 公共数据库中的肝细胞癌样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5083 | 2025-10-05 |
Characterization of cancer-related fibroblasts in bladder cancer and construction of CAFs-based bladder cancer classification: insights from single-cell and multi-omics analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1580986
PMID:41019085
|
研究论文 | 通过单细胞和多组学分析表征膀胱癌中癌症相关成纤维细胞并构建基于CAFs的膀胱癌分类 | 首次系统鉴定膀胱癌中10个不同的CAF亚群，并建立基于pCAFs的膀胱癌分子分型系统 | 样本量有限，需要进一步实验验证各亚型的临床适用性 | 探索膀胱癌中癌症相关成纤维细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的作用 | 膀胱癌组织和其中的癌症相关成纤维细胞 | 生物信息学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 机器学习算法 | 机器学习算法 | 单细胞RNA测序数据, 批量RNA测序数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 5084 | 2025-10-05 |
PLK2 as a key regulator of glycolysis and immune dysregulation in polycystic ovary syndrome
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1610713
PMID:41019094
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和批量RNA测序分析，发现PLK2是多囊卵巢综合征中糖酵解和免疫失调的关键调控因子 | 首次将PLK2确立为PCOS中内皮细胞糖酵解的核心调控基因，并揭示其通过NF-κB和IL-17信号通路促进慢性炎症和卵巢纤维化的机制 | 研究主要基于动物模型和生物信息学分析，需要进一步临床验证 | 阐明多囊卵巢综合征中卵巢基质细胞糖酵解失调的分子机制 | 多囊卵巢综合征患者和DHEA诱导的PCOS大鼠模型 | 生物信息学 | 多囊卵巢综合征 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫浸润分析, 功能富集分析 | Seurat, CellChat, CIBERSORT, ESTIMATE, ssGSEA | 基因表达数据 | 三个独立的批量RNA-seq数据集和DHEA诱导的PCOS大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 5085 | 2025-10-05 |
A splicing-based multitissue association study of joint transcriptomes identified susceptibility genes for osteoarthritis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1590008
PMID:41019096
|
研究论文 | 通过跨组织和单组织转录组关联分析结合单细胞测序技术，鉴定骨关节炎易感基因LTBP1及其在软骨细胞分化中的调控作用 | 首次整合跨组织/单组织TWAS分析与单细胞测序数据，系统揭示LTBP1基因通过TGF-β和Notch信号通路参与骨关节炎发病的新机制 | 未明确说明样本规模及具体测序平台技术细节 | 鉴定骨关节炎的易感基因并阐明其功能机制 | 骨关节炎相关遗传位点及LTBP1基因 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 单细胞测序, 转录组关联分析(TWAS), 全基因组关联研究(GWAS) | UTMOST, FUSION, MAGMA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5086 | 2025-10-05 |
Spatial and single-cell transcriptomics capture two distinct cell states in soybean defense response to Phakopsora pachyrhizi infection
2025, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2025.1637176
PMID:41019740
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研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组技术揭示大豆对亚洲大豆锈病病原体感染的两种不同细胞状态及其空间分布模式 | 首次结合空间转录组和单核转录组技术揭示植物免疫反应的空间协调性，发现感染区域与周边区域存在不同的防御反应状态 | 仅针对大豆-Phakopsora pachyrhizi互作系统，其他植物-病原体系统的普适性有待验证 | 解析植物对病原体感染的空间防御反应机制 | 大豆植株及其对Phakopsora pachyrhizi病原体感染的响应 | 植物生物学 | 植物病害 | 空间转录组学, 单核RNA测序, 基因共表达网络分析 | NA | 空间转录组数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5087 | 2025-10-05 |
Dissecting and validation the biomarker of heart failure progression in patients with atherosclerosis by single-cell sequencing, bioinformatics, and machine learning
2025, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2025.1587274
PMID:41019764
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和转录组数据，结合机器学习方法鉴定动脉粥样硬化向心力衰竭进展的早期生物标志物 | 首次整合单细胞RNA测序和批量转录组数据，结合三种机器学习算法鉴定CD48作为AS向HF进展的潜在生物标志物 | 研究基于公共数据库数据，需要实验验证；样本来源和数量有限 | 识别动脉粥样硬化向心力衰竭进展的早期生物标志物及潜在机制 | 动脉粥样硬化患者向心力衰竭进展的转录组数据 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 转录组分析, 机器学习 | LASSO, Random Forest, SVM-RFE | 基因表达数据 | 多个GEO数据集(GSE28829, GSE57345等)，包含2828个心脏相关基因 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 人类细胞图谱(HCL)平台 |
| 5088 | 2025-10-06 |
Decoding chicken growth regulation through multi-omics insights and emerging genetic tools for growth optimization
2025-Oct, Poultry science
IF:3.8Q1
DOI:10.1016/j.psj.2025.105542
PMID:40652768
|
综述 | 本文综述了鸡生长性状的遗传调控机制，整合多组学方法和新兴基因工具以优化生长性能 | 强调单细胞RNA测序在解析生长相关组织细胞异质性中的应用，结合CRISPR/Cas9基因组编辑技术开辟精准育种新途径 | 现有遗传变异发现对可持续高效家禽生产的应用仍有限制 | 阐明鸡生长性状的遗传调控网络，推动精准育种策略开发 | 鸡的生长性状（体重和生长）及其遗传调控机制 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序, CRISPR/Cas9基因组编辑, 多组学分析（基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学） | NA | 基因组数据, 转录组数据, 蛋白质组数据, 代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 基因组测序 | NA | NA |
| 5089 | 2025-10-06 |
Single cell RNA-sequencing reveals no evidence for meiotic sex chromosome inactivation in the threespine stickleback fish
2025-Sep-29, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1011875
PMID:41021609
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究三刺棘鱼减数分裂过程中性染色体基因表达模式 | 首次在三刺棘鱼中发现缺乏减数分裂性染色体失活现象，挑战了该过程在硬骨鱼类中的保守性假设 | 研究仅针对单一物种，需要更多硬骨鱼类研究验证结论的普适性 | 探究三刺棘鱼减数分裂过程中性染色体失活现象的存在与否 | 三刺棘鱼(Gasterosteus aculeatus)的性染色体(X和Y染色体) | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序，免疫荧光 | NA | 基因表达数据，图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5090 | 2025-10-06 |
Hypothesis-generating evaluation of multi-armoured oncolytic HSV-1 (VG161) in intrahepatic cholangiocarcinoma: pooled insights from multicentre studies
2025-Sep-29, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-335904
PMID:41022576
|
研究论文 | 评估多效溶瘤病毒VG161在肝内胆管癌中的安全性和疗效，并探索其免疫机制 | 首次报道表达IL-12、IL-15和PD-L1拮抗剂的多效溶瘤HSV-1病毒VG161在ICC中的临床数据，通过多组学分析揭示免疫微环境重塑机制 | 样本量较小（24例患者），需要更大规模试验验证结果 | 探索VG161溶瘤病毒在晚期肝内胆管癌患者中的安全性、疗效和免疫机制 | 晚期肝内胆管癌患者 | 肿瘤免疫治疗 | 肝内胆管癌 | 单细胞转录组学、空间转录组学、多组学分析 | NA | 临床数据、肿瘤活检样本、转录组数据 | 24例晚期ICC患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 5091 | 2025-10-06 |
Distinct cell state ecosystems for nodular lymphocyte-predominant Hodgkin lymphoma
2025-Sep-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63339-9
PMID:41006203
|
研究论文 | 本研究开发了NLPHL特异性淋巴细胞优势生态型模型，识别出34种不同细胞状态并建立临床相关生物学分类 | 首次建立NLPHL特异性淋巴细胞优势生态型模型，识别出3种不同的免疫微环境生态型及其临床预后意义 | NLPHL为罕见癌症，样本量相对有限（总171例） | 深入研究结节性淋巴细胞为主型霍奇金淋巴瘤的免疫微环境和罕见淋巴细胞优势细胞 | 171例NLPHL患者样本中的淋巴细胞优势细胞和免疫微环境细胞 | 数字病理学 | 霍奇金淋巴瘤 | 空间转录组学 | LPE生态型模型 | 转录组数据、蛋白质表达数据 | 训练队列109例（65% LPE1/2），验证队列62例（61% LPE1/2），总计171例NLPHL样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 5092 | 2025-10-06 |
Spatially-restricted inflammation-induced senescent-like glia in multiple sclerosis and patient-derived organoids
2025-Sep-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63371-9
PMID:41006208
|
研究论文 | 本研究探讨多发性硬化症中慢性炎症与细胞衰老的关系，发现病变区域存在衰老样胶质细胞积累 | 首次通过单细胞转录组和空间转录组技术揭示MS病变中衰老样胶质细胞的空间分布特征，并利用患者来源的类器官模型验证小胶质细胞对炎症诱导衰老的特殊敏感性 | 样本数量有限，类器官模型可能无法完全模拟体内复杂环境 | 探究多发性硬化症中慢性炎症与细胞衰老的关联及其对疾病进展的影响 | 多发性硬化症患者脑组织样本和hiPSC来源的神经类器官 | 神经科学 | 多发性硬化症 | 单细胞转录组分析、空间转录组学、hiPSC衍生神经类器官、3T MRI | NA | 转录组数据、影像数据 | 466名患者脑组织样本及hiPSC衍生神经类器官 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 5093 | 2025-10-06 |
Comparison of imaging based single-cell resolution spatial transcriptomics profiling platforms using formalin-fixed paraffin-embedded tumor samples
2025-Sep-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63414-1
PMID:41006245
|
研究论文 | 使用福尔马林固定石蜡包埋肿瘤样本比较三种成像空间转录组学平台的性能 | 首次系统评估商业空间转录组学平台在肿瘤样本中的表现，并揭示探针设计等参数对数据质量的重要性 | 研究仅使用肺癌和胸膜间皮瘤样本，样本类型相对有限 | 评估不同空间转录组学平台在肿瘤生物学研究中的性能差异 | 肺腺癌和胸膜间皮瘤的福尔马林固定石蜡包埋手术切除样本 | 空间转录组学 | 肺癌 | 空间转录组学（CosMx、MERFISH、Xenium）、批量RNA测序、多重免疫荧光、GeoMx、HE染色 | NA | 空间转录组数据、图像数据 | 使用组织微阵列中的肺腺癌和胸膜间皮瘤样本 | CosMx, MERFISH, Xenium | 空间转录组学，单细胞分辨率成像 | CosMx, MERFISH, Xenium | 单模态和多模态Xenium平台 |
| 5094 | 2025-10-06 |
Aging in mice alters regionally enriched striatal astrocytes
2025-Sep-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-63429-8
PMID:41006292
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠纹状体中星形胶质细胞随年龄增长的分子变化和区域异质性 | 首次在单细胞分辨率下识别了纹状体中分子特征不同的星形胶质细胞亚型，并发现背侧纹状体星形胶质细胞表现出更大的年龄相关分子变化 | 研究仅限于小鼠模型，未涉及人类样本；样本数量未明确说明 | 探究衰老对纹状体星形胶质细胞分子特征和区域分布的影响 | 年轻和老年小鼠的纹状体星形胶质细胞 | 神经科学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 年轻和老年小鼠（具体数量未说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5095 | 2025-10-06 |
Mechanism of sepsis regulation by ELANE via macrophage polarization
2025-Sep-26, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-18848-4
PMID:41006720
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析和实验验证揭示了ELANE基因通过促进巨噬细胞M1极化加剧脓毒症的机制 | 首次系统性地将ELANE鉴定为脓毒症核心免疫调控基因，并通过单细胞测序和体外实验证实其在巨噬细胞极化中的关键作用 | 样本量较小（20例患者），且主要基于体外实验，需要更大规模的临床验证 | 鉴定脓毒症核心免疫调控基因ELANE并探索其通过巨噬细胞极化调控脓毒症的机制 | 脓毒症患者和健康对照者的外周血样本，以及LPS刺激的巨噬细胞 | 免疫学 | 脓毒症 | RNA测序、生物信息学分析、单细胞测序、流式细胞术、ELISA | NA | RNA测序数据、单细胞测序数据、蛋白质相互作用数据 | 20例脓毒症患者和10例健康对照 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 5096 | 2025-10-06 |
BiAEImpute: a robust bidirectional autoencoder framework for High-fidelity dropout imputation in single-cell transcriptomics
2025-Sep-26, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11988-x
PMID:41013245
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研究论文 | 提出一种基于双向自编码器的单细胞转录组数据缺失值插补方法BiAEImpute | 采用行向和列向自编码器协同学习细胞和基因特征，增强插补过程的鲁棒性和准确性 | NA | 开发有效的单细胞RNA测序数据缺失值插补方法 | 单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 双向自编码器(Bidirectional Autoencoder) | 基因表达数据 | 四个真实scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5097 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing of endometrium uncovers dynamic characteristics and dysregulation of perivascular CD9+SUSD2+ cells in thin endometrium
2025-Sep-26, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04658-y
PMID:41013639
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示薄型子宫内膜中血管周围CD9+SUSD2+细胞的动态特征和功能失调 | 首次在单细胞水平鉴定薄型子宫内膜中血管周围CD9+SUSD2+细胞作为祖干细胞，并揭示其功能异常机制 | 样本量较小（正常组n=3，薄型子宫内膜组n=3） | 探究薄型子宫内膜中CD9+SUSD2+细胞的分子特征和功能机制 | 人类子宫内膜组织，特别是血管周围CD9+SUSD2+细胞 | 单细胞生物学 | 薄型子宫内膜 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)，流式细胞术，Western blotting，多重免疫荧光分析 | NA | 单细胞转录组数据，蛋白质表达数据，组织学图像 | 6例子宫内膜样本（3例正常，3例薄型子宫内膜），共59,770个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 5098 | 2025-10-06 |
Adenine base editing rescues disrupted BCKDH function and reduces BCAAs toxic accumulation in maple syrup urine disease patient iPSC-hepatic organoids
2025-Sep-26, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04630-w
PMID:41013826
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研究论文 | 本研究利用腺嘌呤碱基编辑器ABE8e成功修复MSUD患者iPSC来源肝类器官中的BCKDHB基因突变，恢复BCKDH酶功能并降低支链氨基酸毒性积累 | 首次在MSUD患者特异性iPSC肝类器官中应用ABE8e碱基编辑技术精准纠正致病突变，并系统评估其功能恢复效果和安全性 | 研究仅限于体外类器官模型，尚未进行体内动物实验验证 | 开发基于碱基编辑技术的MSUD基因治疗方法 | MSUD患者诱导多能干细胞来源的肝类器官 | 基因编辑与干细胞研究 | 枫糖尿症(MSUD) | 腺嘌呤碱基编辑(ABE8e)、单细胞RNA测序(scRNA-Seq)、全基因组测序(WGS)、qRT-PCR、Western blot | iPSC-derived hepatic organoids | 基因组数据、转录组数据、蛋白质表达数据 | MSUD患者iPSC来源肝类器官及对照样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 5099 | 2025-10-06 |
Metabolic heterogeneity and survival outcomes in papillary renal cell carcinoma: insights from multi-datasets and machine learning analyses
2025-Sep-26, Hereditas
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s41065-025-00571-9
PMID:41013841
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研究论文 | 本研究通过多数据集和机器学习分析揭示了乳头状肾细胞癌的代谢异质性并建立了预后预测模型 | 整合90种机器学习算法构建代谢相关特征，并在单细胞水平验证关键基因 | 研究基于回顾性数据集，需要进一步前瞻性验证 | 研究肾乳头状细胞癌中代谢相关分子的特征并识别潜在预后生物标志物 | 肾乳头状细胞癌(KIRP)患者 | 机器学习 | 肾癌 | 加权基因共表达网络分析、差异表达分析、单细胞RNA测序、定量PCR、免疫组化染色 | 随机生存森林(RSF)、Cox回归 | 基因表达数据 | TCGA-KIRP和GSE2748队列数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 5100 | 2025-10-06 |
Nodal Spread Prediction in Human Oral Tongue Squamous Cell Carcinoma Using a Cancer-Testis Antigen Genes Signature
2025-Sep-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26189258
PMID:41009820
|
研究论文 | 本研究开发了一种基于癌-睾丸抗原基因特征的诊断工具，用于预测口腔舌鳞状细胞癌的淋巴结转移 | 首次整合多组学数据识别与口腔舌癌淋巴结转移相关的癌-睾丸抗原基因特征，并验证其预测价值 | 样本量较小（16例患者），需要更大规模研究验证 | 开发能够准确预测口腔舌鳞状细胞癌淋巴结转移的基因诊断工具 | 口腔舌鳞状细胞癌患者 | 数字病理 | 口腔癌 | 微阵列、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、NanoString nCounter RNA分析 | 决策树、t-SNE、CNN | 基因表达数据 | 16例接受舌切除术和选择性颈清扫术的患者 | NanoString | 基因表达分析 | nCounter | NanoString nCounter RNA分析系统 |