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当前共找到 10557 篇文献，本页显示第 4841 - 4860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4841 | 2025-10-05 |
Systematic identification of oscillatory gene expression in single cell types
2025-Sep-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.02.673125
PMID:40950173
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和新型计算方法系统识别了单个细胞类型中的振荡基因表达 | 开发了识别振荡基因和细胞类型的严格统计方法，首次在胶质细胞等被忽视的细胞类型中发现振荡基因表达 | 未在神经元或肌肉细胞中检测到振荡基因表达，可能存在技术检测限制 | 系统识别单个细胞类型中的振荡基因表达模式 | 果蝇幼虫发育过程中的各种细胞类型 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序, PCA分析, UMAP分析 | 统计模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4842 | 2025-10-05 |
Absolute copy number aware CNV calling of sub-megabase segments in ultra-low coverage single-cell DNA sequencing data
2025-Sep-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaf919
PMID:40973453
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研究论文 | 提出ASCENT计算方法，用于超低覆盖度单细胞DNA测序数据中的拷贝数变异检测 | 基于统计建模而非参考比较实现真正的绝对拷贝状态推断，并实现无需参考的拷贝中性杂合性缺失检测 | 未提及具体样本数量限制或方法适用范围 | 开发适用于超低覆盖度单细胞DNA测序数据的拷贝数变异检测方法 | 单细胞DNA测序数据，特别是儿科B-ALL样本 | 生物信息学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | 全基因组测序，单细胞DNA测序 | 统计建模，联合分割方法 | DNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞DNA测序，全基因组测序 | NA | 基于直接tagmentation的全基因组测序 |
| 4843 | 2025-10-05 |
Morphogen-guided neocortical organoids recapitulate regional areal identity and model neurodevelopmental disorder pathology
2025-Sep-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.09.02.672952
PMID:40950130
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研究论文 | 本研究开发了一种通过形态发生素引导生成具有区域特异性的大脑皮层类器官的方法，并利用该平台模拟神经发育障碍病理 | 通过短期早期暴露于前部或后部形态发生素，建立了能够重现大脑皮层区域特性的类器官模型 | 当前的大脑皮层类器官模型在很大程度上未能重现这种区域化模式 | 建立能够模拟大脑皮层区域特性并研究神经发育障碍病理的平台 | 人类新皮层类器官和脆性X综合征模型 | 发育神经生物学 | 神经发育障碍 | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4844 | 2025-10-05 |
Multi-omics investigation of Bisphenol A in gastrointestinal carcinogenesis: a network toxicology and molecular docking approach
2025-Sep, Environment international
IF:10.3Q1
DOI:10.1016/j.envint.2025.109785
PMID:40939530
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研究论文 | 通过多组学方法和分子对接技术研究双酚A在胃肠道肿瘤发生中的致癌机制 | 首次系统整合转录组学和单细胞转录组学数据，揭示BPA通过代谢重编程、肿瘤微环境重塑和细胞周期失调三重机制促进胃肠道肿瘤发生 | 基于数据库分析，需要进一步实验验证 | 系统研究双酚A在胃肠道肿瘤中的潜在致癌机制 | 肝内胆管癌、结直肠癌和食管癌三种胃肠道肿瘤 | 生物信息学 | 胃肠道肿瘤 | 网络毒理学、分子对接、转录组学、单细胞转录组学 | 分子对接模型 | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4845 | 2025-10-05 |
Scaling up spatial transcriptomics for large-sized tissues: uncovering cellular-level tissue architecture beyond conventional platforms with iSCALE
2025-Sep, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02770-8
PMID:40954300
|
研究论文 | 本研究开发了iSCALE方法，用于重建大规模超分辨率基因表达图谱并自动注释超出当前空间转录组平台捕获区域样本的细胞级组织结构 | 突破了现有空间转录组技术在成本、周转时间、分辨率、基因覆盖度和组织捕获面积方面的限制，能够分析超出常规平台捕获范围的大型组织样本 | 未明确说明样本数量的限制或方法在其他组织类型中的适用性 | 开发能够分析大型组织样本的空间转录组方法，揭示传统方法无法检测的细胞特征 | 多发性硬化症人类脑组织样本 | 空间转录组学 | 多发性硬化症 | 空间转录组学，免疫组织化学染色 | NA | 基因表达数据，空间位置数据，病理学注释 | NA | NA | 空间转录组学 | iSCALE | 能够重建大规模超分辨率基因表达图谱并自动注释细胞级组织结构的方法 |
| 4846 | 2025-10-05 |
A basophil-fibroblast pro-inflammatory axis fuels type 2 skin inflammation
2025-Aug-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116114
PMID:40782349
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研究论文 | 本研究通过单细胞时空图谱揭示了嗜碱性粒细胞与成纤维细胞之间的促炎轴在2型皮肤炎症中的关键调控作用 | 首次发现嗜碱性粒细胞通过分泌OSM和IL-4协同激活促炎性成纤维细胞，形成正向反馈环路驱动皮肤炎症 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证仍需进一步开展 | 阐明2型皮肤炎症的细胞分子机制 | 小鼠皮肤炎症模型中的细胞相互作用 | 单细胞生物学 | 特应性皮炎 | MERFISH, scRNA-seq | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 约430,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4847 | 2025-10-05 |
A spatiotemporal atlas of orchiectomy-induced androgen deprivation-mediated modulation of cellular composition and gene expression in the mouse prostate
2025-Jul-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.07.11.664414
PMID:40791419
|
研究论文 | 通过整合空间转录组学和单细胞分析，构建了小鼠前列腺在阉割诱导雄激素剥夺后的细胞组成和基因表达时空图谱 | 发现了一种新的成纤维细胞亚型（OIF），并揭示了前列腺不同叶在雄激素剥夺后的特异性时空基因表达变化和细胞间通讯动态 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 解析雄激素剥夺治疗对前列腺细胞组成和基因表达的影响 | 小鼠前列腺组织 | 空间转录组学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 小鼠前列腺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4848 | 2025-10-05 |
Simultaneous inference for generalized linear models with unmeasured confounders
2025-Jun-06, Journal of the American Statistical Association
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/01621459.2025.2485379
PMID:40964623
|
研究论文 | 提出一种在存在未测量混杂因素的情况下进行广义线性模型大规模假设检验的统一框架 | 利用正交结构和线性投影开发了三阶段估计与推断框架，能够在任意混杂机制下有效控制错误发现率 | 需要样本量和响应尺寸趋于无穷大才能保证渐近检验的有效性 | 解决基因组研究中存在未测量混杂因素时的大规模假设检验问题 | 广义线性模型中的多元假设检验 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 广义线性模型, Lasso | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4849 | 2025-10-05 |
Rare Subset of T Cells Form Heterotypic Clusters with Circulating Tumor Cells to Foster Cancer Metastasis
2025-Apr-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.01.646421
PMID:40236049
|
研究论文 | 本研究揭示了一种罕见的CD4和CD8双阳性T细胞通过与循环肿瘤细胞形成异质性簇促进癌症转移的新机制 | 首次发现罕见的CD4/CD8双阳性T细胞在CTC-WBC簇中显著富集，并鉴定VLA4-VCAM1相互作用是簇形成的关键介质 | 研究主要基于晚期乳腺癌患者样本，需要验证是否适用于其他癌症类型和早期患者 | 探索外周血免疫细胞与循环肿瘤细胞的相互作用机制及其在癌症转移中的作用 | 晚期乳腺癌患者的血液样本和临床前小鼠模型 | 癌症生物学 | 乳腺癌 | 流式细胞术, ImageStream分析, 单细胞RNA测序, 基因扰动研究 | NA | 血液样本, 测序数据, 图像数据 | 1,529例乳腺癌患者血液标本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4850 | 2025-10-05 |
Simultaneous inference for generalized linear models with unmeasured confounders
2025-Mar-15, ArXiv
PMID:37744467
|
研究论文 | 提出一种在存在未测量混杂因素情况下进行广义线性模型大规模假设检验的统一框架 | 利用正交结构和线性投影，通过三阶段方法在任意混杂机制下解耦边际和无关混杂效应 | 需要样本量和响应尺寸趋于无穷大才能保证渐近z检验的有效性 | 解决基因组研究中存在未测量混杂因素时的大规模假设检验问题 | 广义线性模型中的多元假设检验 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 广义线性模型, Lasso | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4851 | 2025-10-05 |
Scaling up spatial transcriptomics for large-sized tissues: uncovering cellular-level tissue architecture beyond conventional platforms with iSCALE
2025-Mar-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.25.640190
PMID:40060412
|
研究论文 | 开发了一种名为iSCALE的空间转录组学方法，用于分析超出标准平台捕获区域的大尺寸组织 | 能够预测超分辨率基因表达并自动注释大尺寸组织的细胞级组织结构，突破了现有空间转录组学平台的组织捕获区域限制 | NA | 解决现有空间转录组学技术在大尺寸组织分析中的限制 | 多发性硬化症人脑样本 | 空间转录组学 | 多发性硬化症 | 空间转录组学，免疫组织化学染色 | NA | 基因表达数据，空间位置数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4852 | 2025-10-05 |
DUX4-stimulated genes define the antiviral response to herpesviruses in human trophoblasts
2025-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.22.634317
PMID:39896594
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研究论文 | 本研究通过人类滋养细胞类器官揭示了DUX4及其刺激基因在抗疱疹病毒防御中的关键作用 | 发现疱疹病毒在滋养细胞中不触发干扰素反应，而是特异性诱导DUX4及其下游基因表达，这代表了一种新型抗病毒防御机制 | 研究仅限于七种致畸病毒，且主要关注疱疹病毒亚群 | 探索滋养细胞对致畸病毒的转录反应机制 | 人类滋养细胞类器官 | 转录组学 | 病毒感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 人类滋养细胞类器官暴露于七种致畸病毒 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4853 | 2025-10-05 |
DWI-based Biologically Interpretable Radiomic Nomogram for Predicting 1-year Biochemical Recurrence after Radical Prostatectomy: A Deep Learning, Multicenter Study
2025, Current medical imaging
IF:1.1Q3
|
研究论文 | 开发基于DWI的深度学习放射组学列线图预测前列腺癌根治术后1年生化复发 | 首次将深度学习提取的放射组学特征与临床参数结合构建预测模型，并探索放射组学评分与肿瘤微环境的关联 | 回顾性研究设计，样本量有限（n=349），单细胞RNA测序数据仅来自4名患者 | 预测前列腺癌根治术后1年生化复发风险 | 接受前列腺癌根治术的患者 | 医学影像分析 | 前列腺癌 | 扩散加权成像，单细胞RNA测序，深度学习 | 3D U-Net, Cox比例风险回归 | 医学影像，临床数据，基因表达数据 | 349名患者（两个独立队列），4名患者单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序，多参数磁共振成像 | NA | NA |
| 4854 | 2025-10-05 |
Blood Single-Cell Transcriptomic and Proteomic Signatures of Paradoxical Eczema in Patients with Psoriasis Treated with Biologics
2025-Oct, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2025.02.153
PMID:40157420
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和质谱流式技术揭示了银屑病患者接受生物制剂治疗后出现矛盾性湿疹的分子机制 | 首次在单细胞水平揭示了矛盾性湿疹的炎症特征，并发现趋化因子和TNF通路信号传导的遗传易感性独立于已知的特应性风险位点 | 样本量相对有限，需要在更大规模的研究中验证发现 | 探究银屑病患者接受生物制剂治疗后出现矛盾性湿疹的发病机制 | 接受生物制剂治疗的银屑病患者 | 单细胞组学 | 银屑病，湿疹 | 单细胞RNA测序，质谱流式技术 | NA | 单细胞转录组数据，蛋白质组数据 | 未明确具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序，质谱流式细胞术 | NA | NA |
| 4855 | 2025-10-05 |
Targeting ribosomes reprograms the tumour microenvironment and augments cancer immunotherapy
2025-Oct, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03109-y
PMID:40646287
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研究论文 | 本研究通过靶向核糖体生物合成重塑肿瘤微环境并增强癌症免疫治疗效果 | 首次揭示核糖体生物合成阻断对肿瘤微环境中免疫细胞的调控作用，发现对免疫治疗敏感的关键免疫细胞亚群 | 研究主要基于临床前模型，在人体中的具体效果需要进一步验证 | 探索核糖体生物合成阻断对肿瘤免疫微环境的重编程作用及其对免疫治疗的增强效应 | 免疫活性小鼠模型、人类单细胞RNA测序数据、临床样本 | 肿瘤免疫学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据、临床样本数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4856 | 2025-10-05 |
DiSTect: a Bayesian model for disease-associated gene discovery and prediction in spatial transcriptomics
2025-Sep-22, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf530
PMID:40981505
|
研究论文 | 提出一种名为DiSTect的贝叶斯收缩模型，用于空间转录组学中的疾病相关基因发现和预测 | 通过自回归项整合组织点的空间相关性，采用分层结构分析多个相关样本，并能处理组织内的缺失数据 | NA | 识别疾病指示基因并预测组织点的疾病状态 | HER2阳性乳腺癌和阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | 乳腺癌,阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | 贝叶斯收缩模型 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4857 | 2025-10-05 |
CLUEY enables knowledge-guided clustering and cell type detection from sinlge-cell omics data
2025-Sep-22, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf528
PMID:40981522
|
研究论文 | 提出了一种名为CLUEY的知识引导框架，用于单细胞组学数据的细胞类型检测和聚类分析 | 将先验生物学知识整合到聚类过程中，为最佳聚类数量提供指导并增强结果的可解释性 | NA | 解决单细胞组学数据聚类分析中的主观性问题，提供更可靠的细胞类型检测方法 | 单细胞组学数据，包括单模态（如scRNA-seq、scATAC-seq）和多模态数据集（如CITE-seq、SHARE-seq） | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，单细胞ATAC测序，多组学测序 | 知识引导聚类框架 | 单细胞组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 4858 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing identifies CD8Teff cell activation as a predictive biomarker in triple-negative breast cancer immunotherapy
2025-Sep-19, Molecular biomedicine
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s43556-025-00306-2
PMID:40971094
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析三阴性乳腺癌免疫微环境，发现CD8效应T细胞活化可作为免疫治疗疗效预测标志物 | 首次系统揭示CD8Teff细胞在三阴性乳腺癌免疫治疗中的预测价值，并发现CXCL13作为关键调节因子 | 未明确说明样本量大小和研究队列的具体特征 | 探索三阴性乳腺癌免疫治疗的疗效预测生物标志物 | 三阴性乳腺癌患者肿瘤样本 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 转录组分析 | 人工智能模型 | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据, 病理图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4859 | 2025-10-05 |
Multi-omics Approaches to CCAAT/Enhancer-Binding Protein Beta in Oral Squamous Cell Carcinoma: Crosstalk Between Tumor Cells and Tumor-Associated Macrophages Driving Disease Progression
2025-Sep-18, Current cancer drug targets
IF:2.3Q3
|
研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示CEBPB通过激活GAS6转录促进口腔鳞癌转移的分子机制 | 首次发现CEBPB通过调控GAS6增强子活性介导肿瘤细胞与巨噬细胞相互作用 | 研究主要基于公共数据库数据，实验验证仍需进一步扩展 | 探究CEBPB在口腔鳞癌中调控肿瘤细胞与免疫细胞相互作用的表观遗传机制 | 口腔鳞癌细胞与肿瘤相关巨噬细胞 | 生物信息学 | 口腔鳞状细胞癌 | RNA-seq, ChIP-seq, scRNA-seq, ChIP-qPCR, ELISA, Transwell实验 | HOMER算法, Seurat分析 | 基因组数据, 表观遗传数据, 单细胞数据 | 来自TCGA和GEO数据库的多组学数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, ChIP-seq | NA | NA |
| 4860 | 2025-10-05 |
Unraveling the Role of Perivascular Macrophages in Alzheimer's Disease: Insights from the Crosstalk between Immunometabolism and Ferroptosis
2025-Sep-18, Current neuropharmacology
IF:4.8Q1
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了血管周巨噬细胞在阿尔茨海默病中通过免疫代谢与铁死亡相互作用发挥保护作用的分子机制 | 首次在血管周巨噬细胞中鉴定出8个与阿尔茨海默病风险呈负相关的关键基因，并揭示了这些基因通过免疫代谢与铁死亡相互作用的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证来确认分子机制 | 探讨血管周巨噬细胞在阿尔茨海默病发病机制中的作用，特别关注免疫代谢与铁死亡的相互作用 | 阿尔茨海默病患者和对照组的血管周巨噬细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 差异表达基因分析 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 来自GEO数据库的AD患者和对照组样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |