单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 7544 篇文献，本页显示第 4601 - 4620 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 4601 | 2025-05-17 |
The CD38+HLA-DR+ T cells with activation and exhaustion characteristics as predictors of severity and mortality in COVID-19 patients
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1577803
PMID:40370439
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研究论文 | 该研究通过流式细胞术和单细胞RNA测序技术，分析了COVID-19患者外周免疫细胞的特征，发现CD38+HLA-DR+ T细胞的扩增与疾病严重程度和死亡率相关 | 首次将CD38+HLA-DR+ T细胞确定为COVID-19预后的新型生物标志物，并揭示了其独特的激活-耗竭表型及对NAD+代谢的影响 | 样本来源仅限于外周血，未评估组织中的免疫细胞特征；研究人群的多样性可能有限 | 寻找COVID-19的新型治疗靶点和早期预测生物标志物 | 健康人、细菌性肺炎患者和COVID-19患者的外周免疫细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 流式细胞术、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞表型数据、基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量，但包括健康人、细菌性肺炎患者和COVID-19患者三类人群 |
| 4602 | 2025-05-17 |
Single-cell transcriptome reveals potential mechanisms for gout in children
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1577109
PMID:40370447
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术探索了儿童痛风的分子机制 | 揭示了CD14+单核细胞和DN T细胞在儿童痛风中的关键作用，以及与成人痛风的异同 | 样本来源仅限于外周血，未涉及痛风关节组织 | 探索儿童痛风的分子机制 | 儿童痛风患者和健康对照的外周血样本 | 生物医学 | 痛风 | scRNA-seq | NA | RNA测序数据 | 儿童痛风患者和健康对照的外周血样本（具体数量未说明） |
| 4603 | 2025-05-17 |
Exploration the role of pro-inflammatory fibroblasts and related markers in periodontitis: combing with scRNA-seq and bulk-seq data
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1537046
PMID:40370461
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量转录组数据分析，探索了促炎性牙龈成纤维细胞（PIGFs）在牙周炎中的作用及其相关分子机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出与牙周炎发展密切相关的促炎性牙龈成纤维细胞亚群，并发现MME和TSPAN11两个基因作为潜在治疗靶点 | 研究样本量有限，且未在更大人群中验证MME和TSPAN11的临床效果 | 探索促炎性牙龈成纤维细胞在牙周炎发病机制中的作用及其分子机制 | 牙龈成纤维细胞（GFs）及其亚群促炎性牙龈成纤维细胞（PIGFs） | 数字病理学 | 牙周炎 | scRNA-seq, bulk-seq, qPCR, 免疫荧光染色 | 多种机器学习算法 | RNA测序数据 | 来自正常和牙周炎患者的scRNA-seq数据 |
| 4604 | 2025-05-17 |
Unraveling the role of histone acetylation in sepsis biomarker discovery
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1582181
PMID:40370519
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研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞RNA测序数据，结合机器学习算法，发现了与组蛋白乙酰化相关的脓毒症生物标志物 | 首次将组蛋白乙酰化与脓毒症生物标志物发现联系起来，并利用多种机器学习算法和孟德尔随机化方法进行验证 | 研究样本量未明确说明，且需要进一步临床验证 | 发现脓毒症早期诊断和预后的有效生物标志物 | 脓毒症患者（具体样本信息未提供） | 生物信息学 | 脓毒症 | 转录组测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, 孟德尔随机化 | LASSO, SVM-RFE, Boruta | 基因表达数据 | NA |
| 4605 | 2025-05-17 |
Resveratrol targeting MDM2/P53/PUMA axis to inhibit colonocyte apoptosis in DSS-induced ulcerative colitis mice
2025, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2025.1572906
PMID:40371345
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research paper | 该研究探讨了白藜芦醇通过调节MDM2/P53/PUMA轴抑制结肠细胞凋亡，从而治疗DSS诱导的溃疡性结肠炎的潜力 | 揭示了白藜芦醇通过MDM2/P53/PUMA轴抑制结肠细胞凋亡的新机制，并验证了MDM2作为溃疡性结肠炎治疗靶点的潜力 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验，尚未在人体中进行验证 | 研究白藜芦醇在溃疡性结肠炎治疗中的作用机制和疗效 | DSS诱导的溃疡性结肠炎小鼠模型和体外培养的结肠细胞 | 生物医学 | 溃疡性结肠炎 | 单细胞测序、免疫荧光染色、腺相关病毒系统 | 小鼠溃疡性结肠炎模型 | 实验数据 | 未明确说明样本数量 |
| 4606 | 2025-05-16 |
PINK1 link mitochondria-ER contacts controls deposition of intramuscular fat in pigs
2025-May-20, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151672
PMID:40138759
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研究论文 | 本研究探讨了PINK1如何通过调节线粒体-内质网相互作用来调控猪肌肉内脂肪沉积 | 揭示了PINK1在调控猪肌肉内脂肪沉积中的新作用，特别是其通过线粒体-内质网接触调控脂肪沉积的机制 | 研究主要基于猪模型，结果在人类或其他动物中的适用性尚不明确 | 探究PINK1在调控猪肌肉内脂肪沉积中的作用及其分子机制 | 猪的肌肉内脂肪沉积 | 生物医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 多个猪品种的肌肉组织样本 |
| 4607 | 2025-05-16 |
Unraveling the Heterogeneity of CD8+ T-Cell Subsets in Liver Cirrhosis: Implications for Disease Progression
2025-May-15, Gut and liver
IF:3.4Q2
DOI:10.5009/gnl230345
PMID:38623058
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研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞测序数据分析了肝硬化中CD8+ T细胞的异质性及其对疾病进展的影响 | 揭示了肝硬化中CD8+ T细胞的八种亚型，特别是效应记忆T细胞（Tem）和耗竭T细胞（Tex），并发现CXCL13+ Tex细胞与疾病严重程度和预后不良相关 | 研究未涉及这些细胞亚型在肝硬化治疗中的具体应用 | 阐明CD8+ T细胞在肝硬化中的分子机制及其对疾病进展的影响 | 肝硬化患者的CD8+ T细胞 | 免疫学 | 肝硬化 | 转录组测序、单细胞测序 | NA | RNA-seq数据、单细胞数据 | 未明确说明样本数量 |
| 4608 | 2025-05-16 |
Pdgfrβ marks distinct mesenchymal and pericyte populations within the periosteum with overlapping cellular features
2025-May-15, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxaf020
PMID:40237625
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和转基因小鼠模型，探讨了骨膜中Pdgfrβ阳性细胞的异质性及其在骨修复中的作用 | 揭示了骨膜中Pdgfrβ阳性细胞的不同亚群，包括间充质细胞和周细胞，并分析了它们的增殖、迁移和成骨能力 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性尚需验证 | 探讨骨膜中Pdgfrβ阳性细胞的异质性及其在骨修复中的作用 | 小鼠长骨骨膜中的Pdgfrβ阳性细胞 | 细胞生物学 | 骨疾病 | 单细胞RNA测序，转基因小鼠模型 | Pdgfrβ-CreERT2-mT/mG报告小鼠 | 基因表达数据，组织学数据 | 转基因小鼠模型中的Pdgfrβ阳性细胞 |
| 4609 | 2025-05-16 |
IAP dependency of T-cell prolymphocytic leukemia identified by high-throughput drug screening
2025-May-15, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2024027171
PMID:39869826
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研究论文 | 通过高通量药物筛选发现T细胞前淋巴细胞白血病（T-PLL）对IAP抑制剂的依赖性 | 首次报道T-PLL对自噬靶向药物、核输出抑制剂和IAP抑制剂的敏感性，并揭示IAP抑制剂诱导的细胞死亡主要为坏死性凋亡且依赖TNF-α | 研究样本量较小（30例原代患者样本），且仅限于体外实验 | 发现T-PLL的新治疗靶点 | T细胞前淋巴细胞白血病（T-PLL）细胞 | 血液肿瘤学 | T细胞前淋巴细胞白血病 | 高通量药物筛选、RNA测序（bulk和单细胞）、光谱流式细胞术 | NA | 药物敏感性数据、RNA测序数据、流式细胞术数据 | 30例原代T-PLL患者样本 |
| 4610 | 2025-05-16 |
Zn-Based Multi-Active Framework Nanoparticles TSA-CAN-Zn Inhibit Skin Glycation via Dual Blockade of HMGB1/RAGE and AGEs/RAGE Pathways
2025-May-15, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202500664
PMID:40370206
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研究论文 | 本研究设计了一种基于锌的多活性框架纳米颗粒TSA-CAN-Zn，通过双重阻断HMGB1/RAGE和AGEs/RAGE通路来抑制皮肤糖基化损伤 | 首次将Theasinensin A (TSA)和L-肌肽(CAN)结合到锌基纳米颗粒中，同时抑制HMGB1/RAGE和AGEs/RAGE两条通路 | 研究主要基于体外实验和小鼠模型，尚未进行人体临床试验 | 开发一种新型纳米材料来减轻糖基化引起的皮肤损伤 | 皮肤糖基化损伤机制及治疗 | 纳米医学 | 皮肤疾病 | 分子对接、单细胞RNA测序 | 小鼠皮肤糖基化模型 | 体外实验数据、测序数据 | HaCaT细胞系和小鼠模型 |
| 4611 | 2025-05-16 |
Evidence of secondary Notch signaling within the rat small intestine
2025-May-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.204277
PMID:40371707
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research paper | 该研究探讨了大鼠小肠中一种罕见的上皮细胞群体CFTR高表达细胞（CHEs）的特定形成机制 | 揭示了CHEs通过Notch信号通路的二次激活从其他分泌细胞中分化出来的新机制 | 研究主要基于大鼠模型，未在小鼠中发现CHEs，可能限制结果的普遍性 | 理解小肠分泌细胞谱系的多样性形成机制 | 大鼠小肠中的CFTR高表达细胞（CHEs） | 分子生物学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），假时间轨迹分析 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 4612 | 2025-05-16 |
Microglia Single-Cell RNA-Seq Enables Robust and Applicable Markers of Biological Aging
2025-May-15, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.70095
PMID:40371813
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序技术开发了基于小胶质细胞的生物年龄标记物 | 利用单细胞RNA测序数据开发了新的生物年龄计算模型，相比传统批量分析方法能更精确地反映个体生物年龄 | 研究主要基于小鼠和人类的小胶质细胞数据，可能不适用于其他细胞类型 | 开发基于小胶质细胞单细胞转录组数据的生物年龄预测模型 | 人类和小鼠的小胶质细胞 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | 无监督频率汇总模型 | 单细胞转录组数据 | 三个不同的单细胞数据集 |
| 4613 | 2025-05-16 |
Cell-type deconvolution methods for spatial transcriptomics
2025-May-14, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-025-00845-y
PMID:40369312
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review | 本文综述了空间转录组学中细胞类型解卷积方法的多样性，对比了它们的能力，并总结在一个基于网络的交互式表格中以促进更高效的方法选择 | 提供了一个基于网络的交互式表格，便于研究者选择和对比不同的细胞类型解卷积方法 | NA | 探讨空间转录组学中细胞类型解卷积方法的应用和发展 | 空间转录组学数据中的细胞类型解卷积方法 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA |
| 4614 | 2025-05-16 |
Single cell multiome analysis of the bovine placenta identifies gene regulatory networks in trophoblast differentiation†
2025-May-13, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioaf036
PMID:39987557
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研究论文 | 通过单细胞多组学分析牛胎盘，识别了滋养层细胞分化中的基因调控网络 | 首次使用10X Genomics多组学平台（snRNA-seq和snATAC-seq）分析了牛胎盘发育过程中的染色质可及性景观，揭示了滋养层细胞分化的候选调控网络 | 研究仅关注了牛胎盘的两个发育阶段（第40天和第170天），可能无法全面反映整个发育过程的动态变化 | 理解牛胎盘发育和滋养层细胞分化的分子机制，以探究牛妊娠失败的原因 | 牛胎盘中的细胞群体，特别是滋养层细胞 | 基因组学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序（snRNA-seq）、单细胞ATAC测序（snATAC-seq） | NA | 基因组数据 | 两个发育阶段的牛胎盘样本（第40天和第170天） |
| 4615 | 2025-05-16 |
Parvalbumin neurons mediate neurological phenotypes of anti-NMDAR encephalitis
2025-May-13, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awae374
PMID:40071389
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研究论文 | 本研究通过构建抗NMDAR脑炎动物模型，揭示了小白蛋白神经元在抗NMDAR脑炎神经表型中的作用机制 | 首次阐明抗NMDAR IgG通过损害小白蛋白神经元导致认知障碍的机制，并发现光遗传学和药理遗传学激活这些神经元可逆转认知缺陷 | 研究主要聚焦于mPFC区域，虽然发现海马区也有类似变化，但未全面评估其他脑区的影响 | 探究抗NMDAR脑炎患者认知缺陷的神经病理学机制 | 抗NMDAR脑炎患者血清提取的IgG处理的小鼠模型 | 神经科学 | 自身免疫性脑炎 | 免疫组化染色、电生理测试、光遗传学、药理遗传学、单细胞测序 | 动物模型 | 电生理数据、基因表达数据、行为学数据 | 未明确说明样本量，使用患者血清提取的IgG和健康对照IgG |
| 4616 | 2025-05-16 |
KLHL17 as a Prognostic Indicator and Therapeutic Target in Cervical Cancer: A Comprehensive Analysis
2025-May-13, Combinatorial chemistry & high throughput screening
IF:1.6Q3
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research paper | 该研究通过生物信息学分析和实验验证，探讨了KLHL17在宫颈癌中的表达模式及其作为预后指标和治疗靶点的潜力 | 首次全面分析了KLHL17在宫颈癌中的表达模式、临床相关性及其与免疫细胞浸润、免疫检查点基因表达和微卫星不稳定性的关联 | 研究主要基于TCGA数据库和细胞系实验，缺乏大规模临床样本验证 | 阐明KLHL17在宫颈癌中的生物学功能和临床意义 | 宫颈癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 宫颈癌 | 生物信息学分析、qRT-PCR、单细胞测序 | NA | 基因表达数据、临床数据 | TCGA数据库中的宫颈癌样本和GSE145372数据集 |
| 4617 | 2025-05-16 |
Construction of a novel CD8T cell-related index for predicting clinical outcomes and immune landscape in ovarian cancer by combined single-cell and RNA-sequencing analysis
2025-May-12, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02582-4
PMID:40354001
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研究论文 | 通过结合单细胞和RNA测序分析，构建了一个新的CD8T细胞相关指数（CCAI），用于预测卵巢癌的临床结果和免疫景观 | 开发了一个新的CD8T细胞相关指数（CCAI），能够准确预测卵巢癌患者的预后并区分具有不同免疫景观特征的患者 | 研究依赖于特定的数据集（如EMTAB8107、TCGA-OV等），可能限制了结果的广泛适用性 | 探索CD8T细胞相关生物标志物在预测卵巢癌预后和免疫治疗效果中的潜在作用 | 卵巢癌患者 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞测序、RNA测序 | 机器学习 | 测序数据 | 多个卵巢癌队列（EMTAB8107、TCGA-OV、GSE26712、GSE26193） |
| 4618 | 2025-05-16 |
Multi-omics identify ribosome related causal genes methylation, splicing, and expression in prostate cancer
2025-May-12, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02584-2
PMID:40354008
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研究论文 | 该研究通过整合多组学数据，探讨了核糖体相关基因与前列腺癌之间的关联 | 首次使用SMR和共定位分析结合单细胞分析，揭示了核糖体相关基因NSUN4和MPHOSPH6在前列腺癌中的因果作用 | 研究样本主要来自特定数据库(FinnGen等)，可能限制了结果的普适性 | 探究核糖体相关基因在前列腺癌发生发展中的作用机制 | 前列腺癌患者的多组学数据(基因组学、转录组学) | 生物信息学 | 前列腺癌 | SMR分析、共定位分析、单细胞测序 | NA | 基因组数据、转录组数据、表观遗传数据 | 来自The Prostate Cancer Association Group和FinnGen研究的汇总数据 |
| 4619 | 2025-05-16 |
High-resolution spatial transcriptomics and cell lineage analysis reveal spatiotemporal cell fate determination during craniofacial development
2025-May-12, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-59206-2
PMID:40355462
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研究论文 | 该研究通过高分辨率空间转录组学和细胞谱系分析，揭示了小鼠腭发育过程中颅神经嵴细胞(CNCCs)衍生的间充质细胞谱系多样化的时空动态 | 首次构建了小鼠腭发育过程中CNCCs衍生间充质细胞的高分辨率时空转录组图谱，并发现Sox9+间充质祖细胞群在腭发育起始时就存在异质性 | 研究仅针对小鼠模型，人类腭发育可能存在差异 | 阐明颅面发育过程中细胞命运决定的时空调控机制 | 小鼠胚胎颅神经嵴细胞(CNCCs)及其衍生的间充质细胞 | 发育生物学 | NA | 高分辨率空间转录组学、细胞谱系追踪 | NA | 转录组数据、空间定位数据 | E10.5至E15.5的小鼠胚胎样本 |
| 4620 | 2025-05-16 |
IL-11/IL-11R signal inhibition by 9MW3811 remodels immune tumor microenvironment and enhances anti-tumor efficacy of PD-1 blockade
2025-May-12, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-00913-w
PMID:40355638
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research paper | 该研究介绍了一种名为9MW3811的单克隆抗体，通过抑制IL-11/IL-11R信号通路，重塑肿瘤免疫微环境并增强PD-1阻断疗法的抗肿瘤效果 | 9MW3811作为一种新型单克隆抗体，能够有效中和IL-11，并通过调节肿瘤微环境中的免疫细胞功能，增强PD-1阻断疗法的疗效，特别是在PD-1无应答模型中表现出协同效应 | 研究主要基于小鼠模型，临床效果尚需进一步验证 | 探索IL-11信号通路抑制在抗肿瘤治疗中的作用及其与PD-1阻断疗法的协同效应 | IL-11信号通路、肿瘤微环境、CD8+ T细胞 | 肿瘤免疫治疗 | 癌症 | 单克隆抗体技术、单细胞RNA-seq分析 | 小鼠肿瘤模型 | 基因表达数据 | 多种小鼠肿瘤模型 |