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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4761 | 2025-10-05 |
Molecular mechanism of LncRNA MALAT1 in regulating hepatocellular carcinoma progression via the miR-383-5p/PRKAG1 axis and its role in the tumor immune microenvironment
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1613596
PMID:40958861
|
研究论文 | 本研究揭示lncRNA MALAT1通过miR-383-5p/PRKAG1轴调控肝细胞癌进展的分子机制及其在肿瘤免疫微环境中的作用 | 首次系统阐明MALAT1通过竞争性结合miR-383-5p上调PRKAG1表达的新机制,并发现PRKAG1通过调控免疫细胞浸润和细胞间通讯促进肝癌进展 | NA | 探究MALAT1-PRKAG1轴在肝细胞癌发病机制中的作用及临床意义 | 肝细胞癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 多组学分析、生物信息学分析、单细胞RNA测序、CIBERSORT分析、GO/KEGG富集分析 | NA | 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4762 | 2025-10-05 |
Personalised immunotherapy strategies informed by single cell profiling in thyroid cancer: a mini review
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1651088
PMID:40959084
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综述 | 本文综述了单细胞分析技术如何指导甲状腺癌个性化免疫治疗策略的发展 | 整合单细胞生物学、免疫学和内分泌肿瘤学,识别诊断盲点,发现药物再利用机会,为个性化免疫治疗绘制路线图 | NA | 通过单细胞分析技术改进甲状腺癌免疫治疗策略 | 甲状腺癌肿瘤微环境中的肿瘤细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,CITE-seq | NA | 转录组数据,蛋白质表达数据 | 超过150,000个肿瘤和免疫细胞 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,单细胞多组学 | NA | NA |
| 4763 | 2025-10-05 |
A multi-omic analysis reveals a predictive value of tertiary lymphoid structures in improving the prognosis of colorectal cancer patients with BRAF mutation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1662573
PMID:40959083
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析探讨三级淋巴结构对BRAF突变结直肠癌患者预后的预测价值 | 首次系统评估三级淋巴结构在抵消BRAF突变不良预后影响中的作用,并构建了10基因预后模型 | 样本量相对有限,需要更多前瞻性研究验证 | 研究三级淋巴结构能否改善BRAF突变结直肠癌患者的预后 | 结直肠癌患者,特别是BRAF突变患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, LASSO回归, Cox回归, 免疫浸润分析 | 预后特征模型 | 基因表达数据, 临床病理数据 | 200例结直肠癌患者组织样本,多个公共数据库数据 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 4764 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA-seq reveals a repair pattern in cystic lesions in steroid induced osteonecrosis of the femoral head
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1626337
PMID:40959091
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了类固醇诱导的股骨头坏死中囊性病变的细胞异质性和修复机制 | 首次在SIONFH囊性病变中鉴定出8种细胞类型,并将软骨细胞分为5个亚群,发现CLIC3+表达的肥大软骨细胞群在骨矿化和成骨分化中的关键作用 | 样本量较小(仅3例患者),需要更大规模研究验证发现 | 探究类固醇诱导的股骨头坏死中囊性病变的转录组景观和修复机制 | 类固醇诱导的股骨头坏死患者的囊性病变组织 | 单细胞基因组学 | 股骨头坏死 | 单细胞RNA测序,组织学分析 | NA | 单细胞转录组数据,组织学图像 | 3例SIONFH患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4765 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing and proteomics uncover SIRPα-CD47 immune checkpoint and glycolysis-driven immune evasion in cardiac myxoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1652645
PMID:40959090
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和蛋白质组学揭示心脏粘液瘤中SIRPα-CD47免疫检查点和糖酵解驱动的免疫逃逸机制 | 首次在心脏粘液瘤中发现ap-CAF细胞通过趋化因子招募免疫细胞形成免疫微环境,证实肿瘤细胞来源于间充质干细胞,并揭示糖酵解通路激活和SIRPα-CD47免疫检查点在免疫逃逸中的关键作用 | 研究样本量有限,作为罕见疾病研究可能缺乏大规模验证 | 探究心脏粘液瘤的肿瘤微环境组成、细胞生长机制和免疫逃逸策略 | 心脏粘液瘤组织样本 | 单细胞组学 | 心脏肿瘤 | 单细胞RNA测序,蛋白质组学,Western blot,类器官模型 | 伪时间轨迹分析 | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4766 | 2025-10-05 |
Spermidine potentiates anti-tumor immune responses and immunotherapy sensitivity in breast cancer
2025, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.113235
PMID:40959110
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研究论文 | 本研究探讨亚精胺通过调节CD8⁺ T细胞功能增强乳腺癌抗肿瘤免疫反应和免疫治疗敏感性的机制 | 首次通过整合多组学分析揭示肿瘤内亚精胺水平与CD8⁺ T细胞浸润和活化的正相关性,并证实外源性亚精胺补充可直接促进CD8⁺ T细胞活化 | 亚精胺在乳腺癌中的具体作用机制和治疗潜力仍需进一步明确 | 探究亚精胺在乳腺癌抗肿瘤免疫反应和免疫治疗敏感性中的作用 | 乳腺癌标本和CD8⁺ T细胞 | 肿瘤免疫学 | 乳腺癌 | 多组学分析、单细胞RNA测序、免疫组织化学、多重免疫组织化学 | NA | RNA测序数据、免疫组织化学图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 4767 | 2025-10-05 |
Comprehensive analytical approach identifies a subtype of CTCF+ tumor-associated neutrophils associated with CRC development and as a biomarker for immunotherapy
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.111529
PMID:40959269
|
研究论文 | 本研究通过多组学分析鉴定出结直肠癌中CTCF+肿瘤相关中性粒细胞亚型及其在肿瘤进展和免疫治疗抵抗中的作用机制 | 首次发现并表征了CTCF+肿瘤相关中性粒细胞亚型,揭示了其通过CTCF-MIEN1-IL-1β轴驱动肿瘤进展和免疫抑制的新机制 | NA | 探究结直肠癌中肿瘤相关中性粒细胞的异质性及其在肿瘤微环境中的功能机制 | 结直肠癌患者样本中的肿瘤相关中性粒细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,批量RNA测序 | NA | NA |
| 4768 | 2025-10-05 |
Senescent Tumoral HLA-E Reshapes Microenvironment through Impairing NK Cell-Dendritic Cell-T Cell Network in Malignant Pleural Effusion from Lung Cancer
2025, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.116499
PMID:40959273
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析恶性胸腔积液中衰老肿瘤细胞通过HLA-E抑制NK细胞功能并破坏免疫细胞网络的机制 | 首次揭示衰老肿瘤细胞通过HLA-E介导的免疫逃逸机制重塑恶性胸腔积液微环境 | 样本量有限,机制验证需要进一步实验 | 探究恶性胸腔积液中肿瘤细胞衰老对免疫微环境的影响机制 | 肺癌患者恶性胸腔积液样本中的癌细胞、NK细胞、树突状细胞和T细胞 | 单细胞生物学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,Luminex,ELISA,免疫组织化学 | NA | 单细胞转录组数据,蛋白质定量数据,组织染色数据 | 心力衰竭和肺癌-MPE患者的样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4769 | 2025-10-05 |
Integration of multi-omics data reveals dysregulated RNA methylation in retinal pigment epithelium drives age-related macular degeneration
2025, International journal of ophthalmology
IF:1.9Q2
DOI:10.18240/ijo.2025.09.03
PMID:40881439
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据揭示了视网膜色素上皮细胞中RNA甲基化失调在年龄相关性黄斑变性发病机制中的作用 | 首次在单细胞水平系统分析AMD患者视网膜色素上皮细胞中RNA甲基化相关基因表达谱,并采用孟德尔随机化和机器学习方法验证因果关系 | 样本量相对有限,正常供体11例,AMD患者23例(单细胞数据)及31例正常供体和37例AMD患者(Bulk RNA数据) | 研究RNA甲基化在视网膜色素上皮细胞中对年龄相关性黄斑变性的作用机制 | 年龄相关性黄斑变性患者和正常对照的视网膜色素上皮细胞 | 生物信息学 | 年龄相关性黄斑变性 | 单细胞转录组测序, Bulk RNA测序, 全基因组关联研究, 多组学数量性状位点分析 | 机器学习模型 | 单细胞转录组数据, Bulk RNA测序数据, GWAS数据, QTL数据 | 单细胞数据:34个样本(11正常+23 AMD);Bulk RNA数据:68个样本(31正常+37 AMD) | NA | 单细胞RNA-seq, Bulk RNA-seq | NA | NA |
| 4770 | 2025-10-05 |
IV Immunoglobulin Is Associated With Epigenetic, Ribosomal, and Immune Changes in Pediatric Acute-Onset Neuropsychiatric Syndrome
2025-Nov, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000200467
PMID:40953324
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析静脉注射免疫球蛋白对儿童急性发作神经精神综合征患者外周免疫细胞基因表达的影响 | 首次在单细胞水平揭示PANS患者接受IVIg治疗前后的表观遗传、核糖体和免疫通路变化 | 样本量较小(5例患者,4例对照),采用开放性标签设计 | 研究IVIg对PANS患者细胞特异性基因表达的影响 | 儿童急性发作神经精神综合征患者的外周免疫细胞 | 单细胞转录组学 | 儿童急性发作神经精神综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 5名PANS儿童患者(治疗前后配对样本)和4名对照儿童 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4771 | 2025-10-05 |
Chd4 remodels chromatin to control retinal cell type specification and lineage termination
2025-Oct-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204697
PMID:40905097
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研究论文 | 本研究通过构建视网膜特异性Chd4条件性敲除小鼠,揭示了Chd4依赖的核小体重塑在视网膜细胞类型时序性生成和谱系终止中的关键作用 | 首次证明Chd4通过重塑染色质可及性调控视网膜发育的时序性转换,特别是对谱系终止过程的特异性调控 | 研究主要聚焦于Chd4在视网膜发育中的作用,未涉及其他神经发育过程;机制研究主要基于基因组可及性分析,功能验证有待深入 | 探究染色质重塑因子Chd4在神经前体细胞时序性分化中的调控机制 | 小鼠视网膜发育过程中的神经前体细胞和分化细胞类型 | 发育生物学 | NA | CUT&RUN-seq, ATAC-seq, 单细胞转录组测序 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因组可及性数据,单细胞转录组数据 | 视网膜特异性Chd4条件性敲除小鼠 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 4772 | 2025-10-05 |
APOE deficiency inhibits amyloid-facilitated (A) tau pathology (T) and neurodegeneration (N), halting progressive ATN pathology in a preclinical model
2025-Oct, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03036-7
PMID:40307424
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研究论文 | 本研究通过临床前模型证明APOE缺陷可抑制淀粉样蛋白驱动的tau病理和神经退行性变 | 首次在ATN模型中系统证明APOE缺陷通过多效性机制抑制淀粉样蛋白驱动的tau病理进展 | 研究基于小鼠模型,需要进一步验证在人类中的适用性 | 探究APOE在淀粉样蛋白促进的tau病理和神经退行性变中的作用机制 | 5xFAD与TauP301S杂交小鼠构建的ATN模型 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序,组织染色 | 动物模型 | 基因表达数据,组织图像数据 | 转基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4773 | 2025-10-05 |
Functional defects in FOXG1 variants predict the severity of brain anomalies in FOXG1 syndrome
2025-Oct, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-025-03077-y
PMID:40524015
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研究论文 | 本研究通过分析FOXG1基因变异的功能缺陷与大脑异常严重程度之间的关联,建立了FOXG1综合征患者分层预测模型 | 首次结合蛋白表达、COUP-TFI抑制能力和神经元迁移功能评估,建立了能够预测FOXG1综合征严重程度的患者分层范式 | 样本量较小(仅14名患者),需要在更大队列中验证模型的普适性 | 探究FOXG1基因变异功能缺陷与大脑异常严重程度的关系,建立患者分层预测方法 | 14名FOXG1变异患者、小鼠胚胎大脑 | 神经发育疾病研究 | FOXG1综合征 | 荧光素酶报告基因检测、单细胞RNA测序、子宫内电穿孔 | NA | 基因测序数据、蛋白表达数据、脑成像数据 | 14名FOXG1变异患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4774 | 2025-10-05 |
Spatial transcriptomics exploration of the primary neuroblastoma microenvironment in archived FFPE samples unveils novel paracrine interactions
2025-Oct, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.6457
PMID:40778592
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术探索存档FFPE样本中神经母细胞瘤微环境的细胞间通讯 | 首次在存档FFPE样本中应用空间转录组学技术,发现神经母细胞瘤微环境中新的旁分泌相互作用和信号轴 | 研究仅基于两名患者的样本,样本量有限 | 探索神经母细胞瘤微环境的空间异质性和细胞间通讯机制 | 高风险神经母细胞瘤患者的存档FFPE组织样本 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 2名患者(未经治疗和化疗治疗的高风险神经母细胞瘤) | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4775 | 2025-10-05 |
Spatial transcriptomics of intraductal carcinoma of the prostate
2025-Sep-18, Histopathology
IF:3.9Q1
DOI:10.1111/his.15551
PMID:40964799
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术分析前列腺导管内癌的基因表达谱和拷贝数变异 | 首次使用Visium空间基因表达平台对前列腺导管内癌进行空间转录组学分析,揭示了IDC-P的独特分子特征 | 样本量较小(n=6),需要更大规模研究验证 | 表征前列腺导管内癌的分子特征及其与预后的关系 | 前列腺导管内癌组织和邻近非导管内癌组织 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 空间转录组学,拷贝数变异分析,差异基因表达分析 | 主成分分析,InferCNV | 空间基因表达数据 | 6例前列腺癌患者样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | Visium Spatial Gene Expression平台 |
| 4776 | 2025-10-05 |
A complete Sigmodon hispidus genome and dynamic single-cell transcriptomics reveal evolutionarily conserved responses to RSV infection
2025-Sep-17, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adw7535
PMID:40961223
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研究论文 | 本研究通过构建完整的棉鼠基因组和单细胞转录组图谱,揭示了RSV感染过程中的进化保守反应 | 首次报道棉鼠染色体基因组和呼吸道单细胞转录组图谱,揭示了RSV感染的靶细胞类型和宿主-病毒相互作用机制 | 研究主要关注棉鼠模型,人类临床转化的有效性需要进一步验证 | 探索棉鼠作为RSV感染模型的分子机制和进化保守性 | 棉鼠(Sigmodon hispidus)和人类呼吸道合胞病毒(RSV) | 单细胞转录组学 | 呼吸道病毒感染 | 单细胞RNA测序,系统发育分析 | NA | 基因组数据,单细胞转录组数据 | 棉鼠呼吸道组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4777 | 2025-10-05 |
PD-1-targeted cis-delivery of an IL-2 variant induces a multifaceted antitumoral T cell response in human lung cancer
2025-Sep-17, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.adr3718
PMID:40961225
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研究论文 | 本研究通过PD1-IL2v融合蛋白在人类肺癌模型中诱导多方面的抗肿瘤T细胞反应 | 开发了PD1-IL2v融合蛋白,通过靶向PD-1的顺式递送IL-2变体,同时激活CD8和CD4 T细胞 | 主要基于人类模型系统和肺癌患者来源的肿瘤片段平台,需要进一步临床验证 | 研究PD1-IL2v融合蛋白在人类肿瘤中的免疫调节机制 | 人类肺癌模型、T细胞亚群(CD8 T细胞和常规CD4 T细胞) | 癌症免疫治疗 | 肺癌 | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | 单细胞转录组数据 | 肺癌患者来源的肿瘤片段 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4778 | 2025-10-05 |
Caloric restriction promotes resolution of atherosclerosis in obese mice, while weight regain accelerates its progression
2025-Sep-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI172198
PMID:40627456
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研究论文 | 本研究通过建立肥胖小鼠模型,揭示了热量限制促进动脉粥样硬化消退而体重反弹加速其进展的细胞机制 | 首次发现Fcgr4+巨噬细胞亚群在热量限制期间积累于脂肪组织和动脉斑块中,并证实其通过清除坏死核心促进动脉粥样硬化消退 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类中验证;短期热量限制的效果可能不同于长期干预 | 探究体重减轻和反弹如何直接影响动脉粥样硬化炎症过程 | 肥胖高胆固醇小鼠模型 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,机制研究 | 动物模型 | 基因表达数据,组织学数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4779 | 2025-10-05 |
Uncovering essential lncRNAs through transcriptome-scale CRISPR-Cas13 screening
2025-Sep-15, Advanced biotechnology
DOI:10.1007/s44307-025-00082-8
PMID:40952596
|
研究论文 | 开发了一种转录组规模的CRISPR-Cas13筛选平台CaRPool-seq,用于系统性鉴定功能性长链非编码RNA | 首次建立直接靶向RNA的转录组规模CRISPR-Cas13筛选平台,克服了传统方法的效率、特异性和可扩展性限制 | 未在论文摘要中明确说明研究局限性 | 系统性鉴定人类细胞中具有重要功能的长链非编码RNA | 人类细胞系中的长链非编码RNA | 功能基因组学 | 癌症 | CRISPR-Cas13筛选,单细胞转录组测序 | CRISPR-Cas13筛选平台 | RNA测序数据 | 多种人类细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | CaRPool-seq(转录组规模CRISPR-Cas13筛选平台) |
| 4780 | 2025-10-05 |
Comprehensive analysis of the tumor immune microenvironment in gastric cancer and peritoneal metastasis based on single-cell RNA sequencing analysis
2025-Sep-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-13892-6
PMID:40954153
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研究论文 | 基于单细胞RNA测序分析胃癌及腹膜转移中的肿瘤免疫微环境 | 首次通过单细胞RNA测序揭示胃癌腹膜转移中TAMs向肥大细胞分化的潜力,并鉴定CCL5-CCR1通路作为潜在免疫检查点 | 样本量有限(20个样本),数据来源于公共数据库GEO | 探究胃癌及其腹膜转移的分子机制和生物学过程,寻找临床治疗新靶点 | 胃癌细胞和腹膜转移细胞 | 单细胞组学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | SeuratV5, CytoTRACE, CellChat, Monocle3 | 单细胞RNA测序数据 | 20个单细胞RNA测序样本,包含2,626,594个腹膜转移细胞和17,894个胃癌细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |