单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期:202501-202512] [清除筛选条件]
当前共找到 10618 篇文献,本页显示第 4941 - 4960 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
4941 2025-09-06
Progress in the Application of Single-Cell Sequencing in Neoadjuvant Therapy for Esophageal Cancer
2025-Jul, Cureus
综述 本文探讨单细胞测序技术在食管癌新辅助治疗中的应用进展及其对肿瘤微环境和治疗策略的启示 提供了评估新辅助治疗有效性的新视角,并通过单细胞水平分析揭示个体细胞差异 未明确提及具体研究限制,但属于技术应用综述而非实证研究 推动食管癌新辅助治疗策略的优化和个性化治疗发展 食管癌肿瘤微环境及接受新辅助治疗的患者群体 数字病理学 食管癌 单细胞测序(sc-seq) NA 转录组数据 NA NA NA NA NA
4942 2025-10-06
Immunopipe: a comprehensive and flexible scRNA-seq and scTCR-seq data analysis pipeline
2025-Jun, NAR genomics and bioinformatics IF:4.0Q1
研究论文 开发了一个名为immunopipe的综合灵活的单细胞RNA测序和T细胞受体测序数据分析流程 提供了首个同时整合分析scRNA-seq和scTCR-seq数据的综合流程,并包含用户友好的网页界面 NA 开发单细胞测序数据分析工具以促进对T细胞介导免疫和免疫疗法的理解 单细胞RNA测序和T细胞受体测序数据 生物信息学 NA 单细胞RNA测序, 单细胞TCR测序 NA 单细胞测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 单细胞TCR-seq NA NA
4943 2025-10-06
A Multimodal Spatial and Epigenomic Atlas of Human Adult Lung Topography
2025-May-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 构建了人类成人肺部的多模态空间和表观基因组图谱 整合了snRNA-seq和SNARE-seq2技术,首次在相同细胞核内同时分析染色质可及性和基因表达,并通过MERFISH空间转录组学定位了25种细胞群体 仅使用11名健康成年人的样本,样本规模相对有限 开发高分辨率肺部疾病易感空间生态位参考图谱 人类成人肺部组织 空间转录组学 肺部疾病 snRNA-seq, SNARE-seq2, MERFISH, 多重免疫荧光 NA 单细胞核RNA测序, 染色质可及性, 空间转录组, 蛋白质标记 49个肺组织块,746,047个细胞核,来自11名健康成年人 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学, 空间转录组学 NA SNARE-seq2(同时检测染色质可及性和基因表达), MERFISH(空间转录组学)
4944 2025-10-06
A Phase I Clinical Trial Adding OX40 Agonism to In Situ Therapeutic Cancer Vaccination in Patients with Low-Grade B-cell Lymphoma Highlights Challenges in Translation from Mouse to Human Studies
2025-Mar-03, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research IF:10.0Q1
研究论文 评估OX40激动剂联合原位癌症疫苗治疗低级别B细胞淋巴瘤的I期临床试验 首次在人体中测试OX40激动剂BMS986178联合TLR9激动剂SD101和低剂量放疗的协同治疗效果 样本量较小(14例患者),临床结果不如临床前小鼠模型理想,存在种属差异和T细胞亚群复杂性等转化障碍 评估T细胞共刺激受体激动剂在癌症免疫治疗中的安全性和有效性 低级别B细胞淋巴瘤患者 癌症免疫治疗 B细胞淋巴瘤 流式细胞术,单细胞RNA测序 NA 临床数据,分子生物学数据 14例患者 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4945 2025-10-06
Single-cell and spatial transcriptomics reveal a stress-induced EMT-like epithelial subset driving immune activation in silica-injured lung
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究结合单细胞RNA测序和空间转录组学揭示了二氧化硅损伤肺中应激诱导的上皮细胞亚群驱动免疫激活的机制 发现了一个新型的应激诱导上皮细胞亚群C0,该亚群具有上皮-间质转化样特征并能通过特定信号通路驱动免疫激活 研究仅基于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 探究肺上皮细胞在慢性损伤过程中调节免疫反应的机制 二氧化硅暴露的小鼠肺部上皮细胞 数字病理学 肺疾病 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 伪时序分析, CytoTRACE分析 NA 基因表达数据, 空间定位数据 二氧化硅暴露56天的小鼠肺部样本 NA 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA NA
4946 2025-09-06
Natural killer cell subpopulations in the peripheral blood of single ventricle/hypoplastic left heart syndrome patients via single-cell RNA sequencing
2025, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.)
研究论文 通过单细胞RNA测序分析单心室/左心发育不全综合征患者外周血中的自然杀伤细胞亚群 发现两个新的NK细胞亚群,这些亚群无法通过传统scRNA-seq流程或流式细胞术检测,并揭示了与免疫应答异质性和应激适应相关的独特基因表达谱 样本量较小(仅3例患者和3例健康对照),且使用去标识化样本可能限制临床相关性分析 探究SV/HLHS患者NK细胞的免疫学特征及其在疾病并发症中的作用 单心室/左心发育不全综合征患者和健康对照者的外周血单个核细胞中的自然杀伤细胞 免疫学 心血管疾病 scRNA-seq(单细胞RNA测序) NA 单细胞转录组数据 3例SV/HLHS患者和3例健康对照的PBMC样本 NA NA NA NA
4947 2025-09-06
Silencing RPL11 attenuates acute kidney injury by suppressing tubular apoptosis and macrophage-driven inflammation
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过多组学分析和实验验证,揭示核糖体蛋白RPL11在急性肾损伤(AKI)中的关键作用及其机制 首次发现RPL11作为AKI核心调控因子,并开发了肾脏靶向纳米干预技术沉默RPL11 研究主要基于小鼠模型和细胞实验,临床转化需进一步验证 探究RPL11在急性肾损伤发病机制中的作用并开发治疗策略 小鼠肾脏组织、HK-2人肾小管上皮细胞系 分子病理学 急性肾损伤 scRNA-seq, RNA-seq, siRNA转染, Western blotting, qPCR, 流式细胞术 NA 基因组数据、蛋白质数据、细胞成像数据 小鼠AKI模型和HK-2细胞模型(具体数量未明确说明) NA NA NA NA
4948 2025-09-06
Dysregulated Immune Responses in Sepsis: Insights From Treg-Related Gene Expression
2025, Journal of inflammation research IF:4.2Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习方法,探索了脓毒症中调节性T细胞(Treg)的动态变化及CD82基因的新作用,并开发了一个高精度的诊断基因标志物 首次发现CD82在脓毒症Treg细胞中的上调表达及其免疫调节作用,并利用多数据集整合机器学习构建了七基因诊断模型 CD82的具体作用机制尚需进一步实验验证,研究样本量有限且主要依赖公共数据库 阐明脓毒症中Treg细胞的免疫调节机制并寻找新的诊断标志物 脓毒症患者外周血样本和CLP小鼠模型 生物信息学 脓毒症 scRNA-seq, 流式细胞术, RT-qPCR, 机器学习(SVM, LASSO, random forest) 集成学习模型 基因表达数据 380个样本(来自三个GEO数据集)加患者和小鼠实验样本 NA NA NA NA
4949 2025-09-06
Correction: Single-cell and spatial transcriptomics reveal a stress-induced EMT-like epithelial subset driving immune activation in silica-injured lung
2025, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
correction 对先前发表的关于矽肺损伤肺中应激诱导EMT样上皮亚群驱动免疫激活的单细胞与空间转录组学研究进行更正 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
4950 2025-10-06
Emerging molecular targets in deep vein thrombosis: from inflammation to coagulation
2025-Dec, Hematology (Amsterdam, Netherlands)
综述 本综述探讨深静脉血栓形成中连接炎症与凝血途径的新兴分子靶点 系统整合了连接炎症与凝血途径的多个新兴分子靶点,包括NETs、PAD4、P-selectin等,并提出单细胞RNA测序和CRISPR筛选等新技术在靶点发现中的应用前景 主要基于临床前研究数据,存在物种差异、脱靶效应等转化挑战,且需平衡疗效与免疫防御功能 探索深静脉血栓形成中炎症与凝血相互作用的分子机制及潜在治疗靶点 中性粒细胞胞外诱捕网(NETs)、肽酰精氨酸脱亚氨酶4(PAD4)、P-选择素、高迁移率族蛋白B1(HMGB1)、组织因子(TF)、补体C3和NLRP3炎性体等分子靶点 分子病理学 深静脉血栓 单细胞RNA测序, CRISPR筛选 NA 文献数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
4951 2025-10-06
Alternative splicing as a novel pathogenic mechanism in chronic kidney disease
2025-Nov, Cellular signalling IF:4.4Q2
综述 本文综述了选择性剪接作为慢性肾脏病新型致病机制的研究进展 首次系统阐述选择性剪接在慢性肾脏病中的致病作用,提出靶向选择性剪接的治疗策略 需要进一步研究选择性剪接及其调控因子在慢性肾脏病中的动态变化和功能贡献 阐明选择性剪接与慢性肾脏病之间的功能联系 肾小管上皮细胞及其选择性剪接事件 生物医学 慢性肾脏病 单细胞测序 NA NA 全球超过10%人口 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4952 2025-10-06
N-glycosylation stabilized TNFAIP6 promotes ovarian cancer metastasis by activating the PI3K-AKT signaling pathway
2025-Nov, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 本研究揭示了N-糖基化稳定的TNFAIP6通过激活PI3K-AKT信号通路促进卵巢癌转移的分子机制 首次发现N-糖基化通过抑制泛素-蛋白酶体降解途径稳定TNFAIP6蛋白,并阐明其通过PI3K/AKT信号通路驱动卵巢癌转移的新机制 研究主要基于细胞系和动物模型,需要进一步临床验证;免疫抑制微环境与治疗抵抗的具体机制仍需深入探索 阐明卵巢癌转移的分子驱动机制并寻找潜在治疗靶点 卵巢癌细胞系、动物转移模型和临床样本数据 癌症生物学 卵巢癌 RNA-seq, scRNA-seq, Western blot, 免疫荧光, 慢病毒shRNA敲降/过表达, Co-IP 动物转移模型 基因组数据, 蛋白质数据, 临床数据 TCGA和GEO数据库的批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
4953 2025-10-06
A STAT1-GBP3-STING positive feedback loop governs inflammation, oxidative stress, and DNA damage to trigger acute aortic dissection
2025-Nov, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 本研究揭示了STAT1-GBP3-STING正反馈环路在急性主动脉夹层中调控炎症、氧化应激和DNA损伤的分子机制 首次发现STAT1-GBP3-STING正反馈环路在主动脉退行性变中的关键作用,并证明STAT1抑制剂氟达拉滨可通过干预该环路改善疾病预后 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 阐明急性主动脉夹层中炎症、氧化应激和DNA损伤相互作用的分子机制 小鼠主动脉夹层模型、IFN-γ刺激的血管平滑肌细胞、人类升主动脉组织 分子生物学 心血管疾病 ATAC-seq, RNA-seq, 单细胞RNA测序, ROS染色, ChIP-PCR, CoIP NA 基因组学数据, 转录组数据, 蛋白质相互作用数据 191个差异表达基因,小鼠主动脉夹层模型 NA 单细胞RNA测序, ATAC-seq, RNA-seq NA NA
4954 2025-10-06
G protein-coupled estrogen receptor promotes human extravillous trophoblast invasion via YAP-Snail-mediated CYR61 expression
2025-Nov, Cellular signalling IF:4.4Q2
研究论文 本研究揭示了G蛋白偶联雌激素受体通过YAP-Snail信号轴调控CYR61表达促进人类绒毛外滋养细胞侵袭的分子机制 首次发现GPER-YAP-Snail-CYR61信号轴在滋养细胞侵袭中的调控作用,并证实该通路在子痫前期患者中异常 未明确GPER激活YAP信号的具体上游机制,缺乏动物模型验证 探究GPER调控CYR61表达促进滋养细胞侵袭的分子机制 人类绒毛外滋养细胞(HTR-8/SVneo细胞系和原代细胞) 分子生物学 子痫前期 单细胞RNA测序, 功能缺失实验 NA 基因表达数据, 细胞功能数据 细胞系和原代细胞,公共scRNA-seq数据库中的子痫前期患者样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4955 2025-10-06
The Landscape of SPP1 + Macrophages Across Tissues and Diseases: A Comprehensive Review
2025-Oct, Immunology IF:4.9Q2
综述 全面综述SPP1+巨噬细胞在不同组织和疾病中的分布特征与功能作用 首次系统整合单细胞RNA测序技术揭示的SPP1+巨噬细胞跨疾病谱系功能异质性 NA 探讨SPP1+巨噬细胞在肿瘤与非癌性疾病中的功能特化和治疗靶向潜力 分泌磷蛋白1(SPP1)阳性巨噬细胞亚群 NA 多癌种及非癌性疾病 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
4956 2025-10-06
From tissue architecture to clinical insights: Spatial transcriptomics in solid tumor studies
2025-Oct, Seminars in oncology IF:3.0Q2
综述 深入分析空间转录组学技术在实体瘤研究中的最新进展和应用前景 整合空间转录组学与单细胞多组学及先进计算算法,揭示肿瘤核心区、侵袭边缘和免疫微环境的分子景观 在技术分辨率、数据处理、样本制备和临床标准化方面仍存在挑战 探讨空间转录组学如何推动实体瘤研究和精准肿瘤学发展 实体瘤及其肿瘤微环境 数字病理学 实体瘤 空间转录组学 深度学习 空间基因表达数据 NA NA 空间转录组学, 单细胞多组学 NA NA
4957 2025-10-06
Microarray and Single-Cell RNA Sequencing Reveals G-Protein Gene Expression Signatures of Spermatogonia Stem Cell
2025-Oct, Stem cell reviews and reports IF:4.5Q2
研究论文 通过微阵列和单细胞RNA测序揭示精原干细胞中G蛋白基因的表达特征 首次在人类睾丸单细胞水平系统分析G蛋白基因表达谱,发现精原干细胞发育过程中的关键上下调基因 样本量有限(仅6个人类睾丸),需要进一步功能验证实验 研究人类精原干细胞的发育机制 人类精原干细胞 单细胞转录组学 男性生殖系统疾病 微阵列分析,单细胞RNA测序,生物信息学分析,免疫荧光标记 NA 基因表达数据,单细胞转录组数据,图像数据 6个人类睾丸样本 NA 单细胞RNA测序,微阵列分析 NA NA
4958 2025-10-06
Deciphering the prognostic value and immunotherapeutic strategy of aggrephagy in melanoma: Integrating single-cell sequencing and machine learning
2025-Oct, Seminars in oncology IF:3.0Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞测序和机器学习技术,探索聚集性自噬在皮肤黑色素瘤中的预后价值和免疫治疗策略 首次构建聚集性自噬相关特征(ARS),结合单细胞测序和机器学习算法,在多个数据集中验证其预后预测能力,并通过体内实验验证关键基因TPX2的功能 研究主要基于公共数据库数据,需要更多独立队列验证;体内实验仅针对TPX2基因,其他ARS基因功能有待进一步研究 研究聚集性自噬在皮肤黑色素瘤中的作用,探索其作为预后生物标志物和治疗靶点的潜力 皮肤黑色素瘤患者转录组数据和小鼠模型 机器学习 黑色素瘤 单细胞测序,机器学习算法,流式细胞术 预后预测模型 转录组数据 TCGA数据库和3个独立GEO数据集 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4959 2025-10-06
Predictive model for proliferative diabetic retinopathy using single-cell transcriptomics
2025-Oct, Experimental eye research IF:3.0Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞转录组数据开发了增殖性糖尿病视网膜病变的预测模型 首次整合PDR患者纤维血管膜和健康供体视网膜的单细胞转录组数据,并开发了基于机器学习的预测模型 样本量相对较小,仅包含9个PDR患者的纤维血管膜样本 探索增殖性糖尿病视网膜病变的细胞和分子机制,并开发预测工具 PDR患者的纤维血管膜和健康供体的视网膜组织 生物信息学 糖尿病视网膜病变 单细胞RNA测序,差异基因表达分析,GO和KEGG富集分析 机器学习模型 单细胞转录组数据 9个PDR患者的纤维血管膜样本和健康供体视网膜样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
4960 2025-10-06
CXCR4+ monocytes promote neovascularization in wet age-related macular degeneration
2025-Oct, Experimental eye research IF:3.0Q1
研究论文 本研究通过整合分析方法揭示了湿性年龄相关性黄斑变性中CXCR4+单核细胞通过CXCL12-CXCR4信号轴促进病理性血管生成的新机制 首次发现MMP2+内皮细胞具有血管生成和干细胞样双重特性,并鉴定CXCR4+单核细胞为病理性血管生成的关键介质,确立RUNX3为促血管生成单核细胞分化的主要调控因子 未明确说明样本量大小和研究人群特征,机制研究主要依赖实验模型 阐明湿性年龄相关性黄斑变性中趋化因子信号在血管生成中的作用并鉴定关键单核细胞亚群 湿性年龄相关性黄斑变性相关的血管生成和炎症过程 数字病理学 年龄相关性黄斑变性 bulk RNA测序, 单细胞转录组学, 多重免疫组织化学, 体内模型 NA 转录组数据, 图像数据 NA NA 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 NA NA
回到顶部