单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 10769 篇文献，本页显示第 4961 - 4980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4961 | 2025-10-06 |
Cellular interactions and Ion channel signatures in atrial fibrillation remodeling: insights from single-cell analysis and machine learning
2025, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2025.1615574
PMID:40894480
|
研究论文 | 通过单细胞分析和机器学习方法研究心房颤动中心脏结构重塑的细胞相互作用和电重塑的离子通道标志物 | 首次结合单细胞RNA测序和机器学习算法系统分析AF的结构和电重塑机制，识别了关键的细胞亚型和离子通道标志基因 | 样本量有限，研究结果需要在更大规模队列中验证 | 阐明心房颤动的结构和电重塑机制，识别潜在的生物标志物和治疗靶点 | 心房颤动患者和窦性心律对照者的心房成纤维细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 机器学习, 差异表达分析, 细胞轨迹分析, 细胞间相互作用分析 | LASSO, SVM | 单细胞RNA测序数据, 微阵列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4962 | 2025-10-06 |
eQTL and multi-omics integration reveal PPIH as a prognostic and immunotherapeutic biomarker
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1647722
PMID:40895540
|
研究论文 | 通过整合多组学数据识别PPIH作为跨癌种的预后和免疫治疗生物标志物 | 首次通过孟德尔随机化整合eQTL和GWAS数据，结合单细胞转录组分析系统鉴定PPIH的泛癌生物标志物潜力 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于肝癌细胞系 | 系统识别跨癌种的候选生物标志物并评估其临床价值 | 食管腺癌、胃癌、透明细胞肾细胞癌和肝细胞癌等多种恶性肿瘤 | 生物信息学 | 多种癌症 | 孟德尔随机化, 单细胞RNA-seq, 多组学整合分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 多组学整合 | NA | NA |
| 4963 | 2025-10-06 |
A fusion ORF3a-E subgenomic RNA involved in SARS-CoV-2 infection efficacy by influencing cellular protein synthesis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1619538
PMID:40895568
|
研究论文 | 本研究鉴定了一种SARS-CoV-2的融合ORF3a-E亚基因组RNA，并揭示其通过调控细胞蛋白合成影响病毒感染效能的机制 | 首次发现并表征了SARS-CoV-2中具有双重编码功能的ORF3a-E融合亚基因组RNA及其在病毒生命周期中的关键作用 | 研究主要基于细胞系模型，尚未在动物模型或临床样本中验证 | 探究SARS-CoV-2亚基因组RNA在病毒感染过程中的功能机制 | SARS-CoV-2病毒及其感染的16HBE人支气管上皮细胞系 | 病毒学 | COVID-19 | 单细胞测序 | NA | RNA测序数据 | SARS-CoV-2感染的16HBE细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4964 | 2025-10-06 |
The osteosarcoma immune microenvironment in progression: PLEK as a prognostic biomarker and therapeutic target
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1651858
PMID:40895569
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析发现PLEK是骨肉瘤的预后生物标志物和免疫代谢调控枢纽 | 首次揭示PLEK在骨肉瘤免疫微环境中的核心作用，连接免疫浸润与代谢重编程 | 研究样本量有限，功能验证主要在体外进行 | 鉴定骨肉瘤中的免疫代谢生物标志物 | 骨肉瘤组织和肿瘤免疫微环境 | 生物信息学 | 骨肉瘤 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, qRT-PCR, Western blot, siRNA | CytoHubba算法, 蛋白质相互作用网络 | 转录组数据, 单细胞数据 | TCGA/GTEx数据库和GSE162454单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 转录组测序 | NA | NA |
| 4965 | 2025-10-06 |
Targeting macrophages and ion homeostasis in T2D: new genes and therapeutic pathways identified
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1514243
PMID:40895573
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习方法，探索了2型糖尿病患者中巨噬细胞特异性基因表达与异常血单价无机阳离子浓度相关基因的交叉作用 | 首次整合单细胞RNA测序与机器学习识别巨噬细胞中与离子稳态相关的关键基因，并构建了高精度的T2D预测模型 | 样本量相对有限（44例），需要更大规模研究验证发现 | 识别2型糖尿病中巨噬细胞与离子稳态相关的关键基因和潜在治疗靶点 | 2型糖尿病患者的胰岛细胞，特别是巨噬细胞 | 机器学习 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序，机器学习，PPI网络分析，调控网络分析 | GBM | 单细胞RNA测序数据 | 44例（27例非糖尿病患者，17例2型糖尿病患者） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4966 | 2025-10-06 |
Transcriptomic features of immune inflammation and neural plasticity associated with early neurological improvement in acute ischemic stroke patients with large vessel occlusion
2025, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2025.1581758
PMID:40896336
|
研究论文 | 本研究通过外周血mRNA转录组分析揭示了大血管闭塞性急性缺血性卒中患者早期神经功能改善的免疫炎症和神经可塑性相关分子特征 | 首次系统揭示ENI患者外周血转录组特征，发现免疫激活与神经可塑性抑制的动态平衡机制 | 样本量较小（仅20例），回顾性研究设计 | 探究大血管闭塞性急性缺血性卒中患者血管内取栓后早期神经功能改善的分子机制 | 急性缺血性卒中伴大血管闭塞患者 | 生物信息学 | 缺血性卒中 | mRNA转录组测序，生物信息学分析 | NA | RNA测序数据 | 20例患者（13例ENI组，7例非ENI组） | NA | bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4967 | 2025-10-06 |
Marker genes reveal dynamic features of cell evolving processes
2025, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbaf185
PMID:40896714
|
研究论文 | 通过分析单细胞RNA测序数据揭示细胞演化过程中关键基因的动态特征 | 发现关键基因在细胞分支前后的不同统计特征和表达模式，以及基因调控强度在伪时间轨迹上的变化规律 | 仅分析了四种特定细胞类型的数据集，需要更多验证 | 揭示细胞命运决定过程中基因表达的动态特征 | 小鼠胚胎细胞、小鼠胚胎成纤维细胞、人类骨髓和肠道类器官 | 单细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 四个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4968 | 2025-10-06 |
SEMA3C regulates tumor-associated macrophage phenotype and influences lung cancer cell migration and invasion through VNN1
2025 Jan-Dec, Human & experimental toxicology
IF:2.7Q3
DOI:10.1177/09603271251376577
PMID:40901786
|
研究论文 | 本研究探讨了SEMA3C通过VNN1调控肿瘤相关巨噬细胞表型并影响肺癌细胞迁移和侵袭的机制 | 首次揭示了SEMA3C通过VNN1介导的CAFs与巨噬细胞相互作用调控TAM极化的新机制 | 研究主要基于体外实验，缺乏体内验证；样本来源和数量有限 | 探究肿瘤相关巨噬细胞在肺腺癌细胞侵袭迁移中的作用机制 | 肺腺癌细胞、肿瘤相关巨噬细胞、癌症相关成纤维细胞 | 单细胞分析 | 肺癌 | 单细胞测序, Western blot, Transwell迁移侵袭实验, 免疫荧光染色 | NA | 单细胞测序数据, 实验数据 | GSE131907数据集中的肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4969 | 2025-10-06 |
Multiparametric Profiling of Circulating Immune Cells Identifies an Expansion of CD25high Switched Memory B Cells in Osteoarthritis
2025-Sep, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.43186
PMID:40229860
|
研究论文 | 通过多参数分析循环免疫细胞，发现骨关节炎患者中CD25高表达转换记忆B细胞扩增 | 首次在单细胞分辨率下识别骨关节炎相关的循环免疫细胞特征，发现CD25hiCXCR5hiCD27+IgD-转换记忆B细胞亚群扩增 | 样本量有限（21名健康供体，17名OA患者，10名DMT患者），需要更大规模研究验证 | 识别骨关节炎的潜在细胞生物标志物 | 外周血单核细胞（PBMCs） | 单细胞分析 | 骨关节炎 | 飞行时间质谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞蛋白质表达数据，单细胞转录组数据 | 48个样本（21健康供体，17OA患者，10DMT患者） | NA | 质谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 29标记物面板的飞行时间质谱流式细胞术 |
| 4970 | 2025-10-06 |
Multiomic spatial atlas shows deleted in malignant brain tumors 1 (DMBT1) glycoprotein is lost in colonic dysplasia
2025-05, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6406
PMID:40026233
|
研究论文 | 本研究通过多组学空间图谱揭示DMBT1糖蛋白在结肠发育异常中表达缺失的机制 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和免疫荧光技术，揭示DMBT1在炎症与发育异常结肠中的双向调控机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究宿主-微生物相互作用在结肠肿瘤发生过程中的机制 | 结肠发育异常组织、小鼠模型、人类样本、类器官 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光, 类器官培养 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 多个小鼠模型和人类样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4971 | 2025-10-06 |
Interleukin-11 expressed in the polyp-enriched fibroblast subset is a potential therapeutic target in Peutz-Jeghers syndrome
2025-05, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6408
PMID:40070038
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序鉴定Peutz-Jeghers综合征息肉中富集的成纤维细胞亚群，并发现IL-11是该疾病潜在治疗靶点 | 首次识别PJS息肉富集的隐窝顶部成纤维细胞(pCTF)亚群，并证实IL-11在成纤维细胞重编程中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床验证尚需进一步研究 | 探究Peutz-Jeghers综合征息肉形成的细胞机制和潜在治疗靶点 | PJS小鼠模型息肉和患者息肉样本 | 单细胞生物学 | Peutz-Jeghers综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | PJS小鼠模型和患者息肉样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4972 | 2025-10-06 |
Cancer-associated fibroblast heterogeneity in chordoma†
2025-05, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6420
PMID:40088426
|
评论 | 本文综述了脊索瘤中癌症相关成纤维细胞（CAF）异质性的最新研究进展 | 定义了脊索瘤中的炎症性CAF亚型（iCAF），该亚型与不良预后和肿瘤侵袭相关 | 区分CAF调控肿瘤表型中的相关性和因果关系仍面临重大挑战 | 研究脊索瘤中癌症相关成纤维细胞的异质性及其在肿瘤进展中的作用 | 脊索瘤肿瘤微环境中的细胞组成，特别是癌症相关成纤维细胞 | 数字病理学 | 脊索瘤 | 单细胞转录组学，空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 4973 | 2025-10-06 |
Multi-omics analysis unveils the role of inflammatory cancer-associated fibroblasts in chordoma progression
2025-01, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6369
PMID:39611243
|
研究论文 | 通过多组学分析揭示炎症性癌症相关成纤维细胞在脊索瘤进展中的作用 | 首次在脊索瘤中发现并表征了炎症性癌症相关成纤维细胞(iCAF)亚群，揭示了其空间分布特征和促癌机制 | 样本量相对有限，需要更大规模的研究验证 | 探究脊索瘤中癌症相关成纤维细胞的异质性、空间分布和临床意义 | 脊索瘤患者肿瘤样本和正常髓核样本 | 数字病理学 | 脊索瘤 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序,多重定量免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据,空间转录组数据,批量转录组数据,免疫荧光图像 | 7个肿瘤样本和4个正常髓核样本用于scRNA-seq，126例患者用于批量RNA-seq分析，116例患者用于QIF验证 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序,多重定量免疫荧光 | NA | NA |
| 4974 | 2025-10-06 |
Decoding meningioma prognosis with multi-omics: macrophage diversity, immune-CNV interplay, and novel SPP1-targeted strategies
2025-Oct, Journal of neuro-oncology
IF:3.2Q2
DOI:10.1007/s11060-025-05116-8
PMID:40522564
|
研究论文 | 通过整合多组学数据对脑膜瘤进行预后分层，揭示巨噬细胞功能异质性和CNV驱动的免疫微环境差异 | 首次在脑膜瘤中整合DNA甲基化和单细胞转录组数据，识别SPP1作为巨噬细胞功能的关键调节因子 | 样本量相对有限，需要进一步验证SPP1靶向治疗的有效性 | 开发脑膜瘤预后分层系统并探索治疗靶点 | 302对配对脑膜瘤样本 | 数字病理 | 脑膜瘤 | DNA甲基化测序, bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | SCISSOR, scRank | 基因组数据, 转录组数据 | 302对配对脑膜瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, DNA甲基化测序 | NA | NA |
| 4975 | 2025-10-06 |
A prognostic gene signature and subtype-specific drug sensitivity in TNBC revealed by single-cell and bulk RNA sequencing: Insights into stemness and tumor heterogeneity
2025-Oct, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2025.06.007
PMID:40541706
|
研究论文 | 通过单细胞和bulk RNA测序揭示TNBC的预后基因特征和亚型特异性药物敏感性，深入了解干性和肿瘤异质性 | 整合多组学方法识别出具有高度可塑性的癌症上皮亚群，建立了四基因预后特征，并发现与染色质重塑相关的独特分子亚型 | 研究依赖于现有数据库数据，需要进一步实验验证 | 研究三阴性乳腺癌的细胞异质性和耐药机制 | 三阴性乳腺癌患者样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序,bulk转录组学,表观基因组学,突变分析 | 无监督聚类 | 基因表达数据 | GSE176078数据集和TCGA-BRCA数据 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 4976 | 2025-09-03 |
Corrigendum to "Identification and validation of synergistic drug strategies targeting macrophage polarization in triple-negative breast cancer via single-cell transcriptomics and deep learning" [Translational Oncology 2025 Jun 26;59:102457]
2025-Oct, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102474
PMID:40818872
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 4977 | 2025-10-06 |
Fine particulate matter exacerbates asthma by activating STC2-mediated mitophagy through METTL3/YTHDF2-dependent m6A methylation
2025-Sep-05, Journal of hazardous materials
IF:12.2Q1
DOI:10.1016/j.jhazmat.2025.138854
PMID:40499413
|
研究论文 | 本研究揭示了细颗粒物通过METTL3/YTHDF2依赖的m6A甲基化激活STC2介导的线粒体自噬加剧哮喘的分子机制 | 首次发现PM通过m6A甲基化调控STC2表达激活线粒体自噬的新机制，并验证了季节性PM暴露与METTL3/STC2血清浓度的关联 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本仅检测了血清标志物，缺乏直接机制验证 | 探究细颗粒物加剧哮喘的分子机制 | 哮喘小鼠模型和哮喘患者外周血样本 | 分子生物学 | 哮喘 | 单细胞RNA测序，分子机制研究 | NA | 基因表达数据，血清浓度数据 | 哮喘小鼠和季节性采集的哮喘患者外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4978 | 2025-10-06 |
TRAF3IP2-AS1 Deficiency Induces Necroptosis to Promote Pancreatic Cancer Liver Metastasis
2025-Sep-02, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-24-4784
PMID:40586914
|
研究论文 | 本研究揭示长链非编码RNA TRAF3IP2-AS1通过调控坏死性凋亡和免疫抑制微环境促进胰腺癌肝转移的机制 | 首次发现TRAF3IP2-AS1缺失通过双重机制诱导坏死性凋亡：通过竞争性结合IGF2BP2降低MLKL mRNA稳定性，同时干扰PPM1B泛素化促进RIPK3磷酸化 | 研究主要基于患者来源类器官和动物模型，临床样本验证仍需扩展 | 探究胰腺癌肝转移的分子机制和潜在治疗靶点 | 胰腺导管腺癌(PDAC)患者样本、患者来源类器官、TGFβ1条件性基因敲除小鼠模型 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序、多重免疫荧光染色、3D体外模型 | 动物模型、类器官模型 | 基因表达数据、蛋白质定位数据 | PDAC患者样本（具体数量未明确） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4979 | 2025-10-06 |
EML4-ALK Rearrangement Creates a Distinctive Myeloid Cell-Dominant Immunosuppressive Microenvironment in Lung Cancer
2025-Sep-02, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-24-0532
PMID:40627846
|
研究论文 | 本研究揭示了EML4-ALK重排通过创建髓系细胞主导的免疫抑制微环境导致肺癌对免疫治疗不响应的机制 | 首次发现ALK+肺腺癌具有独特的髓系细胞主导免疫抑制微环境，并证实IL6R抑制剂可逆转该免疫抑制状态 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化效果需进一步验证 | 探索ALK+肺腺癌对免疫治疗不响应的免疫学机制 | ALK阳性和阴性肺腺癌患者的肿瘤组织及小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，肿瘤浸润白细胞分析 | 小鼠ALK+肺腺癌模型 | 基因表达数据，细胞计数数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4980 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing of pig lung transplantation reveals macrophage ferroptosis in lung ischemia-reperfusion injury
2025-Sep, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2025.04.011
PMID:40262727
|
研究论文 | 通过猪肺移植模型的单细胞RNA测序研究巨噬细胞铁死亡在肺缺血再灌注损伤中的作用 | 首次建立猪原位单肺移植模型模拟长时间冷缺血再灌注损伤，并通过单细胞RNA测序揭示巨噬细胞铁死亡的关键作用 | 研究样本量有限，需要进一步验证巨噬细胞铁死亡的具体分子机制 | 研究肺缺血再灌注损伤的病理机制并建立大型动物模型 | 猪肺移植模型中的肺组织样本 | 单细胞测序分析 | 肺缺血再灌注损伤 | 单细胞RNA测序，透射电子显微镜 | NA | 单细胞转录组数据，显微镜图像 | 猪肺移植模型组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |