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当前共找到 10572 篇文献，本页显示第 4901 - 4920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4901 | 2025-10-17 |
Artificial intelligence-based multi-modal multi-tasks analysis reveals tumor molecular heterogeneity, predicts preoperative lymph node metastasis and prognosis in papillary thyroid carcinoma: a retrospective study
2025-Jan-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000001875
PMID:38990290
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研究论文 | 本研究通过人工智能多模态多任务分析揭示甲状腺乳头状癌的分子异质性，并预测术前淋巴结转移和预后 | 开发了整合组织病理学图像、基因组、转录组和免疫细胞数据的深度学习多模态模型，首次在PTC中实现多维度预测 | 回顾性研究设计，样本来源有限，需要前瞻性验证 | 探索PTC分子异质性，预测淋巴结转移和疾病无进展生存期 | 甲状腺乳头状癌患者 | 数字病理 | 甲状腺癌 | DNA二代测序，单细胞RNA测序，深度学习 | 深度学习多模态模型，GradCAM | 组织病理图像，基因组数据，转录组数据，免疫细胞数据 | 1011例PTC患者（256例来自队列1，275例来自队列2，490例来自TCGA） | NA | 单细胞RNA测序，DNA二代测序 | NA | NA |
| 4902 | 2025-10-16 |
From Harmony to Discord: Multicellular Coordination in Tissues and Its Rewiring in Cancer
2025-Oct-15, Cancer research
IF:12.5Q1
DOI:10.1158/0008-5472.CAN-25-3155
PMID:40698653
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评论 | 讨论CoVarNet计算框架如何通过单细胞和空间转录组学解析多细胞模块在组织中的协调作用及其在癌症中的重编程 | 提出从细胞中心生物学向生态系统水平生物学的概念转变，开发可映射跨组织多细胞模块的通用计算框架 | 模块化组织生物学中仍存在未解决的问题 | 研究组织水平的多细胞协调机制及其在癌症中的重编程 | 35种人体组织中的多细胞模块 | 计算生物学 | 癌症 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | CoVarNet | 单细胞数据, 空间转录组数据 | 35种人体组织 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4903 | 2025-10-16 |
Tumor-resident probiotic Clostridium butyricum improves aPD-1 efficacy in colorectal cancer models by inhibiting IL-6-mediated immunosuppression
2025-Oct-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2025.07.012
PMID:40780216
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研究论文 | 本研究鉴定出丁酸梭菌作为益生菌可通过抑制IL-6介导的免疫抑制增强抗PD-1疗法在结直肠癌模型中的疗效 | 首次发现丁酸梭菌表面蛋白secD通过结合GRP78受体抑制PI3K-AKT-NF-κB通路，减少免疫抑制因子IL-6分泌，从而增强免疫检查点阻断疗效 | 研究主要基于小鼠模型和类器官共培养系统，尚未在人体临床试验中验证 | 探索增强结直肠癌免疫检查点阻断疗法疗效的新策略 | 结直肠癌模型、丁酸梭菌、免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 类器官共培养 | NA | 基因表达数据 | 多种结直肠癌模型（原位移植瘤、AOM/DSS诱导模型、无菌小鼠、人源化小鼠） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4904 | 2025-10-16 |
Comprehensive multi-omics analysis reveals the core role of glycerophospholipid metabolism in the influence of short-chain fatty acids on the development of sepsis
2025-Aug-09, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-13322-7
PMID:40783504
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研究论文 | 通过多组学分析揭示短链脂肪酸通过甘油磷脂代谢途径影响脓毒症发展的核心机制 | 首次整合代谢组学、转录组学、单细胞测序和孟德尔随机化方法，系统阐明短链脂肪酸通过调节甘油磷脂代谢影响脓毒症发展的因果机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据的验证仍需进一步扩展 | 探究短链脂肪酸在脓毒症发展中的具体作用机制 | C57BL/6小鼠和人类转录组数据 | 多组学分析 | 脓毒症 | 非靶向代谢组学, 转录组学, 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化 | SVM-RFE, LASSO回归 | 代谢组数据, 转录组数据, 单细胞数据 | 60只C57BL/6小鼠，多个公共数据库数据集 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组测序, 代谢组学 | NA | NA |
| 4905 | 2025-10-16 |
Joint representation and visualization of derailed cell states with Decipher
2025-Jul-23, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03682-8
PMID:40702544
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研究论文 | 提出一种名为Decipher的深度生成模型，用于整合单细胞基因组学数据并可视化正常与异常细胞状态间的转变 | 开发首个能联合建模和可视化正常与扰动单细胞RNA-seq数据中基因表达和细胞状态的深度生成模型 | NA | 开发计算工具以整合跨条件的单细胞基因组学数据并表征正常到异常细胞状态的转变 | 单细胞RNA测序数据中的细胞状态 | 机器学习 | 胰腺炎、急性髓系白血病、胃癌 | 单细胞RNA测序 | 深度生成模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4906 | 2025-10-16 |
Single-cell and spatial detection of senescent cells using DeepScence
2025-Apr-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.21.568150
PMID:38045252
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研究论文 | 开发基于深度神经网络的DeepScence方法，用于在单细胞和空间转录组数据中检测衰老细胞 | 提出了CoreScence衰老相关基因集，并开发了DeepScence深度学习方法，在多种数据平台上均能准确识别衰老细胞 | NA | 开发准确识别衰老细胞的方法，研究其空间和分子特征 | 衰老细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 深度神经网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4907 | 2025-10-15 |
T cell-mediated SIV dissemination into the CNS: a single-cell transcriptomic analysis
2025-May-09, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6537361/v1
PMID:40386405
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示CD4+细胞毒性样T细胞在SIV病毒进入中枢神经系统的关键作用 | 首次在急性SIV感染期发现同时表达髓系和淋巴系基因的独特脑细胞簇，并鉴定CD4+细胞毒性样T细胞是病毒进入中枢神经系统的主要媒介 | 研究仅基于三只急性感染猕猴，样本量较小，且为动物模型研究 | 表征急性感染期间脑淋巴细胞的作用及CD4+T细胞表型在SIV传播至中枢神经系统中的功能 | 急性SIV感染的恒河猴脑部和血液细胞 | 单细胞转录组学 | HIV/SIV感染 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析，体外共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据 | 三只急性SIV感染恒河猴的脑部和血液细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4908 | 2025-10-15 |
Single-cell multi-omics analysis reveals the mechanism of action of a novel antioxidant polyphenol nanoparticle loaded with STAT3 agonist in mediating cardiomyocyte ferroptosis to ameliorate age-related heart failure
2025-Mar-29, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-025-03317-x
PMID:40158134
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学分析探究了负载STAT3激动剂的抗氧化多酚纳米颗粒通过介导心肌细胞铁死亡改善年龄相关性心力衰竭的作用机制 | 开发了新型抗氧化多酚纳米颗粒PN@Col，首次结合单细胞RNA测序和AUCell分析揭示STAT3在心力衰竭中的关键作用，并验证其通过减轻氧化应激和铁死亡改善心脏功能 | 研究主要基于小鼠模型，临床转化仍需进一步验证；样本规模有限 | 探究新型纳米颗粒治疗剂对年龄相关性心力衰竭的治疗效果及作用机制 | 心肌细胞、老年心力衰竭小鼠模型 | 单细胞多组学 | 心力衰竭 | 单细胞RNA测序、AUCell分析、细胞实验、动物实验 | NA | 基因表达数据、实验数据 | 老年心力衰竭小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4909 | 2025-10-15 |
Data-driven fine-grained region discovery in the mouse brain with transformers
2025-Feb-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.05.05.592608
PMID:38766132
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研究论文 | 提出一种基于Transformer的自监督空间域检测工作流程CellTransformer，用于小鼠大脑精细区域发现 | 开发了新颖的编码器-解码器架构CellTransformer，能够分层学习组织特征，并实现多百万细胞数据集的扩展分析 | NA | 解决器官尺度空间转录组数据分析中的关键瓶颈，实现精细组织空间域的检测 | 小鼠大脑组织 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，自监督学习 | Transformer，编码器-解码器架构 | 空间转录组数据 | 900万细胞，200多个组织切片，4只小鼠 | NA | 空间转录组学，MERFISH，Slide-seqV2 | NA | NA |
| 4910 | 2025-10-11 |
Reduced Availability of Essential Amino Acids Disrupts Differentiation of Anorexigenic POMC Neurons in the Fetal Rat Hypothalamus
2025-Nov, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-05201-z
PMID:40681826
|
研究论文 | 本研究探讨妊娠期蛋白质限制对胎儿下丘脑发育的影响，特别是对调节食欲和能量平衡的神经元群体形成的影响 | 首次揭示必需氨基酸减少通过mTOR信号通路和表观遗传机制选择性破坏ISL1前体细胞向POMC神经元分化 | 仅研究了特定发育窗口期，需要进一步研究其他发育阶段 | 探究宫内生长受限与长期代谢紊乱风险的机制联系 | 妊娠期蛋白质限制的大鼠模型及其胎儿下丘脑发育 | 发育生物学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序, EdU标记, 免疫组织化学, RNAscope, mTOR信号分析, DNA甲基化分析 | NA | 基因表达数据, 组织图像, 甲基化数据 | 妊娠15天和17天的大鼠胎儿下丘脑组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4911 | 2025-10-11 |
Engineering CRISPR System-Based Bacterial Outer Membrane Vesicle Potentiates T Cell Immunity for Enhanced Cancer Immunotherapy
2025-Oct, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202501565
PMID:40495695
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研究论文 | 本研究开发了一种基于CRISPR系统的工程化细菌外膜囊泡，用于增强T细胞免疫以改善癌症免疫治疗 | 通过工程化改造大肠杆菌BL21来源的外膜囊泡，实现了多基因的高效包装和递送，显著增强了T细胞的趋化和活化能力 | 研究主要在小鼠模型中进行验证，在人类患者中的有效性和安全性仍需进一步评估 | 开发新型癌症免疫治疗策略，克服免疫检查点阻断治疗的局限性 | 细菌外膜囊泡(OMVs)、T细胞免疫、癌症免疫治疗 | 生物医学工程 | 膀胱癌、乳腺癌 | CRISPR系统、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据、单细胞转录组数据 | MB49和B16F10小鼠肿瘤模型、人源化小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4912 | 2025-10-11 |
Inhibition of methylthioadenosine phosphorylase protects from experimental acute kidney injury
2025-Aug-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00138.2025
PMID:40602784
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研究论文 | 本研究通过抑制甲基硫代腺苷磷酸化酶(MTAP)在小鼠急性肾损伤模型中展示保护作用 | 首次证明MTAP抑制在实验性急性肾损伤中的保护作用，并通过单细胞RNA测序在人类AKI活检中验证其表达特征 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据仅为观察性分析，缺乏临床干预验证 | 探索MTAP抑制对急性肾损伤的保护机制及治疗潜力 | 小鼠急性肾损伤模型和人类肾脏单细胞RNA测序数据 | 肾脏病学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序，转录组分析 | NA | 基因表达数据，组织病理学数据 | 小鼠实验模型和人类肾脏活检样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4913 | 2025-10-11 |
Kidney organoids demonstrate that PTH1R drives a cystogenic cAMP-pPKA-pCREB axis in developmental polycystic kidney disease
2025-Aug-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00056.2025
PMID:40602764
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研究论文 | 本研究利用肾脏类器官模型揭示了PTH1R在发育性多囊肾病中驱动囊肿形成的cAMP-pPKA-pCREB信号轴 | 首次发现PTH1R作为G蛋白偶联受体在发育性多囊肾病中启动囊肿形成信号级联反应 | 研究主要基于体外类器官模型，缺乏体内验证 | 探索发育性多囊肾病的囊肿形成机制和潜在治疗靶点 | 人类诱导多能干细胞衍生的ARPKD类器官、等基因野生型类器官、人类ARPKD组织 | 发育生物学 | 多囊肾病 | 单细胞RNA测序、靶向机制研究 | 肾脏类器官模型 | 基因表达数据、组织学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4914 | 2025-10-08 |
The transcription factor LHX2 mediates and enhances oncogenic BMP signaling in medulloblastoma
2025-Oct, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-025-01488-6
PMID:40148468
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子LHX2在髓母细胞瘤中介导并增强致癌性BMP信号通路的分子机制 | 首次发现LHX2通过转录诱导BMP I型受体ACVR1表达，形成BMP信号的正反馈环路，并证实其在肿瘤干细胞特性和化疗耐药中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验，临床转化价值需进一步验证 | 探索BMP信号通路在髓母细胞瘤中的作用机制 | 髓母细胞瘤患者来源的肿瘤样本和细胞模型 | 癌症生物学 | 髓母细胞瘤 | 空间转录组学、转录组分析、免疫组织化学、细胞移植 | 小鼠异种移植模型 | 基因表达数据、蛋白质定位数据 | 多个髓母细胞瘤亚组的患者来源肿瘤样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4915 | 2025-10-08 |
AI-Driven Analysis Unveils Functional Dynamics of Müller Cells in Retinal Autoimmune Inflammation
2025-May-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.28.640907
PMID:40093069
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研究论文 | 通过AI驱动的单细胞RNA测序分析揭示视网膜自身免疫炎症中Müller细胞的功能动态 | 首次使用AI辅助工具SCassist系统分析Müller细胞亚群功能，发现活化Müller细胞表达免疫检查点分子调控Th1细胞活性的新机制 | 研究基于Aire-/-小鼠模型，结果在人类视网膜中的适用性需要进一步验证 | 探究视网膜自身免疫炎症中Müller细胞的功能特性和与T细胞的相互作用 | Aire-/-小鼠视网膜中的Müller细胞和T细胞 | 单细胞转录组学 | 视网膜自身免疫炎症 | 单细胞RNA测序 | AI辅助分析工作流 | 单细胞转录组数据 | Aire-/-小鼠视网膜scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4916 | 2025-10-08 |
Machine learning predictions from unpredictable chaos
2025-Mar-19, ArXiv
PMID:40166748
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研究论文 | 本文提出了一种名为混沌学习的新型多尺度拓扑范式，能够从混沌系统中实现准确预测 | 首次引入混沌学习概念，通过多尺度拓扑拉普拉斯算子将现实世界数据嵌入混沌动力系统，实现了对混沌系统的定量预测 | 仅使用了28个数据集和两种混沌动力系统进行概念验证，需要更多样化的数据集和系统验证 | 探索混沌系统的可预测性并建立拓扑、混沌与学习之间的桥梁 | 脑电波、蛋白质数据集、单细胞RNA测序数据和图像数据 | 机器学习 | NA | 多尺度拓扑拉普拉斯算子 | 混沌学习模型 | 脑电波、蛋白质数据、单细胞RNA测序数据、图像数据 | 28个数据集（10个脑电波、4个蛋白质数据集、13个单细胞RNA测序数据集、1个图像数据集） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4917 | 2025-10-07 |
Transcriptomic profiling of vitiligo patients shows polar immune dysregulation in involved and uninvolved skin
2025-Oct, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2025.06.002
PMID:40513622
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研究论文 | 通过转录组分析揭示白癜风患者皮损和非皮损区域存在极化的免疫失调现象 | 首次全面揭示白癜风不仅皮损区域存在TH1/干扰素驱动的免疫异常，非皮损区域也表现出明显的TH2和TH17/22相关标志物上调 | 样本量相对有限（15例白癜风样本和14例健康对照），需要更大规模研究验证 | 获取白癜风皮损和非皮损区域的整体皮肤转录组特征 | 白癜风患者的皮损和非皮损皮肤活检样本 | 转录组学 | 白癜风 | RNA测序, 实时PCR, 免疫组织化学, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据, 基因表达数据 | 15例白癜风皮损和非皮损样本，14例匹配健康对照 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4918 | 2025-10-06 |
Protocol for single-cell spatial transcriptomic profiling of cultured cells and engineered tissues without embedding or sectioning
2025-Sep-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104074
PMID:40938748
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研究论文 | 本文提出了一种无需包埋或切片即可对培养细胞和工程组织进行单细胞空间转录组分析的新方案 | 开发了适用于标准包埋切片不兼容的2D工程组织和细胞培养物的空间转录组分析新方法 | NA | 建立适用于特殊样本类型的空间转录组分析技术方案 | 2D工程组织和细胞培养物 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组分析 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | Visium HD空间技术 |
| 4919 | 2025-10-06 |
Multi-omics analysis reveals the attenuation of the interferon pathway as a driver of chemo-refractory ovarian cancer
2025-Sep-16, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2025.102316
PMID:40885189
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研究论文 | 通过多组学分析揭示干扰素通路减弱是卵巢癌化疗耐药的关键驱动因素 | 首次发现化疗耐药卵巢癌中I型干扰素通路活性降低与缺氧通路增强的分子特征，并证实干扰素活性可独立预测化疗反应 | 样本量相对有限，需要更大规模研究验证 | 探索卵巢高级别浆液性癌化疗耐药的分子机制 | DECIDER观察性试验中化疗耐药卵巢癌患者的治疗前活检样本 | 多组学分析 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序,空间蛋白质分析,体外实验 | NA | 基因组学数据,转录组学数据,蛋白质组学数据 | DECIDER临床试验注册患者（NCT04846933） | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,多组学分析 | NA | NA |
| 4920 | 2025-10-06 |
Appendiceal B lymphocytes contribute to the pathogenesis of experimental colitis through fueling colonic CD4+ T polarization
2025-Sep-11, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2025.09.001
PMID:40945653
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研究论文 | 本研究揭示阑尾B淋巴细胞通过CCL20-CCR6轴迁移至结肠并促进CD4+ T细胞介导的Th1/Th17免疫反应，从而加剧实验性结肠炎 | 首次阐明阑尾B淋巴细胞通过特定迁移机制加剧结肠炎的具体病理机制，并提出阑尾口炎症可能代表溃疡性结肠炎的特殊亚型 | 研究主要基于动物模型，人类数据验证仍需进一步扩展 | 探究阑尾B淋巴细胞在实验性结肠炎发病机制中的作用 | 小鼠模型和溃疡性结肠炎患者的结肠组织 | 免疫学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞测序，免疫荧光共染色 | NA | 基因表达数据，组织图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |