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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
4581 2025-10-05
CXCL6 Is a Novel Biliary Marker and a Downstream Target of MMP7 in Biliary Atresia
2025-Sep, Hepatology research : the official journal of the Japan Society of Hepatology IF:3.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序发现CXCL6是MMP7的下游靶点,并验证其作为胆道闭锁新型胆道标志物的潜力 首次发现CXCL6是MMP7在胆道闭锁中的下游靶点,并证实其在肝纤维化过程中的病理作用 未阐明MMP7-CXCL6信号通路在胆道闭锁发病机制中的完整分子机制 探究MMP7在胆道闭锁发病机制中的下游信号通路 胆道闭锁患者肝脏组织和血清样本,胆管上皮细胞 单细胞组学 胆道闭锁 单细胞RNA测序,qRT-PCR,免疫组化,Western blot,ELISA,免疫荧光 NA 单细胞转录组数据,基因表达数据,蛋白表达数据 胆道闭锁患者、非胆道闭锁胆汁淤积患者和正常对照的肝脏及血清样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4582 2025-10-05
Heterogeneity in Osteosarcoma Revealed by scRNA Sequencing: CLU+ Endothelial Cells as Key Players in Tumor Progression
2025-Sep, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示骨肉瘤的空间异质性,发现外周区域CLU+内皮细胞在肿瘤进展中的关键作用 首次在骨肉瘤中系统比较中心区域和外周区域的单细胞转录组差异,鉴定出CLU+内皮细胞亚群通过ITGB1介导的胶原蛋白家族成员促进肿瘤转移,并通过Nectin2-TIGIT通路诱导CD8+ T细胞耗竭 样本量较小(仅6例患者),需要更大规模研究验证发现 探索骨肉瘤瘤内异质性在肿瘤进展中的作用机制 骨肉瘤患者的配对肿瘤组织样本(中心区域和外周区域) 单细胞测序 骨肉瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 6例骨肉瘤患者的配对肿瘤组织样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4583 2025-10-05
Investigating cytotoxic and inflammatory human IL-7 receptor low effector memory CD8+ T cells in lupus
2025-Sep, EBioMedicine IF:9.7Q1
研究论文 本研究通过分析狼疮患者外周血和肾脏组织中的CD8+ T细胞异质性,揭示了IL7Rlow效应记忆CD8+ T细胞在狼疮发病机制中的关键作用 首次发现IL7Rlow效应记忆CD8+ T细胞在狼疮患者中积累,并证明其通过TNF-α和IFN-γ依赖性方式诱导中性粒细胞胞外诱捕网形成 研究主要基于转录组数据和体外实验,需要进一步的功能验证和机制研究 探讨CD8+ T细胞在狼疮发病机制中的作用及其异质性意义 狼疮患者的外周血和肾脏组织样本 免疫学 狼疮 单细胞RNA测序,微阵列,成像质谱流式细胞术 NA RNA测序数据,微阵列数据,图像数据 狼疮患者和正常人的外周血及肾脏组织样本 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
4584 2025-10-05
Neuromodulatory Signaling in Chronic Pain Patients: A Narrative Review
2025-Aug-27, Cells IF:5.1Q2
综述 本叙述性综述综合分析了神经调节信号系统在慢性疼痛中的作用机制及治疗潜力 整合转录组分析、功能性神经影像和单细胞RNA测序等新技术发现患者特异性神经调节功能障碍模式,提出精准医疗干预点 叙述性综述缺乏系统性文献检索和定量分析,证据质量受原始研究限制 探讨神经调节信号通路在慢性疼痛病理生理机制中的作用及治疗靶点 慢性疼痛患者及相关的神经调节系统 神经科学 慢性疼痛 转录组分析,功能性神经影像,单细胞RNA测序 NA 临床观察数据,临床前研究数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
4585 2025-10-05
Artificial Intelligence in Ocular Transcriptomics: Applications of Unsupervised and Supervised Learning
2025-Aug-26, Cells IF:5.1Q2
综述 本文综述了2019-2025年间人工智能在眼科转录组学中的应用,重点介绍了无监督和监督学习方法在生物标志物发现、细胞类型分类及眼部疾病建模方面的进展 系统总结了AI在眼科转录组学中的最新应用,涵盖单细胞工作流程标准方法和深度学习框架在多组学整合中的潜力 存在可解释性和标准化方面的挑战 探讨人工智能在眼科转录组学数据分析中的应用 眼部组织转录组数据,包括视网膜、角膜、黄斑等 自然语言处理 年龄相关性黄斑变性 微阵列、bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq PCA, t-SNE, UMAP, WGCNA, LASSO, SVM, 随机森林, 变分自编码器, 神经网络 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
4586 2025-10-05
Current Role and Future Frontiers of Spatial Transcriptomics in Genitourinary Cancers
2025-Aug-26, Cancers IF:4.5Q1
综述 本文概述了空间转录组学技术在泌尿生殖系统癌症中的新兴作用和未来潜力 聚焦空间转录组学技术在泌尿生殖系统癌症中的独特应用,区别于传统转录组学仅关注基因表达水平 NA 探讨空间转录组学技术在泌尿生殖系统癌症研究中的当前作用和未来发展方向 泌尿生殖系统恶性肿瘤 空间转录组学 泌尿生殖系统癌症 空间转录组学 NA 基因表达空间数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
4587 2025-10-05
A fibroblast-centric network drives cold fibrosis in the tumor microenvironment of lung squamous cell carcinoma
2025-Aug-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析揭示了肺鳞癌肿瘤微环境中由癌症相关成纤维细胞驱动的冷纤维化网络 首次将非癌性纤维化中的热/冷纤维化概念应用于肺鳞癌,发现了由CAF自分泌生长因子环路维持的冷纤维化结构 样本量相对较小(16例患者),仅针对初治患者进行研究 探究慢性炎症相关癌症中纤维化基质的组织原则 肺鳞癌患者的肿瘤和癌旁正常组织 数字病理学 肺癌 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序数据 16例初治肺鳞癌患者的匹配肿瘤和癌旁组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
4588 2025-10-05
Genomic Insights into Tumorigenesis in Newly Diagnosed Multiple Myeloma
2025-Aug-23, Diagnostics (Basel, Switzerland)
研究论文 通过单细胞RNA测序分析新诊断多发性骨髓瘤患者的遗传突变,揭示疾病进展的分子机制 首次通过单细胞RNA测序比较MGUS、SMM和新诊断MM各阶段的遗传突变特征,发现新的肿瘤发生相关基因 样本数量未明确说明,研究仅关注遗传突变而可能忽略其他分子机制 识别导致多发性骨髓瘤进展和肿瘤发生的遗传突变 MGUS、SMM和新诊断多发性骨髓瘤患者样本 基因组学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序 计算分析流程 基因组序列数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
4589 2025-10-05
Dynamic Intercellular Networks in the CNS: Mechanisms of Crosstalk from Homeostasis to Neurodegeneration
2025-Aug-22, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 本文综述了中枢神经系统中动态细胞间通讯网络在健康稳态到神经退行性疾病过程中的作用机制 通过整合单细胞和空间转录组学最新发现,系统比较了不同疾病背景下细胞间通讯网络的动态变化 作为综述文章,主要基于现有文献分析,缺乏原始实验数据验证 探讨中枢神经系统中细胞间通讯网络在健康稳态和疾病状态下的作用机制 神经元、星形胶质细胞、小胶质细胞、少突胶质细胞等中枢神经系统细胞 神经科学 阿尔茨海默病 单细胞转录组学、空间转录组学 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq、空间转录组学 NA NA
4590 2025-10-05
Plasma Proteomics Reveals Dysregulated Pathways Across the Spectrum LMNA Cardiomyopathy
2025-Aug, Circulation. Genomic and precision medicine
研究论文 通过血浆蛋白质组学分析揭示LMNA心肌病发展过程中的失调通路 首次在LMNA心肌病中鉴定出EDA2R、MYL4等新型蛋白标志物,并发现26个蛋白在心肌细胞中呈现一致性差异表达 样本量相对有限(LMNA组41例,肌小节组18例),需要更大规模研究验证 探索LMNA基因致病变异相关的蛋白质和生物学通路 遗传性扩张型心肌病患者(LMNA和肌小节变异)及表型阴性家族成员 蛋白质组学 心血管疾病 血浆蛋白质组学分析,单细胞测序 主成分分析 蛋白质表达数据,基因表达数据 114例(41例LMNA DCM,18例肌小节DCM,55例表型阴性个体) OLINK 血浆蛋白质组学 OLINK平台 测量约3000种血浆蛋白质
4591 2025-10-05
Autophagy-related biomarkers in non-obstructive azoospermia: insights from transcriptomics and single-cell sequencing
2025-Aug, Journal of assisted reproduction and genetics IF:3.2Q2
研究论文 本研究通过转录组学和单细胞测序技术筛选非梗阻性无精子症中的自噬相关生物标志物 首次结合差异表达分析、WGCNA和机器学习算法筛选NOA的自噬相关生物标志物,并在单细胞水平验证其表达模式 研究主要依赖公共数据库数据,需要进一步实验验证生物标志物的功能机制 探索自噬相关基因在非梗阻性无精子症中的作用并筛选诊断生物标志物 非梗阻性无精子症患者的睾丸组织样本 生物信息学 男性不育症 转录组测序, 单细胞测序, RT-qPCR, 机器学习 机器学习算法 基因表达数据 多个公共数据集(包括GSE9210和GSE145467) NA 单细胞RNA-seq, 转录组测序 NA NA
4592 2025-09-14
Comparative spatial transcriptomics of pancreatic cancer with ductal and acinar origins in mouse models
2025-Aug, Clinical and translational medicine IF:7.9Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
4593 2025-10-05
Barcoded monoclonal embryoids are a potential solution to confounding bottlenecks in mosaic organoid screens
2025-Jul-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究开发了条形码单克隆胚胎体技术,解决了嵌合体类器官筛选中因细胞瓶颈导致的统计效力不足和结果混淆问题 开发了可扩展的单克隆胚胎体协议,通过遗传条形码技术解决了嵌合体类器官筛选中细胞瓶颈导致的统计效力限制 研究仍处于概念验证阶段,需要在更广泛的遗传扰动和表型分析中进一步验证 解决嵌合体类器官遗传筛选中因细胞瓶颈导致的统计效力不足和结果不可重复性问题 小鼠胚胎干细胞和胚胎体 发育生物学 NA CRISPR筛选,单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
4594 2025-10-05
Resident memory T cell development is gradual and shows AP-1 gene expression in mature cells
2025-Jun-23, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了组织驻留记忆T细胞发育的渐进过程及成熟细胞中AP-1转录因子家族的关键作用 首次定义了跨越皮肤和小肠上皮淋巴细胞的时序性TRM特征,发现AP-1转录因子家族在成熟TRM中的特异性表达 研究主要关注CD8+ TRM细胞,其他T细胞亚型的研究相对有限 阐明组织驻留记忆T细胞分化机制及其回忆效应功能的启动原理 CD8+ 组织驻留记忆T细胞(皮肤和小肠上皮淋巴细胞) 免疫学 感染性疾病 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, 循环免疫荧光成像 线性模型 基因表达数据, 表观遗传数据, 组织成像数据 10个发育时间点的单细胞数据 NA 单细胞RNA-seq, ATAC-seq, 空间成像 NA NA
4595 2025-10-05
High-throughput differentiation of human blood vessel organoids reveals overlapping and distinct functions of the cerebral cavernous malformation proteins
2025-Jun-06, Angiogenesis IF:9.2Q1
研究论文 本研究通过高通量分化人血管类器官揭示脑 cavernous 畸形蛋白的重叠和独特功能 结合高通量血管类器官分化、单细胞RNA测序和高内涵成像技术系统比较CCM1/2/3基因敲除的功能差异 研究主要基于体外类器官模型,需要进一步体内验证 探究CCM3突变为何比CCM1/2突变导致更严重表型的分子机制 人诱导多能干细胞分化的血管类器官 单细胞生物学 脑血管畸形 单细胞RNA测序, 高内涵成像, 基因敲除 类器官模型 单细胞转录组数据, 图像数据 96孔板高通量格式的血管类器官 NA 单细胞RNA-seq NA NA
4596 2025-10-05
A novel frameshift mutation in Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 1 (PIK3R1) causes immunodeficiency and Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS)
2025-May-28, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过鉴定PIK3R1基因的新型移码突变,揭示了其在免疫缺陷和肌萎缩侧索硬化症发病机制中的作用 首次报道PIK3R1基因c.1710dup移码突变导致单倍体不足,并通过iPSC模型证明其对神经元功能和存活的影响 研究基于单例患者样本,需要更大样本量验证 探究PIK3R1基因突变在免疫缺陷和神经系统疾病中的致病机制 携带PIK3R1 c.1710dup突变的常见变异型免疫缺陷患者及其iPSC衍生细胞模型 遗传学与神经科学 肌萎缩侧索硬化症 单细胞RNA测序,iPSC技术,脑类器官培养 iPSC衍生运动神经元和脑类器官模型 基因测序数据,单细胞转录组数据,细胞功能数据 1例患者及其iPSC衍生细胞模型 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4597 2025-10-05
Alternatively activated monocyte-derived myeloid cells promote extracellular pathogen persistence within pulmonary fungal granulomas
2025-May-27, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了CD4 T辅助2细胞通过替代性激活单核来源髓系细胞抑制肺部真菌清除的新机制 发现替代性激活的髓系细胞并非真菌内在复制场所,且真菌主要存在于细胞外环境,提出了T辅助2细胞-髓系细胞环路驱动细胞外真菌持续存在的新机制 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 探究潜伏性真菌感染中无法产生灭菌免疫的机制 隐球菌肉芽肿的免疫动态和细胞结构 空间转录组学 真菌感染 空间转录组学, 流式细胞术, 命运图谱, 小鼠遗传工具 NA 空间转录组数据, 流式细胞数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
4598 2025-10-05
Trajectories of macrophage ontogeny and reprogramming in cancer
2025-May-16, iScience IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了肿瘤相关巨噬细胞的发育轨迹及其在癌症免疫治疗中的重编程机制 首次通过伪时间分析揭示了巨噬细胞从免疫刺激状态向免疫抑制状态的发育轨迹,并发现特定基因失活可阻断这一过程 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限 探索肿瘤相关巨噬细胞的发育轨迹及其在免疫治疗中的作用机制 肿瘤相关巨噬细胞 单细胞生物学 肺癌 单细胞RNA测序 伪时间分析 单细胞转录组数据 小鼠癌症模型和癌症患者样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
4599 2025-10-05
An improved nuclei isolation protocol from leaf tissue for single-cell transcriptomics
2025, PloS one IF:2.9Q1
研究论文 本研究开发了一种从玉米叶片组织中分离细胞核的改进方案,用于单细胞转录组学研究 利用叶绿体自发荧光特性在FACS步骤中有效去除叶绿体污染,提高了测序reads与基因组和转录组的比对效率 该方法主要针对高叶绿体含量的植物叶片组织,在其他组织类型中的适用性需要进一步验证 开发适用于高叶绿体含量植物组织的单细胞核RNA测序样品制备方法 玉米叶片组织 植物生物学 NA 单细胞核RNA测序,荧光激活细胞分选 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
4600 2025-10-05
Single-cell RNA sequencing reveals heterogeneous response of interlamellar cell mass to hypoxic stress in crucian carp (Carassius auratus) gills
2025-Nov, Fish & shellfish immunology IF:4.1Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序技术揭示鲫鱼鳃中间片细胞团对缺氧应激的异质性响应机制 首次在单细胞水平揭示鲫鱼鳃中间片细胞团对缺氧应激的异质性响应,发现内质网应激是细胞凋亡主要通路 研究仅针对鲫鱼特定细胞类型,未验证其他鱼类或组织的普适性 探究鱼类鳃组织对缺氧应激的细胞分子响应机制 鲫鱼(Carassius auratus)鳃组织中的间片细胞团 单细胞生物学 缺氧应激 单细胞RNA测序,组织学分析 NA 单细胞转录组数据,组织切片图像 未明确样本数量 NA 单细胞RNA测序 NA NA
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