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当前共找到 10570 篇文献，本页显示第 441 - 460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 441 | 2026-09-16 |
Transcriptome-wide analysis reveals potential roles of CFD and ANGPTL4 in fibroblasts regulating B cell lineage for extracellular matrix-driven clustering and novel avenues for immunotherapy in breast cancer
2025-05-08, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01237-y
PMID:40340806
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研究论文 | 该研究通过转录组范围的分析，识别了乳腺癌中基于细胞外基质（ECM）的分子分型，并构建了预后模型，揭示了CFD和ANGPTL4在成纤维细胞调节B细胞谱系中的作用及其对免疫治疗的潜在影响 | 首次基于ECM成分和调节因子的特征，利用非负矩阵分解（NMF）将乳腺癌患者分为三个ECM相关集群（C1神经型、C2 ECM型、C3免疫型），并构建了ECM相关指数（ECI）预后模型；发现了ANGPTL4+和CFD+成纤维细胞分别与C2表型和其他ECM集群相关，并通过不同信号通路调节B细胞谱系；揭示了CFD和ANGPTL4对免疫治疗反应的相反影响 | 摘要中未明确提及研究的局限性 | 研究乳腺癌中ECM的组成模式及其生物学功能，探索ECM相关集群与肿瘤微环境（TME）的关系，并构建预后模型以指导免疫治疗 | 乳腺癌患者 | 机器学习 | 乳腺癌 | 转录组测序、单细胞转录组测序 | 非负矩阵分解（NMF）、加权基因共表达网络分析（WGCNA）、机器学习 | 转录组数据、基因组数据、单细胞转录组数据 | TCGA数据库中的乳腺癌患者样本（数量未明确），以及10个独立公共队列：Metabric、SCAN_B、GSE12276、GSE16446、GSE19615、GSE20685、GSE21653、GSE58644、GSE58812、GSE88770；训练队列n=5,392，测试队列n=1,344；单细胞数据来自GSE161529 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 442 | 2026-09-16 |
Surgery/anesthesia may cause monocytes to promote tumor development
2025-05-07, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01213-6
PMID:40335909
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术深入分析了围手术期手术/麻醉对外周血单个核细胞的影响 | 首次在围手术期深入分析手术/麻醉对外周血单个核细胞的影响，发现非经典单核细胞在术后受到影响且在48小时内无恢复趋势 | 样本量较小，仅纳入4例患者 | 探讨手术/麻醉对围手术期外周血单个核细胞的影响 | 4例接受手术的患者的外周血样本 | 单细胞测序 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序, RT-PCR | NA | 单细胞转录组数据, 基因表达数据 | 4例患者的手术前、手术后0、24和48小时的外周血样本 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 443 | 2026-09-16 |
Exploring ribosome biogenesis in lung adenocarcinoma to advance prognostic methods and immunotherapy strategies
2025-05-02, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06489-0
PMID:40316986
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研究论文 | 该研究利用单细胞RNA测序技术构建肺腺癌单细胞图谱，基于核糖体生物发生相关基因建立预后模型RBS，并验证其在预后预测和免疫治疗反应评估中的价值 | 首次基于331个核糖体生物发生相关基因构建肺腺癌预后模型RBS，发现CD4+初始样T细胞高表达核糖体生物发生相关基因且随CD4+ T细胞发育逐渐降低，RBS模型在预后预测上优于140个已发表的肺腺癌预后模型 | 研究主要基于公共数据库和体外实验验证，缺乏大规模前瞻性临床试验验证RBS模型的临床实用性，KIF23的功能验证仅限于体外实验 | 探索核糖体生物发生在肺腺癌中的作用，构建预后模型并评估免疫治疗策略 | 肺腺癌患者样本及肺腺癌细胞系 | 数字病理学, 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学 | 机器学习 | 图像, 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 444 | 2026-09-16 |
Decoding per- and polyfluoroalkyl substances (PFAS) in hepatocellular carcinoma: a multi-omics and computational toxicology approach
2025-05-02, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06517-z
PMID:40317014
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研究论文 | 该研究采用多组学和计算毒理学方法，揭示PFAS暴露驱动肝细胞癌（HCC）的分子机制，并构建了PFAS相关HCC预后风险模型（PFASRHSig） | 首次将网络毒理学、集成机器学习、单细胞RNA测序、空间转录组学、实验验证和分子对接模拟相结合，系统解析PFAS在HCC中的核心靶点和机制，并构建了PFASRHSig预后模型 | 研究主要基于公共转录组数据和计算预测，实验验证仅限于RT-qPCR和IHC，缺乏体内动物模型和前瞻性临床队列验证 | 揭示PFAS暴露驱动肝细胞癌发生的分子机制，识别核心靶点，并构建预后风险模型 | 肝细胞癌（HCC）患者队列的转录组数据及PFAS暴露相关基因 | 机器学习 | 肝癌 | 网络毒理学、集成机器学习、单细胞RNA测序、空间转录组学、RT-qPCR、免疫组化染色、分子对接模拟 | 集成机器学习、PPI网络、生存风险模型 | 转录组数据、图像 | 多个公共HCC队列的转录组数据，具体样本量未在摘要中明确 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 445 | 2026-09-16 |
PD-1 regulates the anti-tumor immune function of macrophages through JAK2-STAT3 signaling pathway in colorectal cancer tumor microenvironment
2025-05-02, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06469-4
PMID:40317043
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研究论文 | 该研究结合bulk RNA测序和单细胞RNA测序数据，揭示了结直肠癌肿瘤微环境中PD-1通过JAK2-STAT3信号通路调控巨噬细胞抗肿瘤免疫功能的作用机制 | 首次系统揭示了TAM上PD-1表达通过JAK2-STAT3信号通路调控巨噬细胞M2型极化、抑制吞噬活性及IFN-γ信号分子合成的分子机制，并阐明其在促进免疫抑制微环境形成和肿瘤进展中的关键作用 | 研究主要基于CT26小鼠结直肠癌细胞系和BMDMs体外模型，缺乏临床患者样本的直接验证，且未深入探讨PD-1在TAM上表达的上游调控机制 | 探究结直肠癌肿瘤微环境中TAM上PD-1的表达与患者预后的关联，以及PD-1调控巨噬细胞功能的分子机制 | 结直肠癌肿瘤微环境中的肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）、CT26小鼠结直肠癌细胞系、骨髓来源巨噬细胞（BMDMs）、荷瘤小鼠模型 | digital pathology, machine learning | 结直肠癌 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | 文本, 图像 | 未明确说明，涉及bulk RNA测序和scRNA-seq数据、CT26荷瘤小鼠模型及BMDMs体外实验 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 446 | 2026-09-16 |
Randomized phase 2 trial of pembrolizumab alone or in combination with low dose chemotherapy for patients with non-small cell lung cancer and poor performance status
2025-05, Lung cancer (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.lungcan.2025.108513
PMID:40203764
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研究论文 | 一项随机二期临床试验，比较帕博利珠单抗单药与联合低剂量化疗在体能状态较差的非小细胞肺癌患者中的疗效。 | 针对体能状态差（PS=2）的非小细胞肺癌患者，探索帕博利珠单抗联合极低剂量化疗的疗效，并利用单细胞测序分析免疫细胞基因表达谱。 | 样本量较小，联合治疗组与单药组之间的疗效差异未达到统计学显著性，部分分析为探索性。 | 评估帕博利珠单抗单药或联合低剂量化疗在体能状态较差的晚期非小细胞肺癌患者中的疗效和安全性。 | 晚期非小细胞肺癌且ECOG体能状态评分为2的患者 | 临床肿瘤学 | 肺癌 | 流式细胞术, 单细胞测序 | NA | 临床数据, 血液样本 | 43例患者入组，20例提供血液样本进行生物标志物分析 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 447 | 2026-09-16 |
Habitat radiomics predicts occult lymph node metastasis and uncovers immune microenvironment of head and neck cancer
2025-05-01, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06474-7
PMID:40312725
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研究论文 | 本研究旨在建立基于肿瘤内、瘤周和栖息区域的影像组学模型，用于预测头颈部鳞状细胞癌的隐匿性淋巴结转移，并揭示其与免疫微环境的关联 | 首次提出栖息区域影像组学模型（RF-habitat radiomics model）用于预测头颈部鳞状细胞癌的隐匿性淋巴结转移，并通过影像基因组学分析揭示了该模型与耗竭相关CD8+ T细胞丰度的生物学关联 | 样本量相对有限，单细胞RNA测序分析仅涉及6例样本，需要更大规模的多中心前瞻性研究进一步验证模型的泛化能力和临床实用性 | 建立并验证基于肿瘤内、瘤周和栖息区域的影像组学模型，用于无创预测头颈部鳞状细胞癌的隐匿性淋巴结转移，并探索其潜在的免疫微环境机制 | 经病理确诊的头颈部鳞状细胞癌患者，来自三个医疗中心及TCGA数据库 | 数字病理学 | 头颈部癌 | 影像组学、bulk RNA-seq、单细胞RNA测序 | 随机森林（RF）、逻辑回归（LR）、支持向量机（SVM） | 图像（CT影像）、文本（基因组数据）、单细胞转录组数据 | 训练集330例，内部测试集154例，外部测试集183例，TCGA基因组集50例，单细胞RNA测序集6例 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 448 | 2026-09-16 |
Innate immune training in the neonatal response to sepsis
2025-04-30, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01179-5
PMID:40307728
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研究论文 | 本文研究了新生儿接种卡介苗（BCG）通过重编程髓系造血功能，提高对多微生物脓毒症的存活率 | 揭示了BCG疫苗接种通过同时重编程多个髓系亚群（包括LSK、GMPs和CD11b+Gr1+细胞）来改善新生儿对多微生物脓毒症的存活率，并利用单细胞RNA测序全面阐明了BCG对髓系转录景观的广泛影响 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 探究新生儿期BCG疫苗接种对后续多微生物脓毒症感染的保护性免疫应答机制 | 新生儿小鼠及其脾细胞 | 免疫学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本（基因表达数据） | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 449 | 2026-09-16 |
scRNA-seq reveals that VEGF signaling mediates the response to neoadjuvant anlotinib combined with PD-1 blockade therapy in non-small cell lung cancer
2025-04-25, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-025-06485-4
PMID:40281576
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研究论文 | 该研究利用单细胞RNA测序技术，分析了接受新辅助安罗替尼联合PD-1阻断治疗的非小细胞肺癌患者的免疫细胞、基质细胞和癌细胞的动态变化，揭示了VEGF信号通路在治疗反应和耐药机制中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了VEGF信号通路介导非小细胞肺癌对新辅助安罗替尼联合PD-1阻断治疗的反应，发现了内皮细胞ZEB1可能上调FLT1表达以响应安罗替尼，以及VEGFR+内皮细胞特征可预测NSCLC患者生存 | 样本量较小，仅涉及9例NSCLC患者进行单细胞RNA测序分析，需要更大规模的临床验证 | 探索非小细胞肺癌患者对新辅助安罗替尼联合PD-1阻断治疗的潜在耐药机制并预测疗效 | 非小细胞肺癌患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | 约47,000个单细胞来自9例NSCLC患者，包括3例初治患者、3例治疗后主要病理缓解患者和3例非主要病理缓解患者，以及135例NSCLC患者用于免疫组化验证 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 450 | 2026-09-16 |
Spatiotemporal transcriptomics reveals key gene regulation for grain yield and quality in wheat
2025-Apr-11, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03569-8
PMID:40217326
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，覆盖小麦籽粒发育早期（授粉后4至12天），对小麦籽粒进行细胞类型分类并鉴定关键调控基因 | 首次提供小麦籽粒发育早期的全面时空转录数据集，鉴定出10种不同细胞类型及其192个标记基因，并通过共表达和基序分析发现TaABI3-B1等关键调控基因 | 研究仅覆盖授粉后4至12天的早期发育阶段，未涉及后期发育阶段；空间转录组学的分辨率可能限制对某些稀有细胞类型的鉴定 | 揭示小麦籽粒产量和品质相关的关键基因调控机制，为小麦产量改良提供遗传资源 | 小麦籽粒（授粉后4至12天的发育早期阶段） | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | WGCNA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 451 | 2026-09-16 |
Polymorphic tandem repeats influence cell type-specific gene expression across the human immune landscape
2025-Apr-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.02.621562
PMID:40291654
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研究论文 | 该研究利用全基因组和单细胞RNA测序数据，探索了多态性串联重复序列（TRs）对人类免疫细胞类型特异性基因表达的影响 | 首次大规模系统性研究多态性串联重复序列（TRs）在人类免疫细胞类型特异性基因表达中的作用，识别了超过62,000个单细胞表达数量性状TR位点（sc-eTRs），并揭示了TRs作为免疫介导和血液学性状遗传关联的潜在介质 | 研究主要基于血液来源细胞，可能无法完全代表其他组织中的TRs调控功能；此外，TRs的准确检测和分析仍存在技术挑战 | 探索多态性串联重复序列（TRs）变异对人类血液细胞类型特异性基因表达的影响 | 来自1,925个个体的超过540万个血液来源细胞 | 机器学习 | NA | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 1,925个个体的超过540万个血液来源细胞，超过170万个多态性TR位点 | NA | 全基因组测序, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 452 | 2026-09-16 |
Divergent PTEN-p53 interaction upon DNA damage in a human thyroid organoid model with germline PTEN mutations
2025-04-01, Endocrine-related cancer
IF:4.1Q2
DOI:10.1530/ERC-24-0216
PMID:39970536
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研究论文 | 该研究利用CRISPR-Cas9基因编辑技术构建携带不同胚系PTEN突变的人诱导多能干细胞来源的甲状腺类器官，通过bulk和单细胞RNA测序分析辐射诱导的DNA损伤反应，揭示PTEN M134R变异体与甲状腺癌易感性相关的分子机制 | 首次利用人诱导多能干细胞衍生的功能性甲状腺类器官模型，结合CRISPR-Cas9基因编辑技术，比较甲状腺癌相关（PTEN M134R）与非相关（PTEN G132D）胚系PTEN突变在辐射诱导DNA损伤后的转录组差异，揭示PTEN-p53物理互作在决定甲状腺癌易感性中的作用 | 研究仅基于体外类器官模型，缺乏体内动物实验验证；仅比较了两种PTEN变异体，未涵盖更多临床相关的PTEN突变类型；样本量有限 | 探究不同胚系PTEN突变类型在电离辐射诱导DNA损伤后如何改变DNA损伤反应，揭示特定PTEN变异体与分化型甲状腺癌易感性之间的分子机制 | 携带PTEN WT/G132D和PTEN WT/M134R杂合突变的人诱导多能干细胞衍生的甲状腺类器官，以及野生型对照 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | CRISPR-Cas9基因编辑, bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | 文本（转录组数据） | 野生型及两种杂合PTEN突变的人诱导多能干细胞系（PTEN WT/G132D和PTEN WT/M134R）衍生的甲状腺类器官 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 453 | 2026-09-16 |
Runx2 drives Schwann cells repair phenotype switch through chromatin remodeling and Sox2 activation after nerve injury
2025-03-21, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01142-4
PMID:40119274
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研究论文 | 本文研究了Runx2通过染色质重塑和Sox2激活驱动神经损伤后施万细胞修复表型转换的机制 | 揭示了Runx2通过开放转录调控区域并结合自身基因调控域实现正反馈调节，同时激活Sox2等转录因子从转录沉默状态转为活跃状态，协同调控施万细胞表型转换的表观遗传机制 | 研究主要基于大鼠坐骨神经损伤模型和体外实验，未涉及人类样本验证；多组学分析中部分数据来源于公共数据库（GSE216665、GSE94590） | 探究Runx2调控修复施万细胞表型转换的表观遗传机制 | 健康成年Sprague-Dawley大鼠坐骨神经损伤模型中的施万细胞及RSC96细胞系 | 机器学习, 数字病理学 | 神经系统损伤 | 转录组测序, ATAC测序, CUT&Tag测序, 单细胞RNA测序, qPCR, 双荧光素酶报告实验 | NA | 图像, 文本, 测序数据 | 健康成年SD大鼠（100-150g），损伤后4天和7天采集样本 | Illumina | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, ATAC-seq, CUT&Tag | Illumina NovaSeq | NA |
| 454 | 2026-09-16 |
Charting Postnatal Heart Development Using In Vivo Single-Cell Functional Genomics
2025-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.10.642473
PMID:40161658
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研究论文 | 该研究通过整合单核转录组学与基于图像的空间转录组学，构建了出生后心脏发育的时空图谱，并开发了基于探针的Indel可检测扰动测序技术（PIP-seq），用于高通量功能性解析心肌细胞成熟过程中的调控因子 | 开发了PIP-seq（基于探针的Indel可检测扰动测序），一种利用探针化学在单核分辨率下直接捕获sgRNA表达、扰动状态和转录组图谱的高通量平台；整合单核转录组学与空间转录组学构建出生后心脏时空图谱；鉴定出21个新的心肌细胞成熟调控因子 | 摘要中未明确提及研究限制 | 构建出生后心脏发育的时空图谱，揭示心肌细胞成熟的动态调控网络，并建立高通量功能性基因筛选平台 | 出生后心脏组织及心肌细胞 | 单细胞功能基因组学 | 心血管疾病 | 单核RNA测序、空间转录组学、Perturb-seq、PIP-seq | NA | 转录组数据、空间转录组数据、图像 | NA | 10x Genomics | single-cell RNA-seq, spatial transcriptomics | 10x Chromium, 10x Visium | NA |
| 455 | 2026-09-16 |
Spatial-Temporal Diversity of Extrachromosomal DNA Shapes Urothelial Carcinoma Evolution and Tumor-Immune Microenvironment
2025-Mar-11, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-24-1532
PMID:40062518
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研究论文 | 该研究通过全基因组测序分析595例尿路上皮癌患者的ecDNA，揭示了ecDNA的时空多样性及其对肿瘤演化和免疫微环境的影响 | 首次系统揭示ecDNA在尿路上皮癌中的时空多样性，证明ecDNA通过选择性扩增驱动克隆演化、促进多灶性和瘤内异质性，并发现ecDNA+恶性细胞通过下调MHC I类分子逃逸T细胞免疫，且尿液沉渣DNA可高特异性检测ecDNA | 摘要中未提及明确的局限性 | 探究ecDNA的时空多样性及其对尿路上皮癌演化和肿瘤免疫微环境的影响 | 595例尿路上皮癌患者 | 数字病理学 | 尿路上皮癌 | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组测序数据, 单细胞转录组数据, 尿液沉渣DNA | 595例尿路上皮癌患者 | NA | bulk DNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 456 | 2026-09-16 |
Imbalance of bladder neurohomeostasis by Myosin 5a aggravates diabetic cystopathy
2025-03-10, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01140-6
PMID:40065210
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研究论文 | 本研究探讨了Myosin 5a在糖尿病膀胱病（DCP）中的调控作用，发现其失调可能加重膀胱过度活动 | 首次揭示Myosin 5a通过影响膀胱神经稳态参与糖尿病膀胱病的发病机制，并证明其缺失导致排尿功能障碍和神经递质表达下降 | 研究主要基于动物模型，缺乏人体样本验证，且未深入探讨Myosin 5a调控神经递质释放的具体分子机制 | 探究Myosin 5a在糖尿病膀胱病中的潜在调控作用及其作为治疗靶点的可能性 | 糖尿病大鼠膀胱组织、Myosin 5a缺陷DBA小鼠、膀胱神经元 | 数字病理学 | 糖尿病膀胱病 | 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 文本 | 糖尿病大鼠和Myosin 5a缺陷DBA小鼠的膀胱组织样本（具体数量未提供） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 457 | 2026-09-16 |
Persistent pre-exhausted CD8+ T cells shape the tumor immune microenvironment in anaplastic thyroid cancer
2025-03-01, Endocrine-related cancer
IF:4.1Q2
DOI:10.1530/ERC-24-0169
PMID:39752183
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研究论文 | 该研究通过单细胞RNA测序分析甲状腺未分化癌和甲状腺乳头状癌的肿瘤免疫微环境，发现未分化癌中富集的前耗竭CD8+ T细胞，并验证GNLY为其潜在生物标志物 | 构建了计算流程，通过多个独立的未分化癌和乳头状癌单细胞转录组数据识别未分化癌特异性免疫细胞群体和差异表达基因；在未分化癌数据集中发现前耗竭CD8+ T细胞显著富集；鉴定出115个前耗竭CD8+ T细胞的潜在生物标志物基因，并实验验证GNLY为最佳候选标志物 | 未明确说明样本量及队列来源的局限性；GNLY及其他生物标志物在调节甲状腺癌免疫反应中的功能意义尚未深入探究；需要未来研究进一步探索 | 分析甲状腺未分化癌和甲状腺乳头状癌的免疫微环境，揭示未分化癌中前耗竭CD8+ T细胞的流行情况及其生物标志物，为开发靶向免疫治疗提供依据 | 甲状腺未分化癌和甲状腺乳头状癌样本及其肿瘤免疫微环境中的免疫细胞 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据、图像 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 458 | 2026-09-16 |
Identifying patterns differing between high-dimensional datasets with generalized contrastive PCA
2025-02, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012747
PMID:39919147
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研究论文 | 本文提出广义对比主成分分析（gcPCA），一种无需超参数的方法，用于比较两个高维数据集以提取条件富集的低维模式，并在神经生理记录和单细胞RNA测序数据中验证了其效用。 | gcPCA无需调整超参数，避免了cPCA需要手动选择参数的问题；同时对称地处理两个实验条件，使其更适合比较两个条件。 | 摘要中未明确提及研究的局限性。 | 开发一种灵活、无需超参数的方法来比较两个高维数据集，以提取在不同实验条件下富集的低维模式。 | 高维生物数据集，包括神经生理记录和单细胞RNA测序数据。 | 机器学习 | 2型糖尿病 | NA | 主成分分析 | 高维数据、神经生理记录、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 459 | 2026-09-16 |
Integrating multiscale mathematical modeling and multidimensional data reveals the effects of epigenetic instability on acquired drug resistance in cancer
2025-02, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012815
PMID:39951474
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研究论文 | 该研究整合多维数据与多尺度数学模型，揭示表观遗传不稳定性在癌症获得性耐药中的作用，并优化间歇性治疗策略 | 从进化视角构建了涵盖表观遗传与细胞群体动态的新型多尺度数学模型，结合随机模拟与定量分析，首次将表观遗传不稳定性确定为与DTP细胞亚群出现及间歇治疗有效性最相关的动力学特征，并揭示了DTP细胞的细胞自噬和迁移等此前未被认识的生物学特征及新的治疗耐受生物标志物基因 | 摘要中未明确提及研究局限性 | 阐明耐药持留（DTP）细胞导致获得性耐药的生物学与动态机制，并优化间歇性治疗策略 | 经药物处理的PC9肺癌细胞及肺癌单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 多尺度数学模型 | 文本, 数值 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 460 | 2026-09-16 |
Single cell RNA sequencing improves the next generation of approaches to AML treatment: challenges and perspectives
2025-01-30, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01085-w
PMID:39885388
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综述 | 该综述探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在急性髓系白血病（AML）治疗中的应用，包括分类、风险分层、识别治疗靶点、耐药机制及移植优化，并讨论了技术挑战与人工智能结合的改进方向 | 系统总结了scRNA-seq在AML精准医疗中的多方面应用前景，包括指导治疗选择、优化造血干细胞移植、开发癌症疫苗和CAR T细胞疗法，并提出了结合人工智能模型来应对数据分析挑战的新视角 | 面临高维数据分析、技术噪声、批次效应以及小生物模式识别等挑战，目前仍需改进，且可能需结合人工智能模型才能有效解决 | 探讨单细胞RNA测序技术如何改进AML的治疗策略并分析其面临的挑战与前景 | 急性髓系白血病（AML）患者及其白血病干细胞、骨髓微环境等 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |