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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 461 | 2025-12-13 |
Comprehensive analysis of the PLXNA3 gene on prognosis and immune characteristics in breast cancer
2025-Aug-04, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-13843-1
PMID:40760011
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研究论文 | 本研究通过分析PLXNA3基因在乳腺癌中的表达、预后意义及其对肿瘤免疫微环境的影响,揭示了其作为乳腺癌不良预后指标和潜在治疗靶点的重要性 | 首次在乳腺癌中系统研究PLXNA3的生物学功能,发现其高表达与肿瘤恶性程度、不良预后及抗PD1免疫治疗反应差相关,并明确了其在肿瘤细胞簇而非免疫细胞中的特异性富集 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏大规模临床队列验证和体内动物模型实验 | 探究PLXNA3基因在乳腺癌中的预后价值、生物学功能及其与肿瘤免疫微环境的相互作用 | 乳腺癌细胞、乳腺癌患者的转录组数据 | 生物信息学与肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | bulk RNA测序、单细胞RNA测序、体外细胞功能实验 | NA | RNA测序数据、临床生存数据、细胞实验数据 | 未明确具体样本数量,基于公共数据库和体外细胞系 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 462 | 2025-12-13 |
The Genomics of Aging at the Single-Cell Scale
2025-08, Annual review of genomics and human genetics
IF:7.7Q1
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在研究衰老相关细胞变化中的应用,总结了衰老对哺乳动物器官中细胞类型特异性种群的影响 | 通过整合近期单细胞研究,系统性地总结了衰老对哺乳动物全身细胞类型特异性种群的影响,填补了系统性理解衰老相关细胞变化的知识空白 | NA | 阐明衰老对哺乳动物器官中细胞类型特异性种群变化的影响,为衰老及相关疾病提供潜在治疗靶点 | 哺乳动物器官中的细胞类型特异性种群 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 463 | 2025-12-13 |
Evolution of SARS-CoV-2 T cell responses as a function of multiple COVID-19 boosters
2025-Jul-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.115907
PMID:40580476
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研究论文 | 本研究通过一项为期3年的队列研究,探讨了重复接种COVID-19疫苗对适应性免疫的长期影响 | 首次通过长达3年的纵向研究,结合单细胞RNA测序技术,系统揭示了重复疫苗接种后T细胞反应的动态变化与表型特征,并发现了无症状感染对免疫应答的独特影响 | 样本量相对较小(78人),且依赖于自我报告的无症状感染证据,可能存在漏报或误报 | 评估重复COVID-19疫苗接种对适应性免疫(特别是T细胞反应)的长期影响 | 78名未报告有症状感染的个体 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 78名个体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 464 | 2025-12-13 |
Molecular Mechanisms of Perivascular Macrophages in Alzheimer's Disease: Insights from Single-Cell Sequencing and Mendelian Randomization
2025-Jul-07, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-025-01590-w
PMID:40622473
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研究论文 | 本研究结合单细胞测序和孟德尔随机化分析,探讨了阿尔茨海默病中血管周围巨噬细胞的分子机制 | 首次将单细胞测序与孟德尔随机化分析结合,系统研究血管周围巨噬细胞在阿尔茨海默病中的分子机制,并识别出四个关键基因 | 研究主要基于公共数据集分析,缺乏实验验证;样本来源和数量可能限制结果的普适性 | 揭示血管周围巨噬细胞在阿尔茨海默病发病和进展中的具体分子机制 | 阿尔茨海默病患者中的血管周围巨噬细胞 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序, 孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 表达数量性状位点数据 | 基于GSE264648和eQTLGen数据集,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 465 | 2025-12-13 |
spRefine Denoises and Imputes Spatial Transcriptomics with a Reference-Free Framework Powered by Genomic Language Model
2025-Jul-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.22.649977
PMID:40631230
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研究论文 | 本文介绍了一种名为spRefine的深度学习框架,利用基因组语言模型对空间转录组数据进行去噪和插补 | 提出了一种无需参考的框架,结合基因组语言模型联合处理空间转录组数据,提高了数据整合的鲁棒性并支持模型预训练和新生物信号发现 | NA | 克服空间转录组数据的高噪声和基因测量缺失问题,提升数据质量和分析准确性 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 深度学习框架,基因组语言模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 466 | 2025-12-13 |
CD36 promotes iron accumulation and dysfunction in CD8+ T cells via the p38-CEBPB-TfR1 axis in early-stage hepatocellular carcinoma
2025-07, Clinical and molecular hepatology
IF:14.0Q1
DOI:10.3350/cmh.2024.0948
PMID:40037690
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研究论文 | 本研究揭示了CD36通过p38-CEBPB-TfR1轴促进早期肝细胞癌中CD8+ T细胞铁积累和功能失调的机制 | 首次发现CD36通过调控铁摄取蛋白TfR1介导CD8+ T细胞铁积累和功能失调,并提出了NRF2激活作为潜在治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限,机制细节需进一步探索 | 探究早期肝细胞癌中CD8+ T细胞功能失调的分子机制 | 小鼠肝细胞癌模型中的CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | NA | RNA测序数据,流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 467 | 2025-12-13 |
Acquired resistance to immunotherapy by physical barriers with cancer cell-expressing collagens in non-small cell lung cancer
2025-Jun-17, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2500019122
PMID:40498460
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研究论文 | 本研究揭示了非小细胞肺癌中肿瘤细胞通过表达胶原蛋白形成物理屏障,从而导致获得性免疫治疗耐药的新机制 | 首次在体内模型中完整重现了从免疫治疗响应到获得性耐药的全过程,并发现肿瘤细胞通过表达COL3A1和COL6A1形成两种不同结构的物理屏障来抵抗T细胞攻击 | 研究主要基于小鼠模型和肿瘤类器官,尚未在临床患者中得到直接验证 | 探究非小细胞肺癌获得性免疫治疗耐药的内在机制 | 非小细胞肺癌小鼠模型、肿瘤类器官、肿瘤细胞 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序、电子显微镜检测、基因敲除 | 小鼠肿瘤模型、肿瘤类器官移植模型 | 基因表达数据、显微图像数据 | 未明确说明具体样本数量,使用小鼠模型和系列移植实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 468 | 2025-12-13 |
Tissue-Resident CD8+ T Cells as Mediators of Protective Immunity in Breast Milk Transmission of Human Cytomegalovirus
2025-Jun-02, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiae618
PMID:39661655
|
研究论文 | 本研究探讨了母乳中组织驻留记忆CD8+ T细胞在预防人类巨细胞病毒母婴传播中的作用 | 首次描述了母乳中存在组织驻留记忆T细胞,并发现其频率与母乳HCMV病毒载量呈负相关,且非传播者母亲母乳中CD8+ Trm频率更高 | 样本量相对较小,未明确Trm的具体保护机制,需要进一步验证性研究 | 探究母乳中T细胞在预防HCMV母婴传播中的免疫保护作用 | 母乳样本及其中分离的T细胞 | 免疫学 | 病毒感染(人类巨细胞病毒感染) | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | HCMV传播者与非传播者母亲的母乳样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 469 | 2025-12-13 |
Application of computational algorithms for single-cell RNA-seq and ATAC-seq in neurodegenerative diseases
2025-Jan-15, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elae044
PMID:39500613
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综述 | 本文综述了整合单细胞RNA测序和ATAC测序数据的计算工具与机器学习方法,及其在神经退行性疾病中的应用 | 整合scRNA-seq和scATAC-seq数据以关联转录组与染色质可及性,揭示神经退行性疾病的致病机制 | 面临数据稀疏性和计算需求高的挑战 | 促进单细胞多组学技术在神经退行性疾病研究中的应用,以阐明病理机制并识别治疗靶点 | 阿尔茨海默病和帕金森病等神经退行性疾病 | 机器学习 | 神经退行性疾病 | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 单细胞转录组和染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 470 | 2025-12-13 |
TIMP1 Mediates Astrocyte-Dependent Local Immunosuppression in Brain Metastasis Acting on Infiltrating CD8+ T Cells
2025-Jan-13, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-24-0134
PMID:39354883
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脑转移中星形胶质细胞的异质性,并发现一个分泌TIMP1的星形胶质细胞亚群通过抑制浸润性CD8+ T细胞的抗肿瘤活性介导局部免疫抑制,为症状性脑转移患者的联合免疫治疗提供了新策略 | 首次利用单细胞RNA测序技术解析脑转移中星形胶质细胞的异质性,并鉴定出通过分泌TIMP1介导局部免疫抑制的pSTAT3+星形胶质细胞亚群及其对CD63+ CD8+ T细胞功能的调控机制 | 研究主要基于小鼠和人类脑转移模型,临床转化效果需进一步验证;TIMP1作为生物标志物的敏感性和特异性在更大样本中待评估 | 探究脑转移中星形胶质细胞介导的局部免疫抑制机制,以开发针对症状性脑转移的联合免疫治疗策略 | 脑转移中的星形胶质细胞和浸润性CD8+ T细胞 | 单细胞测序与免疫学 | 脑转移瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 471 | 2025-12-13 |
Mechanistic insights into GPAA1-mediated cold tumor phenotype and immune evasion in colorectal cancer: integrative multi-omics analysis and experimental validation
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1701368
PMID:41367867
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据揭示了GPAA1在结直肠癌中的过表达及其通过基因组不稳定性和免疫抑制促进肿瘤进展的机制 | 首次系统分析了GPAA1在泛癌及结直肠癌中的表达模式,并揭示了其通过诱导基因组不稳定和免疫冷表型促进肿瘤进展的新机制 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏体内动物模型验证;样本来源多样可能引入批次效应 | 阐明GPAA1在结直肠癌中的表达模式、功能作用及其与免疫微环境的关系 | 结直肠癌组织和细胞系 | 多组学分析 | 结直肠癌 | 多组学整合分析、单细胞转录组学、空间转录组学、功能实验(增殖、迁移、侵袭) | NA | mRNA表达数据、蛋白质表达数据、单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 来自TCGA、GTEx、GEO、HPA等多个公共数据库的结直肠癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 472 | 2025-12-13 |
Case Report: Blood single-cell analysis of a IVB high-grade serous ovarian cancer patient presenting a favorable prognosis
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1697863
PMID:41367869
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病例报告 | 本文报告了一例IVB期高级别浆液性卵巢癌患者,通过血液单细胞分析揭示其良好预后的潜在分子特征 | 采用多平台液体活检方法,结合血小板RNA测序、单细胞RNA测序和成像流式细胞术,全面分析血液成分,识别与预后相关的独特分子特征 | 本研究为单病例报告,样本量有限,结果需要更大规模研究验证 | 探索IVB期高级别浆液性卵巢癌患者良好预后的潜在驱动因素 | 一名IVB期高级别浆液性卵巢癌患者 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,成像流式细胞术 | NA | RNA测序数据,流式细胞术图像数据 | 1名患者的术前外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 473 | 2025-12-13 |
Integrated Multi-Omic Analysis Reveals Causal Relationships and Causal Mechanisms of Peripheral Lymphocyte-Driven Remodeling in the Intrahepatic Immune Microenvironment of Early-Stage MAFLD
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S546860
PMID:41368350
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研究论文 | 本研究通过整合孟德尔随机化、批量RNA测序和单细胞RNA测序分析,揭示了外周淋巴细胞通过Cd5介导的炎症通路和Vcam1-Itgb1粘附通路驱动早期MAFLD肝内免疫微环境重塑的因果关系和机制 | 首次利用孟德尔随机化建立了外周淋巴细胞与MAFLD风险的单向因果关系,并通过单细胞RNA测序在MAFLD模型中鉴定出新的Itgb1⁺Cd5⁺Cd4⁺T细胞亚群及其与肝内Vcam1highMmp12⁺Kupffer细胞的相互作用机制 | 研究主要基于小鼠模型和公共数据集,需要在更大规模的人类队列中进行验证;因果关系推断依赖于孟德尔随机化假设 | 探究外周血细胞指标与早期MAFLD肝内免疫微环境重塑之间的因果关系和潜在机制 | 代谢功能障碍相关脂肪肝病(MAFLD)患者和小鼠模型 | 单细胞组学 | 代谢功能障碍相关脂肪肝病 | 孟德尔随机化分析,批量RNA测序,单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据,转录组数据,单细胞转录组数据 | 小鼠模型和人类公共单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | NA | NA |
| 474 | 2025-12-13 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Microglial Heterogeneity and Functional States After Cerebral Ischemia-Reperfusion Injury
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S539404
PMID:41368344
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了脑缺血再灌注损伤后小胶质细胞的异质性和功能状态 | 识别了七个转录特征不同的小胶质细胞亚群,并发现ATF3作为核心调控因子,将CH25H介导的代谢变化与细胞因子驱动的神经炎症联系起来 | 研究基于大鼠模型,结果向人类转化需进一步验证 | 分析缺血性卒中中小胶质细胞的异质性、激活轨迹和代谢状态,以发现治疗靶点 | 缺血性和对照大鼠的脑组织 | 单细胞组学 | 缺血性卒中 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, Western blot, 免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确具体数量,但涉及缺血性和对照大鼠的脑组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 475 | 2025-12-12 |
Microbial metabolite trimethylamine-N-oxide facilitates colorectal inflammation-cancer transformation by blocking lysosomal degradation of Wnt signaling
2025-Dec-31, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2597626
PMID:41376600
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了肠道微生物代谢物氧化三甲胺通过阻断Wnt信号通路的溶酶体降解,促进结直肠炎症向癌症转化的新机制 | 首次发现TMAO通过结合分子伴侣Hspa8/Hsc70,阻断β-catenin蛋白的溶酶体降解,从而增强Wnt信号通路,建立了微生物代谢物与结直肠癌发生之间的直接分子联系 | 研究主要基于小鼠模型和类器官,人体内验证尚不充分;TMAO-Hspa8相互作用的特异性及在更广泛癌症类型中的作用有待进一步探索 | 探究肠道微生物代谢物在结直肠炎症-癌症转化过程中的作用机制 | 结肠炎相关结直肠癌小鼠模型、患者来源的结直肠癌类器官 | 多组学分析 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、微生物组分析、代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据、微生物组数据、代谢组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 476 | 2025-12-12 |
Single-Cell Transcriptome-Wide Mendelian Randomization and Colocalization Analyses Uncover Cell-Specific Mechanisms in Epigenetic Age Acceleration
2025-Dec-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202503032R
PMID:41378907
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞表达数量性状位点数据与孟德尔随机化和贝叶斯共定位分析,揭示了免疫细胞特异性基因表达对表观遗传年龄加速的因果调控机制 | 首次在单细胞分辨率下结合孟德尔随机化和贝叶斯共定位方法,系统识别了影响四种主要表观遗传时钟的细胞特异性因果基因 | 研究主要聚焦于免疫细胞类型,未涵盖其他组织或细胞类型;因果推断依赖于遗传变异假设 | 揭示表观遗传年龄加速的细胞特异性基因调控机制 | 14种免疫细胞类型中的基因表达与表观遗传时钟的关联 | 生物信息学 | 衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序,孟德尔随机化,贝叶斯共定位分析 | 统计因果推断模型 | 单细胞转录组数据,表观遗传时钟数据,全基因组关联数据 | 未明确说明样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 477 | 2025-12-12 |
SOX11 modulates BCR signaling through the PAX5/CD19 axis for therapeutic targeting in BTK-resistant mantle cell lymphoma
2025-Dec-23, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2025016801
PMID:40845256
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研究论文 | 本研究揭示了转录因子SOX11通过激活PAX5/CD19轴驱动BCR信号通路,为靶向BTK抑制剂耐药的套细胞淋巴瘤提供了新的治疗策略 | 首次发现SOX11通过转录调控PAX5/CD19轴驱动BCR信号通路,并证明SOX11抑制剂对多种耐药模型(包括BTKi、BCL2抑制剂和CAR-T耐药)均具有细胞毒性 | 研究主要基于细胞系和异种移植模型,尚未进行临床试验验证 | 探索套细胞淋巴瘤中BTK抑制剂耐药的上游机制,并开发新的治疗靶点 | 套细胞淋巴瘤细胞系、患者来源的异种移植模型 | 肿瘤生物学 | 套细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | 转基因模型、异种移植模型 | 基因表达数据 | 未明确样本数量,但使用了伊布替尼敏感和耐药患者的单细胞RNA测序数据及多种细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 478 | 2025-12-12 |
Breaking the shields of resistance: multidimensional therapeutic strategies in the breast cancer drug resistance conundrum
2025-Dec-11, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000004424
PMID:41376375
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综述 | 本文综述了乳腺癌治疗中多维度策略的临床应用与最新进展,并探讨了克服耐药性的创新方法 | 系统整合了单细胞测序、纳米技术和靶向治疗等新兴方法,以应对乳腺癌治疗中的耐药性挑战 | 作为综述文章,未提供原始实验数据或具体临床验证结果 | 总结乳腺癌治疗的临床现状与进展,探讨克服耐药性的多维度策略 | 乳腺癌及其治疗耐药性 | NA | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 479 | 2025-12-12 |
EXPRESS: Mast Cell-5-HT-HTR2A Axis Involvement in Chronic Itch Induced by SADBE
2025-Dec-11, Molecular pain
IF:2.8Q2
DOI:10.1177/17448069251410452
PMID:41378780
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研究论文 | 本研究揭示了肥大细胞-5-HT-HTR2A轴在SADBE诱导的慢性瘙痒中的作用机制 | 首次明确了肥大细胞来源的5-HT在SADBE诱导的慢性瘙痒中的作用,并揭示了HTR2A受体在背根神经节神经元亚群中的特异性表达模式 | 研究主要基于小鼠模型,人体内的相关机制仍需进一步验证 | 探究SADBE诱导的过敏性接触性皮炎中慢性瘙痒的分子机制 | SADBE诱导的ACD小鼠模型、背根神经节神经元 | NA | 过敏性接触性皮炎 | 单细胞RNA测序、RNAscope原位杂交 | NA | 基因表达数据、行为学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 480 | 2025-12-12 |
Inhibition of PFKFB3 in macrophages ameliorates intestinal inflammation by modulating gut microbiota in DSS-induced colitis
2025-Dec-11, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.00632-25
PMID:41378888
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研究论文 | 本研究探讨了PFKFB3在巨噬细胞中对肠道炎症和微生物群的影响,发现其缺失可减轻结肠炎并改变肠道菌群 | 首次证明巨噬细胞中PFKFB3缺失通过调节肠道微生物群来缓解结肠炎,为溃疡性结肠炎提供了新的治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据相关性需进一步验证,且抗生素处理可能影响微生物群结果的解释 | 探究PFKFB3在溃疡性结肠炎中的作用机制及其对肠道微生物群的影响 | 人类UC患者、小鼠模型(包括PFKFB3缺陷巨噬细胞小鼠) | NA | 溃疡性结肠炎 | 免疫组化染色、单细胞RNA测序、流式分析、高通量转录组数据分析 | NA | 图像、转录组数据、微生物群数据 | 人类UC队列和健康对照、小鼠模型(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |