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当前共找到 10653 篇文献，本页显示第 4801 - 4820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4801 | 2025-10-06 |
Regulatory mechanisms of the Hippo/YAP axis by G-protein coupled estrogen receptor in gastric signet-ring cell carcinoma
2025-09, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2025.101199
PMID:40554953
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研究论文 | 本研究揭示了G蛋白偶联雌激素受体通过调控Hippo/YAP信号轴在胃印戒细胞癌中的致癌机制 | 首次在胃印戒细胞癌中发现GPER通过竞争性结合ARRB2抑制LATS1介导的YAP磷酸化，并揭示GPER与YAP之间存在的正反馈循环机制 | 研究主要基于细胞系和异种移植模型，缺乏临床患者样本的验证 | 阐明GPER在胃印戒细胞癌中调控Hippo/YAP信号轴的功能机制 | 胃印戒细胞癌细胞系和裸鼠异种移植模型 | 癌症生物学 | 胃癌 | 单细胞测序，体外细胞功能实验，体内异种移植模型 | NA | 测序数据，实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4802 | 2025-10-06 |
Novel Transcriptomic Signatures in Fibrostenotic Crohn's Disease: Dysregulated Pathways, Promising Biomarkers, and Putative Therapeutic Targets
2025-Jun-13, Inflammatory bowel diseases
IF:4.5Q1
DOI:10.1093/ibd/izaf021
PMID:39977234
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研究论文 | 本研究通过转录组学分析探索克罗恩病纤维狭窄的分子特征，识别关键生物标志物和治疗靶点 | 首次系统揭示克罗恩病纤维狭窄的独特转录组特征，结合机器学习方法识别特异性基因表达模式 | 样本量较小（仅9例患者），需要在更大队列中验证发现 | 探索克罗恩病纤维狭窄的转录组特征及其生物学机制 | 克罗恩病患者手术切除的纤维狭窄肠道组织 | 转录组学 | 克罗恩病 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序, qPCR | 随机森林 | RNA测序数据 | 9例克罗恩病患者 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | 10x Chromium Controller | 10x Chromium单细胞测序平台 |
| 4803 | 2025-10-06 |
Comparison of differences in transcriptional and genetic profiles between intra-central nervous system and extra-central nervous system large B-cell lymphoma
2025-02, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2024.101119
PMID:39733690
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研究论文 | 通过多组学测序比较中枢神经系统内和中枢神经系统外大B细胞淋巴瘤的转录和遗传特征差异 | 首次通过单细胞RNA测序和全外显子测序系统揭示PCNS-DLBCL特有的B细胞亚群、免疫抑制微环境和BCR-NFkB/TLR通路突变特征 | 样本量相对有限（93例患者），且为观察性研究 | 探索PCNS-DLBCL的特定发病机制和治疗靶点 | PCNS-DLBCL、继发性CNS-DLBCL和颅外DLBCL患者的肿瘤样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 全外显子测序, 多组学测序 | NA | 转录组数据, 基因组数据 | 93例患者肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 全外显子组测序 | NA | NA |
| 4804 | 2025-10-06 |
Overexpression of CX3CL1-CX3CR1 Signaling in the Stria Vascularis rather than the Basilar Membrane May Be the Trigger for Inflammaging in the Cochlea
2025, ORL; journal for oto-rhino-laryngology and its related specialties
DOI:10.1159/000545134
PMID:40058359
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现CX3CL1-CX3CR1信号通路在耳蜗血管纹基底细胞中的过表达可能是老年性听力损失中炎症衰老的触发因素 | 首次通过单细胞RNA测序揭示CX3CL1-CX3CR1信号通路在耳蜗不同区域的分布差异及其在炎症衰老中的特异性作用 | 仍需进一步的体内干预实验验证研究结论 | 探究CX3CL1-CX3CR1信号通路在耳蜗炎症衰老中的作用机制 | 年轻和老年小鼠的耳蜗组织及BV2细胞系 | 单细胞转录组学 | 老年性听力损失 | 单细胞RNA测序, 免疫荧光, 实时定量PCR, Western blot, 细胞迁移实验 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据, 蛋白质数据 | 年轻和老年小鼠的耳蜗组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4805 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing on PBMCs from patients with HA and HB with inhibitors reveals different immune responses to FVIII and FIX
2025-Aug-12, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2025015799
PMID:40402102
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研究论文 | 通过单细胞测序分析血友病A和血友病B伴抑制剂患者外周血单个核细胞的免疫应答差异 | 首次在单细胞水平比较血友病A和血友病B伴抑制剂患者对FVIII和FIX的不同免疫应答机制 | 样本量较小（各5例患者），需更大样本验证 | 探索血友病A和血友病B患者对FVIII和FIX的不同免疫应答机制 | 血友病A和血友病B伴抑制剂患者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 血友病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5例HA患者和5例HB患者，共75,051个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4806 | 2025-10-06 |
DARLIN mouse for in vivo lineage tracing at high efficiency and clonal diversity
2025-08, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01141-z
PMID:40119004
|
研究论文 | 介绍DARLIN小鼠模型用于高效谱系追踪的逐步实验方案 | 整合三个条形码阵列并结合Cas9和TdT提高编辑多样性，理论上可产生10^10个独特谱系条形码 | 需要熟悉测序文库构建和Linux操作，单细胞分析中条形码回收率约70% | 开发高效谱系追踪技术研究组织发育和稳态中的细胞历史与动力学 | 小鼠模型中的细胞谱系 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序，bulk测序，CRISPR-Cas9编辑 | NA | 基因组测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4807 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA-Seq Reveals Aging-Related Impairment of Microglial Efferocytosis Contributing to Apoptotic Cells Accumulation After Retinal Injury
2025-Aug, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70097
PMID:40374315
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示衰老导致小胶质细胞清除凋亡细胞功能受损，造成视网膜损伤后凋亡细胞积累 | 首次在单细胞水平系统揭示衰老通过影响小胶质细胞清除凋亡细胞功能导致视网膜损伤后凋亡细胞积累的机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类视网膜衰老的验证尚需进一步研究 | 阐明衰老对视网膜小胶质细胞清除凋亡细胞功能的影响及其机制 | 年轻和老年小鼠视网膜细胞，BV2小胶质细胞系 | 单细胞转录组学 | 年龄相关性视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 74,412个视网膜细胞来自年轻和老年小鼠 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4808 | 2025-10-06 |
Circadian Gene BMAL1 Regulation of Cellular Senescence in Thyroid Aging
2025-Aug, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70119
PMID:40434135
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了昼夜节律基因BMAL1通过调控NFKBIA表达影响甲状腺细胞衰老的机制 | 首次发现昼夜节律核心基因BMAL1在甲状腺衰老过程中的关键作用及其通过NF-κB通路调控细胞衰老的新机制 | 研究样本量有限，机制研究主要基于动物模型和细胞系实验，在人体中的直接验证不足 | 探究甲状腺衰老的分子机制及昼夜节律基因在其中的作用 | 人类甲状腺组织、甲状腺特异性Bmal1敲除小鼠模型、甲状腺细胞系 | 单细胞生物学 | 甲状腺疾病 | 单细胞RNA测序, 转录组测序, 基因敲除 | 动物模型, 细胞系模型 | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | 年轻、中年和老年组的人类甲状腺样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4809 | 2025-10-06 |
Cross-Analysis of Single-Cell Transcriptomic Datasets Reveals Conserved Neurogenic Gene Signatures and New Insights Into Neural Stem Cell Aging
2025-Aug, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70106
PMID:40464165
|
研究论文 | 通过跨分析单细胞转录组数据集揭示神经干细胞保守的神经源性基因特征及其在衰老过程中的变化 | 识别了神经干细胞中保守的基因表达谱，提出了新的标记物作为标准化参考，并利用伪时间推断分析揭示神经干细胞的时间动态 | 依赖公开可用的单细胞RNA测序数据集，可能存在数据质量和注释不一致的问题 | 解决神经干细胞分子分类和功能研究中的挑战，优化其分类框架 | 海马体成人神经干细胞 | 单细胞转录组学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | 伪时间推断分析 | 单细胞转录组数据 | 多个公开单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4810 | 2025-10-06 |
Linking single-cell transcriptomes with secretion using SEC-seq
2025-07, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01112-w
PMID:39979460
|
研究论文 | 开发了一种名为SEC-seq的新方法，能够将单个细胞的转录组与其分泌蛋白量关联起来 | 首次实现了在单细胞水平上同时测量转录组和分泌蛋白量的技术，通过纳米孔技术和寡核苷酸条形码标记系统 | 需要特定的纳米孔技术和设备，可能对某些实验室来说设备要求较高 | 研究细胞分泌表型与基因表达状态之间的关联 | T细胞、间充质基质细胞、浆细胞等分泌型细胞 | 单细胞多组学 | NA | 单细胞RNA测序，流式细胞术，微流控技术 | NA | 单细胞转录组数据，分泌蛋白定量数据 | 数千个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 微流控油包水乳液系统 |
| 4811 | 2025-10-06 |
Integration of lipidomics with targeted, single cell, and spatial transcriptomics defines an unresolved pro-inflammatory state in colon cancer
2025-Mar-06, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332535
PMID:39658263
|
研究论文 | 本研究通过整合脂质组学与靶向、单细胞和空间转录组学，揭示了结肠癌中存在未解决的促炎症状态 | 首次将脂质组学与多种转录组学技术整合，系统揭示了结肠癌中脂质类别转换缺陷导致的促炎症状态持续存在 | 样本量相对有限（40例非靶向分析，81例靶向分析），需要更大规模研究验证 | 探索结直肠癌中脂质失调是否由炎症消退失败驱动 | 人类结直肠癌组织和正常配对样本 | 多组学整合分析 | 结直肠癌 | 液相色谱串联质谱(LC-MS/MS), 定量逆转录PCR, 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | 脂质组数据, 基因表达数据, 空间转录组数据 | 40对（非靶向分析）和81对（靶向分析）人结直肠癌与正常配对样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 脂质组学 | NA | NA |
| 4812 | 2025-10-06 |
TRain: T-cell receptor automated immunoinformatics
2025-Mar-06, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06074-8
PMID:40050726
|
研究论文 | 开发了一个名为TRain的自动化生物信息学工具，用于简化从T细胞受体序列到三维TCR-pMHC复合物结构预测的流程 | 首次提供了一个整合的自动化流程，将单细胞测序数据转换为完整的TCR氨基酸序列，并自动化进行TCR结构建模和与pMHC的对接预测 | 依赖于现有的TCR特异性建模流程和RosettaDock工具，可能受限于这些工具的准确性和局限性 | 开发自动化工具简化TCR-pMHC复合物结构预测流程 | T细胞受体和肽-MHC复合物 | 生物信息学 | 免疫相关疾病 | 单细胞测序，蛋白质结构建模，分子对接 | RosettaDock | 序列数据，结构数据 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 4813 | 2025-10-06 |
β-Catenin mediated TAM phenotype promotes pancreatic cancer metastasis via the OSM/STAT3/LOXL2 axis
2025-02, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2024.101096
PMID:39740539
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研究论文 | 本研究揭示了β-连环蛋白通过调控肿瘤相关巨噬细胞表型促进胰腺癌转移的新机制 | 首次发现β-连环蛋白信号在TAM中特异性激活，并鉴定出β-连环蛋白/OSM-STAT3/LOXL2信号轴在TAM诱导的胰腺癌进展中的关键作用 | 研究主要基于细胞系和动物模型，需要进一步在临床样本中验证 | 探究肿瘤相关巨噬细胞促进胰腺导管腺癌进展的分子机制 | 胰腺导管腺癌细胞、THP-1来源的巨噬细胞、Panc02肺转移模型 | 肿瘤生物学 | 胰腺癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 体外共培养, 体内转移模型 | NA | 基因表达数据, 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4814 | 2025-10-06 |
Experimental and Computational Methods for Allelic Imbalance Analysis from Single-Nucleus RNA-seq Data
2025-Jan-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.08.13.607784
PMID:39185246
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研究论文 | 本文开发了一套用于单细胞和单核RNA测序数据的等位基因特异性表达分析的实验与计算方法 | 发现单核RNA测序中内含子区域读长更适合等位基因失衡分析，并开发了新的计算工具套件 | NA | 改进单细胞水平等位基因特异性表达分析的方法 | 单细胞RNA测序和单核RNA测序数据 | 生物信息学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 等位基因特异性表达分析 | NA | RNA测序数据 | 94名帕金森病患者队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
| 4815 | 2025-10-06 |
Tcf21 as a founder transcription factor in specifying Foxd1 cells to the juxtaglomerular cell lineage
2025-Jan-01, American journal of physiology. Renal physiology
DOI:10.1152/ajprenal.00235.2024
PMID:39589156
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子Tcf21在Foxd1阳性基质祖细胞向肾小球旁细胞谱系分化过程中的关键作用 | 首次通过整合单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序分析，揭示了Tcf21在肾脏发育早期阶段对Foxd1细胞向肾小球旁细胞分化的关键调控作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类肾脏发育中的类似机制仍需进一步验证 | 探究Tcf21转录因子在Foxd1阳性基质祖细胞向肾小球旁细胞分化过程中的作用机制 | 小鼠肾脏Foxd1阳性基质祖细胞和肾小球旁细胞 | 发育生物学 | 肾脏发育疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, 免疫染色, 原位杂交 | 小鼠基因敲除模型 | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据, 组织图像数据 | 2,054个细胞（来自E12、E18、P5和P30时间点的GFP阳性基质谱系细胞） | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | NA |
| 4816 | 2025-10-06 |
Spatial proteomics and transcriptomics characterization of tissue and multiple cancer types including decalcified marrow
2025-Jan, Cancer biomarkers : section A of Disease markers
IF:2.2Q3
DOI:10.1177/18758592241308757
PMID:40109220
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研究论文 | 本研究优化了空间生物学技术的前处理方法，开发了适用于多种肿瘤类型和脱钙骨髓样本的空间蛋白质组学和转录组学分析方案 | 开发了分子和蛋白质友好的脱钙方案，建立了系统性的组织质量评估方法，实现了空间蛋白质组学和转录组学平台的相互验证 | 未明确说明样本规模和具体的统计验证方法 | 优化空间生物学技术的前处理方法，解决不同组织和肿瘤类型的技术挑战 | 多癌种组织微阵列和脱钙处理的骨髓核心样本 | 空间生物学 | 多癌种 | 空间蛋白质组学, 空间转录组学, 高重免疫组织化学 | 单细胞分析 | 空间蛋白质表达数据, 空间转录组数据 | 多癌种组织微阵列和骨髓核心样本 | 10x Genomics, Akoya Biosciences | 空间转录组学, 空间蛋白质组学, 单细胞分析 | Xenium, PhenoCycler-Fusion | Xenium空间转录组学平台, PhenoCycler-Fusion高重空间蛋白质组学平台 |
| 4817 | 2025-10-06 |
Identification and Construction of a R-loop Mediated Diagnostic Model and Associated Immune Microenvironment of COPD through Machine Learning and Single-Cell Transcriptomics
2025-Aug, Inflammation
IF:4.5Q2
DOI:10.1007/s10753-024-02232-x
PMID:39798034
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研究论文 | 通过机器学习和单细胞转录组学构建R-loop介导的COPD诊断模型并分析其免疫微环境特征 | 首次系统研究R-loop调节因子在COPD中的作用，利用12种机器学习算法识别关键R-loop调节因子，建立基于14个R-loop调节因子的风险评分模型并发现两种不同COPD亚型 | 研究样本量未明确说明，部分发现仅在动物模型中验证 | 探索R-loop调节因子在慢性阻塞性肺疾病(COPD)发病机制中的作用并构建诊断模型 | COPD患者肺组织、小鼠肺组织 | 机器学习, 单细胞转录组学 | 慢性阻塞性肺疾病 | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序, RT-PCR | 机器学习算法(12种算法150种组合) | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 4818 | 2025-10-06 |
PD-L1 Promotes Immunological Tolerance and Enhances Visual Protection of hESC-RPE Grafts in Retinal Degeneration
2025-Aug, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.70007
PMID:39953740
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研究论文 | 本研究探讨PD-L1过表达在改善人胚胎干细胞来源视网膜色素上皮细胞移植治疗年龄相关性黄斑变性中的免疫保护作用 | 提出无需删除MHC基因仅通过PD-L1过表达即可增强hESC-RPE移植物存活和视觉保护的新策略 | 研究主要聚焦于PD-L1的免疫调节作用，未全面评估其他免疫检查点的潜在影响 | 探索PD-L1过表达对hESC-RPE移植免疫耐受和视觉功能保护的作用机制 | 人胚胎干细胞来源视网膜色素上皮细胞和视网膜退行性病变模型 | 细胞治疗 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4819 | 2025-10-06 |
Exploration of heterogeneity and recurrence signatures in hepatocellular carcinoma
2025-Aug, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.70012
PMID:40018995
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研究论文 | 本研究通过整合分析肝细胞癌的单细胞RNA测序数据，揭示了复发肿瘤的异质性特征并构建了复发预后模型 | 首次系统揭示肝细胞癌复发过程中的细胞异质性变化，识别MIF-(CD74+CXCR4)信号通路的关键作用，并开发了基于机器学习的新型复发风险评分模型 | 研究样本量有限，需要更大规模队列验证模型的普适性 | 探索肝细胞癌复发异质性特征并开发预后预测模型 | 肝细胞癌患者样本和小鼠移植模型 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq, 机器学习, RT-qPCR, 免疫组化 | 机器学习模型 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4820 | 2025-10-06 |
Time, the final frontier
2025-Aug, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.70025
PMID:40126098
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评论 | 本文主张将时间动态维度整合到癌症研究中，强调从传统终点实验向数据驱动的连续方法转变 | 提出将时间动态分析作为癌症研究的新前沿，强调开发活体成像技术、时间组学方法和计算工具来探索肿瘤演化过程 | NA | 推动癌症研究从静态分析向动态时间维度整合的范式转变 | 肿瘤生态系统及其时间演化过程 | 数字病理学 | 癌症 | 活体成像技术、时间组学方法、计算分析 | NA | 时间序列数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |