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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4761 | 2025-10-05 |
Cellular cartography reveals mouse prostate organization and determinants of castration resistance
2025-Sep-02, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2427116122
PMID:40854129
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序、单细胞多组学和空间转录组学技术,构建小鼠前列腺细胞图谱并揭示去势抵抗的关键决定因素 | 首次系统整合多组学数据揭示小鼠前列腺叶特异性细胞类型及其在去势治疗响应中的转录和表观遗传基础 | 研究主要基于小鼠模型,人类前列腺癌的验证仍需进一步研究 | 解析前列腺癌对雄激素剥夺疗法(ADT)抵抗的细胞机制 | 小鼠前列腺组织及人类前列腺癌样本 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学, 空间转录组学, 荟萃分析 | NA | 单细胞转录组数据, 表观遗传数据, 空间转录组数据 | 小鼠前列腺组织及人类前列腺癌荟萃分析数据 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4762 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA Sequencing In Pediatric Sepsis: γδ T Cell Exhibits A Differentiation To γδT17 Subtype Along With Significantly Enhanced Cell Communication With Neutrophils
2025-Sep-02, Journal of innate immunity
IF:4.7Q2
DOI:10.1159/000547934
PMID:40931501
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析儿科脓毒症患者γδ T细胞的免疫特征和分化机制 | 首次在儿科脓毒症中发现γδ T细胞向γδT17亚型分化,并揭示中性粒细胞通过RETN-CAP1结合增强与γδ T细胞的通讯 | 研究样本量有限,机制验证仍需进一步实验 | 阐明儿科脓毒症中γδ T细胞的免疫特征和分化机制 | 儿科脓毒症患者外周血单个核细胞中的γδ T细胞 | 单细胞测序分析 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序,流式细胞术 | 伪时序分析,细胞通讯分析 | 单细胞RNA测序数据 | 儿科脓毒症患者PBMC样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4763 | 2025-10-05 |
An Organ-on-Chip Platform for Strain-Controlled, Tissue-Specific Compression of Cartilage and Mineralized Osteochondral Interface to Study Mechanical Overloading in Osteoarthritis
2025-Sep, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202501588
PMID:40556597
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研究论文 | 开发了一种用于研究骨关节炎机械过载的骨软骨单元芯片平台 | 首次在芯片上实现应变控制、组织特异性压缩的骨软骨界面模型,模拟体内应变梯度 | 该模型仍为体外微组织系统,无法完全模拟完整关节的复杂生物力学环境 | 研究机械过载在骨关节炎发生发展中的分子机制 | 人源复合透明软骨-矿化软骨下骨微组织 | 组织工程 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | 器官芯片模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4764 | 2025-10-05 |
Senescent Microglia Mediate Neuroinflammation-Induced Cognitive Dysfunction by Selective Elimination of Excitatory Synapses in the Hippocampal CA1
2025-Sep, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70167
PMID:40624910
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研究论文 | 本研究揭示了衰老小胶质细胞通过选择性清除海马CA1区兴奋性突触介导神经炎症诱导的认知功能障碍的机制 | 首次发现衰老小胶质细胞通过过度吞噬兴奋性突触导致神经炎症相关认知功能障碍,并证明使用senolytic药物ABT-737可逆转这一过程 | 研究仅使用小鼠模型,尚未在人类中验证;观察期较短,长期效果未知 | 阐明衰老小胶质细胞在神经炎症诱导认知功能障碍中的具体作用机制 | C57BL/6J小鼠的海马CA1区小胶质细胞和锥体神经元 | 神经科学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序,高尔基染色,全细胞膜片钳记录,Western blotting,免疫荧光 | 小鼠神经炎症模型 | 基因表达数据,电生理记录,行为学数据,蛋白质表达数据 | 未明确说明具体样本数量,使用C57BL/6J小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4765 | 2025-10-05 |
Integrating single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics to reveal the Glycolysis-related gene GPRC5A as a potential biomarker for gastric cancer by machine learning
2025-Sep, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.147059
PMID:40865843
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研究论文 | 本研究整合单细胞RNA测序和空间转录组学,通过机器学习识别糖酵解相关基因GPRC5A作为胃癌潜在生物标志物 | 开发了基于四分位距的糖酵解活性评估新方法,解决了以往评分方法分辨率不足和稳健性有限的问题 | NA | 识别胃癌糖酵解代谢相关生物标志物,为早期诊断和靶向治疗提供支持 | 胃癌细胞和组织 | 机器学习 | 胃癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,机器学习 | 机器学习模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 4766 | 2025-10-05 |
A Spatially Coordinated Keratinocyte-Fibroblast Circuit Recruits MMP9+ Myeloid Cells to Drive IFN-I-Driven Inflammation in Photosensitive Autoimmunity
2025-Aug-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.08.19.670635
PMID:40894544
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和空间转录组学等技术,揭示了光敏性自身免疫疾病中角质形成细胞-成纤维细胞-髓系细胞的炎症级联反应机制 | 首次发现MMP9+ CD14+髓系细胞在光敏性自身免疫中的核心作用,并阐明其通过角质形成细胞-成纤维细胞轴被招募至真皮-表皮连接处的空间协调机制 | 研究主要基于体外模型和有限临床样本,需要更大规模的临床验证 | 阐明紫外线B暴露引发皮肤特异性自身免疫的分子机制 | 皮肤红斑狼疮和皮肌炎患者的皮肤组织及体外细胞模型 | 数字病理学 | 自身免疫性皮肤病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学(seqFISH+), 体外建模 | NA | 基因表达数据, 空间定位数据 | 未明确样本数量,包括患者皮肤组织和体外细胞模型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | seqFISH+空间转录组技术 |
| 4767 | 2025-10-05 |
Integrated spatial and functional metabolic profiling identified the thick ascending limb as a mitochondrial vulnerability hub in acute kidney injury
2025-Aug-22, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2025.07.021
PMID:40850621
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研究论文 | 本研究通过整合空间和功能代谢分析,发现肾小管粗升支是急性肾损伤中的线粒体脆弱性枢纽 | 首次通过整合空间转录组学、单细胞转录组学和同位素示踪成像技术,系统揭示了肾小管粗升支在急性肾损伤中的特殊代谢脆弱性 | 研究主要基于动物模型和有限的临床样本,需要在更大规模的人群研究中进一步验证 | 探索急性肾损伤的代谢机制和肾脏能量代谢的空间分布特征 | 小鼠模型和人类肾移植患者的肾脏组织 | 空间生物学 | 急性肾损伤 | 空间转录组学, 单细胞转录组学, 免疫荧光, 同位素示踪成像 | NA | 转录组数据, 图像数据, 代谢数据 | 小鼠模型和人类肾移植患者样本 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4768 | 2025-10-05 |
FAHD1-mediated pyruvate metabolism in hepatocellular carcinoma: Multi-omics and causal genetic evidence
2025-Aug-14, HGG advances
DOI:10.1016/j.xhgg.2025.100494
PMID:40814172
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了FAHD1在肝细胞癌中调控丙酮酸代谢的因果机制及其在肿瘤微环境中的空间分布特征 | 首次整合单细胞转录组学、空间定位和遗传因果推断方法,识别出丙酮酸高活性上皮亚群及其与肿瘤核心区域的代谢分区特征,发现FAHD1作为丙酮酸代谢的因果驱动因子 | 研究主要基于观察性数据和体外模型验证,需要进一步的体内实验和临床试验确认FAHD1靶向治疗的临床价值 | 探索肝细胞癌中丙酮酸代谢的因果调控机制及其在肿瘤微环境中的空间分布特征 | 肝细胞癌肿瘤微环境中的上皮细胞亚群、癌症相关成纤维细胞及其相互作用 | 多组学整合分析 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序、空间转录组、孟德尔随机化分析、分子对接 | NA | 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 4769 | 2025-10-05 |
Loeys-Dietz syndrome subtypes exhibit distinct clinical behavior and aortic cellular transcriptomic profiles
2025-Aug, JTCVS open
DOI:10.1016/j.xjon.2025.06.013
PMID:40923070
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研究论文 | 本研究整合Loeys-Dietz综合征患者主动脉根部置换术后的纵向临床结果与主动脉平滑肌细胞转录组分析,探讨不同亚型特异性主动脉脆弱性的机制 | 首次通过单细胞RNA测序比较TGFBR1/2和SMAD3变异患者的主动脉平滑肌细胞表型,揭示亚型特异性基因调控模式 | 单机构研究,样本量有限(特别是单细胞RNA测序仅8例样本),随访时间中位6.16年 | 研究Loeys-Dietz综合征不同亚型的临床行为差异及其分子机制 | Loeys-Dietz综合征患者(62例,包括TGFBR1/2和SMAD3变异亚型) | 单细胞转录组学 | Loeys-Dietz综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据和单细胞RNA测序数据 | 62例患者(其中59例基因确认),单细胞RNA测序分析8例(3例TGFBR1/2,5例SMAD3) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4770 | 2025-10-05 |
CREB drives acinar cells to ductal reprogramming and promotes pancreatic cancer progression in preclinical models of alcoholic pancreatitis
2025-Jul-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.05.574376
PMID:38903082
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研究论文 | 本研究揭示了CREB在酒精性胰腺炎中驱动腺泡细胞向导管重编程并促进胰腺癌进展的机制 | 首次阐明CREB与致癌Kras在慢性炎症环境下协同促进胰腺癌进展的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 | 探究CREB在酒精性胰腺炎促进胰腺癌进展中的作用机制 | 遗传修饰小鼠模型(Ptf1aCreERTM/+;LSL-KrasG12D/+)和腺泡细胞 | 癌症生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序, Western blotting, 磷酸激酶阵列, 定量PCR, 谱系追踪 | 遗传小鼠模型 | 基因表达数据, 组织学图像, 蛋白质印迹数据 | 多种遗传背景的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4771 | 2025-10-05 |
Single-cell analysis of dup15q syndrome reveals developmental and postnatal molecular changes in autism
2025-Jul-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-61184-4
PMID:40615364
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研究论文 | 通过单细胞分析研究dup15q综合征在自闭症中的发育和出生后分子变化 | 首次结合皮质类器官和死后脑样本的单细胞测序,揭示dup15q综合征在胎儿期和青少年-成人期的细胞类型特异性分子变化 | 研究样本数量未明确说明,且依赖死后脑组织可能存在保存质量问题 | 研究dup15q综合征在自闭症发病机制中的分子基础 | dup15q患者来源的iPSCs皮质类器官和死后脑样本 | 数字病理学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学,基因共表达网络分析 | NA | RNA测序数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单核RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 4772 | 2025-10-05 |
Chronic hyperactivation of midbrain dopamine neurons causes preferential dopamine neuron degeneration
2025-Mar-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.05.588321
PMID:38645054
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研究论文 | 本研究通过化学遗传学方法慢性激活中脑多巴胺神经元,揭示了帕金森病中多巴胺神经元退化的新机制 | 首次建立了慢性激活多巴胺神经元的化学遗传学小鼠模型,证明了神经活动增强会导致黑质多巴胺神经元优先退化 | 动物模型研究,需要进一步验证在人类中的适用性 | 探究慢性神经活动改变在多巴胺神经元退化中的作用机制 | 中脑多巴胺神经元,特别是黑质致密部多巴胺神经元 | 神经科学 | 帕金森病 | 化学遗传学(DREADD),电生理记录,空间转录组学 | DREADD小鼠模型 | 电生理数据,行为数据,钙成像数据,转录组数据 | DREADD转基因小鼠模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 4773 | 2025-10-05 |
Unveiling the mechanism of Pogostemon cablin (Blanco) Benth in treating heat illnesses via network pharmacology and molecular simulation
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0331401
PMID:40920657
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研究论文 | 本研究通过网络药理学和分子模拟技术揭示广藿香治疗热射病的作用机制 | 首次整合网络药理学、单细胞RNA测序和分子动力学模拟系统解析广藿香治疗热射病的分子靶点 | 样本量较小(11例患者和14例健康志愿者),需要更大规模研究验证 | 阐明广藿香治疗热射病的分子作用机制 | 热射病患者和健康志愿者的外周血样本 | 生物信息学 | 热射病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 分子对接, 分子动力学模拟 | 网络药理学分析, 分子对接模型 | RNA测序数据, 分子结构数据 | 25例(11例热射病患者+14例健康志愿者) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 4774 | 2025-10-05 |
Construction of a gene-metabolite-microbiome regulatory network reveals novel therapeutic targets in bladder cancer through multi-omics analysis
2025-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2025.2553220
PMID:40908816
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研究论文 | 通过多组学分析构建膀胱癌的基因-代谢物-微生物调控网络并识别新的治疗靶点 | 首次整合转录组、外显子组、代谢组和微生物组数据构建膀胱癌调控网络,发现成纤维细胞作为核心调控因子 | 样本来源相对有限,需要更大规模验证 | 阐明膀胱癌的发病机制并识别新的治疗靶点 | 膀胱癌患者的肿瘤组织和癌旁组织 | 多组学分析 | 膀胱癌 | 转录组测序,全外显子组测序,代谢组学,微生物组分析,单细胞测序 | 调控网络分析,分子分型 | 基因组数据,转录组数据,代谢组数据,微生物组数据 | 膀胱癌患者组织样本,结合公共数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,全外显子组测序,代谢组学,微生物组分析 | NA | NA |
| 4775 | 2025-10-05 |
KAT6A Promotes Macrophage Inflammation and Periodontitis
2025-Oct, Journal of clinical periodontology
IF:5.8Q1
DOI:10.1111/jcpe.14203
PMID:40635126
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研究论文 | 本研究揭示KAT6A通过调控巨噬细胞炎症反应促进牙周炎进展的机制 | 首次发现KAT6A在牙周炎巨噬细胞中表达上调,并通过基因敲除小鼠模型证实其在牙周炎发病中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步研究 | 探究KAT6A在牙周炎发病机制中的作用 | 巨噬细胞、牙周炎小鼠模型 | 表观遗传学 | 牙周炎 | 单细胞RNA测序, qRT-PCR, RNA-seq, 流式细胞术, Cut&tag | 基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据, 表观遗传数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 4776 | 2025-10-05 |
Integrated 'omics analysis reveals human milk oligosaccharide biosynthesis programs in human lactocytes
2025-Sep-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113269
PMID:40894860
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据和HMO浓度测量,揭示人类乳腺细胞中母乳寡糖的生物合成程序 | 首次在单细胞水平识别HMO合成基因的差异表达模式,发现新的候选基因和转录因子,提出HMO合成可能通过乳腺细胞亚型特化实现 | HMO生物合成通路在哺乳期乳腺中的复杂机制仍未被完全阐明 | 解析人类母乳寡糖在乳腺细胞中的生物合成机制 | 人类乳腺上皮细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,HMO浓度测量数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 4777 | 2025-10-05 |
Adaptive individualized gene pair signatures distinguishing melanoma and predicting response to immune checkpoint blockade
2025-Sep-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.113329
PMID:40917881
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研究论文 | 提出自适应个体化基因对特征方法,用于区分黑色素瘤亚型并预测免疫检查点阻断治疗反应 | 开发基于基因对逆转的自适应特征选择方法,相比现有方法提高分类准确率5%以上,预测性能提升6% | 研究样本量相对有限(850个样本用于分类,252个样本用于预测),需要更多独立队列验证 | 开发稳健的基因特征方法以区分相似癌症亚型并预测免疫治疗反应 | 黑色素瘤患者样本 | 机器学习 | 黑色素瘤 | RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 850个样本来自24个队列用于分类,252个样本来自7个队列用于预测 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 4778 | 2025-10-05 |
TREM-1 as a novel immunotherapeutic target to treat pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-Sep-18, Molecular therapy. Oncology
DOI:10.1016/j.omton.2025.201034
PMID:40917508
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研究论文 | 本研究探讨TREM-1激活在胰腺导管腺癌中改变肿瘤微环境和增强肿瘤免疫的潜力 | 首次发现TREM-1激活能通过重编程免疫抑制性肿瘤微环境来治疗胰腺导管腺癌 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚不充分 | 探索TREM-1作为胰腺导管腺癌免疫治疗新靶点的潜力 | 胰腺导管腺癌(PDAC)的肿瘤微环境和免疫细胞 | 肿瘤免疫学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | Pan02小鼠模型 | 基因表达数据 | 小鼠模型和人类PDAC组织样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 4779 | 2025-10-05 |
Cancer-associated fibroblast marker signatures and stromal composition in usual interstitial pneumonia-associated lung adenocarcinoma: an analysis using a proteomic-immunohistochemical approach
2025-Sep-09, Virchows Archiv : an international journal of pathology
IF:3.4Q1
DOI:10.1007/s00428-025-04254-8
PMID:40926109
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学和免疫组织化学方法分析普通型间质性肺炎相关肺腺癌中癌症相关成纤维细胞标志物特征和基质组成 | 首次结合激光显微切割蛋白质组分析和公开单细胞RNA测序数据,揭示UIP相关LUAD中ACAN和HAPLN1等新型基质蛋白的表达特征 | 样本量较小(仅32例),且为回顾性研究 | 表征普通型间质性肺炎相关肺腺癌的肿瘤微环境特征 | 肺腺癌患者组织样本(16例伴UIP,16例不伴UIP) | 数字病理学 | 肺癌 | 免疫组织化学, 蛋白质组学分析, 单细胞RNA测序 | NA | 组织图像, 蛋白质组数据, 基因表达数据 | 32例肺腺癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学 | NA | 激光显微切割技术 |
| 4780 | 2025-10-05 |
Long-chain sulfatide enrichment is an actionable metabolic vulnerability in intraductal papillary mucinous neoplasm (IPMN)-associated pancreatic cancers
2025-Sep-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-335220
PMID:40268349
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研究论文 | 本研究通过跨物种空间分析发现长链硫苷脂富集是胰腺导管内乳头状黏液性肿瘤恶性进展的关键代谢弱点 | 首次发现长链硫苷脂在IPMN/PDAC中的选择性富集,并证实UGT8抑制可通过神经酰胺介导的线粒体自噬激活内在凋亡通路 | 样本量相对有限(n=23),主要基于小鼠模型验证 | 揭示IPMN向PDAC恶性进展的生化分子驱动机制 | 人类切除的IPMN/PDAC组织(n=23)和Kras;Gnas突变小鼠模型 | 空间多组学 | 胰腺癌 | MALDI质谱成像, Visium空间转录组, CRISPR/cas9, siRNA, 药理学抑制 | NA | 空间代谢组, 空间转录组 | 23例人类组织样本及小鼠模型 | 10x Genomics | 空间转录组 | Visium | Visium空间转录组技术 |